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Estudo da influência de fatores genéticos e ambientais sobre as características produtivas e reprodutivas em um rebanho de bovinos da raça Nelore no Estado de Goiás / Influence of genetic and environmental factors on production and reproduction traits in a nellore cattle herd in Goias state HERD IN GOIAS STATE

Oliveira, Larissa Dirceu de 17 February 2007 (has links)
Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Agronomia e Medicina Veterinária, 2007. / Submitted by mariana castro (nanacastro0107@hotmail.com) on 2009-12-16T16:22:04Z No. of bitstreams: 1 2007_LarissaDirceudeOliveira.PDF: 426773 bytes, checksum: c8ad856fda16f90c882bc4a96b4d9930 (MD5) / Approved for entry into archive by Daniel Ribeiro(daniel@bce.unb.br) on 2009-12-16T21:47:53Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2007_LarissaDirceudeOliveira.PDF: 426773 bytes, checksum: c8ad856fda16f90c882bc4a96b4d9930 (MD5) / Made available in DSpace on 2009-12-16T21:47:53Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2007_LarissaDirceudeOliveira.PDF: 426773 bytes, checksum: c8ad856fda16f90c882bc4a96b4d9930 (MD5) Previous issue date: 2007-02-17 / O objetivo geral deste trabalho foi avaliar os fatores genéticos e não-genéticos que influenciaram nas características de produção e reprodução. Estimaram-se a herdabilidade direta e materna, variações diretas e de ambiente comum das características: peso ao nascer (PN); peso à desmama corrigido para 205 dias (P205); idade ao primeiro parto (IPP); intervalo entre partos (IEP) e fertilidade real (FR) e também correlações genéticas entre as características de interesse. Foram analisados os dados de um rebanho bovino puro da raça Nelore no município de Padre Bernardo situado no estado de Goiás, o qual de 1400 fêmeas e 1300 machos. Os programas SAS e MTDFREML foram utilizados para análise dos fatores ambientais e genéticos que afetaram as características de interesse. Os efeitos fixos sexo do animal/bezerro, mês de nascimento/parto e ano de nascimento/parto foram significativos (p<0,001) para as características PN, P205 e FR. Já o número do parto da vaca foi significativo (p<0,001) apenas para P205 e FR. Para as características IPP e IEP foram significativos os efeitos do ano de nascimento/parto, sendo que para IEP o número do parto da vaca também foi significativo. As médias para PN, P205, IPP, IEP e FR foram 29,56 Kg, 115,73 Kg, 1340,6 dias, 539,47 dias e 88,41 Kg de bezerro desmamado por ano, respectivamente era composto. A herdabilidade direta e materna para PN e P205 foram 0,28 e 0,73; 0,13 e 0,02, respectivamente. As características IPP, IEP e FR não apresentaram herdabilidade materna, sendo 0,29, 0,10 e 0,16 as herdabilidades diretas respectivamente. Foi encontrado o efeito do ambiente permanente somente nas características PN (0,73) e P205 (0,02). As correlações genéticas PN x P205, IPP x IEP, IEP x FR e FR x P205 foram 0,42, 0,54, 0,33 e 0,64, respectivamente. As regressões de DEPs nos anos mostraram que a seleção para P205 melhorou as outras características como IEP e FR. _______________________________________________________________________________________ ABSTRACT / The objective of this study was evaluate genetic and non-genetic factors which influence production and reproduction traits in a Nelore herd in Goiás state. Direct and maternal heritabilites and direct and common environmental effects were evaluated for birth weight (PN), weaning weight corrected for 205 days (P205), age at first calving (IPP), calving interval (IEP) and real fertility (FR), as well as genetic correlations between traits of interest. Data came from a Nelore herd in Padre Bernardo, Goiás State which has 1400 females and 1300 males. The SAS and MTDFREML programs were used to analyse the data. The fixed effects of animal/calf and month and year of birth/calving were significant (p<0,001) for PN, P205 and FR. The parturition number was only significant (p<0,001) for P205 and FR. For IPP and IEP year of birth/calving was significant, as was number for parturition for IEP. The means for PN, P205, IPP, IEP and FR were 29.56 Kg, 115.73 Kg, 1340.6 days, 539.47 days and 88.41 Kg calf weaned per year, respectively. The heritability (direct and maternal) for PN and P205 were 0.28 and 0.73; 0.13 and 0.02 respectively. IPP, IEP and FR did not show maternal heritability, with direct heritabilities 0.29, 0.10 and 0.16 respectively. Permanent environment effects were found for PN (0.73) and P205 (0.02). Genetic correlations between PN x P205, IPP x IEP, IEP x FR and FR x P205 were 0.42, 0.54, 0.33 and 0.64, respectively. Regressions of DEPs on year showed that selection for P205 improved the other traits.
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Polimorfismos de DNA nos genes dos receptores de estrogênio e FSHR e associação com resposta superovulatória em bovinos / Dna polymorphims in receptors estrogen and FSRH gene and association to superovulatory response in bovine

Valeriano, Ana Cláudia de Melo 25 May 2009 (has links)
Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Agronomia e Medicina Veterinária, 2009. / Submitted by Larissa Ferreira dos Angelos (ferreirangelos@gmail.com) on 2010-03-05T17:48:19Z No. of bitstreams: 1 2009_AnaClaudiadeMeloValeriano.pdf: 348938 bytes, checksum: 1dacb40fa7251b2be3b866121a3a4eab (MD5) / Approved for entry into archive by Lucila Saraiva(lucilasaraiva1@gmail.com) on 2010-03-09T01:46:45Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2009_AnaClaudiadeMeloValeriano.pdf: 348938 bytes, checksum: 1dacb40fa7251b2be3b866121a3a4eab (MD5) / Made available in DSpace on 2010-03-09T01:46:45Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2009_AnaClaudiadeMeloValeriano.pdf: 348938 bytes, checksum: 1dacb40fa7251b2be3b866121a3a4eab (MD5) Previous issue date: 2009-05-25 / Estudos baseados em genes candidatos buscam identificar polimorfismos e a prospecção de genes candidatos que estão envolvidos no processo de ovulação são ferramentas de importantes quando se pretende incrementar a eficiência reprodutiva de rebanhos e melhorar as respostas das biotécnicas de multiplicação animal. Sendo assim, o objetivo deste estudo foi sequenciar e detectar polimorfismos em parte do “exon” 10 do gene do receptor do hormônio folículo estimulante (FSHR); genotipar doadoras de embriões para um SNP nos genes receptor de estrógeno (ER) e FSHR; analisar se esses genes podem ser usados como marcadores moleculares para a resposta superovulatória em bovinos. _______________________________________________________________________________ ABSTRACT / Candidate gene based studies intend to identify polymorphisms and to prospect candidate genes evolved in ovulation process are important tools to increase the cattle reproduction efficiency and to improve animal biotechnology response. Thus, the aim of this study was to sequence and to detect polymorphisms present in exon 10 from follicle stimulation hormone receptor (FSHR) gene; to genotype estrogen receptor gene (ER1) and FSHR SNPs in embryo donors; and to verify the possibility to use these genes as molecular markers to assess the bovine ovullatory response.
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Viabilidade dos espermatozóides bovinos após exposição a nanopartículas de maghemita recobertas com DMSA / Viability of bull spermatozoa after exposure to maghemite nanoparticle coated vith DMSA

Caldeira, Denise Ferreira 07 July 2011 (has links)
Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Agronomia e Medicina Veterinária, 2011. / Submitted by Albânia Cézar de Melo (albania@bce.unb.br) on 2011-10-07T14:47:24Z No. of bitstreams: 1 2011_DeniseFerreiraCaldeira.pdf: 838817 bytes, checksum: 8324f7a9f376b731e330a1af342b8f6e (MD5) / Approved for entry into archive by Camila Mendes(camila@bce.unb.br) on 2011-10-16T17:25:21Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2011_DeniseFerreiraCaldeira.pdf: 838817 bytes, checksum: 8324f7a9f376b731e330a1af342b8f6e (MD5) / Made available in DSpace on 2011-10-16T17:25:21Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2011_DeniseFerreiraCaldeira.pdf: 838817 bytes, checksum: 8324f7a9f376b731e330a1af342b8f6e (MD5) / A utilização de nanopartículas magnéticas no sêmen permite o incremento de técnicas de reprodução assistida para a realização transgênese e seleção espermática. Para tanto, é importante conhecer o comportamento da celular espermática em contato com as nanopartículas magnéticas para que possam ser utilizadas em larga escala nas diferentes biotécnicas da reprodução. A resposta espermática após contato com fluído magnético contendo nanopartículas de maghemita recoberta com DMSA foi avaliada com o intuito de determinar a toxicidade do nanomaterial. Sêmen bovino descongelado, após passagem pelo gradiente de Percoll, foi incubado a 37,5 ºC em meio SP-TALP+ (BSA 1,5%)adicionado de fluido magnético (FM) com concentrações finais de 0,06, 0,03 e 0,015 mg de Fe/mL. O grupo controle, sem adição de FM, foi incubado apenas com meio SP-TALP+. Durante a incubação avaliou-se a cinética espermática através do sistema CASA a cada 15 minutos durante duas horas, bem como na terceira e quarta horas de incubação. No início da incubação (zero hora), na segunda e na quarta horas também foram avaliadas a integridade da membrana plasmática e a reação acrossomal por meio da associação de corantes fluorescentes (iodeto de propídio e FITC-PNA). Ao final do período de incubação, o sêmen remanescente de cada tratamento foi fixado para análise em microscópio eletrônico de transmissão (MET). Observou-se que para os parâmetros do CASA, integridade da membrana e reação acrossomal não houve influencia da nanopartícula na resposta do sêmen ao longo do período de incubação, independente da concentração utilizada. Na análise da MET não foram observados danos ultraestruturaisàs células espermáticas após contato com o FM. Também não foi observado internalização das nanopartículas em nenhum grupo tratado com FM. Desta forma, o FM contendo nanopartículas de maghemita recobertas com DMSA pode ser utilizado em contato direto com o sêmen para o incremento das técnicas de reprodução assistida, uma vez que não há alteração na função e estrutura espermática nas condições testadas. ______________________________________________________________________________ ABSTRACT / The use of magnetic nanoparticles in semen allows the improvement of assisted reproduction techniques to achieve transgenesis and sperm selection. Therefore, it is important to know the sperm cell behavior after exposure to magnetic nanoparticles, to achieve their use in different biotechnologies of reproduction in large scale. The sperm response after exposure to magnetic fluid containing maghemite nanoparticles coated with DMSA was evaluated in order to determine the toxicity of the nanomaterial. After passage through the Percoll gradient, frozenthawed bull semen was incubated at 37.5 °C in SP-TALP+ medium (1.5% BSA) added to the magnetic fluid (MF) with final concentrations of 0.06, 0.03 and 0.015 mg Fe/mL. The control group, without MF, was just incubated with SP-TALP+ medium. During incubation the sperm kinetic pattern was assessed using CASA system, the assessments were performed every 15 minutes during two hours, as well as in the third and fourth hours of incubation. At the beginning of the incubation (hour zero), as well as in the second and fourth hours the sperm plasma membrane integrity and acrosome reaction were evaluated through the combination of fluorescent dyes (propidium iodide and FITC-PNA).In the ETM analysis, sperm cells ultrastructural damage were not observed after exposure to the MF. The uptake of nanoparticles by the spermatozoa was also not observed in any group treated with MF. Thus, the MF containing maghemite nanoparticles coated with DMSA can be used in semen in order to improve the assisted reproduction techniques, since there is no change in sperm function and structure under the conditions tested.
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Produção in vitro de embriões : cultivo de embriões pós-eclosão e criopreservação de meios prontos para uso

Brandão, Daniela Oliveira 26 October 2006 (has links)
Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Biologia Celular, 2006. / Submitted by Diogo Trindade Fóis (diogo_fois@hotmail.com) on 2009-11-03T11:20:58Z No. of bitstreams: 1 2006_Daniela Oliveira Brandao.pdf: 802866 bytes, checksum: b6d64ec9d9889cfa0f753bbc6743fa44 (MD5) / Approved for entry into archive by Luanna Maia(luanna@bce.unb.br) on 2009-11-09T12:25:32Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2006_Daniela Oliveira Brandao.pdf: 802866 bytes, checksum: b6d64ec9d9889cfa0f753bbc6743fa44 (MD5) / Made available in DSpace on 2009-11-09T12:25:32Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2006_Daniela Oliveira Brandao.pdf: 802866 bytes, checksum: b6d64ec9d9889cfa0f753bbc6743fa44 (MD5) Previous issue date: 2006-10-26 / Taxas de blastocisto aceitáveis são obtidas com os sistemas atuais de produção in vitro de embriões. Entretanto, o elevado índice de reabsorção embrionária e descontinuidade de gestação, bem como as variações dos resultados obtidos, diminuem de forma significativa a eficiência da técnica. Na tentativa de minimizar estes dois fatores foi focado nesta tese o desenvolvimento de novas formas de monitoramento dos embriões e simplificação da rotina diária. O primeiro trabalho, desenvolvido para o monitoramento do desenvolvimento embrionário, procura aprofundar o entendimento das perdas embrionárias no período de reconhecimento materno da gestação. Apesar de inúmeras investigações do desenvolvimento e caracterização embrionárias serem constantemente realizadas, estas estão restritas ao embrião até 7 dias de vida ou à gestação avançada. A maioria dos problemas, no entanto, está concentrada no período de reconhecimento materno, seguido da implantação no endométrio, sendo imprescindível a criação de métodos práticos e confiáveis que permitam o monitoramento do desenvolvimento embrionário pós-eclosão. Diante dessa necessidade, foi estabelecido um sistema de cultivo in vitro de embriões bovinos no período pós-eclosão denominado sistema PHD (post hatching development). Nele, embriões produzidos in vitro foram cultivados em túneis de gel de agarose em meio de cultivo modificado e os dados obtidos revelaram que o sistema de cultivo foi capaz de sustentar a diferenciação celular do embrião em trofoblasto, hipoblasto e epiblasto, inclusive com a formação da camada de Rauber, definindo assim o disco embrionário. Este sistema de cultivo representa o primeiro modelo experimental capaz de promover crescimento e diferenciação pós-eclosão in vitro, podendo ser utilizado com sucesso para monitorar o efeito tardio de tratamentos utilizados no sistema de cultivo. Dados preliminares de seu uso para monitorar substâncias tóxicas e expressão gênica foram obtidos e estão relacionados no corpo desta Tese. Adicionalmente ao sistema PHD, um segundo trabalho focou a simplificação e maior padronização da rotina da produção in vitro de embriões, sugerindo para isto, o congelamento e estoque de meios de cultivo prontos para uso. Os resultados obtidos com meios congelados em dois sistemas distintos de produção in vitro (DIAS-Dinamarca e Embrapa- Brasil), mostraram ser possível a produção de embriões em meios previamente congelados, sem que haja prejuízo nas taxas de blastocisto alcançadas. Além de facilitar a laboriosa rotina de produção de meios de cultivo, seu congelamento e estoque permitiram a existência de padronização entre manipulações, dado que a partida dos meios de cultivo utilizados é sempre a mesma. Em conclusão, os dois trabalhos desenvolvidos nesta Tese, um de contribuição científica e o outro aplicado, procuram contribuir em áreas pouco exploradas e deixam claro que existem lacunas a serem investigadas para melhoria dos sistemas atuais da produção in vitro de embriões. ________________________________________________________________________________ ABSTRACT / Acceptable blastocyst rates are obtained with the actual systems of in vitro embryo production. However, the high rate of embryonic death and gestation interruption, as much as the broad variation in the obtained results, reduce significantly the technique efficiency. In a trial to minimize both factors, this thesis has focused on developing new monitoring systems and routine work simplification. The first work was developed for monitoring embryo development, in an effort to understand embryos loss in the maternal recognition of pregnancy period. Although several investigations have been focused in embryo development and characterization, these are restricted to the embryo up to 7 days, or to the late gestation. However, most of the problems are concentrated in the maternal recognition period, followed by endometrium implantation, so it is fundamental to create practical and trustable methods for monitoring the post-hatching embryo development. Considering this necessity, a post-hatching culture system denominated PHD (Post Hatching Development) system was established. In this system, in vitro produced embryos were cultured in agarose gel tunnels under a modified culture medium and the obtained data revealed that it was capable to sustain embryonic cell differentiation in trophoblast, hypoblast and epiblast, including the Rauber´s layer formation, defining the embryonic disc. This represents the first complete experimental model to promote rapid growing and post-hatching differentiation in vitro, able to be successfully used to monitor the late effect of treatments in the culture system. Preliminary data of its use to monitor toxic substances and gene expression were obtained and are described in this thesis. Additionally to the PHD system, a second work focused on the simplification and pattern of in vitro embryo production. For that, we suggested the freezing and stocking of ready-to-use medium. The results obtained in two different systems (DIAS-Dinamarca and Embrapa- Brasil) have shown that it is possible to produce embryos in previously frozen medium without affecting embryo rates. Besides facilitating the laborious routine of medium production, freezing aliquots has allowed to create a pattern among different manipulations, considering that the medium batch was always the same. In conclusion, both works developed in this thesis, one more scientific and the other more applied, try to contribute in non explored areas and clearly show that there are gaps to be investigated for enhancing the results in in vitro embryo production.
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Gene expression and proteomic analysis underlying adipogenesis in livestock / Expressão gênica e análise proteômica envolvidas na adipogênese em animais de produção

Campos, Carolina Filardi de 18 July 2016 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-02-13T14:24:38Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 829966 bytes, checksum: a8d60c6e89fcd3f90f9b32b2ba74816d (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-13T14:24:38Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 829966 bytes, checksum: a8d60c6e89fcd3f90f9b32b2ba74816d (MD5) Previous issue date: 2016-07-18 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Marmoreio ou gordura intramuscular (IMF) é um componente importante da produção animal, já que é um dos principais fatores para a qualidade de carne. IMF é alcançada pela adipogênese, processo de proliferação e diferenciação de pré-adipócitos, e pela lipogênese, com a assimilação subsequente de lipídeos. A compreensão dos eventos que ocorrem durante a diferenciação de pré-adipócitos tem avançado consideravelmente nos últimos anos e baseou-se principalmente no uso de cultura de tecidos. Os modelos animais podem ser utilizados não apenas para a melhor compreensão da deposição de gordura, mas também como modelos para maior compreensão sobre os mecanismos moleculares subjacentes a determinadas condições humanas. Além disso, a diferenciação em adipócitos tem muitas implicações para doenças em humanos. É sabido que esta diferenciação envolve uma cascata transcricional, de modo que o presente estudo proporciona conhecimento sobre genes e fatores de transcrição utilizando a técnica de RT-qPCR, envolvidos na diferenciação de pré-adipócitos em adipócitos maduros comparando duas raças divergentes de suínos. Os resultados mostram que alguns genes são diferencialmente expressos entre a linhagem comercial e a raça Piau. Além disso, um estudo de expressão gênica e um estudo proteômico são fornecidos revelando os efeitos da vitamina A sobre a adipogênese em bovinos, revelando efeito negativo sobre a adipogênese. Assim, destacamos a importância da expressão gênica e dos estudos proteômicos para aumentar a compreensão dos mecanismos moleculares envolvidos na adipogênese. / Marbling or intramuscular fat (IMF) is an important component of livestock production, as it is a major factor in the overall meat quality. IMF is achieved by adipogenesis, the process of proliferation and differentiation of preadipocytes, and lipogenesis, with the subsequent assimilation of lipid. The understanding of events that occur during preadipocyte differentiation has advanced considerably in the last few years and has relied mainly on the use of tissue culture models of adipogenesis. Animal models can be used not only for a better understanding of fat deposition in livestock, but also as models to an increased comprehension on molecular mechanisms behind human conditions. Furthermore, adipocyte differentiation has many implications for human disease conditions. It is well known that this differentiation involves a transcriptional cascade, so the present study provided knowledge about genes and transcription factors using RT-qPCR technique, involved in differentiation of preadipocytes into mature adipocytes comparing two divergent pig breeds. The results show us that some genes are differentially expressed between commercial line and Piau breed. Moreover a gene expression and a proteomic study are provided revealing the effects of vitamin A on adipogenesis in cattle, revealing the negative effect on adipogenesis. Thereby, we highlighted the importance of gene expression and proteomic studies to increase the understanding of molecular mechanisms underlying adipogenesis.
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Influência do método de separação dos espermatozóides viáveis (swim-up) na eficiência de seleção do sexo de bovinos por gradiente descontínuo de densidade e o impacto no melhoramento genético animal

Lucio, Aline Costa de [UNESP] 31 July 2007 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:07Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2007-07-31Bitstream added on 2014-06-13T19:33:22Z : No. of bitstreams: 1 lucio_ac_me_jabo.pdf: 498660 bytes, checksum: f8a6a9a504926a49d1926ba32ce8e61e (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Universidade Estadual Paulista (UNESP) / A produção de doses de sêmen, enriquecidas com espermatozóides portadores do cromossomo X ou Y, aumentará a contribuição da inseminação artificial para: o incremento do progresso genético, produtividade e retorno econômico nas atividades pecuárias, e para a prevenção de doenças ligadas ao cromossomo X, na espécie humana. Constituiu objetivo do presente trabalho: aplicar o método de “swim-up” associado à centrifugação em gradiente descontínuo de densidade para produzir amostras de sêmen enriquecidas com espermatozóides portadores do cromossomo X, em bovinos. Após os tratamentos, os espermatozóides foram submetidos ao controle de qualidade pela avaliação da integridade acrossomal e taxas de produção de embriões in vitro. A validação dos resultados foi feita pela análise da proporção sexual dos embriões produzidos in vitro através da amplificação de uma seqüência específica do cromossomo Y presente no genoma bovino. Após a análise dos resultados observouse que não houve diferença significativa (P>0,05) no desvio da proporção sexual quando comparamos o grupo controle (45,20% de fêmeas) com os procedimentos de separação de espermatozóides (60,65% de fêmeas, em média). Os métodos de separação de espermatozóides, não prejudicaram a fertilidade dos espermatozóides (taxas de clivagem e blastocistos, em média, de 70% e 26% respectivamente). Este pode ser considerado um procedimento a ser utilizado na PIV de embriões bovinos. / The production of doses of semen enriched with X- and Y- bearing spermatozoa will increase the artificial insemination contribution for genetic progress, productivity and economic return in livestock production and prevention of diseases connected to X chromosome, in humans. The purpose of this work was associated the modified swimup method with the centrifugation in density gradient for separation of X-bearing spermatozoa. Quality control of centrifuged spermatozoa were evaluated by acrosomal integrity and in vitro embryo production. The results were validated by sex proportion of in vitro produced embryos using PCR by Y- specific sequences present in bovine male genomic DNA. After the determination of genetic sex of in vitro produced embryos, the results showed no statistical difference (P>0.05) on deviation of sex ratio when the control group (45.20% female) was compare with the others spermatozoa selection procedures (60.65% female). The spermatozoa selection methods didn’t impair fertility of X-bearing spermatozoa (cleavage and blastocyst rates: 70% and 26%, respectively) and would be considered methods of relevance to be introduced on in vitro produced embryos programs.
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Influência do método de separação dos espermatozóides viáveis ("swim-up") na eficiência de seleção do sexo de bovinos por gradiente descontínuo de densidade e o impacto no melhoramento genético animal /

Lucio, Aline Costa de January 2007 (has links)
Resumo: A produção de doses de sêmen, enriquecidas com espermatozóides portadores do cromossomo X ou Y, aumentará a contribuição da inseminação artificial para: o incremento do progresso genético, produtividade e retorno econômico nas atividades pecuárias, e para a prevenção de doenças ligadas ao cromossomo X, na espécie humana. Constituiu objetivo do presente trabalho: aplicar o método de "swim-up" associado à centrifugação em gradiente descontínuo de densidade para produzir amostras de sêmen enriquecidas com espermatozóides portadores do cromossomo X, em bovinos. Após os tratamentos, os espermatozóides foram submetidos ao controle de qualidade pela avaliação da integridade acrossomal e taxas de produção de embriões in vitro. A validação dos resultados foi feita pela análise da proporção sexual dos embriões produzidos in vitro através da amplificação de uma seqüência específica do cromossomo Y presente no genoma bovino. Após a análise dos resultados observouse que não houve diferença significativa (P>0,05) no desvio da proporção sexual quando comparamos o grupo controle (45,20% de fêmeas) com os procedimentos de separação de espermatozóides (60,65% de fêmeas, em média). Os métodos de separação de espermatozóides, não prejudicaram a fertilidade dos espermatozóides (taxas de clivagem e blastocistos, em média, de 70% e 26% respectivamente). Este pode ser considerado um procedimento a ser utilizado na PIV de embriões bovinos. / Abstract: The production of doses of semen enriched with X- and Y- bearing spermatozoa will increase the artificial insemination contribution for genetic progress, productivity and economic return in livestock production and prevention of diseases connected to X chromosome, in humans. The purpose of this work was associated the modified swimup method with the centrifugation in density gradient for separation of X-bearing spermatozoa. Quality control of centrifuged spermatozoa were evaluated by acrosomal integrity and in vitro embryo production. The results were validated by sex proportion of in vitro produced embryos using PCR by Y- specific sequences present in bovine male genomic DNA. After the determination of genetic sex of in vitro produced embryos, the results showed no statistical difference (P>0.05) on deviation of sex ratio when the control group (45.20% female) was compare with the others spermatozoa selection procedures (60.65% female). The spermatozoa selection methods didn't impair fertility of X-bearing spermatozoa (cleavage and blastocyst rates: 70% and 26%, respectively) and would be considered methods of relevance to be introduced on in vitro produced embryos programs. / Orientador: Vera Fernanda Martins Hossepian de Lima / Coorientador: Lúcia Galvão de Albuquerque / Coorientador: Francisco Antonio Techiatti Fazano / Banca: Humberto Tonhati / Banca: Gisele Zoccal Mingoti / Mestre
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Modelos não lineares mistos na análise de curvas de crescimento de bovinos da raça Tabapuã / Nonlinear mixed models in the analysis of growth curves of cattle breed Tabapuã

Pereira, Nayara Negrão 21 February 2014 (has links)
Made available in DSpace on 2015-03-26T13:32:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 434501 bytes, checksum: 0ab5e3021a0cbd11c8c868f09b269488 (MD5) Previous issue date: 2014-02-21 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The analysis of growth curves of animals has been widely used to increase the efficiency of beef cattle ranching. Related to growth curves with nonlinear mixed models strategic, studies have strategic applications in genetic improving programs in defining selection criteria for earliness and weight gain, aimed at, that for each individual is estimated a random coefficient, facilitating identification and selection of more efficient animals based on the coefficients. This methodology considers the variability between and within individuals. The objective of this study was to evaluate the efficiency of the adjustment of growth curves by nonlinear mixed models. Nonlinear models, Michaelis-Menten Modified, Logistic, von Bertalanffy, Gompertz, Richards and Brody, were fitted, with and without the incorporation of random effects for analysis of growth in beef cattle Tabapuã race. For comparison between fixed and mixed models were used the following adjustment quality evaluators: Akaike s information criterion (AIC), Bayesian information criterion (BIC), mean absolute deviation (DMA), mean square error (MSE) and coefficient of determination (R2). The use of nonlinear mixed model was efficient to describe bovine growth curves. / A análise de curvas de crescimento de animais tem sido muito utilizada para aumentar a eficiência da pecuária de corte. Estudos relacionados a curvas de crescimento com modelos não lineares mistos podem ter aplicações estratégicas em programas de melhoramento genético na definição de critérios de seleção para precocidade e ganho de peso, tendo em vista, que para cada indivíduo é estimado um coeficiente aleatório, facilitando a identificação e seleção de animais mais eficientes com base nos coeficientes. Essa metodologia considera a variabilidade entre e dentro de indivíduos. O objetivo deste trabalho foi avaliar a eficiência do ajuste de curvas de crescimento através de modelos não lineares mistos. Foram ajustados os modelos não lineares Michaelis-Menten Modificado, Logístico, von Bertalanffy, Gompertz, Richards e Brody, com e sem a incorporação de efeitos aleatórios para análise de curva de crescimento de bovinos de corte da raça Tabapuã. Para comparação entre modelos fixos e mistos foram utilizados os seguintes avaliadores de qualidade de ajuste: critério de informação de Akaike (AIC), critério de informação bayesiano (BIC), desvio médio absoluto (DMA), erro quadrático médio (EQM) e coeficiente de determinação (R2). A utilização de modelos não lineares mistos foi eficiente para descrever curvas de crescimento de bovinos.
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A Importância da qualidade da informação na predição de valores genéticos para características de crescimento em bovinos da raça nelore

Pereira, Cristiane de Fátima 01 September 2014 (has links)
The objective of this study was to evaluate the influence of information quality in the prediction of genetic values for the Nellore cattle\'s growth traits. The information regarding the Nellore cattle from four farms participating in a program of the Brazilian National Association of Breeders and Researchers (ANCP, acronym in portuguese), named Nellore Brasil, is corresponding to the years 2012 and 2013. The selected farms are certified by the ANCP for quality of zootechnical information, having received the association\'s seal of approval, Global G1. Field data such as batch or management group were considered an assessment criteria, and the growth traits related to the body weight at 120 (W120), 210 (W210), 365 (W365) and 450 (W450) days were evaluated under different scenarios of information quality: inclusion of all management lot information and random inclusion of management lot information in 90%, 70%, 50%, 30% and absence of information on management lots. During the scrutiny of different scenarios of management lot information for the genetic evaluation of growth traits, it was found that there were changes in the file structure for genetic evaluation, after the statistical treatment of the data. The contemporary group experienced changes in the number of animals due to the poor quality of information. Changes were observed in all the (co)variance components and genetic parameters compared to those obtained by the scenario used as a reference. Concerning growth traits, there was an increase in the estimates of heritability and the additive genetic variance in as far as the number of information about management lots decreased. Due to the change in contemporary groups in the absence of information on management lots, the results obtained in genetic analyzes\' were biased, reaching overestimated breeding values, which can be misleading as to the choice of animals. With respect to the average of predicted breeding values, it was found that for the maternal additive genetic effects of the body weight at 120 and 210 days of age, the change in the information quality interfered negatively, leading to reduction of average breeding values of the herds evaluated. When evaluating correlations or Spearman rank breeding values obtained from data with information quality (scenario), in three groups of accuracy of breeding values compared to those obtained in different scenarios of the inclusion of information, in different proportions, it was found that there was a change in the animal classification for growth traits. / Objetivou-se com este trabalho avaliar a influência da qualidade da informação na predição de valores genéticos para as características de crescimento em bovinos da raça Nelore. Foram utilizadas informações de bovinos da raça Nelore provenientes de fazendas participantes do Programa Nelore Brasil da Associação Nacional de Criadores e Pesquisadores (ANCP), correspondentes aos anos de 2012 a 2013. As fazendas selecionadas são certificadas quanto à qualidade da informação zootécnica, possuindo o selo Global G1. Considerou-se como critério de avaliação dados de campo, como lote ou grupo de manejo, sendo analisadas características de crescimento relacionadas aos pesos padronizados aos 120 (P120), 210 (P210), 365 (P365) e 450 (P450) dias de idade, avaliadas sob diferentes cenários de qualidade da informação: inclusão de todas as informações de lote de manejo; inclusão aleatória das informações de lote de manejo em 90%, 70%, 50%, 30% e dados sem a informação do lote de manejo dos animais com medidas fenotípicas. Ao considerar os diferentes cenários das informações de lotes de manejo para a avaliação genética das características de crescimento, verificou-se que houve alterações na estrutura dos arquivos para avaliação genética, após o tratamento estatístico dos dados. O grupo de contemporâneo sofreu alterações no número dos animais em decorrência da pouca qualidade da informação. Observou-se alterações em todos os componentes de (co)variância e parâmetros genéticos, quando comparados aos obtidos pelo cenário utilizado como referência. Para as características de crescimento houve aumento nas estimativas de herdabilidade e nas variâncias genéticas aditivas à medida que se reduziu o número de informações sobre os lotes de manejo. Devido à alteração nos grupos contemporâneos na ausência de informações sobre os lotes de manejo, foram obtidos resultados viesados nas análises genéticas, atingindo valores genéticos superestimados, que podem levar a enganos quanto à escolha dos animais. Ao avaliar as correlações de posto ou Spearman dos valores genéticos obtidos a partir de dados com qualidade na informação (cenário REF), em três grupos de acurácia dos valores genéticos, comparados aos obtidos nos diferentes cenários de inclusão das informações de lotes de manejo houve alteração na classificação dos animais para as características de crescimento avaliadas. / Mestre em Ciências Veterinárias
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Avaliação genética de bovinos Nelore para pesos até a desmama sob modelos com diferentes estruturas de grupos de contemporâneos / Genetic evaluation of Nelore cattle for weights before weaning using different comtemporany groups structures

PÁSCOA, Lillian 08 July 2011 (has links)
Made available in DSpace on 2014-07-29T15:13:44Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Tese Lillian Pascoa.pdf: 1515217 bytes, checksum: 2cddf8e0acaa3cd41225727107c6f820 (MD5) Previous issue date: 2011-07-08 / Data from 72,731 Nelore calves were used to estimate (co)variances and predict breeding values for actual and adjusted weight for 120 and 210 days of age using different contemporary group structures. Males and females calves born from 1985 to 2005 belonging to 40 herds participating in the Nelore Brasil Program were analysed. Ten models were used including five different contemporary group (GC) structures, judged by coefficient of determination, residual variance and by the Akaike (AIC), Bayesian (BIC) and modified Akaike (CAIC) information criteria. The GLM procedure of SAS was used to carry out the analyses. All effects in the model were significant (P<0.001) for the traits analyzed. The inclusion of semester or trimester of birth in the composition of GC was more appropriate than when it was estimated independently as this took into account interactions with the other effects in the GC. Sex of calf (SB) and age of cow at calving (CIVP) had similar effects across models suggesting independence from other effects in these models. In all models, the effect of age of the calf was greater than the other effects tested. The use of actual weights in models without SB in GC allowed for better genetic connectivity between GC, and higher accuracy in the genetic evaluations. The estimates of (co)variance and genetic parameters were similar among models but the information criteria (BIC, CAIC) indicated that the most adequate model considered GC as a random effect, constituted by the effects of herd, year of birth, management group and the effect of trimester of birth with the effect of calf sex independent from GC. For each model animals were classified by their genetic value (VG), subdivided into categories (animals without progeny, bulls and cows). For both weights (actual and adjusted) VG were similar considering contemporary group as fixed or random, with sex included or not in its composition and with greater differences between models with actual and adjusted weights. Accuracy was similar among compared models within each category, bulls having more accurate VG predictions than cows. Spearman correlation coefficients for animal rank using direct and maternal VGs and simple (Pearson) correlations for accuracies among different models were all high and significant (P<0.001) with the greatest difference observed comparing models with actual and adjusted weights. For bulls, the classification of individuals with actual weights in models with random GC was more adequate. Removal of animals without adjusted weights or in contemporary groups with less than five individuals would lead to the elimination of animals which would contribute to the genetic gain in the population. / Com o objetivo de estimar (co)variâncias e predizer valores genéticos de pesos reais e padronizados aos 120 e 210 dias de idade sob modelos com diferentes estruturas de grupos de contemporâneos, analisaram-se dados de 72.731 bezerros Nelore, machos e fêmeas, nascidos de 1985 a 2005, em 40 rebanhos integrantes do Programa Nelore Brasil da ANCP. Foram comparados 10 modelos incluindo cinco diferentes estruturas de grupos de contemporâneos (GC), julgados pelo coeficiente de determinação, variância residual e pelos critérios de informação de Akaike (AIC), Bayesiano (BIC) e modificado de Akaike (CAIC). O procedimento GLM do SAS foi utilizado para as análises. Todos os efeitos incluídos nos modelos foram significativos (P<0,001) para as características analisadas. A inclusão do efeito do semestre ou trimestre de nascimento na composição dos GC resultou mais apropriada que sua estimativa independente por levar em conta as interações com os demais efeitos no GC. Os efeitos de sexo do bezerro (SB) e idade da vaca ao parto (CIVP) mostraram-se estáveis nos modelos, indicando independência dos demais efeitos. Em todos os modelos, a contribuição do efeito de idade do bezerro foi maior em relação aos demais efeitos testados. O uso de pesos reais sob modelos sem o efeito SB no GC constitui alternativas que permitiriam melhor conexidade genética entre GC, e maior acurácia das avaliações genéticas. As estimativas de (co)variâncias e parâmetros genéticos foram similares entre os modelos, porém os critérios de informação (BIC, CAIC) indicaram que o modelo mais adequado foi o que considerou o grupo de contemporâneos como efeito aleatório, sendo este constituído pela concatenação dos efeitos de rebanho, ano de nascimento, grupo de manejo e efeito de trimestre de nascimento, e com efeito do sexo do bezerro independente do GC. Para cada modelo os animais foram classificados por seus valores genéticos (VG), subdivididos por categorias (animais sem progênie, touros e vacas). Para ambos os pesos, reais e padronizados, os VG foram semelhantes entre os modelos com grupo de contemporâneos fixo ou aleatório, incluindo ou não sexo em sua composição e com diferenças maiores de VG entre modelos com pesos reais ou padronizados. As magnitudes dos valores de acurácia entre os modelos comparados foram similares dentro de cada categoria, sendo que os touros apresentaram predições de VG mais acuradas e as vacas menos. Os coeficientes de correlação de posto na classificação dos animais pelos seus VG diretos e maternais e de correlação simples para valores de acurácia por diferentes modelos foram todos altos e significativos (P<0,001) e maior diferença foi observada entre a comparação de modelos com pesos reais ou padronizados. Para touros, a classificação dos indivíduos que possuem pesos reais em modelos com GC aleatório foram mais adequadas. Desconsiderar das análises animais sem pesos padronizados ou pertencentes a grupos de contemporâneos com menos de cinco indivíduos, promove a exclusão de animais que contribuem para o ganho genético da população.

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