Thesis (Ph. D.)--University of Melbourne, 1994. / Typescript (photocopy). Includes bibliographical references (leaves 235-246).

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:28:37Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2002-03Bitstream added on 2014-06-13T18:35:02Z : No. of bitstreams: 1 lombardi_apz_me_botfca.pdf: 581931 bytes, checksum: 9814a2183bbedf87f52d22c5bc7aef25 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / A cercosporiose do cafeeiro, causada por Cercospora coffeicola Berk e Cooke, é uma doença importante porque prejudica o desenvolvimento do cafeeiro, principalmente em condições de viveiro, pela intensa desfolha, raquitismo e atraso no crescimento. Em 1998, notou-se, em uma propriedade em Santa Juliana, Minas Gerais, intensa desfolha de plantas no campo e presença de manchas grandes e típicas daquelas causadas por Cercospora, e os exames das lesões mostraram conídios longos, mais finos na sua espessura, hialinos e multiseptados, sendo a morfologia dos conídios diferente da verificada no material provenientes de Paracatu, Monte Carmelo e Santa Juliana, cidades situadas em Minas Gerais, em 1986. Essas diferenças apresentadas na morfologia dos conídios foram atribuídas a hipóteses, como a influência do ambiente, em função da época do ano ou a existência de mais de um gênero do fungo provocando sintomas semelhantes nas folhas dos cafeeiros. Os estudos realizados para caracterizar os isolados de Cercospora do cafeeiro, coletados em diversos municípios dos estados de São Paulo e Minas Gerais, através da patogenicidade, morfologia dos conídios, fisiologia, técnicas moleculares e sensibilidade a fungicidas, indicaram a inexistência de correlação entre esses parâmetros... / Cercospora coffeicola Beerk e Cooke is a fungus which causes an important disease on coffee trees resulting on leaves shedding and slowing plant development. In 1998, one isolate was selected in Santa Juliana, Minas Gerais State, Brazil, wich have longer and narrow spores when compared isolates collected in Paracatú, Monte Carmelo and Santa Juliana counties, in 1986. Studies were made to characterize and compare different isolates by pathogenicity test, conidia morphology, growth physiology, molecules characteristics and fungicides sensibility. By conidia morphology three groups of isolates were characterized differing by conidia lengh, width and number of septa. Physiological characterization showed no correlation between mycelium growth on different media e conidia production. The best sporulation was observed when the fungus was growed on V-8 medium. By in vitro test it was showed that minimum inhibitory concentration for fungus growing in the presence of fungicides (azoxystrobin, benomyl, chlorothalonil, tebuconazole, propiconazole, oxicloreto de cobre e methalaxyl-mancozeb) varied as a function of isolates.

Frogeye leaf spot, caused by Cercospora sojina Hara, is a foliar disease affecting soybean (Glycine max (L.) Merr.), often managed by applications of quinone outside inhibitor (QoI) fungicides. In 2013 and 2014, symptomatic leaf samples were collected from Mississippi soybean fields leading to the collection of 634 mono-conidial C. sojina isolates. In vitro bioassays were performed to evaluate the sensitivity of 14 isolates plus a baseline. Resistant and sensitive isolates were characterized by determining the effective fungicide concentrations at which 50% of conidial germination was inhibited (EC50). Additionally, the molecular mechanism of resistance was determined for all 634 isolates. Greater than 93% of C. sojina isolates collected in Mississippi carried the G143A amino acid substitution indicating a shift to a QoI-resistant population throughout Mississippi soybean fields. Greenhouse studies confirmed that due to this amino acid substitution, symptoms caused by QoI-resistant isolates developed in spite of a QoI fungicide application.

Soybean is an economically important crop. It is a selfertilized species grown on vast contiguous acres. These facts predispose soybean to disease epidemics. Cercospora sojina, causal agent of frogeye leaf spot, has reduced United States soybean productivity 0.3 percent on average per year between 2008 and 2010. Several states have reported the pathogen developing resistance to the strobilurin class of fungicides. To date genetic host resistance has been identified as single dominant genes (Rcs1, Rcs2, and Rcs3). However, the lifespans of Rcs1 and Rcs2 were 10 and 16 years respectively. Currently, the Rcs3 locus has been utilized in all major soybean breeding programs of the US and has been for over 20 years. Seventyive accessions of soybean were found to exhibit resistance to multiple races of C. sojina while not exhibiting the Rcs3 haplotype. Twenty of these plant introductions (PIs) were screened by six races within the new race classification system of C. sojina representing all domestic variability of the pathogen. Two agronomically favorable PIs, PI398993 and PI399068, were found in this research to exhibit broad resistance to sources documented to contain most domestic variability of the pathogen. Two segregating populations were developed by crossing PI398993 x ‘Blackhawk’ and PI399068 x Blackhawk. Segregation ratios of F2 as well as F2:3 family seedling screens of both populations indicating single dominant gene action in both resistance sources. Single marker analysis indicated markers associated with the phenotype were indeed on chromosome 16 (MLG J), but possibly beyond Rcs3 in both sources. Interval mapping placed the highest probability of the resistance loci near SNP_171 and SNP_368, 72.86 and 72.48 cM respectively, but distal to the Rcs3 locus. Analysis of reaction ratings also indicated significant influence on phenotype was also associated with markers located at or beyond the published Rcs3 locus. The evidence in this research supports the hypothesis that both PIs may contain a resistance loci, potentially different than Davis, but within the same gene cluster. Equally as likely, the resistance could prove allelic to Davis.

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Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2017-02-08T10:27:46Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 916784 bytes, checksum: 03475d7989277b617f66a3b91500defc (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-08T10:27:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 916784 bytes, checksum: 03475d7989277b617f66a3b91500defc (MD5) Previous issue date: 2016-10-14 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Muitas espécies de Cercospora são patógenos generalistas. A versatilidade das espécies de Cercospora associadas ao Crestamento Foliar de Cercospora (CFC) e Mancha Púrpura da Semente (MPS) na soja parece ser historicamente subestimada. Neste trabalho, foram montados bancos de dados moleculares concatenados de sete genes nucleares e um mitocondrial, com sequências de 30 isolados fúngicos amostrados em hospedeiros alternativos à soja do Brasil (15 espécies) e Estados Unidos (seis espécies). Um conjunto de ferramentas complementares foi utilizado para explorar as relações filogenéticas e filogeográficas dos isolados de Cercospora associadas ao CFC e MPS na soja e de outros hospedeiros. A produção de cercosporina e a incidência das mutações de ponto E198G e G143A – duas mutações que conferem resistência a fungicidas – foram investigadas. Entre as cinco linhagens genealógicas de Cercospora associadas ao CFC e MPS, apenas a linhagem 1 foi hospedeiro específica, sendo encontrada somente na soja. As linhagens restantes foram generalistas, uma vez que foram encontradas causando o CFC e MPS na soja e manchas foliares em plantas daninhas e ornamentais. Os isolados foram agrupados nas linhagens de acordo com suas origens geográficas e não foi correlacionada com o hospedeiro de origem. A ausência de compartilhamento de hospedeiros entre isolados do Brasil e EUA sugere que a soja compartilha seus patógenos com outras espécies em escala local. Todos os isolados foram produtores da toxina cercosporina e tanto isolados provenientes da soja quanto de outros hospedeiros foram portadores das mutações pontuais G143A e E198G. Para analisar a distribuição geográfica das linhagens de Cercospora associadas ao CFC e MPS no Brasil e EUA, bem como essas linhagens estão distribuídas nos órgãos da planta foram utilizados 329 isolados coletados em 11 localidades do Brasil e quatro nos EUA. Oito genes nucleares e um mitocondrial foram sequenciados mostrando a existência de duas linhagens genealógicas adicionais às outras cinco previamente descritas. Três dessas linhagens foram endêmicas no Brasil, duas foram endêmicas nos EUA e outras duas estão presentes nos dois países. As sete linhagens foram encontradas em folhas, caule e sementes. A presença de espécies crípticas associadas ao CFC e a MPS na soja alertam para o risco fitossanitário decorrente do erro de identificação de agentes causais de doenças com base apenas no hospedeiro. / Many Cercospora spp. are multihost pathogens. The versatility of Cercospora newly associated with cercospora leaf blight (CLB) and purple seed stain (PSS) in soybeans seems to have been historically underestimated. Herein, we assembled multilocus sequence data of seven nuclear and one mitochondrial gene regions with sequences from 30 fungal isolates sampled from nonsoybean host species from Brazil (15 species) and United States (six species). An array of complementary tools explored the phylogenetic and phylogeographic relationships among CLB- and PSS-causing Cercospora and the newly isolated Cercospora spp. Cercosporin production and the incidence E198G and G143A — two known point mutations associated with fungicide resistances — were investigated. Among the five genealogical lineages of CLB- and PSS-causing Cercospora, only Lineage 1 showed host specificity; this lineage had C. kikuchii as the only member and infected soybeans exclusively. The remaining four lineages were multihost pathogens; they infected soybeans along with ornamental and weed species. Genealogical placements were unrelated to host association; isolates clustered together according to geography. The lack of host sharing between Brazil and USA suggested that soybean crops shared pathogens with nearby nonsoybean host species locally. All isolates belonged to cercosporin-producing species of Cercospora. Isolates from nonsoybean host species exhibited both E198G and G143A. To analyze the geographical distribution of Cercospora lineages associated with CLB and PSS in Brazil and USA and the lineages distribution in the soybean organs we used 329 isolates collected in 11 locations in Brazil and four in the United States. Eight nuclear genes and mitochondrial were sequenced showing the existence of two additional lineages to the other five previously described. Three of these lines were endemic in Brazil, two were endemic in the US and other two are present in both countries. The seven lineages were found in leaves, stems and seeds. The presence of cryptic species causing CLB and PSS in soybean alert for phytosanitary risk due to taxonomic errors considering host specificity of Cercospora.

Tanto a mancha parda (Septoria gliycines Hemmi) quanto o crestamento foliar de cercospora (Cercospora kikuchii (Matsu. & Tomoyasu) Gardner) estão disseminados por todas as regiões produtoras de soja no Brasil. Ambas ocorrem na mesma época e, devido às dificuldades que apresentam nas avaliações individuais, são consideradas como um complexo de doenças de final de ciclo. O maior dano causado por esse complexo de doenças se deve à antecipação da desfolha. Sabe-se que antecipação da desfolha promove redução na produção, a qual geralmente se deve ao menor tamanho dos grãos. Com o objetivo de melhor compreender os danos causados pelas doenças de final de ciclo, foi conduzido um experimento para avaliar os efeitos dessas doenças na duração da área foliar sadia (HAD) da soja, procurar relações entre a severidade da doença e produção, bem como identificar o melhor estádio fenológico e dose de fungicida para o controle dessas doenças. Com base nos resultados obtidos, pôde-se concluir que: a) as doenças foliares de final de ciclo causaram perdas na produção da soja na ordem de 21%, sendo a redução no peso de 1000 grãos o principal fator de perda quantitativa; b) embora a análise estatística tenha demonstrado não haver diferenças significativas quanto à época de aplicação dos fungicidas (estádio R5.3 x estádio R4 repetindo-se a aplicação 15 dias mais tarde) em relação à produção e ao peso de 100 grãos de soja, os maiores valores absolutos das variáveis acima mencionadas foram conseguidos, para ambos os fungicidas, com uma aplicação de 500 g do produto comercial no estádio R4 de desenvolvimento da cultura da soja, seguida de outra aplicação da mesma quantidade do produto comercial 15 dias após primeira; c) o uso da variável severidade não se apresentou como uma boa indicadora para se prever ou estimar reduções na produção, haja vista a falta de relação que esta variável (severidade) apresenta com a mesma (produção); d) a duração da área foliar sadia (HAD) é uma variável de avaliação que apresenta relações significativas com a produção e peso de 1000 grãos, podendo ser utilizada no patossistema soja-doenças foliares de final de ciclo, uma vez que estas doenças afetam diretamente a HAD. / not available

Tanto a mancha parda (Septoria gliycines Hemmi) quanto o crestamento foliar de cercospora (Cercospora kikuchii (Matsu. & Tomoyasu) Gardner) estão disseminados por todas as regiões produtoras de soja no Brasil. Ambas ocorrem na mesma época e, devido às dificuldades que apresentam nas avaliações individuais, são consideradas como um complexo de doenças de final de ciclo. O maior dano causado por esse complexo de doenças se deve à antecipação da desfolha. Sabe-se que antecipação da desfolha promove redução na produção, a qual geralmente se deve ao menor tamanho dos grãos. Com o objetivo de melhor compreender os danos causados pelas doenças de final de ciclo, foi conduzido um experimento para avaliar os efeitos dessas doenças na duração da área foliar sadia (HAD) da soja, procurar relações entre a severidade da doença e produção, bem como identificar o melhor estádio fenológico e dose de fungicida para o controle dessas doenças. Com base nos resultados obtidos, pôde-se concluir que: a) as doenças foliares de final de ciclo causaram perdas na produção da soja na ordem de 21%, sendo a redução no peso de 1000 grãos o principal fator de perda quantitativa; b) embora a análise estatística tenha demonstrado não haver diferenças significativas quanto à época de aplicação dos fungicidas (estádio R5.3 x estádio R4 repetindo-se a aplicação 15 dias mais tarde) em relação à produção e ao peso de 100 grãos de soja, os maiores valores absolutos das variáveis acima mencionadas foram conseguidos, para ambos os fungicidas, com uma aplicação de 500 g do produto comercial no estádio R4 de desenvolvimento da cultura da soja, seguida de outra aplicação da mesma quantidade do produto comercial 15 dias após primeira; c) o uso da variável severidade não se apresentou como uma boa indicadora para se prever ou estimar reduções na produção, haja vista a falta de relação que esta variável (severidade) apresenta com a mesma (produção); d) a duração da área foliar sadia (HAD) é uma variável de avaliação que apresenta relações significativas com a produção e peso de 1000 grãos, podendo ser utilizada no patossistema soja-doenças foliares de final de ciclo, uma vez que estas doenças afetam diretamente a HAD. / not available

During the summer 1988 and 1989, surveys were conducted on the muck soils, South of Montreal to estimate the prevalence and incidence of the carrot diseases. Cercospora blight was the most prevalent disease; 91% and 96% of the fields and 99% and 92% of the plants sampled were diseased in 1988 and 1989, respectively. In decreasing order of occurrence the diseases present were: Crown gall, Alternaria blight, Root Knot, Sclerotinia rot and Aster yellows. / Greenhouse and field studies were carried out to evaluate partial resistance to Cercospora blight in 111 carrot cultivars based on the mean incubation period (MIP), the proportion of leaf area diseased (PLAD), and the sporulation / mm$ sp2$ lesion area (SPO). Significant differences among varieties were observed for all the parameters studied under greenhouse conditions and a significant negative correlation was found between PLAD and MIP (r = $-$0.29). Resistance equivalents were calculated for the PLAD, as proportions of the cultivar Dagger, so that they could be incorporated in a fundamental forecast model.