Le déplacement animal joue un rôle déterminant dans la structuration spatiale et la dynamique des populations biologiques, en particulier des espèces fortement mobiles. L’espace et l’environnement font ainsi partie intégrante du cycle de vie des tortues marines. Ce travail de thèse propose de caractériser l’écologie spatiale des tortues marines, du stade juvénile au stade adulte, dans le Sud-ouest de l’océan Indien, principalement par l’usage de deux méthodes : la télémétrie satellitaire et la modélisation individu-centrée. Il montre en premier lieu que la phénologie de la reproduction de la tortue verte à travers la région est principalement liée à la température de surface de la mer au voisinage des sites de reproduction. Sont ensuite étudiés les patrons de dérive des nouveau-nés générés par les courants océaniques qui impacteraient inégalement leurs traits d’histoire de vie selon l’emplacement du site de naissance. Concernant le stade immature, les résultats suggèrent un cycle de développement trans-équatorial pour la tortue caouanne dans l’océan Indien. Pour le stade adulte, cette étude caractérise les couloirs et la connectivité migratoires de la tortue verte dans la région. Enfin, l’intégration de ces résultats permet de comprendre la structuration des patrons migratoires régionaux et leur influence sur la dynamique des populations. L’ensemble des connaissances acquises fournit un support concret d’aide à la décision pour la mise en place de plans de gestion et de conservation des tortues marines dans le Sud-ouest de l’océan Indien. Cela souligne l’importance d’une approche à grande échelle pour la protection d’un patrimoine biologique partagé par plusieurs nations. / Animal movement is crucial to the ecology of spatially structured population, particularly for highly mobile species. Marine turtles’ life cycle is indeed closely related to spatial and environmental factors. This work analyses the spatial ecology of marine turtles, from early juvenile to adult stages, in the Southwest Indian Ocean, primarily through the use of two methods: satellite tracking and individual-based modeling. Firstly, this analysis argues that green turtle’s reproductive phenology across the region is mainly related to the sea surface temperature in the vicinity of the nesting site. Then, it shows how drifting trajectories of hatchlings in oceanic currents unevenly influence their life history traits depending on the position of the natal site. By tracking late juvenile stage, this work also suggests a trans-equatorial developmental cycle for loggerhead turtle in the Indian Ocean. At adult stage, it describes migratory corridors and connectivity for green turtle across the region. Finally, an integrative approach considering all these results allows for an understanding of the regional migratory patterns and their influence on population dynamics. The results of this work provide a practical policy decision tool for management and conservation of marine turtles in the Southwest Indian Ocean and highlight the need for a large-scale approach in the protection of biological resources and heritage shared by multiple nations.

La région méditerranéenne, hot-spot de biodiversité avec un fort taux d'endémisme, est classée parmi les zones les plus touchées par le changement climatique. La conservation des espèces nécessite de comprendre finement leur démographie face à ces changements, mais aussi leur capacité à s’adapter à ces nouvelles conditions. Au cours de cette thèse, deux espèces végétales rares méditerranéennes ont été étudiées, Centaurea corymbosa et Brassica insularis, en utilisant des modèles mathématiques récents pour analyser des suivis démographiques de long-terme (22 ans et 18 ans). Dans la première partie de cette thèse, des modèles de projection matriciels ont été construits afin d’analyser la variation spatio-temporelle des taux d’accroissement des populations de C. corymbosa. Cela a permis d'identifier les facteurs climatiques clefs qui impactent les taux d’accroissement des populations, et plus finement, les paramètres de survie, de floraison et de fécondité. Une analyse de viabilité des populations a été réalisée sous différents scénarios climatiques. Dans un second temps, une analyse de la capacité des populations de C. corymbosa à répondre à ces changements climatiques a été effectuée avec un modèle de projection intégral. Les changements des traits d’histoire de vie au cours du temps ont montré que la stratégie de floraison observée répond aux variations climatiques en suivant la même direction que la stratégie optimale. Ceci montre que les populations sont capables de s’adapter au changement climatique. Enfin, des modèles de capture-recapture (CR) ont été construits afin de déterminer l’influence de la faible détectabilité des individus sur l’estimation des paramètres démographiques chez B. insularis. Les probabilités de survie estimées par l’approche classique sont inférieures à celles estimées par les modèles CR. Les paramètres estimés par les deux approches sont en général très corrélés, à l'exception d'une population montrant des problèmes d'identification des individus. L'ensemble de cette thèse est replacé dans le cadre de la biologie de la conservation des espèces végétales, notamment en suggérant de prendre en compte leur capacité de réponse au changement climatique. / Mediterranean region is a biodiversity hot-spot with a high endemism rate and is classified among the areas most sensitive to climate change. Deep understanding of demography and evolution following these changes is a necessity for species conservation. During this thesis, two rare Mediterranean plant species have been studied, Centaurea corymbosa and Brassica insularis, using recent mathematical models to analyse long term demographic datasets (22 and 18 years). In the first part of this thesis, matrix projection models have been used to analyse spatio-temporal variation in population growth rate in C. corymbosa. Major climatic parameters that impact population growth rate and survival, flowering and fecundity have been identified. A population viability analysis has been performed under various climatic scenarios. In a second part, an analysis of the population ability of C. corymbosa to response to these climatic changes has been performed using integral projection models. Temporal variation of life-history traits showed that the realized flowering strategy varied with climatic conditions following the same direction than the optimal flowering strategy. It can thus be concluded that the studied populations can adapt to climatic changes. Finally, capture-recapture models have been applied on the Brassica insularis dataset to analyse the effect of plant detectability on demographic parameter estimations. Survival probabilities obtained with the classical approach are lower than the ones estimated using the CR models. However, the parameters estimated using both methods are highly correlated, except for one population where individual identification is problematic. Results of this thesis are linked to some considerations in conservation biology of plants, particularly in link to their ability to respond to climatic changes.

L’objectif principal de la thèse était de caractériser les impacts de différents types de gestion pastorale (bovins, équins, caprins) sur les communautés végétales de « nouveaux écosystèmes » fortement anthropisés que sont les digues et remblais de la réserve de Donzère-Mondragon dans la basse vallée du Rhône. Différents outils ont été utilisés (relevés de végétation, analyses de sols, analyses minérales des herbages, télédétection, SIG, etc.) à des échelles spatiales différentes afin de dégager les interrelations entre les différents niveaux d’organisation et fonctionnalités de la végétation. En effet, l’émergence des « nouveaux écosystèmes » oblige les gestionnaires à reconsidérer les principes initiaux de la gestion conservatoire. Dans notre étude, il a pu être démontré que les systèmes de pâturage faisant appel à des troupeaux d’herbivores dont l’organisation est adaptée pour maintenir l’ouverture des milieux, augmentent la richesse spécifique, la diversité et l’hétérogénéité de la végétation à court terme (3-5 années) par rapport à l’absence de gestion ou aux interventions mécaniques. Les analyses montrent également que les espèces annuelles qui apparaissent sont appétentes et contribuent à augmenter la valeur fourragère de certains faciès du site pâturé par les chevaux. Ces herbivores ont également un impact sur la banque de graines permanente du sol en augmentant son hétérogénéité et la densité de graines viables sous les faciès les plus pâturés. Le pâturage des vaches et des chevaux confirme une corrélation entre l’indice de végétation (NDVI) obtenu après l’analyse de photographies aériennes, la biomasse et la richesse en espèces végétales. Les estimations d’indices de consommation de la ronce sous SIG ont permis d’apprécier l’efficacité de l’action des chèvres. Ces différents résultats, pour les modalités testées, correspondent bien à ceux déjà obtenus lors d’applications de systèmes pastoraux en milieux naturels. Des expérimentations devraient également être menées à l’avenir via des systèmes de pâturage mixtes notamment bovin-caprin et équin-caprin pour accroître l’effet de la restauration aux dépens de la colonisation d’arbustes compétitifs dont la ronce. La gestion pastorale appliquée devrait néanmoins être pensée sur le moyen terme, si possible via des contrats pluriannuels, favorisant la durabilité de cette méthode de gestion et de ses effets dans le temps. / The main objective of the thesis was to characterize the impacts of different types of pastoral management (cattle, horses, goats) on "new ecosystems" plant communities. Our experimentations were conducted in highly anthropized dykes and embankments of the Donzère-Mondragon reserve in the lower Rhone valley. Various tools were used (i.e. vegetation surveys, soil analyzes, grassland mineral analyzes, remote sensing, GIS, etc.), and at different spatial scales in order to identify the interrelationships between the different levels of vegetation organization and functions. Indeed, the emergence of "new ecosystems" requires managers to reconsider the initial principles of conservation management. Our study showed that, in the short term (3-5 years), grazing systems using herds of herbivores, whose organization is adapted to maintain open habitats, increase species richness, diversity and heterogeneity of plant communities compared to lack of management or mechanical interventions. Moreover, the annual species that appear are appetizing and contribute to increase the forage value of the site grazed by horses. These herbivores also have an impact on the permanent seed bank by increasing both its heterogeneity and the density of viable seeds under the most grazed patches. Grazing of cattle and horses confirm a correlation between the vegetation index (NDVI), biomass and plant species richness. Finally, we evaluated the efficacy of goats’ action on bramble via consumption indices calculated using GIS. Our different results are in the line with those already obtained in natural environments. Future experiments should test the effects of mixed grazing systems, particularly cattle, goats and horses, on the colonization dynamic of competitive shrubs such as brambles. Applied pastoral management should be considered in the medium term, via multi-year contracts to promote the sustainability of this management method and its effects over time.

Apesar da disseminação das sementes comerciais híbridas e transgênicas, muitas famílias no Rio Grande do Sul resistem como guardiãs de sementes crioulas realizando a conservação da agrobiodiversidade. Elas compartilham conhecimentos, práticas e crenças, organizam-se em associações de guardiões de sementes crioulas, estabelecendo redes e parceiros, buscando soluções para suas próprias demandas, ainda que em condições estruturais desfavoráveis. Assim, diversos elementos sociais, políticos, econômicos e culturais são envolvidos nas práticas de conservação. A biologia da conservação, ao não reconhecer o protagonismo e o potencial de muitas práticas imersas no conhecimento tradicional dos agricultores para a conservação nos agroecossistemas, não é suficiente para compreender as práticas destes agricultores familiares camponeses. Sendo assim, as indagações que motivaram a construir esta tese são as seguintes: Como se dá a conservação das sementes crioulas realizada por agricultores guardiões? Que práticas estão envolvidas nesta conservação e como elas se vinculam a outros aspectos além do biológico? O objetivo geral deste trabalho é compreender como os agricultores realizam a conservação das variedades crioulas, que práticas estão envolvidas e como elas se relacionam com outros elementos, além dos aspectos ecológicos, para a conservação. Os objetivos específicos são: identificar experiências de guardiões de sementes crioulas no Rio Grande do Sul; compreender o que são as sementes crioulas para os agricultores guardiões; compreender o que é conservação para os agricultores guardiões; analisar quais as práticas dos agricultores que contribuem para a conservação das variedades crioulas e compreender quais os elementos que estão envolvidos e se relacionam com a prática da conservação. Para alcançar estes objetivos, a partir de uma abordagem etnográfica, optou-se pelo recorte de casos-tipo representativos de guardiões na associação de guardiões das sementes crioulas de Ibarama e da associação de guardiões da agrobiodiversidade de Tenente Portela. A metodologia consistiu na convivência com três famílias em Ibarama e quatro em Tenente Portela visitando-as entre abril de 2014 e agosto de 2016. Além destas, outras famílias foram entrevistadas ao longo do trabalho de campo. Foram realizadas observações das práticas cotidianas e das percepções dos agricultores, realizadas entrevistas com gravação de áudio e transcrição. Como ferramentas auxiliares utilizaram-se a construção do mapa da propriedade e a tomada de fotografias perguntando aos agricultores para que me indicassem até cinco coisas na propriedade que eram muito importantes para eles. Para seguir os atores tomei a Perspectiva Orientada ao Ator (LONG, 2001, 2007) e para analisar as práticas dos agricultores e suas relações com as sementes crioulas tomei como base os conceitos de corpus de conhecimentos, práxis camponesa e kosmos (mundo das crenças) de Toledo (1991, 1993, 2001, 2013). Para analisar as relações entre as práticas individuais dos agricultores e como elas se envolviam com as práticas de outros agricultores na família e nas associações de guardiões tomei como auxiliar a noção de prática social de Reckwitz, e Schatzki, Knorr-Cetina e Von Savigny. A partir da prática social pude compreender que as sementes crioulas são um elo que conecta outros elementos da vida social dos agricultores, que neste estudo foram categorizados em dimensões: socioecológica, socioeconômica, política e cultural, todas permeados pelo aspecto ético com as gerações passadas e as futuras, relacionadas com a reciprocidade. As sementes crioulas remetem principalmente à ancestralidade, ao que é antigo e puro, demonstrando o orgulho da identidade de guardiões. A conservação das variedades crioulas entendida como prática social expressa mais do que intenção, mas uma atividade prática embebida de subjetividades presentes no mundo das crenças dos agricultores. Os guardiões de sementes crioulas são atores potenciais e necessários para a conservação das variedades crioulas, elemento importante da agrobiodiversidade que mantém a família e propriedade rural. Discuto, por fim, a etnoconservação como uma perspectiva que complementa as debilidades da perspectiva da biologia da conservação para pensar a conservação nos agroecossistemas com potencialidades para a orientação de políticas públicas e projetos de conservação da agrobiodiversidade. / Despite the spread of hybrid and transgenic commercial seeds, many families in Rio Grande do Sul resist as landraces (creole seeds) guardians, maintaining the agrobiodiversity. They share knowledge, practices and beliefs, organize themselves into associations of landraces guardians, establishing networks and partners, seeking solutions to their own demands, even under unfavorable structural conditions. Thus, several social, political, economic and cultural elements are involved in conservation practices. Conservation biology, by not recognizing the role and potential of many practices immersed in farmers' traditional knowledge for conservation in agroecosystems, is not enough to understand the practices of these peasant family farmers. Therefore, the questions that motivated the construction of this thesis are the following: How is the conservation of the landraces carried out by guardian peasant family farmers? What practices are involved in this conservation and how are they linked to other aspects than biological? The general objective of this work is to understand how peasant family farmers perform the conservation of creole varieties, what practices are involved and how they relate to other elements, beyond ecological elements for conservation. The specific objectives are: to identify experiences of guardians of landraces in Rio Grande do Sul; understand what are the landraces for the guardian peasant family farmers; understand what conservation is for the guardian peasant family farmer; to analyze which practices of family farmers contribute to the conservation of creole varieties; and to understand what elements are involved in the practice of conservation and what elements relate to this practice. In order to achieve these objectives, from an ethnographic approach, I opted for the representative casetypes of guardians in the association of landraces guardians of Ibarama and the association of guardians of the agrobiodiversity of Tenente Portela. The methodology consisted of living with three families in Ibarama and four in Tenente Portela between April 2014 and August 2016. In addition, other families were interviewed throughout the field work. Observations were made on daily practices and farmers' perceptions. Interviews with recording and audio and transcription were carried out. As ancillary tools I used the construction of the property map and I took pictures asking farmers to point to five things on the property that were very important for them. To follow the actors was used the Perspective Oriented Actor (LONG, 2001, 2007) and to analyze peasant family farmers' practices and their relations with the creole seeds, I took as a base the concepts of corpus of knowledge, peasant praxis and Kosmos (world of beliefs) of Toledo (1991, 1993, 2001, 2013). In order to analyze the relationships between peasant family farmers' individual practices and how they engaged with the practices of other farmers in the family and guardian associations, I took the notion of social practice of Reckwitz, Schatzki, Knorr-Cetina, and Von Savigny. From the social practice I was able to understand that the creole seeds are a link that connects other elements of the social life of the farmers, who in this study were categorized in socioecological, socioeconomic, political and cultural dimensions, all permeated by the ethical aspect with past and future generations, related to reciprocity. Landraces refer mainly to ancestry, to what is ancient and pure, demonstrating the pride of the identity of guardians. The conservation of creole varieties understood as social practice expresses more than intention, but a practical activity steeped in subjectivities that are present in the world of farmers' beliefs. Farmer‟s guardians are potential and necessary conservation agents of landraces, because they are also an important element of agrobiodiversity that maintains family and rural property. Finally, ethnoconservation is discussed as a perspective of complementing the weaknesses of conservation biology to think about conservation in agroecosystems with potentialities for the orientation of public policies and projects for the conservation of agrobiodiversity. / A pesar de la propagación de semillas comerciales híbridas y transgénicas, muchas familias en Rio Grande do Sul se destacan como guardianes de las semillas criollas y nativas en que realizan la conservación de la agrobiodiversidad. Ellos comparten conocimientos, prácticas y creencias, organizándose en asociaciones de guardianes, estableciendo redes y colaboradores, para solucionar sus propios problemas, incluso cuando las condiciones estructurales son desfavorables. Así, elementos sociales, políticos, económicos y culturales están involucrados en prácticas de conservación. La biología de la conservación, al no reconocer el papel y el potencial de muchas prácticas inmersas en los conocimientos tradicionales de los agricultores para la conservación no es suficiente para entender las prácticas de los agricultores familiares. Por lo tanto, las preguntas que llevaron a construir esta tesis son las siguientes: ¿De qué manera los agricultores guardianes realizan la conservación de las semillas criollas? ¿Qué prácticas están involucradas en la conservación y como están relacionados con otros aspectos más allá de lo biológico? El objetivo general de este estudio es comprender cómo los agricultores realizan la conservación de las variedades criollas, que prácticas están involucradas y cómo ellas se relacionan con otros elementos, además de los aspectos ecológicos para la conservación. Los objetivos específicos son: identificar las experiencias de guardianes de las semillas criollas y nativas en Rio Grande do Sul; comprender qué son las semillas criollas y nativas para agricultores guardianes; comprender lo que es la conservación para los agricultores; analizar cuáles son las prácticas de los agricultores que contribuyen a la conservación de las variedades criollas y nativas y comprender qué elementos intervienen y se relacionan con la práctica de la conservación. Para lograr estos objetivos, desde un enfoque etnográfico, he optado por los recortes de casos-tipo representativos de guardianes en la asociación de guardianes de semillas criollas y nativas en Ibarama y asociación de guardianes de la agrobiodiversidad en Tenente Portela. La metodología consistió en vivir con tres familias Ibarama y cuatro en Tenente Portela visitándolas entre abril de 2014 y agosto del 2016. Además, otras familias fueron entrevistadas a lo largo del trabajo de campo. Fueron hechas observaciones de las prácticas de todos los días y de las percepciones de los agricultores, entrevistas con grabación y transcripción de audio. Como herramientas auxiliares he utilizado la construcción del mapa de la propiedad y la toma de fotografías preguntando a los agricultores cuáles son las cinco cosas más importantes para ellos en la propiedad. Para seguir los actores fue utilizada la Perspectiva Orientada al Actor (LONG, 2001, 2007) y para analizar las prácticas de los agricultores y sus relaciones con las semillas fueron utilizados conceptos como el corpus de conocimiento, la práxis campesina y el kosmos (mundo de las creencias) de Toledo (1991, 1993, 2001, 2013). Para analizar las relaciones entre las prácticas individuales de los agricultores y cómo ellas se relacionan con las prácticas de otros agricultores en la familia y en las asociaciones de guardianes he utilizado la noción auxiliar de la práctica social de los autores Reckwitz Schatzki, Knorr-Cetina y Von Savigny. A partir de la práctica social fue posible comprender que las semillas criollas y nativas son un eslabón que conecta a otros elementos de la vida social de los agricultores, que en este estudio se clasificaron en las dimensiones: socioecologica, socioeconómico, político y cultural, todo impregnado por el aspecto ético con las generaciones pasadas y con las futuras, relacionadas con la reciprocidad. Las semillas criollas y nativas se refieren principalmente a los ancestros, a lo que es antiguo y puro, lo que demuestra el orgullo del guardián de semillas como identidad. La conservación de las variedades criollas y nativas es una práctica social, es más que la expresión de una intención, sino una actividad práctica empapada de subjetividades presentes en el mundo de las creencias de los agricultores. Los guardianes de las semillas criollas y nativas son actores potenciales y necesarios para la conservación de las variedades criollas que son un elemento importante de la agrobiodiversidad que mantiene la familia y la finca. Se discute, finalmente, la etnoconservación como una perspectiva de complementación a las debilidades de la biología de la conservación para pensar la conservación en los agroecosistemas com potencialidades para la orientación de las políticas públicas y proyectos para la conservación de la agrobiodiversidad.

Adaptive radiation – the proliferation of species from a single ancestor and diversification into many ecologically different forms – has long been heralded as an important process in the generation of phenotypic diversity. However, the early stages of adaptive radiation are notoriously elusive to observe and study. In this dissertation, I capitalize on communities of introduced non-native Anolis lizards as analogues of early stage adaptive radiations. In Chapter II, I begin by reviewing the concept of “ecological opportunity” – a classic hypothesis put forward as a potential key to understanding when and how adaptive radiation occurs. In Chapter III, I investigate the mechanisms which allow for coexistence and community assembly among ecologically-similar species. To do this I investigate range dynamics and assembly patterns of introduced anoles on the oceanic island of Bermuda. I discover that interspecific partitioning of the structural environment facilitates species coexistence, however the order of species assembly was an important predictor of final community composition. In Chapter IV, I then investigate how interspecific interactions between coexisting species may drive phenotypic divergence. This is the process of character displacement, which has been widely hypothesized to be an important mechanism driving phenotypic divergence in adaptive radiations. To do this I investigate sympatric and allopatric populations of introduced Cuban brown anoles (Anolis sagrei) and Puerto Rican crested anoles (A. cristatellus) in Miami FL, USA. I identify morphological shifts in sympatry, driven by divergence in habitat use and decreases in abundance. This study provides evidence of how selection on both ecologically and sexually-important traits can both drive phenotypic divergence during character displacement. Finally, in Chapter V, after taking advantage of non-native species as model eco-evolutionary systems in previous chapters, I investigate the potentially harmful effects that their presence may have on vulnerable native biodiversity. To do this I investigate the conservation risk posed by newly-discovered populations of A. sagrei on Bermuda to Critically Endangered endemic Bermuda skinks (Plestiodon longirostris). Through a detailed analysis of habitat use, diet, population size, and morphology of A. sagrei on Bermuda, we conclude it likely poses a high conservation threat to P. longirostris through interspecific competition.

Apesar da disseminação das sementes comerciais híbridas e transgênicas, muitas famílias no Rio Grande do Sul resistem como guardiãs de sementes crioulas realizando a conservação da agrobiodiversidade. Elas compartilham conhecimentos, práticas e crenças, organizam-se em associações de guardiões de sementes crioulas, estabelecendo redes e parceiros, buscando soluções para suas próprias demandas, ainda que em condições estruturais desfavoráveis. Assim, diversos elementos sociais, políticos, econômicos e culturais são envolvidos nas práticas de conservação. A biologia da conservação, ao não reconhecer o protagonismo e o potencial de muitas práticas imersas no conhecimento tradicional dos agricultores para a conservação nos agroecossistemas, não é suficiente para compreender as práticas destes agricultores familiares camponeses. Sendo assim, as indagações que motivaram a construir esta tese são as seguintes: Como se dá a conservação das sementes crioulas realizada por agricultores guardiões? Que práticas estão envolvidas nesta conservação e como elas se vinculam a outros aspectos além do biológico? O objetivo geral deste trabalho é compreender como os agricultores realizam a conservação das variedades crioulas, que práticas estão envolvidas e como elas se relacionam com outros elementos, além dos aspectos ecológicos, para a conservação. Os objetivos específicos são: identificar experiências de guardiões de sementes crioulas no Rio Grande do Sul; compreender o que são as sementes crioulas para os agricultores guardiões; compreender o que é conservação para os agricultores guardiões; analisar quais as práticas dos agricultores que contribuem para a conservação das variedades crioulas e compreender quais os elementos que estão envolvidos e se relacionam com a prática da conservação. Para alcançar estes objetivos, a partir de uma abordagem etnográfica, optou-se pelo recorte de casos-tipo representativos de guardiões na associação de guardiões das sementes crioulas de Ibarama e da associação de guardiões da agrobiodiversidade de Tenente Portela. A metodologia consistiu na convivência com três famílias em Ibarama e quatro em Tenente Portela visitando-as entre abril de 2014 e agosto de 2016. Além destas, outras famílias foram entrevistadas ao longo do trabalho de campo. Foram realizadas observações das práticas cotidianas e das percepções dos agricultores, realizadas entrevistas com gravação de áudio e transcrição. Como ferramentas auxiliares utilizaram-se a construção do mapa da propriedade e a tomada de fotografias perguntando aos agricultores para que me indicassem até cinco coisas na propriedade que eram muito importantes para eles. Para seguir os atores tomei a Perspectiva Orientada ao Ator (LONG, 2001, 2007) e para analisar as práticas dos agricultores e suas relações com as sementes crioulas tomei como base os conceitos de corpus de conhecimentos, práxis camponesa e kosmos (mundo das crenças) de Toledo (1991, 1993, 2001, 2013). Para analisar as relações entre as práticas individuais dos agricultores e como elas se envolviam com as práticas de outros agricultores na família e nas associações de guardiões tomei como auxiliar a noção de prática social de Reckwitz, e Schatzki, Knorr-Cetina e Von Savigny. A partir da prática social pude compreender que as sementes crioulas são um elo que conecta outros elementos da vida social dos agricultores, que neste estudo foram categorizados em dimensões: socioecológica, socioeconômica, política e cultural, todas permeados pelo aspecto ético com as gerações passadas e as futuras, relacionadas com a reciprocidade. As sementes crioulas remetem principalmente à ancestralidade, ao que é antigo e puro, demonstrando o orgulho da identidade de guardiões. A conservação das variedades crioulas entendida como prática social expressa mais do que intenção, mas uma atividade prática embebida de subjetividades presentes no mundo das crenças dos agricultores. Os guardiões de sementes crioulas são atores potenciais e necessários para a conservação das variedades crioulas, elemento importante da agrobiodiversidade que mantém a família e propriedade rural. Discuto, por fim, a etnoconservação como uma perspectiva que complementa as debilidades da perspectiva da biologia da conservação para pensar a conservação nos agroecossistemas com potencialidades para a orientação de políticas públicas e projetos de conservação da agrobiodiversidade. / Despite the spread of hybrid and transgenic commercial seeds, many families in Rio Grande do Sul resist as landraces (creole seeds) guardians, maintaining the agrobiodiversity. They share knowledge, practices and beliefs, organize themselves into associations of landraces guardians, establishing networks and partners, seeking solutions to their own demands, even under unfavorable structural conditions. Thus, several social, political, economic and cultural elements are involved in conservation practices. Conservation biology, by not recognizing the role and potential of many practices immersed in farmers' traditional knowledge for conservation in agroecosystems, is not enough to understand the practices of these peasant family farmers. Therefore, the questions that motivated the construction of this thesis are the following: How is the conservation of the landraces carried out by guardian peasant family farmers? What practices are involved in this conservation and how are they linked to other aspects than biological? The general objective of this work is to understand how peasant family farmers perform the conservation of creole varieties, what practices are involved and how they relate to other elements, beyond ecological elements for conservation. The specific objectives are: to identify experiences of guardians of landraces in Rio Grande do Sul; understand what are the landraces for the guardian peasant family farmers; understand what conservation is for the guardian peasant family farmer; to analyze which practices of family farmers contribute to the conservation of creole varieties; and to understand what elements are involved in the practice of conservation and what elements relate to this practice. In order to achieve these objectives, from an ethnographic approach, I opted for the representative casetypes of guardians in the association of landraces guardians of Ibarama and the association of guardians of the agrobiodiversity of Tenente Portela. The methodology consisted of living with three families in Ibarama and four in Tenente Portela between April 2014 and August 2016. In addition, other families were interviewed throughout the field work. Observations were made on daily practices and farmers' perceptions. Interviews with recording and audio and transcription were carried out. As ancillary tools I used the construction of the property map and I took pictures asking farmers to point to five things on the property that were very important for them. To follow the actors was used the Perspective Oriented Actor (LONG, 2001, 2007) and to analyze peasant family farmers' practices and their relations with the creole seeds, I took as a base the concepts of corpus of knowledge, peasant praxis and Kosmos (world of beliefs) of Toledo (1991, 1993, 2001, 2013). In order to analyze the relationships between peasant family farmers' individual practices and how they engaged with the practices of other farmers in the family and guardian associations, I took the notion of social practice of Reckwitz, Schatzki, Knorr-Cetina, and Von Savigny. From the social practice I was able to understand that the creole seeds are a link that connects other elements of the social life of the farmers, who in this study were categorized in socioecological, socioeconomic, political and cultural dimensions, all permeated by the ethical aspect with past and future generations, related to reciprocity. Landraces refer mainly to ancestry, to what is ancient and pure, demonstrating the pride of the identity of guardians. The conservation of creole varieties understood as social practice expresses more than intention, but a practical activity steeped in subjectivities that are present in the world of farmers' beliefs. Farmer‟s guardians are potential and necessary conservation agents of landraces, because they are also an important element of agrobiodiversity that maintains family and rural property. Finally, ethnoconservation is discussed as a perspective of complementing the weaknesses of conservation biology to think about conservation in agroecosystems with potentialities for the orientation of public policies and projects for the conservation of agrobiodiversity. / A pesar de la propagación de semillas comerciales híbridas y transgénicas, muchas familias en Rio Grande do Sul se destacan como guardianes de las semillas criollas y nativas en que realizan la conservación de la agrobiodiversidad. Ellos comparten conocimientos, prácticas y creencias, organizándose en asociaciones de guardianes, estableciendo redes y colaboradores, para solucionar sus propios problemas, incluso cuando las condiciones estructurales son desfavorables. Así, elementos sociales, políticos, económicos y culturales están involucrados en prácticas de conservación. La biología de la conservación, al no reconocer el papel y el potencial de muchas prácticas inmersas en los conocimientos tradicionales de los agricultores para la conservación no es suficiente para entender las prácticas de los agricultores familiares. Por lo tanto, las preguntas que llevaron a construir esta tesis son las siguientes: ¿De qué manera los agricultores guardianes realizan la conservación de las semillas criollas? ¿Qué prácticas están involucradas en la conservación y como están relacionados con otros aspectos más allá de lo biológico? El objetivo general de este estudio es comprender cómo los agricultores realizan la conservación de las variedades criollas, que prácticas están involucradas y cómo ellas se relacionan con otros elementos, además de los aspectos ecológicos para la conservación. Los objetivos específicos son: identificar las experiencias de guardianes de las semillas criollas y nativas en Rio Grande do Sul; comprender qué son las semillas criollas y nativas para agricultores guardianes; comprender lo que es la conservación para los agricultores; analizar cuáles son las prácticas de los agricultores que contribuyen a la conservación de las variedades criollas y nativas y comprender qué elementos intervienen y se relacionan con la práctica de la conservación. Para lograr estos objetivos, desde un enfoque etnográfico, he optado por los recortes de casos-tipo representativos de guardianes en la asociación de guardianes de semillas criollas y nativas en Ibarama y asociación de guardianes de la agrobiodiversidad en Tenente Portela. La metodología consistió en vivir con tres familias Ibarama y cuatro en Tenente Portela visitándolas entre abril de 2014 y agosto del 2016. Además, otras familias fueron entrevistadas a lo largo del trabajo de campo. Fueron hechas observaciones de las prácticas de todos los días y de las percepciones de los agricultores, entrevistas con grabación y transcripción de audio. Como herramientas auxiliares he utilizado la construcción del mapa de la propiedad y la toma de fotografías preguntando a los agricultores cuáles son las cinco cosas más importantes para ellos en la propiedad. Para seguir los actores fue utilizada la Perspectiva Orientada al Actor (LONG, 2001, 2007) y para analizar las prácticas de los agricultores y sus relaciones con las semillas fueron utilizados conceptos como el corpus de conocimiento, la práxis campesina y el kosmos (mundo de las creencias) de Toledo (1991, 1993, 2001, 2013). Para analizar las relaciones entre las prácticas individuales de los agricultores y cómo ellas se relacionan con las prácticas de otros agricultores en la familia y en las asociaciones de guardianes he utilizado la noción auxiliar de la práctica social de los autores Reckwitz Schatzki, Knorr-Cetina y Von Savigny. A partir de la práctica social fue posible comprender que las semillas criollas y nativas son un eslabón que conecta a otros elementos de la vida social de los agricultores, que en este estudio se clasificaron en las dimensiones: socioecologica, socioeconómico, político y cultural, todo impregnado por el aspecto ético con las generaciones pasadas y con las futuras, relacionadas con la reciprocidad. Las semillas criollas y nativas se refieren principalmente a los ancestros, a lo que es antiguo y puro, lo que demuestra el orgullo del guardián de semillas como identidad. La conservación de las variedades criollas y nativas es una práctica social, es más que la expresión de una intención, sino una actividad práctica empapada de subjetividades presentes en el mundo de las creencias de los agricultores. Los guardianes de las semillas criollas y nativas son actores potenciales y necesarios para la conservación de las variedades criollas que son un elemento importante de la agrobiodiversidad que mantiene la familia y la finca. Se discute, finalmente, la etnoconservación como una perspectiva de complementación a las debilidades de la biología de la conservación para pensar la conservación en los agroecosistemas com potencialidades para la orientación de las políticas públicas y proyectos para la conservación de la agrobiodiversidad.

Apesar da disseminação das sementes comerciais híbridas e transgênicas, muitas famílias no Rio Grande do Sul resistem como guardiãs de sementes crioulas realizando a conservação da agrobiodiversidade. Elas compartilham conhecimentos, práticas e crenças, organizam-se em associações de guardiões de sementes crioulas, estabelecendo redes e parceiros, buscando soluções para suas próprias demandas, ainda que em condições estruturais desfavoráveis. Assim, diversos elementos sociais, políticos, econômicos e culturais são envolvidos nas práticas de conservação. A biologia da conservação, ao não reconhecer o protagonismo e o potencial de muitas práticas imersas no conhecimento tradicional dos agricultores para a conservação nos agroecossistemas, não é suficiente para compreender as práticas destes agricultores familiares camponeses. Sendo assim, as indagações que motivaram a construir esta tese são as seguintes: Como se dá a conservação das sementes crioulas realizada por agricultores guardiões? Que práticas estão envolvidas nesta conservação e como elas se vinculam a outros aspectos além do biológico? O objetivo geral deste trabalho é compreender como os agricultores realizam a conservação das variedades crioulas, que práticas estão envolvidas e como elas se relacionam com outros elementos, além dos aspectos ecológicos, para a conservação. Os objetivos específicos são: identificar experiências de guardiões de sementes crioulas no Rio Grande do Sul; compreender o que são as sementes crioulas para os agricultores guardiões; compreender o que é conservação para os agricultores guardiões; analisar quais as práticas dos agricultores que contribuem para a conservação das variedades crioulas e compreender quais os elementos que estão envolvidos e se relacionam com a prática da conservação. Para alcançar estes objetivos, a partir de uma abordagem etnográfica, optou-se pelo recorte de casos-tipo representativos de guardiões na associação de guardiões das sementes crioulas de Ibarama e da associação de guardiões da agrobiodiversidade de Tenente Portela. A metodologia consistiu na convivência com três famílias em Ibarama e quatro em Tenente Portela visitando-as entre abril de 2014 e agosto de 2016. Além destas, outras famílias foram entrevistadas ao longo do trabalho de campo. Foram realizadas observações das práticas cotidianas e das percepções dos agricultores, realizadas entrevistas com gravação de áudio e transcrição. Como ferramentas auxiliares utilizaram-se a construção do mapa da propriedade e a tomada de fotografias perguntando aos agricultores para que me indicassem até cinco coisas na propriedade que eram muito importantes para eles. Para seguir os atores tomei a Perspectiva Orientada ao Ator (LONG, 2001, 2007) e para analisar as práticas dos agricultores e suas relações com as sementes crioulas tomei como base os conceitos de corpus de conhecimentos, práxis camponesa e kosmos (mundo das crenças) de Toledo (1991, 1993, 2001, 2013). Para analisar as relações entre as práticas individuais dos agricultores e como elas se envolviam com as práticas de outros agricultores na família e nas associações de guardiões tomei como auxiliar a noção de prática social de Reckwitz, e Schatzki, Knorr-Cetina e Von Savigny. A partir da prática social pude compreender que as sementes crioulas são um elo que conecta outros elementos da vida social dos agricultores, que neste estudo foram categorizados em dimensões: socioecológica, socioeconômica, política e cultural, todas permeados pelo aspecto ético com as gerações passadas e as futuras, relacionadas com a reciprocidade. As sementes crioulas remetem principalmente à ancestralidade, ao que é antigo e puro, demonstrando o orgulho da identidade de guardiões. A conservação das variedades crioulas entendida como prática social expressa mais do que intenção, mas uma atividade prática embebida de subjetividades presentes no mundo das crenças dos agricultores. Os guardiões de sementes crioulas são atores potenciais e necessários para a conservação das variedades crioulas, elemento importante da agrobiodiversidade que mantém a família e propriedade rural. Discuto, por fim, a etnoconservação como uma perspectiva que complementa as debilidades da perspectiva da biologia da conservação para pensar a conservação nos agroecossistemas com potencialidades para a orientação de políticas públicas e projetos de conservação da agrobiodiversidade. / Despite the spread of hybrid and transgenic commercial seeds, many families in Rio Grande do Sul resist as landraces (creole seeds) guardians, maintaining the agrobiodiversity. They share knowledge, practices and beliefs, organize themselves into associations of landraces guardians, establishing networks and partners, seeking solutions to their own demands, even under unfavorable structural conditions. Thus, several social, political, economic and cultural elements are involved in conservation practices. Conservation biology, by not recognizing the role and potential of many practices immersed in farmers' traditional knowledge for conservation in agroecosystems, is not enough to understand the practices of these peasant family farmers. Therefore, the questions that motivated the construction of this thesis are the following: How is the conservation of the landraces carried out by guardian peasant family farmers? What practices are involved in this conservation and how are they linked to other aspects than biological? The general objective of this work is to understand how peasant family farmers perform the conservation of creole varieties, what practices are involved and how they relate to other elements, beyond ecological elements for conservation. The specific objectives are: to identify experiences of guardians of landraces in Rio Grande do Sul; understand what are the landraces for the guardian peasant family farmers; understand what conservation is for the guardian peasant family farmer; to analyze which practices of family farmers contribute to the conservation of creole varieties; and to understand what elements are involved in the practice of conservation and what elements relate to this practice. In order to achieve these objectives, from an ethnographic approach, I opted for the representative casetypes of guardians in the association of landraces guardians of Ibarama and the association of guardians of the agrobiodiversity of Tenente Portela. The methodology consisted of living with three families in Ibarama and four in Tenente Portela between April 2014 and August 2016. In addition, other families were interviewed throughout the field work. Observations were made on daily practices and farmers' perceptions. Interviews with recording and audio and transcription were carried out. As ancillary tools I used the construction of the property map and I took pictures asking farmers to point to five things on the property that were very important for them. To follow the actors was used the Perspective Oriented Actor (LONG, 2001, 2007) and to analyze peasant family farmers' practices and their relations with the creole seeds, I took as a base the concepts of corpus of knowledge, peasant praxis and Kosmos (world of beliefs) of Toledo (1991, 1993, 2001, 2013). In order to analyze the relationships between peasant family farmers' individual practices and how they engaged with the practices of other farmers in the family and guardian associations, I took the notion of social practice of Reckwitz, Schatzki, Knorr-Cetina, and Von Savigny. From the social practice I was able to understand that the creole seeds are a link that connects other elements of the social life of the farmers, who in this study were categorized in socioecological, socioeconomic, political and cultural dimensions, all permeated by the ethical aspect with past and future generations, related to reciprocity. Landraces refer mainly to ancestry, to what is ancient and pure, demonstrating the pride of the identity of guardians. The conservation of creole varieties understood as social practice expresses more than intention, but a practical activity steeped in subjectivities that are present in the world of farmers' beliefs. Farmer‟s guardians are potential and necessary conservation agents of landraces, because they are also an important element of agrobiodiversity that maintains family and rural property. Finally, ethnoconservation is discussed as a perspective of complementing the weaknesses of conservation biology to think about conservation in agroecosystems with potentialities for the orientation of public policies and projects for the conservation of agrobiodiversity. / A pesar de la propagación de semillas comerciales híbridas y transgénicas, muchas familias en Rio Grande do Sul se destacan como guardianes de las semillas criollas y nativas en que realizan la conservación de la agrobiodiversidad. Ellos comparten conocimientos, prácticas y creencias, organizándose en asociaciones de guardianes, estableciendo redes y colaboradores, para solucionar sus propios problemas, incluso cuando las condiciones estructurales son desfavorables. Así, elementos sociales, políticos, económicos y culturales están involucrados en prácticas de conservación. La biología de la conservación, al no reconocer el papel y el potencial de muchas prácticas inmersas en los conocimientos tradicionales de los agricultores para la conservación no es suficiente para entender las prácticas de los agricultores familiares. Por lo tanto, las preguntas que llevaron a construir esta tesis son las siguientes: ¿De qué manera los agricultores guardianes realizan la conservación de las semillas criollas? ¿Qué prácticas están involucradas en la conservación y como están relacionados con otros aspectos más allá de lo biológico? El objetivo general de este estudio es comprender cómo los agricultores realizan la conservación de las variedades criollas, que prácticas están involucradas y cómo ellas se relacionan con otros elementos, además de los aspectos ecológicos para la conservación. Los objetivos específicos son: identificar las experiencias de guardianes de las semillas criollas y nativas en Rio Grande do Sul; comprender qué son las semillas criollas y nativas para agricultores guardianes; comprender lo que es la conservación para los agricultores; analizar cuáles son las prácticas de los agricultores que contribuyen a la conservación de las variedades criollas y nativas y comprender qué elementos intervienen y se relacionan con la práctica de la conservación. Para lograr estos objetivos, desde un enfoque etnográfico, he optado por los recortes de casos-tipo representativos de guardianes en la asociación de guardianes de semillas criollas y nativas en Ibarama y asociación de guardianes de la agrobiodiversidad en Tenente Portela. La metodología consistió en vivir con tres familias Ibarama y cuatro en Tenente Portela visitándolas entre abril de 2014 y agosto del 2016. Además, otras familias fueron entrevistadas a lo largo del trabajo de campo. Fueron hechas observaciones de las prácticas de todos los días y de las percepciones de los agricultores, entrevistas con grabación y transcripción de audio. Como herramientas auxiliares he utilizado la construcción del mapa de la propiedad y la toma de fotografías preguntando a los agricultores cuáles son las cinco cosas más importantes para ellos en la propiedad. Para seguir los actores fue utilizada la Perspectiva Orientada al Actor (LONG, 2001, 2007) y para analizar las prácticas de los agricultores y sus relaciones con las semillas fueron utilizados conceptos como el corpus de conocimiento, la práxis campesina y el kosmos (mundo de las creencias) de Toledo (1991, 1993, 2001, 2013). Para analizar las relaciones entre las prácticas individuales de los agricultores y cómo ellas se relacionan con las prácticas de otros agricultores en la familia y en las asociaciones de guardianes he utilizado la noción auxiliar de la práctica social de los autores Reckwitz Schatzki, Knorr-Cetina y Von Savigny. A partir de la práctica social fue posible comprender que las semillas criollas y nativas son un eslabón que conecta a otros elementos de la vida social de los agricultores, que en este estudio se clasificaron en las dimensiones: socioecologica, socioeconómico, político y cultural, todo impregnado por el aspecto ético con las generaciones pasadas y con las futuras, relacionadas con la reciprocidad. Las semillas criollas y nativas se refieren principalmente a los ancestros, a lo que es antiguo y puro, lo que demuestra el orgullo del guardián de semillas como identidad. La conservación de las variedades criollas y nativas es una práctica social, es más que la expresión de una intención, sino una actividad práctica empapada de subjetividades presentes en el mundo de las creencias de los agricultores. Los guardianes de las semillas criollas y nativas son actores potenciales y necesarios para la conservación de las variedades criollas que son un elemento importante de la agrobiodiversidad que mantiene la familia y la finca. Se discute, finalmente, la etnoconservación como una perspectiva de complementación a las debilidades de la biología de la conservación para pensar la conservación en los agroecosistemas com potencialidades para la orientación de las políticas públicas y proyectos para la conservación de la agrobiodiversidad.

During the past century the Swedish otter (Lutra lutra) population showed a rapid decline in abundance and genetic diversity. Among the most affected areas was the southern province of Skåne. After prohibiting hunting of otters and banning harmful pollutants like PCB, Swedish populations slowly recovered. To some areas the otter returned late, like Kristianstad in north-eastern Skåne. Here, the River Helge å enters Kristianstad’s Vattenrike, Biosphere Reserve and forms a biodiverse wetland. By 2011, otters had established once more along the river. In recent years, a female otter with cubs have appeared outside Vattenriket visitor’s centre “naturum”, to the joy of inhabitants and visitors. In Kristianstad, otters have become a recurring winter attraction. However, not much is known about this new population. For assessment of abundance and genetic diversity, microsatellite variation was investigated among now-living individuals from eleven sites in the Biosphere reserve, and stored museum samples from ten otters with origins in North-eastern Skåne. Using a non-invasive methodology, investigated DNA was extracted from faeces and muscle tissue from dead individuals. Multiple replicate screening was performed to detect errors in genotyping procedures. Results show the presence of three now-living individuals (two males and one female). Now-living otters and museum specimens from north-eastern Skåne were not closely related. Sampled individuals show Hardy-Weinberg Equilibrium, but their heterozygosity is very low. Results suggest that, even though some individuals may remain undetected, low admixture of new genes may be a cause for concern. For long-term protection and management in Kristianstad’s Vattenrike, Biosphere Reserve, further knowledge is needed about our new and precious otter population. / Den svenska utterstammen (Lutra lutra) genomgick drastiska populationsminskningar under mitten av 1900-talet. Minskningen ledde till en förlust av genetisk diversitet i många områden, och bland de värst drabbade var Skåne. Uttern blev fredad från jakt och ett förbud mot det skadliga miljögiftet PCB infördes, vilket skapade förutsättningar för utterpopulationen i Sverige att långsamt återhämta sig i antal. Men uttern återvände sent till vissa områden, som Kristianstad i Nordöstra Skåne. Genom staden Kristianstad rinner Helge å, som formar vidsträckta, artrika våtmarker i Biosfärområde Kristianstads Vattenrike. Uttern visade inga tecken på återkomst till området förrän 2011. De senaste åren har en utterhona med ungar regelbundet visat sig vid besökscentret ”naturum”, till glädje för stadens invånare och besökare. Uttrarna har blivit en återkommande vinterattraktion i Kristianstad. Men kunskapen om den nya populationen är begränsad. För uppskattning av antal och genetisk diversitet, undersöktes mikrosatellitvariationer hos nu levande individer från elva lokaler i Vattenriket. För jämförelse inkluderades arkiverade prover från Naturhistoriska Riksmuseets ”Miljöprovbank”, från tio döda uttrar med ursprung i Nordöstra Skåne. Med icke-invasiva metoder undersöktes DNA som extraherats från avföring- och muskelvävnad. Multipel replikatanalys gjordes för detektering av eventuella fel i genotypningsproceduren. Resultaten visar förekomsten av tre nu levande individer i Vattenriket (två hanar och en hona). Det är dock troligt att en- eller flera nu levande individer kan ha undkommit identifiering. Individerna var inte nära släkt med museiexemplaren från Nordöstra Skåne. Studerade individer är i Hardy-Weinberg jämvikt, men heterozygositeten är låg. Låg heterozygositet kan bero på en låg genomblandning i populationen, vilket kan vara en anledning till oro och bör undersökas närmre. Det behövs ytterligare kunskap och studier för att långsiktigt skydda och förvalta den nya, värdefulla utterpopulationen i Kristianstads Vattenrike.

Les pressions anthropiques agissent en synergie du gène à l’écosystème, des régions polaires aux régions tropicales et induisent une érosion biologique telle, qu'elle est qualifiée de sixième extinction de masse.Ce constat pose la question de l’évolution de la biodiversité face aux changements environnementaux en cours. C’est dans ce contexte que s’inscrit ce travail de thèse focalisé sur les populations de surface (5 -60 m) de corail rouge, Corallium rubrum (Linnaeus, 1758), en Méditerranée Nord-Occidentale.Le corail rouge (Octocorallia, Coralliidae) est une espèce sessile à phase larvaire caractérisée par sa longévité importante, sa dynamique de population lente et son rôle structurant au sein des communautés de substrats durs de Méditerranée. Soumis à une importante pression de récolte, Corallium rubruma récemment subi deux évènements de mortalité massive concordant avec des anomalies thermiques positives, potentiellement liées au réchauffement climatique. La combinaison de ces deux pressions environnementales est donc susceptible d’affecter fortement l’évolution des populations de surface de cette espèce. Basé sur une approche intégrant génétique des populations et écologie de terrain, ce travail a pour objectif principal d’étudier les processus microévolutifs en jeu chez le corail rouge, de l’inter- à l’intra- populationel, afin de contribuer à l'amélioration de nos connaissances sur la biologie de cette espèce dans le contexte environnemental actuel.Ce travail de thèse élargit le champ de connaissances relatif à l’écologie de Corallium rubrum et fournit un ensemble d’outils et de données pour sa conservation face aux perturbations environnementales en cours.Il contribue, par la même occasion, à une avancée significative dans la compréhension de la biologie des organismes marins sessiles à phase larvaire.Il illustre notamment la pertinence d'approches mises place à des échelles spatiales réduites, pour répondre à des questions fondamentales sur l’évolution de ces organismes, souvent clés au sein de communautés sous pression / Anthropic pressures act synergistically from gene to ecosystems and from polar to tropical regions, inducing a strong biological loss, which is considered by many as the sixth mass extinction. The evolution of biodiversity facing the ongoing global change is thus an open question.The present study is focused on the shallow populations (5 - 60 m) of Corallium rubrum (Octocorallia,Coralliidae) in the North Western Mediterranean Sea. The red coral is a sessile and long-lived species with a larval phase, a slow population dynamics and an important structuring role in the Mediterranean hard substrates communities. This species faces a strong harvesting pressure, and recently underwent two massmortality events linked to positive thermal anomalies putatively due to ongoing climate change. These two pressures may have deep implications on the evolution of the shallow populations of this species. Using population genetics and field ecology, the main objective of this study was to define microevolutionary processes acting between and within red coral populations, to enhance our knowledge on the biology of this species facing the environmental changes. This work extends our knowledge concerning the ecology of Corallium rubrum, and provides new toolsand data for its conservation in the context of the ongoing global change. Moreover, this work improves our understanding in the biology of sessile marine organisms with a larval phase, illustrating for example the relevance of approaches conducted at fine geographical scales to address questions regarding the evolution of these organisms.

Automated observation of avian vocal activity and species diversity can be a transformative tool for ornithologists, conservation biologists, and bird watchers to assist in long-term monitoring of critical environmental niches. Deep artificial neural networks have surpassed traditional classifiers in the field of visual recognition and acoustic event classification. Still, deep neural networks require expert knowledge to design, train, and test powerful models. With this constraint and the requirements of future applications in mind, an extensive research platform for automated avian activity monitoring was developed: BirdNET. The resulting benchmark system yields state-of-the-art scores across various acoustic domains and was used to develop expert tools and public demonstrators that can help to advance the democratization of scientific progress and future conservation efforts. / Die automatisierte Überwachung der Vogelstimmenaktivität und der Artenvielfalt kann ein revolutionäres Werkzeug für Ornithologen, Naturschützer und Vogelbeobachter sein, um bei der langfristigen Überwachung kritischer Umweltnischen zu helfen. Tiefe künstliche neuronale Netzwerke haben die traditionellen Klassifikatoren im Bereich der visuellen Erkennung und akustische Ereignisklassifizierung übertroffen. Dennoch erfordern tiefe neuronale Netze Expertenwissen, um leistungsstarke Modelle zu entwickeln, trainieren und testen. Mit dieser Einschränkung und unter Berücksichtigung der Anforderungen zukünftiger Anwendungen wurde eine umfangreiche Forschungsplattform zur automatisierten Überwachung der Vogelaktivität entwickelt: BirdNET. Das daraus resultierende Benchmark-System liefert state-of-the-art Ergebnisse in verschiedenen akustischen Bereichen und wurde verwendet, um Expertenwerkzeuge und öffentliche Demonstratoren zu entwickeln, die dazu beitragen können, die Demokratisierung des wissenschaftlichen Fortschritts und zukünftige Naturschutzbemühungen voranzutreiben.