Orientador: Simon Biagio Chiacchio / Banca: Roberto Calderon Gonçalves / Banca: Rogério Martins Amorim / Banca: José Giometti / Banca: Laurenil Gaste / Resumo: O objetivo do experimento foi avaliar o efeito de diferentes suplementações com selênio (Se) sobre a resposta imune humoral anti-rábica, na concentração sérica de selênio e cortisol em bovinos. Utilizou-se sessenta bovinos machos não castrados da raça Nelore, com 10 a 12 meses de idade, alimentados com pastagem de Brachiaria decumbens. Os animais foram divididos em 4 grupos (N=15) sendo que o primeiro deles não receberam suplementação (Gc) e os outros três suplementados diariamente e individualmente com concentrações de Se de 3,6 mg (G3,6), 5,4 mg (G5,4) ou 6,4 mg (G6,4). Os animais foram imunizados no dia zero com uma dose de vacina anti-rábica comercial, líquida e inativada. Nos dias zero, 15, 30, 60, 90 e 120 durante os quais submetidos ao estresse de manejo no curral e colheita de sangue. As amostras de sangue foram colhidas depois da vacinação e depois de serem submetidos ao estresse para determinação da concentração sérica de selênio, títulos de anticorpos anti-rábicos e cortisol sérico. A concentração de selênio também foi determinada nas amostras das forrageiras colhidas dos piquetes utilizados pelos bovinos. A concentração de Se na B. decumbens foi de 0,04 mg de Se/Kg de matéria seca. A concentração sérica de Se obtida no dia zero no grupo Gc era mais elevada que nos grupos G5,4 e G6,4 (P= 0,005). A concentração sérica de Se diminuiu ao longo do experimento no Gc (P<0,004), aumentou no G3,6 (P<0,000) e no grupo G5,4 (P<0,000), entretanto, no grupo G6,4 aumentou no dia 60 (P<0,002). Os títulos de anticorpos anti-rábicos não diferiram entre os grupos tratados ou não com selênio. Entretanto, 120 dias após a vacinação os títulos de anticorpos no grupo G3,6 permaneceram acima do mínimo considerado protetor (=0,5 UI/mL) (P<0,000), enquanto que nos outros grupos permaneceram baixos (P<0,05). A concentração sérica de cortisol dos bovinos... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: This study evaluated the effect of different concentrations of selenium (Se) supplementation on cattle antirabies humoral immune response, serum Se concentrations and cortisol levels. Sixty uncastrated male Nelore calves from 10 to 12 months grazing on Brachiaria decumbens forage were studied. The animals were assigned to one of four groups (N=15 each), which received nonsupplemented diets (Gc) or supplemented with daily and individual Se concentrations of 3.6 mg (G3.6), 5.4 mg (G5.4) or 6.4 mg (G6.4). The animals were immunized on day 0 with one dose of commercial liquid inactivated rabies vaccination. On days 15, 30, 60, 90 and 120, the cattle underwent the same stressing procedures used for vaccination in the corral. Cattle blood samples were collected after vaccination and stressing procedures to determine serum Se levels, rabies antibody titers and serum cortisol. Se levels were also determined in forage samples collected from the paddocks in which the cattle were held. Se concentration in B. decumbens was 0.04 mg of Se/Kg dry matter. Baseline Se levels obtained on day 0 were higher in Gc than in G5.4 and G6.4 (P= 0.005). Serum Se levels decreased in Gc throughout the experiment (P<0.004), increased in G3.6 (P<0.000) and G5.4 (P<0.000) and were kept high from day 60 on in group G6.4 (P<0.002). Rabies antibody titers did not differ between control and supplemented groups. However, 120 post-vaccination rabies antibody titers were kept above the protecti ve levels (=0.5 UI/mL) only in group G3.6 (P<0.00002), whereas they dropped in the other groups (P<0.05). Serum cortisol levels did not differ among the experimental groups (P=0.79), reached peak levels on day 90 and returned close to baseline levels on day 120. Se and cortisol levels were not markedly correlated. Serum cortisol and rabies antibody titers were correlated only in group G6.4, on day 60 (R=0.513; P=0.05)... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Resumo: O fator de transcrição mitocondrial A (gene Tfam), uma proteína fundamental para a ocorrência do processo de transcrição mitocondrial e um participante na replicação do genoma dessa organela, atua indiretamente na biogênese e oxidação de lipídeos. O objetivo do presente estudo foi de caracterizar e verificar a relação entre polimorfismos na região promotora do gene Tfam com características de carcaça em novilhas Nelore. Foram analisadas 272 novilhas da raça Nelore pertencentes a três rebanhos experimentais da Estação Experimental de Zootecnia de Sertãozinho - (EEZS), unidade de pesquisa do Instituto de Zootecnia, dois deles selecionados (NeS e NeT) para peso ao ano (machos) e ao sobreano (fêmeas) e um rebanho controle (NeC), em que os animais são selecionados para a média desses pesos. O DNA genômico foi extraído a partir do sangue dos animais, seguindo-se a amplificação do fragmento analisado e posterior digestão com enzimas de restrição. As medidas de gordura de cobertura foram obtidas por ultra-sonografia entre 555 e 800 dias de idade. Pela análise de PCR-RFLP-Hae III foi observada a presença de três genótipos (AA, CA e CC) e, pela análise de PCR-RFLP-Mbo I foram observados apenas dois genótipos (CC e TC). Não houve associação significativa entre os polimorfismos observados no gene Tfam, com as enzimas Hae III e Mbo l, e a característica espessura de gordura de cobertura. Entretanto, os resultados sugerem uma associação entre o polimorfismo detectado pela enzima Hae III e a área do músculo Longissimus dorsi. / Abstract: The mitochondrial transcription factor A (Tfam) is an essential protein for the transcription and genome replication processes of this organelle which also has indirect effects on lipids biosynthesis and oxidation. This study was conducted on intent to verify the existence of polymorphisms on the promoter region of Tfam gene and verify their possible relationships with carcass traits from Nelore heifers (Bos indicus). Genomic DNA were extracted from blood samples of 272 animals followed by PCR isolation/amplification of Tfam gene and application of the RFLP with thr restriction enzymes Hae III and Mbo I. The carcass traits considered were rib eye and fat thickness and were obtained by ultrasound between the ages of 555 and 800 days. The analysis with PCR-RFLP Hae III and Mbo I showed the migration patterns AA, CA, CC and CC,TC, respectively. There was no significant association among the patterns obtained and the fat thickness. However, the results showed an associated effect among the patterns obtained with PCR-RFLP Hae III and rib eye, which indicates the possible use of Tfam as a candidate gene. / Orientadora: Lúcia Galvão de Albuquerque / Coorientadora: Maria Eugênia Zerlotti Mercadante / Banca: Humberto Tonhati / Banca: Antonio Roberto Otaviano / Mestre

Orientador: João Carlos Pinheiro Ferreira / Banca: Mario Binelli / Banca: Roberto Sartori Filho / Resumo: O objetivo do presente estudo foi estudar as alterações da concentração plasmática de progesterona (P4), perfusão sanguínea e volume luteais após administração de sub-dose de cloprostenol sódico (análogo da PGF2α) no sexto dia do ciclo estral em bovinos. Foram utilizadas 18 vacas da raça Caracu adultas, e em todas foram inicialmente sincronizadas as ovulações antes de serem iniciados os três módulo experimentais. Em cada módulos as vacas foram divididas aleatoriamente entre os grupos 1 (desafiadas com 2 mL de solução fisiológica 0,9%; IM, n=6), 2 (duas doses de 500 μg de cloprostenol sódico com intervalo de 2 horas, n=6) e 3 (83,33 μg de cloprostenol sódico IM, n=7). As coletas de dados foram iniciadas com avaliações ultrassonográficas modo B e Power-Doppler, seguida de coleta de sangue para dosagem de P4, realizadas nos momentos 0, 8, 16, 24, 32, 40 e 48 horas após o tratamento. Os dados foram submetidos a analise de variância e para diferenças entre as médias foi aplicado o teste TUKEY com 5% de probabilidade. Os tratamentos influenciaram as concentrações plasmáticas de P4, perfusão sanguínea e volume luteal. No tratamento 1 não foi observado alterações na P4, perfusão sanguínea e volume luteal, porém no tratamento 2 a progesterona diminuiu no momento 16 e nos momentos seguintes foram semelhas ao observados inicialmente. A perfusão sanguínea e volume luteal diminuíram 48 horas após o tratamento 2. No tratamento 3 a P4 diminuiu até a hora 16 e voltou a aumentar, igualando a valores iniciais.Porém a perfusão sanguínea e volume não alteraram. No grupo luteólise quando excluído um animal que não apresentou luteólise, a P4 manteve-se baixa a partir da hora 16, e no grupo luteólise parcial quando excluído o animal que apresentou luteólise total, a P4 48 horas após tratamento foi maior que na hora 16... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The objective of this study was to evaluate progesterone plasmatic concentration, blood flow and luteal volume after cloprostenol (PGF2α analogue) sub-doses on sixth day of bovine estrus cycles. Initially all animals has the ovulations synchronize to initiate every stage. In tree firsts stage on day 6 the animals receive treatment and in every stage it were randomly allocate between group 1 (2 mL Physiologic solution 0,9%; IM, n=6 ), 2 (two doses 500 μg cloprostenol 2 hours interval, n=6) and 3 (83,33 μg cloprostenol IM on D6, n=7). Data collection were initiate with mode B ultrasonography and Power-Doppler evaluations follow by blood collection for progesterone (P4) measure at moments 0, 8, 16, 24, 32, 40 e 48 hours after treatment. Data was submitted to variance analyze between mean the TUKEY test with 5% probability was applied. Treatments influenced P4 concentration, blood flow and luteal volume. On treatment 1 there was no P4, blood perfusion and luteal volume changes, but on treatment 2 P4 decrease on moment 16 the follow moments was similar to the initial.Blood flow and luteal volume decreased 48 hours after treatment 2. In treatment 3 was observed a decrease in P4 concentrations from moment 0 to 16 with a increase returning to initial values after this moment. Although this, blood flow and luteal volume did not change. On luteolysis group when excluded a animal that had partial luteolysis P4 concentrations remained low after hour 16. On partial luteolysis group when a animal that had luteolysis was excluded P4 at 48 hours after treatment was higher than 16 hour. Is possible to conclude that 83,33 μg cloprostenol causes partial luteolysis and that is characterized by an initial P4 decrease 16 hours after treatment follow by luteal function rescue on the follow moments / Mestre

Resumo: O estudo teve por objetivo avaliar o índice bispectral, efeitos hemodinâmicos e respiratórios da infusão contínua de diferentes taxas de propofol em bezerros. Foram utilizados 8 animais de seis a 12 meses de idade, holandeses, pesando de 84 a 124 kg. Os animais foram induzidos à anestesia com propofol na dose de 5 mg/kg IV e posicionados em decúbito lateral direito, onde permaneceram respirando espontaneamente ar ambiente. Ato contínuo, a manutenção anestésica foi realizada pela infusão contínua de propofol, administrado por meio de bomba de infusão em duas diferentes taxas 0,6 mg/kg/minuto IV (G06) e 0,8 mg/kg/minuto IV, (G08) durante 60 minutos. Os 8 animais foram anestesiados duas vezes, com uma semana de intervalo entre uma anestesia e outra. As variáveis hemodinâmicas (FC, PAS, PAD, PAM, DC, PVC, PAPm, PAPOm, IC, IS, IRVS e IRVP), respiratórias (ETCO, f, SpO, 2 2 V, V, e PFI), hemogasométricas (PaO, PaCO, SaO, DB, pH e HCO -) e TE ME 2 2 2 3 índice bispectral (BIS, EMG e IQS) foram avaliadas antes da indução anestésica (M ), e 15, 30, 45 e 60 minutos após o início da infusão contínua do B propofol (M15, M30, M45 e M60, respectivamente). Já a colheita das amostras para a dosagem plasmática do propofol foi realizada aos M15, M30, M45 e M60 minutos durante a infusão contínua do propofol e as demais colheitas foram realizadas após o termino da infusão com intervalos de 10 minutos por um período de 50 minutos (M70, M80, M90, M100 e M110 respectivamente). A infusão contínua de diferentes taxas de propofol não alterou as variáveis do BIS ao longo do tempo durante a infusão, também não causou alterações hemodinâmicas importantes, porém o G08 apresentou acidose respiratória indicando uso de ventilação controlada / Abstract: The aim of this study was to evaluate the bispectral index, hemodynamic and respiratory effects of continuous infusion of different rates of propofol in calves. Eight Holstein calves aging between six and 12 months and weighing 84-124 kg were used. They were induced to anesthesia with propofol at a dose of 5 mg / kg IV and positioned in right lateral recumbency, where they remained spontaneously breathing ambient air. Immediately thereafter, the anesthesia was maintained by continuous infusion of propofol administered with the aid of an infusion pump in two different rates 0.6 mg / kg / minute, IV (G06) and 0.8 mg / kg / minute, IV, (G08), during 60 minutes. The 8 animals were anesthetized twice, with one-week interval between anesthesia. The measurements of hemodynamic (HR, SAP, DAP, MAP, CO, CVP, mPAP, mPAPO, CI, SI, SVRI and PVRI), and respiratory parameters (ETCO2, f, SpO2, VTE, VME, and PFI), arterial blood gases (PaO2, PaCO2, SaO2, BE, pH and HCO3-) and bispectral index (BIS, EMG and SQI) were assessed before induction of anesthesia (MB), and 15, 30, 45 and 60 minutes after the start of continuous infusion of propofol (M15 , M30, M45 and M60, respectively). Sampling to measure plasma propofol was performed M15, M30, M45 and M60 minutes during continuous infusion of propofol and other samples were harvested after the end of infusion with 10-minute intervals during a period of 50 minutes (M70, M80, M90, M100 and M110 respectively). Continuous infusion of propofol at different rates did not alter the variables BIS over time and also did not cause significant hemodynamic changes, but the G08 had respiratory acidosis suggesting the use of controlled ventilation / Orientador: Paulo Sergio Patto dos Santos / Banca: Valéria Nobre Leal de Souza Oliva / Banca: Simone Bopp / Mestre

Orientador: José Buratini Junior / Banca: José Antonio Visitin / Banca: Guilherme de Paula Nogueira / Banca: Fernanda da Cruz Landim e Alvarenga / Banca: Sony Dimas Bicudo / Resumo: Durante o desenvolvimento ovariano fetal, a formação folicular inicial é decisiva para a fertilidade da fêmea, pois define sua reserva gametogênica. Tem sido proposto que a progesterona e o estradiol desempenham papel regulatório na foliculogênese pré-antral, de forma que sua produção reduzida em ovários fetais bovinos antecede o surgimento de folículos primordiais e primários. Recentemente, os FGFs 10 e 18 foram reportados em folículos ovarianos bovinos como redutores dos níveis de esteróides, o que parece envolver a inibição da expressão de enzimas necessárias à esteroidogênese. Em adição, a expressão do FGF10 foi observada durante o desenvolvimento ovariano fetal bovino, e esteve positivamente associada ao aumento no número de folículos primários. O presente estudo investigou primeiramente o padrão de expressão do RNAm das enzimas esteroidogênicas (StAR, CYP11A1, 3β-HSD, CYP17A1, CYP19A1 e 17β-HSD) em ovários de fetos bovinos em idades gestacionais específicas (60, 75, 90, 120, 150 e 210 dias). Todos os genes investigados se mostraram expressos e regulados ao longo da gestação. Os níveis de RNAm da CYP19A1 diminuíram dos 60 para os 90 dias, sugerindo envolvimento desta enzima com a produção decrescente de estradiol observada previamente durante este período gestacional. A expressão das demais enzimas foi elevada ao longo da gestação, coincidente com o aumento da competência esteroidogênica descrito preliminarmente durante o desenvolvimento folicular inicial. Em adição, foi investigada a participação dos FGFs 10 e 18 na esteroidogênese ovariana fetal bovina. A expressão do FGF18 e de seus receptores (FGFR2C, FGFR3C e FGFR4) foi detectada em ovários fetais bovinos ao longo da gestação (60, 75, 90, 120, 150 e 210 dias). A abundância de RNAm do FGF18 aumentou... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: During fetal ovarian development, early follicular formation is essential to female fertility, when the gametogenic reserve is defined. It has been proposed that progesterone and estradiol play regulatory role on preantral folliculogenesis, once its reduced production in bovine fetal ovaries precedes primordial and primary follicle assembly. Recentlly, FGFs 10 and 18 were reported in bovine ovarian follicles as reducers of steroids levels, and this seems to involve the inhibition of enzymes necessary to steroidogenesis. In addition, FGF10 expression was observed during bovine fetal ovary development, and it was positively associated with the elevation on primary follicles number. The present study first investigated the mRNA expression patterns for steroidogenic enzymes (StAR, CYP11A1, HSD3B1, CYP17A1, CYP19A1 and HSD17B1) in bovine fetal ovaries at specific gestational ages (60, 75, 90, 120, 150 e 210 days). Expression of all investigated genes was detected and regulated through gestation. Messenger RNA levels of CYP19A1 decreased from days 60 to 90 of gestation, suggesting involvement of this enzyme on decrescent estradiol production previously observed during this gestational period. The expression of other enzymes was elevated during gestational period, which was coincident with the enhance of steroidogenic competence previously described during early follicular development. In addition, the participation of FGFs 10 and 18 on steroidogenesis in bovine fetal ovaries was investigated. The expression of FGF18 and its receptors (FGFR2C, FGFR3C and FGFR4) was detected in bovine fetal ovaries through gestation (60, 75, 90, 120, 150 e 210 days). The mRNA abundance of FGF18 enhanced between 90 and 120 days and decreased at 210 days. The expression of FGFR2C and FGFR4 did not vary during... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Orientador: Gilson Pereira de Oliveira / Banca: Marcos Rogerio André / Banca: Márcia Cristina de Senna Oliveira / Resumo: Os extratos vegetais têm sido importantes fontes de substâncias com diferentes estruturas químicas expressando diversas atividades deletérias contra os parasitas. A presente pesquisa teve como objetivo avaliar a ação antiparasitária de Artemisia annua in vivo. Para tal, foram propostos dois estudos: um utilizando bovinos naturalmente infestados e outro usando ovinos artificialmente infectados. Experimento I: foram selecionadas vinte novilhas com peso médio de 280 kg para avaliar a eficácia carrapaticida sobre R. (Boophilus) microplus. As mesmas foram divididas em dois grupos experimentais, um grupo que recebeu por via oral 200g/dia de A. annua em cocho coletivo e outro não recebeu. As contagens foram realizadas nos dias 0, 3, 7, 21, 35, 42, 49, 56, pós tratamento.Foi realizada a quantificação de artemisinina por cromatografia líquida de alta eficiência. Os resultados das três contagens de carrapatos com o valor referente às médias do dia foi 96,55. Nas contagens posteriores não observou-se diferença significativa entre ambos os grupos. Experimento II: Para avaliar a atividade antihelmíntica, foi conduzido um estudo controlado utilizando-se vinte e quatro ovinos machos Santa Inês com peso médio de 20 Kg artificialmente infectados com H. contortus e randomizados em quatro grupos homogêneos com seis animais cada, sendo, controle não tratado (Grupo I), Controle positivo tratado com levamizol 10 mg/kg (GII), A. annua a 10% (GIII) e A. annua a 20% (GIV). Contagens de OPG foram realizadas nos dias -3, -2, - 1, 0 (dia do tratamento), 3, 7, 10, 14, 17, 21, 24 e 28 pós-tratamento. De acordo com as quantificações estatísticas, foram observadas eficácias persistentes de 92,57% e de 85,00% no grupo controle positivo tratado com levamizol. Nota-se não houve diferença significativa entre ambos os grupos. Portanto, os resultados obtidos possibilitam inferir que A. annua administrada via ... / Abstract: Vegetal extracts has been important sources for substances with different chemical structures that express several deleterious activities against parasites. The present study focused on evaluating the anti-parasitic action of Artemisia annua in vivo. For such, two experiments were proposed: one using naturally infested animals and a second one with artificially infected sheep. Experiment I: twenty heifers weighing around 280 kg were selected in order to evaluate the acaricidal efficacy of the compound against Rhipicephalus (Boophilus) microplus. These animals were divided in two experimental groups: one being held as a control group and the second one were animals received, orally, 200 g/day of A. annua in a collective trough on days 0, 3, 7, 21, 35, 42, 49 and 56, post-treatment. Artemisinine was quantified through high performance liquid chromatography. Results of the three tick counts, regarding the average values, was of 96.55. In subsequent counts, no significant difference was observed between both groups. Experiment II: To evaluate the anthelmintic efficacy of the compound, a controlled trial was conducted using 24 male sheep, from the "Santa Inês" breed, with an average weight of 20 Kg, artificially infected with H. contortus. These animals were randomized in four homogeneous groups with six animals each, being: untreated control (Group I); positive control, treated with levamisole at 10 mg/kg (Group II); A. annua at 10% (Group III) and A. annua at 20% (Group IV). EPG counts were conducted on days -3, -2, -1, 0 (treatment day), 3, 7, 10, 14, 17, 21, 24 and 28 post-treatment. According to statistical quantifications, persistent efficacies of 92.57% and 85.00% were observed in the positive controls, treated with levamisole. It is possible to note that no significant difference was observed between the other groups. Therefore, the obtained results allow inferring that Artemisia annua ... / Mestre

Resumo:A HMGB1 pode atuar promovendo uma resposta inflamatória. Desta forma, os objetivos deste estudo foram quantificar sua concentração no plasma e no líquido peritoneal de bezerros com um processo crônico de hérnia umbilical, antes e após a herniorrafia, além de avaliar seu níveis durante paracenteses seriadas utilizadas como meio diagnóstico auxiliar para se avaliar a resposta inflamatória na cavidade abdominal. A presença de hérnia elevou os valores de HMGB1 no plasma e líquido e peritoneal. A herniorrafia não foi estímulo suficiente para aumentar as concentrações desta proteína no sangue. No entanto, no líquido peritoneal houve elevação dos níveis de HMGB1 em 7 a 15 dias após a cirurgia, decorrente do processo inflamatório esperado estabelecido na cavidade abdominal no pós-operatório. A realização de paracenteses seriadas foi capaz de elevar a concentração da HMGB1 apenas no líquido peritoneal, demonstrando um processo inflamatório local discreto, cujos valores retornam aos basais após um intervalo maior entre uma punção e outra. Sendo assim, a presença de hérnia umbilical congênita em bezerros causa reação local e sistêmica alterando os valores de HMGB1 tanto no plasma quanto no líquido peritoneal, enquanto a herniorrafia e a paracenteses seriadas provocam alterações nas concentrações de HMGB1 tardiamente apenas no líquido peritoneal / Abstract:HMGB1 protein may act by promoting an inflammatory response. Thus, the goals of this study were to quantify plasma and peritoneal fluid concentrations of HMGB1 in calves with or without congenital umbilical hernia before and after surgery, as well as assess their levels during serial paracentesis used as an auxiliary diagnostic tool for assessing the inflammatory response in the abdominal cavity. The presence of a congenital umbilical hernia caused increased values of HMGB1 in plasma and peritoneal fluid. The herniorraphy was not a stimulus intense enough to increase the concentration of this protein in the peripheral blood. However, in the peritoneal fluid, HMGB1 levels were increasead from 7 to 15 days after surgery, in response to the inflammatory process established in the abdominal cavity postoperatively. Serial paracentesis caused an increase of HMGB1 levels in the peritoneal fluid only, showing a mild inflammatory process, returning to baseline values after a longer interval between punctures. Thus, the presence of congenital umbilical hernias in calves cause local and systemic changes in HMGB1 levels both in plasma and in the peritoneal fluid while herniorraphy and serial paracentesis cause later changes in HMGB1 levels only in the peritoneal fluid / Orientador:Juliana Regina Peiró / Banca:Alexandre Secorun Borges / Banca:Valéria Marçal Felix de Lima / Mestre

Orientador: Ricardo da Fonseca / Coorientador: Aldrin Vieira Pires / Banca: Idalmo Garcia Pereira / Banca: Mauricio de Alvarenga Mudadu / Banca: Sandra Aidar de Queiroz / Banca: Roberto Carvalheiro / Resumo: No melhoramento genético animal a forma tradicional de realizar seleção é com base no fenótipo dos indivíduos e na informação do parentesco entre estes, porém é um processo lento, sendo assim, programas de melhoramento estão procurando identificar os genes responsáveis pela característica de interesse e assim realizar a seleção dos animais que carregam a informação desejada. Com as informações dos indivíduos genotipados, tornou-se possível a utilização da informação de genes idênticos em estado tornando viável a utilização de uma matriz de parentesco (G) permitindo aumentar a precisão das avaliações genéticas, porém, devido à dificuldade de se obter o genótipo de todos os animais de uma população, foi proposto um método que realiza a integração da matriz G com a matriz de parentesco (A) em uma matriz de parentesco-genômica (H). Embora tenham trabalhos que indiquem uma similaridade no progresso genético utilizando estas diferentes matrizes é importante a avaliação da contribuição da avaliação genômica nos processos de avaliação genética em populações com estruturas de parentesco diferentes, bem como avaliar a metodologia de seleção genômica em populações multirraciais, a fim de atender o sistema de criação de animais cruzados. Assim, o objetivo geral deste trabalho foi estudar os efeitos da informação genômica na avaliação genética animal por meio de diferentes matrizes genômicas, utilizando dados de bovinos de corte com diferentes estruturas populacionais e composições raciais. Primeiramente avaliou-se 3 diferentes metodologias de se obter a matriz H, com a frequência alélica observada (HGOF), menor frequência alélica (HGMF) e uma frequência de 0,5 para todos os SNPs (HG50). Foram feitas comparações entre estas matrizes genômicas e a matriz de parentesco tradicional (A) utilizando uma população de 1695 animais da raça Brahman (BB). De acordo com os ... / Abstract: In animal breeding methodologies, the traditional method of performing selection is based on the phenotype of individuals and information of relationship between them, but it is a slow process, so breeding programs are trying to identify the genes responsible for the trait of interest and thus achieve selection of animals that carry the interesting genes. With the information of genotyped individuals, it became possible to use the information of genes identical in state making it feasible to use a relationship matrix (G) which increase the accuracy of genetic evaluations, however, due to difficulty of obtaining the genotype of all animals in a population, we propose a method that performs the integration of the G matrix with the relationship matrix (A) in a pedigree-genomic relationship matrix (H). Although studies indicating a similarity in genetic progress using these matrices is important to evaluate the contribution of genomic evaluation in the process of genetic evaluation in populations with different structures of kinship, as well as evaluating the methodology of genomic selection in multiracial populations in order to cater to the creation of crossbred system. Thus the objective of this work was to study the effects of genomic information in genetic evaluation through different genomic arrays using data from beef cattle with different population structures and racial compositions. First we evaluated three different methods of obtaining the H matrix with the observed allele frequency (HGOF), lower allele frequency (HGMF) and a frequency of 0.5 for all SNPs (HG50). Comparisons between these genomic arrays and traditional kinship (A) using a population of 1695 animals breed Brahman (BB) matrix were made. According to the results , the HGOF was a matrix that showed the greatest similarity to the matrix A but the greatest differences were found in the classification of animals, when we evaluated the classification of animals ... / Doutor

Orientador: Luiz Carlos Marques / Banca: Lindsay Unno Gimenez / Banca: Cezinande Meira / Banca: Gilson Hélio Toniollo / Banca: Lúcia Helena Rodrigues / Resumo: O Brasil possui o maior rebanho bovino comercial do mundo e chegou a 212,8 milhões de cabeças em 2011. Foram comercializadas 12,3 milhões de doses de sêmen bovino em 2012. O efetivo de fêmeas bovinas em idade reprodutiva é 61,4 milhões e a utilização de duas doses de sêmen por vaca estima-se que 10% do rebanho nacional está sendo inseminado. A fertilidade é uma importante característica nos sistemas produtivos e o macho de grande importância. Utilizando a termografia infravermelha (TIV) e ultrassonografia Doppler a termorregulação e o fluxo sanguíneo foram avaliados em touros. Dois grupos de seis touros foram avaliados por um ano e os dados obtidos da termografia - temperatura global do plexo (TGP), temperatura global do escroto (TGE), temperatura do plexo esquerdo (TPE), temperatura do plexo direito (TPD), temperatura do escroto esquerdo (TEE), temperatura do escroto direito (TED) e da ultrassonografia Doppler - velocidade sistólica máxima (VSM), velocidade diastólica final (VDF), índice de pulsatilidade (IP), índice de resistência (IR) e a temperatura ambiental (TA) foram correlacionados com os espermogramas. Foram observadas correlações positivas e negativas entre as variáveis da TIV e US Doppler com as variáveis dos espermogramas e conclui-se que a TIV permite a observação de alterações precoces da temperatura do plexo e escroto; a US Doppler demonstrou correlações entre a VDF, IR e IP com qualidade do sêmen; de acordo com este estudo touros com qualidade de sêmen superior apresentaram menor impedância vascular das artérias testiculares / Abstract: Brazil has the largest commercial cattle herd in the world and reached 212,8 million head in 2011. 12,3 million doses of bovine semen were sold in 2012. Effective from cows of reproductive age is 61,4 million and the use of two doses of semen per cow is estimated that 10 % of the national herd is being inseminated. Fertility is an important feature in production systems and the bull has great importance. Using infrared thermography (IRT) and Doppler ultrasonography thermoregulation and blood flow were evaluated in bulls. Two groups of six bulls were evaluated for a year and the data of thermography - global temperature plexus (GTP), global temperature of the scrotum (GTE), temperature of the left plexus (TLP), temperature of the right plexus (TRP), temperature the left scrotum (TLE), temperature of the right scrotum (TRE) and Doppler ultrasonography - peak systolic velocity (PSV ), end diastolic velocity (EDV), pulsatility index (PI), resistance index (RI) and room temperature (RT) were correlated with semen analyzes. Positive and negative correlations were found between the variables of IRT and US Doppler variables of semen analyzes and concludes that IRT allows observation of early changes of the plexus and scrotal temperature; Doppler US demonstrated correlations between EDV, RI and IP with semen quality; according to this study bulls with superior quality of semen showed lower vascular impedance of the testicular arteries / Doutor

Orientador: Jackson Antônio Marcondes de Souza / Banca: Manoel Victor Franco Lemos / Banca: Amanda Azarias Guimarães / Resumo: Desde a expansão da indústria, a partir da revolução industrial, a população mundial tem crescido de forma exponencial. Este aumento populacional aliado aos avanços tecnológicos constantes alavancou o consumo mundial de energia. Este cenário tem incentivado países do mundo todo a buscar alternativas para aumentar a produção de energia. Uma das alternativas adotadas são os biocombustíveis, onde o etanol tem lugar de destaque. Para tanto, a degradação de biomassa vegetal, para a liberação dos açúcares estruturais da fibra vegetal para fermentação, tem se intensificado. O etanol é o principal biocombustível brasileiro e o uso de biomassa vegetal é uma alternativa para o aumento de sua produção. No entanto, a ação enzimática ineficiente na degradação de polissacarídeos estruturais impede a produção industrial. Uma solução é a prospecção de enzimas degradantes de biomassa e um ambiente para esta busca pode ser o rúmen. O qual é um ambiente rico em micro-organismos que degradam a lignocelulose. Considerando que cerca de 99% dos micro-organismos não são passíveis ao cultivo tradicional, a fim de romper com estas limitações foi usada a abordagem metagenômica neste estudo para caracterização de genes com potencial para degradar biomassa e também para avaliação da diversidade taxonômica do ambiente ruminal bovino. Foram coletadas amostras de rúmen de um gado Nelore para a obtenção de DNA, que posteriormente foi sequenciado pelo sequenciador HiScan SQ (Illumina). Foram obtidas 65 milhões de sequências, cada uma com 100 pb, que foram analisadas no servidor MG-RAST. Para montar o perfil taxonômico deste metagenoma foram usados três bancos de dados na análise das sequências: Ribossomal database Project (RDP), que encontrou 18 filos na amostra; Greengenes, que encontrou 16 filos; e SILVA Small SubUnit (SSU) onde foram encontrados 22 filos. Dentre todos os filos encontrados o Firmicutes foi o... / Abstract: Since the expansion of industry through the Industrial Revolution, the world population has increased unprecedented. This rise together the constant technological advances leveraged the world's energy consumption. This scenario has encouraged countries around the world to seek alternatives to higher energy production, being the biofuels one of the adopted alternatives, which ethanol has excelled. Therefore, the plant biomass degradation for the release of structural sugars from plant fiber fermentation has intensified. Ethanol is the main Brazilian biofuel and the use of plant biomass is an alternative for increasing its production. However, inefficient enzymatic action in the degradation of structural polysaccharides prevents industrial production. One solution is the prospect of biomass degrading enzymes and an environment for this search may be the rumen, which is an environment rich in microorganisms that degrade lignocellulose. Whereas about 99% of the microorganisms are not amenable to traditional growth, in order to break these limitations was used a metagenomics approach in this study to characterize genes with potential to degrade biomass and to evaluate the taxonomic diversity of bovine rumen environment. Rumen samples were collected from Nelore cattle for obtaining total DNA, which was subsequently sequenced by SQ HiScan (Illumina) sequencer. Sixtyfive million sequences were obtained, each with a 100 bp, which were analyzed by MG-RAST server. In order to mount the taxonomic profile of this metagenomic we used three databases on the analysis of sequences: Ribosomal Database Project (RDP), which found 18 phyla in the sample; GreenGenes, which found 16 phyla; and SILVA Small subunit (SSU) which found 22 phyla. Among all the phyla, Firmicutes was the most abundant, followed by Bacteroidetes and Proteobacteria by the three databases. For the functional analysis were used five databases for prospecting glycoside Hydrolases ... / Mestre