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Proteínas inativadoras de ribossomos: identificação de novas proteínas e estudos de interação da cadeia-A da pulchellina (PAC) com monocamada de Langmuir / Ribosome inactivating proteins: identification of new members and studies of the interaction of pulchellin A-chain (PAC) with Langmuir monolayers

Luis Fernando Reyes 29 March 2011 (has links)
Proteínas Inativadoras de Ribossomos (RIPs) são rRNA N-glicosilases capazes de inibir a síntese protéica pela remoção de uma adenina específica do RNA ribossomal. São geralmente classificadas em tipo 1 e tipo 2, sendo as últimas divididas em altamente tóxicas e não tóxicas. A maior parte das RIPs tipo 2 identificadas pertence a espécies de dicotiledôneas, como é o caso da pulchellina. As cadeias tóxicas das RIPs possuem uma região C-terminal hidrofóbica conservada, a qual se atribui a capacidade de interação com a membrana do retículo endoplasmático (RE), durante o transporte retrógrado da toxina para o citosol. Neste trabalho duas abordagens diferentes foram aplicadas para o estudo das RIPs tipo 2: identificação e caracterização de novos integrantes desta família de proteínas, e investigação da interação da cadeia-A da pulchellina (PAC) com sistemas miméticos da membrana celular. Na primeira abordagem, uma busca in silico em bancos de dados genéticos públicos permitiu identificar quatro novas RIPs do tipo 2 de monocotiledôneas. A análise da estrutura primária das proteínas identificadas mostrou a ocorrência de mutações em alguns dos principais aminoácidos que formam o sítio ativo nas RIPs, indicando uma possível perda de função. O representante de Saccharum officinarum (cana-de-açúcar) foi então analisado em maior detalhe, sendo sua cadeia-A clonada (soRIPA), expressa em sistema heterólogo e caracterizada em termos de atividade e estrutura secundária. Os ensaios in vitro mostraram que a soRIPA não foi capaz de depurinar ribossomos eucariotos. Porém, os ensaios de inibição da síntese proteica mostraram uma possível atividade inibitória da soRIP, que precisa ainda ser confirmada. A presença dos transcritos no banco do SUCEST sugere que estes genes não sejam pseudogenes, embora não tenha sido possível purificar a proteína a partir de extratos de folhas. Isto indica que se a soRIP está sendo traduzida, deve sofrer um rápido turnover, tornando difícil a sua detecção e purificação ou, ainda, que a ausência de sítios de ligação à galactose funcionais na cadeia-B impediu sua purificação por cromatografia de afinidade à galactose. A outra abordagem no estudo das RIPs tipo 2 foi centrada na cadeia-A recombinante da pulchellina (rPAC), estudando sua interação com monocamadas de Langmuir. Foram construídos 3 mutantes da rPAC, cada um com diferentes deleções na região C-terminal visando determinar a região responsável pela interação com a membrana do RE. A cinética de adsorção e pressão superficial exercida pela rPAC sobre a monocamada, assim como o estudo com os mutantes demontraram que a proteína interage fortemente com a monocamada fosfolipídica e que esta interação in vitro é dependente da presença da região C-terminal. De forma geral, os resultados obtidos neste trabalho contribuíram com novas informações sobre esta família de proteínas, identificando e analisando novos integrantes e, ainda, adicionando detalhes do mecanismo funcional do tráfego das toxinas RIPs. / Ribosome Inactivating Proteins (RIPs) are rRNA N-glycosilases which are able to inhibit the protein synthesis by removing a specific adenine from the ribosomal RNA. They are usually classified as type 1 and type 2, being the latter divided into highly toxic and nontoxic. The majority of type 2 RIPs currently identified are found in species of dicotyledons, as the pulchellin. The toxic chain of RIPs has a conserved hydrophobic C-terminal region, which is believed to be responsible for the interaction with the lipid membrane of the endoplasmic reticulum ER during the retrograde transport of the toxin to the cytosol. In this work, two different approaches were applied in the study of type 2 RIPs: identification and characterization of new members of this protein family, and investigation of the interaction of the pulchellin\'s A-chain (PAC) with systems that mimic the cellular membrane. In the first approach, an in silico search in public genetic databases was performed and allowed us to identify four new type 2 RIPs in monocots. The primary structure analysis of the identified proteins showed the presence of mutations in key amino acids that form the active site of RIPs, indicating a possible interference on its catalytic activity. The representative of Saccharum officinarum (sugar cane) was then analyzed in greater detail. Its A-chain clone (soRIPA) was expressed in a heterologous system and characterized in terms of activity and secondary structure. In vitro experiments showed that soRIPA was not able to perform the depurination of eukaryotic ribosomes. However, the inhibition of protein synthesis assays presented a possible low inhibitory activity of the soRIP, which still needs to be further investigated. The presence of transcripts on the bank of SUCEST indicates that these genes are not pseudogenes, although it was not possible to purify the protein from leaf extracts. If the soRIP is being translated, this may indicate that it undergoes a quick turnover, preventing its detection and purification. It is also possible that the absence of functional galactose binding sites in the B-chain has prevented its purification by galactose affinity chromatography. Our second approach to the study of type 2 RIPs was focused on the recombinant pulchellin A-chain (rPAC), by investigating its interaction with Langmuir monolayers. We have constructed three mutants of rPAC, each one with different deletions at the C-terminal to determine the region responsible for interaction with the membrane of the ER. The adsorption kinetic and surface pressure applied by rPAC on the monolayer, as well as the study of the mutants, have demonstrated that the protein has a strong interaction with the phospholipid monolayer and that this interaction in vitro is dependent on the presence of the C-terminal. The results of this work have provided new information about the type 2 RIP protein family, identifying and analyzing new members, and also bringing new details about the functional mechanism of the RIP\'s toxin traffic.
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Produtividade e comportamento biométrico da cana-de-açúcar sob aplicação de vinhaça (in natura) e adubação mineral via gotejamento subsuperficial / Yield and biometric behavior of sugarcane under subsurface drip application of vinasse (in natura) and mineral fertilizer

Pedro Henrique Chinelato 16 June 2016 (has links)
Devido à crise que o setor sucroenergético vem sofrendo ultimamente, mediante baixas nas cotações de açúcar e etanol nos mercados internacionais, a técnica de irrigação em cana-de-açúcar vem passando por alguns questionamentos quanto a viabilidade de implantação dos sistemas. Diante disso, novos sistemas de irrigação vêm surgindo no meio sucroenergético em busca da redução de perdas de água por evaporação e lixiviação e, também buscando uma maior longevidade de canaviais a fim de obter maior lucro líquido ao longo da vida útil da lavoura. A exemplo disso tem-se o sistema de gotejamento subsuperficial já bastante difundido na Austrália. Outro aspecto é a aplicação de vinhaça em cana-de-açúcar, cuja técnica vem sendo adotada há muito tempo visto que promove melhorias nas condições físico-química do solo além de promover economias com redução da aplicação de fertilizantes minerais visto que a vinhaça é rica no nutriente potássio. Diante disso, buscouse conduzir uma pesquisa sobre fertirrigação com aplicação de vinhaça e adubação mineral, em diferentes doses, via gotejamento subsuperficial em um Argissolo vermelho-amarelo com a variedade de cana-de-açúcar CTC15, buscando verificar os seus efeitos na produtividade da variedade e parâmetros biométricos, visto que, irrigação por gotejamento subsupercial em cana-de-açúcar é uma tecnologia relativamente nova para cultura no Brasil. Portanto, foi instalado um experimento de campo em área de aproximadamente 1600 m2, composto por 6 tratamentos compostos de diferentes doses de vinhaça, adubação mineral e sequeiro, e 4 repetições, em delineamento inteiramente casualizado, conduzidos por duas safras de cana (2013-2014 e 2014-2015), sendo o T1 sem irrigação e com adubação convencional junto ao plantio, T2 fertirrigado convencionalmente, T3 ½ DoseCETESB, T4 dose calculada a partir dos critérios da norma P4.231/2015 (DoseCETESB), T5 2xDoseCETESB e T6 3xDoseCETESB. O manejo da irrigação foi realizado por tensiômetros instalados em profundidades de 20, 40 e 60 cm. Os parâmetros avaliados foram: biometria completa da parte aérea (altura de planta, comprimento de limbo foliar, largura de limbo foliar, distância entre internódios, número de colmos, diâmetro de colmos, número de folhas e de perfilhos, clorofila a, b e total), produção por área e avaliação tecnológica (Brix, Pureza, Fibra, Cinzas e ATR). Os parâmetros foram avaliados por análise estatística de variância e teste de comparação entre médias por Tukey a 5% de probabilidade. Diante dos resultados obtidos, comparado à condição de sequeiro (T1), a irrigação exercida no ciclo da cana planta promoveu ganhos em número de perfilhos da ordem de 16%, número de colmos na ordem de 10% e largura de limbo foliar em 15%. A fertirrigação com vinhaça no ciclo de primeira soca, em comparação ao sequeiro (T1), promoveu ganhos de 13% para altura de plantas, 5% para comprimento de folhas, 12% para número de perfilhos e 4% para largura de limbo foliar. E não foram encontradas diferenças estatísticas para clorofila a, b e total e nem para parâmetros tecnológicos nos dois ciclos. O tratamento que melhor respondeu a fertirrigação com vinhaça em produtividade foi T4 (DoseCETESB) obtendo um valor de 190 ton ha-1. / Due to low sugar and ethanol prices in international markets, questions have arisen about the economic feasibility of implementing new irrigation techniques. Consequently, irrigation systems with reduced leaching and evaporative water loss, and with greater longevity, are being developed to achieve higher net income for sugarcane. The use of subsurface drip is already widespread in Australia, for example. One such management technique is the use of vinasse in sugarcane crops in Brazil. Vinasse has a long history of use in sugarcane production in Brazil, since it promotes improvements in the physical-chemical conditions of the soil and reduces the use of mineral fertilizers, as it is rich the potassium. This research relates to subsurface drip fertigation of the CTC15 variety of sugarcane in a redyellow Argisol, with vinasse and mineral fertilizer. The objective was to characterize the effect of fertigation on yield and several biometric parameters, since subsurface drip irrigation/fertigation is a relatively new technology for sugarcane production in Brazil. A drip irrigation system was installed in a 1600 m2 field, consisting of 4 replications of 6 treatments with different vinasse doses, mineral fertilizer and rainfed conditions, in a completely randomized design. The treatments were T1: No irrigation and conventional fertilization at planting, T2: fertigation at conventional fertilizer levels, T3: fertigation at ½ the standard P4.231/2015 CETESB rate, T4: fertigation at the standard CETESB rate, T5: fertigation at twice the CETESB rate and T6: fertigation at three times the CETESB rate. Data were collected for the 2013-2014 and 2014-2015 sugarcane crops. Irrigation was scheduled based on the moisture content in tensiometers installed at 20, 40 and 60 cm depth. The parameters evaluated were complete shoot biometrics (plant height, leaf blade length, width of leaf blade, the distance between internodes, number of stems, stalk diameter, number of leaves and tillers, chlorophyll a, b and total chlorophyll), crop yield, and sugarcane quality (Brix, Purity, Fiber, Embers and ATR). The parameters were evaluated by statistical analyses of variances, and comparison test of means by Tukey at 5% probability. Based on these results, compared to rainfed condition (T1), irrigation improved tiller number by 16 %, culm number by 10%, and width of leaf blade at 15%. The fertigation with vinasse in the first ratoon cycle, improved plant height by 13%, sheet length by 5%, number of tillers by 12%, and width of leaf blade by 4%. There were no statistical differences in chlorophyll A, chlorophyll B, total chlorophyll and sugarcane quality in either of the two crop cycles. The T4 treatment, fertigation at the standard CETESB rate, had the best yield response to fertigation with vinasse (190 ton ha-1).
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Análise da combustão e emissões em motores a bio-diesel. / Combustion and emissions analysis of biodiesel engines.

Flavio Gustavo Lehmann 08 April 2015 (has links)
A rápida evolução do mercado automotivo, em função de maiores restrições sobre as emissões, impulsionou a utilização de várias alternativas para melhorias dos motores diesel, entre elas as mudanças nos seus componentes com o auxílio de ferramentas de modelagem e a utilização de combustíveis alternativos. As características dos combustíveis afetarão a queima e, assim, alteram os resíduos do processo de combustão. Novos combustíveis podem também ser utilizados como uma alternativa para veículos de gerações anteriores com o intuito de reduzir as emissões. Este estudo mostra os efeitos da utilização do Biodiesel B20 e do Biodiesel Amyris em motores de combustão interna. Para isso, foram realizados testes de motores em salas dinamométricas, e seus resultados confrontados e discutidos. Além disso, são abordados os efeitos do combustível no processo da combustão. Esta Dissertação está concentrada, principalmente, na emissão de NOx e de material particulado, que são poluentes mais restritivos perante a Legislação brasileira de emissões CONAMA P7. / The fast evolution of the automotive market, in light of the more restrictive emissions requirements, spurred several alternatives for improvements of diesel engines; among them, changes in the engine components with the aid of modeling tools and use of alternative fuels. The fuel characteristics will affect the combustion and thus combustion process residues. New fuels also can be an alternative for vehicles of previous generations of emissions, aiming of reducing them. This study shows the effects of the B20 biodiesel and Amyris biodiesel in diesel engines. Engine tests were held in dynamometric testing cells and their results were compared and discussed. The effects of the different fuels in the combustion process are also discussed. This work is focused mainly in NOx (nitrogen oxide) and particulate matter emissions, which are more restrictive pollutants regarding the Brazilian emissions legislation CONAMA P7.
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Diversidade de vespas sociais (Hymenoptera: Vespidae, Polistinae) em fragmentos de Floresta Estacional Semidecidual no Noroeste do Estado de São Paulo com diferentes tipos de matriz de entorno / Diversity of social wasps (Hymenoptera: Vespidae; Polistinae) on semi deciduous seasonal forest fragments with different surrounding matrix in northwest of São Paulo State.

Getulio Minoru Tanaka Junior 22 July 2010 (has links)
A região noroeste do Estado de São Paulo é uma das que mais sofre com o processo de fragmentação da vegetação natural que foi substituída principalmente por ambientes urbanizados, pastagens e áreas agriculturáveis. Cana-de-açúcar e citricultura são duas das principais monoculturas presentes atualmente na região. A área de entorno (matriz) dos fragmentos florestais exerce influência nas populações que habitam seu interior, incluindo o grupo das vespas sociais. O presente trabalho teve o objetivo de realizar um levantamento das vespas sociais (Polistinae) presentes em fragmentos florestais do Noroeste Paulista com matrizes de entorno compostas por canaviais e laranjais. Utilizamos uma metodologia baseada em coleta ativa utilizando líquido atrativo em um transecto no interior e um na borda dos fragmentos e obtivemos 20 espécies em Magda, 13 em Bebedouro, 13 em Matão e 19 em Barretos. Verificamos uma maior riqueza de espécies na borda dos fragmentos. O gênero mais representativo foi Agelaia em todas as áreas analisadas. Os maiores índices de diversidade de Shannon-Wiener foram obtidos nos transectos da borda de Barretos (H=2,26) e borda de Magda (H=2,25), fragmentos circundados por laranja e cana-de-açúcar respectivamente. Analisando a área como umtodo, Magda apresentou a maior diversidade (H=2,12). Espécies como Brachygastra moebiana, Metapolybia docilis, Mischocyttarus ignotus, M. paulistanus e M. consimilis não haviam sido registrados em levantamentos recentes no estado, além disso o registro de M. consimilis aparentemente é novo para o estado de São Paulo. Realizamos comparações com outros levantamentos realizados no estado e verificamos um indício de que a riqueza de vespas sociais pode estar relacionada com a quantidade de vegetação natural remanescente da área. Concluímos que com nossos dados não foi possível observar uma relação entre a ocorrência de vespas sociais e a matriz de entorno. / The northwest of São Paulo State is a region that undergoes a fragmentation process of its natural vegetation that was replaced by urban areas, meadows or farming lands. Sugarcane and citrus are two of the main regional monocultures. The surrounding area (matrix) of forest fragments influences the populations that inhabit the interior, including social wasps. The present work aimed at surveying social wasps (Polistinae) present in forest fragments of northwest of São Paulo State with different surrounding matrices composed by sugarcane and citrus. We used a methodology based on active collection using and attractive liquid in one transect on the edge and one on the interior of the fragments and we collected 20 species in Magda, 13 in Bebedouro, 13 in Matão and 19 in Barretos. We noted a greater richness on the edge of the fragments. Agelaia was the most representative genus in all of the areas. The greatest indices of Shannon-Wiener diversity were obtained on the edge of Barretos (H=2,26) and on the edge of Magda (H=2,25), fragments surrounded by citrus and sugarcane respectively. If the total area was analyzed, Magda showed the greater diversity (H=2,12). Species such as Brachygastra moebiana, Metapolybia docilis, Mischocyttarus ignotus, M. paulistanus and M. consimilis had not been recorded on recent surveys on the state, furthermore Mischocyttarus consimilis apparently is a new record for the São Paulo State. We did comparisons with others surveys made on the state and we noted that social wasps richness can be related with the amount of remnants of natural vegetation in a given area. We concluded that with our data it was not possible to observe a relation between the occurrence of social wasps and the surrounding matrix.
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A criação, circulação e transformação do conhecimento em redes de inovação : o programa de melhoramento genetico da cana-de-açucar do IAC

Hasegawa, Mirian 23 February 2001 (has links)
Orientador: Andre Tosi Furtado / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Geociencias / Made available in DSpace on 2018-07-27T13:46:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Hasegawa_Mirian_M.pdf: 3900627 bytes, checksum: d5edb2eb0a9bf0dc9dac65e3fb84ec41 (MD5) Previous issue date: 2001 / Resumo: A inovação é o resultado de numerosas interações entre vários atores e instituições que, juntos, formam uma rede por onde o conhecimetno circula e se transforma muitas vezes até chegar a um resultado econômico. O objetivo do presente trabalho é tentar entender como o conhecimento circula e se transforma e como é criado e recriado durante o processo de gestação de uma inovação, no qual participam diversas organizações e atores heterogêneos. O intuito é abrir a caixa preta da criação da inovação. A idéia é usar o modelo proposto por Nonaka e Takeuchi (1997) e complementá-Io com alguns conceitos propostos por Callon (1994) e com o modelo interativo de inovação (Kline & Rosenberg, 1986). O modelo de Nonaka e Takeuchi se baseia no pressuposto de que o conhecimento humano é criado e expandido através da interação social entre os conhecimentos tácito e explícito. Primeiro, o conhecimento tácito passa da forma individual para a coletiva (socialização). É importante ressaltar que o conhecimento tácito requer aprendizado, interação social e experiência para ser transferido. Segundo, o tácito coletivo é explicitado (externalização). O conhecimento codificado é mais facilmente compartilhado, pois ele representa "informação" que pode ser transmitida a um grande número de pessoas através da in&aestrutura de informação. Finalmente, os indivíduos internalizam o conhecimento explícito e, desta forma, ampliam seu estoque de conhecimento tácito. Assim, a "espiral do conhecimento" começa novamente. Nesta dissertação, procura-se entender a criação do conhecimetno dentro de redes de inovação, e não somente dentro dos limites de uma organização isolada. Assume-se que o processo inovativo é caracterizado por constantes interações e feedbacks entre pesquisa, desenvolvimento e mercado. Então, o conhecimento circula por estes pólos, que são formados por muitos atores (instituições de pesquisa, usuários, firmas, indivíduos externos, etc). Estes atores são heterogêneos e formam uma rede onde cada um possui uma linguagem e um comportamento diferente. No estabelecimento das ligações sociais entre eles, muitas operações de tradução são necessárias antes que a comunicação e as trocas possam ocorrer de forma eficiente. O modelo de criação do conhecimento de Nonaka e Takeuchi deu conta de explicar apropriadamente os fluxos de conhecimentos dentro de uma rede de inovação. Constatou-se, no estudo de caso, que o conhecimento passou das dimensões tácita para explícita, individual para coletiva e específica para geral, e também ficou claro que as traduções são muito mais dificeis dentro de uma rede de inovação heterogênea do que dentro de uma única organização. Estudo de caso: Programa de Melhoramento Genético da cana-de-açúcar do IAC / Abstract: Innovation is the result of nwnerous interactions among severa! actors and institutions that together fonn a network through wlúch knowledge flows and is transfonned until it reaches an economic resulto This dissertation aims at opening the "black box" ofthe innovation creation by studying how knowledge flows and is created and recreated during the innovative processo The idea is to use the model proposed by Nonaka and Takeuchi (1997) and to extend it with some ofthe concepts used by Callon (1994), and with the interactive model ofinnovation (Kline &Rosenberg, 1986). The model of Nonaka and Takeuclú is based on the asswnption that hwnan knowledge is created and expanded through the social interaction between tacit and explicit knowledge. First, tacit knowledge goes &om an individual fonn to a collective fonn (socialization). It is worth emphasizing that tacit knowledge requires learning, social interaction and experience to be transferred. Second, coIlective tacit knowledge is converted into explicit knowledge (articulation). The codified knowledge is more easily made collective, because it is transfonned into "infonnation" which can be transmitted to a large nwnber of individuais through infonnation in&astructures. Finally, individuais internalize the explicit knowledge, which extends their tacit knowledge base. Thus, the "spiral ofknowledge" starts ali over again. In this paper we want to understand the knowledge creation within innovation networks, and not only within a single organization. We recognize that innovation process is characterized bya constant interaction and feedback between research, design activities and market. Thus, the knowledge circulates through these poles, which are fonned by many actors (research institutions, users, finns, external individuais, etc). These actors are heterogeneous and constitute a network. Each actor acts and speaks in a different way. In the establishment of the social link between them many translation operations are necessary before the communication and exchanges could occur efficiently. However, the Nonaka & Takeuclú model of knowledge creation can explain appropriately the knowledge flows inside an innovation network. We found in our case study that knowledge is transfonned &om an individual to a collective dimension, &om the tacit to the explicit fonn, and &om the specific to the general dimension. Meanwlúle, translation process is much more difficult inside a heterogeneous innovation network than inside a single organization. Case study: Campinas Agriculture Institute Sugar-cane Breeding Programme / Mestrado / Politica Cientifica e Tecnologica / Mestre em Política Científica e Tecnológica
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A cana-de-açucar e as mudanças climaticas : efeitos de uma atmosfera enriquecida em 'CO IND. 2' sobre o crescimento, desenvolvimento e metabolismo de carboidratos de Saccharum ssp / Sugarcane and climate changes : effects of 'CO IND. 2 enrichment atmosphere in growth, development and carbohydrate metabolism in Saccharum ss

Souza, Amanda Pereira de 20 April 2007 (has links)
Orientadores: Marcos Silveira Buckeridge, Marilia Gaspar / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-09T03:07:16Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Souza_AmandaPereirade_M.pdf: 752519 bytes, checksum: 0abdf68fd1d19b70a0af931741ccf052 (MD5) Previous issue date: 2007 / Resumo: Desde o início da Revolução Industrial as concentrações de CO2 atmosférico aumentaram em cerca de 30% e estimativas apontam que esta concentração poderá atingir aproximadamente 720 ppm até a metade deste século. Estudos sobre o efeito do alto CO2 no desenvolvimento de diversas espécies vegetais já foram realizados, porém poucos com espécies de gramíneas tropicais do tipo C4, como é o caso da cana-de-açúcar. Considerando a importância econômica da cana e seu potencial na obtenção de biocombustíveis é importante saber como esta cultura irá responder ao aumento previsto na concentração de CO2 atmosférico. Sendo assim, o objetivo deste trabalho foi estudar o efeito do aumento do CO2 atmosférico sobre o crescimento, desenvolvimento e metabolismo de carboidratos da cana-de-açúcar visando avaliar o potencial de seqüestro de carbono e o impacto das mudanças climáticas sobre a produtividade. Parâmetros fisiológicos, bioquímicos e moleculares foram analisados em plantas cultivadas em câmaras de topo aberto durante 50 semanas com atmosfera de CO2 ambiente (~370 ppm) e elevada (~720 ppm). Os principais resultados obtidos indicam incremento em altura, na taxa fotossintética e em biomassa de colmo e folhas das plantas cultivadas sob elevado CO2. Ao final das 50 semanas foi detectado no colmo das plantas crescidas em tais condições, um aumento no teor de sacarose, de fibras e no conteúdo de celulose. A análise do perfil de transcritos de folhas após 9 e 22 semanas de cultivo usando microarranjos revelou expressão diferencial de 37 genes, sendo que 14 foram reprimidos e 23 foram induzidos e correspondem principalmente a genes de fotossíntese e desenvolvimento. Nossos resultados indicam que a cultura da cana-de-açúcar tem capacidade para seqüestro de carbono e potencial para aumento na produtividade em condições de alta concentração de CO2 / Abstract: Since the beginning of the Industrial Revolution, the concentrations of CO2 in the atmosphere increased about 30% and the current forecasts point out that this concentration will reach approximately 720 ppm until the middle of this century. Studies about the effect of CO2 on the development of several plant species have been performed. However, few studies have been performed with tropical grass species having photosynthesis C4, as is the case of sugar cane. Due to the economic importance of sugar cane and its high potential to obtain biofuel, it is important to known how this crop will respond to the forecasted increase in the CO2 concentration in the atmosphere. Therefore, the goal of this work was to study the effects of increased CO2 concentration on growth, development and carbohydrate metabolism of sugar cane aiming the evaluation of the potential of this specie for carbon sequestration and the impact of the global climatic change on its productivity. Physiological, biochemical and molecular features of these plants have been analyzed during 50 weeks of growth in Open-Top-Chambers (OTCs) with ambient (~370 ppm) and elevated (~720 ppm) CO2 concentrations. After 50 weeks of growth under these conditions, we observed an increase of sucrose content, fiber an also in cellulose contents in stems of plants grown under elevated CO2. The microarray analysis of the transcriptome of leaves was obtained after 9 and 22 weeks and revealed differential expression of 37 genes. Fourteen genes were repressed and 23 induced by elevated CO2. The latter correspond mainly to the processes of photosynthesis and development. Our results indicate that the sugar cane crop has a high potential for carbon sequestration and increase of productivity under elevated CO2 concentrations / Mestrado / Biologia Celular / Mestre em Biologia Celular e Estrutural
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Estrategias para a organizção da pesquisa em cana-de-açucar : uma analise de governança em sistemas de inovação / Strategies for organizational research in sugar cane : an analytical approach to governance in innovation systems

Pedro, Edilson da Silva 14 August 2008 (has links)
Orientador: Sergio Luiz Monteiro Salles Filho / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Geociencias / Made available in DSpace on 2018-08-11T22:04:51Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Pedro_EdilsondaSilva_D.pdf: 4051339 bytes, checksum: d09b246c6421ec992188b778a4af5802 (MD5) Previous issue date: 2008 / Resumo: O propósito deste estudo de tese é identificar melhores estratégias institucionais de governança e coordenação para organizar a Pesquisa em Melhoramento Genético de Cana-de-açúcar. Para este fim, conceitualmente foram utilizadas as abordagens evolucionistas visando sintetizar um marco analítico com foco direcionado à questão da governança em sistemas setoriais de inovação ligados a agricultura. A estratégia de pesquisa exploratória foi empregada como metodologia para precisar o problema e compreender seus elementos e relações relevantes. Também foram aplicadas ferramentas de prospectiva estratégica para analisar cenários e incertezas críticas. A partir destas definições e recursos, a pesquisa identificou as forças, fraquezas, oportunidades e ameaças e, sobretudo, as falhas de coordenação nas dimensões atores, base de conhecimento e marcos regulatórios. Estes elementos subsidiaram a composição e análise das incertezas críticas e trajetórias institucionais estratégicas na projeção de cenários alternativos. Como resultado, o estudo aponta inovações institucionais que podem apoiar o desenvolvimento e organização da coordenação da PD&I, baseando-se em diretrizes de aumento de coerência sistêmica - tais como gestão dos processos decisórios, compartilhamento de objetivos e recursos. Entendese que este estudo setorial apresenta uma plataforma importante para desenhar políticas e estratégias institucionais mais robustas para a organização da pesquisa enfrentar as transformações no padrão produtivo da agricultura e agroindústria nos próximos 10 anos. / Abstract: The purpose of this study is to identify better governance institutional strategies and coordination of Research in Sugar Cane Genetic Improvement. Therefore, evolutional approaches were used to synthesize an analytical mark focusing on governance question in sectorial systems of innovation connected to agriculture. The strategy of exploratory research was used as a methodology to define the problem, understand its elements, and relevant relations. Strategic prospecting tools were applied to analyze scenarios and critical uncertainnesses. From these definitions and resources, the research identified strengths, weaknesses, opportunities and threats, and above all, coordination failures in dimensions as such actors, knowledge base, and regulatory marks. And these elements supported the composition and analysis of critical uncertainnesses and strategic institutional trajectories in alternative scenario projections. As a result, the study indicates institutional innovations which can support the development and organization of RD&I coordination according to the directions of systemic coherence increasing - as such management of decision processes, sharing of goals and resources. It is understood that this sectorial study presents an important platform to design more powerful institutional politics and strategies so that the organizational research can face agricultural and agroindustrial productive patter transformations in the next ten years. / Doutorado / Doutor em Política Científica e Tecnológica
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América Latina e o etanol de cana-de-açúcar : diagnóstico do ambiente sistêmico e dos fatores / Latin America and ethanol from sugarcane : diagnosis of systemic environment and critical competitive factors

Castañeda Ayarza, Juan Arturo 21 August 2018 (has links)
Orientador: Luis Augusto Barbosa Cortez / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia Mecânica / Made available in DSpace on 2018-08-21T09:05:16Z (GMT). No. of bitstreams: 1 CastanedaAyarza_JuanArturo_D.pdf: 2849571 bytes, checksum: 941c9f10aac20b21b7fae5e292aef51a (MD5) Previous issue date: 2012 / Resumo: Este trabalho teve como objetivo geral avaliar o ambiente competitivo sistêmico que oferece a America Latina para o desenvolvimento da industria de etanol da cana-de-açúcar. Para isso, primeiramente foi realizada a revisão do atual cenário da região em relação a indústria de cana e etanol combustível. Como segundo passo foi aplicado o método de analise de competitividade sistêmica chamada "Diamante Competitivo de Porter" em quatro países escolhidos, que permitiu estruturar o ambiente no qual a industria de etanol se desenvolve em cada pais e o nível de competitividade que este ambiente oferece. Finalmente foram identificados os fatores críticos competitivos do ambiente encontrado em cada pais e em toda a região, como base para a elaboração de propostas estratégicas que poderiam contribuir no reforço da competitividade do ambiente e das condições para que o mercado de etanol combustível possa se desenvolver na America Latina. Como resultado, obteve-se que: a pesar dos diferentes estágios do mercado de etanol em cada pais, o Papel do Governo e o determinante que mais influencia a competitividade do ambiente sistêmico; o Brasil tem o ambiente mais competitivo, impulsionada pela industria nacional de apoio; finalmente, considerando a experiência, a tecnologia e o conhecimento adquirido no setor de cana e etanol, a região latino-americana, através da integração e cooperação poderia fortalecer o ambiente competitivo e ate se tornar em um pólo de produção e consumo. Esse processo de integração poderia ser liderado pelos países mais experientes nesse mercado, tendo como destaque o Brasil / Abstract: The general objective of this thesis was evaluate the systemic competitive environment found in Latin America towards to develop the sugarcane ethanol industry. For this purpose, first of all was made a reviewed the current regional scene in relation to this industry from technical and scientific materials available. After that was applied the method of competitive analysis called "Porter's Competitive Diamond" to four selected countries, that allowed to structure the environment which ethanol industry is developing in each country and the competitiveness performance of that environment. Finally, identified the critical competitive factors from environment found in each country and all region, as grounding for proposal of strategies that could help the competitiveness of environment and this way the development of fuel ethanol market in Latin America. The results showed that despite different stages of ethanol market development in each country, the role of government is the most potent determinant of competitiveness in national environment. Brazil account the most competitive environment based on the presence of national supplier industries. Lastly, from experience, technology and knowledge gained by sugarcane and ethanol sectors throughout the region, could strengthen the entire competitive environment and even to become a pole of production and consumption, if taken the opportunity to cooperation and integration between countries. In this case, the most experienced countries in sugarcane ethanol could lead the integration process, and Brazil has the greater chance to highlight / Doutorado / Planejamento de Sistemas Energeticos / Doutor em Planejamento de Sistemas Energéticos
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Desenvolvimento do sistema radicular e produtividade da cana-de-açúcar em diferentes espaçamentos / Root growth and sugarcane productivity in different rowspacing

Rossi Neto, João, 1987- 28 August 2018 (has links)
Orientadores: Zigomar Menezes de Souza, Henrique Coutinho Junqueira Franco / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia Agrícola / Made available in DSpace on 2018-08-28T13:34:33Z (GMT). No. of bitstreams: 1 RossiNeto_Joao_M.pdf: 2877691 bytes, checksum: 756adbc1ddceaf03ebfcaa7a460d07ac (MD5) Previous issue date: 2015 / Resumo: Com a necessidade de diminuir o impacto sofrido pelo solo, devido à grande utilização de máquinas agrícolas em operações de campo, o qual historicamente define o espaçamento de plantio da cultura, vem-se projetando uma estrutura de tráfego controlado, criando-se inúmeras possibilidades de plantio da cultura. Desse modo, a dissertação baseia-se na hipótese de que a redução do espaçamento entrelinhas e o aumento da distância entre touceiras da cana-de-açúcar eleva a produção de biomassa por área independente da textura do solo em que esta é cultivada. Assim, o projeto de pesquisa teve como objetivo avaliar o desempenho da cana-de-açúcar em diferentes configurações de espaçamento entre plantas e entrelinhas relacionado com o desenvolvimento do sistema radicular em ambientes edafoclimáticos distintos. Para isso, desde julho de 2012 vem sendo conduzido dois experimentos com a cultura em condições de campo, localizados na Usina Alcídia (Município de Teodoro Sampaio-SP) e Usina Guaíra (Município de Guaíra-SP). Os experimentos apresentam delineamento experimental em blocos casualizados, com seis configurações de plantio, sendo: T1-espaçamento convencional (EC - 1,50 m entrelinhas); T2-espaçamento alternado (EA - 0,90x1,50 m entrelinhas duplas); T3-espaçamento triplo (ET - 0,75x0,75x1,50 m entrelinhas triplas); T4-plantio de precisão (PP 1,0 m - 1,0x1,0 m entre plantas e entrelinhas); T5-plantio de precisão (PP 0,75 m - 0,75x0,75 m entre plantas e entre linhas); T6-plantio de precisão (PP 0,5 m - 0,5x0,5 m entre plantas e entrelinhas). Durante a cana-planta e primeira soqueira foi avaliado: biomassa de raiz; biomassa de parte aérea (em cana-planta); produtividade de colmos (Mg.ha-1) e produção de açúcar (TPH). Aditivamente, por meio do método de classificação foi avaliado o atributo biométrico que apresenta maior correlação com a produtividade da cana-planta. Houve aumento de produtividade com o espaçamento PP 0,75 m em solo argiloso, por outro lado, em solo arenoso o espaçamento PP 1,0 m obteve a maior produção no segundo ciclo. Existe superioridade dos espaçamentos mais reduzidos, nos dois primeiros ciclos, em relação à produção total de açúcar por área. A produção e a distribuição de biomassa de raiz da cana-de-açúcar não explicaram a produtividade da parte aérea nos espaçamentos. Em solo argiloso a taxa máxima de acúmulo de biomassa da parte aérea da cultura ocorreu de forma mais intensa e rápida que a taxa verificada em solo arenoso. O atributo biométrico com maior ganho de informação em relação à lógica dos dados foi à população de plantas por hectare / Abstract: With the need to reduce the impact suffered by the soil, due to the large use of agricultural machines in field operations, which historically defines the planting row space of crops, it has been designing a Structure of Controlled Traffic, creating numerous opportunities for planting. In this way, the thesis is based on the assumption that the reduction of spacing inter row and the increase in the distance between clump of sugarcane elevates the production of biomass by independent area of the texture of the soil in which it is grown. Thus, the research project aimed to evaluate the performance of the sugarcane in different configurations of spacing between plants and rows related to the development of the root system in different environments. For this reason, since July 2012 is being performed two experiments in field conditions, located in Alcídia SugarMill (Teodoro Sampaio-SP County) and Guaíra Sugar Mill (Guaíra-SP County). The experiments has the same experimental design (blocks), with six settings of planting, being: T1 - conventional spacing (EC - 1.50 m of interrow); T2 - alternate spacing (EA - 0.90 x 1.50 m of dual row); T3 - triple spacing (ET - 0.75 x 0.75 x 1.50 m of triple row); T4 - precision planting (PP 1.0 m - 1.0 x 1.0 m between plants and rows); T5 - precision planting (PP 0.75 m - 0.75 x 0.75 m between plants and between rows); T6 - precision planting (PP 0.5 m - 0.5 x 0.5 m between plants and between rows). During the plant cane and first ratoon crop cycle was evaluated: biomass of roots; biomass of aboveground part (only in plant cane); yield of stalks (Mg.ha-1) and sugar production per ha (TPH). Additively, through the method of classification was assessed the biometric attribute that has the highest correlation with the productivity of sugarcane. There was an increase in productivity in the PP 0.75 m in clay soil (Alcídia SugarMill area).On the other hand, in sandy soil the PP 1.0 m obtained the highest production in the second cycle (first ratoon). There is no superiority of spacings more reduced, in the first two cycles, in relation to total sugar production per area. The production and the distribution of biomass of root of sugarcane did not explain the productivity of aerial part in spacings. In clayey soil the maximum rate aboveground part production of culture occurred with more intense and faster than the rate recorded in sandy soil. The biometric attribute which has the higher-gain of information in relation to the logic of the data was the population of plants per hectare / Mestrado / Agua e Solo / Mestre em Engenharia Agrícola
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Atributos físicos do solo e desenvolvimento radicular da cana planta em diferentes sistemas de manejo / Soil physical attributes and root development of plant cane in different management systems

Barbosa, Leandro Carneiro, 1986- 28 August 2018 (has links)
Orientadores: Zigomar Menezes de Souza, João Luís Nunes Carvalho / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia Agrícola / Made available in DSpace on 2018-08-28T23:42:11Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Barbosa_LeandroCarneiro_M.pdf: 2000639 bytes, checksum: 0eb5805e7b0c6a1993fa2a420d39c9e5 (MD5) Previous issue date: 2015 / Resumo: O manejo de solo é essencial para promover condições ideais para o desenvolvimento radicular da cultura de cana-de-açúcar visando o aumento de produtividade de biomassa. Este trabalho teve como objetivo avaliar a influência dos sistemas de preparo do solo convencional e plantio direto sobre o desenvolvimento radicular da cana planta para cultivar RB96-6928, em áreas com e sem rotação de cultura, relacionando-a com os atributos físicos do solo. Os manejos aplicados foram: a) rotação de cultura: i) área sem rotação (pousio); ii) com rotação de cultura utilizando Crotalária sp. b) sistema de preparo: i) preparo convencional (PC) ¿ subsolagem, aração, gradagem e sulcação da área para o plantio; ii) plantio direto (PD) ¿ sulcação e plantio. As amostras para a avaliação da densidade do solo (DS), macroporosidade, microporosidade e porosidade total foram coletadas em anéis volumétricos. A resistência do solo à penetração (RP) foi obtida em laboratório com o medidor automatizado de bancada. A avaliação do sistema radicular foi feita utilizando-se duas metodologias: monólito e sonda. Foram coletados 25 monólitos no espaçamento de 1,5 m linear até 1,0 m de profundidade. Os monólitos tinham as seguintes dimensões 0,3 x 0,1x 0,1 m coletados nas seguintes camadas de 0,00-0,10 e 0,10-0,20 m; 0,3 x 0,2 x 0,1m coletadas nas camadas 0,20-0,40 e 0,40-0,60 e 0,4 x 0,3 x 0,1 na camada 0,60-1,00 m. A sondagem foi feita com uma sonda de aço inox de 1,2 m de comprimento e 0,055 m de diâmetro interno. As raízes mais solo foram lavadas em água corrente e passadas em peneiras de 1 mm, e depois secas em estufas a 65°C por 72h. Os sistemas de preparo assim como o uso ou não de rotação de culturas antes do plantio da cana-de-açúcar não proporcionaram diferenças na produtividade tanto da parte aérea de colmos como do sistema radicular da cana planta. Por outro lado, houveram diferenças na produtividade da biomassa aérea e subterrânea da cultura entre os locais estudados, verificando as menores produtividades em solo arenoso com elevado déficit hídrico. Os atributos físicos do solo RP e DS apresentaram correlação com o desenvolvimento radicular, sendo que em solo arenoso a restrição ao crescimento das raízes ocorreu quando a RP foi maior que 1,5 MPa e DS de 1,7 kg m-3, enquanto que nos solos de textura argilosa esses valores foram de 2,5 MPa e 1,25 kg m-3 respectivamente. Em geral, o sistema radicular da planta se concentrou nos primeiros 0,40 m (70%) e ao redor da touceira (região do sulco de plantio) / Abstract: The soil management practice is fundamental to promote optimal conditions for root development of sugarcane culture aiming the increase of biomass productivity. This study aims the evaluation of soil physical properties and the root development of sugarcane plant in different management systems. The soil managements applied were: a) crop rotation: i) surface area without rotation (fallow); ii) with crop rotation using Crotalaria sp. b) conventional tillage (CT) - subsoiling, plowing, harrowing and the plough of the area for planting; ii) tillage (NT) ¿ plough and planting. Samples for bulk density (BD), macro, micro and total porosity were collected from soil core in volumetrical rings. The penetration soil resistance (RP) was obtained in laboratory. For the evaluation of root system two methodologies were applied: monolith and probe. 25 monoliths spaced 1.5 m to 1 m deep were collected. The monoliths presented the following dimensions: 0.3 x 0.1 x 0.1 m for the layers 0-0.10 and 0.10-0.20 m, 0.3 x 0.2 x 0.1 m for the layers 0.20-0.40 and 0.40-0.60 m, and 0.4 x 0.3 x 0.1 m for the layer 0.60-1.00 m. The drilling was performed using a stainless steel tube with 1.2 m of length and 0.055 m of internal diameter. The roots and the soil samples were washed in flowing water with a 1 mm sieve and then dried in oven at 65°C for 72h. The tillage systems as well the use or not of the crop rotation, before the planting of sugarcane, didn¿t affect the productivity of aerial part of stems as the root systems of the sugarcane. On the other hand, some differences were showed in productivity of both aboveground and underground biomass between the sites culture studied, finding the lowest yield in sandy soil with a high water deficit. The soil physical attributes RP and BD showed a correlation with the root development, once in the sandy soil the restriction on roots growth occurred when the RP was higher than 1,5 MPa and 1,7 kg m-3, whereas for clay soils the obtained values were 2,5 MPa and 1,25 kg m-3, respectively. It was find for both studied cases that the plant root system concenters in the first 0,40 m (70%) and around the clump (planting region) / Mestrado / Agua e Solo / Mestre em Engenharia Agrícola

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