Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia Animal, 2007. / Submitted by Thaíza da Silva Santos (thaiza28@hotmail.com) on 2009-12-15T20:11:32Z No. of bitstreams: 2 2007_PedroIvoMolinaPellicano_2.pdf: 26121547 bytes, checksum: 4c9e5b6c56118d1b089f7938cf1d3693 (MD5) 2007_PedroIvoMolinaPellicano_1.pdf: 13112854 bytes, checksum: e7d6d26ab6ffbf3347401a3203f62b16 (MD5) / Approved for entry into archive by Daniel Ribeiro(daniel@bce.unb.br) on 2010-01-08T21:27:55Z (GMT) No. of bitstreams: 2 2007_PedroIvoMolinaPellicano_2.pdf: 26121547 bytes, checksum: 4c9e5b6c56118d1b089f7938cf1d3693 (MD5) 2007_PedroIvoMolinaPellicano_1.pdf: 13112854 bytes, checksum: e7d6d26ab6ffbf3347401a3203f62b16 (MD5) / Made available in DSpace on 2010-01-08T21:27:55Z (GMT). No. of bitstreams: 2 2007_PedroIvoMolinaPellicano_2.pdf: 26121547 bytes, checksum: 4c9e5b6c56118d1b089f7938cf1d3693 (MD5) 2007_PedroIvoMolinaPellicano_1.pdf: 13112854 bytes, checksum: e7d6d26ab6ffbf3347401a3203f62b16 (MD5) Previous issue date: 2007-06-29 / Os anfíbios aquáticos trazem consigo uma grande variedade de órgãos sensoriais específicos para a captação de determinado tipo de estímulo. A mecanorrecepção, provida pelos neuromastos, ou órgãos de linha lateral, é a modalidade sensorial responsável pela captação de estímulos vibratórios na água, o que facilita a orientação e a localização de presas. A olfação possui grande importância na comunicação intraespecífica, assim como na localização de presas, que juntamente com a gustação está associada à seleção de alimentos. A quimiorrecepção também ocorre na pele, provavelmente por ação de receptores sensíveis a diferenças de salinidade ou em resposta a feromônios sexuais. Além destes mecanismos, a pele de anfíbios apresenta receptores cutâneos difusos, que respondem a estímulos térmicos, mecânicos, proprioceptivos e nocivos. Anuros do gênero Pipa apresentam na extremidade de seus dígitos estruturas hemisféricas, que sugerem ter alguma função sensorial. O presente trabalho teve por objetivos descrever a organização anatômica dos nervos que compõem o plexo braquial, a morfologia microscópica e ultra-estrutural das terminações distais dos dígitos e avaliar as respostas fisiológicas dessas estruturas a diferentes modalidades de estímulos físicos e químicos, utilizando-se como modelo a espécie Pipa carvalhoi. Os estudos anatômicos mostraram que a organização do plexo braquial de representantes de Pipidae se dá de forma diferente dos demais anuros, especialmente pelo fato do quarto nervo espinhal ser mais calibroso do que nos demais anuros. Esta diferença anatômica reflete uma maior participação de fibras sensoriais na composição desse nervo, o que se depreende pela expressiva inervação da pele, dos órgãos de linha lateral e das extremidades digitais. Alguns ramos do plexo braquial inervam, ainda, a musculatura axial e a musculatura apendicular desses animais. De fato, o repertório motor dos membros anteriores apresentado por pipídeos é considerado bastante simples e primitivo. As extremidades dos dígitos de P. carvalhoi são sustentadas por estruturas cartilaginosas. Quatro feixes de nervo chegam aos dígitos e se ramificam paralelamente quando atingem as papilas digitais. A extremidade distal apresenta terminações nervosas livres que não invadem o epitélio. A superfície das papilas é recoberta por células epiteliais queratinizadas, sem estruturas que indiquem a presença de microvilosidades, de células ou de um órgão sensorial, como os neuromastos. Os ensaios fisiológicos realizados não permitiram definir a natureza sensorial das papilas digitais. Estímulos de diversas naturezas não produziram respostas detectáveis no nervo braquial. O insucesso nestes experimentos pode estar relacionado ao fato do método empregado no presente trabalho ser inadequado para obter tal resposta. Embora as papilas digitais de Pipa sejam citadas na literatura, o presente trabalho foi a primeira tentativa de descrevê-las em seus aspectos morfológico e fisiológico. As características morfológicas e ultra-estruturais das papilas digitais e das fibras que as inervam sugerem que esta região desempenha percepção de estímulos térmicos e vibratórios. Isto pode ser bastante importante na percepção do meio, visto que estes animais passam a maior parte do tempo submersos e em contato com o substrato. _______________________________________________________________________________ ABSTRACT / Aquatic anurans usually have a great diversity of stimuli-specific sensory organs. TheMechanoreceptionisthesensorymodalitywhichplaysanimportantroleonThe Mechanoreception is the sensory modality which plays an important role on orientation and prey detection. Thissenseisfulfilledbythelaterallineorgans,usuallyThis sense is fulfilled by the lateral line organs, usually called neuromasts, by which the animal can perceive small movements underwater. Chemoreception is played both by gustatory and olfactory organs. TheperceptionofThe perception of molecules under water is important for intraespecific communication, sexual selection and prey catching, as well as food selection. ThefrogskinalsodisplayschemoreceptiveThe frog skin also displays chemoreceptive responses to certain stimuli, as salinity gradients, sexual pheromones and nociceptive chemical damages, due mainly to its permeability and to the presence of putative chemoreceptors beneath the epidermis. Besides,thereareothersensesdistributedBesides, there are other senses distributed especially in the frog skin. ThedermisisinnervatedbydifferenttypesofnervefibersThe dermis is innervated by different types of nerve fibers that respond to thermal, proprioceptive, mechanical and nociceptive stimuli. There are hemispherical sensory-like structures on the finger tips of the frogs from the genus Pipa. ThepresentstudyaimedtodescribetheanatomicalorganizationofthenervesthatThe present study aimed to describe the anatomical organization of the nerves that compose the brachial plexus, the microscopic and ultra-structural morphology of the finger tips and also evaluate the physiological responses to physical and chemical stimuli on these structures, using Pipa carvalhoi as a model species. AnatomicalobservationsshowedthatthebrachialplexusisdisplayeddifferentlyAnatomical observations showed that the brachial plexus is displayed differently in pipid frogs. The spinal nerve 4 is thicker and participates more effectively in the plexus, when compared to other anurans. This anatomical peculiarity suggests a major participation of sensorial fibers on the composition of this nerve, due to the significant innervation of the skin, lateral line organs and finger tips. Some branches of the brachial plexus innervate axial and appendicular musculature. Actually, the forearm motor repertory displayed by pipid frogs is considered simple and relatively primitive. The finger tips of Pipa carvalhoi are supported by cartilaginous star-like structures. Four bundles of nerve fibers reach the digits and spread in parallel smaller bundles as they reach the digital buds. TherearefreenerveendingsrestrictedinthedermisinthetopofThere are free nerve endings restricted in the dermis in the top of each digital bud. The surface of the buds is covered by smooth queratinized epidermal cells. There is no evidence of structures on it that indicate the presence of a discrete sensorial organ, not even specific sensorial ciliated cells. The physiological experiments did not suit the purpose of defining the sensorial modality of the digital buds. No stimulus has produced any detectable response in the brachial nerve. The failure of these experiments might be related with the fact that the method applied in the present study was totally inadequate to obtain this kind of response. The digital buds of Pipa are cited on literature. �However,thepresentstudywasHowever, the present study was the first attempt to give them a morphological and physiological description. The ultra-structural and morphological characteristics of the digital buds, as well as the nerve fibers that innervate them, suggest that this structure respond to thermical and vibratory stimuli, which might be very important for these animals when perceiving its surrounding environment, for they spend most of their daytime laying on the substratum beneath water ponds.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia Animal, 2008. / Submitted by Luana Patrícia de Oliveira Porto (luana_porto_23@hotmail.com) on 2010-03-12T20:33:00Z No. of bitstreams: 1 2008_MichelledaSilvaLiberio.pdf: 6096417 bytes, checksum: 5931809225d410af1726c5387c700412 (MD5) / Approved for entry into archive by Daniel Ribeiro(daniel@bce.unb.br) on 2010-05-12T18:28:38Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2008_MichelledaSilvaLiberio.pdf: 6096417 bytes, checksum: 5931809225d410af1726c5387c700412 (MD5) / Made available in DSpace on 2010-05-12T18:28:38Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2008_MichelledaSilvaLiberio.pdf: 6096417 bytes, checksum: 5931809225d410af1726c5387c700412 (MD5) Previous issue date: 2008 / Atualmente, o surgimento de resistência às drogas disponíveis no mercado pelos microorganismos e pelas células de câncer tornou o desenvolvimento de novas formas terapêuticas imprescindível. A secreção cutânea dos anfíbios é uma rica fonte natural de peptídeos com atividades anticarcinogênica (PAC) e antimicrobiana (PAM). Entretanto, o veneno desses animais também é constituído de outras macromoléculas, por exemplo, enzimas, as quais têm sido pouco investigadas. O presente estudo teve como objetivo caracterizar, de forma geral, a secreção glandular da rã-pimenta Leptodactylus labyrinthicus. Especificamente, buscou-se identificar e caracterizar química e biologicamente alguns dos peptídeos presentes, além de investigar a presença de atividades enzimáticas. O estudo revelou a ocorrência de inúmeros peptídeos e proteínas, demonstrando a riqueza e o potencial biológico desse veneno. Os dois peptídeos antimicrobianos purificados foram fallaxin e pentadactylin, os quais já haviam sido isolados de outras espécies do gênero Leptodactylus. Ambos apresentaram atividade contra bactérias Gram-positivas e Gram-negativas; e fallaxin foi identificado como fracamente hemolítico. Como vários PAMs de amplo espectro de ação também são citotóxicos para células de câncer, os dois peptídeos isolados foram testados contra as linhagens celulares de câncer HeLa, MCF-7 e B16F10, demonstrando-se efetivos contra todas as linhagens. Observou-se também que os dois PACs são pouco seletivos, pois foram mais tóxicos para células normais de fibroblasto (FHN) do que para as células tumorais. Portanto, o uso terapêutico desses PACs deverá ser via estratégias que aumentem a especificidade dos mesmos. Os estudos de mecanismo de ação com pentadactylin não foram conclusivos, sugerindo a morte de células de MCF-7 via apoptose, podendo ser seguida pelo processo necrótico. Além desses, o fragmento Flx-16 de fallaxin e o peptídeo PGL-Ll, rico em glicina e leucina, foram testados, contudo nenhuma atividade biológica foi detectada. A investigação da atividade enzimática da secreção revelou a presença de enzimas proteolíticas pertencentes aos clãs das metalo- e serino-peptidases e que atuam de maneira ótima em pH neutro a ligeiramente básico; e de fosfolipases do tipo A2. O estudo e caracterização da composição da secreção cutânea de anfíbios são de extrema relevância, podendo ajudar a esclarecer questões taxonômicas, identificar drogas terapêuticas em potencial, além de auxiliar no entendimento da biologia dos anfíbios. _________________________________________________________________________________ ABSTRACT / Nowadays, the emergence of resistance to the current available chemotherapeutic drugs by microorganisms and cancer cells make the development of new agents imperative. The skin secretion of amphibians is a natural rich source of antimicrobial (PAM) and anticancer peptides (PAC). Nevertheless, the venom of these animals is also composed by other macromolecules, such as enzymes, which have not been studied extensively yet. The aim of this study was to characterize the glandular secretion of the pepper-frog Leptodactylus labyrinthicus, targeting to identify and characterize chemically and biologically some of the peptides present, besides detecting enzymatic activities. The research has found a variety of peptides and proteins, showing the richness and the biological potential of this venom. Two PAMs were purified, fallaxin and pentadactylin, which have already been isolated from other species of the genus Leptodactylus. Both peptides were active against Gram-positive and Gram-negative bacterias; moreover, fallaxin showed a weak hemolytic activity. As some PAMs of broad spectrum of action are also toxic to cancer cells, the two peptides isolated were tested against the cancer cell lines HeLa, MCF-7 and B16F10, being effective against all of them. We noticed that both PACs aren’t specific, since they have been more toxic to normal fibroblast cells (FHN) than to tumor cells. Therefore, it is mandatory that the therapeutic use of these PACs be accompanied by strategies that enhance their selectiveness. The studies of action mechanism with pentadactylin were not conclusive, suggesting that MCF-7 cells die by apoptosis; however it may be followed by necrosis. The peptide PGL-Ll, rich in glycine and leucine, and the fragment Flx-16 from fallaxin were tested, though no biological activity was found. The research of enzyme activity of the secretion revealed the presence of proteolytic enzymes of the clans metallo- and serine-peptidases, and that they act optimally at neutral to slightly basic pH, and of phospholipases A2. The study and characterization of the skin secretion of amphibians is of extreme relevance, helping to elucidate taxonomic issues, identifying putative therapeutic drugs, besides helping to understand the biology of amphibians.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Biologia Celular, 2010. / Submitted by Fernanda Weschenfelder (nandaweschenfelder@gmail.com) on 2010-11-16T17:45:46Z No. of bitstreams: 1 2010_EderAlvesBarbosa.pdf: 2016959 bytes, checksum: d0a01e4a8d5a19d2073a2e7c900a90a8 (MD5) / Approved for entry into archive by Daniel Ribeiro(daniel@bce.unb.br) on 2010-11-16T22:59:58Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2010_EderAlvesBarbosa.pdf: 2016959 bytes, checksum: d0a01e4a8d5a19d2073a2e7c900a90a8 (MD5) / Made available in DSpace on 2010-11-16T22:59:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2010_EderAlvesBarbosa.pdf: 2016959 bytes, checksum: d0a01e4a8d5a19d2073a2e7c900a90a8 (MD5) / O presente trabalho descreve um modelo experimental que permite avaliar as alterações nos níveis de transcrição de RNAs, síntese e processamento de peptídeos presentes nas secreções cutâneas de anfíbios. A partir deste modelo, foram utilizadas ferramentas de biologia molecular em associação com técnicas de obtenção de imagens moleculares por espectrometria de massa, com o objetivo de avaliar como Hypsiboas raniceps reage a um modelo experimental no qual anfíbios são submetidos a diferentes tipos de estresses (bióticos e abióticos). A utilização das técnicas de biologia molecular conjugadas a imagens de íons moleculares por espectrometria de massa permitiu as análises dos níveis de transcrição de diversos genes, assim como da síntese dos peptídeos codificados a partir destes, em uma mesma região do tecido animal. Os resultados sugerem que a aplicação do estímulo elétrico (estresse abiótico) promove um aumento imediato dos níveis de transcrição dos genes e seus respectivos peptídeos antimicrobianos em H. raniceps o qual se estende por até 36 horas, período no qual as glândulas granulares tornam-se carregadas de peptídeos novamente e os níveis de transcrição voltam a diminuir. De forma análoga aos dados anteriores, a presença de micro-organismos (Estresse biótico) na pele de H. raniceps parece estimular o sistema imune inato de defesa ao promover o aumento dos níveis de transcrição dos genes que codificam peptídeos antimicrobianos. Sob condições experimentais complementares às anteriores, anfíbios submetidos ao contato tópico com os antibióticos, oxacilina, gentamicina e ampicilina, apresentaram níveis de expressão gênica superiores àqueles dos anfíbios que foram expostos unicamente a micro-organismos. O modelo experimental proposto apresenta-se como uma estratégia alternativa para estudos de análise da expressão diferencial de peptídeos em tecidos biológicos. _________________________________________________________________________________ ABSTRACT / The present work describes a strategy for in situ identification of antimicrobial peptides present in frog skin, their respective RNA transcription levels and peptide synthesis variation analysis. The chosen experimental model is based on molecular biology and imaging mass spectrometry (IMS) techniques to investigate the antimicrobial peptide skin composition of Hypsiboas raniceps when the anuran is submitted to biotic and abiotic stress. Under a mild electrical shock stimulation high transcriptional levels of RNA encoding antimicrobial peptides can be observed for 36 hours, only after that antimicrobial peptides ions are detected by IMS experiments whereas the transcriptional levels decrease. When the animals are exposed to pathogenic microorganisms (biotic stress) there is an evident increase in gene expression levels leading to a corresponding increment on antimicrobial polypeptide content in the skin. In a complementary experiment, frogs were washed with an antibiotic solution, containing oxacillin, gentamicin and ampicilin. Under this conditions superior RNA expressions levels than the previous experiments were observed suggesting that the microorganism-based molecules that composed the antibiotic solution may have triggered the defense mechanism more efficiently. The experimental model introduced here represents an alternative strategy for differential gene expression analysis and peptides identification directly on biological tissue.

Orientador: Luciano Alves dos Anjos / Coorientador: Reinaldo José da Silva / Resumo: A referida tese é o resultado de um trabalho que buscou discutir, como tema geral, o impacto que os parasitas podem causar na ecologia de seus hospedeiros. Ela foi divida em dois capítulos: o primeiro capítulo é uma revisão bibliográfica que discute sobre como os parasitas podem influenciar no desempenho reprodutivo de seus hospedeiros; e o segundo capítulo investigou em três espécies de anfíbios anuros (Leptodactylus chaquensis, Leptodactylus podicipinus, e Hypsiboas raniceps), se os indivíduos parasitados por helmintos são acometidos por alterações em aspectos da reprodução. As três espécies de anuros estudadas, não apresentaram evidências que possam ter alguma relação entre a intensidade parasitária de helmintos e caracteres morfológicos associados à reprodução. O que sugere que estas espécies estudadas apresentem respostas imunológicas e/ou adaptações fisiológicas mediante infecção parasitária. / Abstract: This thesis is the result of a work that sought to discuss, as a general theme, the impact that parasites can have on the ecology of their hosts. It was divided into two chapters: the first chapter is a literature review that discusses how the parasites can influence the reproductive performance of their hosts; and the second chapter investigated in three species of anuran amphibians (Leptodactylus chaquensis, Leptodactylus podicipinus, and Hypsiboas raniceps), if the individuals parasitized by helminths are affected by changes in aspects of reproduction. The three species of anurans studied didn't present evidence that could have any relation between the parasite intensity of helminths and morphological characters associated to reproduction. This suggests that these species studied present immunological responses and/or physiological adaptations through parasitic infection. / Doutor

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:22:57Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-02-21Bitstream added on 2014-06-13T20:10:13Z : No. of bitstreams: 1 jordani_mx_me_sjrp.pdf: 496922 bytes, checksum: 53192c339992141dcf9a964d92f8fe77 (MD5) / A história evolutiva das linhagens e as características ambientais são fatores conhecidos por influenciar a coexistência das espécies em uma comunidade. Ao longo da evolução, os atributos funcionais das espécies, que determinam a forma como as espécies utilizam os recursos, podem se diferenciar ou se manter semelhantes aos de seus ancestrais. As características abióticas promovem a seleção de espécies que possuam atributos que possibilitem sua sobrevivência sob um conjunto específico de condições ambientais. Nosso objetivo foi verificar se a ocorrência de girinos em poças está relacionada com as variáveis ambientais dos corpos d’água, o que indica a atuação de processos ecológicos como filtros ambientais ou competição, considerando as relações de parentesco entre as espécies. Esperamos que as diferenças nas características dos corpos d’água afetem os padrões de co-ocorrência de girinos e que espécies filogeneticamente próximas co- ocorram mais do que o esperado ao acaso. Amostramos girinos em 13 corpos d’águas lênticos no Parque Estadual da Serra do Mar – núcleo Picinguaba, entre setembro de 2011 e março de 2012. Testamos a influência do hidroperíodo dos corpos d’água, cobertura de dossel, temperatura e pH da água na co-ocorrência dos girinos. Inferimos a relação de parentesco entre os anuros presentes nas comunidades através de uma hipótese filogenética já proposta e obtivemos os comprimentos dos ramos em milhões de anos a partir das idades dos nós. Analisamos o efeito do ambiente e do parentesco sobre três padrões de co-ocorrência de espécies: agrupado, associado e mutuamente excludente. Nossos resultados indicam que as características dos corpos d’água influenciam fortemente a estruturação das comunidades de girinos. Nossos resultados demonstram que a influência... / The evolutionary history of lineages and the environmental characteristics are factors known for influencing the species coexistence in a community. Along evolution, functional traits of species, which determine the way species use resources, can differ or remain similar to their ancestors. Abiotic characteristics promote selection of traits that allow survival under a set of environmental conditions. Our objective was to verify whether the co-occurrence of tadpoles in ponds is related to environmental variables of water bodies, what indicates either ecological processes as environmental filters or competition, or to relatedness among species. We expect that differences in characteristics of the ponds affect the co-occurrence patterns of tadpoles and also that related species co-occur more than expected at random. We sampled tadpoles in 13 ponds at Parque Estadual da Serra do Mar – núcleo Pincinguaba, between September of 2011 and March of 2012.We tested the influence of the hydroperiod of the ponds, the canopy cover, water temperature and pH in co-occurrence of tadpoles. We determinedrelatedness between anurans present in communities through an already proposed topology and obtained the length of branches in millions of years from the age of the nodes. We analyzed the effects of habitat and species relatedness on three possible patterns of species co-ocorrence: clumping, togetherness and checkerboard. Our results show that environmental filters have strong influence in structuring communities. The gradient of canopy cover, hydroperiod and pH seem to be important environmental filters in habitat selection of species with togetherness and checkerboard co-occurrence patterns. Also, we detected the co-occurrence of pairs of closely related species in ponds with distinct environmental characteristics, evidencing... (Complete abstract click electronic access below)

Orientador: Denise de Cerqueira Rossa Feres / Banca: Paula Cabral Eterovick / Banca: Ricardo Jannini Sawaya / Resumo: A história evolutiva das linhagens e as características ambientais são fatores conhecidos por influenciar a coexistência das espécies em uma comunidade. Ao longo da evolução, os atributos funcionais das espécies, que determinam a forma como as espécies utilizam os recursos, podem se diferenciar ou se manter semelhantes aos de seus ancestrais. As características abióticas promovem a seleção de espécies que possuam atributos que possibilitem sua sobrevivência sob um conjunto específico de condições ambientais. Nosso objetivo foi verificar se a ocorrência de girinos em poças está relacionada com as variáveis ambientais dos corpos d'água, o que indica a atuação de processos ecológicos como filtros ambientais ou competição, considerando as relações de parentesco entre as espécies. Esperamos que as diferenças nas características dos corpos d'água afetem os padrões de co-ocorrência de girinos e que espécies filogeneticamente próximas co- ocorram mais do que o esperado ao acaso. Amostramos girinos em 13 corpos d'águas lênticos no Parque Estadual da Serra do Mar - núcleo Picinguaba, entre setembro de 2011 e março de 2012. Testamos a influência do hidroperíodo dos corpos d'água, cobertura de dossel, temperatura e pH da água na co-ocorrência dos girinos. Inferimos a relação de parentesco entre os anuros presentes nas comunidades através de uma hipótese filogenética já proposta e obtivemos os comprimentos dos ramos em milhões de anos a partir das idades dos nós. Analisamos o efeito do ambiente e do parentesco sobre três padrões de co-ocorrência de espécies: agrupado, associado e mutuamente excludente. Nossos resultados indicam que as características dos corpos d'água influenciam fortemente a estruturação das comunidades de girinos. Nossos resultados demonstram que a influência... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The evolutionary history of lineages and the environmental characteristics are factors known for influencing the species coexistence in a community. Along evolution, functional traits of species, which determine the way species use resources, can differ or remain similar to their ancestors. Abiotic characteristics promote selection of traits that allow survival under a set of environmental conditions. Our objective was to verify whether the co-occurrence of tadpoles in ponds is related to environmental variables of water bodies, what indicates either ecological processes as environmental filters or competition, or to relatedness among species. We expect that differences in characteristics of the ponds affect the co-occurrence patterns of tadpoles and also that related species co-occur more than expected at random. We sampled tadpoles in 13 ponds at Parque Estadual da Serra do Mar - núcleo Pincinguaba, between September of 2011 and March of 2012.We tested the influence of the hydroperiod of the ponds, the canopy cover, water temperature and pH in co-occurrence of tadpoles. We determinedrelatedness between anurans present in communities through an already proposed topology and obtained the length of branches in millions of years from the age of the nodes. We analyzed the effects of habitat and species relatedness on three possible patterns of species co-ocorrence: clumping, togetherness and checkerboard. Our results show that environmental filters have strong influence in structuring communities. The gradient of canopy cover, hydroperiod and pH seem to be important environmental filters in habitat selection of species with togetherness and checkerboard co-occurrence patterns. Also, we detected the co-occurrence of pairs of closely related species in ponds with distinct environmental characteristics, evidencing... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:30:55Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-03-16Bitstream added on 2014-06-13T20:21:23Z : No. of bitstreams: 1 garey_mv_dr_sjrp.pdf: 928441 bytes, checksum: 60a2a03e4f52316ff113f4c7088dc633 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / O objetivo geral deste estudo foi analisar a diversidade e a estrutura da comunidade de anuros em área de Mata Atlântica no Parque Nacional da Serra da Bocaina. As questões abordadas neste trabalho estão organizadas em quatro capítulos: Capítulo 1, i) as espécies apresentam distribuição sazonal? ii) Quais os fatores climáticos que mais influenciam a distribuição temporal das espécies? iii) Ocorre uma sobreposição no uso do hábitat entre as espécies? iv) Há uma variação espécie-específica no uso do hábitat devido a diferenças na heterogeneidade ambiental?; Capítulo 2, i) Há uma diferença no número de modos reprodutivos entre áreas abertas e a floresta? ii) A diversidade de modos reprodutivos nos ambientes lênticos está relacionada à heterogeneidade ambiental?; Capítulo 3, i) Qual a importância relativa da filogenia e fatores ambientais nos parâmetros do canto dos anuros? ii) A sobreposição nos parâmetros do canto difere do esperado ao acaso em espécies que co-ocorrem?; Capítulo 4, i) As variáveis climáticas e a altitude são preditoras da riqueza nas comunidades de anfíbios em Floresta Ombrófila Densa? ii) Os fatores espaciais são mais importantes que os ambientais na diversidade beta? Para responder as questões dos três primeiros capítulos foram monitorados, mensalmente, ambientes lênticos, localizados entre 1300 e 1600 metros de altitude, tanto no interior de floresta quanto em áreas de campo de altitude. Para responder as perguntas do quarto capítulo foi elaborada uma base de dados secundária compilada de publicações científicas e coleções científicas. No primeiro capítulo observamos que a distribuição temporal das espécies foi sazonal, com maior agregação durante o período mais quente e chuvoso do ano. A variação temporal na riqueza foi relacionada positivamente... / My aim in this study was to analyze the diversity and community structure of anurans from a Atlantic rain forest in Serra da Bocaina National Park. For the sake of clarity, I divided the addressed questions into four chapters: Chapter 1, (i) Does species distribution respond to seasonality? (ii) Which are the most important climatic factors influencing temporal distribution of species? (iii) Is there an overlap in habitat use?; (iv) Does species have unique response to environmental heterogeneity?; Chapter 2, (i) Is there a variation in the number of reproductive modes between forested areas and montane grasslands? (ii) Is the number of reproductive modes in lentic habitats associated with either water body heterogeneity?; Chapter 3, (i) What is the relative influence of phylogeny and environmental factors (habitat and microhabitat use) on call parameters of anurans? (ii) Do co-occurring species differ in call parameters than expected at random?; Chapter 4, (i) Do climatic variables and altitude predict amphibian richness in communities along the Atlantic rain forest? (ii) Are spatial factors more important than environmental factors in driving beta diversity? To address the questions of the three first chapters, I monitored monthly lentic environments in forested and open areas, between 1,300 and 1,600 m a.s.l. To address the questions of the fourth chapter, I compiled a database from primary literature and specimen records of museums. In the first chapter, I found that the temporal distribution of species was seasonal, with higher species density during the warm and wet period of the year. The temporal variation in species richness was positively related to rainfall. However, species responded in an idiosyncratic way to climatic variables. The pattern spatial distribution of species richness... (Complete abstract click electronic access below)

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:30:56Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2010-05-21Bitstream added on 2014-06-13T19:01:03Z : No. of bitstreams: 1 campos_jrc_dr_rcla.pdf: 3693126 bytes, checksum: 956bd343abe9698615af7508045133b0 (MD5) / Até recentemente, a família Leptodactylidae era considerada polifilética, mas nenhum dos trabalhos realizados antes de 2006 resolveu essa polifilia. Nesse ano, quase que simultaneamente, duas grandes revisões foram publicadas, com base principalmente em sequenciamento gênico e sem considerar dados citogenéticos, resultando em filogenias que mudaram radicalmente a taxonomia e a sistemática de muitos grupos de anuros. Leptodactylidae foi uma das famílias que passou por grandes transformações, sendo os gêneros reduzidos de 57 para apenas quatro. Na presente Tese, foram analisados os cariótipos de nove espécies do gênero Leptodactylus e 19 representantes de famílias relacionadas à Leptodactylidae, cujos dados são apresentados em três partes. No primeiro capítulo são apresentados cariótipos com 2n=20, nos exemplares de Vitreorana eurygnatha e V. uranoscopa (Centrolenidae); 2n=22, em Adelophryne baturitensis (Eleutherodactylidae), Brachycephalus ephippium, Ischnocnema guentheri, I. manezinho e I. parva (Brachycephalidae), Leptodactylus furnarius, L. fuscus, L. latrans, L. mystaceus, L. podicipinus e L. syphax (Leptodactylidae), Odontophrynus americanus (Cycloramphidae), Physalaemus barrioi, P. cuvieri e P. moreirae (Leiuperidae); e 2n=26 para Cycloramphus boraceiensis, C. brasiliensis, C. ryakonastes, Thoropa miliaris e Zachaenus parvulus (Cycloramphidae), Flectonotus sp. e Gastrotheca microdiscus (Hemiphractidae). São também descritos o padrão de Ag-RON e bandamento C para a grande maioria das espécies. Os dados cromossômicos aqui obtidos, juntamente com os disponíveis na literatura, foram avaliados à luz das árvores filogenéticas atuais, tendo sido observada grande concordância com as alterações propostas. O segundo capítulo trata dos cariótipos de três espécies de Leptodactylus que pertenciam ao gênero Adenomera, com 2n=24 em L. cf. marmoratus, 2n=23... / Until recently, the family Leptodactylidae was considered polyphyletic, but no paper published before 2006 clarify this question. In that year two extensive revisions were published, almost simultaneously, based mainly on gene sequencing with no contribution of cytogenetic data. These studies resulted in phylogenetic trees which have radically changed the taxonomy and systematic of several groups of frogs. Leptodactylidae was one of the families that suffered great modifications, and the number of genus was reduced from 57 to only 4. In this work, the karyotypes of 9 species of Leptodactylus and representatives of 19 families related to Leptodactylidae were analyzed, and the data are presented in three parts. The first chapter describes the karyotypes with 2n=20, in species of Vitreorana eurygnatha and V. uranoscopa (Centrolenidae); 2n=22 in Adelophryne baturitensis (Eleutherodactylidae), Brachycephalus ephippium, Ischnocnema guentheri, I. manezinho and I. parva (Brachycephalidae), Leptodactylus furnarius, L. fuscus, L. latrans, L. mystaceus, L. podicipinus and L. syphax (Leptodactylidae), Odontophrynus americanus (Cycloramphidae), Physalaemus barrioi, P. cuvieri and P. moreirae (Leiuperidae); and 2n=26 in Cycloramphus boraceiensis, C. brasiliensis, C. ryakonastes, Thoropa miliaris and Zachaenus parvulus (Cycloramphidae) Flectonotus sp. and Gastrotheca microdiscus (Hemiphractidae). The C band and Ag- RON patterns are described for the majority of the species. The chromosomal data obtained here, along with those available in the literature, were analyzed in the light of the current phylogenetic trees, and are in accordance to the proposed modifications. The second chapter reports the karyotypes of three Leptodactylus species belonging to the former genus Adenomera, with 2n=24 in L. cf. marmoratus, 2n=23 in Leptodactylus sp. (aff bokermanni), and 2n=26 in L. hylaedactylus, bearing different... (Complete abstract click electronic access below)

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:35:43Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2007-08-20Bitstream added on 2014-06-13T18:47:10Z : No. of bitstreams: 1 pereira_lftr_dr_rcla.pdf: 1890208 bytes, checksum: 494aae6f71d5d96e2d79e4d2660b0777 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Até a presente tese, a informação sobre predação e estratégias defensivas em anuros estava fragmentada e desconexa na literatura científica. Na ausência de uma revisão sobre o tema, algumas especulações foram geradas baseadas nas impressões pessoais de diversos pesquisadores. Por exemplo, existem muitos ou poucos relatos de anuros sendo apresados? Um determinado comportamento defensivo já foi descrito em algum lugar, ou é inédito? Qual a relação entre os predadores e os mecanismos de defesa dos anuros? Essas e outras perguntas estavam em aberto. Mesmo em livros texto, os quais geralmente revisam os assuntos abordados de forma abrangente, nota-se o parco conhecimento sobre o tema, sendo estes sempre os menores capítulos dos livros e de conteúdo razoavelmente superficial. Todavia, muita informação já foi gerada e muita ainda está por vir. É nesse sentido que idealizamos e realizamos o presente estudo, visando reunir grande parte do conhecimento atual e gerar novas previsões e hipóteses testáveis. Assim, relacionamos os predadores atuais e naturais dos anfíbios anuros (incluindo as desovas e pós-metamórficos) e revisamos as principais estratégias defensivas dos adultos (pós-metamórficos). Muitos dados apresentados são inéditos e outros compilados da literatura, mas ambos analisados de maneira integrada e sempre dando enfoque evolutivo nas discussões apresentadas. Consideramos este estudo um ponto inicial para compreendermos mais profundamente as estratégias defensivas dos anuros e sua relação com os predadores naturais. / Until the present moment, the information about defensive strategies and predation upon anurans was fragmented and disconnected in the scientific literature. In the absence of an overview of the subject, some speculations have been raised based on personal points of view of several scientists. For example, are there many or few reports of predation upon anurans? A specific defensive behavior has already been described or not? How is the relationship between the defensive strategies and predator mechanisms? These and odder questions were hard to answer. Even in text books, where the subjects are treated in a broad way we can notice the poor knowledge of the subject and these are always the shorter and superficial chapters. However, many information is already available and many is about to come. Therefore, we idealized and did the present thesis, aiming to joint a large part of the current knowledge and promoting some previsions and testable hypotheses. So, we related the actual and natural predators of anurans (including eggs and post-metamorphics) and reviewed the main defensive strategies of the adults (post-metamorphics). A great amount of the data presented is novel and other set of data were found in the available literature, but both were analyzed simultaneously with an evolutive approach. We consider this thesis a starting point of a deeper comprehension of the anurans defensive strategies and their relationship with natural predators.

Made available in DSpace on 2014-08-13T14:50:47Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-02-28Bitstream added on 2014-08-13T18:00:34Z : No. of bitstreams: 1 000758239.pdf: 1005727 bytes, checksum: b67d66057a2c388cb3d5c5d8bbe8de7a (MD5) / Os anfíbios ocupam grande variedade de microhabitats refletindo os diversos modos reprodutivos, estilos de vida e parasitas que estes animais apresentam. Os parasitas são indicativos de muitos aspectos biológicos de seus hospedeiros, incluindo a dieta, ocupação do habitat e a filogenia, podendo também ser bons indicadores diretos do estado de qualidade ambiental. A Ilha Anchieta, parque estadual em área de Mata Atlântica, torna-se interessante para estudos biológicos devido a sua dinâmica insular e isolamento geográfico. O objetivo deste estudo foi avaliar a fauna de helmintos de 195 anfíbios da Ilha Anchieta representados por 14 espécies, Flectonotus fissilis (n = 18), Haddadus binotatus (n = 9), Ischnocnema bolbodactyla (n = 4), Ischnocnema parva (n = 20), Rhinella ornata (n = 20), Dendrophryniscus brevipollicatus (n = 3), Hypsiboas albomarginatus (n = 18), Scinax hayii (n = 23), Hylodes asper (n = 2), Hylodes phyllodes (n = 3), Leptodactylus cf. marmoratus (n = 42), Leptodactylus latrans (n = 4), Chiasmocleis carvalhoi (n = 26) e Myersiella microps (n = 3). Foram identificadas pelo menos 14 espécies de helmintos entre as comunidades componentes dos anfíbios: 12 espécies de nematóides (Falcaustra mascula, Oxyascaris oxyascaris, Oswaldocruzia sp., Rhabdias sp., Physaloptera sp., Aplectana crucifer, Aplectana pintoi, Aplectana sp., Cosmocerca brasiliense, Cosmocerca parva, Cosmocerca travassosi e Cosmocerca sp.), uma espécie de cestóide (Cylindrotaenia cf. americana) e uma espécie de Acanthocephala (cistacantos). Este estudo apresenta uma revisão dessas espécies de helmintos com seus anfíbios hospedeiros até hoje relatados; a helmintofauna associada a estas espécies hospedeiras; e uma análise de similaridade das infracomunidades de algumas espécies de anfíbios, mostrando que o habitat pode influenciar na composição e abundância da comunidade parasita / The amphibians use a variety of microhabitats, relationship with the various reproductive modes, life style and parasites that these animals presented. The parasites are indicatives about a lot of biological aspects of yours hosts, including feeding, use of habitat and phylogeny. They also may be good indicators about status of environmental quality. The Anchieta Island, state park in Atlantic Rain Forest area, is very interesting for biological studies because insular dynamics and geographical isolation. The aim of this study was to evaluate the helminth fauna of 195 amphibians from Anchieta Island representing 14 species, Flectonotus fissilis (n = 18), Haddadus binotatus (n = 9), Ischnocnema bolbodactyla (n = 4), Ischnocnema parva (n = 20), Rhinella ornata (n = 20), Dendrophryniscus brevipollicatus (n = 3), Hypsiboas albomarginatus (n = 18), Scinax hayii (n = 23), Hylodes asper (n = 2), Hylodes phyllodes (n = 3), Leptodactylus cf. marmoratus (n = 42), Leptodactylus latrans (n = 4), Chiasmocleis carvalhoi (n = 26), and Myersiella microps (n = 3). They were necropsied to examine for helminth parasites. We identified at least 14 helminths species in the component communities of anurans: 12 nematodes species (Falcaustra mascula, Oxyascaris oxyascaris, Oswaldocruzia sp., Rhabdias sp., Physaloptera sp., Aplectana crucifer, Aplectana pintoi, Aplectana sp., Cosmocerca brasiliense, Cosmocerca parva, Cosmocerca travassosi, and Cosmocerca sp.), one cestode species (Cylindrotaenia cf. americana), and one species of Acanthocephala (cystacanths). This study presents a revision about these helminth species with the related hosts to date; the helminth fauna associated to these host species; and the similarity about infracommunities of some amphibian species, showing habitat can influence on composition and abundance of parasite community