À la suite du dévoilement d’une agression sexuelle, l’examen médical est l’une des étapes importantes qui sont recommandées pour les enfants victimes, mais seulement certains d’entre eux le complètent. L’objectif de la présente étude est de vérifier si les enfants qui font l’examen anogénital à la suite du dévoilement d’agression sexuelle sont différents de ceux qui n’en font pas ainsi que de documenter les variables, notamment les caractéristiques de l’enfant, de la famille, de l’agresseur et de l’agression, qui pourraient prédire le fait de compléter cet examen. L’échantillon est composé de 211 enfants âgés de 6 à 13 ans recevant des services au Centre d’expertise Marie-Vincent. Une régression logistique binaire révèle que l’absence d’emploi de la mère (RC = 6,15), être victime d’une agression sexuelle très sévère (RC = 6,02), être victime d’un agresseur adulte (RC = 3,43) et provenir d’une famille monoparentale (RC = 2,89) contribuent à prédire si l’examen anogénital est réalisé ou pas à la suite du dévoilement. Les résultats confirment que les enfants complètent l’examen surtout afin de trouver des éléments de preuves et que parmi ceux qui pourraient en bénéficier pour leur bien-être, plusieurs ne sont pas rencontrés. / Following the disclosure of sexual assault, the medical examination is one of the most important steps recommended for child victims, but only some of them undergo the examination. The objective of this study was to determine whether children who undergo an anogenital examination following a disclosure of sexual assault are different than those who do not, as well as to document the variables, particularly, the characteristics of the child, the family, the aggressor and the assault, that could predict whether or not an anogenital examination is conducted. The study group was composed of 211 children within between the ages of 6 to 13 years old receiving services at the Centre d’expertise Marie-Vincent. A binary logistic regression reveals that when the mother is unemployed (RC = 6.15), being a victim of a very violent sexual assault (RC = 6.02), being a victim of an adult aggressor (RC = 3.43) and coming from a single-parent family (RC = 2.89) contribute to predicting if the anogenital exam is given or not following the disclosure. Results confirm that the primary goal of the anogenital examination is to find elements of proof and that many children who could benefit from this test for their wellbeing are not being examined.

À la suite du dévoilement d’une agression sexuelle, l’examen médical est l’une des étapes importantes qui sont recommandées pour les enfants victimes, mais seulement certains d’entre eux le complètent. L’objectif de la présente étude est de vérifier si les enfants qui font l’examen anogénital à la suite du dévoilement d’agression sexuelle sont différents de ceux qui n’en font pas ainsi que de documenter les variables, notamment les caractéristiques de l’enfant, de la famille, de l’agresseur et de l’agression, qui pourraient prédire le fait de compléter cet examen. L’échantillon est composé de 211 enfants âgés de 6 à 13 ans recevant des services au Centre d’expertise Marie-Vincent. Une régression logistique binaire révèle que l’absence d’emploi de la mère (RC = 6,15), être victime d’une agression sexuelle très sévère (RC = 6,02), être victime d’un agresseur adulte (RC = 3,43) et provenir d’une famille monoparentale (RC = 2,89) contribuent à prédire si l’examen anogénital est réalisé ou pas à la suite du dévoilement. Les résultats confirment que les enfants complètent l’examen surtout afin de trouver des éléments de preuves et que parmi ceux qui pourraient en bénéficier pour leur bien-être, plusieurs ne sont pas rencontrés. / Following the disclosure of sexual assault, the medical examination is one of the most important steps recommended for child victims, but only some of them undergo the examination. The objective of this study was to determine whether children who undergo an anogenital examination following a disclosure of sexual assault are different than those who do not, as well as to document the variables, particularly, the characteristics of the child, the family, the aggressor and the assault, that could predict whether or not an anogenital examination is conducted. The study group was composed of 211 children within between the ages of 6 to 13 years old receiving services at the Centre d’expertise Marie-Vincent. A binary logistic regression reveals that when the mother is unemployed (RC = 6.15), being a victim of a very violent sexual assault (RC = 6.02), being a victim of an adult aggressor (RC = 3.43) and coming from a single-parent family (RC = 2.89) contribute to predicting if the anogenital exam is given or not following the disclosure. Results confirm that the primary goal of the anogenital examination is to find elements of proof and that many children who could benefit from this test for their wellbeing are not being examined.

Le virus du papillome humain (HPV) est l’infection sexuellement transmise la plus fréquente au monde. Plusieurs études ont établi son implication dans l’étiologie de pratiquement tous les cancers du col de l’utérus, une maladie qui constitue un problème de santé majeur dans les pays pauvres. Le HPV est également responsable de 90% des cancers de l’anus, 40-50% des cancers du pénis, de la vulve et du vagin, et 30% des cancers de la tête et du cou. L’objectif général de cette thèse est de combler les lacunes relatives aux connaissances sur la distribution génotypique du HPV dans les lésions néoplasiques cervicales utérines et de la tête et du cou, plus particulièrement en Afrique. Les objectifs spécifiques sont les suivants: 1) analyser la distribution génotypique du HPV dans les cancers du col de l’utérus et faire une analyse comparative de cette distribution dans cinq pays africains en fonction de la prévalence du VIH; 2) évaluer la présence du HPV dans les cancers de la tête et du cou au Sénégal; 3) faire une revue de la littérature et une méta-analyse sur la distribution du HPV dans les cancers de la tête et du cou dans toutes les régions du monde. Pour le premier et le second objectifs, qui découlent d’un large projet international coordonné par l’Institut Catalan d’Oncologie pour l’Organisation Mondiale de la Santé (OMS), une étude transversale multicentrique a été menée au Mali et au Sénégal pour collecter des blocs de paraffine de patientes diagnostiquées entre 2001 et 2010 du cancer invasif du col et des cancers de la tête et du cou. Pour le troisième objectif, une revue exhaustive de la littérature a permis d’identifier tous les articles qui ont été publiés sur les cancers de la tête et du cou dans tous les pays du monde et d’effectuer une méta-analyse sur la prévalence de l’ADN du HPV selon le site du cancer et la région géographique. Notre analyse montre que les principaux types de HPV ciblés dans les vaccins prophylactiques (HPV16/18) représentent la majorité des types de HPV détectés dans le cancer invasif du col de l’utérus en Afrique subsaharienne. Par contre, le HPV45 vient au second rang dans certains pays d’Afrique, dont le Mali et le Sénégal. Nos données suggèrent également que le VIH aurait un rôle dans la contribution relative du HPV18 et HPV45 dans le développement du cancer du col de l’utérus. Au Sénégal, notre étude montre que la prévalence du HPV dans les cancers de la tête et du cou est très faible et ne semble pas jouer un rôle important dans l’oncogenèse. Finalement, la méta-analyse a mesuré la prévalence des HPV dans les cancers de la cavité orale, de l’oropharynx, du larynx et de l’hypopharynx, et confirme l’importante contribution relative du HPV16 dans ces cancers. Globalement, cette thèse permet de mieux comprendre l’impact potentiel des vaccins prophylactiques sur l’incidence des cancers associés au HPV. / Human papillomavirus (HPV) infection is the most common sexually transmitted infection worldwide. Several studies have shown its involvement in the etiology of virtually all cancers of the cervix, which is a major health problem in poor countries. HPV is also responsible for 90% of anal cancers, 40-50% of penile, vulvar and vaginal cancers, and 30% of head and neck cancers. The overall objective of this thesis is to fill the gaps in knowledge on the genotype distribution of HPV in anogenital and head and neck neoplasia, especially in sub-Saharan Africa. The specific objectives are to: 1) analyze HPV genotype distribution in cervical cancer and compare this distribution in five African countries according to HIV prevalence; 2) evaluate the presence of HPV in cancers of the head and neck in Senegal; 3) review the literature on the distribution of HPV in cancers of the head and neck in all regions of the world and perform a meta-analysis. For the first and second objectives, which were derived from a larger international project coordinated by the Catalan Institute of Oncology for the World Health Organization (WHO), a cross-sectional multicentric study was conducted to collect paraffin-embedded blocks of invasive cervical cancer and head and neck cancer diagnosed between 2001 and 2010 in Mali and Senegal. For the third objective, a comprehensive search of the literature was conducted to identify all articles published to date on head and neck cancer. A meta-analysis was performed to estimate the prevalence of HPV DNA according to cancer site and geographical region. Our analysis shows that the main HPV types targeted in the prophylactic vaccines (HPV16/18) accounted for the majority of the HPV types found in invasive cervical cancer in sub-Saharan Africa. Our data also suggests that HIV may play a role in the contribution of HPV18 and HPV45 to the development of cervical cancer. However, HPV45 ranks second in many African countries, notably in Mali and Senegal. In Senegal, our study shows that HPV DNA prevalence in head and neck cancer is very low and is not importantly involved in the oncogenesis. Finally, the meta-analysis measured the prevalence of HPV in cancers of the oral cavity, oropharynx, larynx and hypopharynx, and confirmed the significant relative contribution of HPV16 in these cancers. Overall, this thesis contributes to a better understanding of the potential impact of HPV prophylactic vaccines on the incidence of HPV-associated cancers.

Reports of endocrine disrupting potential of common environmental chemicals and the effects on reproductive health are well documented in literature. It has been suggested that deteriorating male reproductive health could be due to in utero exposures to these chemicals. The effects mediated through endocrine disrupting chemicals (EDCs) are on the fetus and may therefore be trans-generational. Ultimately, these chemicals land up in aquatic systems and affect wildlife and humans. Humans are exposed to these chemicals through multiple routes including atmosphere, water, occupational, domestic and food consumption. South Africa (SA) is an important livestock producer with about 13.8 million cattle within the feedlot industry contributing up to 80% of the total beef production. Veterinary growth stimulants (VGS) are used by beef producers to enhance growth in cattle. In SA, the following five VGS have been approved for use in beef products under the Register Act 36 of 1947, estradiol, progesterone and testosterone (natural), α'-zearalanol and trenbolone (synthetic). These VGS and their metabolites are environmentally stable compounds. The excretions from the animals are not treated and land up in the local aquatic systems, indirectly posing a health risk. In SA no research has been done on VGS associated with feedlot activities. The aim of this study was to investigate the effects of a mixture of VGS, as possible EDCs on the reproductive health and thyroid function in male rats in utero, during lactation and life-time exposure. The (anti)estrogenic and (anti)androgenic activity in water from specific feedlots was determined by using a battery of screening bio-assays. Water samples were collected over a period of a year and assessed for EDC activity in the recombinant yeast screen (YES), the T47D-KBluc (estrogenic) and the MDA-Kb2 (androgenic) bioassays. The OECD (Organization for Economic Co-operation and Development) 415 protocol, (1983) for a one-generation reproduction toxicity study, was modified to accommodate one control and three experimental groups. The experimental groups were orally gavaged with mixtures of: zilpaterol, diethylstilbestrol (DES) and α-zearalanol (Group 2; estogenic); with β'-trenbolone and methyltestosterone (MT) (Group 3; androgenic); a combination of compounds (Group 4; estrogenic and androgenic) and the Control group received cottonseed oil only. The bio-assay results indicated that water samples analysed from selected feedlots contained compounds with estrogenic activity. The shorter anogenital distance (AGD) (Group 3), decreased seminal vesicle mass (Group 4), decreased prostate mass (Group 4), increased lumen diameter (Group 3 and 4), lowered sperm concentration (Group 3), and increased T4 (Group 2 and 3) differed significantly from the control. The body weight of the males in Group 2 in the F2 generation was significantly lower than the control. The F2 females in Group 2, 3 and 4 were also significantly lower than the control. The reduced AGD, decreased seminal vesicle and increased T4 (thyroxine) might be the result of an estrogenic effect. The reduced sperm concentration might be the result of in utero and lactation exposure to these VGS. The bio-assays confirmed estrogenic activity in the feedlot water sources. The reproductive toxicology study findings confirm the hypothesis that VGS can act as EDCs and could therefore be responsible for negative reproductive effects and thyroid function. More research is needed to investigate the effects of VGS mixtures at different concentrations on male reproductive health, thyroid function and their offspring. AFRIKAANS : Goed gedokumenteerde literatuur dui aan dat chemikalieë wat algemeen in die omgewing gevind word, die potensiaal het om die manlike voortplantingstelsel aan te tas. Dit word gespekuleer dat in utero blootstelling verantwoordelik kan wees vir hierdie agteruitgang. Die fetus en daarop- volgende geslagte se gesondheid kan ook beÏnvloed word deur chemikalieë. Hierdie chemikalieë het die potensiaal om die watersisteme te bereik en gevolglik dier en menslike gesondheid te beÏnvloed. Blootstelling kan plaasvind deur verskeie roetes wat die atmosfeer, water, werksomstandighede, huishoudelike produkte en gekontamineerde voedsel insluit. Suid-Afrika (SA) is 'n belangrike produsent van vleisprodukte met omtrent 13.8 miljoen beeste wat bydra tot 80% van die vleisproduksie. Veterinêre-groei-stimulante (VGS) word gebruik om die vleisproduksie te verbeter. Vyf groei stimulante naamlik estradiol, progesteroon, testosteroon (natuurlike), α-zearalanol en trenboloon (sinteties) is goedgekeur onder die Wet 36 van 1947, vir groei produksie van beeste. Hierdie VGS en hul metaboliete is stabiel in die natuur. Die fekale en urinere uitskeidingsprodukte van die diere word nie behandel nie en eindig op in ons waterstelsels. Geen navorsing is nog in SA gedoen om die potensiële bydraes wat voerkrale tot die besoedeling van water lewer, te bestudeer nie. Die doel van die studie was om die gesamentlike effekte van mengsels VGS as moontlike endokrien-ontwrigtende chemicalieë (EOC) op die manlike voortplantingstelsel en tiroïdhormone van mannetjiesrotte na in utero-, gedurende laktasie- en na 'n leeftyd-blootstelling te bepaal. Die (anti)estrogeniese en (anti)androgeniese aktiwiteit in water vanaf spesifieke voerkrale is met behulp van 'n reeks biologiese seltoetse bepaal. Watermonsters is geanaliseer met die gisseltoets (YES)(estrogenies), die T47D-KBluc (estrogenies) en die MDA-Kb2 (androgenies). Die OECD 415 protokol (1983) vir een generasie reproduktiewe toksologie toets was aangepas om een kontrole en drie eksperimentele groepe te huisves. Die eksperimentele groepe rotte is oraal gedoseer met 'n mengsel van zilpaterol, dietielstilbestrol (DES) en α-zearalanol (Groep 2); β-trenboloon en metieltestosteroon (Groep 3); 'n kombinasie van al bogenoemde (Groep 4); en 'n kontrole groep wat katoensaad olie VGS ontvang het nie. Estrogeniese aktiwiteit en sitotoksisiteit was teenwoordig in die water vanaf die voerkrale. Die verkorte anogenitale afstand (AGD) (Groep 3), kleiner seminale vesikel (SV) massa (Groep 4), kleiner prostaat massa (Groep 4), groter lumen deursneë (Groep 3 en 4), laer spermtelling (Groep 3), verhoogde T4 (Groep 2 en 3), het almal statisties-betekenisvol van die kontrole groep verskil. In die F2 generasie het die liggaamsmassas van die mannetjies in Groep 2 en liggaamsmassas van die wyfies in Groepe 2, 3 , 4, almal statisties-betekenisvol laer as die kontrole Groep. Die verkorte AGD, kleiner SV en verhoogde T4 kan moonlik wees as gevolg van 'n estrogeniese effek en die verlaagde sperm konsentrasie weens 'n in utero en laktasie blootstelling. Die biologiese seltoetse het die teenwoordigheid van estrogeniese aktiwiteit in voerkrale se water bevestig. Die gevolge van die blootstelling van EOC mengsels op voortplantings-parameters bevestig die moontlikheid van EOC effek geassosieer met VGS. Verdere navorsing is nodig om die dosisresponsverhoudings van verskillende VGS te ondersoek. Copyright / Dissertation (MSc)--University of Pretoria, 2011. / School of Health Systems and Public Health (SHSPH) / Unrestricted

The doctoral thesis MD. Liubov Kastnerova (previous name Kyrpychova) is focused on the histomorphological and molecular biologic features of selected cutaneous epithelial and nonepithelial tumors and is structured as a commentary to the 20 articles published during four years, representing the completed scientific projects in the Ph.D. course. In eight papers, the author of the thesis is the first author, whereas she coauthored in the remaining 12 papers. The thesis is composed of the commented files of authors own publications and it is divided into cutaneous epithelial and nonepithelial tumors. The first section, «Cutaneous epithelial tumors», includes 14 articles that are subdivided into two parts: adnexal tumors (9 articles) and lesions of anogenital mammary-like glands (5 articles). Of the nine articles on adnexal tumors, there are 5 articles focused on various benign and malignant adnexal lesions with apocrine or eccrine differentiation. Novel findings in this part include the identification of hitherto unreported alterations of the MYBL1 gene in adenoid cystic carcinoma of the skin and lack of deletion of the 1p36 locus in this neoplasm; the lack of a correlation between cellular composition and the presence CRTC1-MAML2 fusions in hidradenoma, the absence of CRTC3-MAML2 fusions in this tumor,...