Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Agronomia e Medicina Veterinária, 2007. / Submitted by mariana castro (nanacastro0107@hotmail.com) on 2009-12-16T16:22:04Z No. of bitstreams: 1 2007_LarissaDirceudeOliveira.PDF: 426773 bytes, checksum: c8ad856fda16f90c882bc4a96b4d9930 (MD5) / Approved for entry into archive by Daniel Ribeiro(daniel@bce.unb.br) on 2009-12-16T21:47:53Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2007_LarissaDirceudeOliveira.PDF: 426773 bytes, checksum: c8ad856fda16f90c882bc4a96b4d9930 (MD5) / Made available in DSpace on 2009-12-16T21:47:53Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2007_LarissaDirceudeOliveira.PDF: 426773 bytes, checksum: c8ad856fda16f90c882bc4a96b4d9930 (MD5) Previous issue date: 2007-02-17 / O objetivo geral deste trabalho foi avaliar os fatores genéticos e não-genéticos que influenciaram nas características de produção e reprodução. Estimaram-se a herdabilidade direta e materna, variações diretas e de ambiente comum das características: peso ao nascer (PN); peso à desmama corrigido para 205 dias (P205); idade ao primeiro parto (IPP); intervalo entre partos (IEP) e fertilidade real (FR) e também correlações genéticas entre as características de interesse. Foram analisados os dados de um rebanho bovino puro da raça Nelore no município de Padre Bernardo situado no estado de Goiás, o qual de 1400 fêmeas e 1300 machos. Os programas SAS e MTDFREML foram utilizados para análise dos fatores ambientais e genéticos que afetaram as características de interesse. Os efeitos fixos sexo do animal/bezerro, mês de nascimento/parto e ano de nascimento/parto foram significativos (p<0,001) para as características PN, P205 e FR. Já o número do parto da vaca foi significativo (p<0,001) apenas para P205 e FR. Para as características IPP e IEP foram significativos os efeitos do ano de nascimento/parto, sendo que para IEP o número do parto da vaca também foi significativo. As médias para PN, P205, IPP, IEP e FR foram 29,56 Kg, 115,73 Kg, 1340,6 dias, 539,47 dias e 88,41 Kg de bezerro desmamado por ano, respectivamente era composto. A herdabilidade direta e materna para PN e P205 foram 0,28 e 0,73; 0,13 e 0,02, respectivamente. As características IPP, IEP e FR não apresentaram herdabilidade materna, sendo 0,29, 0,10 e 0,16 as herdabilidades diretas respectivamente. Foi encontrado o efeito do ambiente permanente somente nas características PN (0,73) e P205 (0,02). As correlações genéticas PN x P205, IPP x IEP, IEP x FR e FR x P205 foram 0,42, 0,54, 0,33 e 0,64, respectivamente. As regressões de DEPs nos anos mostraram que a seleção para P205 melhorou as outras características como IEP e FR. _______________________________________________________________________________________ ABSTRACT / The objective of this study was evaluate genetic and non-genetic factors which influence production and reproduction traits in a Nelore herd in Goiás state. Direct and maternal heritabilites and direct and common environmental effects were evaluated for birth weight (PN), weaning weight corrected for 205 days (P205), age at first calving (IPP), calving interval (IEP) and real fertility (FR), as well as genetic correlations between traits of interest. Data came from a Nelore herd in Padre Bernardo, Goiás State which has 1400 females and 1300 males. The SAS and MTDFREML programs were used to analyse the data. The fixed effects of animal/calf and month and year of birth/calving were significant (p<0,001) for PN, P205 and FR. The parturition number was only significant (p<0,001) for P205 and FR. For IPP and IEP year of birth/calving was significant, as was number for parturition for IEP. The means for PN, P205, IPP, IEP and FR were 29.56 Kg, 115.73 Kg, 1340.6 days, 539.47 days and 88.41 Kg calf weaned per year, respectively. The heritability (direct and maternal) for PN and P205 were 0.28 and 0.73; 0.13 and 0.02 respectively. IPP, IEP and FR did not show maternal heritability, with direct heritabilities 0.29, 0.10 and 0.16 respectively. Permanent environment effects were found for PN (0.73) and P205 (0.02). Genetic correlations between PN x P205, IPP x IEP, IEP x FR and FR x P205 were 0.42, 0.54, 0.33 and 0.64, respectively. Regressions of DEPs on year showed that selection for P205 improved the other traits.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Agronomia e Medicina Veterinária, Programa de Pós-graduação em Agronegócios, 2011. / Submitted by Suelen Silva dos Santos (suelenunb@yahoo.com.br) on 2011-06-28T19:07:48Z No. of bitstreams: 1 2011_EzioGomesMota.pdf: 1181027 bytes, checksum: 581e840f6171f2cef41fa5511f0a9890 (MD5) / Approved for entry into archive by Guilherme Lourenço Machado(gui.admin@gmail.com) on 2011-06-29T16:28:14Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2011_EzioGomesMota.pdf: 1181027 bytes, checksum: 581e840f6171f2cef41fa5511f0a9890 (MD5) / Made available in DSpace on 2011-06-29T16:28:14Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2011_EzioGomesMota.pdf: 1181027 bytes, checksum: 581e840f6171f2cef41fa5511f0a9890 (MD5) / Uma série de acontecimentos ocorridos na Europa e no mundo, relacionados a doenças dos animais e a contaminação dos alimentos como: o “Mal da Vaca Louca” (Encefalopatia Espongiforme Bovina – EEB) e seus registros da enfermidade correlata nos seres humanos, contaminação por dioxinas, aftosa e outros eventos, deixaram o mundo em alerta em relação aos alimentos de origem animal, especialmente de bovinos. Como consequência e com os objetivos principais de aumentar a segurança dos alimentos e a credibilidade dos sistemas de produção e comercialização junto aos consumidores, primeiramente a União Européia, seguida por outros países importadores como Albânia e Chile passaram a exigir dos países fornecedores de carne bovina a adoção de regras de identificação e registro de origem de todo rebanho bovino, estabelecendo prazos para a implementação da rastreabilidade dos animais. Hoje, em muitas regiões, o rastreio completo da origem da carne é um requisito para o comércio internacional e, com isso, há países que se valem da rastreabilidade para assegurar sua competitividade. Para viabilizar a continuidade na exportação de carne bovina in natura, o Ministério da Agricultura, Pecuária e Abastecimento implantou em 2002 o Sistema Brasileira de Identificação e Certificação de Origem Bovina e Bubalina – SISBOV . Esta pesquisa, de caráter qualitativo, está fundamentada em levantamentos da legislação aplicada ao setor na União Européia e no Brasil, com uma abordagem especial sobre os avanços da atividade de pecuária de corte brasileira e, da legislação relacionada à rastreabilidade bovina desde a implantação do SISBOV. A pesquisa de campo foi realizada em cinco segmentos da Cadeia Produtiva da Carne Bovina assim representados: Coordenação de Rastreabilidade do MAPA e algumas Certificadoras credenciadas, Entidades de Classe representativas do Setor, produtores rurais habilitados à exportação para a União Européia, em particular produtores da região de Patos de Minas em Minas Gerais, frigoríficos de exportação e alguns supermercados distribuidores de carne em Brasília. Os resultados desta pesquisa somados às diversas informações relacionadas com a rastreabilidade bovina no Brasil, descritas nos trabalhos pesquisados e notícias afins apontam no sentido de que existe uma frágil coordenação via preços na cadeia dessa importante atividade, particularmente na questão de remuneração do pecuarista que trabalha com animais rastreados. Ocorreu uma acentuada queda no preço da arroba do boi rastreado a partir do inicio de abate de bovídeos confinados, que em grande parte são de propriedade dos frigoríficos. Isto gerou um desequilíbrio entre a oferta e a procura por animais rastreados acarretando instabilidade no diferencial de preços pagos pela arroba do boi rastreado em relação ao comum. _______________________________________________________________________________________ ABSTRACT / A series of events in Europe and around the world, related to animal diseases and food contamination as the “Mad-Cow Disease” (Bovine Spongiform Encephalopathy - BSE) and its records related illness in humans, dioxin contamination disease and other events left the world on alert for food of animal origin, especially cattle. As a consequence, with the main objectives of increasing food safety and reliability of production systems and marketing to consumers, primarily the European Union, followed by other importing countries such as Albania and Chile began to require of the countries supplying beef to adopt rules of origin identification and registration to origin of all cattle, setting deadlines for implementing the traceability of cattle. Today, in many regions, for full traceability of the origin of meat is a requirement for international trade and, thus, there are countries that use the traceability to ensure its competitiveness. To facilitate continuity in the export of fresh beef to the EU and other countries that adopt the same rules of the EU in its imports, the Ministry of Agriculture, Livestock and Supply in 2002 implanted the Brazilian System of Identification and Certification of Bovine Origin and Buffalo - SISBOV. This qualitative research is based on surveys of law applied to the sector in the European Union and Brazil, with a special approach on the progress of the activity of Brazilian beef cattle, and legislation related to bovine traceability since the implementation of SISBOV. The fieldwork was done in five segments of the Bovine Meat Production Chain represented as follows: MAPA Coordination Traceability and some Accredited Certification, Class Entities representing the industry, farmers cleared for export to the EU, in particular producers in the region Patos de Minas in Minas Gerais, stores and some supermarkets export meat distributors in Brasilia. These results added to the various information related to bovine traceability in Brazil, respondents described the work and related news link in the sense that there is a weak coordination thought prices in the chain of this important activity, particularly on the issue of remuneration of the rancher who works with animals screened. There was a sharp drop in the price differential of the at sign of the ox traceable from the beginning of the slaughter of cattle feedlot, which largely are the property of slaughterhouse. This begot an imbalance between supply and demand for animals screened causing instability in the price differential paid by at sign of the ox traced to common.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Agronomia e Medicina Veterinária, 2011. / Submitted by Albânia Cézar de Melo (albania@bce.unb.br) on 2011-11-01T11:35:24Z No. of bitstreams: 1 2011_IsabelaReboucasBessa.pdf: 1322125 bytes, checksum: 4474d6fb57a2955d26b304bb4411576e (MD5) / Approved for entry into archive by Leila Fernandes (leilabiblio@yahoo.com.br) on 2011-12-13T11:20:22Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2011_IsabelaReboucasBessa.pdf: 1322125 bytes, checksum: 4474d6fb57a2955d26b304bb4411576e (MD5) / Made available in DSpace on 2011-12-13T11:20:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2011_IsabelaReboucasBessa.pdf: 1322125 bytes, checksum: 4474d6fb57a2955d26b304bb4411576e (MD5) / O objetivo do presente estudo foi estudar o perfil da expressão de genes candidatos para a aquisição da competência durante o crescimento ovocitário em bovinos utilizando ovócitos de diferentes tamanhos provenientes de várias categorias de folículos. Os genes candidatos foram selecionados por estarem possivelmente envolvidos com a aquisição da competência (BMP15, OOSP1, H1FOO, H2A, H3A, H4, SLBP, DNMT1, DNMT3B, HAT, HDAC e SUV39H1). Para determinar o tamanho dos ovócitos a serem utilizados, foi realizado um pré- experimento, em que os folículos pré-antrais foram classificados orfologicamente, agrupados em diferentes categorias em primordial, primário, secundário inicial e secundário final. Após a classificação, os ovócitos de cada folículo foram individualmente isolados e medidos. Folículos pré-antrais e antrais foram isolados de ovários de vacas Nelore (Bos taurus indicus), por dissociação mecânica utilizando o Tissue Chopper. Para o isolamento dos ovócitos, os folículos foram expostos à colagenase tipo II (0,5 mg/ml) e então submetidos a sucessivas pipetagens. Os ovócitos foram medidos através do programa Motic images Plus 2.0 e classificados de acordo com seu diâmetro nas seguintes categorias: 1) ovócitos de folículos primordiais: diâmetro de até 20 μm; 2) ovócitos de folículos primários: 25 a 35 μm; 3) ovócitos de folículos secundários iniciais: 40 a 60 μm e 4) ovócitos de folículos secundários finais; 65 a 85 μm. Para a obtenção dos ovócitos oriundos de folículos antrais incompetentes e competentes, foram utilizadas as medidas de 100 a 120 μm e acima de 128 μm respectivamente. O RNA total foi extraído de 4 pools de 25 ovócitos, de cada categoria de folículo, e os transcritos dos genes foram quantificados por qPCR. Os valores de expressão dos genes alvos foram normalizados pela expressão do gene constitutivo CYC A. Os resultados foram analisados através do teste não paramétrico Kruskall Wallis, para comparar os tamanhos de folículos e ovócitos e avaliar o efeito do tamanho do ovócito na quantidade de expressão gênica. O nível de significância considerado foi P<0,05. Os resultados mostraram que os transcritos da H2A, H3, H4 e SUV39H1 não diferiram (P>0,05) entre os grupos de ovócitos de folículos antrais e pré-antrais. A expressão da OOSP1, SLBP, BMP15, H1FOO, DNMT1, DNMT3B e HAT foram menores (P<0,05) em ovócitos préantrais quando comparados com os de folículos antrais. A H3A foi o único gene em que foi detectado a expressão de RNAm em ovócito de folículo primordial. De todos os genes estudados, apenas a HDAC apresentou diferença significativa entre ovócitos de folículos antrais competentes e incompetentes. Os resultados sugerem que o acúmulo dos estoques dos genes analisados ocorre antes do estágio final da folículogênese e provavelmente não são marcadores para a competência. A HDAC foi o único gene que pode estar relacionado à competência do ovócito, pois mostrou uma diminuição (P<0,05) no nível de transcrito nos grupos de ovócitos competentes quando comparados com o grupo de antrais iniciais (1a 3mm). ______________________________________________________________________________ ABSTRACT / The aim of this present study was investigate the expression profile of candidates genes for the acquisition of competence during oocyte growth in bovine using oocytes from different sizes obtained from several follicle categories. The candidate genes were selected to be possibly involved in competence (BMP15, OOSP1, H1FOO, H2A, H3A, H4, SLBP, DNMT1, DNMT3B, HAT, HDAC e SUV39H1). A pre-experiment was conducted to classify the follicles according to their categories in primordial, primary, small secondary and final secondary follicles. Then the oocytes were individually isolated and measured. Preantral and antral follicles were isolated from ovaries of Nelore (Bos taurus indicus) cows by mechanical dissociation using a Tissue Chopper. To isolate the oocytes, follicles were exposed to collagenase type II solution (0.5 mg/ml) and then submitted to successive pipetting. The oocytes were measured with Motic Images Plus 2.0 program and classified according to their diameter into the following categories: 1) oocytes from primordial follicle: diameter < 20 μm; 2) oocytes from primary follicles: 25 to 35 μm; 3) oocytes from small secondary follicles: 40 to 60 μm; 4) oocytes from final secondary follicles: 65 to 85 μm; 5) oocytes from early antral follicles: 100 to 120 μm; and 6) oocytes from final antral follicles: > 128 μm. Total RNA was extracted from 4 pools of 25 oocytes from each category of follicles using Rneasy Plus® kit, subjected to reverse transcription reaction and genes quantified by qPCR. Target gene expression was normalized using CYC A. Data were analyzed using Kruskal-Wallis test for values which were not normally distributed. Level of significance was considered P<0.05. The results show that the transcripts of H2A, H3A, H4 e SUV39H1 did not differ significantly between groups, showing the same pattern from preantral to antral follicles. For OOSP1, SLBP, BMP-15, H1FOO, DNMT1, DNMT3B and HAT, the pattern of expression was lower in oocytes from preantral follicles when compared to antral follicles. The H3A was the only gene in which expression was detected in oocytes from primordial follicles. From all the studied genes, only HDAC differed significantly between incompetent and competent oocytes. These results suggest that the stocks of transcripts of the studied genes are accumulated before the final phase of folliculogenesis. The HDAC was the only gene in which expression could be related to oocyte competence since it showed a decrease (P<0.05) in transcript levels from final antral oocytes (competent) compared to small antral group.

Dissertação (mestrado)-Universidade de Brasília, Faculdade de Agronomia e Medicina Veterinária, 2007. / Submitted by Patrícia Nunes da Silva (patricia@bce.unb.br) on 2011-04-25T20:45:20Z No. of bitstreams: 1 Tese_Luis Fernando.pdf: 497950 bytes, checksum: b737992962108f1d5802bb11bfee8d7f (MD5) / Approved for entry into archive by Patrícia Nunes da Silva(patricia@bce.unb.br) on 2011-04-25T20:45:44Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Tese_Luis Fernando.pdf: 497950 bytes, checksum: b737992962108f1d5802bb11bfee8d7f (MD5) / Made available in DSpace on 2011-04-25T20:45:44Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Tese_Luis Fernando.pdf: 497950 bytes, checksum: b737992962108f1d5802bb11bfee8d7f (MD5) / Avaliou-se o efeito da suplementação protéico-energética e o seu fornecimento em diferentes freqüências de fornecimento sobre o ganho de peso e o comportamento ingestivo diurno de bezerros em pastagem de Brachiaria brizantha cv. Marandu na época da seca. O período experimental foi de 140 dias, sendo o desempenho dos sete bezerros da raça Nelore de cada tratamento realizado através de pesagens a cada 28 dias. Os tratamentos analisados consistiam de um lote sem acesso à suplementação (Grupo controle), e os demais com acesso à mesma quantidade de suplemento ofertado nas freqüências de 7, 3 e 1 vez por semana, a quantidade de suplemento ofertado correspondia a 0,72 kg/animal/dia. O delineamento utilizado foi de blocos completos casualizados com duas repetições. As variáveis comportamentais ingestivas foram obtidas através de observações visuais feitas a cada 10 minutos durante 12 horas em cada dia de observação, sendo realizado durante o experimento cinco observações. O tratamento sem suplementação resultou em ganho médio diário de 0,005 kg, enquanto os tratamentos com suplementação obtiveram ganho médio diário de 0,183 kg, verificando-se, assim, diferença (P<0,05) entre o tratamento controle e os tratamentos suplementados. Já entre as diferentes freqüências de suplementação não houve diferença (P>0,05) nos ganhos médios diários, os quais foram de 0,177 kg, 0,183 kg e 0,190 kg, nas freqüências 7, 3 e 1 vez por semana, respectivamente. Quanto às variáveis comportamentais, os animais sem acesso à suplementação pastejaram por mais tempo e dedicaram menos horas ao ócio que os animais suplementados. Entre as três freqüências de suplementação, não houve diferença (P>0,05) nas variáveis tempo de pastejo, ruminação, ócio, tempo de cocho, sal e bebedouro. Os resultados obtidos são indicativos de que tanto a suplementação protéico-energética como sua oferta em escala semanal proporcionam melhoria no desempenho dos bezerros no período da seca. _________________________________________________________________________________________ ABSTRACT / The effect of the protein-energy supplementation was evaluated and its supply in different frequencies of supply on the profit of weight and the diurne ingestive behavior of year-old calves in pasture of Brachiaria brizantha cv. Marandu at the dry season. The experimental period was of 140 days, being the performance of the seven year-old calves of the Nelore race of each treatment carried through weight analization to each 28 days. The analyzed treatments consisted of a lot without access to the supplementation (Group have controlled), and excessively with access to the same amount of supplement offered in the frequencies of 7, 3 and 1 time per week, the amount of the 0,72 offered supplement corresponded kg/animal/day. The used delineation was complete blocks with two repetitions. The variable mannering ingestive had been gotten through visual comments made to each 10 minutes during 12 hours in each day of comment, being carried through during the experiment five comments. The treatment without supplementation resulted in daily average profit of 0,005 kg, while the treatments with supplementation had gotten 0,183 kg, verifying itself, thus, difference (P<0,05) in the daily average profits. Between the different frequencies supplementation haven’t had difference (P>0,05) in the diary gain, which had been of 0,177 kg, 0,183 kg and 0,190 kg, in frequencies 7, 3 and 1 time per week, respectively. As to the mannering variable, the animals without access to the supplementation grazed for more hours and less time for resting than the other animals. Among the three supplementation frequencies, haven’t had different (P>0,05) in the variables of the time of grazing, rumination, or resting as well as the time at the trough either eating or drinking or eating salt .The gotten results are indicative of that as much the protein-energy supplementation as it its offers in weekly scale provide improvement in the performance of the year-old calves in the dry season.

Avanços na área da genômica têm propiciado a inclusão da informação genômica no melhoramento genético animal. O sucesso de sua utilização depende da extensão do desequilíbrio de ligação (DL) entre marcadores e QTL, do número de animais genotipados no grupo de treinamento (GT) e da h2 da característica. O conhecimento de parâmetros de diversidade genética tais como endogamia e tamanho efetivo da população (Ne), associados ao aumento dos níveis de DL, são úteis no estudo da viabilidade da seleção genômica. Com o objetivo de estimar estes parâmetros em uma população de gado de corte, bovinos Nelore foram estudados através de uma análise de pedigree. O Ne estimado foi de 114, 245 e 101 para os anos de 95-99, 99-03 e 03-07, respectivamente. Para estimar a acurácia do valor genômico direto (VGD) foram simuladas duas populações com estrutura de DL semelhante àquela em gado de corte com 40k (POP1) e 800k (POP2) marcadores SNP. O DL entre os SNP adjacentes, medido pelo r2, foi de 0,25 e 0,32 e o Ne foi de 250 e 120 para POP1 e POP2, respectivamente. Para POP1, GT foram formados por 1920, 960 e 480 touros com acurácia média do valor genético estimado (VGE) de 0,79, 0,90 e 0,94 para h2 0,10, 0,25 e 0,40, respectivamente, e para POP2, 480 touros com a mesma acurácia média dos VGE. Outros dois GT (7680 e 1920 para POP1 e POP2) foram formados por animais com fenótipo disponível para estimar os efeitos dos marcadores ao invés do VGE. A acurácia do VGD aumentou significativamente (p<0,05) com o aumento do número de touros no GT, h2 e densidade dos marcadores. O número de animais no GT teve um efeito quadrático sobre as acurácias do VGD para todas as h2(p<0,0001). Para a POP1, a acurácia mais alta (0,64) foi observada para h2=0,40 e n=1920. As acurácias do VGD na POP2 foram maiores (de 16% a 24%) do que aquelas para 40k SNP e n=480 e similares àquelas para 40k SNP e n=960. Aumentar em 4 vezes o GT e usar fenótipos para calcular os efeitos dos marcadores não foi suficiente para manter ou aumentar a acurácia do VGD para h2<0,40, tanto para POP1, como POP2. Os resultados obtidos quando o número de SNP foi aumentado de 40k para 800k SNP com n=480 indicou que o painel mais denso requer 2 vezes menos touros no GT do que 40k SNP para produzir acurácias do VGD similares. Os resultados sugerem que a seleção genômica pode trazer ganhos em acurácia na ordem de 27, 13 e 10%, considerando n=1920 e h2=0,10, 0,25 e 0,40, respectivamente e 7% para n=960 e h2=0,10 com relação aos VGE de animais jovens (média dos pais). Estes níveis de ganho foram menores do que aqueles relatados para gado de leite. Portanto, justificam-se mais trabalhos de pesquisa nesta área. / Advances in genomics have led to the inclusion of genomic information in livestock breeding. The success of its use depends mainly on the extent of linkage disequilibrium (LD) between markers and QTL, the number of genotyped animals in the training set (TS), and the heritability of the trait. The knowledge of genetic diversity parameters such as rate of inbreeding and the effective population size (Ne) which are associated with the increase in LD levels is useful for studying the feasibility of genomic selection. Aiming to estimate these parameters in beef cattle, a population of Nellore cattle was studied by pedigree analysis. The Ne was estimated to be 114, 245 and 101 for the years 95-99, 99-03 and 03-07, respectively. Aiming to estimate the accuracy of genomic selection, two populations were simulated with a LD structure similar to that in beef cattle with 40k (POP1) and 800k (POP2) SNP markers. The LD between adjacent markers, as measured by r2, was 0.25 and 0.32 and Ne was 250 and 120 for POP1 and POP2, respectively. TS were formed by 1920, 960 and 480 bulls with EBV with mean accuracy of 0.79, 0.90 and 0.94 for h2 of 0.10, 0.25 and 0.40, respectively, for POP1, and 480 bulls with the same average accuracies of EBV for POP2. Two large TS (7680 and 1920 for POP1 and POP2) were composed by animals with phenotypic information to estimate the marker effects, rather than EBV. The accuracy of direct genomic EBV (DGEBV) increased significantly (p<0.05) with the increasing of number of bulls in the TS, h2 and density of the markers. The number of animals in the TS showed a quadratic effect on the accuracy of DGEBV (p<0.0001) for all h2. For POP1, the highest accuracy (0.64) was observed for h2 of 0.40 and 1920 bulls in TS. The accuracies of DGEBV in POP2 were higher (from 16% to 24%) than those from 40K SNP and 480 bulls in the TS and similar to those from 40K SNP and 960 bulls in TS. Increasing the number of animals in TS by 4-fold and using phenotypes to calculate the marker effects was not enough to maintain or increase the accuracy of DGEBV estimated using EBV as response variable to estimate the marker effects, when the h2 was lower than 0.40 for both POP1 as POP2. Results of increasing the number of markers from 40k to 800k with a TS of 480 genotyped bulls indicate that the high density marker panel would require 2 times less bulls in the TS than 40K for yielding similar accuracies of DGEBV. The results suggest that genomic selection can bring gains in accuracy of 27, 13 and 10%, considering 1920 bulls in the TS for h2=0.10, 0.25 and 0.40, respectively, and 7% for TS of 960 bulls and h2=0.10 when compared to the parent average of young animals. These gains were lower than those reported in dairy cattle. Therefore, more investigations are warranted.

Foi desenvolvido um modelo bioeconômico para calcular valores econômicos para caracteres dos objetivos de seleção em sistemas de produção de ciclo completo e propor índices de seleção econômicos com base nos critérios de seleção utilizado no programa de melhoramento da raça Aberdeen Angus no estado do Rio Grande do Sul. As informações de parâmetros biológicos e econômicos utilizados nos cálculos são provenientes das propriedades, de outros estudos e do programa de melhoramento da raça - PROMEBO. Foram usadas planilhas Excel para o desenvolvimento do modelo. Os valores econômicos foram estimados para os objetivos de seleção de sistemas de produção de ciclo completo, sendo estes o número de bezerros desmamados (NBD) e peso ao abate (PA). Para avaliar o impacto das mudanças no desempenho dos caracteres sobre o lucro total do sistema de produção, os valores iniciais dos caracteres foram aumentados em 1%. Os caracteres são expressos em reais por unidade de mudança no caráter e foram calculados na base vaca/ano. Os valores econômicos para NBD e PA foram respectivamente R$ 6,65 e R$ 1,43. A partir das matrizes de (co)variância genética entre os objetivos e os critérios de seleção foram calculados ponderadores econômicos para os critérios de seleção utilizados no PROMEBO, estes são os seguintes: peso (P) a desmama (D) e ao sobreano (S), conformação (C), precocidade (G) e musculatura (M) a desmama e ao sobreano e perímetro escrotal (PE). Os ponderadores econômicos para PD, CD, GD e MS foram positivos e variarem de 2,61 a 0,62 reais. Para PS, CS, GS, MS e PE os ponderadores variaram de 1,40 a 0,004 reais. O índice de seleção a desmama alocaria 44,77% de ênfase para PD, 14,24% para CD, 30,36% para GD e 10,63% para MD. O índice de sobreano daria ênfase de 77,61% para PS, 4,99% para CS, 11,09% para GS, 6,10% para MD e 0,22% para PE. O caráter que mais impactou economicamente o sistema de produção de ciclo completo usando pastagem foi o reprodutivo, NBD, já o PA teve importância econômica positiva no sistema de produção, indicando que a seleção para esses caracteres aumentará a lucratividade do sistema. Os ponderadores econômicos para os caracteres ponderais e escores visuais de C, P e M e PE foram positivos indicando que esses caracteres podem ser usados na seleção dos animais que irão contribuir para incrementar a lucratividade do sistema de produção. / We developed a bio-economic model to estimate economic values for traits of breeding goals in production systems and propose full cycle economic selection indexes based on the criteria selection used in the breeding program Aberdeen Angus breed in the state of Rio Grande do Sul. Biological and economics information parameters used in the calculations are derived from the properties of other studies and the breeding program of the breed - PROMEBO. Excel spreadsheets were used for model development. Economic values were estimated for the purposes of selection of complete cycle systems production, the number of weaned calves (NCW) and slaughter weight (SW). In order to assess the impact of changes in the performance of the characters on the overall profitability of the production system, the initial values of the characters were increased by 1%. The characters are expressed in Real(R$) per unit change in character, and were based on cow / year. The economic values for NCW and SW were respectively R$ 6,65 and R$ 1,43. From the matrix of (co)variance components, between the objectives and the criteria of selection, we have calculated economic weights for selection criteria used in PROMEBO as the following: weight (W) weaning (W) and yearling (Y), conformation (C), precocity (P) and muscle (M) and weaning and yearling scrotal circumference (SC). The economic weights for WW, CW, PW and MW were positive and ranged from 2,61 to 0,62 reais. PY, CY, GY, MY and SC the weight ranged from 1,40 to 0,004 reais. The weaning selection index allocates 44.77% of emphasis for PW, 14.24% for CW, 30.36% to 10.63% for GW and MW. The index for yearling give emphasis 77.61% for PY, 4.99% for CY, 11.09% for GY, 6.10% to 0.22% for MY and SC. The character that most impacted economically production system complete cycle using grazing was the reproductive NCW. The SW had positive economic importance in the production system, indicating that selection for these characters increase the profitability of the system. The economic weights for traits and visual scores by weight for C, P and M and SC were positive, indicating that these characters can be used in the selection of animals that will contribute to increase the profitability of the production system.

Orientador: Antonio de Melo Serrano / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia de Alimentos / Made available in DSpace on 2018-07-18T04:19:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Roca_RobertodeOliveira_D.pdf: 4035287 bytes, checksum: 9143ebb23c281eb221092d0b159c3e01 (MD5) Previous issue date: 1993 / Resumo: O resumo poderá ser visualizado no texto completo da tese digital Com o objetivo de avaliar a influência do banho de aspersão antes do abate em alguns parâmetros da qualidade da carne bovina, foram determinadas as modificações bioquímicas e bacterianas do músculo Longus coli, as contaminações da superfície da carcaça ao longo da linha de abate e a eficiência da sangria dos animais. Foram utilizados 36 bovinos sãos, da raça Nelore, abatidos em matadouro-frigorifico, sendo 18 animais submetidos ao banho de aspersão e 18 animais não submetidos ao banho. Foram colhidas amostras assepticamente na porção torácica do músculo Longus coli no inicio do resfriamento carcaça. Para amostragem da carcaça da superfície foi empregada a técnica da zaragatoa logo após a esfola, antes lavagem da carcaça e no inicio do resfriamento. A eficiência da sangria foi avaliada através de determinações do teor de hemoglobina em amostras de sangue, colhido cinco segundos apos o corte dos vasos sanguíneos, e da mesma amostra do músculo Longus coli empregada nas outras determinações. Nas amostras de músculo foram feitas as determinações de glicogênio, glicose, pH, acidez, capacidade retenção de água, contagem total de bactérias e contagem de psicrotróficos e contagem de Enterobacteriaceae, após 5,24 e 48 horas do abate. Na superfície da carcaça as avaliações foram: contagem total de bactérias e contagem de psicrotróficos. Foi empregada análise multivariada para as avaliações bioquímicas e microbianas e, para a avaliação da eficiência da sangria, foi adotado o delineamento experimental de blocos inteiramente casualisados. Verificou-se que o banho de aspersão antes do abate não afetou (P> 0,05) o perfil da glicólise. Houve um efeito significativo do tempo após o abate nas determinações de glicogênio, glicose, pH, acidez e capacidade de retenção de água nas primeiras 24 horas, não ocorrendo o mesmo efeito no período entre 24 e 48 horas após o abate. O banho de aspersão ante-mortem não afetou as contagens bacterianas no interior do músculo. Até o período de 48 horas após o abate ocorreu apenas um aumento das contagens de bactérias psicrotróficas. Não houve diferença (P > 0,05) na contagem total de bactérias e contagem de psicrotróficos na superfície da carcaça entre os animais submetidos ao banho de aspersão e animais não submetidos ao banho. Também não ocorreram diferenças significativas de contagens em relação ao momento de colheita: esfola, antes da lavagem e câmara frigorífica. O teor de hemoglobina retido no músculo e a eficiência de sangria não foram afetadas pelo banho de aspersão / Abstract: To determine the effects of the pre-slaughter showering on some meat quality parameters, we have studied the biochemical and bacterial changes in the Longus coli muscle, the contamination of the meat surface at three different points of the slaughter line, and the bleeding efficiency. Thirty six healthy Nelore steers, were slaughtered in a commercial slaughterhouse. Eighteen animals were submitted to pre-slaughter showering; a control group of eighteen animals were slaughtered without showering. Aseptic samples were collected for evaluations in the muscle depth, in the anterior portion of Longus coli muscle, just before chilling. The swab method was used for sampling meat surface right after dressing, before carcass washing, and at the beginning of chilling. Bleeding efficiency was evaluated through the ratio of muscle hemoglobin/blood hemoglobin using blood samples taken at bleeding and muscle sample taken before chilling Longus coli muscle samples were also used to determine glycogen, glucose, pH, acidity, water holding capacity, bacteria total count, psychrotrophic count and Enterobaoteriaoeae count, after 5,24 and 48 hours of the slaughter, and in meat surface, bacteria total count and psychrotrophic count. Multivariate methods were used to evaluate biochemical and bacterial data. The bleeding efficiency data analysis followed the randomized blocks design. The pre-slaughter showering did not affect (P>0.05) the glucolisis. There was a significant effect of time in glycogen, glucose, pH, acidity and water holding capacity results, in the first 24 hours. The use of pre-slaughter showering did not affect the bacteria total counts, in the deep tissue. A significant growth of psychrotrophic bacteria was detected in both treatments. No significant differences (P > 0.05) were found in bacteria count total and psychrotrophic count between treatments. Also, no differences (P >0.05) were detected between counts taken at different moments at the kill floor: skinning, before carcass washing, and at the cooler, before chilling. Hemoglobin retained in the muscle and bleeding efficiency were not affected (P>0.05) by pre-slaughter showering / Doutorado / Doutor em Tecnologia de Alimentos

Orientador: Sandra Aidar de Queiroz / Coorientador: Roberto Carvalheiro / Banca: João Ademir de Oliveira / Banca: Patrícia Tholon / Resumo: No Brasil, são escassos os estudos referentes ao escore de condição corporal (ECC) de vacas de corte que, quando associado ao peso, têm impacto na produção de bezerros e na reprodução, pois reflete o balanço energético do corpo animal. Assim, o objetivo deste trabalho foi associar ECC com a prenhez de vacas Nelore e com o desempenho de seus produtos a desmama, bem como verificar se esta característica pode ser incluída nos critérios de seleção da raça Nelore. O ECC das vacas foi atribuído no diagnóstico de gestação ou no desmame, variando de 1 a 5. Por regressão logística, utilizando o método de seleção Stepwise, foram analisados os seguintes efeitos sobre o ECC: grupo de contemporâneos a desmama, peso e altura de garupa da vaca, ordem de parto, diagnóstico de gestação, histórico reprodutivo anterior à coleta do ECC, presença de bezerro ao pé e escores de C e P dos produtos a desmama. Na análise genética, elaborada usando-se inferência baeysiana, foram incluídos os mesmos efeitos anteriores, com peso e altura de garupa da vaca como co-variáveis, e acrescidos do efeito genético aditivo da vaca. Os resultados mostraram que vacas com ECC elevado emprenharam mais do que as de pior ECC, porém o desempenho dos seus bezerros foi inferior. Vacas multíparas foram mais pesadas e de escores mais magros (ECC 1 e 2). As correlações de Spearman entre ECC e suas fontes de variação foram, em sua maioria, de baixa magnitude. Os efeitos que mais explicaram a variação do ECC foram peso, grupo de contemporâneos e altura da garupa. A estimativa de herdabilidade do ECC foi igual a 0,22, com intervalo de credibilidade entre 0,13 e 0,31, valor de magnitude moderada, demonstrando a presença de ação gênica aditiva na determinação do ECC e que este pode ser utilizado como critério de seleção de vacas / Abstract: In Brazil few studies have been done on the body condition score (BCS) of beef cows. The knowledge of this score associated with body weight can produce an impact on calf production and cow's reproduction, because it reflects the energy balance of the animal body. The objective of this study was to associate BSC with pregnancy of cows and the performance of their calves at weaning, and to verify if this trait could be included as selection criteria. The BCS was recorded on pregnancy diagnosis or at weaning and ranged from 1 to 5. Applying logistic regression, using the Stepwise selection method, we analyzed the following effects on BSC: contemporary group at weaning, classes of weight and hip height of the cow, number of calvings, pregnancy diagnosis, reproductive history prior to collection BSC, the presence of calf and C and P score of calves at weaning. For the genetic analysis, performed using Baesyan inference, the same effects were considered, with weight and hip height as covariate, and also the genetic direct effect of the cow. The results showed that cows with higher BCS had better pregnancy rate than those with lower BSC, but the performance of their calves was worse. Multiparous cows were heavier and had leaner scores (BCS 1 and 2) than the primiparous ones. The Spearman rank correlation between BSC and their sources of variation were generally of low magnitude. Contemporary group, body weight and height of the cow were the effects that accounted for most of the variation of BSC. The heritability estimate of BCS was equal to 0.22 with credible interval ranging from 0.13 to 0.31, a moderate magnitude value that indicates the presence of additive genetic variation and that BSC can be used as selection criterion for cows / Mestre

Orientador: Lucia Galvão de Albuquerque / Coorientador: Fernando Sebastián Baldi Rey / Banca: Danísio Prado Munari / Banca: Josineudson Augusto II de Vasconcelos e Silva / Banca: Arione Augusti Boligon / Banca: Fabyano Fonseca e Silva / Resumo: O Brasil destaca-se mundialmente como o maior exportador e o segundo maior produtor de carne bovina. Entretanto, o rebanho brasileiro é composto majoritariamente por animais de raças Zebuínas, que produzem carnes de menor qualidade sensorial, quando comparados com os animais de raças Taurinas. Apesar da importância dessas características para a cadeia produtiva, a seleção ainda é pouco praticada, uma vez que as mesmas são difíceis de serem medidas, dependendo do abate dos animais e, consequentemente, de realização de testes de progênie para avaliação dos touros, atrasando o processo seletivo. Desta forma, a seleção indireta por meio de características comumente empregadas nos programas de seleção apresenta-se como alternativa. Neste contexto, as avaliações visuais por escorestêm sido incluídas nos programas de melhoramento genético de bovinos de corte, com o objetivo de melhorar características de carcaça. Objetivou-se com o presente trabalho estudar os parâmetros genéticos para as características da carcaça e carne, bem como suas relações com mensurações de avaliação visual. Os dados são provenientes de animais da raça Nelore, machos e fêmeas, que pertencem a dois programas de melhoramento genético - DeltaGen e Paint. Os animais com registros de dados fenotípicos para as características da carcaça e carne foram somente machos, nascidos entre 2008 e 2010, criados em sistemas de pastejo e confinados apenas na fase de terminação, por período ao redor de 90 dias. Foram utilizados registros de 36.660, 36.550, 36.550 e 36.550 animais machos e fêmeas, respectivamente, para peso à desmama (PD), conformação ao sobreano (C), precocidade ao sobreano (P) e musculatura ao sobreano (M) e, para as características da carcaça e da carne foram utilizados 1.442, 1.441, 1.435, 1.533, 1.535, 1.535, 1.534, 1.533 e 1.522 para área de olho de lombo (AOL), peso ... / Abstract: Brazil is the largest beef exporter and the second beef producer in the world. However, the Brazilian cattle composite is mostly Bos indicus, which produces meat with less quality than Bos taurus. Despite the importance of carcass (CARC) and meat quality (MQ) traits for the beef production cycle, its selection is not applied. Genetic evaluation after harvest is expensive because it requires a long period of time for the trait to be evaluated and consequently, also requires a progeny test. Therefore, the indirect selection through the traits which are commonly applied on breeding programs is feasible. Within this context, the visual evaluation using scores has been used on breeding programs, aiming to improve the carcass traits. The objective of the present study was to evaluate the genetic parameters of CARC and MQ, as well as their genetic associations with visual scores in Nellore cattle. For CARC and MQ traits were used only males, from animals that were born between 2008 and 2010, raised on grazing system and kept around 90 days in feed lot system for finishing. Records of 36,600, 36,550, 36,550, 1,442, 1,441, 1,435, 1,533, 1,535, 1,535, 1,534, 1,533 and 1,522 for yearling conformation (C), yearling finishing precocity (P), yearling muscling (M), rib eye area (REA), hot carcass weight (HCW), fat thickness (FT), Warner - Bratzler shear force (SF), marbling score (MS), lightness (L*), redness (a*), yellowness (b*) and intramuscular lipid (IL), respectively, were used. The (co)variance components were estimated by the restricted maximum likelihood method using tri and multitrait animal model. For the visual scores the model included the genetic additive and residual random effects, the contemporary group (CG) as a fixed effect and age of the animal (linear and quadratic) as covariate. For CARC and MQ the model included the genetic additive effect and residual effect as random effects, and ... / Doutor

Orientador: Flávio Dutra de Resende / Banca: Paulo Roberto Leme / Banca: Mario de Beni Arrigoni / Banca: Izabelle Auxiliadora Molina de Almeida Teixeira / Banca: Wignez Henrique / Resumo: Objetivou-se com este trabalho estudar os efeitos de diferentes aditivos alimentares administrados sozinhos ou associados na dieta de tourinhos Nelore confinados por 109 dias. Os tratamentos foram constituídos por dieta controle, dieta com monensina sódica (27,0 mg.kg MS-1), dieta com levedura viva Yea-Sacc8417 (2,0 g.animal-1) e dieta com associação dos dois aditivos. As dietas (10,00% bagaço de cana; 73,60% milho triturado; 6,40% caroço de algodão; 6,40% farelo de soja; 0,26% glúten de milho; 0,79% ureia e 2,55% núcleo mineral) variaram somente na inclusão dos aditivos. Para a avaliação do desempenho produtivo, utilizou-se 66 bovinos Nelore, não castrados (387,24±21,17 kg), sendo 22 abatidos durante o experimento (6 ao início e 16 logo após a adaptação - 25 dias) para mensuração do peso em corpo vazio (PCVz) e serviram como animais referência (Experimento 1). Para a avaliação dos parâmetros ruminais, utilizou-se 16 bovinos Nelore, não castrados (422,00 ± 80,26 kg), canulados no rúmen (Experimento 2). Os experimentos foram delineado em blocos casualizados em função do peso corporal inicial. Os animais foram mantidos em confinamento individual e considerados como unidade experimental. Experimento 1 - Nos tratamentos contendo monensina sódica, o consumo de matéria seca (CMS) foi menor (P=0,0798) (8,47 kg MS.dia-1) em relação a dieta controle (10,20 kg MS.dia-1). A levedura fornecida sem a associação não interferiu (P>0,10) no CMS. O fornecimento de energia líquida (EL) pela dieta foi maior (P=0,0055) nos 2 tratamentos contendo monensina sódica (1,98 e 1,33 Mcal.kg MS-1 para mantença e ganho, respectivamente) quando comparado com a dieta controle e com levedura sem a associação (1,79 e 1,17 Mcal.kg MS-1, mantença e ganho, respectivamente). O ganho em peso médio diário avaliado em peso corporal (1,47 kg.dia-1) e PCVz (1,58 kg.dia-1) não diferiram (P>0,10) entre dietas, porém, quando avaliado em ... / Abstract: The objective of this study was to analyze the effects of different food additives administered solely or combined in diets for young Nellore bulls in a feedlot for 109 days. The treatments consisted of a control diet with monensin sodium (27.0 mg kg DM-1), a diet with Yea-Sacc8417 live yeast (2.0 g animal-1) and a diet with the two additives combined. Diets (10.00% sugarcane bagasse, 73.60% ground corn, 6.40% cottonseed, 6.40% soybean meal, 0.26% corn gluten, 0.79% urea and 2.55% mineral mix) varied only in the inclusion of additives. For evaluation of performance, we used 66 non-castrated Nellore bulls (387.24±21.17 kg), 22 of which were slaughtered in the course of the experiment (6 at the beginning and 16 right after the adaptation period [25 days]) to measure the empty body weight (EBW) and served as reference animals (Trial 1). For evaluation of ruminal parameters, we used 16 non-castrated Nellore bulls (422.00 ± 80.26 kg) cannulated in the rumen (Trial 2). The trials were arranged in a completely randomized blocks design as a function of the initial body weight. The animals were kept in individual pens and were considered the experimental unit. Trial 1 - The dry matter intake (DMI) was lower (P=0.0798) (8.47 kg DM day-1) in the treatments containing monensin in relation to control diet (10.20 kg DM day-1). The yeast supplied alone did not interfere (P>0.10) on DMI. The supply of net energy (NE) by the diet was greater (P=0.0055) in the two treatments containing monensin (1.98 and 1.33 Mcal kg DM-1 for maintenance and gain, respectively) as compared with the control diet and with yeast alone (1.90 and 1.17 Mcal kg DM-1 for maintenance and gain, respectively). The average daily gain evaluated as body weight (BW) (1.47 kg day-1) and as EBW (1.58 kg day-1) did not differ (P>0.10) among diets, but when evaluated as carcass, the diets with monensin reduced (P<0.10) the values (0.89 kg day-1) as compared with the others ... / Doutor