Made available in DSpace on 2014-06-11T19:31:36Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-02-20Bitstream added on 2014-06-13T18:42:25Z : No. of bitstreams: 1 curcelli_f_dr_botfca.pdf: 404578 bytes, checksum: ca98af9172e92ded24238514275c687c (MD5) / A mandioca, por ser concentradora de amido na raiz, fonte de energia, e proteína na parte aérea, tem sido usada na alimentação de animais domésticos. A prática da poda da parte aérea da mandioca é comum em lavouras destinadas à produção de raízes para a indústria, porém esta prática ainda é pouca estudada. Com objetivo de avaliar o potencial do uso da planta de mandioca, podada em diferentes épocas, na alimentação animal, por meio de análises bromatológicas, foi realizado entre os anos de 2008/2010, na UNESP-Botucatu, experimento, em blocos completos casualizados, envolvendo podas da parte aérea da variedade IAC-14. As plantas foram podadas mês a mês, do sétimo ao décimo quinto mês após o plantio (MAP) e uma testemunha sem poda. As análises bromatológicas foram efetuadas no momento da colheita, ou seja, 22 MAP. Foram analisadas a produção, produtividade em massa seca e fresca da raiz e parte aérea, o conteúdo e produtividade de proteína bruta (PB) e as porcentagens de fibra bruta (FB), fibra em detergente neutro (FDN), fibra em detergente ácido (FDA), nutrientes digestíveis totais (NDT), extrato livre de nitrogênio (ELN) e açúcares totais da parte aérea e da raiz, além do conteúdo e produtividade do amido de raiz. Foi calculado, a partir de equações matemáticas, valores de energia metabolizável para aves e coelhos e digestível para ruminantes, tanto da parte aérea quanto da raiz. Não foi observada diferença na produtividade de matéria fresca de raiz entre os tratamentos estudados. Podas realizadas anteriormente ao período de repouso fisiológico causaram nas raízes: menores porcentagens de amido e a mesma produtividade. Em relação à parte aérea, tecidos mais jovens, ou seja, plantas podadas tardiamente tiveram menores porcentagens de PB e FB. Com relação à... / The cassava, to be concentrating starch on the root, source of energy and protein in the shoot, has been used in feed for livestock. The practice of pruning is common in cassava crops for the production of roots for the industry, but this practice is still little studied. In order to evaluate the potential use of the cassava plant, pruned at different times, in animal feed, through chemical analysis was performed between the years 2008/2010, at UNESP-Botucatu, research, in a randomized block design, pruning of shoots involving the IAC-14. The plants were pruned every month, on the seventh of the fifteenth month after planting (MAP) and a control without pruning. The chemical analyzes were performed at harvest, 22 MAP. Were analyzed the production, productivity in fresh and dry matter of roots and shoots, content and productivity of crude protein (CP), crude fiber (CF), neutral detergent fiber (NDF), acid detergent fiber (ADF), total digestible nutrients (TDN), nitrogen free extract (ELN) and total sugars of shoot and root, and the root starch. Were calculated from mathematical equations, metabolizable energy values for poultry and rabbits and digestible for ruminants, such as roots as aeral part. We analyzed the production, productivity in fresh and dry matter of roots and shoots, content and productivity of crude protein (CP) and the percentages of crude fiber (CF), neutral detergent fiber (NDF), acid detergent fiber (ADF), total digestible nutrients (TDN), nitrogen free extract (NFE) and total sugars of shoot and root, beyond the content and productivity of root starch. Were calculated, from mathematical equations, the metabolizable energy values for poultry and rabbits and digestible for ruminants of the shoot and root. There was no difference in the productivity of fresh root among treatments. Pruning before the rest period... (Complete abstract click electronic access below)

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:33:25Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-02-01Bitstream added on 2014-06-13T18:45:07Z : No. of bitstreams: 1 sousa_e_dr_jabo.pdf: 731084 bytes, checksum: 8b5b74e4f498844e65d919aeece86e5e (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Para a manutenção da avicultura brasileira e conservação dos seus altos índices de produção e exportação de produtos avícolas, são exigidas medidas de prevenção e controle de alguns agentes etiológicos nas granjas, como por exemplo, a Salmonella spp. O objetivo deste trabalho foi isolar e classificar Salmonella spp., em materiais colhidos de instalações avícolas, sunícolas e avifauna selvagem local, inocular posteriormente os sorotipos isolados em pintos de frangos de corte verificando sua patogenicidade.. Foram capturadas 36 aves selvagens de diferentes espécies nas instalações avícolas de uma granja integrada de frango de corte. Foi isolado Salmonella Heidelberg dos órgãos e conteúdo intestinal de um pica-pau-do-campo (Colaptes campestris),. As amostras positivas provenientes das aves de produção foram: cama aviária (Salmonella enterica subsp. enterica sorotipo 4,5,12:R:-; Salmonella Heidelberg; Salmonella Infantis), fezes de frangos de corte (Salmonella Heidelberg; Salmonella enterica subsp. enterica sorotipo 6,7:R:-; Salmonella enterica subsp. enterica sorotipo 4,5,12:R:-; Salmonella Tennessee); água (Salmonella Glostrup; Salmonella enterica subsp. enterica sorotipo 6,8:d:-;) e cascudinhos (Alphitobius diaperinus) encontrados na cama aviária (Salmonella Tennessee). Em fezes de suínos criados em galpões na mesma propriedade, foram isolados Salmonella Panama e Salmonella Typhimurium. Quanto à infecção experimental, em todos os nove grupos de aves foi observado entre o 3° dpi (dia pós-infecção) e o 12° dpi, fezes amolecidas no chão das gaiolas, ao redor da cloaca e na penugem das aves. Aos 15 e 21 dpi, os diferentes sorotipos de Salmonella foram isolados do conteúdo cecal, do baço e do fígado. Nas necropsias não foram encontradas alterações macro nem microscópicas relevantes / For maintenance of the high levels of production in Brazil and the export of poultry products, preventive measures and control of some etiologic agents on farms, such as Salmonella spp., are required. The purpose of the present study was to initially investigate the presence of Salmonella spp.through bacterial culture in poultry houses materials collected from local poultry and wild birds and subsequently inoculate the isolated serotypes in broiler chicks and verify the effect on these. From the 36 wild birds captured in the poultry houses, Salmonella Heidelberg were isolated from the organs and intestinal contents from one woodpecker (Colaptes campestris) From the poultry houses the positive samples were: litter (Salmonella enterica subsp. enterica sorotipo 4,5,12:R:-; Salmonella Heidelberg; Salmonella Infantis), feces of broiler (Salmonella Heidelberg; Salmonella enterica subsp. enterica sorotipo 6,7:R:-; Salmonella enterica subsp. enterica sorotipo 4,5,12:R:-; Salmonella Tennessee), water (Salmonella Glostrup; Salmonella enterica subsp. enterica sorotipo 6,8:d:-;) and lesser mealworm (Alphitobius diaperinus) found in litter (Salmonella Tennessee). From the feces of swine also produced in sheds on the same farm were isolated Salmonella Typhimurium and Salmonella Panama. In the experimental infection done in nine avian groups (n=15) was observed between the 3rd dpi (days post-infection) and 12th dpi the presence of soft feces on the floor of the cages, around the cloaca and on feathers of the birds. On 15 and 21 dpi the different serotypes of Salmonella were isolated from the cecal contents, spleen and liver. At the necropsies weren’t observed relevant macro or microscopic alterations

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:33:26Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2008-07-31Bitstream added on 2014-06-13T21:06:05Z : No. of bitstreams: 1 furuta_pi_dr_jabo.pdf: 1073038 bytes, checksum: 5e772861c92b1e24fce5e65feea5cf02 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / A neosporose é uma doença causada pelo protozoário Neospora caninum, e causa um grande impacto econômico na pecuária mundial. Sabe-se que muitos mamíferos são considerados hospedeiros intermediários, e que recentemente, foi confirmado o papel das aves no ciclo de vida de N. caninum como hospedeiros intermediários. O presente trabalho teve como finalidade estudar o ciclo evolutivo e patogenia de N. caninum em cães alimentados com ovos embrionados de Gallus gallus domesticus previamente inoculados com taquizoítas. Realizou-se diariamente o exame de fezes dos animais, pela técnica de flutuação, constatando a presença de oocistos nas fezes a partir de 7 dia apósinfecção. Anticorpos anti- N. caninum foram pesquisados semanalmente nos cães pela RIFI, sendo observados anticorpos a partir dos 14dai. Semanalmente um cão foi eutanasiado e durante a necropsia observou-se em todos os cinco animais, aumento dos linfonodos mesentéricos e das tonsilas, presença de muco no duodeno e jejuno e hepatoesplenomegalia, com hiperplasia de polpa branca do baço. Pelo exame histopatológico detectou-se reatividade dos linfonodos, lesões no fígado, coração, pulmão, baço e rim. Pelas técnicas de imunoistoquímica, imunofluorescência indireta dos tecidos e no Real-time PCR, observou-se a presença do parasito. Os resultados obtidos apontam que, os ovos embrionados infectados pelo parasito mostraram eficiência como modelo experimental para infectar cães, que eliminaram oocistos nas fezes, mesmo não apresentando sinais clínicos da neosporose. Ademais, os cães infectados apresentaram prematura soroconversão pela prévia administração de bicarbonato de sódio e o uso das técnicas citadas tornou possível a detecção do parasito nos tecidos analisados. / Neosporosis is a protozoan disease caused by Neospora caninum and affects the reproductive system in cattle worldwide. Infection by the parasite has been widely described in mammals, and recently the role of birds in its lifecycle was confirmed as intermediate hosts. This work aimed to study the life cycle of N. caninum and the pathogeny in dogs that were fed with embryonated eggs inoculated with tachyzoites. The tested dogs were followed up for oocyst shedding, by flotation technique, and it was detected at 7 days after infection. Antibodies anti- N. caninum were detected at 14dai. Once a week, one dog was euthanized and at the necropsy alterations was observed on the mesenteric lymph nodes and tonsils, presence of mucus at duodenum and jejunum portions, and hepatosplenomegaly. At the histopathological examination lymph nodes alterations were noticed ranging from moderate to intense. In addition, there were alterations in liver, heart, lung, spleen and kidney. The parasite was detected by immunochemistry and indirect immunofluorescense tests as well as by Real-time PCR. The results herein presented suggest that inoculated embryonated eggs showed to be an efficient model to infect dogs, because of shedding oocysts, and no clinical alterations. Moreover, the infected dogs presented earlier seroconvertion because of sodium bicarbonate solution administration and the parasite detection in the analyzed tissues was successful by the techniques used.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:27:21Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2007-07-06Bitstream added on 2014-06-13T20:16:37Z : No. of bitstreams: 1 piza_vmt_me_jabo.pdf: 496784 bytes, checksum: 8e82f3b02d746dfe3daa52fd23b8be9e (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Nesse estudo foi desenvolvido e aplicado o procedimento de imunocaptura para realizar a reação de transcrição reversa seguida pela reação em cadeia da polimerase (IC-RT-PCR) a fim de ser amplificada uma região 5'_ proximal do gene 81 do vírus da bronquite infecciosa (VBI) com 228 pb e de forma a fazer a detecção e a diferenciação desse vírus, comparando-se os resultados dessa metodologia com os obtidos na técnica convencional de RT-PCR. Todas as 11 estirpes do VBI testadas foram amplificadas pelas duas técnicas moleculares, enquanto que nenhum dos vírus heterólogos (Pneumovírus Aviário do grupo A e B, Vírus da Doença de Gumboro e o Vírus da Doença de Newcastle) ensaiados levaram a amplificação específica do gene 81. O limiar de detecção para a técnica de IC-RT-PCR foi idêntico ao do método de RT-PCR e correspondeu a 102.8 Doses Infectantes Embrionárias 50%. Para um total de 35 amostras de tecidos do trato respiratório testadas e provenientes de aves infectadas experimentalmente, 32 foram positivas pela técnica de IC-RT-PCR e também pela RT-PCR convencional, enquanto que o isolamento viral foi obtido para 22 dessas amostras. A análise do produto amplificado do gene 81 na IC-RT-PCR através da técnica de RFLP (restriction fragment length polymorphism), com as enzimas Alul e Mboll, permitiu a diferenciação das 5 estirpes de referências e dos 6 isolados de campo analisados em 4 diferentes genótipos, correspondentes às estirpes de referência M41, Connecticut, ou 8E-17, ou a um isolado de campo. Portanto, a técnica de IC¬RT -PCR demonstrou um grande potencial para ser aplicada no diagnóstico direto do VBI, apresentando vantagens sobre a técnica convencional de RT-PCR, as quais foram derivadas da combinação da especificidade da imunocaptura em fase sólida com a sensibilidade da reação de PCR, o que pode proporcionar ganho de tempo e menor custo para a manipulação de um maior número de amostras. / In this study, the immunocapture procedure followed by reverse transcription and polymerase chain reaction (IC-RT-PCR) technique was standardized and applied for the amplification of 5'- proximal pari of 81 gene of infectious bronchitis virus (IBV) in infected f1uid or tissue samples, which were collected from embryonating chicken eggs or experimentally infected birds. The results of this technique were compared with those obtained in conventional RT-PCR. Ali eleven IBV strains tested were amplified, while none of the heterologous avian viral pathogens (Groups A and B Avian Pneumovirus, Newcastle Disease Virus and Gumboro Disease Vírus) gave positive results. The limit of detection for IC-RT¬PCR was identical to the common RT-PCR and corresponded to 102.8 50% embryonic infectious doses. Thirty two out of thirty five respiratory tissue samples collected from experimentally infected chickens were positive by both molecular techniques (IC-RT-PCR I common RT-PCR), whereas the vírus isolation test detected IBV in twenty two of these samples. The AluL and Mobll RFLP analysis of the 228 bp amplicon generated from IC-RT-PCR led to the discrimination of the 5 reference strains and 6 field IBV isolates in four genotypes; which were associated to the M41, to Connecticut, ar to 8E-17 strain, or to a field isolate. Therefore, the IC-RT-PCR demonstrated in this study a high potential for the application in the direct diagnosis of IBV and has relevant advantages over the conventional RT¬PCR, because it combines the specificity of the immunocapture in a solid phase with the sensitivity of the PCR, providing simplicity, rapidity and low cost for the manipulation of a high number of samples.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:27:23Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2009-12-22Bitstream added on 2014-06-13T18:56:05Z : No. of bitstreams: 1 fernandes_cc_me_jabo.pdf: 1349174 bytes, checksum: b0d752648346a29041d0fbd5f330fbf6 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Anticorpos monoclonais se constituem na base de vários testes usados na detecção e na identificação de antígenos. Nesse contexto, tais imuno-reagentes têm sido extensivamente empregados na identificação de estirpes virais envolvidas na etiologia de surtos de bronquite infecciosa a campo, permitindo o aperfeiçoamento das técnicas de detecção e caracterização antigênica do vírus da bronquite infecciosa das galinhas (VBI). No presente estudo, uma biblioteca de fragmentos de anticorpos de galinha originalmente preparada por “phage display” contra a estirpe vacinal (H120) do VBI, foi usada para a seleção de fragmentos de anticorpos recombinantes com reatividade cruzada para as estirpes heterólogas IBVPR01, IBVPR05, isoladas de surtos a campo no Brasil e SE-17, isolada nos Estados Unidos. Após três ciclos de “panning”, foi identificado pelo ELISA um conjunto de 15 anticorpos scFv expressos em fagos e com reatividade cruzada para essas mesmas estirpes do VBI. A análise por Western-blotting revelou que três desses clones apresentavam fagos expressando fragmentos de anticorpos monoclonais com reatividade cruzada para a nucleoproteína N das três estirpes do VBI e também para a forma recombinante dessa nucleoproteína derivada da estirpe M41. Concluindo, os fragmentos de anticorpos monoclonais recombinantes scFv-N produzido em fagos interagem com um epítopo mais conservado da proteína N do VBI e apresentam um grande potencial para utilização na detecção e no diagnóstico direto desse vírus e no estudo de evolução de variantes desse vírus. / Monoclonal antibodies are the basis of various techniques used for antigen detection or characterization, and their use is specially recommended for the identification of viral strains involved in the etiology of outbreaks of infectious bronchitis, because these antibodies are homogeneous, highly specific and fully characterized, allowing the improvement of detection of immunological techniques and antigenic characterization of avian infectious bronchitis virus strains (IBV). We used a phage display library prepared previously against the IBV vaccine strain (H120) for the selection of new scFv antibody fragments reacting with heterologous IBV strains isolated from outbreaks in Brazil (IBVPR01, IBVPR05) and USA (SE-17). After three cycles of panning a set of 15 scFv antibodies was expressed in phages and exhibited crossreaction in ELISA with these three viral strains. Western-blotting analysis showed that three of this clone set were expressing scFv specific for the nucleoprotein of these IBV strains, as well as to the recombinant form of this protein derived from M41 strain of IBV. In conclusion, the recombinant fragments of monoclonal antibodies expressed by phage-display technique have a great potential for future use in immunodiagnostic techniques and study the evolution of variant strains of this virus.

Orientador: Hélio José Montassier / Banca: Liana Brentano / Banca: Maria da Glória Buzinaro / Resumo: Nesse estudo foi desenvolvido e aplicado o procedimento de imunocaptura para realizar a reação de transcrição reversa seguida pela reação em cadeia da polimerase (IC-RT-PCR) a fim de ser amplificada uma região 5'_ proximal do gene 81 do vírus da bronquite infecciosa (VBI) com 228 pb e de forma a fazer a detecção e a diferenciação desse vírus, comparando-se os resultados dessa metodologia com os obtidos na técnica convencional de RT-PCR. Todas as 11 estirpes do VBI testadas foram amplificadas pelas duas técnicas moleculares, enquanto que nenhum dos vírus heterólogos (Pneumovírus Aviário do grupo A e B, Vírus da Doença de Gumboro e o Vírus da Doença de Newcastle) ensaiados levaram a amplificação específica do gene 81. O limiar de detecção para a técnica de IC-RT-PCR foi idêntico ao do método de RT-PCR e correspondeu a 102.8 Doses Infectantes Embrionárias 50%. Para um total de 35 amostras de tecidos do trato respiratório testadas e provenientes de aves infectadas experimentalmente, 32 foram positivas pela técnica de IC-RT-PCR e também pela RT-PCR convencional, enquanto que o isolamento viral foi obtido para 22 dessas amostras. A análise do produto amplificado do gene 81 na IC-RT-PCR através da técnica de RFLP (restriction fragment length polymorphism), com as enzimas Alul e Mboll, permitiu a diferenciação das 5 estirpes de referências e dos 6 isolados de campo analisados em 4 diferentes genótipos, correspondentes às estirpes de referência M41, Connecticut, ou 8E-17, ou a um isolado de campo. Portanto, a técnica de IC¬RT -PCR demonstrou um grande potencial para ser aplicada no diagnóstico direto do VBI, apresentando vantagens sobre a técnica convencional de RT-PCR, as quais foram derivadas da combinação da especificidade da imunocaptura em fase sólida com a sensibilidade da reação de PCR, o que pode proporcionar ganho de tempo e menor custo para a manipulação de um maior número de amostras. / Abstract: In this study, the immunocapture procedure followed by reverse transcription and polymerase chain reaction (IC-RT-PCR) technique was standardized and applied for the amplification of 5'- proximal pari of 81 gene of infectious bronchitis virus (IBV) in infected f1uid or tissue samples, which were collected from embryonating chicken eggs or experimentally infected birds. The results of this technique were compared with those obtained in conventional RT-PCR. Ali eleven IBV strains tested were amplified, while none of the heterologous avian viral pathogens (Groups A and B Avian Pneumovirus, Newcastle Disease Virus and Gumboro Disease Vírus) gave positive results. The limit of detection for IC-RT¬PCR was identical to the common RT-PCR and corresponded to 102.8 50% embryonic infectious doses. Thirty two out of thirty five respiratory tissue samples collected from experimentally infected chickens were positive by both molecular techniques (IC-RT-PCR I common RT-PCR), whereas the vírus isolation test detected IBV in twenty two of these samples. The AluL and Mobll RFLP analysis of the 228 bp amplicon generated from IC-RT-PCR led to the discrimination of the 5 reference strains and 6 field IBV isolates in four genotypes; which were associated to the M41, to Connecticut, ar to 8E-17 strain, or to a field isolate. Therefore, the IC-RT-PCR demonstrated in this study a high potential for the application in the direct diagnosis of IBV and has relevant advantages over the conventional RT¬PCR, because it combines the specificity of the immunocapture in a solid phase with the sensitivity of the PCR, providing simplicity, rapidity and low cost for the manipulation of a high number of samples. / Mestre

Orientador: Hélio José Montassier / Banca: José Moacir Marin / Banca: Liana Brentano / Resumo: Um método de diagnóstico baseado na associação entre as técnicas de RT-PCR e ELISA foi desenvolvido para a detecção do vírus da bronquite infecciosa das aves (VBI). Inicialmente, a especificidade e a sensibilidade analíticas dessa técnica, bem como dos métodos de RT-PCR e Nested-RT-PCR, foram determinadas, tendo-se demonstrado, para o primeiro parâmetro, apenas a detecção do VBI, enquanto que outros vírus heterólogos aviários testados, tais como pneumovírus aviário (APV / estirpe do grupo B), vírus da doença de Newcastle (NDV / estirpe La Sota) e vírus da doença de Gumboro (GDV - estirpe Lukert), não foram detectados. Quanto à avaliação da sensibilidade analítica dos métodos empregados neste estudo foi constatado que o RT-PCR-ELISA demonstrou ser 10 vezes mais sensível do que a RT-PCR, enquanto que a reação de Nested-PCR foi 100 vezes mais sensível que a RT-PCR e 10 vezes mais sensível que o RT-PCR-ELISA. A técnica de RT-PCR-ELISA, juntamente com os outros dois métodos de biologia molecular, foram aplicadas para a detecção das estirpes H-120 e A034 do VBI, em amostras de pulmão e traquéia obtidas de aves experimentalmente infectadas com essas duas estirpes virais. Os resultados obtidos nos diferentes métodos de biologia molecular foram comparados entre si e com a técnica padrão de isolamento viral em ovos embrionados, verificando-se que o RT-PCR-ELISA revelou-se tão específico quanto as técnicas de isolamento viral e Nested-PCR, porém foi menos sensível do que esses mesmos métodos na detecção do VBI. A técnica de RT-PCR-ELISA, utilizada pela primeira vez para o VBI, demonstrou o potencial de se constituir uma alternativa viável para um diagnóstico direto mais rápido e específico do VBI. / Abstract: A molecular biology method for the detection of avian infectious bronchitis virus (IBV) was developed combining the reverse transcription and polymerase chain reaction (RT-PCR) with the enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA). Firstly, the analytical specificity and sensitivity of RT-PCR-ELISA, RT-PCR and Nested-RT-PCR were assessed. The specificity of these methods were confirmed since only IBV was detected, while other heterologous avian viral pathogens such as pneumovirus (Group B), Newcastle disease virus (LaSota strain) and gumboro disease virus (Lukert strain) were not detected by these techniques. The sensitivity of these methods was established, indicating that the RT-PCR-ELISA was about ten times more sensitive than conventional RT-PCR, while Nested-PCR was a hundred more sensitive than RT-PCR and ten times more sensitive than PCR-ELISA. The RT-PCR-ELISA and the two molecular biology methods were also applied for the detection of IBV strains H-120 and A034, in lung and tracheal tissue samples collected from experimentally infected chickens. The results of these different methods were also compared with the standard diagnostic technique, the virus isolation in chicken embryonated eggs, showing that RT-PCR-ELISA was as specific as virus isolation and Nested-PCR, however it was less sensitive than these methods for the IBV detection. The RT-PCR-ELISA, applied for the first time for IBV detection and direct diagnosis in tissue samples, can be potentially applied as an useful alternative for the rapid and specific diagnosis of IBV. / Mestre

Orientador: Silvio José Bicudo / Banca: Paulo Roberto de Lima Meirelles / Banca: Eduardo Barreto Aguiar / Banca: Ciniro Costa / Banca: Teresa Losada Vale / Resumo: A mandioca, por ser concentradora de amido na raiz, fonte de energia, e proteína na parte aérea, tem sido usada na alimentação de animais domésticos. A prática da poda da parte aérea da mandioca é comum em lavouras destinadas à produção de raízes para a indústria, porém esta prática ainda é pouca estudada. Com objetivo de avaliar o potencial do uso da planta de mandioca, podada em diferentes épocas, na alimentação animal, por meio de análises bromatológicas, foi realizado entre os anos de 2008/2010, na UNESP-Botucatu, experimento, em blocos completos casualizados, envolvendo podas da parte aérea da variedade IAC-14. As plantas foram podadas mês a mês, do sétimo ao décimo quinto mês após o plantio (MAP) e uma testemunha sem poda. As análises bromatológicas foram efetuadas no momento da colheita, ou seja, 22 MAP. Foram analisadas a produção, produtividade em massa seca e fresca da raiz e parte aérea, o conteúdo e produtividade de proteína bruta (PB) e as porcentagens de fibra bruta (FB), fibra em detergente neutro (FDN), fibra em detergente ácido (FDA), nutrientes digestíveis totais (NDT), extrato livre de nitrogênio (ELN) e açúcares totais da parte aérea e da raiz, além do conteúdo e produtividade do amido de raiz. Foi calculado, a partir de equações matemáticas, valores de energia metabolizável para aves e coelhos e digestível para ruminantes, tanto da parte aérea quanto da raiz. Não foi observada diferença na produtividade de matéria fresca de raiz entre os tratamentos estudados. Podas realizadas anteriormente ao período de repouso fisiológico causaram nas raízes: menores porcentagens de amido e a mesma produtividade. Em relação à parte aérea, tecidos mais jovens, ou seja, plantas podadas tardiamente tiveram menores porcentagens de PB e FB. Com relação à... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The cassava, to be concentrating starch on the root, source of energy and protein in the shoot, has been used in feed for livestock. The practice of pruning is common in cassava crops for the production of roots for the industry, but this practice is still little studied. In order to evaluate the potential use of the cassava plant, pruned at different times, in animal feed, through chemical analysis was performed between the years 2008/2010, at UNESP-Botucatu, research, in a randomized block design, pruning of shoots involving the IAC-14. The plants were pruned every month, on the seventh of the fifteenth month after planting (MAP) and a control without pruning. The chemical analyzes were performed at harvest, 22 MAP. Were analyzed the production, productivity in fresh and dry matter of roots and shoots, content and productivity of crude protein (CP), crude fiber (CF), neutral detergent fiber (NDF), acid detergent fiber (ADF), total digestible nutrients (TDN), nitrogen free extract (ELN) and total sugars of shoot and root, and the root starch. Were calculated from mathematical equations, metabolizable energy values for poultry and rabbits and digestible for ruminants, such as roots as aeral part. We analyzed the production, productivity in fresh and dry matter of roots and shoots, content and productivity of crude protein (CP) and the percentages of crude fiber (CF), neutral detergent fiber (NDF), acid detergent fiber (ADF), total digestible nutrients (TDN), nitrogen free extract (NFE) and total sugars of shoot and root, beyond the content and productivity of root starch. Were calculated, from mathematical equations, the metabolizable energy values for poultry and rabbits and digestible for ruminants of the shoot and root. There was no difference in the productivity of fresh root among treatments. Pruning before the rest period... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Orientador: Hélio José Montassier / Banca: João Pessoa Araujo Júnior / Banca: Valéria Marçal Félix de Lima / Banca: Edison Luiz Durigon / Banca: Jesus Aparecido Ferro / Resumo: O vírus da Bronquite infecciosa (VBI) é um Coronavírus aviário que infecta aves domésticas de corte e postura, ocasionando grandes perdas econômicas na indústria avícola. Dada a natureza altamente contagiosa e aguda da doença, há uma grande necessidade do desenvolvimento de métodos diagnósticos que possam ajudar na detecção e/ou caracterização de estirpes variantes do VBI. Sendo assim, para auxiliar no diagnostico laboratorial da infecção, foi construída uma biblioteca de fragmentos de anticorpos monoclonais pela técnica de Phage-display. Para tanto, após a imunização de galinhas com a estirpe vacinal H120, foi extraído o RNA total do baço das aves imunizadas e amplificadas as cadeias variáveis leve e pesada que foram unidas por linker, originando o fragmento gênico de cadeia única scFv. Após a realização de três ciclos de seleção foram obtidos 400 clones que foram avaliados em ensaios de ELISA e Western blotting para averiguação da especificidade dos mesmos frente às proteínas da estirpe H120. Após realização dos testes foram selecionados dois clones, um que apresentou grande reatividade para com a proteína de nucleocapsídeo (N) (scFv-N) e o outro com reatividade para com a subunidade 1 da glicoproteína de superfície (S) (scFv-S1). O anticorpo scFv-S1 quando utilizado em ensaio de vírus-neutralização em ovos embrionados mostrou titulo significativo de proteção. Já em testes de ELISA utilizando estirpes de referência e isolados brasileiros de campo do VBI, o anticorpo scFv-N foi capaz de detectar todas as estirpes (H120, M41, Arkansas, IBVPR05, IBVPR02, IBVPR01, IBVSC01), enquanto que o scFv-S1 pode discriminar as estirpes pertencentes ao sorotipo Massachusetts (H120, M41 e IBVSC01) das demais estirpes variantes avaliadas. Os fragmentos de anticorpos scFv-N e scFv-S1 também mostraram bons resultados quando utilizados na técnica... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Infectious bronchitis virus (IBV), the coronavirus of the chicken, is one of the main causes of economic loss within the poultry industry, affecting the performance of meattype and egg-laying domestic fowls. Given the highly contagious and acute nature of the disease, there is an urgent need for the development of diagnostic assays that can detect and/or characterize IBV strains. In order to improve the laboratory diagnosis of IBV infection, phage-displayed recombinant antibody library derived from splenic mRNA of chickens immunized with H120 vaccine strain of infectious bronchitis virus (IBV) was constructed as single chain variable fragments (scFv) by overlap extension polymerase chain reaction (PCR) of the individual heavy (VH) and light (VL) chain variable gene segments. After three rounds of panning selection, ten scFv phage display antibodies of 400 randomly chosen clones were demonstrated to react with IBV antigens by ELISA. The western blot analysis selected two scFv antibodies reacting strongly with nucleocapsid (N) (scFv-N) protein or subunit 1 of spike glycoprotein (S1) (scFv-S1) of IBV. The anti-S1 scFv antibody showed a significant neutralization titre in embryonating chicken egg test. In ELISA analysis using reference IBV strains and Brazilian field isolates, the anti-N scFv antibody was able to detect all strains (H120, M41, ARKANSAS, IBVPR05, IBVPR02, IBVPR01, IBVSC01), while the anti-S1 could discriminate Massachusetts serotype (H120, M41 and IBVSC01) between variant strains. A scFv-based indirect immunoperoxidase (IP) procedure was also applied to detect infectious bronchitis virus (IBV) antigens in formalin-fixed tracheal tissue sections. Thus, the results showed that scFv-N and scFv-S1 antibodies can be used for the detection and differentiation of IBV strains. / Doutor

Orientador: Irenilza de Alencar Nääs / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia Agricola / Made available in DSpace on 2018-08-04T17:21:01Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Lima_AnnaMonteiroCorreia_D.pdf: 727089 bytes, checksum: 35dbabd5e5be44e560b02060dfe791b0 (MD5) Previous issue date: 2005 / Resumo: O aumento de produção que levou o Brasil a ocupar a posição de segundo maior produtor de frangos de corte do mundo se deve a intensificação de criação. Essa intensificação teve como base vários aspectos que foram cuidadosamente controlados, dentre eles a nutrição e o manejo (sistemas de criação, ambiência, sanidade etc). Atualmente o que se observa em várias partes do mundo é a tendência em produzir frangos de corte, com bem estar animal. Paralelamente no Brasil, vem ressurgindo em nova versão a criação de frangos caipiras. O objetivo desse estudo foi avaliar índices zootécnicos obtidos durante a produção de dois sistemas de frango de corte em escala comercial (In situ), um intensivo, convencional (granja A) e outro semi-extensivo, caipira (granja B), para verificar as inter-relações entre bem-estar animal, manejo, saúde animal e qualidade da carne. Na granja A foram alojados 14000 pintos enquanto que na granja B foram 7150. Observou-se que frangos da granja A apresentaram mais problemas locomotores: calos de pés, discondroplasia tibial quando comparados com frangos provenientes da granja B. Os frangos da granja A apresentaram alta prevalência de necrose da cabeça do fêmur, melhor conversão alimentar e ganho de peso, embora tenham apresentado maior mortalidade A e B, foram respectivamente 5,32 e 1,34%. Quanto a Salmonella sp. e Mycoplasma sp. não houve presença de frangos reagentes nas duas granjas. Quanto à qualidade da carne em termos físico-químicos, o pH do peito apresentou-se menor significativamente para carcaças de frangos provenientes da granja A, enquanto o pH da coxa não apresentou diferença significativa. A força de cisalhamento da carne de frango proveniente da granja A apresentou-se menor, quando comparada à de carcaças de frangos da granja B (1,972 para carcaças de A e 2,462 para as de B). A capacidade de retenção de água não diferiu entre as carcaçaa provenientes das granjas. Em termos microbiológicos a Salmonella sp. não foi encontrada em nenhuma carcaça de frango, embora a Listeria sp. tenha sido encontrada em 50% das carcaças analisadas. Os frangos da granja B estiveram em melhores condições de bem-estar animal. Com base nesses resultados foi possível estimar que os índices zootécnicos da granja A foram melhores que os da granja B, entretanto os problemas locomotores foram maiores nos frangos provenientes da granja A / Abstract: The increase in production technology was the major factor that lead Brazil to be the second largest world poultry producer. This production technology had the basis several aspects that were carefully controlled, among them nutrition and management (environment, health and rearing systems). Nowadays it is observed a world¿s tendency to produce animal searching good welfare conditions. In parallel in Brazil is growing a new version of extensive produced broilers (free-range broiler). The objective of this study was to evaluate the production indexes from two distinct industrial scale broiler productions (in situ): one intensive (farm A) and other semi-extensive (farm B) for verifying the inter-relations among welfare, management, health and meat quality (14000 broilers in farm A and 7150 broilers in farm B). It was observed that birds from farm A showed more leg weakness (foot burn and tibial dyschondroplasia) when compared with broiler from farm B. The broilers from farm A presented high prevalence of femur necrosis, higher feed conversion, and higher gain weight, although they had presented higher mortality (5,32 in farm A and 1,34% in farm B.). Regarding Salmonella sp and Mycoplasma sp it was not found serological reagent birds in neither of the studied farms. Regarding meat quality (in the physical chemistry analysis) the breast meat pH from farm A¿s birds presented values significantly smaller than the bird¿s carcass from farm B. The shearing force on meat from broiler reared at farm A were smaller than the ones from birds reared at farm B (1,972 farm A e 2,462 farm B).. Water holding capacity did not differ from the carcasses from both farms. In microbiological terms Samonella sp was not found the studied carcasses, however Listeria sp was found in 50% of the analyzed carcasses. About welfare conditions broilers from farm B were better. Based on these results it was possible to estimate that production index was better in farm A than in farm B, however leg weakness problems were higher in broilers from farm B / Doutorado / Construções Rurais e Ambiencia / Doutor em Engenharia Agrícola