Submitted by Elizabete Silva (elizabete.silva@ufes.br) on 2014-12-10T18:32:08Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Dissertação.FernandaZaidan.pdf: 1993203 bytes, checksum: f121a5630a788106b0700f04818f9194 (MD5) / Approved for entry into archive by Elizabete Silva (elizabete.silva@ufes.br) on 2014-12-11T18:33:32Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Dissertação.FernandaZaidan.pdf: 1993203 bytes, checksum: f121a5630a788106b0700f04818f9194 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-12-11T18:33:32Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Dissertação.FernandaZaidan.pdf: 1993203 bytes, checksum: f121a5630a788106b0700f04818f9194 (MD5) Previous issue date: 2014 / Animais híbridos representam um desafio à taxonomia e sistemática, pois correspondem a unidades evolutivas geralmente sem clara delimitação morfológica, comportamental e genética. Híbridos podem ser morfologicamente intermediários aos parentais ou, devido à introgressão e retrocruzamentos, suas características podem se misturar tornando difícil sua identificação. Uma das formas de identificação de híbridos é por meio de ferramentas de biologia molecular, que ao utilizarem marcadores de DNA mitocondrial (herança exclusiva materna) e DNA nuclear (herança materna e paterna), permitem a comparação entre informações genéticas. Além da hibridização existem outras fontes de conflito entre dados moleculares provenientes do DNA mitocondrial e DNA nuclear, como por exemplo a retenção de polimorfismos ancentrais. Em localidades do Espírito Santo, Brasil, foram coletados indivíduos de morfologia distinta de Trachycephalus mesophaeus e T. nigromaculatus, que são as únicas espécies do gênero conhecidas nesse estado. Porém, estudos piloto usando o gene mitocondrial Citocromo Oxidase subunidade I (COI) agruparam esses espécimes com amostras de T. typhonius. Devido a estas incongruências, foram sequenciados fragmentos de dois genes mitocondriais - COI e Nicotinamida Desidrogenase subunidade 2 (ND2) e um exon nuclear (tirosinase) de 173 indivíduos de Trachycephalus, de forma a esclarecer as identificações taxonômicas e investigar a correspondência entre caracteres morfológicos e genéticos nesta linhagem, na sua área de ocorrência As filogenias moleculares, divergências genéticas, redes de haplótipos e polimorfismos de nucleotídeos únicos (SNPs) confirmaram as três espécies acima mencionadas como linhagens evolutivas distintas e revelaram mais sete indivíduos potencialmente híbridos, mas morfologicamente assinalados a T. mesophaeus, T. nigromaculatus ou T. typhonius.. Devido à taxa de evolução lenta da tirosinase, as espécies mais recentes T. typhonius e T. nigromaculatus parecem não terem sido sorteadas completamente nesse gene. Já T. mesophaeus, que é a espécie mais antiga das três, foi recuperada inequivocamente em todas as análises. De forma inédita, as análises moleculares evidenciaram a ocorrência de introgressão bidirecional entre T. nigromaculatus e T. typhonius e entre T. nigromaculatus e T. mesophaeus, sendo que há indícios de indivíduos F1 (cruzamentos entre espécies parentais puras gerando híbridos). A utilização do gene ND2 mostrou-se mais eficiente do que o gene COI nas filogenias e, apesar da tirosinase ser um gene nuclear de evolução lenta, contribuiu para a identificação de incongruências citonucleares. Nossos resultados mostram que a história filogenética de Trachycephalus é complexa e que o uso de marcadores nucleares de evolução mais rápida e ampliação dessas análises para outras espécies do gênero podem revelar mais eventos de hibridização. / Hybrids are evolutionary units generally without clear morphological, behavioral and genetic delimitation, thus representing a challenge to taxonomy and systematics. They can morphologically resemble their parents or, due to introgression, their characteristics can be diluted with a prevailing appearance of one of the parental species, which could hinder identification. One way to identify hybrids is through molecular biology tools, such as mitochondrial DNA (maternal inherintance exclusively) and nuclear DNA (maternal and paternal inheritance), allowing genetic comparisons. Besides hybridization, conflicting mtDNA and nDNA identifications may have other explanations, such as Incomplete Lineage Sorting. Some individuals collected in localities of Espírito Santo State, Brazil, presented a mix of morphological characters of T. mesophaeus and T. nigromaculatus, which are the only Trachycephalus species known to the region. However, previous studies using COI sequences grouped theses individuals as T. typhonius. Giving this, we sequenced fragments of two mitochondrial genes (COI and ND2) and part of the nuclear exon of tyrosinase of 173 individuals of Trachycephalus, in order to better clarify the taxonomic uncertainty, and the link between morphological and genetic characters behind the identifications, according to the occurrence area. Results of molecular phylogenies, genetic divergences, haplotype networks, and single nucleotide polymorphisms (SNPs) confirmed .T. mesophaeus, T. nigromaculatus, and T. typhonius as distinct evolutionary lineages and revealed seven more individuals potentially hybrids, but morphologically assigned to one species. Due to the slow mutation rate of tyrosinase, the most recently diverged species (T. typhonius and T. nigromaculatus) have not completely sorted in this gene. Trachycephalus mesophaeus is the oldest species of the three, and it was identified unambiguously in all analysis. Here, for the first time, evidence of bidirectional introgression between T. nigromaculatus and T. typhonius and between T. nigromaculatus and T. mesophaeus, with signs of F1 individuals, is presented. The use of ND2 gene seems to be more efficient than COI to recover the phylogenies in this particular group and, although tyrosinase is a slow evolving gene, it contributed significantly in order to identify cytonuclear incongruences. Our results indicate a complex phylogenetic history of Trachycephalus, and that more introgressive hybrids may be identified with the use of faster nuclear markers and the inclusion of more species of the genus in the analyses..

Programa de Pós-Graduação em Ecologia de Biomas Tropicais. Departamento de Biodiversidade, Evolução e Meio Ambiente, Instituto de Ciências Exatas e Biológicas, Universidade Federal de Ouro Preto. / Submitted by Marise Leite (marise_mg@yahoo.com.br) on 2016-03-02T15:07:07Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) DISSERTAÇÃO_CaracterizaçãoEcológicaAnfíbios.pdf: 2118285 bytes, checksum: 7784762a99afdf791c527d8314ec8692 (MD5) / Approved for entry into archive by Oliveira Flávia (flavia@sisbin.ufop.br) on 2016-04-11T14:23:42Z (GMT) No. of bitstreams: 2 DISSERTAÇÃO_CaracterizaçãoEcológicaAnfíbios.pdf: 2118285 bytes, checksum: 7784762a99afdf791c527d8314ec8692 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2016-04-12T19:38:57Z (GMT). No. of bitstreams: 2 DISSERTAÇÃO_CaracterizaçãoEcológicaAnfíbios.pdf: 2118285 bytes, checksum: 7784762a99afdf791c527d8314ec8692 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2014 / As espécies colonizadoras precisam ter características que permitam que cheguem ao local e se mantenham com os recursos e condições ali existentes. Dentre os anfíbios, ocorrem espécies com diferentes capacidades para colonizar ambientes alterados por ação antrópica. Esses animais podem ser utilizados para avaliar a efetividade de áreas a partir de suas características ecológicas. O presente estudo foi realizado em matas ciliares reflorestadas no Cerrado, localizadas no entorno do reservatório da usina hidrelétrica de Volta Grande, entre os estados de São Paulo e Minas Gerais. A mata ciliar nativa foi inundada para a formação da represa. Entre 10 e 30 anos, o entorno das áreas inundadas foi reflorestado e, atualmente, estas áreas de mata ciliar reflorestadas estão isoladas de remanescentes florestais por matrizes agrícolas. O objetivo do presente estudo foi analisar as espécies de anuros que conseguiram colonizar as matas ciliares reflorestadas, utilizando como parâmetros aspectos da paisagem local, bem como da ecologia e da história natural das espécies. Foram amostrados cinco fragmentos ciliares reflorestados entre março de 2013 e janeiro de 2014. As coletas se deram por armadilhas de pitfall, instaladas no interior das matas ciliares, e por procura ativa no período noturno associada à zoofonia, nas áreas do entorno desses fragmentos. Como resultados, as matas ciliares reflorestadas da represa Volta Grande contribuem para a conservação de 21 espécies. Não foram encontradas espécies endêmicas ou dependentes de matas ciliares. As espécies capazes de colonizar estas áreas são predominantemente resistentes à alteração antrópica, com ampla distribuição geográfica; habitat generalistas e apresentam modo reprodutivo característico de áreas abertas e ambientes lênticos. Sendo assim, os aspectos predominantes da ecologia e história natural das espécies colonizadoras podem ser utilizados para comparações em estudos futuros em matas ciliares reflorestadas. O tipo de matriz exerceu influência somente sobre a abundância da anurofauna na área com matriz seringal, enquanto a composição diferiu entre as cinco áreas. Nas menores áreas reflorestadas, foram encontrados os menores valores de equitabilidade, provavelmente em função do efeito de borda. Dessa forma, é reforçada a importância da largura da mata ciliar e conectividade com matas ciliares nativas para que apresentem melhor distribuição da abundância entre as espécies e tenham um ambiente que seja fonte de espécies típicas de mata ciliar.

Made available in DSpace on 2016-02-05T18:29:52Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-03-30. Added 1 bitstream(s) on 2016-02-05T18:33:56Z : No. of bitstreams: 1 000856906_20200330.pdf: 252372 bytes, checksum: 02c2741a36d6004e8b4bc263260ac6f2 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / O gênero Adenomera é composto por 16 espécies, das quais seis possuem distribuição restrita à Mata Atlântica. O grupo apresenta uma taxonomia complicada por apresentar espécies crípticas, com alto grau de polimorfismo intraespecífico e interespecífico. Recentemente, uma análise filogenética extensa, abrangendo grande parte da distribuição das espécies do gênero, 35 espécies candidatas foram propostas; 16 na Mata Atlântica. No presente trabalho, propomos testar se as espécies candidatas distribuídas na Mata Atlântica compõem um grupo monofilético. Usando uma abordagem interativa com dados diretos de morfologia externa e bioacústica, pudemos delimitar espécies dentro dos clados Thomei e Marmorata. A maior amostragem dados fenotípicos e de um fragmento do gene 16S de indivíduos da Mata Atlântica na análise, permitiu inferir com maior confiança que as espécies distribuídas na Mata Atlântica compõem um grupo monofilético (clados Thomei + Marmorata), irmão do clado Hylaedactyla + Martinezi. O material adicional nos permitiu delimitar e redescrever duas espécies previamente consideradas como um complexo de espécies (Adenomera marmorata e A. bokermanni). Das 16 espécies candidatas do clado Mata Atlântica previamente sugeridas, pudemos delimitar apenas 10 espécies sendo sete já conhecidas e três novas para a Ciência. / The genus Adenomera has 16 species, six of which are Atlantic Forest dwellers. The genus has a difficult taxonomy, mostly due to the high levels of intra and interspecific polymorphism. Recently, a phylogenetic analysis using samples collected through the whole geographic distribution of the genus (roughly tropical and temperate cis-Andean South America) suggested the existence of 35 candidate species; 16 of which being Atlantic Forest dwellers.The present contribution intends to test whatever the Atlantic Forest dwellers are a monophyletic unit. An integrative approach with directly observed data on morphology and bioacoustics allowed species delimitation within the Thomei and Marmorata Clades. Based on a denser sampling of phenotipic and 16S rRNA fragments, we recovered the Atlantic Forest dwellers are a monophyletic unit, with two major clades (Thomei + Marmorata) and sister to the Hylaedactyla + Martinezi clade. The additional material allowed the delimitation and redescritpion of two species previously understood as species complexes (Adenomera marmorata and A. bokermanni). Of the 16 Atlantic Forest dwellers candidate species, we could delimit only 10; seven of those assignable to previously described species / FAPESP: 10/515606-8

Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia Animal, 2015. / Submitted by Ana Cristina Barbosa da Silva (annabds@hotmail.com) on 2015-06-29T14:35:46Z No. of bitstreams: 1 2015_AnaCarolinadeOliveiraRamalho_Parcial.pdf: 8063331 bytes, checksum: c003ccb92b9e67879823f53d6b4c2b0e (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana(raquelviana@bce.unb.br) on 2015-06-29T15:49:06Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2015_AnaCarolinadeOliveiraRamalho_Parcial.pdf: 8063331 bytes, checksum: c003ccb92b9e67879823f53d6b4c2b0e (MD5) / Made available in DSpace on 2015-06-29T15:49:06Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2015_AnaCarolinadeOliveiraRamalho_Parcial.pdf: 8063331 bytes, checksum: c003ccb92b9e67879823f53d6b4c2b0e (MD5) / Quitridiomicose é uma doença infecciosa emergente causada pelo fungo quitrídeo Batrachochytrium dendrobatidis e é responsável por declínios em populações de anfíbios em diversos lugares do mundo. O presente trabalho reporta o primeiro registro do fungo B. dendrobatidis em anfíbios de vida livre do Cerrado do Brasil Central e investiga a influência das características ecológicas das espécies e suas relações de parentesco nos parâmetros de infecção, em uma comunidade de anuros do Cerrado. Uma hipótese filogenética foi usada para testar a presença de sinal filogenético nesses parâmetros. Não foi detectada influência das distâncias filogenéticas sobre os parâmetros de infecção. Por outro lado, o tamanho e o peso corporal, o local de desova, o tipo de ninho, o modo reprodutivo e o índice aquático foram importantes preditores na prevalência e intensidade da quitridiomicose. A proximidade com a água parece ser um ponto chave na susceptibilidade dos anfíbios à infecção e as altas temperaturas do Cerrado e o período de baixa precipitação podem atuar como fatores limitantes ao desenvolvimento do fungo. ______________________________________________________________________________________________ ABSTRACT / Chytridiomycosis is an emergent infectious disease caused by the chyrid fungus Batrachochytrium dendrobatidis and is responsible for worldwide declines of amphibian populations. The current work reports the first record of B. dendrobatidis in free-living amphibians from Brazilian Cerrado and investigates the role of species traits and their phylogenetic relationships on infection parameters, in an anuran community in the Cerrado. An ensemble phylogenetic hypothesis was used to test for phylogenetic signal in these parameters. We found no influence of phylogenetic distances upon infection parameters. Conversely, body size and weight, spawning site, type of nest, reproductive mode and the aquatic index were important predictors of the prevalence and intensity of chytridiomycosis. The association with water seems to be a key point in the susceptibility of amphibians to infection and the high temperatures of the Cerrado and the period of low rainfall can act as limiting factors to the development of the fungus.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Ecologia, 2015. / Submitted by Fernanda Percia França (fernandafranca@bce.unb.br) on 2016-01-28T11:26:05Z No. of bitstreams: 1 2015_MarianaGarcezStein.pdf: 14262578 bytes, checksum: e78acb50d466bd267f079a5b032b4c9d (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana(raquelviana@bce.unb.br) on 2016-02-04T17:07:20Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2015_MarianaGarcezStein.pdf: 14262578 bytes, checksum: e78acb50d466bd267f079a5b032b4c9d (MD5) / Made available in DSpace on 2016-02-04T17:07:20Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2015_MarianaGarcezStein.pdf: 14262578 bytes, checksum: e78acb50d466bd267f079a5b032b4c9d (MD5) / A busca por padrões de distribuição dos organismos é uma das questões centrais da biologia. A Biogeografia é a ciência que busca identificar esses padrões assim como os processos que levaram a formação dos mesmos. A Caatinga é único bioma exclusivamente brasileiro e embora historicamente descrito como homogêneo e sem biota própria, atualmente sabe-se que é um bioma heterogêneo e que apresenta regiões de elevado endemismo. Apesar disso, trata-se do bioma menos estudado e conservado do país. Este trabalho teve como objetivo identificar e compreender os padrões de distribuição dos anuros na Caatinga, utilizando ferramentas de modelagem de distribuição de espécies, análise de endemicidade e análise de agrupamento. Os resultados mostraram que há uma de escassez de informações sobre a distribuição geográfica dos organismos. Apesar disso, elevadas áreas de riqueza foram encontradas e se localizaram principalmente na região leste do bioma e na Chapada Diamantina. Entre as áreas de endemismo obtidas no estudo destacam-se a área referente a Caatinga e outra localizada na Chapada Diamantina. A Caatinga mostra-se ainda como um bioma heterogêneo, dividido em seis grupos pela análise de agrupamento. Os grupos obtidos se mostraram distintos da divisão da Caatinga em ecorregiões. Assim, estudos de conservação de anfíbios no bioma não devem ser baseados na divisão do bioma em ecorregiões, pois as mesmas não representam a distribuição dos anfíbios no bioma. ______________________________________________________________________________________________ ABSTRACT / The search for organism distribution patterns is one of the central questions in biology studies. The science that seeks to identify these patterns, as well as the processes that led to them, is called Biogeography. Caatinga is the only exclusively Brazilian biome and, although historically described as homogeneous and without unique biota, it is now considered a heterogeneous biome, with high endemism regions. Nevertheless, it is the least studied and conserved biome in the country. This study aimed to identify and understand the distribution patterns of anurans in Caatinga, using species distribution modeling, endemicity, and cluster analysis. The results showed that there is a scarcity of information on the geographical distribution of organisms. However, we found high richness areas, located mainly in the eastern part of the biome and in Chapada Diamantina region. Among the endemism areas observed in this study, both the area regarding the entire biome and the one located in Chapada Diamantina stood out. We also perceived that Caatinga is a heterogeneous biome, divided into six groups by cluster analysis. The obtained groups were distinct from the ecoregions suggested as a division of Caatinga. Therefore, amphibian studies and actions for their conservation in the biome should not be based on classical division in ecoregions, because they do not represent the real distribution of amphibians in the biome.

Orientador: Classius de Oliveira / Banca: Marta Verardino de Stéfani / Banca: Selma Maria Almeida Santos / Resumo: O sistema pigmentar extracutâneo é composto por células pigmentares sendo a mais conhecida denominada melanócito, são células grandes e irregulares e no seu conteúdo citoplasmático é que estão os pigmentos (melanina) armazenados em grânulos denominados melanossomos, sendo a própria célula que sintetiza esses pigmentosos. Os melanócitos são encontradas em diversos órgãos como rins, baço, testículos, fígado, porções do intestino, encéfalo, ouvido, peritônio e ainda em volta de vasos sanguíneos e nervos. Com esta pesquisa foi descrita a pigmentação visceral padrão de três espécies de anuros: Physalaemus cuvieri, Dendropsophus nanus e Rhinella schneideri e observado se existe alguma alteração no sistema pigmentar extracutâneo das espécies submetidas a variações no fotoperíodo (longo-20 horas claro e curto-4 horas claro) e temperatura (alta-35ºC e baixa-10ºC). Esses parâmetros foram avaliados separadamente utilizando-se para cada um deles 9 animais de cada espécie capturados na região de São José do Rio Preto - SP. Dos 9 animais capturados 3 foram em seguida analisados (grupo controle). Os outros 6 animais foram colocados em uma estufa tipo B.O.D., separados em terrários individuais onde, após 3 dias, 3 deles foram sacrificados e analisados, os outros 3 animais foram sacrificados após 8 dias do início do experimento para suas análises. Nas analises os animais tinham os órgãos expostos para identificar os órgãos que possuíam pigmentação, bem como seu padrão de intensidade que seguiu uma escala de 4 categorias sendo que a categoria número 0 referente à órgãos sem nenhum pigmento e a número 3 órgãos intensamente pigmentados, com 2 estágios intermediários progressivamente mais pigmentados. Os órgãos analisados foram: coração, pericárdio e vasos da base, fígado, baço, peritônio, estômago, intestino e mesentério, reto... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The present investigation examined the extracutaneous pigmentation pattern of three species of anuran amphibians, Dendropsophus nanus, Physalaemus cuvieri, and Rhinella schneideri, during the course of their breeding seasons. Pigmentation intensity in the different organs was graded on a 4-category scale, in which category 0 refers to organs without pigment and category 3 refers to intensely pigmented organs, with 2 intermediate stages of progressively stronger pigmentation. Rhinella schneideri showed testicular pigmentation, with intra-specific variation (categories 0 and 1). In P. cuvieri there was variation in the presence of pigmentation in the lungs: all the animals showed pigmentation (category 1) at the beginning of the breeding season, and as the season progressed the absence of pigments became the most common pattern. In the liver of the first animals collected, the pigment intensity was high (category 2) with many iridophores present, but in the last specimens collected no iridophores were found. The variation in D. nanus occurred in the kidneys, where animals collected at the beginning of the season did not show pigmentation. Renal veins displayed few melanocytes (category 1); animals collected at the end of the season showed more pigmentation in the kidney (category 2), whereas in the renal veins the intensity remained the same. The changes observed in the extracutaneous pigment system in some organs, during the reproductive period, may be due to physiological alterations or may represent a speciesspecific characteristic. / Mestre

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:22:57Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-02-24Bitstream added on 2014-06-13T19:49:21Z : No. of bitstreams: 1 almeida_hj_me_sjrp.pdf: 760562 bytes, checksum: 3990a9566c6c626d3c9aa06da14b06bf (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / A diversidade local de espécies pode ser regulada por fatores locais (como competição, perturbação, condições abióticas, dispersão) e regionais (como a história climática, evolução e migração). O objetivo deste estudo foi entender quais fatores locais e da paisagem melhor explicam os padrões de distribuição de espécies de anuros. O estudo foi desenvolvido na região noroeste do Estado de São Paulo, entre julho de 2007 e fevereiro de 2009, empregando duas metodologias de amostragem: 1) armadilhas de interceptação e queda, instaladas no interior de 18 fragmentos florestais, e 2) procura auditiva e visual em 64 corpos d’água da região. Das 37 espécies conhecidas para esta região, 30 foram registradas neste estudo, sendo 13 no interior dos fragmentos florestais e 29 nos corpos d’água. A eficiência de amostragem foi avaliada por rarefação da curva do coletor. A curva do coletor atingiu a assíntota, indicando que para encontrarmos mais uma espécie o efeito amostral deveria ser muito intensificado. Modelos lineares generalizados (GLM) e análise de ordenação foram aplicados aos dados dos fragmentos florestais, incluindo uma variável espacial (coordenadas geográficas) como preditor de riqueza e composição além das variáveis ambientais que descrevem os fragmentos florestais. Para verificar qual variável ou conjunto de variáveis explicam a riqueza e composição de espécies observadas nos corpos d’água, foram aplicadas análises de regressão linear e correlação de matrizes. Se um efeito significativo fosse detectado, isso indicaria que a riqueza e composição de espécies dos fragmentos florestais e/ou corpos d’água seriam formadas por processos de seleção de habitat. Os resultados indicam que nem as características nem a sua localização geográfica dos fragmentos tem efeito significativo... / Species local diversity can be regulated by local (such as competition, disturbance, abiotic conditions) and regional factors (climate history, evolution and migration). The aim of this study was understand which local and landscape factors best explain the distribution patterns of anuran species. The study was developed in the northwestern São Paulo State between july 2007 and february 2009, using two sampling methods: 1) pitfall traps, installed in the interior of 18 forest fragments, and 2) hearing and visual search in 64 ponds located around the forest fragments. We registered 30 of the 37 known species to the study region: 13 in the interior of forest fragments and 29 in ponds. A rarefaction curve was used in the assessment of the sampling efficiency and results indicate that sampling effort should be highly intensified in order to find one more species. We characterize forest fragments and ponds by measuring five and ten environmental variables, respectively. These environmental variables were used as predictors of richness and composition of these habitats. General Linear Models (GLM) and ordination analysis were applied to the forest fragments data, which includes a spatial variable (geographic coordinates) as a predictor of richness and composition besides environmental variables that describe the forest fragments. In order to verify which variable or set of variables would explain the observed species richness and composition in ponds, it was applied linear regression and matrices correlation to the data. If a significant effect was detected, this would indicate that species richness and composition of the forest fragments and/or ponds are shaped by habitat selection processes. Results indicate that neither the fragments characteristics nor their location have significant effect over the species... (Complete abstract click electronic access below)

Orientador: Denise de Cerqueira Rossa Feres / Coorientador: Célio Fernando Baptista Haddad / Banca: Fernando Rodrigues da Silva / Banca: Paula Cabral Eterovick / Banca: Mateus Ferrareze Feitosa / Banca: Ricardo Janini Sawaya / Resumo: O objetivo geral deste estudo foi analisar a diversidade e a estrutura da comunidade de anuros em área de Mata Atlântica no Parque Nacional da Serra da Bocaina. As questões abordadas neste trabalho estão organizadas em quatro capítulos: Capítulo 1, i) as espécies apresentam distribuição sazonal? ii) Quais os fatores climáticos que mais influenciam a distribuição temporal das espécies? iii) Ocorre uma sobreposição no uso do hábitat entre as espécies? iv) Há uma variação espécie-específica no uso do hábitat devido a diferenças na heterogeneidade ambiental?; Capítulo 2, i) Há uma diferença no número de modos reprodutivos entre áreas abertas e a floresta? ii) A diversidade de modos reprodutivos nos ambientes lênticos está relacionada à heterogeneidade ambiental?; Capítulo 3, i) Qual a importância relativa da filogenia e fatores ambientais nos parâmetros do canto dos anuros? ii) A sobreposição nos parâmetros do canto difere do esperado ao acaso em espécies que co-ocorrem?; Capítulo 4, i) As variáveis climáticas e a altitude são preditoras da riqueza nas comunidades de anfíbios em Floresta Ombrófila Densa? ii) Os fatores espaciais são mais importantes que os ambientais na diversidade beta? Para responder as questões dos três primeiros capítulos foram monitorados, mensalmente, ambientes lênticos, localizados entre 1300 e 1600 metros de altitude, tanto no interior de floresta quanto em áreas de campo de altitude. Para responder as perguntas do quarto capítulo foi elaborada uma base de dados secundária compilada de publicações científicas e coleções científicas. No primeiro capítulo observamos que a distribuição temporal das espécies foi sazonal, com maior agregação durante o período mais quente e chuvoso do ano. A variação temporal na riqueza foi relacionada positivamente... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: My aim in this study was to analyze the diversity and community structure of anurans from a Atlantic rain forest in Serra da Bocaina National Park. For the sake of clarity, I divided the addressed questions into four chapters: Chapter 1, (i) Does species distribution respond to seasonality? (ii) Which are the most important climatic factors influencing temporal distribution of species? (iii) Is there an overlap in habitat use?; (iv) Does species have unique response to environmental heterogeneity?; Chapter 2, (i) Is there a variation in the number of reproductive modes between forested areas and montane grasslands? (ii) Is the number of reproductive modes in lentic habitats associated with either water body heterogeneity?; Chapter 3, (i) What is the relative influence of phylogeny and environmental factors (habitat and microhabitat use) on call parameters of anurans? (ii) Do co-occurring species differ in call parameters than expected at random?; Chapter 4, (i) Do climatic variables and altitude predict amphibian richness in communities along the Atlantic rain forest? (ii) Are spatial factors more important than environmental factors in driving beta diversity? To address the questions of the three first chapters, I monitored monthly lentic environments in forested and open areas, between 1,300 and 1,600 m a.s.l. To address the questions of the fourth chapter, I compiled a database from primary literature and specimen records of museums. In the first chapter, I found that the temporal distribution of species was seasonal, with higher species density during the warm and wet period of the year. The temporal variation in species richness was positively related to rainfall. However, species responded in an idiosyncratic way to climatic variables. The pattern spatial distribution of species richness... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Orientador: Reinaldo José da Silva / Coorientador: Luciano Alves dos Anjos / Banca: Max Rondon Werneck / Banca: Vanda Lucia Ferreira / Resumo: Os anfíbios ocupam grande variedade de microhabitats refletindo os diversos modos reprodutivos, estilos de vida e parasitas que estes animais apresentam. Os parasitas são indicativos de muitos aspectos biológicos de seus hospedeiros, incluindo a dieta, ocupação do habitat e a filogenia, podendo também ser bons indicadores diretos do estado de qualidade ambiental. A Ilha Anchieta, parque estadual em área de Mata Atlântica, torna-se interessante para estudos biológicos devido a sua dinâmica insular e isolamento geográfico. O objetivo deste estudo foi avaliar a fauna de helmintos de 195 anfíbios da Ilha Anchieta representados por 14 espécies, Flectonotus fissilis (n = 18), Haddadus binotatus (n = 9), Ischnocnema bolbodactyla (n = 4), Ischnocnema parva (n = 20), Rhinella ornata (n = 20), Dendrophryniscus brevipollicatus (n = 3), Hypsiboas albomarginatus (n = 18), Scinax hayii (n = 23), Hylodes asper (n = 2), Hylodes phyllodes (n = 3), Leptodactylus cf. marmoratus (n = 42), Leptodactylus latrans (n = 4), Chiasmocleis carvalhoi (n = 26) e Myersiella microps (n = 3). Foram identificadas pelo menos 14 espécies de helmintos entre as comunidades componentes dos anfíbios: 12 espécies de nematóides (Falcaustra mascula, Oxyascaris oxyascaris, Oswaldocruzia sp., Rhabdias sp., Physaloptera sp., Aplectana crucifer, Aplectana pintoi, Aplectana sp., Cosmocerca brasiliense, Cosmocerca parva, Cosmocerca travassosi e Cosmocerca sp.), uma espécie de cestóide (Cylindrotaenia cf. americana) e uma espécie de Acanthocephala (cistacantos). Este estudo apresenta uma revisão dessas espécies de helmintos com seus anfíbios hospedeiros até hoje relatados; a helmintofauna associada a estas espécies hospedeiras; e uma análise de similaridade das infracomunidades de algumas espécies de anfíbios, mostrando que o habitat pode influenciar na composição e abundância da comunidade parasita / Abstract: The amphibians use a variety of microhabitats, relationship with the various reproductive modes, life style and parasites that these animals presented. The parasites are indicatives about a lot of biological aspects of yours hosts, including feeding, use of habitat and phylogeny. They also may be good indicators about status of environmental quality. The Anchieta Island, state park in Atlantic Rain Forest area, is very interesting for biological studies because insular dynamics and geographical isolation. The aim of this study was to evaluate the helminth fauna of 195 amphibians from Anchieta Island representing 14 species, Flectonotus fissilis (n = 18), Haddadus binotatus (n = 9), Ischnocnema bolbodactyla (n = 4), Ischnocnema parva (n = 20), Rhinella ornata (n = 20), Dendrophryniscus brevipollicatus (n = 3), Hypsiboas albomarginatus (n = 18), Scinax hayii (n = 23), Hylodes asper (n = 2), Hylodes phyllodes (n = 3), Leptodactylus cf. marmoratus (n = 42), Leptodactylus latrans (n = 4), Chiasmocleis carvalhoi (n = 26), and Myersiella microps (n = 3). They were necropsied to examine for helminth parasites. We identified at least 14 helminths species in the component communities of anurans: 12 nematodes species (Falcaustra mascula, Oxyascaris oxyascaris, Oswaldocruzia sp., Rhabdias sp., Physaloptera sp., Aplectana crucifer, Aplectana pintoi, Aplectana sp., Cosmocerca brasiliense, Cosmocerca parva, Cosmocerca travassosi, and Cosmocerca sp.), one cestode species (Cylindrotaenia cf. americana), and one species of Acanthocephala (cystacanths). This study presents a revision about these helminth species with the related hosts to date; the helminth fauna associated to these host species; and the similarity about infracommunities of some amphibian species, showing habitat can influence on composition and abundance of parasite community / Mestre

Orientador: Fausto Foresti / Coorientador: José Carlos Pansonato Alves / Banca: Luciana Bolsoni Lourenço / Banca: Cláudio Ângelo Agostinho / Resumo: Variações populacionais são fatos relativamente frequentes em populações naturais que permitem inferir considerações sobre o caminho evolutivo e a estreita relação dos táxons com o ambiente. Dentre as espécies brasileiras, Proceratophrys moratoi (Anura, Cycloramphidae) é considerada endêmica do Estado de São Paulo e, nas últimas décadas, novas populações foram registradas, verificando-se sutis variações. Diante das novas populações e considerando o grau de importância que as mesmas apresentam para a compreensão da espécie, realizou-se neste trabalho um estudo da variação populacional da espécie com base em caracteres morfométricos, morfológicos e citogenéticos. Para tanto foram examinados 52 indivíduos componentes de cinco populações conhecidas de P. moratoi. Na comparação entre as populações foram utilizados 81 caracteres morfológicos e 15 morfométricos, somando 96 caracteres distintos. Os dados citogenéticos foram obtidos com o uso de técnicas de citogenética básica pela coloração com Giemsa, localização das regiões organizadoras de nucléolo (RONs) e localização da heterocromatina constitutiva. Os valores obtidos pela análise dos 15 caracteres morfométricos foram submetidos à Análise de Componentes Principais, resultando em dois componentes (PC1 e PC2) que permitiram contemplar 73% da variabilidade. A Análise dos Fatores Discriminantes foi significativa e permitiu a formação de três agrupamentos, sendo a população de Botucatu aquela que apresentou melhor estruturação e também a que apresentou valores das médias morfométricas menores em relação às amostras das demais localidades. Os caracteres morfológicos foram analisados através de uma matriz comparativa que permitiu identificar caracteres invariáveis, variáveis intra e inter-populacionalmente e... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Population variations are frequent facts in natural populations that permit to infer considerations about evolution trends and the close relationship between the species and the environment. Among Brazilian's species, Proceratophrys moratoi (Anuran, Cycloramphidae) is considered endemic in Sao Paulo State and in the last decades new populations have being registered showing such slightly variations. Face the new populations and considering the importance degree they represent for species understanding in this work a study of population variations was performed based on morphometric, morphological and cytogenetic characters. For it 52 individuals were examinaed and distributed into five populations of P. moratoi. In the comparison 81 morphological and 15 morphometric characters were used summing 96 distinct characters. The cytogenetic data were gotten using basic cytogenetics ( Giemsa coloration, NORs and Heterochromatin regions localization ( C-banding).The obtained values through the 15 morphometric characters were submitted under the Principal Components Analysis (PCA) and resulted in two components (PC1 e PC2) that permitted contemplating 73% of variability. The discriminating factors analysis was significant and permitted the three groups formation in which Botucatu's population was the best structured one and also the one that showed smaller morphometic averages related to other locations.The morphological characters were analyzed through comparative matrix that permitted to identify invariable characters, into and inter-populations variations, and punctual phenotypes. From the 81 morphological characters analyzed, 22 were invariable, 9 were punctual and 50 variable inter and intopopulations. From the 50 variations, 14 were regional ones ocurring only in one population and... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre