A Actuopaleontologia é o ramo da Paleontologia que visa aperfeiçoar as interpretações paleoambientais e paleoecológicas através das assinaturas tafonômicas, principalmente aquelas presentes em conchas bivalves. Tais estudos tafonômicos com bivalves marinhos têm sido conduzidos em ambientes sedimentares do Holoceno, porém, no Brasil, investigações similares são ainda incipientes, tendo sua predominância no litoral norte do Estado de São Paulo. O Complexo Estuarino de Paranaguá (CEP), situado na porção centro-norte do litoral do Paraná, possui feições fisiográficas distintas das encontradas no litoral norte do Estado de São Paulo. Com o objetivo de gerar dados comparativos entre os diferentes ambientes da costa brasileira, este estudo pretende caracterizar tafonomicamente as associações de moluscos bivalves em 11 pontos de coleta ao longo do CEP. Foram coletados oito litros de sedimento com a utilização de pegador de fundo tipo Petersen, em parceria com o Laboratório de Oceanografia Geológica (LOGeo CEM/UFPR). As assinaturas tafonômicas analisadas, podendo ser de origem química, física e/ou biológica, foram: articulação, tipo de valva, fragmentação, modificação da margem da concha, corrasion, perióstraco, brilho, cor, bioerosão, incrustação e predação. A ação dessas assinaturas pode resultar em outra assinatura tafonômica aqui analisada, a alteração da textura da superficial da concha. Foram analisados 150 bioclastos de cada um dos pontos de coleta, e cada assinatura tafonômica foi classificada individualmente. Os bioclastos foram peneirados em malhas de 2 mm para que as menores classes de tamanho não fossem excluídas das análises tafonômicas. Além dos bioclastos, foram coletadas amostras da água junto ao fundo dos locais amostrados, para registro de pH, salinidade, temperatura e turbidez. Ao total, 1.438 bioclastos foram utilizados nas análises tafonômicas e, das 11 estações de coleta, apenas duas não apresentaram o n mínimo de 150 conchas. Os dados abióticos não apresentaram grandes diferenças nas diferentes estações de coleta. A análise de cluster foi feita levando-se em consideração todas as assinaturas tafonômicas estudadas, e um dendograma geral relacionou os 9 pontos de coleta em que obteve-se o mínimo de 150 bioclastos. O dendograma gerado nesta análise mostrou quais as acumulações de moluscos bivalves e seus respectivos pontos de coleta estão mais semelhantes. Há um primeiro grupo formado pelas estações 683, 336, 482, 696 e 32. Com exceção da estação 32, as estações reunidas no primeiro grupo são os pontos de coleta mais próximos às desembocaduras do CEP, região de maiores profundidades e fortes correntes de marés. O segundo grupo é formado pelas estações 607, 152, 645 e 472, sendo pontos de coleta mais internos na área do CEP, próximos a ilhas, manguezais e bancos de areia. As assinaturas alteração da cor, brilho, modificação da margem, perióstraco e corrasion não parecem ser assinaturas úteis na identificação ou para uma possível caracterização dos diferentes ambientes do CEP. Isto porque elas não são variáveis entre esses diferentes ambientes. Houve predominância de desarticulação e fragmentação das valvas em todos os ambientes estudados, sendo possível que a fragmentação esteja sobre maior influência dos danos biológicos. Bioerosão e incrustação não apareceram em frequências expressivas, porém, apenas as estações de coleta próximas a desembocadura do CEP apresentaram bioeorosão, enquanto incrustação apareceu em todas as estações. A textura superficial da concha correlacionou-se positivamente com as assinaturas corrasion e bioerosão. / Actuopaleontology is the branch of Paleontology that aims to enhance paleoecological and paleoenvironmental interpretations, through the taphonomic signatures, especially those in bivalve shells. Such taphonomic studies with marine bivalves have been conducted in sedimentary Holocene environments, however, in Brazil, similar investigations are still incipient, having its predominance in the northern coast of São Paulo. The Paranaguá Estuarine Complex (CEP), situated in the north central portion of the Paraná coast, has different physiographic characteristics of those found in the north coast of São Paulo. In order to generate comparative data between different environments of the Brazilian coast, this study aims to characterize the taphonomy of bivalve mollusk associations from 11 collection stations along the CEP. Eight liters of sediment were collected with background catcher Petersen, in partnership with the Laboratory of Geological Oceanography (LOGeo - CEM/UFPR). The taphonomic signatures analyzed, which may be of chemical, physical and/or biological origin, were: articulation, valve type, fragmentation, edge modification, corrasion, periostracum, brightness, color, bioerosion, encrustation and predation. The action of these signatures may result in other taphonomic signature analyzed here, the alteration of shell superficial texture. 150 bioclasts were analyzed from each collection point and each taphonomic signature was individually classified. The bioclasts were sieved through mesh of two millimeter, so that classes of smaller size were not excluded from the taphonomic analyzes. In addition, water samples were collected at the bottom of each station for analysis of pH, salinity, temperature and turbidity. In total, 1,438 bioclasts were used in the taphonomic analysis and only two stations did not show the minimum n of 150 shells. Abiotic data showed no great differences in the different sampling stations. The cluster analysis was performed taking into account all studied taphonomic signatures, and a general dendrogram listed the collection points that showed the minimum of 150 bioclasts. The dendrogram generated in this analysis showed which accumulations of bivalve molluscs and their respective collection points are more similar. There is a first group formed by the stations 683, 336, 482, 696 and 32. With the exception of station 32, the stations on the first group are the closest to the mouths of the CEP, region of greater depths and strong tidal currents. The second group is formed by stations 607, 152, 645 and 472, being the more internal collection points, near islands, mangroves and sandbanks. The signatures color, brightness, edge modification, periostracum and corrasion do not seem to be useful in identifying or for a possible characterization of the different environments of the CEP, because they are not variable between these different environments. There was predominance of disarticulation and fragmentation of the valves in all study sites, being possible that the fragmentation was influenced more by biological damages. Bioerosion and encrustation did not appear in expressive frequencies, however, only the stations near the mouth of the CEP presented bioeorosão, while encrustation appeared in all stations. The surface texture of the shell was correlated positively with the sigantures corrasion and bioerosion.

Orientador: Regina Maura Bueno Franco / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-11T18:48:07Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Leal_DiegoAveraldoGuiguet_M.pdf: 3198919 bytes, checksum: 4b596c748379fae87029d533ef64688a (MD5) Previous issue date: 2008 / Resumo: Moluscos bivalves por serem eficazes organismos filtradores acumulam e concentram substâncias, partículas e até mesmo patógenos em seus tecidos, se os locais onde vivem ou são cultivados receberem cargas de efluentes contaminados. Estes animais atuam como bioindicadores de contaminação fecal e, ao serem ingeridos crus ou mal cozidos, podem transmitir os patógenos acumulados em seus tecidos. Diversos estudos em diferentes países reportaram a presença de protozoários patogênicos como Cryptosporidium e Giardia em moluscos bivalves destinados ao consumo humano, porém, no Brasil estes dados são inexistentes. Diante deste cenário, é interessante e relevante investigar a ocorrência destes protozoários neste tipo de alimento, consumidos em diversas regiões do país. Este estudo teve a finalidade de avaliar a contaminação natural por oocistos e cistos dos protozoários parasitos em moluscos bivalves localizados em um ambiente de estuário do litoral norte do Estado de São Paulo; detectar as formas parasitárias em água de rio e água do mar; verificar se existe correlação entre fatores climáticos, físico-químicos e microbiológicos e a ocorrência natural dos parasitos nestes ambientes aquáticos e verificar se existe correlação entre a qualidade das águas e a contaminação dos moluscos que vivem nesta região. Os exemplares de moluscos foram processados através da homogeneização de tecidos específicos e submetidos a centrífugo-concentração com éter-PBS e as amostras hídricas foram analisadas pela técnica de filtração em membranas. A visualização dos protozoários foi realizada através da reação de imunofluorescência direta e a confirmação da morfologia dos protozoários feita com a utilização de microscopia de contraste de fase e a incorporação de um corante vital (DAPI). Cistos de Giardia foram detectados em 8 das 12 amostras de água do rio e uma amostra continha oocistos de Cryptosporidium. Ambos os patógenos foram detectados na água do mar, onde Cryptosporidium esteve presente em 40,0 % e Giardia em 20,0 % do total amostrado. O pool de homogenados teciduais de brânquias foi positivo para oocistos e cistos em dois períodos, com concentrações de 12/oocistos/animal e 50 cistos/animal. Não houve associação significativa entre os fatores climáticos, físico-químicos e microbiológicos e o número de oocistos detectados na água do rio e na água do mar; para os cistos, foi encontrada uma correlação significativa com coliformes termotolerantes (p = 0,007) na água do mar. Ademais, não foi possível estabelecer correlação entre a qualidade da água e o número de cistos e oocistos detectados nos tecidos das ostras. Esta é a primeira vez que oocistos de Cryptosporidium e cistos de Giardia foram encontrados em ostras de uma região costeira do país e também na América Latina. Estes achados têm importância para a saúde pública, pois refletem a extensão da contaminação dos ambientes e dos alimentos de origem marinha, requerendo a padronização de um controle de qualidade. Palavras-chave: Cryptosporidium spp.; Giardia spp.; moluscos bivalves; Crassostrea rhizophorae; água do mar; água de rio; estuário; esgoto / Abstract: Bivalve molluscs are great filter feeders that may accumulate and concentrate substances, particles and even pathogens in their tissues, if the places that they inhabit or are cultivated receive contaminated effluents dispose. These animals, which serve as biological indicators of faecal contamination, may transmit the protozoa accumulated in their tissues, whenever they are ingested in a raw or lightly cooked form. Several studies in different countries reported the presence of parasite protozoa like Cryptosporidium and Giardia in bivalve molluscs destined for human consumption, however, in Brazil, these data are non-existent. For this reason, it is interesting and relevant the investigation of the occurrence of these protozoan in this type of food, consumed in different regions of the country. The aim of this study was to evaluate the natural contamination of oocysts and cysts of parasite protozoan in bivalve molluscs located in an estuarine environment in the Northern coast of São Paulo State; detect this protozoan in river and seawater; verify if there is a correlation between climatic, microbiological, physical and chemical factors with the natural occurrence of parasites in aquatic environments and verify if there is a correlation between water quality and the contamination of bivalve molluscs present at the region. Bivalve molluscs were processed through the homogenization of specific tissues and submitted to centrifugal concentration with ether-PBS, and water samples were analyzed by membrane filtration technique. Protozoa were visualized with direct immunofluorescence antibody test and to confirm the morphology of the parasites, contrast-phase microscopy and the incorporation of a vital dye (DAPI) were used. Giardia cysts were detected in 8 of 12 samples of river water and one sample contained Cryptosporidium oocysts. Both pathogens were detected in marine water where Cryptosporidium were present in 40,0% and Giardia in 20,0% of all samples analyzed. Gill pools homogenates of oysters were positive for oocysts and cysts in two periods with a mean concentration of 12 oocysts/oyster and 50 cysts/oyster. There was no significant association between the climatic, physical, chemical and microbiological factors with the number of oocysts detected in river water and in seawater; for cysts, it was found a high association only with thermotolerant coliforms (p = 0,007) in seawater. Moreover, it was not possible to establish correlation between water quality and the number of oocysts and cysts detected in oysters tissues. This is the first time that Cryptosporidium oocysts and Giardia cysts were found in oysters from the coastal region of Brazil, and it is also the first report in Latin America to date. These findings might be of public health importance, reflecting the extension of the contamination in marine environment and on seafood, requiring a need for quality control standards. Key-words: Cryptosporidium spp.; Giardia spp.; bivalve molluscs; Crassostrea rhizophorae; seawater; river water; estuary; sewage / Mestrado / Parasitologia / Mestre em Parasitologia

A Actuopaleontologia é o ramo da Paleontologia que visa aperfeiçoar as interpretações paleoambientais e paleoecológicas através das assinaturas tafonômicas, principalmente aquelas presentes em conchas bivalves. Tais estudos tafonômicos com bivalves marinhos têm sido conduzidos em ambientes sedimentares do Holoceno, porém, no Brasil, investigações similares são ainda incipientes, tendo sua predominância no litoral norte do Estado de São Paulo. O Complexo Estuarino de Paranaguá (CEP), situado na porção centro-norte do litoral do Paraná, possui feições fisiográficas distintas das encontradas no litoral norte do Estado de São Paulo. Com o objetivo de gerar dados comparativos entre os diferentes ambientes da costa brasileira, este estudo pretende caracterizar tafonomicamente as associações de moluscos bivalves em 11 pontos de coleta ao longo do CEP. Foram coletados oito litros de sedimento com a utilização de pegador de fundo tipo Petersen, em parceria com o Laboratório de Oceanografia Geológica (LOGeo CEM/UFPR). As assinaturas tafonômicas analisadas, podendo ser de origem química, física e/ou biológica, foram: articulação, tipo de valva, fragmentação, modificação da margem da concha, corrasion, perióstraco, brilho, cor, bioerosão, incrustação e predação. A ação dessas assinaturas pode resultar em outra assinatura tafonômica aqui analisada, a alteração da textura da superficial da concha. Foram analisados 150 bioclastos de cada um dos pontos de coleta, e cada assinatura tafonômica foi classificada individualmente. Os bioclastos foram peneirados em malhas de 2 mm para que as menores classes de tamanho não fossem excluídas das análises tafonômicas. Além dos bioclastos, foram coletadas amostras da água junto ao fundo dos locais amostrados, para registro de pH, salinidade, temperatura e turbidez. Ao total, 1.438 bioclastos foram utilizados nas análises tafonômicas e, das 11 estações de coleta, apenas duas não apresentaram o n mínimo de 150 conchas. Os dados abióticos não apresentaram grandes diferenças nas diferentes estações de coleta. A análise de cluster foi feita levando-se em consideração todas as assinaturas tafonômicas estudadas, e um dendograma geral relacionou os 9 pontos de coleta em que obteve-se o mínimo de 150 bioclastos. O dendograma gerado nesta análise mostrou quais as acumulações de moluscos bivalves e seus respectivos pontos de coleta estão mais semelhantes. Há um primeiro grupo formado pelas estações 683, 336, 482, 696 e 32. Com exceção da estação 32, as estações reunidas no primeiro grupo são os pontos de coleta mais próximos às desembocaduras do CEP, região de maiores profundidades e fortes correntes de marés. O segundo grupo é formado pelas estações 607, 152, 645 e 472, sendo pontos de coleta mais internos na área do CEP, próximos a ilhas, manguezais e bancos de areia. As assinaturas alteração da cor, brilho, modificação da margem, perióstraco e corrasion não parecem ser assinaturas úteis na identificação ou para uma possível caracterização dos diferentes ambientes do CEP. Isto porque elas não são variáveis entre esses diferentes ambientes. Houve predominância de desarticulação e fragmentação das valvas em todos os ambientes estudados, sendo possível que a fragmentação esteja sobre maior influência dos danos biológicos. Bioerosão e incrustação não apareceram em frequências expressivas, porém, apenas as estações de coleta próximas a desembocadura do CEP apresentaram bioeorosão, enquanto incrustação apareceu em todas as estações. A textura superficial da concha correlacionou-se positivamente com as assinaturas corrasion e bioerosão. / Actuopaleontology is the branch of Paleontology that aims to enhance paleoecological and paleoenvironmental interpretations, through the taphonomic signatures, especially those in bivalve shells. Such taphonomic studies with marine bivalves have been conducted in sedimentary Holocene environments, however, in Brazil, similar investigations are still incipient, having its predominance in the northern coast of São Paulo. The Paranaguá Estuarine Complex (CEP), situated in the north central portion of the Paraná coast, has different physiographic characteristics of those found in the north coast of São Paulo. In order to generate comparative data between different environments of the Brazilian coast, this study aims to characterize the taphonomy of bivalve mollusk associations from 11 collection stations along the CEP. Eight liters of sediment were collected with background catcher Petersen, in partnership with the Laboratory of Geological Oceanography (LOGeo - CEM/UFPR). The taphonomic signatures analyzed, which may be of chemical, physical and/or biological origin, were: articulation, valve type, fragmentation, edge modification, corrasion, periostracum, brightness, color, bioerosion, encrustation and predation. The action of these signatures may result in other taphonomic signature analyzed here, the alteration of shell superficial texture. 150 bioclasts were analyzed from each collection point and each taphonomic signature was individually classified. The bioclasts were sieved through mesh of two millimeter, so that classes of smaller size were not excluded from the taphonomic analyzes. In addition, water samples were collected at the bottom of each station for analysis of pH, salinity, temperature and turbidity. In total, 1,438 bioclasts were used in the taphonomic analysis and only two stations did not show the minimum n of 150 shells. Abiotic data showed no great differences in the different sampling stations. The cluster analysis was performed taking into account all studied taphonomic signatures, and a general dendrogram listed the collection points that showed the minimum of 150 bioclasts. The dendrogram generated in this analysis showed which accumulations of bivalve molluscs and their respective collection points are more similar. There is a first group formed by the stations 683, 336, 482, 696 and 32. With the exception of station 32, the stations on the first group are the closest to the mouths of the CEP, region of greater depths and strong tidal currents. The second group is formed by stations 607, 152, 645 and 472, being the more internal collection points, near islands, mangroves and sandbanks. The signatures color, brightness, edge modification, periostracum and corrasion do not seem to be useful in identifying or for a possible characterization of the different environments of the CEP, because they are not variable between these different environments. There was predominance of disarticulation and fragmentation of the valves in all study sites, being possible that the fragmentation was influenced more by biological damages. Bioerosion and encrustation did not appear in expressive frequencies, however, only the stations near the mouth of the CEP presented bioeorosão, while encrustation appeared in all stations. The surface texture of the shell was correlated positively with the sigantures corrasion and bioerosion.

Orientador: Flávio Dias Passos / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-20T10:56:39Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Magalhaes_FredericoThomaisino_M.pdf: 177494137 bytes, checksum: 180836253ab4ccebefd0ddea49b4655e (MD5) Previous issue date: 2012 / Resumo: O Brasil aderiu ao "Tratado Antártico" em 1975, e desde 1982 mantém o "Programa Antártico Brasileiro. A partir de 1984 as pesquisas brasileiras se concentraram na Baía do Almirantado, na Ilha Rei George, onde se localiza a base do país. A Baía do Almirantado foi eleita uma "Área Antártica Especialmente Gerenciada" pelas Partes Consultivas do Tratado Antártico e trata-se de um local representativo do ecossistema costeiro antártico, principalmente em termos de distribuição e composição de espécies. Lá os pesquisadores tem estudado a fauna bentônica da região, entre eles os Mollusca, que são abundantes e importantes no estudo dos processos que determinam a estrutura e o funcionamento das comunidades bentônicas marinhas. Este estudo se focou na classe Bivalvia, provendo um novo material de referência para identificação destes animais, e mais especificamente daqueles da Baía do Almirantado, apresentando-se como um guia ilustrado, com descrições detalhadas das conchas dessas espécies. Além disso, dados de distribuição geográfica e batimétrica foram reunidos para uma análise dessa fauna, na tentativa de qualificar a importância da região das Ilhas Shetland do Sul como um local estratégico para estudos em biogeografia. Foram identificadas 39 espécies de 18 famílias distintas, e seus dados de biologia, distribuição batimétrica e geográfica reunidos. As famílias mais representativas foram Philobryidae, Nuculanidae e Lasaeidae, contabilizando 15 espécies. As regiões com mais espécies em comum com a área estudada foram o Estreito de Magalhães, Ilha Georgia do Sul, Mar de Weddell, Península Antártica e sul do Chile; regiões notáveis pela riqueza de Bivalvia. As famílias mais largamente distribuídas, encontradas neste estudo, foram LImidae e Carditidae; e as mais restritas foram Siliculidae e Nuculanidae. A espécie com maior distribuição foi Cyclocardia astartoides, e as mais restritas Ennucula georgiana e Mysella narchii. As espécies encontradas se concentram nas profundidades até 1000 m, com seu número caindo para menos da metade além disso. Apenas seis espécies ocorrendo além dos 2000 m: Yoldiella profundorum, Limopsis marionensis, Limopsis lilliei, Adacnarca nitens, Limatula pygmaea e Cyclocardia astartoides. Este estudo demonstram a região da Baía do Almirantado como abrigo de uma fauna de Bivalvia composta por espécies estritamente antárticas, e outras que ocorrem ao norte da Convergência Antártica; sendo assim uma região importante para o estudo da distribuição destes animais / Abstract: Brazil abided to the "Antarctic Treaty" in 1975, and since 1982 maintains the "Brazilian Antarctic Program". As from 1984 the Brazilian researches focused on Admiralty Bay, in King George Island, where the country?s Antarctic base is located. Admiralty Bay was elected a "Antarctic Especially Managed Area" by the Antarctic Treaty Consultative Parties and is a representative place for the Antarctic coastal ecosystem, especially in views of species distribution and composition. In there researchers have been studying the regional benthic fauna, amidst it the Mollusca, abundant and important animals for the study of determinant process in the structure and operation of the marine benthic community. The present study focused on the class Bivalvia, providing a new reference source for identification of the group, and specifically for those of Admiralty Bay, presented as an illustrated guide with detailed shell descriptions for all the species found. Furthermore, data on geographic and bathymetric distribution were gathered for an analysis of this fauna, in attempt to qualify the importance of the South Shetland Islands as a strategic place for studies on biogeography. Thirty-nine species, of 18 distinct families, were identified, and their biological, geographical and bathymetrical data gathered. The most representative families were Philobryidae, Nuculanidae and Lasaeidae, counting 15 species in sum. The geographic regions with more species in common with the studied area were Strait of Magellan, South Georgia Island, Weddell Sea, Antarctic Peninsula and Southern Chile; notable regions for Bivalvia richness. The families found with the largest geographic distribution were Limidae and Carditidae, and the most restricted ones were Siliculidae and Nuculanidae. The species with largest geographical distribution was Cyclocardia astartoides, while the most restricted were Ennucula georgiana and Mysella narchii. The species found in this study are concentrated in depths until 1000 m, beyond that their number shortens to less than half. Only six occur deeper than 2000 m: Yoldiella profundorum, Limopsis marionensis, Limopsis lilliei, Adacnarca nitens, Limatula pygmaea and Cyclocardia astaroides. The present study shows Admiralty Bay as shelter to a Bivalvia fauna with strictly Antarctic species and northern ones, common north to the Antarctic Convergence, thus being an important place for studying the distribution of these animals / Mestrado / Ecologia / Mestre em Ecologia

Orientadores: Solange Cadore, Sergio Luis Costa Ferreira / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Quimica / Made available in DSpace on 2018-08-08T00:57:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Carvalho_RitaMariaWesteNano_D.pdf: 2677135 bytes, checksum: 453aee11d8c1855bb96aa0236c654c2d (MD5) Previous issue date: 2006 / Resumo: A poluição dos mares, baías e estuários provocada pela emissão de efluentes industriais e residenciais contendo íons metálicos é um dos principais fatores que favorece a contaminação dos moluscos bivalves. Esses organismos sofrem de maneira intensa a bioacumulação de íons metálicos, mesmo em baixas concentrações, tornando-se muitas vezes impróprios para o consumo humano e, além disso, podem refletir o grau de contaminação ambiental. Métodos de digestão com aquecimento assistido por microondas (MW) e com bloco digestor (BD) foram desenvolvidos para a determinação de íons metálicos em tecido de moluscos bivalves, por Espectrometria de Emissão Óptica em Plasma com Acoplamento Indutivo (ICP OES). Um planejamento de misturas do tipo simplex-centróide foi utilizado para estudar o efeito dos reagentes HNO3, HCl e H2O2 nos dois métodos. A análise de material de referência certificado de tecido de ostra (SRM 1566b - NIST) em condições instrumentais otimizadas e nos comprimentos de onda selecionados, apresentaram recuperação dos íons estudados entre 90 - 105%, para o método de digestão com aquecimento assistido por MW, e entre 90 - 100% para o método de digestão com aquecimento no BD. A eficiência das digestões foi avaliada pela determinação do carbono orgânico total (TOC) presente na solução, obtendo-se uma variação de 0,05 a 0,64%. A acidez das soluções variaram de 1,3 a 5,6% sendo que as soluções provenientes da digestão em forno de MW apresentaram menores valores comparados com a decomposição no bloco digestor. Usando o modelamento de misturas foi possível ajustar modelos matemáticos e determinar a composição adequada da mistura HCl - HNO3 - H2O2 para a decomposição de tecidos de moluscos bivalves. As proporções dos componentes foram 0,333: 0,333: 0,334 e 0,200: 0,200: 0,600 para digestão assistida por microondas e em bloco digestor, respectivamente. Os métodos empregados permitiram determinar macro e microconstituintes em tecidos de moluscos, constituindo-se em importantes ferramentas a serem empregadas para a solução de problemas ambientais / Abstract: The pollution of oceans, bays and estuaries as a result of industrial and domestic effluents that contain metallic ions is one of the most important factors that lead to the contamination of bivalve molluscs. These organisms are greatly affected by the bioaccumulation of inorganic species, even at low concentrations, reflecting the environmental contamination level. Under these conditions the ingestion of this kind of food is not recommended. Digestion methods based on heating in a microwave oven (MW) or with a digester block BD) for the subsequent determination of metallic ions in bivalve tissues by Inductively Coupled Plasma Optical Emission Spectrometry (ICP OES) were developed. Mixtures planned using a simplex-centroide program were to study the effect of the reagents HNO3, HCl e H2O2 in both methods. The analysis of a certified reference material of oyster tissue (SEM 1566b - NIST) under the optimized instrumental conditions at the selected wavelengths showed recoveries of 90 -105%, for digestion by MW and of 90 -100%, for digestion by BD. The efficiency of digestion was evaluated by the determination of total organic carbon (TOC) remaining in the solution and values between 0.05 and 0.64% were obtained. The digestion using MW heating showed lower values compared with BD decomposition. Using the modelling of the mixtures it was possible to determine the most adequate composition of HCl-HNO3-H2O2 mixture for the decomposition of bivalve mollusc tissues. The ratios of mixtures were: 0.333:0.333:0.334, for MW digestion and 0.200:0.200:0.600 for BD digestion. The developed methods allowed the determination of macro and microconstituents in mollusc tissues and are important tools for environmental studies / Doutorado / Quimica Analitica / Doutor em Ciências

Moluscos bivalves são organismos filtradores capazes de concentrar susbtâncias produzidas por microalgas tóxicas. No estado de Santa Catarina, líder na produção nacional, os cultivos têm sido oficialmente monitorados para a detecção de ficotoxinas causadoras dos Envenenamentos Diarreico (DSP), Amnésico (ASP) e Paralisante (PSP) por Consumo de Moluscos nas partes comestíveis. Amostras de água também são coletadas para a quantificação de algas nocivas. O objetivo deste trabalho foi sugerir o uso de áreas amostrais para coletas semanais, bem como calcular o tamanho das amostras agrupadas e analisar os dados de ocorrência. Diferentes cenários foram desenvolvidos para simular a variação dos tamanhos amostrais, utilizando-se o EpiTools®. Considerando-se uma alta prevalência e altas sensibilidades dos testes, é possível sugerir dois pools amostrais para a detecção de Toxinas Lipofíficas (2x30), duas para detectar PSP (2x15) e uma para detectar ASP (1x20) em cada uma das 24 áreas amostrais sugeridas. Se o teste de Cromatografia Líquida com Espectrometria de Massa (LC-MS/MS) for validado para todas as biotoxinas, apenas um pool amostral seria suficiente (1x15). Informações espaçotemporais de ocorrência também foram analisadas e apenas ficotoxinas causadoras de DSP foram encontradas. Utilizando-se os softwares SaTScan® e QGIS 2.12.2- Lyon®, foram desenvolvidos mapas de calor com os dois clusters espaciais encontrados para as detecções de DSP em moluscos e os quatro para Dinophysis acuminata (≥100cels/L) em amostras de água. Os resultados com maiores riscos relativos corresponderam ao cluster temporal do segundo semestre de 2014, os clusters espaciais das áreas 7 a 11 para DSP e áreas de 7 a 9 para D. acuminata. Esses resultados poderão contribuir para o planejamento de estratégias a serem incorporadas num futuro sistema de vigilância de moluscos bivalves do estado. / Bivalve molluscs are filtering organisms capable to concentrate substances produced by toxic microalgae. In Santa Catarina state, main Brazilian producer, the crops have been officially monitored for the detection of phycotoxins that cause Diarrheic (DSP), Amnesic (ASP), and Paralyzing (PSP) Shellfish Poisonings in edible parts. Water samples are also collected for harmful algae quantification. The goal of this study was to suggest the use of areas to be weekly sampled, as well as to calculate pooled sample sizes and to analyze the occurrence data. Different scenarios were developed to simulate the variation of sample sizes in EpiTools®. Considering a high prevalence and high tests sensitivities, we can suggest two pools to detect Lipophilic Toxins (2x30), two to detect PSP (2x15), and one to detect ASP (1x20) in each of the 24 suggested sampling areas. If the test of Liquid Chromatography with Mass Spectrometry (LC-MS/MS) becomes validated for all biotoxins, only one pool would be enough (1x15). Space-time occurence information was also analyzed and only phycotoxins causing DSP were found. Using SaTScan® and QGIS 2.12.2-Lyon® softwares, we developed heatmaps with two clusters found for DSP detection in shellfish and the four found for Dinophysis acuminate (≥100cels/L) in water samples. The results with higher relative risk values corresponded to the time cluster of the second semester of 2014, spatial cluster of the areas 7 to 11 for DSP, and areas 7 to 9 for D. acuminate. These results can contribute for the strategic plans to be incorporated in a future bivalve molluscs surveillance system of the state.

Resumo: Bivalves fósseis são comuns em rochas siliciclásticas e carbonáticas das formações Teresina e Rio do Rasto (Permiano Médio/Superior), Bacia do Paraná. Entretanto, a gênese das camadas de conchas carbonáticas ainda é pouco conhecida. Cinco camadas de calcários do centro-sul e norte do Estado do Paraná foram selecionados para estudo tafonômico: dois grainstones oolíticos a bivalves (Prudentópolis) e um grainstone a peloides e bivalves com intraclastos e oncoides (Rio Preto) da Formação Teresina; um packstone e um wackestone a bivalves e oncoides (Ribeirão Claro) da Formação Rio do Rasto. As camadas carbonáticas (≤ 45 cm de espessura), estão intercaladas entre rochas pelíticas, possuem contato basal erosivo, quantidade variável de intraclastos pelíticos, valvas caoticamente distribuídas com gradação vertical descontínua e empacotamento denso a disperso. As conchas encontram-se desarticuladas, comumente fragmentadas, às vezes incrustadas por cianobactérias, e correspondem a espécies alóctonas que viviam em substratos distintos. As assembléias de bivalves representam, portanto, tanatocenoses em tempestitos proximais amalgamados, gerados em água rasa com frequentes modificações por bioturbação e baixa taxa de sedimentação. A presente pesquisa corrobora outras evidências de que acumulações de conchas paleozóicas em mares epicontinentais resultaram de história tafonômica complexa com acentuada mistura temporal e espacial dos bioclastos sob influência de tempestades / Abstract: Bivalve fossils are common in siliciclastic and carbonate rocks of the Teresina and Rio do Rasto formations (Middle to Late Permian), Paraná Basin. However, little is known about shell concentrations in carbonates. Five limestone beds in south-central and northern Paraná State were selected for a taphonomic study: two oolite-bivalve grainstones at Prudentópolis and one peloid-bivalve grainstone with intraclasts and oncoids at Rio Preto, from Teresina Formation; one packstone and one wackestone with bivalves and oncoids at Ribeirão Claro, from Rio do Rasto Formation. The limestone beds (≤ 45 cm thick) are intercalated with pelitic rocks; the basal contact is sharp and erosive, with variable amount of pelitic intraclasts. Shells are randomly oriented (many nested/stacked), showing dense to disperse packing, and discontinuous grading. The shells are disarticulated, commonly fragmented, sometimes encrusted by stromatolites, and correspond to allochthonous specimens winnowed from distinct life-substrates. The bivalve concentrations were generated in shallow water settings punctuated by storms, under very low sedimentation rates, with frequent intrastratal bioturbation. Hence, the concentrations are amalgamated proximal tempestites. This work corroborates previous evidences that Paleozoic shell beds from the epeiric seas have complex taphonomic histories and result from strong temporal/spatial mixing of bioclasts under storm influence / Orientador: Rosemarie Rohn Davies / Coorientador: Marcello Guimarães Simões / Banca: Joel Carneiro de Castro / Banca: Sabrina Coelho Rodrigues / Mestre

Moluscos bivalves são organismos filtradores capazes de concentrar susbtâncias produzidas por microalgas tóxicas. No estado de Santa Catarina, líder na produção nacional, os cultivos têm sido oficialmente monitorados para a detecção de ficotoxinas causadoras dos Envenenamentos Diarreico (DSP), Amnésico (ASP) e Paralisante (PSP) por Consumo de Moluscos nas partes comestíveis. Amostras de água também são coletadas para a quantificação de algas nocivas. O objetivo deste trabalho foi sugerir o uso de áreas amostrais para coletas semanais, bem como calcular o tamanho das amostras agrupadas e analisar os dados de ocorrência. Diferentes cenários foram desenvolvidos para simular a variação dos tamanhos amostrais, utilizando-se o EpiTools®. Considerando-se uma alta prevalência e altas sensibilidades dos testes, é possível sugerir dois pools amostrais para a detecção de Toxinas Lipofíficas (2x30), duas para detectar PSP (2x15) e uma para detectar ASP (1x20) em cada uma das 24 áreas amostrais sugeridas. Se o teste de Cromatografia Líquida com Espectrometria de Massa (LC-MS/MS) for validado para todas as biotoxinas, apenas um pool amostral seria suficiente (1x15). Informações espaçotemporais de ocorrência também foram analisadas e apenas ficotoxinas causadoras de DSP foram encontradas. Utilizando-se os softwares SaTScan® e QGIS 2.12.2- Lyon®, foram desenvolvidos mapas de calor com os dois clusters espaciais encontrados para as detecções de DSP em moluscos e os quatro para Dinophysis acuminata (≥100cels/L) em amostras de água. Os resultados com maiores riscos relativos corresponderam ao cluster temporal do segundo semestre de 2014, os clusters espaciais das áreas 7 a 11 para DSP e áreas de 7 a 9 para D. acuminata. Esses resultados poderão contribuir para o planejamento de estratégias a serem incorporadas num futuro sistema de vigilância de moluscos bivalves do estado. / Bivalve molluscs are filtering organisms capable to concentrate substances produced by toxic microalgae. In Santa Catarina state, main Brazilian producer, the crops have been officially monitored for the detection of phycotoxins that cause Diarrheic (DSP), Amnesic (ASP), and Paralyzing (PSP) Shellfish Poisonings in edible parts. Water samples are also collected for harmful algae quantification. The goal of this study was to suggest the use of areas to be weekly sampled, as well as to calculate pooled sample sizes and to analyze the occurrence data. Different scenarios were developed to simulate the variation of sample sizes in EpiTools®. Considering a high prevalence and high tests sensitivities, we can suggest two pools to detect Lipophilic Toxins (2x30), two to detect PSP (2x15), and one to detect ASP (1x20) in each of the 24 suggested sampling areas. If the test of Liquid Chromatography with Mass Spectrometry (LC-MS/MS) becomes validated for all biotoxins, only one pool would be enough (1x15). Space-time occurence information was also analyzed and only phycotoxins causing DSP were found. Using SaTScan® and QGIS 2.12.2-Lyon® softwares, we developed heatmaps with two clusters found for DSP detection in shellfish and the four found for Dinophysis acuminate (≥100cels/L) in water samples. The results with higher relative risk values corresponded to the time cluster of the second semester of 2014, spatial cluster of the areas 7 to 11 for DSP, and areas 7 to 9 for D. acuminate. These results can contribute for the strategic plans to be incorporated in a future bivalve molluscs surveillance system of the state.

Submitted by Ana Hilda Fonseca (anahilda@ufba.br) on 2014-09-05T14:43:24Z No. of bitstreams: 1 Tese de Doutorado Gabriel Luiz dos Santos.pdf: 1820652 bytes, checksum: 813a41cbb9ae01d5c374c54cce45816c (MD5) / Approved for entry into archive by Fatima Cleômenis Botelho Maria (botelho@ufba.br) on 2014-09-05T16:01:28Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Tese de Doutorado Gabriel Luiz dos Santos.pdf: 1820652 bytes, checksum: 813a41cbb9ae01d5c374c54cce45816c (MD5) / Made available in DSpace on 2014-09-05T16:01:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Tese de Doutorado Gabriel Luiz dos Santos.pdf: 1820652 bytes, checksum: 813a41cbb9ae01d5c374c54cce45816c (MD5) / CNPq / O presente trabalho realizado em amostras coletadas na Baía de Todos os Santos, Bahia, Brasil, propõe estratégias para determinação multielementar e análise de especiação de vanádio em amostras de moluscos bivalves e sedimentos, empregando ICP OES e ICP-MS. Na primeira parte da tese, foram avaliadas as potencialidades de dois espectrômetros de massa com plasma indutivamente acoplado para determinação de As, Cr, Ni, Se e V em amostras de moluscos bivalves. Para efeito de comparação, três materiais de referência certificados (CRM) foram analisados: NIST 1566b SRM Oyster tissue, NRCC TORT-2 Lobster Hepatopancreas e NIST 2977 SRM Mussel tissue. A condição recomendada, que consistiu na determinação no modo padrão com adição de padrão interno, foi aplicada na determinação dos analitos em amostras de Macoma constricta coletadas em diferentes regiões da BTS. Os resultados apontaram que a maioria dos níveis de As, Cr, Ni, Se e V presentes na espécie Macoma constricta apresentaram valores acima dos níveis estabelecidos pela legislação vigente brasileira que são: 1,0 (As); 0,1 (Cr); 5,0 (Ni); 0,3 (Se) e 0,77 (V) g g-1 (peso úmido), o que representa risco à população e ao ecossistema. Na segunda parte da tese, foram investigadas as condições para a análise de especiação de vanádio em amostras de sedimentos, empregando extração alcalina e determinação por ICP OES. A concentração de V(IV) foi determinada por diferença, considerando a determinação de vanádio total, também realizada por ICP OES, após digestão das amostras com ácido nítrico em forno de micro- ondas com cavidade, usando o procedimento EPA 3051A. O procedimento foi validado através de testes de adição e recuperação e de análise do seguinte material de referência certificado: NIST 2702 (Inorganics in marine sediment). Pelos resultados obtidos pode-se concluir que os compostos contendo V(IV) são mais dominantes nas amostras dos sedimentos analisados. / The present work conducted on samples collected in Todos os Santos Bay, Bahia, Brasil, proposes strategies for multielement determination and speciation analysis of vanadium in bivalve molluscs and sediments samples, using ICP OES and ICP-MS. In the first part of the thesis, the potential of two inductively coupled plasma mass spectrometers for determination of As, Cr, Ni, Se and V in bivalve molluscs samples were evaluated. For comparison, three certified reference materials (CRM) were analyzed: NIST 1566b SRM Oyster tissue, NRCC TORT-2 Lobster Hepatopancreas e NIST 2977 SRM Mussel tissue. The recommended condition, which consisted in determining the standard mode with addition of internal standard, was applied in the determination of analytes in samples of Macoma constricta collected in different regions of the BTS. The results showed that most levels of As, Cr, Ni, Se and V present in the species Macoma constricta have values above the levels established by the Brazilian legislation, that are: 1.0 (As); 0.1 (Cr); 5.0 (Ni); 0.3 (Se) and 0.77 (V) g g-1 (wet weight), which represents risk to the population and the ecosystem. In the second part of the thesis, the conditions for speciation analysis of vanadium in soil and sediment samples were investigated, using alkaline extraction and determining by ICP OES. The V (IV) concentration was determined by difference, considering the total vanadium determination, also performed by ICP OES, after the samples digestion with nitric acid in cavity microwave oven, using the procedure EPA 3051A. The procedure was validated through addition and recovery tests and analysis of the following certified reference material: NIST 2702 (Inorganics in marine sediment). From the obtained results it can be concluded that compounds containing V (IV) are majority in the sediment samples analyzed.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:13Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2009-10-05Bitstream added on 2014-06-13T19:54:17Z : No. of bitstreams: 1 neves_jp_me_rcla.pdf: 9688721 bytes, checksum: e459ad8bf7d442ee8695ccc1b4c3da9f (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Bivalves fósseis são comuns em rochas siliciclásticas e carbonáticas das formações Teresina e Rio do Rasto (Permiano Médio/Superior), Bacia do Paraná. Entretanto, a gênese das camadas de conchas carbonáticas ainda é pouco conhecida. Cinco camadas de calcários do centro-sul e norte do Estado do Paraná foram selecionados para estudo tafonômico: dois grainstones oolíticos a bivalves (Prudentópolis) e um grainstone a peloides e bivalves com intraclastos e oncoides (Rio Preto) da Formação Teresina; um packstone e um wackestone a bivalves e oncoides (Ribeirão Claro) da Formação Rio do Rasto. As camadas carbonáticas (≤ 45 cm de espessura), estão intercaladas entre rochas pelíticas, possuem contato basal erosivo, quantidade variável de intraclastos pelíticos, valvas caoticamente distribuídas com gradação vertical descontínua e empacotamento denso a disperso. As conchas encontram-se desarticuladas, comumente fragmentadas, às vezes incrustadas por cianobactérias, e correspondem a espécies alóctonas que viviam em substratos distintos. As assembléias de bivalves representam, portanto, tanatocenoses em tempestitos proximais amalgamados, gerados em água rasa com frequentes modificações por bioturbação e baixa taxa de sedimentação. A presente pesquisa corrobora outras evidências de que acumulações de conchas paleozóicas em mares epicontinentais resultaram de história tafonômica complexa com acentuada mistura temporal e espacial dos bioclastos sob influência de tempestades / Bivalve fossils are common in siliciclastic and carbonate rocks of the Teresina and Rio do Rasto formations (Middle to Late Permian), Paraná Basin. However, little is known about shell concentrations in carbonates. Five limestone beds in south-central and northern Paraná State were selected for a taphonomic study: two oolite-bivalve grainstones at Prudentópolis and one peloid-bivalve grainstone with intraclasts and oncoids at Rio Preto, from Teresina Formation; one packstone and one wackestone with bivalves and oncoids at Ribeirão Claro, from Rio do Rasto Formation. The limestone beds (≤ 45 cm thick) are intercalated with pelitic rocks; the basal contact is sharp and erosive, with variable amount of pelitic intraclasts. Shells are randomly oriented (many nested/stacked), showing dense to disperse packing, and discontinuous grading. The shells are disarticulated, commonly fragmented, sometimes encrusted by stromatolites, and correspond to allochthonous specimens winnowed from distinct life-substrates. The bivalve concentrations were generated in shallow water settings punctuated by storms, under very low sedimentation rates, with frequent intrastratal bioturbation. Hence, the concentrations are amalgamated proximal tempestites. This work corroborates previous evidences that Paleozoic shell beds from the epeiric seas have complex taphonomic histories and result from strong temporal/spatial mixing of bioclasts under storm influence