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Diagnóstico imunológico da tuberculose infantil utilizando os antígenos recombinantes ESAT-6 e CFP-10 / Immunological diagnosis of tuberculosis in children based on the recombinants antigens ESAT-6 and CFP-10

Van-Lume, Daniele Silva de Moraes January 2008 (has links)
Made available in DSpace on 2012-05-07T14:43:55Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) 000042.pdf: 1706671 bytes, checksum: dc956801bf26bdb2686d937802c8fb3f (MD5) Previous issue date: 2008 / O diagnóstico da tuberculose (TB) se baseia em dados clínicos e epidemiológicos associados aos métodoslaboratoriais (baciloscopia, cultura de materiais biológicos e TTI - Teste Tuberculínico Intradérmico) e radiografia de tórax. Em crianças, por serem paucibacilares e muitas vezes apresentarem reações cruzadas ao TST, devido à vacinação recente com BCG e à exposição à micobactérias ambientais, existem dificuldades maiores para obter esse diagnóstico. Diante disso, métodos imunológicos têm sido propostos. Dentre eles, destacam-se os baseados em antígenos recombinantes específicos do complexo M. tuberculosis: o ESAT-6 (early secretory antigen target 6) e o CFP- 10 (culture filtrate protein 10), que são potentes indutores de IFN- . Baseado nisso, o nosso estudo teve como objetivos: avaliar os níveis de IFN- , produzidos por células sanguíneas induzidos por ESAT-6, CFP-10 e PPD in vitro, através de ELISA (enzyme linked immunosorbent assay), em pacientes pediátricos e determinar a sensibilidade e a especificidade dos ensaios definindo qual o teste mais apropriado para o diagnóstico. Foram selecionadas, no Hospital das Clínicas e no Instituto Professor Fernando Figueira-PE, crianças com idade de 3 a 15 anos, de ambos os sexos, e de acordo com os fatores de inclusão foram distribuídas em grupos de TB doença (n = 21) e TB latente (n = 17). O grupo controle negativo (n=21) foi formado por crianças com ausência de sinais e sintomas de TB e sem história de contato com adulto bacilífero. Os níveis de IFN- contra os antígenos ESAT-6, CFP-10 e PPD in vitro foram quantificados e a curva ROC (receiving operating characteristics) foi utilizada para avaliar a capacidade desses antígenos de diagnosticar TB infantil (latente e/ou doença). O único antígeno que demonstrou essa capacidade foi o ESAT-6 (P 0,05), tanto para TB latente (AAC
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Efeito de biocidas sobre biofilmes bacterianos envolvidos em processos de biocorrosão em plataformas marítimas da PETROBRAS

Cavalcanti, Guarani de Hollanda January 2001 (has links)
Made available in DSpace on 2014-12-05T18:40:15Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) guarani_cavalcanti_ioc_mest_2001.pdf: 19435422 bytes, checksum: 70afbf197134ad291c3099b285e07bb6 (MD5) Previous issue date: 2014-11-18 / Universidade Federal do Rio de Janeiro. Centro de Pesquisas e Desenvolvimento Leopoldo Américo Miguez de Mello. Gerência de Avaliação e Monitoramento Ambiental. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Estudamos o efeito de soluções químicas (biocidas, bases ativas, inibidores metabólicos e de corrosão) no controle do crescimento de bactérias redutoras de sulfato (BRS) sésseis e planctônicas e na desorganização de biofilmes presentes nos oleodutos e em tubulações do sistema de injeção de água do mar de plataformas de petróleo da Petrobras. Bactérias coletadas nesses locais foram cultivadas em laboratório, em sistemas estático e dinâmico de fluxo d\2019água, na ausência e presença de cinco diferentes produtos. Posteriormente, amostras tratadas e não tratadas foram analisadas por testes microbiológicos, ultra-estruturais e por microanálise de raios-X. Além dos ensaios laboratoriais, foram analisados resíduos coletados de um oleoduto da Bacia de Campos, antes e após o tratamento com bases ativas. Adicionalmente, padronizamos a técnica de microscopia confocal de varredura a laser para o estudo in situ de biofilmes bacterianos aderidos à superfície metálica de corpos-de-prova. Dentre os produtos testados no controle microbiano, a solução de ácido dietilenotriaminopentacético (DTPA) foi a de melhor desempenho nos testes estáticos, seguida pela solução de glutaraldeído conjugado com sais quaternários de amônio (GA-QAT). O DTPA também foi utilizado no oleoduto, obtendo bons resultados. Em sistema dinâmico, glutaraldeído (GA) dosado isoladamente ou coadjuvado com QAT apresentou eficiência baixa ou média contra bactérias sésseis, a depender dos tempos de contato com a solução de tratamento. Todos os produtos testados foram mais efetivos contra bactérias planctônicas que sésseis Os testes ultra-estruturais indicaram que as soluções de GA e de GA-QAT não foram eficientes na remoção dos biofilmes aderidos aos corpos-de-prova em sistema estático e dinâmico de fluxo d\2019água. Já a solução de DTPA foi capaz de alterar a ultra-estrutura das células e do biofilme aderido ao metal, tanto em testes estáticos laboratoriais, como no tratamento do oleoduto. Microanálises de raios-X sugeriram que o DTPA é capaz de dissolver incrustações de sulfato de bário encontradas associadas a biofilmes bacterianos nos oleodutos. Esta técnica também permitiu caracterizar o sulfeto de ferro como sendo o principal produto de corrosão, encontrado geralmente adsorvido à matriz extracelular dos biofilmes ou em contato com a superfície de bactérias sésseis e planctônicas. A metodologia de análise dos corpos-de-prova por microscopia confocal mostrou-se útil para a avaliação da presença e a densidade do biofilme aderido ao metal e também para a detecção de profundidades de pontos de corrosão abaixo desses biofilmes. Essa técnica, portanto, poderá ser aplicada para avaliações futuras do controle da biocorrosão nas tubulações de plataformas de petróleo / We studied the effect of chemical solutions (biocides, metabolic, corrosion and incrustation inhibitors) in the control of plancktonic and sessile sulphate-reducing bacteria (SRB) growth and also in the disassembly of biofilms present in oil field pipelines of seawater injection systems of PETROBRAS' offshore platforms. Bacteria collected from field were cultured in laboratory under static and dynamic water flow systems, in the absence and presence of five different products. Later on, treated and non-treated samples were analysed by microbiological and ultrastructural techniques and by X-ray microanalysis. Besides laboratory assays, residues collected from an oil field pipeline of Campos' Basin were analysed before and after biocide treatment. Additionally, we standardised the laser scanning confocal microscopy technique for the in situ study of bacterial biofilms attached to the surface of metallic coupons. Among the tested products aiming the microbial control, diethilenetriaminepentaacetic acid (DTPA) presented the best performance under static tests, proceeded by glutaraldehyde (GA) solution conjugated with quaternary salts of ammonium (QAT). In dynamic system, GA alone or conjugated with QAT presented low or medium efficiency profile against sessile bacteria, depending on the time of contact with the cells. All the tested products were more effective against plancktonic bacteria as compared to sessile ones. DTPA was also used in the oil field pipeline, obtaining good results. Ultrastructural studies indicated that GA and GA-QAT solutions were not efficient to remove biofilms attached to the coupons in both static and dynamic systems. However, DTPA solution was capable to alter the ultrastructure of the cells and of the biofilm attached to the metal, either in laboratory static tests or in the pipeline treatment. Through the X-ray microanalysis, we characterised iron sulphide as the main corrosion product. This compound was generally found adsorbed to extracellular matrix elements or even adsorbed to plancktonic and sessile bacterial surface. The methodology to analyse coupons by confocal microscopy was quite useful to evaluate the presence and density of the biofilm attached to the metal, and also to detect depths of corrosion pits found below those biofilms. This technique, therefore, can be applied for future evaluations related to biocorrosion control in oil field pipelines of petroleum offshore platforms
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“Identificação molecular de bactérias em lesões cariosas dentinárias e em biofilme de crianças com diferentes estágios da cárie precoce da infância” / Molecular detection of bacteria in dentinal carious lesions and in biofilm of children with different stages of early childhood caries

Neves, Beatriz Gonçalves January 2014 (has links)
NEVES, Beatriz Gonçalves. “Identificação molecular de bactérias em lesões cariosas dentinárias e em biofilme de crianças com diferentes estágios da cárie precoce da infância”. 2014. 79 f. Tese (Doutorado em Odontologia) - Faculdade de Farmácia, Odontologia e Enfermagem, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2014. / Submitted by denise santos (denise.santos@ufc.br) on 2015-05-18T12:15:01Z No. of bitstreams: 1 2014_tese_bgneves.pdf: 5205928 bytes, checksum: f393ffe2d2087a50e6b97e35d5823491 (MD5) / Approved for entry into archive by denise santos(denise.santos@ufc.br) on 2015-05-18T12:16:09Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2014_tese_bgneves.pdf: 5205928 bytes, checksum: f393ffe2d2087a50e6b97e35d5823491 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-05-18T12:16:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2014_tese_bgneves.pdf: 5205928 bytes, checksum: f393ffe2d2087a50e6b97e35d5823491 (MD5) Previous issue date: 2014 / Early childhood caries (ECC) is considered a serious public health issue among children all over the world. However, many aspects should be explored about the oral microbiota related to the ECC progression and how the bacterial community modifies according to the dentine lesion activity. This thesis, composed by two chapters, aimed to investigate and quantify with quantitative polymerase chain reaction (qPCR) the following bacteria Actinomyces naeslundii, Bifidobacterium spp., Lactobacillus acidophilus, Streptococcus gordonii, Streptococcus mutans, as well as members of the groups Lactobacillus casei and Mitis on biofilm from pre-school children with different stages of early childhood caries progression (Chapter 1) and on active and inactive dentine carious lesions (Chapter 2), and also to verify the association of these microorganisms on the process of health or disease. The sample consisted on preschool children aged between 2 and 5 years from nurseries and public preeschools in Fortaleza-CE. The children were examined for caries diagnosis with ICDAS II index (International Caries Detection Assessment System), and the Nyvad criteria, in order to evaluate prevalence and caries activity. The supragingival biofilm collection was taken from 75 children, who were divided in three groups according to the ICDAS II: CF (caries free) (n=20), ECL (presence of enamel caries lesion) (n=17) and DCL (presence of dentine caries lesion) (n=38). Samples of carious dentine were collected under rubber dam isolation of 56 lesions of dentine affected by caries, being 17 inactive and 39 active. The DNA of all the collected samples was extracted and purified, then tested for the presence of the formerly mentioned bacterial species/groups through qPCR. The quantity of bacteria was compared through the Kruskal-Wallis and Mann-Whitney tests. Besides, the association between the presence of bacteria and ECC was analyzed through the Chi-square test, with a 5% significance level and the multiple logistic regression was applied. Bacteria from the group L. casei and L. acidophilus presented low detection on biofilm of all evaluated groups. The presence of S. mutans and Bifidobacterium spp. showed a strong association with dental caries progression on the biofilm from children with dentine lesions with odds ratio of 21,5 and 5,9; respectively. On active dentine lesions, concentrations of Bifidobacterium spp. and species from the Lactobacillus casei group were significantly higher when compared to the inactive lesions (p<0.05). The levels of Actinomyces naeslundii, Streptococcus gordonni and species from Mitis group were not significantly different among biofilm groups as well as comparing dentine lesions. In conclusion, the microbial profile from biofilm samples presented differences on the proportion of acidogenic and aciduric bacteria with dental caries progression. The presence of Bifidobacterium spp. and S. mutans presented a strong association with the development of the more advanced stages of ECC. Regarding the activity of dentine lesions, higher detection levels of the group L. casei and Bifidobacterium spp. showed an important role of these bacteria in the dentine caries activity. / A cárie precoce da infância (CPI) é considerada um grave problema de saúde pública em crianças pré-escolares em todo mundo. No entanto, muitos aspectos ainda devem ser explorados acerca da microbiota oral relacionada com a progressão da CPI e como a comunidade bacteriana se modifica de acordo com a atividade da lesão dentinária. Esta tese, constituída de dois capítulos, teve como objetivo identificar e quantificar através da técnica de reação em cadeia da polimerase quantitativa (qPCR) as bactérias Actinomyces naeslundii, Bifidobacterium spp., Lactobacillus acidophilus, Streptococcus gordonii, Streptococcus mutans, bem como espécies dos grupos Lactobacillus casei e Mitis em biofilme de crianças pré-escolares com diferentes estágios de progressão da cárie precoce da infância (Capítulo 1) e em lesões cariosas dentinárias ativas e inativas (Capítulo 2) e ainda verificar a associação destes microrganismos ao processo de saúde ou de doença. A amostra consistiu em pré-escolares com idade entre 2 e 5 anos de idade que frequentavam creches e escolas públicas de Fortaleza-CE. As crianças foram examinadas com o uso de índices visuais ICDAS II (International Caries Detection Assessment System) e Nyvad, a fim de avaliar a prevalência e atividade de cárie. A coleta de biofilme supragengival foi realizada em 75 crianças, as quais foram agrupadas de acordo com índice ICDAS II em três grupos: CF (livres de cárie) (n=20), ECL (presença de lesões de cárie em esmalte) (n=17) e DCL (presença de lesões de cárie em dentina) (n=38). Amostras de dentina cariada foram coletadas sob isolamento absoluto de 56 lesões cariosas dentinárias, sendo 17 inativas e 39 ativas. O DNA de todas as amostras coletadas foi extraído e purificado e, em seguida, testado para a presença das espécies/grupos bacterianos acima citados através de qPCR. A quantidade das bactérias foi comparada pelos testes Kruskal-Wallis e Mann-Whitney. Além disso, a associação da presença de bactérias e CPI foi analisada através do teste Qui-quadrado, com nível de significância de 5% e aplicado a regressão logística múltipla. Bactérias L. acidophilus e do grupo L. casei apresentaram baixa detecção no biofilme de todos os grupos avaliados. A presença de S. mutans e Bifidobacterium spp. mostrou forte associação com a progressão da doença no biofilme de crianças com lesões dentinárias com “odds ratio” de 21,5 e 5,9, respectivamente. Em lesões dentinárias ativas, concentrações de Bifidobacterium spp. e bactérias do grupo L. casei foram significativamente maiores quando comparadas às lesões inativas (p<0.05). Os níveis de A. naeslundii, bactérias do grupo Mitis e S. gordonni não apresentaram diferença significativa entre os grupos de biofilme, assim como nas lesões dentinárias. Conclui-se que as amostras de biofilme apresentaram alteração na proporção de bactérias acidogênicas e acidúricas com a progressão da doença cárie. A presença de Bifidobacterium spp. e S. mutans apresentou forte associação com os estágios mais avançados da CPI. Em relação às lesões dentinárias, o aumento da concentração de bactérias Bifidobacterium spp. e do grupo L. casei evidenciou um papel importante destas bactérias na atividade de lesões dentinárias.
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Interação entre Staphylococcus aureus resistente à meticilina (MRSA) e Acanthamoeba polyphaga / Interaction between methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) and Acanthamoeba polyphaga

Souza, Thamires Klein de January 2016 (has links)
As interações que ocorrem entre as bactérias e amebas podem dar-se através de relações mútuas, onde ambos os organismos se beneficiam da associação ou parasitárias, em que um organismo se beneficia em detrimento do outro. Quando esses organismos compartilham o mesmo ambiente, pode resultar em algumas alterações, seja no crescimento dos organismos, nos padrões de adaptação, na morfologia, no seu desenvolvimento ou até mesmo na sua capacidade para sintetizar proteínas e outras substâncias. No presente estudo, avaliou-se a interação entre Acanthamoeba polyphaga e Staphylococcus aureus (MRSA) através de um modelo de cocultivo em diferentes tempos de incubação. A partir deste, 89% das células amebianas permaneceram viáveis após contato com a bactéria. O isolado bacteriano foi visualizado no interior da ameba através de microscopia confocal e de fluorescência em até 216 horas de cocultivo, sendo considerado um microrganismo resistente à ameba. O contato de A. polyphaga com S. aureus (MRSA) não demonstrou alteração fenotípica da ameba através dos testes fisiológicos de osmo e termotolerância. O lisado da cultura amebiana aumentou o crescimento de S. aureus (MRSA) nos diferentes tempos de incubação, porém houve diferença significativa apenas entre o controle e 96 horas de cocultivo. O crescimento de S. aureus (MRSA) foi inibido ao longo dos tempos de incubação pelo efeito do sobrenadante da cultura amebiana apresentando diferença significativa entre o controle e 96 horas de cocultivo, sugerindo-se que A polyphaga tenha secretado algum tipo de metabólito, que inibiu o crescimento da bactéria. A interação dos microrganismos não apresentou alterações significativas no perfil de susceptibilidade aos antibióticos testados. S. aureus (MRSA) permaneceu viável em cistos de A. polyphaga, reforçando a hipótese de que Acanthamoeba pode desempenhar um papel crucial na propagação de S. aureus (MRSA) na comunidade e ambiente hospitalar. O maior percentual de amebas encistadas deu-se em 96 horas de incubação quando cocultivadas com o isolado de S. aureus (MRSA), apresentando um aumento progressivo deste percentual a cada período de incubação. A partir disso, estudos devem intensificar-se para melhor compreender os mecanismos de virulência envolvidos na interação entre ambos os microrganismos. / The interactions that occur between bacteria and amoebae can give through mutual relations, where both organisms benefit from the association or parasitic in which one organism benefits at the expense of the other. When these organisms share the same environment, can result in some changes in the growth of organisms, in adaptation patterns, in morphology, development or even in their ability to synthesize proteins and other substances. In the present study, we evaluated the interaction between Acanthamoeba polyphaga and Staphylococcus aureus (MRSA) using a coculture model at different incubation times. From this, 89% of amoebic cells remain viable after contact with the bacteria. The bacterial isolate was visualized inside the amoeba through confocal microscopy and fluorescence for up to 216 hours of cocultivation, being considered a resistant microorganism to the amoeba. The contact of A. polyphaga with S. aureus (MRSA) showed no phenotypic changes of amoeba through physiologic osmo or thermotolerance tests. The lysate of amoebic culture increased the growth of S. aureus (MRSA) in the different incubation times, but there was a significant difference only between the control and 96 hours of cocultivation. The growth of S. aureus (MRSA) has been inhibited over the incubation times for the effect of amoebic culture supernatant showing a significant difference between the control and 96 hours of coculture, suggesting tha A. polyphaga has some kind of secreted metabolites inhibiting the growth of bacteria. The interaction of microorganisms showed no significant changes in the susceptibility profile of the tested antibiotics. S. aureus (MRSA) remained viable cysts of A. polyphaga, reinforcing the hypothesis that Acanthamoeba can play a crucial role in the spread of S. aureus (MRSA) in the community and hospital. The highest percentage of encysted amoebae occurred in 96 hours of incubation when cocultured with the isolate of S. aureus (MRSA), with a progressive increase in this percentage to each incubation period. From this, studies should be intensified to better understand the virulence mechanisms involved in the interaction between these two organisms.
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"Avaliação da redução de sulfato e produção de sulfeto dissolvido em reator anaeróbio de manta de lodo (UASB) tratando esgoto sanitário em escala real"

SUBTIL, E. L. 28 June 2007 (has links)
Made available in DSpace on 2016-08-29T15:09:31Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_2633_Dissertação, Subtil, E.L - FINAL.pdf: 3237230 bytes, checksum: f6812f817e7ac05f29389f57827b5b0b (MD5) Previous issue date: 2007-06-28 / sulfeto pelas Bactérias Redutoras de Sulfato (BRS) através de um processo denominado redução desassimilatória do íon SO42-.Em geral, a redução de sulfato em sistemas anaeróbios destinados ao tratamento de esgotos sanitários é um processo considerado indesejável, dado que a formação de sulfeto causa uma série de problemas como toxicidade, corrosão, odor, aumento da DQO efluente, além de diminuir a qualidade e quantidade do biogás. No presente trabalho, avaliou-se a redução de sulfato e sua relação com a geração de sulfeto dissolvido (S2-, HS- e H2S) em um reator anaeróbio de manta de lodo e fluxo ascendente (UASB) tratando esgoto sanitário em escala real. O reator operou com uma vazão afluente de 86,4 m3.d-1 e uma Carga Orgânica Volumétrica de 0,73 Kg DQOtotal/m3.d. Os valores médios no afluente do reator da Demanda Química de Oxigênio (DQO) total e filtrada, sulfato, sulfeto e Número Mais Provável (NMP) de BRS foram, respectivamente, 235 mg O2/L, 168 mg O2/L, 151 mg SO4 2-/L, 1,4 mg S2-/L e 1,2 x 105 NMP BRS/mL. A Eficiência de remoção de DQO total foi de 53% e de DQO filtrada igual a 49%. Durante todo o experimento foi verificada redução de sulfato no reator, com uma redução média de 24%. No entanto, a concentração de sulfeto dissolvido no reator não foi superior 5,0 mg/L, não representando risco à metanogênese. A biomassa de BRS no reator foi de 7,6 x 105 NMP/mL e a DQO consumida por essas bactérias representaram 13% da DQO total removida. O modelo cinético de primeira ordem apresentou-se bem ajustado para descrever as velocidades globais de consumo de sulfato e produção de sulfeto, com valores de K1 para sulfato igual a - 0,064 h-1 e 0,276 h-1 para sulfeto dissolvido. Os coeficientes de correlação para os dados de sulfato e sulfeto estiveram acima dos 92% e a reprodução dos dados foram boas, sendo as taxas máximas para redução de sulfato e produção de sulfeto dissolvido de 9,67 mg SO4 2-/L.h-1 e 1,03 mg S2-/L.h-1 respectivamente.
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Sobrevivência de Xanthomonas campestris pv. campestris no solo, no filoplano e na rizosfera de plantas daninhas / Survival of xanthomonas campestris pv. campestris in soil, phylloplane and rhizosphere of weeds

Silva, João César da [UNESP] 27 November 2015 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2016-03-07T19:20:55Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-11-27. Added 1 bitstream(s) on 2016-03-07T19:24:44Z : No. of bitstreams: 1 000858751.pdf: 1279197 bytes, checksum: a6b7adec5b4fbf5c0cbc62f17a606107 (MD5) / A podridão negra, incitada por Xanthomonas campestris pv. campestris (Xcc), é considerada a doença bacteriana mais destrutiva das brássicas em muitos países, podendo promover consideráveis reduções na produtividade. O estudo dos nichos ecológicos de sobrevivência de bactérias fitopatogênicas possui grande importância no manejo de fitobacterioses, uma vez que uma pequena quantidade de inóculo sobrevivente entre os ciclos de cultivo pode ser suficiente para iniciar uma nova epidemia no campo. Baseado nisso, o presente trabalho avaliou a sobrevivência de Xcc em diferentes ensaios, através da utilização do isolado 3098C de Xcc resistente a 100 μg/mL de rifampicina. A sobrevivência de Xcc na forma de células livres no solo foi avaliada em cinco experimentos, desenvolvidos em condições de campo, entre maio e agosto de 2014. Em condições controladas¸ foram utilizados seis tipos de solo, amostrados de diferentes áreas com cultivo ou não de brássicas. A colonização do filoplano e rizosfera de 26 espécies de plantas daninhas por Xcc também foi avaliada em experimentos de campo, entre agosto de 2014 a outubro de 2015. Nos experimentos de campo, Xcc sobreviveu entre 4 e 7 dias no solo, sendo influenciada diretamente pela temperatura e umidade, ocorridas durante os experimentos. Em condições controladas, a bactéria sobreviveu de 10 a 24 dias, sendo esses períodos influenciados pela textura, pH e teor de matéria orgânica em cada tipo de ... / Black rot, incited by Xanthomonas campestris pv. campestris (Xcc), is the most destructive bacterial disease of brassicas in many countries, and can promote substantial reductions in productivity. The study of survival ecological niches of phytopathogenic bacteria has great importance in the management of plant bacteriosis, since a small amount of inoculum surviving among the cultivation cycle may be sufficient to initiate a new outbreak in the field. Based on this, this study evaluated the survival of Xcc in different experiments using Xcc strain 3098C, resistant to 100 μg/mL of rifampicin. The survival of Xcc as free cells in the soil was evaluated in five experiments, carried out in field conditions, between May and August, 2014. Under controlled conditions, six types of soil were used, sampled from different areas, with or without brassicas cultivation. The colonization of phylloplane and rhizosphere of 26 weed species by Xcc was also evaluated in field experiments, between August, 2014 and October, 2015. In field experiments, Xcc survived between 4 and 7 days in the soil, being directly influenced by temperature and humidity that occurred during the experiments. Under controlled conditions, the bacteria survived for 10 to 24 days, and these periods were influenced by texture, pH and organic matter content in each soil type. In weeds rhizosphere, Xcc had low capacity to survive, at most 28 days on Raphanus raphanistrum. In phylloplane, Xcc survived more than 42 days in Lepidium virginicum, and up to 70 days in Raphanus raphanistrum. Weeds from Amaranthaceae and Poaceae families did not show potential for the epiphytic survival of Xcc.
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Coberturas vegetais e doses de nitrogênio, associadas à inoculação com Azospirillum brasilense, no cultivo do milho na região de Cerrado

Portugal, José Roberto [UNESP] 24 February 2015 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2015-08-20T17:09:46Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-02-24. Added 1 bitstream(s) on 2015-08-20T17:26:26Z : No. of bitstreams: 1 000843763.pdf: 3771507 bytes, checksum: 95075b8d207831c0a64fbf7c2f3c81e0 (MD5) / No Brasil e no mundo, a cultura do milho é uma das mais importantes, por ser a base da alimentação animal e utilizado também na alimentação humana. Técnicas sustentáveis de manejo na cultura do milho são necessárias, visando aumento de produtividade, minimizando custos e impactos ambientais. O objetivo deste trabalho foi avaliar diferentes coberturas vegetais (milheto, crotalária, guandu, milheto + crotalária, milheto + guandu e pousio), doses de N (0, 40, 80 e 120 kg ha -1 ) com e sem a inoculação de sementes com Azospirillum brasilense na cultura do milho, cultivado em sistema plantio direto no crescimento e produtividade na região do Cerrado. Foi utilizado delineamento experimental em blocos casualizados em esquema fatorial 6x4x2, constituindo 48 tratamentos, com 4 repetições. O estudo foi realizado na Fazenda Experimental pertencente à Faculdade de Engenharia - UNESP - Campus de Ilha Solteira, localizada no município de Selvíria - MS. O solo do local é do tipo LATOSSOLO VERMELHO Distrófico típico argiloso. A precipitação média anual é de 1.330 mm, a temperatura média anual é de 25 oC e a umidade relativa do ar entre 70 e 80%. Durante a condução do experimento, foram realizadas as seguintes avaliações: massa seca, teores e quantidades acumuladas de N, P e K nas plantas de cobertura; no milho: população inicial e final de plantas, produção de massa seca da parte aérea das plantas, teor de N foliar, índice de clorofila foliar, teores e valores acumulados de N, P e K na planta, altura de plantas e de inserção de espiga, diâmetro de colmo, comprimento de espiga, diâmetro de espiga, massa de mil grãos e produtividade de grãos. As coberturas vegetais, exceto o guandu no primeiro ano e pousio no segundo, produziram quantidade adequada de resíduo para manter o sistema plantio direto na região de Cerrado de baixa altitude. O consórcio milheto + crotalária possibilita quantidades acumuladas de N e K.. / In Brazil and in the world, maize crop is one of the most important because it is the basis of animal feed and also used in human feed. Sustainable techniques of management in maize crop are needed, aiming at increasing yield, reducing costs and environmental impacts. The objective of this study was to evaluate different cover crops (millet, sunn hemp, pigeonpea, millet + sunn hemp, millet + pigeonpea and fallow), N rates (0, 40, 80 and 120 kg ha -1 ) with and without inoculation of seeds with Azospirillum brasilense in maize crop, cultivated in no- tillage system on growth and yield in the Cerrado region. The experimental design was complete randomized blocks in a factorial scheme 6x4x2, constituting 48 treatments, with 4 replications. The study was conducted at the Experimental Farm belonging to the Faculty of Engineering - UNESP (Ilha Solteira), located in Selviria - MS. The soil of the place is a Typical Dystrophic Red Latosol clayey texture. The average annual rainfall is 1.330 mm, the average annual temperature is 25°C and the relative humidity between 70 and 80%. During the experiment, the following evaluations were performed: dry matter, content and accumulated values of N, P and K in cover crops; in maize: initial and final population of plants, production of dry matter of the shoots, leaf nitrogen content, leaf chlorophyll index, content and accumulated values of N, P and K in the whole plant, plant height and of ear insertion, stem diameter, ear length, ear diameter, thousand grain weight and grain yield. The cover crops except the pigeonpea in 2012/13 and fallow in 2013/14 produced adequate amount of residue to keep the no-tillage system in the Cerrado region. The consortium of millet + sunn hemp provided the greater accumulated amount of N and K for both years of cultivation. The great yield of maize grains under pigeonpea residue was due to increase in ear diameter and thousand-grain weight. Thus, the great maize yield ...
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Degradação do herbicida diuron por bactérias isoladas de solos de cultura de cana-de-açúcar e avaliação da toxidade dos metabolitos gerados sobre peixes

Silva, Pedro Lucas Bueno da [UNESP] January 2015 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2015-09-17T15:24:55Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015. Added 1 bitstream(s) on 2015-09-17T15:47:00Z : No. of bitstreams: 1 000846498.pdf: 1036513 bytes, checksum: 20b1a0a893ab3c949ec6aec78aafd6a3 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / A intensificação da agricultura tem levado um aumento da utilização de pesticidas, o que pode carrear esses compostos e seus derivados do solo para ambientes aquáticos. Para minimizar a presença desses compostos xenobióticos no meio, tem se sugerido técnicas de biorremediação que utiliza a atividade de micro-organismos para eliminação ou redução desses poluentes. O ataque de compostos aromáticos e clorados por micro-organismos ou por suas enzimas livres no meio podem levar ao desejável processo de biodegradação, originando derivados quimicamente mais simples e menos tóxicos até a mineralização total do composto. O objetivo do trabalho foi estudar a degradação do diuron por cepas bacterianas previamente isoladas de solos de cultivo de cana-de-açúcar com histórico de aplicação desse herbicida, em fermentação submersa e em microcosmos e avaliar a toxicidade dos compostos derivados do diuron gerados pelo metabolismo microbiano. Todas as bactérias testadas foram capazes de degradá-lo quando cultivadas em meio líquido. Quando se utilizou sistemas de cultivo em solo acrescido de diuron (microcosmos) obteve-se até 50% do composto. Nos testes de toxicidade dos metabólitos do diuron sobre peixes foi utilizada a atividade enzimática da 7-etoxiresorufina-O-deetilase (EROD) e teste do cometa como referência. Foi observada uma inibição da atividade da EROD, possivelmente relacionada a uma inibição das isoenzimas... / The intensification of agriculture has led an increase in the use of pesticides, which may carry these compounds and their derivatives from soil to aquatic environments. To minimize the presence of xenobiotics in the environment, it has been suggestes bioremediation techniques that use the activity of microorganisms to eliminate or reduce these pollutants. The attack of aromatic and chlorinated compounds by microorganisms or their enzymes free in the medium can lead to desirable biodegradation process, yielding chemically simpler and less toxic derivatives until the total mineralization of the compound. The aim of this work was to study the degradation of diurom by bacterial strains previously isolated from cane sugar cultivation of soils with application history of this herbicide in submerged fermentation and in microcosms and evaluate the toxicity of diuron derived from compounds generated by metabolism microbial. All bacteria tested were able to grow in the presence of diuron, but not all were able to degrade it when cultured in liquid medium. When used in a soil cultivation systems plus diuron (microcosms) afforded 50% compound. In the tests of toxicity of the metabolites of diuron was used fish the enzymatic activity of 7-O-etoxiresorufina deetilase (EROD) and comet assay as a reference. Was observed inhibition of EROD activity, possibly related to...
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Citocompatibilidade, propriedades antibiofilme e físicas e cimentos endodônticos associados à amoxilina

Andolfatto, Carolina [UNESP] 05 February 2015 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2015-09-17T15:25:03Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-02-05. Added 1 bitstream(s) on 2015-09-17T15:49:25Z : No. of bitstreams: 1 000845518_20160402.pdf: 83963 bytes, checksum: b27fb8e88a318385605bd8bd1405bf1a (MD5) Bitstreams deleted on 2016-04-04T12:10:26Z: 000845518_20160402.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2016-04-04T12:11:06Z : No. of bitstreams: 1 000845518.pdf: 674514 bytes, checksum: 62da913b8ef513635c243ef06495c521 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Cimentos endodônticos associados à amoxicilina têm sido pesquisados como uma alternativa para obturação do canal radicular. Os objetivos do presente estudo foram: Avaliar a citocompatibilidade do AH Plus e do Sealapex associados com amoxicilina em quantidade de 10% do peso total dos cimentos (Capítulo 1) e avaliar o escoamento e o tempo de presa dos cimentos AH Plus e Sealapex associados à amoxicilina em diferentes concentrações e a atividade antibiofilme dos cimentos associados a uma maior concentração de amoxicilina que não altera as propriedades físicas de ambos os cimentos (Capítulo 2). No Capítulo 1 a citocompatibilidade dos materiais foi avaliada utilizando fibroblastos L929 expostos por 24 horas a diferentes diluições dos extratos dos cimentos puros e associados à amoxicilina. Os ensaios de brometo de 3-(4,5-dimetil-2-tiazolil )-2,5-difenil-2Htetrazólio (MTT) e vermelho neutro foram utilizados para avaliação da viabilidade celular e a fluorescência para actina e α-tubulina foram utilizadas para análise do citoesqueleto. Os dados foram analisados empregando a análise de variância a dois critérios e pós teste de Bonferroni, com nível de significância de 5%. Os resultados mostraram que a incorporação de amoxicilina na concentração de 10% do peso total dos cimentos não diminuiu a viabilidade dos fibroblastos e não causou alterações estruturais nos componentes do citoesqueleto estudados. Conclui-se que à amoxicilina poderia ser um agente antimicrobiano promissor para ser incorporada aos cimentos endodônticos. No Capítulo 2 o escoamento a o tempo de presa dos cimentos puros ou associados à amoxicilina em concentrações de 0,25 a 10% foram estudadas de acordo com a especificação no6876 da Organização Internacional de Padronização (ISO 2012). A avaliação antibiofilme dos cimentos puros e associados à amoxicilina 1% foi realizada por teste de contato...(Resumo completo clicar acesso eletrônico) / Sealers associatedwith amoxicillinhave been developed as an alternative to root canal filling. The objectives of this study were to evaluate the cytocompatibility of AH Plus and Sealapex associated with amoxicillin in concentration of 10% of the total weight of sealer (Chapter 1) and evaluate the flow and the setting time of AH Plus sealer and Sealapex associated with amoxicillin at different concentrations and the activity of sealers antibiofilm associated with higher concentrations of amoxicillin which does not alter the physical properties of both sealers (Chapter 2). In Chapter 1 cytocompatibility of the materials was assessed using the L929 fibroblasts exposed for 24 hours with different dilutions of the extracts of pure sealer and associated with amoxicillin. The testing of 3- (4,5-dimethyl-2-thiazolyl) -2,5-diphenyl-2H-tetrazolium (MTT), and neutral red were used for evaluation of cell viability and fluorescence actin and α-tubulin were used for analysis of the cytoskeleton. Data were analyzed using analysis of variance and two criteria Bonferroni post test at 5% significance level. The results showed that incorporation of amoxicillin at a concentration of 10% by weight of the sealer did not decrease the viability of fibroblasts and did not cause structural changes in the cytoskeletal components studied. It is concluded that amoxicillin could be a promising antimicrobial agent to be incorporated in sealers. In chapter 2 the flow and setting time of the sealer pure or associated with amoxicillin from 0.25 to 10% concentrations were evaluated according to no 6876 specification of the International Organization for Standardization (ISO 2012). The antibiofilm evaluation of pure sealer and 1% associated with amoxicillin was performed by direct contact test with Enterococcus faecalis biofilm previously induced in bovine dentin for 14 days. Fresh sealer were in contact with the biofilm... (Complete abstract electronic access below)
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Expressão heteróloga de peptídeos fusionados a elastin-like polypeptide e avaliação da sua atividade in vitro contra Klebsiella pneumoniae

Silva, Sheila Nara Borges da 02 March 2018 (has links)
Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Centro de Desenvolvimento Sustentável, Programa de Pós-Graduação em Desenvolvimento Sustentável, 2018. / Submitted by Raquel Almeida (raquel.df13@gmail.com) on 2018-05-17T16:53:42Z No. of bitstreams: 1 2018_SheilaNaraBorgesdaSilva.pdf: 1443727 bytes, checksum: 945b24673cb24a4a608435aff547aa9e (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana (raquelviana@bce.unb.br) on 2018-05-21T15:21:00Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2018_SheilaNaraBorgesdaSilva.pdf: 1443727 bytes, checksum: 945b24673cb24a4a608435aff547aa9e (MD5) / Made available in DSpace on 2018-05-21T15:21:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2018_SheilaNaraBorgesdaSilva.pdf: 1443727 bytes, checksum: 945b24673cb24a4a608435aff547aa9e (MD5) Previous issue date: 2018-05-21 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES). / As infecções causadas por microrganismos Gram-negativos são crescentes e preocupantes. Neste contexto, os peptídeos antimicrobianos (PAMs) representam uma classe de moléculas com potencial para atuar como agentes de controle microbiano, pois podem apresentar diferentes atividades funcionais no controle de infecções. A utilização desses compostos associados a diferentes estratégias terapêuticas, como a sua incorporação em sistemas de liberação controlada, pode ser um caminho viável na busca de novos agentes antimicrobianos. No presente trabalho foi realizada a produção heteróloga em sistema procarioto utilizando vetor de expressão pET25b+ modificado de dois peptídeos: Synoeca-MP e Mastoparano-MO, em diferentes construções - com sítio de clivagem e sem este sítio, fusionados a duzentas repetições da sequência codificadora da elastin-like polypeptide (ELP). Após a expressão heteróloga e produção de quatro litros de cada uma das construções, o material foi purificado por histerese térmica, em ciclos a 37ºC e a 4ºC. Seguido desse processo, foi realizada a clivagem da tag de ELP, confirmada por MALDI TOF. Os peptídeos produzidos heterologamente e aqueles produzidos quimicamente, foram avaliados quanto a sua atividade contra uma cepa resistente de K. peneumoniae (KPC1410503). Os testes apresentaram MIC de 80µM com Synoeca-MP-DP, comparado a 40 µM do mesmo peptídeo sintético, enquanto os Mastoparanos, tanto o biossintetizado quanto o sintético não apresentaram resultados de inibição microbiana in vitro. / Infections caused by Gram-negative microorganisms are increasing and worrying. In this context, antimicrobial peptides (AMPs) represent a class of molecules with potential to act as microbial control agents, once they can show many different functional activities and act in infections control. The use of these compounds associated with different therapeutic strategies, such as their incorporation in controlled release systems, may be a viable path in the search for new antimicrobial agents. In the present work the heterologous production was carried out in a prokaryotic system using the modified pET25b+ expression vector. Two peptides: Synoeca-MP and Mastoparano-MO, in different constructions - with the cleavage site and without this site, fused to two hundred replicates of the elastin-like polypeptide (ELP) coding sequence. After the heterologous expression and production of four liters of each construction, the samples were purified by thermic hysteresis, in different cycles of 37ºC and 4ºC. After this procedure, the cleavage of the tag of ELP was performed and confirmed by MALDI TOF. Biosynthesized and synthetically produced peptides were tested their activity against a resistant strain of K. peneumoniae (KPC1410503). The tests showed MIC of 80 μM with Synoeca-MP-DP, compared to 40 μM of the same synthetic peptide, while the biosynthesized and synthetic mastoparans presented no results of microbial inhibition in vitro.

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