Made available in DSpace on 2014-06-11T19:27:42Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2007-06-22Bitstream added on 2014-06-13T20:17:01Z : No. of bitstreams: 1 polizelneto_a_me_botfmvz.pdf: 213763 bytes, checksum: ec04bafe3cb210da97cdba073aab26e1 (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Universidade Estadual Paulista (UNESP) / O presente trabalho objetivou avaliar o efeito da suplementação mineral protéica com adição de cromo orgânico no desempenho produtivo, com avaliações de carcaça por meio de ultra-som, e na qualidade da carne de bovinos terminados em regime de pastagem. Foram utilizados 18 Nelore e 18 F1 Brangus x Nelore castrados, com idade inicial de 16 meses e abatidos aos 22 meses, distribuídos igualmente em dois tratamentos de suplementação mineral protéica com e sem adição de cromo orgânico. Não se observou diferença entre grupos genéticos quanto ao ganho peso vivo, entretanto animais suplementados com cromo apresentaram maior ganho (494 g/animal/dia) que os animais controle (420 g/animal/dia). Não se observou diferenças entre os tratamentos experimentais quanto à área de olho de lombo, espessura de gordura subcutânea do dorso e da garupa, tomados por meio do ultrasom, obtendo-se respectivamente valores médios finais de 63,42 cm2, 5,46 mm e 5,58 mm. Foi observado um peso médio de carcaça quente de 235,01 kg e rendimento médio de carcaça quente de 52,09%, com superioridade do tratamento cromo (238 kg e 52,9%) frente ao controle (231 kg e 51,2%), e sem diferença entre os grupos genéticos; e obtenção de carne de qualidade em todos os tratamentos experimentais estudados. Os Nelore e F1 Brangus x Nelore apresentam potencial similar de produção de carne de qualidade a pasto, e que a suplementação mineral protéica com adição de cromo orgânico incrementa o ganho de peso e o rendimento de carcaça, não influenciando nos parâmetros qualitativos avaliados da carne. / The present work aimed to evaluate the effect of mineral protein supplementation with organic chromium addition on productive performance, with carcass evaluations by means of ultrasound measures, and beef quality in steers finished on pasture system. For this, 18 Nellore and 18 F1 Brangus x Nellore steers were used, with 16 months of average initial age and sloughed at 22 months, distributed equally in two treatment of mineral protein supplementation with and without organic chromium addition. There was no observed difference between genetic groups regarding average daily gain (ADG). On the other hand, animals supplied with chromium showed better ADG (494 g) than control animals (420 g). Once again, there was no observed difference among experimental treatments regarding rib eye area, subcutaneous fat thickness at the back and at the rump, measured by ultrasound, reaching final mean values of 63,42 cm2, 5,46 mm e 5,58 mm, respectively. It was observed an average of 235.01 kg for hot carcass weight and 52.09% for average carcass yield, with a superiority for the chromium treatment (238 kg and 52.9%) versus control (231 kg and 51.2%), and without difference between genetic groups; also obtained quality beef in every experimental treatment evaluated. The Nellore e F1 Brangus x Nellore steers show equal production potential of the quality beef on pasture, and that mineral protein supplementation with organic chromium increase the weight gain and carcass yield, not influencing the evaluated beef quality parameters.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:29:32Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-01-31Bitstream added on 2014-06-13T19:38:38Z : No. of bitstreams: 1 matos_avr_me_botfmvz.pdf: 605553 bytes, checksum: 8e2ed75543eaa220ad6547f720052fb2 (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / O tecido muscular de animais sadios é considerado estéril, livre de contaminação por qualquer micro-organismo. Após o abate, a carne passa a apresentar uma microbiota bastante variável, e sujeita a contaminações. Muitos desses micro-organismos são constituintes naturais da microbiota intestinal de bovinos, e procedimentos não adequados na linha de abate podem determinar rupturas de alças intestinais e contaminação das carcaças. Foram colhidas amostras de 100 carcaças em um frigorífico exportador, localizado no interior do Estado de São Paulo, amostradas ao longo de um ano através do método de esponjas, aplicado na região do peito do animal. As amostras foram colhidas em três pontos, denominados A, B e C, sendo cada carcaça amostrada nos três pontos, localizados nas etapas: pós sangria (A); pós esfola (B) e pós lavagem (C). Foram realizadas pesquisas de Listeria sp., E. coli O157, Salmonella spp. e Micro-organismos Indicadores (Petrifilms® AC, EC e EB). Não foram isolados Listeria ou E. coli O157 em nenhuma das 300 amostras. Salmonella spp. foi isolada em 9, sendo oito no ponto A e uma no ponto B. Para Mesófilos, as contagens variaram de 0 a 6,8 log UFC/cm2 , para Coliformes totais, de 0 a 4,57 log UFC/cm2 e para E. coli de 0 a 4,38 log UFC/cm2. Diante dos resultados obtidos, e em comparação com a literatura, conclui-se que o estabelecimento estudado apresenta qualidade, tanto sanitária (devido às baixas prevalências dos patógenos) quanto higiênica (devido à acentuada diminuição da carga microbiana de indicadores ao longo da linha) / The muscle tissue of healthy animals is considered sterile, free of any contamination by micro-organism. After slaughter, the meat begins to show a microbiota quite variable and subject to contamination. Many of these micro-organisms are natural constituents of the intestinal tract of cattle, and procedures not appropriate on the slaughter line may determine rupture of the bowel and contamination of carcasses. Samples were collected from 100 carcasses in a slaughterhouse exporter, located within the State of São Paulo, sampled over a year by the sponge method, applied to the chest of the animal. Samples were taken at three points, called A, B and C, each carcass sampled at three points located in steps: after bleeding (A) after skinning (B) and after washing (C). Research was conducted of Listeria sp., E. coli O157, Salmonella spp. and Micro-organism (Petrifilms ® AC, EC and EB). Does not were isolated Listeria or E. coli O157 in any of the 300 samples. Salmonella spp. was isolated in nine, eight at point A and one at point B. To Mesophiles, scores ranged from 0 to 6.8 log UFC/cm2; for Total coliforms, 0 to 4.57 log UFC/cm2 and E. coli from 0 to 4.38 log UFC/cm2. With the results obtained and compared with the literature, it is concluded that the establishment in study has both quality sanitary (due to the low prevalence of pathogens) as hygienic quality (due to the sharp decrease in the microbial load of indicators along the line

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:29:32Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2005Bitstream added on 2014-06-13T18:39:11Z : No. of bitstreams: 1 moscardijr_e_me_botfmvz.pdf: 201670 bytes, checksum: 2eb14d48653faede9c3f3d6f4b381325 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Sessenta novilhos com seis meses de vida foram acompanhados durante um período de confinamento com o objetivo de se determinar a prevalência de Salmonella spp. durante a fase de engorda e também na etapa de abate. Os trabalhos foram desenvolvidos na Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia da UNESP, Botucatu, SP. Durante os seis meses de confinamento foram analisadas: 15 amostras das instalações pré-chegada dos lotes, 1 amostra de insetos, 1 amostra de conteúdo intestinal de um roedor, 10 de fezes de conjunto obtidas 24 h após a chegada de cada grupo animal, 83 de alimentos e água de dessedentação, 322 de fezes individuais coletadas da ampola retal de cada novilho, 60 amostras de carcaças obtidas na indústria frigorífica após o abate e 30 amostras do ambiente frigorífico (paredes, instalações, instrumentais). Isolou-se Salmonella spp. de amostras de dois alimentos (caroço de algodão e concentrado – 2/83, 2,4%), de amostras de fezes individuais de quatro animais (4/232, 1,3%) e de duas carcaças (2/60, 2,33%). Foram identificados dois sorotipos: Salmonella Mbandaka (caroço de algodão) e Salmonella Tennessee (concentrado, fezes individuais e carcaças). Conclui-se que a prevalência do patógeno durante o confinamento bem como nas carcaças abatidas foi baixa, sendo que o encontro de Salmonella em alguns constituintes da ração pode ter se refletido no aparecimento de carcaças contaminadas, por falhas ocorridas durante as operações de abate. / Sixty steers six months old were monitored during a period of feedlot to determine the prevalence of Salmonella spp. during the fattening phases and slaughtering stage. The activities were developed in the Veterinary Medicine and Zootecnist College, UNESP, at Botucatu, SP. During the ten months of feedlot were analyzed: 15 samples of the facilities before the animal loots arrive, 1 sample of the insects, 1 sample of mice intestinal contents, 10 samples of steers mixed feces obtained 24 h after the arrival of each animal group, 83 of feed and drinkable water, 322 of individual feces collected from rectum flask of each steer, 60 samples from bovine carcasses and 30 samples of environment obtained from slaughterhouse (walls, facilities and instrumentals). Salmonella spp. were identified in two samples of feed (cotton seed, protein and mineral mix , 2/83 = 2,4%), samples of individual feces from four animals (4/322 = 1,3%) and from two carcasses (2/60 = 2,33%). Two serotypes were identified: Salmonella Mbandaka (cotton seed) and Salmonella Tennessee (protein and mineral mix, individual feces and carcasses). It follows that the prevalence of the pathogen during the feedlot and in the slaughtered carcasses was low, while the isolation of Salmonella in some ingredients may have influenced the occurrence of contaminated carcasses because of faults occurred during slaughter procedures.

Orientador: José Paes de Almeida Nogueira Pinto / Banca: Jean Guilherme Fernandes Joaquim / Banca: Luciano dos Santos Bersot / Resumo: O tecido muscular de animais sadios é considerado estéril, livre de contaminação por qualquer micro-organismo. Após o abate, a carne passa a apresentar uma microbiota bastante variável, e sujeita a contaminações. Muitos desses micro-organismos são constituintes naturais da microbiota intestinal de bovinos, e procedimentos não adequados na linha de abate podem determinar rupturas de alças intestinais e contaminação das carcaças. Foram colhidas amostras de 100 carcaças em um frigorífico exportador, localizado no interior do Estado de São Paulo, amostradas ao longo de um ano através do método de esponjas, aplicado na região do peito do animal. As amostras foram colhidas em três pontos, denominados A, B e C, sendo cada carcaça amostrada nos três pontos, localizados nas etapas: pós sangria (A); pós esfola (B) e pós lavagem (C). Foram realizadas pesquisas de Listeria sp., E. coli O157, Salmonella spp. e Micro-organismos Indicadores (Petrifilms® AC, EC e EB). Não foram isolados Listeria ou E. coli O157 em nenhuma das 300 amostras. Salmonella spp. foi isolada em 9, sendo oito no ponto A e uma no ponto B. Para Mesófilos, as contagens variaram de 0 a 6,8 log UFC/cm2 , para Coliformes totais, de 0 a 4,57 log UFC/cm2 e para E. coli de 0 a 4,38 log UFC/cm2. Diante dos resultados obtidos, e em comparação com a literatura, conclui-se que o estabelecimento estudado apresenta qualidade, tanto sanitária (devido às baixas prevalências dos patógenos) quanto higiênica (devido à acentuada diminuição da carga microbiana de indicadores ao longo da linha) / Abstract: The muscle tissue of healthy animals is considered sterile, free of any contamination by micro-organism. After slaughter, the meat begins to show a microbiota quite variable and subject to contamination. Many of these micro-organisms are natural constituents of the intestinal tract of cattle, and procedures not appropriate on the slaughter line may determine rupture of the bowel and contamination of carcasses. Samples were collected from 100 carcasses in a slaughterhouse exporter, located within the State of São Paulo, sampled over a year by the sponge method, applied to the chest of the animal. Samples were taken at three points, called A, B and C, each carcass sampled at three points located in steps: after bleeding (A) after skinning (B) and after washing (C). Research was conducted of Listeria sp., E. coli O157, Salmonella spp. and Micro-organism (Petrifilms ® AC, EC and EB). Does not were isolated Listeria or E. coli O157 in any of the 300 samples. Salmonella spp. was isolated in nine, eight at point A and one at point B. To Mesophiles, scores ranged from 0 to 6.8 log UFC/cm2; for Total coliforms, 0 to 4.57 log UFC/cm2 and E. coli from 0 to 4.38 log UFC/cm2. With the results obtained and compared with the literature, it is concluded that the establishment in study has both quality sanitary (due to the low prevalence of pathogens) as hygienic quality (due to the sharp decrease in the microbial load of indicators along the line / Mestre

Orientador : José Paes de Almeida Nogueira Pinto / Resumo: Sessenta novilhos com seis meses de vida foram acompanhados durante um período de confinamento com o objetivo de se determinar a prevalência de Salmonella spp. durante a fase de engorda e também na etapa de abate. Os trabalhos foram desenvolvidos na Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia da UNESP, Botucatu, SP. Durante os seis meses de confinamento foram analisadas: 15 amostras das instalações pré-chegada dos lotes, 1 amostra de insetos, 1 amostra de conteúdo intestinal de um roedor, 10 de fezes de conjunto obtidas 24 h após a chegada de cada grupo animal, 83 de alimentos e água de dessedentação, 322 de fezes individuais coletadas da ampola retal de cada novilho, 60 amostras de carcaças obtidas na indústria frigorífica após o abate e 30 amostras do ambiente frigorífico (paredes, instalações, instrumentais). Isolou-se Salmonella spp. de amostras de dois alimentos (caroço de algodão e concentrado - 2/83, 2,4%), de amostras de fezes individuais de quatro animais (4/232, 1,3%) e de duas carcaças (2/60, 2,33%). Foram identificados dois sorotipos: Salmonella Mbandaka (caroço de algodão) e Salmonella Tennessee (concentrado, fezes individuais e carcaças). Conclui-se que a prevalência do patógeno durante o confinamento bem como nas carcaças abatidas foi baixa, sendo que o encontro de Salmonella em alguns constituintes da ração pode ter se refletido no aparecimento de carcaças contaminadas, por falhas ocorridas durante as operações de abate. / Abstract: Sixty steers six months old were monitored during a period of feedlot to determine the prevalence of Salmonella spp. during the fattening phases and slaughtering stage. The activities were developed in the Veterinary Medicine and Zootecnist College, UNESP, at Botucatu, SP. During the ten months of feedlot were analyzed: 15 samples of the facilities before the animal loots arrive, 1 sample of the insects, 1 sample of mice intestinal contents, 10 samples of steers mixed feces obtained 24 h after the arrival of each animal group, 83 of feed and drinkable water, 322 of individual feces collected from rectum flask of each steer, 60 samples from bovine carcasses and 30 samples of environment obtained from slaughterhouse (walls, facilities and instrumentals). Salmonella spp. were identified in two samples of feed (cotton seed, protein and mineral mix , 2/83 = 2,4%), samples of individual feces from four animals (4/322 = 1,3%) and from two carcasses (2/60 = 2,33%). Two serotypes were identified: Salmonella Mbandaka (cotton seed) and Salmonella Tennessee (protein and mineral mix, individual feces and carcasses). It follows that the prevalence of the pathogen during the feedlot and in the slaughtered carcasses was low, while the isolation of Salmonella in some ingredients may have influenced the occurrence of contaminated carcasses because of faults occurred during slaughter procedures. / Mestre

Resumo: Todas as características de um organismo vivo são controladas pela expressão de genes específicos, e na qualidade da carne não é diferente. O presente estudo teve como objetivo correlacionar a expressão dos genes μ-Calpaína (CALP 1), m-Calpaína (CALP 2), Calpastatina (CAST), Tireoglobulina (TG), Diacilglicerol aciltransferase 1 (DGAT1) e a Leptina (LEP) com a qualidade da carne do Longissimus dorsi em dois grupos genéticos: Nelore (Bos indicus) e Canchim (5/8 de Bos taurus x 3/8 Bos indicus) em dois períodos (carne não maturada e com sete dias de maturação), e utilizá-la como marcador genético. Foram analisados 30 touros jovens, 15 Nelore e 15 Canchim, todos mantidos nas instalações do confinamento experimental da FMVZ-UNESP Botucatu, recebendo a mesma dieta e mesmo manejo. Alcançando peso de 370 kg e espessura de gordura de cobertura de 4 mm, foram abatidos e amostras do músculo Longissimus dorsi foram coletadas para análises de: lipídeos totais (LT), força de cisalhamento (FC), índice de fragmentação miofibrilar (MFI) e análise da expressão gênica por RT-qPCR. Entre as características de qualidade da carne, LT e MFI0 apresentaram diferença entre as raças (P<0,01), sendo MFI0 superior no Canchim e LT no Nelore. Quanto à expressão gênica, as CALPs não mostraram expressão diferencial entre os grupos (P>0,05), assim como DGAT1, TG e LEP. CAST foi mais expresso na raça Nelore (P<0,05). Quanto às correlações, foi observada apenas uma positiva entre DGAT1 e MFI0 (r=0,79, P<0,01) no Canchim. Diante dos resultados, sugere-se que a maior expressão de CAST no Nelore propiciou aos animais uma carne mais dura, quando comparados ao Canchim, e que a expressão gênica não pode ser usada como um marcador genético / Abstract: All the features of a living organism are controlled by the expression of specific genes, and the quality of the meat is no different. The present study was performed to correlate gene expression μ-calpain (CALP 1), m-calpain (CALP 2), calpastatin (CAST), thyroglobulin (TG), Diacylglycerol acyltransferase 1 (DGTA1) and leptin (LEP) with the meat quality of Longissimus dorsi muscle in two genetic groups: Nellore (Bos indicus) and Canchim (5/8 Bos taurus x 3/8 Bos indicus) in two periods, and use it as a genetic marker. We analyzed 30 young bulls, 15 and 15 Canchim Nellore. The animals were kept on the installation of the experimental confinement FMVZ-UNESP-Botucatu, receiving the same diet and management. When reached a weight of approximately 370 kg and a subcutaneous fat thickness of 4 mm, they were slaughtered and samples of the Longissimus dorsi muscle were collected for analysis of the: total lipids (TL), shear force (SF), myofibrillar fragmentation index (MFI) and analysis of gene expression by RT-qPCR. Among the characteristics of meat quality, LT and MFI0 showed differences between breeds (P<0,01), higher MFI0 in Canchim and LT higher in Nellore. Regarding gene expression, the CALPs showed no differential expression between groups (P>0.05), as well as DGAT1, TG, and LEP. CAST was more expressed in Nellore (P<0.05). Regarding the correlation was only observed a positive relationship between DGAT1 and MFI0 (r = 0.79, P <0.01) in Canchim. Considering the results, it is suggested that the increased expression of CAST in Nellore animals led to a tougher meat compared to Canchim, and that gene expression can not be used as a genetic marker / Orientador: Henrique Nunes de Oliveira / Coorientador: Maeli Dal Pai Silva / Banca: Simone Cristina Méo Niciura / Banca: Luiz Arthur de Loyola Chardulo / Mestre

Foi desenvolvido um modelo bioeconômico para calcular valores econômicos para caracteres dos objetivos de seleção em sistemas de produção de ciclo completo e propor índices de seleção econômicos com base nos critérios de seleção utilizado no programa de melhoramento da raça Aberdeen Angus no estado do Rio Grande do Sul. As informações de parâmetros biológicos e econômicos utilizados nos cálculos são provenientes das propriedades, de outros estudos e do programa de melhoramento da raça - PROMEBO. Foram usadas planilhas Excel para o desenvolvimento do modelo. Os valores econômicos foram estimados para os objetivos de seleção de sistemas de produção de ciclo completo, sendo estes o número de bezerros desmamados (NBD) e peso ao abate (PA). Para avaliar o impacto das mudanças no desempenho dos caracteres sobre o lucro total do sistema de produção, os valores iniciais dos caracteres foram aumentados em 1%. Os caracteres são expressos em reais por unidade de mudança no caráter e foram calculados na base vaca/ano. Os valores econômicos para NBD e PA foram respectivamente R$ 6,65 e R$ 1,43. A partir das matrizes de (co)variância genética entre os objetivos e os critérios de seleção foram calculados ponderadores econômicos para os critérios de seleção utilizados no PROMEBO, estes são os seguintes: peso (P) a desmama (D) e ao sobreano (S), conformação (C), precocidade (G) e musculatura (M) a desmama e ao sobreano e perímetro escrotal (PE). Os ponderadores econômicos para PD, CD, GD e MS foram positivos e variarem de 2,61 a 0,62 reais. Para PS, CS, GS, MS e PE os ponderadores variaram de 1,40 a 0,004 reais. O índice de seleção a desmama alocaria 44,77% de ênfase para PD, 14,24% para CD, 30,36% para GD e 10,63% para MD. O índice de sobreano daria ênfase de 77,61% para PS, 4,99% para CS, 11,09% para GS, 6,10% para MD e 0,22% para PE. O caráter que mais impactou economicamente o sistema de produção de ciclo completo usando pastagem foi o reprodutivo, NBD, já o PA teve importância econômica positiva no sistema de produção, indicando que a seleção para esses caracteres aumentará a lucratividade do sistema. Os ponderadores econômicos para os caracteres ponderais e escores visuais de C, P e M e PE foram positivos indicando que esses caracteres podem ser usados na seleção dos animais que irão contribuir para incrementar a lucratividade do sistema de produção. / We developed a bio-economic model to estimate economic values for traits of breeding goals in production systems and propose full cycle economic selection indexes based on the criteria selection used in the breeding program Aberdeen Angus breed in the state of Rio Grande do Sul. Biological and economics information parameters used in the calculations are derived from the properties of other studies and the breeding program of the breed - PROMEBO. Excel spreadsheets were used for model development. Economic values were estimated for the purposes of selection of complete cycle systems production, the number of weaned calves (NCW) and slaughter weight (SW). In order to assess the impact of changes in the performance of the characters on the overall profitability of the production system, the initial values of the characters were increased by 1%. The characters are expressed in Real(R$) per unit change in character, and were based on cow / year. The economic values for NCW and SW were respectively R$ 6,65 and R$ 1,43. From the matrix of (co)variance components, between the objectives and the criteria of selection, we have calculated economic weights for selection criteria used in PROMEBO as the following: weight (W) weaning (W) and yearling (Y), conformation (C), precocity (P) and muscle (M) and weaning and yearling scrotal circumference (SC). The economic weights for WW, CW, PW and MW were positive and ranged from 2,61 to 0,62 reais. PY, CY, GY, MY and SC the weight ranged from 1,40 to 0,004 reais. The weaning selection index allocates 44.77% of emphasis for PW, 14.24% for CW, 30.36% to 10.63% for GW and MW. The index for yearling give emphasis 77.61% for PY, 4.99% for CY, 11.09% for GY, 6.10% to 0.22% for MY and SC. The character that most impacted economically production system complete cycle using grazing was the reproductive NCW. The SW had positive economic importance in the production system, indicating that selection for these characters increase the profitability of the system. The economic weights for traits and visual scores by weight for C, P and M and SC were positive, indicating that these characters can be used in the selection of animals that will contribute to increase the profitability of the production system.

Avanços na área da genômica têm propiciado a inclusão da informação genômica no melhoramento genético animal. O sucesso de sua utilização depende da extensão do desequilíbrio de ligação (DL) entre marcadores e QTL, do número de animais genotipados no grupo de treinamento (GT) e da h2 da característica. O conhecimento de parâmetros de diversidade genética tais como endogamia e tamanho efetivo da população (Ne), associados ao aumento dos níveis de DL, são úteis no estudo da viabilidade da seleção genômica. Com o objetivo de estimar estes parâmetros em uma população de gado de corte, bovinos Nelore foram estudados através de uma análise de pedigree. O Ne estimado foi de 114, 245 e 101 para os anos de 95-99, 99-03 e 03-07, respectivamente. Para estimar a acurácia do valor genômico direto (VGD) foram simuladas duas populações com estrutura de DL semelhante àquela em gado de corte com 40k (POP1) e 800k (POP2) marcadores SNP. O DL entre os SNP adjacentes, medido pelo r2, foi de 0,25 e 0,32 e o Ne foi de 250 e 120 para POP1 e POP2, respectivamente. Para POP1, GT foram formados por 1920, 960 e 480 touros com acurácia média do valor genético estimado (VGE) de 0,79, 0,90 e 0,94 para h2 0,10, 0,25 e 0,40, respectivamente, e para POP2, 480 touros com a mesma acurácia média dos VGE. Outros dois GT (7680 e 1920 para POP1 e POP2) foram formados por animais com fenótipo disponível para estimar os efeitos dos marcadores ao invés do VGE. A acurácia do VGD aumentou significativamente (p<0,05) com o aumento do número de touros no GT, h2 e densidade dos marcadores. O número de animais no GT teve um efeito quadrático sobre as acurácias do VGD para todas as h2(p<0,0001). Para a POP1, a acurácia mais alta (0,64) foi observada para h2=0,40 e n=1920. As acurácias do VGD na POP2 foram maiores (de 16% a 24%) do que aquelas para 40k SNP e n=480 e similares àquelas para 40k SNP e n=960. Aumentar em 4 vezes o GT e usar fenótipos para calcular os efeitos dos marcadores não foi suficiente para manter ou aumentar a acurácia do VGD para h2<0,40, tanto para POP1, como POP2. Os resultados obtidos quando o número de SNP foi aumentado de 40k para 800k SNP com n=480 indicou que o painel mais denso requer 2 vezes menos touros no GT do que 40k SNP para produzir acurácias do VGD similares. Os resultados sugerem que a seleção genômica pode trazer ganhos em acurácia na ordem de 27, 13 e 10%, considerando n=1920 e h2=0,10, 0,25 e 0,40, respectivamente e 7% para n=960 e h2=0,10 com relação aos VGE de animais jovens (média dos pais). Estes níveis de ganho foram menores do que aqueles relatados para gado de leite. Portanto, justificam-se mais trabalhos de pesquisa nesta área. / Advances in genomics have led to the inclusion of genomic information in livestock breeding. The success of its use depends mainly on the extent of linkage disequilibrium (LD) between markers and QTL, the number of genotyped animals in the training set (TS), and the heritability of the trait. The knowledge of genetic diversity parameters such as rate of inbreeding and the effective population size (Ne) which are associated with the increase in LD levels is useful for studying the feasibility of genomic selection. Aiming to estimate these parameters in beef cattle, a population of Nellore cattle was studied by pedigree analysis. The Ne was estimated to be 114, 245 and 101 for the years 95-99, 99-03 and 03-07, respectively. Aiming to estimate the accuracy of genomic selection, two populations were simulated with a LD structure similar to that in beef cattle with 40k (POP1) and 800k (POP2) SNP markers. The LD between adjacent markers, as measured by r2, was 0.25 and 0.32 and Ne was 250 and 120 for POP1 and POP2, respectively. TS were formed by 1920, 960 and 480 bulls with EBV with mean accuracy of 0.79, 0.90 and 0.94 for h2 of 0.10, 0.25 and 0.40, respectively, for POP1, and 480 bulls with the same average accuracies of EBV for POP2. Two large TS (7680 and 1920 for POP1 and POP2) were composed by animals with phenotypic information to estimate the marker effects, rather than EBV. The accuracy of direct genomic EBV (DGEBV) increased significantly (p<0.05) with the increasing of number of bulls in the TS, h2 and density of the markers. The number of animals in the TS showed a quadratic effect on the accuracy of DGEBV (p<0.0001) for all h2. For POP1, the highest accuracy (0.64) was observed for h2 of 0.40 and 1920 bulls in TS. The accuracies of DGEBV in POP2 were higher (from 16% to 24%) than those from 40K SNP and 480 bulls in the TS and similar to those from 40K SNP and 960 bulls in TS. Increasing the number of animals in TS by 4-fold and using phenotypes to calculate the marker effects was not enough to maintain or increase the accuracy of DGEBV estimated using EBV as response variable to estimate the marker effects, when the h2 was lower than 0.40 for both POP1 as POP2. Results of increasing the number of markers from 40k to 800k with a TS of 480 genotyped bulls indicate that the high density marker panel would require 2 times less bulls in the TS than 40K for yielding similar accuracies of DGEBV. The results suggest that genomic selection can bring gains in accuracy of 27, 13 and 10%, considering 1920 bulls in the TS for h2=0.10, 0.25 and 0.40, respectively, and 7% for TS of 960 bulls and h2=0.10 when compared to the parent average of young animals. These gains were lower than those reported in dairy cattle. Therefore, more investigations are warranted.

Dissertação (mestrado)— Universidade de Brasília, Faculdade de agronomia e medicina veterinária. / Submitted by Sabrina Silva de Macedo (sabrinamacedo@bce.unb.br) on 2012-06-25T16:21:42Z No. of bitstreams: 1 2012_RonanAparecidoValadaresSantana.pdf: 741035 bytes, checksum: 5746521bfcceaa02833e78b750bf28a9 (MD5) / Approved for entry into archive by Jaqueline Ferreira de Souza(jaquefs.braz@gmail.com) on 2012-06-27T14:29:47Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2012_RonanAparecidoValadaresSantana.pdf: 741035 bytes, checksum: 5746521bfcceaa02833e78b750bf28a9 (MD5) / Made available in DSpace on 2012-06-27T14:29:47Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2012_RonanAparecidoValadaresSantana.pdf: 741035 bytes, checksum: 5746521bfcceaa02833e78b750bf28a9 (MD5) / A comparação de sistemas de produção é importante para que se possa definir o planejamento de uma empresa rural. Deve estar baseada em indicadores zootécnicos e econômicos da produção, além da necessidade de investimento e de manter o fluxo de caixa positivo. Foram simulados quatro sistemas alternativos de produção de bovinos de corte a partir de dados zootécnicos e econômicos existentes de uma fazenda de ciclo completo no município de Corinto, região central de Minas Gerais. Os sistemas simulados foram: ciclo completo com uso de cruzamento industrial (CompCRUZA), ciclo completo exclusivamente com zebuíno (CompZEBU), ciclo de cria com uso de cruzamento industrial (CriaCRUZA), ciclo de cria exclusivamente com zebuíno (CriaZEBU). No sistema com cruzamento industrial os animais eram vendidos logo após a desmama, com 8 meses (CriaCRUZA) ou abatidos aos 13 meses (CompCRUZA), já o sistema com rebanho zebu, os animais eram também vendidos à desmama (CriaZEBU) ou abatidos aos 24 meses (CompZEBU). As bezerras foram recriadas e uma parcela (15%) descartada para a venda. Utilizou-se o programa de simulação bioeconômica Embrapec. Os quatro sistemas apresentaram viabilidade econômica, tendo maior rentabilidade que os juros da poupança e de financiamento agropecuário. Os sistemas que utilizam os cruzamentos (zebuínos x taurinos) tiveram um desempenho econômico mais favorável se comparados ao que utilizaram somente as raças zebuínas. A TIR e a VPL, foram superiores para os sistemas que adotaram o cruzamento de zebuínos com raças europeias, CriaCRUZA (17,2% e R$ 10.151.896,54) e CompCRUZA (18,9% e R$ 11.749.329,42). Quando comparados os sistemas de produção, os que utilizaram ciclo completo, o CompCRUZA e CompZEBU (16,2% e R$ 9.568.293,51) foram mais rentáveis que os de cria, quando comparados com o mesmo grupo genético, CriaCRUZA e CriaZEBU (14,6% e R$ 7.955.230,38. A quantidade de animais em um rebanho estabilizado foi menor nos sistemas cruzados, porém a quantidade (kg) de carcaça vendida/ha (49,9 para CriaCRUZA e 118,1 para CompCRUZA) e a taxa de desfrute (24,4%) foram superiores aos zebuinos. Todos os sistemas de produção simulados foram economicamente viáveis, sendo que o sistema de produção CompCRUZA foi que apresentou maior viabilidade econômica e com melhores indicadores zootécnicos. _________________________________________________________________________________ ABSTRACT / The comparison of production systems is important so that we can define the planning of a rural enterprise. It should be based on zootechnical and economic production indicators , the investment needed, and to maintain the cash flow positive. Were simulated four alternative systems of production from zootechnical and economic beef cattle data of an existing farm full-cycle located in Corinto, state of the Minas Gerais, Brazil. The systems simulated were: full-cycle with the use of crossbreed cattle (CompCRUZA), full cycle, exclusively with zebu cattle (CompZEBU), rearing cycle with the use of crossbreed cattle (CriaCRUZA) and rearing cycle with zebu cattle (CriaZEBU). The crossbreeding system animals were sold immediately after weaning with 8 months (CriaCRUZA) or slaughtered with 13 months (CompCRUZA). The zebu cattle system animals were also sold after weaning (CriaZEBU) or slaughtered with 24 months (CompZEBU). The female calves were reared and 15% were destined for sale. The data were simulated on the bioeconomic software “Embrapec”. The four systems resulted in economic viability, and greater profitability than the interests on savings and agriculture financing. The systems of crossings animals (zebu x taurine) had a favorable economic performance compared to the systems of zebu animals. The internal rate of return and net present value were higher for systems that have adopted the crossing system (taurine x zebu cattle), CriaCRUZA (17.2% and R$ 10,151,896.54) and CompCRUZA (18.9% and R$ 11,749,329.42). When comparing the production systems, those using full-cycle, the CompCRUZA and CompZEBU (16.2% and R$ 9,568,293.51), were more profitable than rearing systems, when compared with the same genetic group, CriaCRUZA and CriaZEBU (14.6% to R$ 7,955,230.38. The number of animals in the herd stabilized were lower in cross-systems, but the amount (kg) of carcass sold/ha (49.9 for CriaCRUZA and 118.1 for CompCRUZA) and offtake rate (24.4%) were superior to zebu cattle. All production systems simulated were feasible economically, but the production systemCompCRUZA showed the highest economic viability and better zootechnical indicators.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Agronomia e Medicina Veterinária, 2008. / Submitted by Natália Cristina Ramos dos Santos (nataliaguilera3@hotmail.com) on 2009-09-29T14:39:20Z No. of bitstreams: 1 2008_WilsonJoseBrandaoJunior.pdf: 383503 bytes, checksum: 6de7529fe53d7fae89dc52ea51d5a5e7 (MD5) / Approved for entry into archive by Luanna Maia(luanna@bce.unb.br) on 2009-09-30T15:37:24Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2008_WilsonJoseBrandaoJunior.pdf: 383503 bytes, checksum: 6de7529fe53d7fae89dc52ea51d5a5e7 (MD5) / Made available in DSpace on 2009-09-30T15:37:24Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2008_WilsonJoseBrandaoJunior.pdf: 383503 bytes, checksum: 6de7529fe53d7fae89dc52ea51d5a5e7 (MD5) Previous issue date: 2008-06 / Objetivou-se avaliar as características de crescimento, Peso no Início da Concepção e Peso aos 550 dias de vida, em relação à variável resposta, Idade à Concepção, além dos efeitos fixos (Raça, Estação de nascimento e Ano de avaliação) e aleatórios (Criatórios), quem podem influenciar na precocidade sexual dos zebuínos de corte da categoria elite. Para a elaboração de um Modelo Misto, os dados foram obtidos através de um estudo observacional de 83 criatórios sob a condição de terem mais de dois animais a nos sete anos, totalizando 1263 pesagens de 421 animais. Foi utilizado PROC MIXED do SAS®, onde se verificou a existência de significância das (co)variáveis Peso no Início da Concepção e Peso aos 550 dias e em alguns casos dos efeitos raça, ano e estação, além de suas interações, demonstrando suas influências na variável resposta. O estudo se estendeu em analisar o comportamento das médias, e os resultados mostram que existe um comportamento inverso das (co)variáveis, sendo o Peso no Início da Concepção positiva e Peso aos 550 dias negativa, e que este peso deve ser acompanhado até a puberdade das novilhas de forma mais intensa, devido aos animais com menor peso corpóreo obterem precocidade sexual superior as demais e chegando aos 550 dias mais pesadas, comparativamente. Mesmo fornecido além das exigências dos animais, o manejo nutricional influencia a capacidade reprodutiva, pois o excesso de gordura interfere nas funções reprodutivas negativamente, além de mascarar outros efeitos que seriam identificados caso os animais não estivessem nas mesmas condições. ________________________________________________________________________________________ ABSTRACT / The goal was to evaluate the characteristics of growth, weight in the beginning of the conception, and weight on the 550th day of life, in relation to the variable answer, age to the conception, besides the fixed effects (race, station of birth and year of evaluation) and random (flocks), which can influence in the sexual precocity of the beef zebu of the elite category. For the elaboration of a mixed model, the data obtained through a study of observations of 83 flocks under the condition that they have more than two animals in the seven years, totaling 1263 weightings of 421 animals. PROC MIXED of SAS® was used, where the existence of the significance of the (co)variables of weight in the beginning of the conception and weight on the 550th day, and in some cases of the effects race, year and station, besides their interactions was verified, demonstrating their influences in the variable answer. The study extended in analyzing the behavior of the averages, and the results show that an inverse behavior of the (co)variables exists, being the weight in the beginning of the positive Conception and weight on the 550th day negative, and that this weight should be accompanied until the puberty of the heifers in a more intense way, due to the fact that the animals with smaller body weight obtain superior sexual precocity than the others and arriving at the 550th day comparatively heavier. Same supplied besides the demands of the animals, the nutritional handling influences the reproductive capacity, because the excess of fat interferes with the reproductive functions negatively, besides masking other effects that would be identified case the animals were not in the same conditions.