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Avaliação genética de crescimento e resistência a verminoses em ovinos Santa Inês utilizando modelos de regressão aleatória e análises multivariadas / Genetic evaluation of growth and resistance to gastrointestinal nematode parasites in Santa Ines sheep using random regression models and multivariate analyzesFreitas, Luara Afonso de 21 February 2018 (has links)
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Previous issue date: 2018-02-21 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / O uso de raças ou animais resistentes aos endoparasitas dentro do sistema de produção de ovinos de carne é uma das alternativas mais eficientes para se obter maior produção. O controle dos acasalamentos entre animais aparentados é de grande importância para reduzir perdas na produção pelo aumento da homozigose de alelos deletérios. O peso corporal é uma das características de maior importância econômica em ovinos e pode ser registrado ao longo da vida de um mesmo animal. Os modelos de regressão aleatória na avaliação genética de medidas longitudinais são geralmente recomendados para estimar parâmetros genéticos de dados longitudinais. As análises multivariadas são um conjunto de métodos estatísticos que torna possível a análise simultânea de medidas múltiplas para cada indivíduo ou fenômeno observado. Este trabalho teve como objetivos: (1) analisar a estrutura populacional e verificar o efeito da endogamia sobre características fenotípicas de crescimento e resistência a verminose, (2) comparar estruturas (homogeneidade e heterogeneidade de variâncias) para modelar a variância residual em modelos de regressão aleatória, (3) avaliar a influência desta modelagem na estimação de parâmetros genéticos a fim de determinar o modelo mais apropriado para estudar o crescimento e a resistência à verminose e (4) avaliar a associação genética e explorar o perfil genético da produção de carne e resistência à verminose em ovinos da raça Santa Inês. O banco de dados fenotípico conteve 2.159 registros de peso corporal oriundos de 753 animais, 1.468 registros de volume globular provenientes de 476 animais e 981 registros de contagem de ovos por grama de fezes oriundos de 375 animais entre 30 a 900 dias de idade medidos mensalmente e registros de pedigree de 2.410 animais da raça Santa Inês. Os animais foram divididos em 10 classes de idade (CI90 = 30 a 90 dias de idade CI180= 91 a 180 dias de idade, CI270= 181 a 270 dias de idade, CI360= 271 a 360 dias de idade, CI450= 361 a 450 dias de idade, CI540= 451 a 540 dias de idade, CI630= 541 a 630 dias de idade, CI720= 631 a 720 dias de idade, CI810= 721 a 810 dias de idade, CI900= 811 a 900 dias de idade). A estrutura do pedigree foi analisada utilizando o programa Endog 4.8. As análises de estimação dos componentes de variância foram realizadas por meio de modelo animal unicaracterística de regressão aleatória pelo método de máxima verossimilhança restrita utilizando polinômios de Legendre. O critério da informação bayesiana foi utilizado para selecionar o melhor modelo. A análise de componentes principais foi realizado no software STATISTIC e a analise de agrupamento hierárquico e não hierárquico no software R. Foi observado aumento no coeficiente de endogamia até a 6ª geração máxima, aumento do parentesco médio e da porcentagem de animais endogâmicos até a 7ª geração máxima. O polinômio de Legendre de ordem 3 (intercepto, linear e quadrático) proporcionou o melhor ajuste dos dados para peso corporal, volume globular e contagem de ovos por grama de fezes. A seleção dos animais poderia ser feita com base no peso corporal a partir de 271 dias de idade, pois a estimativa de herdabilidade foi de 0,23 (0,03) e foram altas as correlações genéticas do peso corporal nesta idade com a maioria dos pesos corporais nas demais idades, exceto com peso corporal medida entre 30 a 90 dias de idade. A seleção destes animais para resistência a verminose se realizada poderá ser pouco eficiente devido às baixas estimativas de herdabilidade para volume globular (0,09±0,01 a 0,18±0,02) e contagem de ovos por grama de fezes (0,01±0,02 a 0,17±0,03), portanto, o ganho genético será a longo prazo. A seleção para peso corporal poderia trazer ganhos genético favoráveis para a característica volume globular devido à proximidade das características no eixo do componente principal um. Nas análises de agrupamento apenas um dos três grupos genéticos identificados apresentou perfil genético indicado para a seleção para peso corporal e volume globular. / The use of resistant animals to gastrointestinal nematode parasites within the meat production system is one of the most efficient alternatives to increase meat yield in sheep. The control of mating between related animals is of great importance to reduce losses in meat production by increasing the homozygosity of deleterious alleles. Application of Random regression models in the genetic evaluation of longitudinal measurements is generally recommended to adjust growth curves and to estimate genetic parameters of longitudinal data. The multivariate analyzes are a set of statistical methods that make possible the simultaneous analysis of multiple measures for each individual or observed phenomena. The aims of this study were: (1) to analyze the population structure and verify the effect of inbreeding on phenotypic traits of growth and resistance to gastrointestinal nematode parasites, (2) to compare structures (homogeneity and heterogeneity of variances) to model residual variance in random regression models, (3) to study the influence of this modeling in the estimation of genetic parameters in order to determine the most appropriate model to study the growth and resistance to gastrointestinal nematode parasites curves, and (4) evaluate the genetic association and explore the genetic profile of meat production and resistance to gastrointestinal nematode parasites in Santa Inês sheep. The data contained 2,159 body weight records from 753 animals, 1,468 mean corpuscular volume records from 476 animals and 981 records of fecal egg counts from 375 animals and pedigree information from 2,410 in Santa Ines sheep. The animals were divided into 10 age classes (CI90 = 30 to 90 days of age CI180 = 91 to 180 days of age, CI270 = 181 to 270 days of age, CI360 = 271 to 360 days of age, CI450 = 361 to 450, CI540 = 451 to 540 days of age, CI630 = 541 to 630 days of age, CI720 = 631 to 720 days of age, CI810 = 721 to 810 days of age, CI900 = 811 to 900 days of age). The structure of the pedigree was analyzed using the program Endog 4.8. Analyzes of the variance component estimates were performed using a one-trait model of random regression using the restricted maximum likelihood method. The Bayesian information criterion was used to select the best model. The principal component analysis was performed in STATISTIC software and hierarchical and non-hierarchical analysis grouping was performed in the software R. There was an increase in the inbreeding coefficient up to the 6th maximum generation and also an increase in the average relatedness and in the percentage of inbred animals up to the 7th maximum generation. Genetic correlation estimates for all traits in the age classes presented values close to the unit at close weighings, with a reduction in the magnitude of the correlations as the time interval between weighings increased. The Legendre polynomial of order 3 (intercept, linear and quadratic) provided the best fit of the data for body weight, mean corpuscular volume, and fecal egg counts. The selection of the animals could be made based on body weight from 271 days of age, as the heritability estimate was moderate, 0.23 (0.03), and showed high genetic correlations with most body weights, except with body weight from 30 to 90 days of age. Selection of these animals for resistance to gastrointestinal nematode parasites if carried out may result in low efficiency due to the low estimates of heritability for the mean corpuscular volume (0.09 ± 0.01 to 0.18 ± 0.02) and fecal egg counts (0.01 ± 0.02 to 0.17 ± 0.03), therefore, the genetic gain will be low and in the long term. The selection of body weight could bring favorable genetic gains to the mean corpuscular volume due to the proximity of the traits in the axis of the main component one. In cluster analysis, only one of the three genetic groups identified has a genetic profile indicated for selection for the studied traits. / 2016/10583-1
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Diversidade fenotípica e determinação do teor de óleo em pinhão-manso por espectroscopia no infravermelho próximo / Phenotypic diversity and determination of oil content in jatropha by near infrared spectroscopyMoraes, Amanda Carolina Prado de [UNESP] 29 April 2016 (has links)
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Previous issue date: 2016-04-29 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / O objetivo do presente trabalho consistiu em caracterizar a diversidade fenotípica em genótipos de pinhão-manso através de análises multivariadas, além de desenvolver um modelo de calibração para a determinação do teor de óleo por meio da espectroscopia do infravermelho próximo (NIR) visando a seleção de genótipos com alto teor de óleo. Para a análise fenotípica, foram avaliados 11 caracteres agronômicos em 165 genótipos de pinhão-manso pertencentes ao banco de germoplasma in vivo localizado no Departamento de Produção Vegetal da UNESP/FCAV, Jaboticabal, SP. Os caracteres utilizados foram: altura da planta, diâmetro do caule, número de ramificações primárias, comprimento de fruto, largura de fruto, peso de fruto, formato de fruto, comprimento de semente, largura de semente, peso de semente e teor de óleo. Os dados foram submetidos à análise de componentes principais (PCA), análise de agrupamento pelo método hierárquico de Ward e método não hierárquico k-médias. O caráter formato de fruto foi retirado das análises multivariadas por ser de natureza qualitativa. Na PCA, os 4 CPs explicaram 71,62% da variância total. Os caracteres de maior contribuição para a discriminação dos genótipos no CP1 foram peso de semente, largura de fruto, comprimento de fruto e peso de fruto. Destacaram-se 22 genótipos promissores com potencial para serem explorados em programas de melhoramento genético. O dendrograma obtido pela análise de agrupamento de Ward e para a análise de k-médias geraram nove grupos, dos quais 5 agruparam genótipos com características vantajosas. As análises multivariadas permitiram a caracterização dos genótipos, possibilitando a seleção para muitos caracteres avaliados e a indicação de estratégias de ganhos com a seleção, para programas de melhoramento genético. Para a construção da curva de calibração e validação para teor de óleo, foram utilizadas sementes de 174 plantas, que tiveram o óleo extraído pelo método "Soxhlet" para obtenção dos valores de referência, que foram entre 50,27% a 63,21% (m/m) de óleo. Os espectros foram coletados das sementes sem tegumento, intactas, por acessório de rotação, por meio da espectroscopia por infravermelho próximo (NIR) em equipamento modelo Tango, Bruker. Cada espectro foi retirado com uma média de 64 scans com resolução de 16 cm-1. As regiões espectrais selecionadas para a curva de calibração foram de 8992 a 7424 cm-1 e 5336 a 4928 cm-1. Os coeficientes de correlação (R2) da curva construída foram de 73,23% para calibração e de 70,79% para validação, sendo o erro quadrado médio de calibração (RMSEC) de 1,35 e o erro quadrado médio de validação cruzada (RMSECV) de 1,40 entre os dados obtidos pelo método de referência e pelo NIR. Os resultados indicaram que o teor de óleo da espécie Jatropha curcas L. pode ser estimado por NIR, e o método de referência utilizado foi satisfatório, apresentando boa correlação com a informação espectral, tornando a curva construída confiável. Contudo, futuramente é necessária a adição de novos valores para a melhoria da sua robustez e amplitude. / The purpose of this study was to characterize the phenotypic diversity in Jatropha genotypes by multivariate analysis, and developing a calibration model for determination oil content by Near-infrared spectroscopy (NIR) in order to select genotypes with high oil content. For the phenotypic analysis, 11 agronomic characters were evaluated in 165 genotypes of Jatropha belonging to the germplasm bank in vivo located in the Department of Plant Production UNESP / FCAV, Jaboticabal, SP. The characters were: plant height, stem diameter, number of primary branches, fruit length, fruit width, fruit weight, fruit shape, seed length, seed width, seed weight and oil content. The data were submitted to principal component analysis (PCA), cluster analysis by the hierarchical method of Ward and non- hierarchical method of k-means. The character fruit shape was removed from multivariate analysis for being qualitative. In PCA, the 4 PCs explained 71.62% of the total variance. The greatest contribution of the characters to discriminate the genotypes in PC1 were seed weight, fruit width, fruit length and fruit weight. They highlighted 22 promising genotypes with potential to be exploited in breeding programs. The dendrogram obtained by Ward cluster analysis and the k-means analysis generated nine groups, 5 of which grouped genotypes with advantageous features. Multivariate analyzes allowed the characterization of the genotypes, allowing the selection for many traits and indicating gains strategies with selection for genetic improvement programs. For the construction of the calibration and validation curve for oil content of seeds were used 174 plants that had oil extracted by the method "Soxhlet" to obtain reference values which were between 50.27 to 63% 21% (m/m) of oil. The spectra were collected from intact seeds without husk by attachment rotation through near-infrared spectroscopy (NIR) in Tango machine model, Bruker. Each spectrum was taken with an average of 64 scans with a resolution of 16 cm-1. The spectral regions chosen for the calibration curve were 8992-7424 cm-1 and 5336-4928 cm-1. The correlation coefficients (R2) of the curve constructed were 73,23% for calibration and 70,79% for validation, the calibration mean square error (RMSEC) was 1,35 and cross validation mean square error (RMSECV) was 1,40 between the data obtained by the reference method and the NIR. The results indicated that the oil content of Jatropha curcas L. can be estimated by NIR, and the reference method was satisfactory, with good correlation with the spectral information, making the built curve reliable. However, future addition of new value to improve their robustness and amplitude is required.
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Resistência ao tripes-do-prateamento e seleção em genótipos interespecíficos de amendoim / Resistance to thrips and selection in interspecific genotypes of peanutPirotta, Melina Zacarelli [UNESP] 25 May 2016 (has links)
Submitted by MELINA ZACARELLI PIROTTA null (melina_pirotta@hotmail.com) on 2016-07-18T21:21:22Z
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Dissertação MelinaPirotta.pdf: 1657280 bytes, checksum: 28a5e7bf7037eb99bdc6bf02f5f176a0 (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Paula Grisoto (grisotoana@reitoria.unesp.br) on 2016-07-20T13:26:33Z (GMT) No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 2016-05-25 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / O amendoim (Arachis hypogaea L.) é uma cultura oleaginosa de grande importância para o agronegócio brasileiro. Um dos principais fatores que afetam sua produção é a incidência de pragas, com destaque para o tripes-do-prateamento, Enneothrips flavens, Moulton, 1941 (Thysanoptera: Thripidae). Têm-se sugerido que genes que condicionam a resistência genética a esta praga, podem ser encontrados em outras espécies do gênero Arachis L. Entretanto, a utilização de espécies silvestres no melhoramento, torna-se dificultada por barreiras de esterilidade, sendo a maioria devido às diferenças de constituição do genoma e de ploidia. Para contornar essa incompatibilidade, sugeriu-se a obtenção de anfidiploides, resultantes do cruzamento de espécies diploides, seguido da duplicação de seus cromossomos, para então cruzá-los com o amendoim cultivado. Mediante o exposto, este trabalho teve como objetivos estudar o potencial de resistência ao tripes-do-prateamento em populações segregantes iniciais do cruzamento envolvendo a cultivar comercial IAC 503 e o anfidiploide sintético (A. magna x A. cardenasii)4x, monitorar os caracteres indicadores de proximidade agronômica dos segregantes interespecíficos com genótipos da espécie cultivada, bem como a seleção de genótipos superiores por meio de análises uni e multivariadas. Os experimentos foram conduzidos no esquema de blocos aumentados de Federer com testemunhas intercalares em duas gerações: F3, conduzida no ano agrícola de 2013/14 e F4, conduzida em 2014/15, sob infestação natural do inseto. A resistência ao tripes foi avaliada por meio de sua infestação e pelos sintomas de injúrias causadas pelo inseto. Foram avaliados também, alguns componentes de produção como indicadores da proximidade dos genótipos segregantes ao cultivado. Para estes caracteres, foram utilizadas as estimativas dos componentes genéticos, ganho genético e predição dos valores genéticos, calculados via modelos mistos (REML/BLUP). Para as análises multivariadas foram utilizadas as técnicas de componentes principais, análise de agrupamento hierárquico e não hierárquico com os dados das progênies de geração F4. Os resultados deste trabalho demonstram que as análises univariada e multivariada foram eficientes na seleção das melhores progênies, evidenciando a superioridade agronômica das mesmas, quanto aos componentes de produção e de resistência ao tripes. Porém, apesar de algumas progênies segregantes selecionadas como resistentes apresentarem bons componentes de produção, seu grau de adequação agronômica aos genótipos A. hypogaea L. ainda é pequeno. Assim, a identificação de progênies com resistência ao tripes geneticamente próximas às espécies do gênero Arachis L., constitui interessante fonte para estratégias futuras de introgressão gênica, podendo para isso, ser utilizado o método dos retrocruzamentos para inserção dos genes desejáveis de resistência e consequente recuperação dos genótipos adaptados, obtendo-se ao final do processo seletivo, cultivares comerciais portadoras de resistência ao tripes e com caracteres agronômicos e comerciais superiores. / The peanut (Arachis hypogaea L.) is an oilseed crop of great importance for Brazilian agribusiness. One of the main factors affecting its production is pests incidence, mainly thrips, Enneothrips flavens, Moulton, 1941 (Thysanoptera: Thripidae). There have suggested that genetic resistance to this pest can be found in other species of the genus Arachis L. However, the use of wild species in breeding was hampered by sterility barriers, mostly due to differences in the genome constitution and ploidy. To work around this incompatibility, it was suggested obtaining amphidiploid, resulting from the crossing of diploid species, followed by duplication its chromosomes, and then cross them with cultivated peanut. Through the above, this study aimed to study the potential for resistance to thrips in early segregating populations crossing involving commercial cultivar IAC 503 and synthetic amphidiploid (A. magna x A. cardenasii) 4x, monitor the agronomic traits proximity indicators of interspecific segregating with cultivated species, as well as the selection of superior genotypes using univariate and multivariate analyses. The experiments were conducted on the Federer augmented blocks with additional checks in two generations: F3, conducted in the agricultural year of 2013/14 and F4, conducted in 2014/15, under natural insect infestation. The thrips resistance was evaluated by its infestation, and the symptoms of injuries caused by insects. It was also evaluated, some production components such as proximity indicators of segregating the genotypes grown. To do so, estimates were used genetic components, genetic gain and prediction of breeding values calculated by mixed models (REML/BLUP). For multivariate analyses were used progenies in F4 generation, through technique principal components and cluster analysis. The results show that the univariate and multivariate analyses were effective in selection the best progenies, demonstrating the agronomic superiority of the same, as the components of production and resistance to thrips. However, despite some segregating progenies selected as resistance present good production components, the degree of agronomic suitability to the genotype A. hypogaea L. is still small. Thus, the identification of progenies with genetic resistance to thrips next to genus Arachis L. is an interesting source for future strategies of gene introgression, using the backcrossing method for insertion desirable genes of resistance and posteriorly recovery of adapted genotypes, getting to the end of the selective process, commercial cultivars with thrips resistance and good agronomic traits.
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Diferenciação do leite convencional e orgânico, por análises de isótopos estáveis e de compostos antioxidantes /Aono, Natalia Mitiko, 1987. January 2014 (has links)
Orientador: Carlos Ducatti / Coorientador: Giuseppina Pace Pereira Lima / Banca: Maria Márcia Pereira Sartori / Banca: Sérgio Marques Costa / Resumo: A demanda por alimentos orgânicos tem crescido nitidamente nos últimos anos, sobretudo pelos produtos lácteos. Logo, técnicas que permitam a autenticação dos mesmos são de grande importância para o consumidor assegurar-se de que está ingerindo um alimento genuinamente orgânico. Desta forma, o objetivo deste estudo foi diferenciar amostras de leites bovinos produzidos em sistemas convencional e orgânico, por meio das razões isotópicas de carbono e nitrogênio, do teor de polifenóis totais e da capacidade antioxidante, além de investigar o efeito da pasteurização sobre esses compostos antioxidantes. Oito amostras de leite cru foram colhidas de quatro fazendas (duas convencionais - Conv 1 e 2 - e duas orgânicas - Org 1 e 2) e uma porção de cada uma foi submetida à pasteurização lenta. Amostras cruas e pasteurizadas foram congeladas, liofilizadas e moídas para a condução das análises. Houve diferença (p<0,05) entre todas as fazendas para ambos os isótopos, exceto entre Org 1 e Conv 2 para δ13C, e entre Org 1 e Conv 1 para δ15N. Para polifenóis, houve diferença (p<0,05) entre as fazendas convencionais, mas não entre as orgânicas, sendo que, entre sistemas distintos, houve diferença entre Conv 1 e Org 2 e entre Conv 2 e Org 1. A pasteurização não afetou (p>0,05) o teor de polifenóis dos leites. A análise de componentes principais permitiu uma distinção mais clara entre todas as fazendas, sendo a razão isotópica ... / Abstract: The demand for organic food has increased sharply in recent years, especially for dairy products. Therefore, procedures for their authentication have a great importance for consumers to assure that food they are purchasing is genuinely organic. Thus, the aim of this study was to differentiate bovine milk samples produced in organic and conventional systems, by stables isotopes ratios of carbon and nitrogen, total polyphenols content and antioxidant capacity, in addition to investigate the effect of pasteurization on these antioxidant compounds. Eight samples of raw milk were collected from four farms (two conventional - Conv 1 and 2 - and two organic - Org 1 and 2) and a portion of each one was subjected to slow pasteurization. Raw and pasteurized samples were frozen, freeze-dried and ground for the conduct of analyzes. There were differences (p<0.05) between all farms for both isotopes, except between Org 1 and Conv 2 for δ13C, and between Org 1 and Conv 1 for δ15N. For polyphenols, there were differences (p<0.05) between conventional farms, but not between organic farms, and about distinct systems, there were differences between Conv 1 and Org 2 and between Conv 2 and Org 1. The pasteurization did not affect (p>0.05) the polyphenol content in milk. Principal component analysis allowed a clearer distinction between all farms, and stable nitrogen isotope ratio was the variable that most contributed to the distinction / Mestre
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Relação solo-vegetação em área de cerrado no nordeste do Maranhão, Brasil /Martins, Fredgardson Costa. January 2014 (has links)
Orientador: José Marques Junior / Coorientador: Nivaldo de Figueiredo / Banca: Gener Tadeu Pereira / Banca: Maria Esmeralda Soares Payão Demattê / Banca: Mara de Andrade Marinho / Banca: André Luiz Gomes da Silva / Resumo: A vegetação do bioma Cerrado é predominantemente constituída por fisionomias savânicas (cerrado lato sensu). Os fatores que determinam a distribuição das diferentes fisionomias estão em constante debate, e têm sido relacionados principalmente a gradientes de fertilidade, profundidade do solo, disponibilidade hídrica, ocorrência de fogo, pressão antrópica e topografia. Entretanto, não são raros os estudos que têm encontrado resultados antagônicos ou não alinhados a esses. Neste sentido, com este estudo, pretendeu-se contribuir para o entendimento dessas questões, buscando responder às seguintes perguntas: existem diferenças florísticas e estruturais na vegetação e nos atributos do solo entre fisionomias previamente classificadas como cerradão e cerrado ralo? O cerradão ocorre em solos mais férteis e/ou com condições físicas menos restritivas que aquelas onde ocorre o cerrado ralo? Para isso, relacionamos atributos físicos e químicos do solo, assim como os padrões florísticos (riqueza e composição de espécies) e estruturais (densidade, área basal, etc.) da comunidade vegetal de três fragmentos de cerrado (cerradão, cerradão "degradado" e cerrado ralo) do nordeste do Maranhão, localizados muito próximos um do outro, em solos taxonomicamente iguais e, portanto, sujeitos a semelhantes influências ambientais e fatores pedogenéticos. Os fragmentos estudados estão inseridos num mosaico de paisagem constituído por remanescentes de áreas de cerrados em níveis diferenciados de degradação. Para as análises do solo, em cada fragmento de cerrado, foram retiradas 49 amostras do solo na camada de 0-0,10 m de profundidade, distribuídas em uma malha amostral quadrada com espaçamento regular de 15 m. As amostras foram coletadas no ponto de cruzamento entre as linhas da malha amostral. As coletas foram realizadas entre os meses de abril e maio de 2013. O levantamento fitossociológico foi realizado ... / Abstract: The vegetation of the Cerrado biome (Brazilian savanna) is predominantly composed of cerrado physiognomies (cerrado lato sensu). The determining factors on the cerrado physiognomies distribution have been continuously in question, and have been primarily related to gradients of fertility, soil depth, water availability, occurrence of fire, human disturbance and topography. However, there are few studies that have found opposing results or not aligned to these. In this sense, this study was intended to contribute to understanding of these issues, seeking to answer the following questions: Are there floristic and structural differences in vegetation and soil properties faces previously classified as cerradão and cerrado-ralo? Does cerradão occur on soils that are more fertile and/or in mild physical conditions than the cerrado-ralo? For this, we compared physical and chemical soil attributes, as well as floristic patterns (richness and species composition) and structural (density, basal area) of the plant community of three fragments of savanna (cerrado, cerrado "degradado" and cerrado-ralo) of Northeastern state of Maranhão, located very close to each other in taxonomically identical soils, and therefore subject to similar environmental influences and pedogenic factors. The studied fragments are embedded in a landscape mosaic consisting of remaining areas of cerrado in different levels of degradation. For soil analysis, 49 samples were taken in each fragment in the 0-0.10m soil profile, distributed in a square sampling grid with regular spacing of 15 m. Samples were collected at the point of intersection between the lines of the sampling grid. Sampling was carried out between the months of April and May 2013. Phytosociological survey was carried out in 49 circular plots, in which center the soil sample points were located. A sample of plant material was carried out between the months of January 2012 and May 2013. The ... / Doutor
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Estudo sobre a precipita??o simulada no outono na regi?o tropical da Am?rica do Sul atrav?s de downscaling din?mico e previs?o por conjuntoSilva, Aline Gomes da 16 September 2016 (has links)
Submitted by Automa??o e Estat?stica (sst@bczm.ufrn.br) on 2017-03-09T23:04:24Z
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Previous issue date: 2016-09-16 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Cient?fico e Tecnol?gico (CNPq) / Este trabalho apresenta a an?lise do desempenho do m?todo de previs?o por
conjunto atrav?s de Regress?o Linear M?ltipla por Componentes Principais (RCP)
para combinar simula??es, com diferentes configura??es, executadas com um
modelo clim?tico regional (t?cnica downscaling din?mico) a fim de simular a
precipita??o sobre a parte tropical da Am?rica do Sul. As an?lises focaram-se em
duas sub-regi?es do Brasil: Nordeste Brasileiro (NEB) e Amaz?nia (AMZ). O modelo
regional utilizado nas simula??es foi o RegCM4, for?ado por dados do ERA-Interim,
produzidos pelo European Center for Medium-Range Weather Forecast (ECMWF).
Analisaram-se 18 outonos austrais de 1991 at? 2008. Para a composi??o da
previs?o por conjunto foram usados 2/3 do per?odo para treinamento e 1/3 para
valida??o, conforme a t?cnica de holdout. Os resultados foram comparados aos
dados di?rios de precipita??o do Global Precipitation Climatology Center (GPCC) e
com a m?dia aritm?tica (MA) das simula??es, que ? o m?todo geralmente utilizado
para previs?o por conjunto. O modelo RegCM4 apresentou potencialidade para
prever a precipita??o sobre a regi?o tropical da Am?rica do Sul (AS). Al?m disso,
diferentes parametriza??es do modelo podem ser modificadas a fim de torn?-lo mais
eficaz. Entretanto, o bom desempenho do modelo somado ao m?todo de previs?o
por conjunto RCP aumentou a precis?o, comparada ao m?todo MA apresentando:
vieses menos tendenciosos (m?dia pr?xima de zero), enquanto o m?todo MA foi
tendencioso (subestimou a precipita??o); maior captura da variabilidade dos dados
do GPCC e correla??o moderada com os dados do GPCC, enquanto MA obteve
correla??o fraca e maior erro quadr?tico m?dio. Al?m disso, o m?todo RCP
reproduziu, com melhor desempenho, a distribui??o da frequ?ncia de chuva di?ria
ao longo de todo o per?odo para ambas as regi?es. Portanto, a partir da metodologia
desenvolvida e implementada obteve-se melhorias na previs?o da intensidade da
chuvas di?rias sobre a regi?o tropical da Am?rica do Sul. / This study presents an analysis of the performance of the method ensemble
forecasting by Multiple Linear Regression Principal Component (RPC) to combine
simulations with different configurations, performed with a regional climate model
(downscaling dynamic technique) in order to simulate rainfall over tropical portion of
South America. The analysis focused on two sub-regions of Brazil: Northeast Brazil
(NEB) and Amazon (AMZ). The regional model used in the simulations was the
RegCM4, forced by ERA-Interim data produced by the European Center for Medium-
Range Weather Forecast (ECMWF). They analyzed 18 austral autumns (1991 until
2008). For the composition of a prediction ensemble, were used for training period
2/3 and 1/3 for validation, as holdout technique. The results were compared to daily
precipitation data from the Global Precipitation Climatology Center (GPCC) and the
average of the simulations (MA method), which is the method generally used for
ensemble forecasting. The RegCM4 model showed potential to predict rainfall over
the tropical region of AS. Moreover, different parameterization of the model can be
modified to make it more effective. However, the good performance of the model
combined with the RCP method of prediction ensemble increased accuracy
compared to the MA method, with: less biased bias (average close to zero), while the
MA method was biased (underestimated precipitation); greater capture the variability
of GPCC data and moderate correlation with the GPCC data, while MA obtained
weak correlation and greater mean square error. In addition, the reproduced PCR
method improves the performance, the distribution of daily precipitation along the
entire the period for both regions. Therefore, from the developed and implemented
methodology yielded improvements in forecasting intensity of daily rainfall over the
tropical region of South America.
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Determinação do intervalo pós-morte por espectroscopia de fluorescência / Determination of post-mortem interval using in situ tissue optical fluorescenceÉverton Sérgio Estracanholli 17 July 2008 (has links)
Neste trabalho estamos propondo um novo método para a determinação do intervalo pós-morte, tendo em vista a necessidade de métodos que forneçam resultados em um curto período de tempo de análise e, ao mesmo tempo, tenha uma precisão semelhante à dos métodos utilizados atualmente. Além disso, é muito importante que sua aquisição seja viável para as instituições interessadas em tal análise, seja para fins como perícia criminal, instituições de pesquisa, instituto médico-legal ou para re-implante de órgãos amputados. Com estas motivações, o objetivo do trabalho é verificar se a técnica de espectroscopia de fluorescência apresenta sensibilidade suficiente para diferenciar os tecidos que estão em diferentes estágios de decomposição, uma vez que a técnica já tem sido muito utilizada para caracterização de tecidos biológicos com outras aplicações. Durante a realização do trabalho e análise dos dados obtidos (espectros de fluorescência), consideradas as dificuldades encontradas para a caracterização temporal das informações, são propostas formas de análise pertinentes. Dentre as análises realizadas, é apresentado o cálculo de análise em componentes principais, onde a diagonalização de matrizes de covariância permite identificar os padrões nos espectros obtidos. Uma interpretação dos dados obtidos de um primeiro grupo de animais utilizados (ratos da raça Wistar) foi feita, criando modelos matemáticos que descrevam as variações observadas em função do tempo, e logo a seguir foi realizado o processo de validação, onde o modelo matemático é posto à prova através da determinação do intervalo pós-morte de outro grupo de animais, cujos valores são conhecidos - estes dados, porém, não foram utilizados para a criação do modelo. A seguir, os resultados obtidos neste trabalho foram comparados com alguns resultados encontrados na literatura obtida, de onde foi possível concluir que o trabalho respondeu positivamente às expectativas. / In this study we propose a new method to evaluate the post-mortem interval, due to a need for methods that simultaneously provide results in a short analysis period of time and present accuracy similar to the methods currently used. Furthermore, it is very important to emphasize that the acquisition system must be practical and accessible in relations to costs getting possible the utilization for different institutions as: judicial expertise, research institutions, medical-legal institutes or to re-implantation of organ amputees. With these goals as motivation, the purpose of this study was to validate the fluorescence spectroscopy as a technique sufficiently sensitive to distinguish tissues in several stages of decomposition, since this technique has been widely used for characterization of biological tissue with other applications. Considering the difficulties found for temporal characterizations obtained by fluorescence spectra analysis any relevant ways of analysis were proposed. Among them we presented the Principal Components Analysis calculation, on which the diagonalization of covariance matrices allows us to identify standard in the obtained spectra. The interpretation of the data obtained from a first group of animals (breed: Wistar rats) was realized, creating mathematical models that describe the changes observed over time. Immediately after, the validation process was applied, where the mathematical model was tested, determining the post-mortem interval of another animals group whose values was known. However these data was not used to create the model. Afterwards, the results obtained in this study were compared to those from literature, and this comparison gotten possible to conclude that the study showed a positive response to the expectations.
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Fatores institucionais associados ao desempenho em matemÃtica por meio da anÃlise de componentes principais (PCA) e da decomposiÃÃo em fatores paralelos (PARAFAC)Luzia de Queiroz Hippolyto 00 March 2018 (has links)
nÃo hà / The results of academic performance in the discipline of Mathematics in Basic Education in Brazil, according to the benchmarking cycles of the Basic Education Assessment System (SAEB), point to a scenario that is not motivating. The negative results of Cearà revealed by SAEB, together with the national and international trend of large-scale evaluations, culminated, in 1992, when the first cycle of large-scale educational assessment of Cearà was carried out, with the aim of providing more accurate and timely information on local education and to monitor policies aimed at advancing the quality, equity, and efficiency of the state education system. However, several factors contribute to the fact that learning does not consolidate as expected. In this sense, the present thesis proposal has as general objective the accomplishment of a study that addresses two techniques of analysis, one bilinear and another trilinear, with the purpose of identifying socioeconomic factors and of institutional school climate, in conventional and professional schools, which are associated to the academic performance, especially in the Mathematics discipline, of high school students, in the city of Fortaleza-CE. The quantitative paradigm is used to measure and establish correlations, trying to identify patterns. Multivariate Analysis, in particular the Principal Component Analysis (PCA) and Multilinear Algebra technique, will be used through the tensor analysis focusing on the Decomposition in Parallel Factors (PARAFAC). The results show that: (i) that the Analysis of Variance (ANOVA) test pointed to a significant difference between students in conventional and professional schools for mathematics; (ii) the efficiency of multilinear algebra for data processing in the field of educational evaluation, since the findings in PARAFAC are directed toward the PCA, a tool readily validated by the academic community for this type of analysis. / Os resultados de desempenho acadÃmico na disciplina de MatemÃtica na EducaÃÃo BÃsica, no Brasil, segundo os ciclos de aferiÃÃo do Sistema de AvaliaÃÃo da EducaÃÃo BÃsica (SAEB), apontam para um cenÃrio nada motivador. Os resultados negativos do CearÃ, revelados pelo SAEB, em conjunto com a tendÃncia nacional e internacional de avaliaÃÃes em larga escala, culminam para que, em 1992, fosse realizado o primeiro ciclo de aferiÃÃo educacional em larga escala do CearÃ, com o intuito de dar respostas mais precisas e rÃpidas sobre a educaÃÃo local e, ainda, monitorar as polÃticas direcionadas para o avanÃo da qualidade, da equidade e da eficiÃncia do sistema educacional estadual. Contudo, diversos sÃo os fatores que contribuem para que a aprendizagem nÃo se consolide conforme o esperado. Nesse sentido, a presente proposta de tese traz como objetivo geral a realizaÃÃo de um estudo que aborde duas tÃcnicas de anÃlise, sendo uma bilinear e outra trilinear, com o intuito de identificar fatores socioeconÃmicos e de clima institucional escolar, em escolas convencionais e profissionais, que estejam associados ao desempenho acadÃmico, em especial, na disciplina de MatemÃtica, dos alunos do ensino mÃdio, no municÃpio de Fortaleza-CE. O paradigma quantitativo à utilizado de modo a realizar medidas e estabelecer correlaÃÃes, procurando identificar padrÃes. Far-se-à uso da AnÃlise Multivariada, em especial a tÃcnica de AnÃlise de Componentes Principais (PCA) e da Ãlgebra Multilinear, por meio da anÃlise tensorial focando-se na decomposiÃÃo em Fatores Paralelos (PARAFAC). Os resultados mostram: i) que o teste de AnÃlise de VariÃncia (ANOVA) apontou, para a disciplina de MatemÃtica, diferenÃa significativa entre os alunos das escolas convencionais e profissionais; ii) a eficiÃncia da Ãlgebra multilinear para tratamento de dados no campo da avaliaÃÃo educacional, uma vez que os achados no PARAFAC se encaminham na direÃÃo da PCA, ferramenta prontamente validada pela comunidade acadÃmica para esse tipo de anÃlise.
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A ImportÃncia da GestÃo no Desenvolvimento Municipal do Estado do CearÃ, 2009 a 2012 / Importance of management for Municipal sustainable development of the state of CearÃ, from 2009 to 2012Juliana Viana Jales 28 May 2015 (has links)
CoordenaÃÃo de AperfeiÃoamento de Pessoal de NÃvel Superior / The role of Brazilian cities had great changes over the last twenty-six. The process of decentralization allowed with the 1988 Constitution aimed the financial and political strengthening of the states and especially the municipalities in relation to the federal government. Thus, given the cities greater autonomy, as became 'federative'. Areas such as health and education have gained proper attribution of the local governments and increase the administrative burden, thereby increasing the financial and cities now have to raise more to fulfill them. The administration of a municipality is what organizes and prepares it for development. The need for a management organized so that the population is well served in their rights converge for the concept of sustainable development. Whereas a municipality depends on many factors to develop sustainably, that is, given its population and thinking of the future generations, we need studies that seek to analyze the situation of the municipalities in its various aspects in order to find answers or directions to removal or replacement of obstructing the process. As well as for the development to occur in one place, one needs appropriate to their stimulus policies, the government also needs favorable framework conditions for public policies of local development induction be effective. Thus, the aim of this study was to analyze whether the municipal administrations of the state of Cearà contributed, from 2009 to 2012 for the development and sustainability of their municipalities. A Municipal Management index was constructed (IGM) for 2009 and 2012 through structure indicators of the management of municipalities. Through the use of analysis techniques of Principal Components was calculated Municipal Sustainability Index (ISM), and the same variables was made by the group of municipalities in seven clusters. To see the relationship between municipal management and sustainability, we used the cumulative distribution method by quantile regression. Variables such as spending on health, spending on education and the municipal debt proved to be very important for the sustainability of cities. It was concluded that for most municipalities there was no change in sustainability over the three years, though there have been changes of management, however the values decreased, which implies that some of the characteristics of the municipalities at the beginning of his administration in 2009 may have It has been lost, such as stocks and services that are no longer running and available to the population, councils who failed to act, municipal plans that no longer exist, joints that were undone. It was noticed that the management has a direct impact on sustainability, being instrumental in the development of the municipality, in all aspects, but mainly by the variables used here to generate adequate living conditions for its residents. / O papel dos municÃpios brasileiros sofreu grandes mudanÃas nos Ãltimos vinte e seis anos. O processo de descentralizaÃÃo permitido com a ConstituiÃÃo de 1988 teve por objetivo o fortalecimento financeiro e polÃtico dos estados e, principalmente, dos municÃpios em relaÃÃo ao governo federal. Com isso, conferiu aos municÃpios maior autonomia, pois passaram a ser âentes federativosâ. Ãreas como saÃde e educaÃÃo ganharam atribuiÃÃes prÃprias dos municÃpios e se aumentam as obrigaÃÃes administrativas, consequentemente, aumentam as financeiras e os municÃpios passaram a ter que arrecadar mais para cumprÃ-las. A administraÃÃo de um municÃpio à o que o organiza e o prepara para o desenvolvimento. A necessidade de uma gestÃo organizada para que a populaÃÃo seja bem atendida em seus direitos converge, entÃo, para este conceito de desenvolvimento sustentÃvel. Considerando que um municÃpio depende de muitos fatores para se desenvolver com sustentabilidade, ou seja, atendendo sua populaÃÃo e pensando nas geraÃÃes futuras, sÃo necessÃrios estudos que procuram analisar a situaÃÃo dos municÃpios em seus mais variados aspectos para que se encontrem respostas ou direcionamentos para a remoÃÃo ou substituiÃÃo dos entraves ao processo. Assim como, para que ocorra o desenvolvimento em um local, precisa-se de polÃticas adequadas ao seu estÃmulo, o poder pÃblico tambÃm necessita de condiÃÃes estruturais favorÃveis para que as polÃticas pÃblicas sejam efetivas. Dessa forma, o objetivo geral deste estudo foi analisar se as gestÃes municipais do estado do Cearà contribuÃram, no perÃodo de 2009 a 2012, para o desenvolvimento com sustentabilidade dos seus municÃpios. Foi calculado um Ãndice de GestÃo Municipal (IGM) para 2009 e 2012 atravÃs de indicadores de estrutura da gestÃo dos municÃpios. AtravÃs do uso das tÃcnicas de AnÃlise dos Componentes Principais foi calculado o Ãndice de Sustentabilidade Municipal (ISM), e com as mesmas variÃveis fez-se o agrupamento dos municÃpios em sete clusters. Para ver as relaÃÃes entre a gestÃo municipal e a sustentabilidade, utilizou-se o mÃtodo de distribuiÃÃo cumulativa, atravÃs da RegressÃo QuantÃlica. VariÃveis como despesa com saÃde, despesa com educaÃÃo e o endividamento municipal mostraram-se muito importantes para a sustentabilidade dos municÃpios. Concluiu-se que para a maior parte dos municÃpios nÃo houve mudanÃa na sustentabilidade ao longo dos trÃs anos, porÃm houveram mudanÃas de gestÃo, entretanto os valores diminuÃram, o que pressupÃe que algumas das caracterÃsticas dos municÃpios no inÃcio de sua gestÃo em 2009 podem ter sido perdidas, como aÃÃes e serviÃos que deixaram de ser executados e oferecidos à populaÃÃo, conselhos que deixaram de atuar, planos municipais que deixaram de existir, articulaÃÃes que foram desfeitas. Percebeu-se que a gestÃo tem impacto direto sobre a sustentabilidade, sendo peÃa fundamental no desenvolvimento do municÃpio, em todos os aspectos, mas principalmente, pelas variÃveis utilizadas aqui, para gerar condiÃÃes de vida adequadas para seus habitantes.
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Fronteira de eficiência econômica em condições de risco: análise de sistemas de produção familiares da região Centro-Sul do Paraná / not availableMaria do Carmo Ramos Fasiaben 18 July 2002 (has links)
É muito grande a diferença na renda recebida pelos produtores agropecuários no Brasil. Isto se observa mesmo quando se trata do universo da agricultura familiar. Na Região Sul, onde se desenvolveu este trabalho, 51,4 %dos agricultores familiares recebem renda anual inferior a R$ 3.000,00, enquanto 1,8 %têm renda superior a R$ 27.500,00. O presente trabalho foi conduzido no município de Boa Ventura de São Roque, na região Centro-Sul do Paraná. Para conhecer a diversidade dos sistemas de produção agropecuários praticados no município elaborou-se uma tipologia empregando-se a análise fatorial por componentes principais a uma amostra de 34 estabelecimentos agrícolas, que foi validada por agricultores e técnicos locais. A tipificação de produtores permitiu a descrição de quatro grupos de estabelecimentos na área de estudos e embasou a escolha de propriedades para análise do processo de tomada de decisão, em condições de risco, de dois tipos extremos de sistemas de produção (um minifundista e um grande produtor), ambos de natureza familiar e que, apesar da grande diferença de dotação de recursos produtivos, têm a soja como a principal atividade produtiva. A Programação Linear foi utilizada para modelar os sistemas de produção das unidades familiares consideradas na análise e o modelo MOTAD (Minimização do desvio absoluto total) foi empregado para a construção da fronteira eficiente, que representa o risco envolvido para a obtenção de determinados níveis de margem bruta. Contrariamente ao esperado, os resultados mostram que o pequeno produtor apresentou taxa de aversão ao risco menor que a do grande, dada a combinação de atividades de seu sistema atual de produção. Os resultados indicam que políticas públicas inerentes à melhoria da infraestrutura regional, assistência técnica, crédito rural, comercialização e geração de empregos são fundamentais para aumentar a rentabilidade das unidades produtoras familiares e possibilitar a permanência dos pequenos agricultores no meio rural. / not available
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