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Variabilidade genética em genes do complexo principal de histocompatibilidade (DRB e DQA) em populações de Ctenomys flamarioni (Rodentia - Ctenomyidae), implicações em conservação

Fornel, Tatiane Noviski January 2013 (has links)
Ctenomys flamarioni é um roedor subterrâneo endêmico do litoral do Estado do Rio Grande do Sul - Brasil. Devido à sua distribuição restrita ao ambiente costeiro, que está em constante mudança, e à fragmentação e destruição do habitat, devido à ação humana, essa espécie está nas listas de fauna ameaçadas de extinção. Estudos anteriores, com marcadores microssatélites e DNA mitocondrial, identificaram a baixa variabilidade genética na espécie, por outro lado, o estudo de loci que se esperam estar sob seleção seria uma ferramenta importante para identificar a relação dos indivíduos com o ambiente e os processos que moldaram a variabilidade genética da espécie ao longo da história. O Complexo Principal de Histocompatibilidade (MHC) é composto por um grupo de genes estreitamente ligados que constituem o componente genético mais importante do sistema imunológico dos mamíferos. Dois principais mecanismos têm sido descritos como responsáveis pela manuntenção da diversidade do MHC e estão relacionados com o combate de parasitas e com mecanismos reprodutivos, que evitam o endocruzamento. Nesse estudo investigamos a variabilidade genética dos loci DRB e DQA do MHC e comparamos os índices de diversidades com os valores encontrados em estudos com outros ctenomídeos e com os encontrados para loci neutros da mesma espécie. A diversidade genética para o locus DRB de C. flamarioni foi menor do que a encontrada em estudos para o mesmo locus em outras espécies do gênero e também foi menor do que a encontrada em estudos para a mesma espécie, com marcadores neutros, inclusive para populações que passaram por reduções recentes (gargalos-de-garrafa). Os resultados indicam que a seleção balanceadora não foi suficiente para manter a diversidade genética nas populações estudadas e que as reduções populacionais, identificadas através dos loci neutros, devem ter sido bastante drásticas, por afetarem também a diversidade de um locus conhecidamente bastante variável (DRB de MHC). Não pudemos avaliar a diversidade do locus DQA devido a alta incidência de sequências muito divergentes encontradas, possivelmente pseudogenes. O estado de conservação de Ctenomys flamarioni é considerado crítico, por todos os fatores que afetam a espécie, como a instabilidade do ambiente em que ocorrem, a fragmentação e destruição do habitat pela ação humana e pela sua baixa diversidade genética, especialmente em um locus importante do sistema imunológico. A perda da diversidade no locus de MHC poderia estar relacionada à diminuição do número de indivíduos por população, que aumenta o risco de endogamia, que por sua vez pode levar à perda da aptidão reprodutiva, expressão de alelos recessivos deletérios e perda da flexibilidade adaptativa. Além disso, a perda da diversidade em um locus importante para a defesa do organismo contra parasitas aumenta a suscetibilidade dos indivíduos a doenças, e todos esses fatores elevam o risco de extinções locais, colocando em perigo o futuro da espécie. / Ctenomys flamarioni is a subterranean rodent, endemic to the coastline of the state of Rio Grande do Sul, Brazil. Due to its strict distribution to the coastal environment, which is constantly changing, and to habitat fragmentation and destruction caused by human actions, this species appears in lists of threatened fauna. Previous studies, using microsatellite markers and mitochondrial DNA, identified the low genetic variability in this species. On the other hand, the study of loci that are expected to be under balancing selection would be an important tool to identify the relation between individuals and their environment and processes which have molded the genetic variability of this species throughout history. The Major Histocompatibility Complex (MHC) is comprised by a closely connected group of genes that constitute the most important genetic component of the immune system of mammals. Two main mechanisms have been described as responsible for maintaining MHC diversity and are associated with parasite combat and reproductive mechanisms for inbreeding avoidance. In this study we investigated the genetic variability of the DRB and DQA loci of the MHC and compared these diversity indices with values found in studies about other ctenomyids and with values found for neutral loci in this species. The genetic diversity for the DRB locus in C. flamarioni was lower than what is found for the same locus in other species of the same genus and it was also lower than what was found in studies with this species using neutral markers, especially in populations which have gone through recent size reductions (bottlenecks). The results indicate that the balancing selection was not sufficient to maintain the genetic diversity in the studied populations and that population size reductions, identified through neutral loci, must have been very drastic, since they also affected the diversity of a loci which is known to be highly variable (DRB of the MHC). We could not evaluate the diversity for the DQA loci due to high incidence of very divergent sequences, possibly pseudogenes. The status of conservation of this species is considered critical due to all the factors that affect the species, such as the instability of the environment on which it occurs, habitat fragmentation and destruction caused by human actions, and its low genetic diversity, especially in an important locus of the immune system. The loss of diversity in the MHC locus could be associated to the decrease in number of individuals per population, which increases the risk of endogamy which, in turn, can lead to the loss of reproductive fitness, expression of deleterious recessive alleles and loss of adaptive flexibility. Moreover, the loss of diversity in a locus which is important in the defense of the organism against parasites increases the susceptibility of the individuals to diseases, and all these factors raise the risk of local extinctions, endangering the future of the species.
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História evolutiva e modelagem de nicho ecológico de Ctenomys flamarioni e Ctenomys australis (Rodentia - Ctenomyidae)

Cruz, Marcelo Merten January 2017 (has links)
Ctenomys flamarioni e Ctenomys australis são dois roedores subterrâneos da América do Sul listados como em perigo na IUCN Red List of Threatened Species. Eles pertencem ao grupo mendocinus do gênero Ctenomys e consequentemente algumas características são comuns, por exemplo, cariótipo com 2n=48, a grande quantidade de heterocromatina e a forma assimétrica dos espermatozoides. Além disso, Ctenomys flamarioni e Ctenomys australis ocorrem em restritos e similares habitats: a primeira linha de dunas. O primeiro, no Rio Grande do Sul, extremo sul do Brasil, e o segundo em Buenos Aires, uma província no nordeste da Argentina. Durante o Último Máximo Glacial, estas duas costas eram geograficamente unidas e consequentemente o Rio da Prata não havia sido formado ainda, portanto não atuava como uma barreira reprodutiva. Um estudo sobre especiação alopátrica foi conduzido na presente dissertação, usando modelagem de nicho ecológico para identificar áreas de alta adequabilidade para essas espécies durante o Último Máximo Glacial, Holoceno e o Presente. Além de análises moleculares de sequências da Região Controladora do DNA mitocondrial (mtDNA) Região que foram usadas para identificar padrões filogeográficos e uma estimativa do tempo de divergência das espécies. Nossas analises suportam a hipótese que o surgimento do Rio da Prata durante o período de deglaciação entre o último Máximo Glacial e o Holoceno bloqueou o fluxo gênico e permitiu o processo de especiação entre Ctenomys australis e Ctenomys flamarioni. / Ctenomys flamarioni and Ctenomys australis are two South American rodents listed as endangered on IUCN Red List of Threatened Species. They belong to the mendocinus group of the genus Ctenomys and consequently some characteristics are common, such as the karyotype with 2n=48, the large amount of heterochromatin and the simple asymmetrical form of the spermatozoa. Furthermore, Ctenomys flamarioni and Ctenomys australis occurs at restrict and similar habitats: the first line of sand dunes. The first one is in Rio Grande do Sul, the extreme south of Brazil, and the second one is in Buenos Ayres, the northeastern province of Argentina. During the Last Glacial Maximum, these two coastlines were geographically linked, hence de La Plata River had not been formed yet as a reproductive barrier. A study of allopatric speciation was conducted at the present dissertation, using ecological niche models to identify areas of high suitability of these species during the Last Glacial Maximum, Holocene and Present. Also, Molecular analysis of mitochondrial DNA (mtDNA) control region (D-loop) sequences was used to clarify phylogeographic patterns and divergence time estimation of these species. Our analysis supports the hypothesis that the rising of De La Plata River during the deglaciation period between the Last Glacial Maximum and the Holocene blocked the gene flow and allowed the speciation process among Ctenomys australis and Ctenomys flamarioni.
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Variabilidade genética em genes do complexo principal de histocompatibilidade (DRB e DQA) em populações de Ctenomys flamarioni (Rodentia - Ctenomyidae), implicações em conservação

Fornel, Tatiane Noviski January 2013 (has links)
Ctenomys flamarioni é um roedor subterrâneo endêmico do litoral do Estado do Rio Grande do Sul - Brasil. Devido à sua distribuição restrita ao ambiente costeiro, que está em constante mudança, e à fragmentação e destruição do habitat, devido à ação humana, essa espécie está nas listas de fauna ameaçadas de extinção. Estudos anteriores, com marcadores microssatélites e DNA mitocondrial, identificaram a baixa variabilidade genética na espécie, por outro lado, o estudo de loci que se esperam estar sob seleção seria uma ferramenta importante para identificar a relação dos indivíduos com o ambiente e os processos que moldaram a variabilidade genética da espécie ao longo da história. O Complexo Principal de Histocompatibilidade (MHC) é composto por um grupo de genes estreitamente ligados que constituem o componente genético mais importante do sistema imunológico dos mamíferos. Dois principais mecanismos têm sido descritos como responsáveis pela manuntenção da diversidade do MHC e estão relacionados com o combate de parasitas e com mecanismos reprodutivos, que evitam o endocruzamento. Nesse estudo investigamos a variabilidade genética dos loci DRB e DQA do MHC e comparamos os índices de diversidades com os valores encontrados em estudos com outros ctenomídeos e com os encontrados para loci neutros da mesma espécie. A diversidade genética para o locus DRB de C. flamarioni foi menor do que a encontrada em estudos para o mesmo locus em outras espécies do gênero e também foi menor do que a encontrada em estudos para a mesma espécie, com marcadores neutros, inclusive para populações que passaram por reduções recentes (gargalos-de-garrafa). Os resultados indicam que a seleção balanceadora não foi suficiente para manter a diversidade genética nas populações estudadas e que as reduções populacionais, identificadas através dos loci neutros, devem ter sido bastante drásticas, por afetarem também a diversidade de um locus conhecidamente bastante variável (DRB de MHC). Não pudemos avaliar a diversidade do locus DQA devido a alta incidência de sequências muito divergentes encontradas, possivelmente pseudogenes. O estado de conservação de Ctenomys flamarioni é considerado crítico, por todos os fatores que afetam a espécie, como a instabilidade do ambiente em que ocorrem, a fragmentação e destruição do habitat pela ação humana e pela sua baixa diversidade genética, especialmente em um locus importante do sistema imunológico. A perda da diversidade no locus de MHC poderia estar relacionada à diminuição do número de indivíduos por população, que aumenta o risco de endogamia, que por sua vez pode levar à perda da aptidão reprodutiva, expressão de alelos recessivos deletérios e perda da flexibilidade adaptativa. Além disso, a perda da diversidade em um locus importante para a defesa do organismo contra parasitas aumenta a suscetibilidade dos indivíduos a doenças, e todos esses fatores elevam o risco de extinções locais, colocando em perigo o futuro da espécie. / Ctenomys flamarioni is a subterranean rodent, endemic to the coastline of the state of Rio Grande do Sul, Brazil. Due to its strict distribution to the coastal environment, which is constantly changing, and to habitat fragmentation and destruction caused by human actions, this species appears in lists of threatened fauna. Previous studies, using microsatellite markers and mitochondrial DNA, identified the low genetic variability in this species. On the other hand, the study of loci that are expected to be under balancing selection would be an important tool to identify the relation between individuals and their environment and processes which have molded the genetic variability of this species throughout history. The Major Histocompatibility Complex (MHC) is comprised by a closely connected group of genes that constitute the most important genetic component of the immune system of mammals. Two main mechanisms have been described as responsible for maintaining MHC diversity and are associated with parasite combat and reproductive mechanisms for inbreeding avoidance. In this study we investigated the genetic variability of the DRB and DQA loci of the MHC and compared these diversity indices with values found in studies about other ctenomyids and with values found for neutral loci in this species. The genetic diversity for the DRB locus in C. flamarioni was lower than what is found for the same locus in other species of the same genus and it was also lower than what was found in studies with this species using neutral markers, especially in populations which have gone through recent size reductions (bottlenecks). The results indicate that the balancing selection was not sufficient to maintain the genetic diversity in the studied populations and that population size reductions, identified through neutral loci, must have been very drastic, since they also affected the diversity of a loci which is known to be highly variable (DRB of the MHC). We could not evaluate the diversity for the DQA loci due to high incidence of very divergent sequences, possibly pseudogenes. The status of conservation of this species is considered critical due to all the factors that affect the species, such as the instability of the environment on which it occurs, habitat fragmentation and destruction caused by human actions, and its low genetic diversity, especially in an important locus of the immune system. The loss of diversity in the MHC locus could be associated to the decrease in number of individuals per population, which increases the risk of endogamy which, in turn, can lead to the loss of reproductive fitness, expression of deleterious recessive alleles and loss of adaptive flexibility. Moreover, the loss of diversity in a locus which is important in the defense of the organism against parasites increases the susceptibility of the individuals to diseases, and all these factors raise the risk of local extinctions, endangering the future of the species.
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História evolutiva e modelagem de nicho ecológico de Ctenomys flamarioni e Ctenomys australis (Rodentia - Ctenomyidae)

Cruz, Marcelo Merten January 2017 (has links)
Ctenomys flamarioni e Ctenomys australis são dois roedores subterrâneos da América do Sul listados como em perigo na IUCN Red List of Threatened Species. Eles pertencem ao grupo mendocinus do gênero Ctenomys e consequentemente algumas características são comuns, por exemplo, cariótipo com 2n=48, a grande quantidade de heterocromatina e a forma assimétrica dos espermatozoides. Além disso, Ctenomys flamarioni e Ctenomys australis ocorrem em restritos e similares habitats: a primeira linha de dunas. O primeiro, no Rio Grande do Sul, extremo sul do Brasil, e o segundo em Buenos Aires, uma província no nordeste da Argentina. Durante o Último Máximo Glacial, estas duas costas eram geograficamente unidas e consequentemente o Rio da Prata não havia sido formado ainda, portanto não atuava como uma barreira reprodutiva. Um estudo sobre especiação alopátrica foi conduzido na presente dissertação, usando modelagem de nicho ecológico para identificar áreas de alta adequabilidade para essas espécies durante o Último Máximo Glacial, Holoceno e o Presente. Além de análises moleculares de sequências da Região Controladora do DNA mitocondrial (mtDNA) Região que foram usadas para identificar padrões filogeográficos e uma estimativa do tempo de divergência das espécies. Nossas analises suportam a hipótese que o surgimento do Rio da Prata durante o período de deglaciação entre o último Máximo Glacial e o Holoceno bloqueou o fluxo gênico e permitiu o processo de especiação entre Ctenomys australis e Ctenomys flamarioni. / Ctenomys flamarioni and Ctenomys australis are two South American rodents listed as endangered on IUCN Red List of Threatened Species. They belong to the mendocinus group of the genus Ctenomys and consequently some characteristics are common, such as the karyotype with 2n=48, the large amount of heterochromatin and the simple asymmetrical form of the spermatozoa. Furthermore, Ctenomys flamarioni and Ctenomys australis occurs at restrict and similar habitats: the first line of sand dunes. The first one is in Rio Grande do Sul, the extreme south of Brazil, and the second one is in Buenos Ayres, the northeastern province of Argentina. During the Last Glacial Maximum, these two coastlines were geographically linked, hence de La Plata River had not been formed yet as a reproductive barrier. A study of allopatric speciation was conducted at the present dissertation, using ecological niche models to identify areas of high suitability of these species during the Last Glacial Maximum, Holocene and Present. Also, Molecular analysis of mitochondrial DNA (mtDNA) control region (D-loop) sequences was used to clarify phylogeographic patterns and divergence time estimation of these species. Our analysis supports the hypothesis that the rising of De La Plata River during the deglaciation period between the Last Glacial Maximum and the Holocene blocked the gene flow and allowed the speciation process among Ctenomys australis and Ctenomys flamarioni.
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Variabilidade genética em genes do complexo principal de histocompatibilidade (DRB e DQA) em populações de Ctenomys flamarioni (Rodentia - Ctenomyidae), implicações em conservação

Fornel, Tatiane Noviski January 2013 (has links)
Ctenomys flamarioni é um roedor subterrâneo endêmico do litoral do Estado do Rio Grande do Sul - Brasil. Devido à sua distribuição restrita ao ambiente costeiro, que está em constante mudança, e à fragmentação e destruição do habitat, devido à ação humana, essa espécie está nas listas de fauna ameaçadas de extinção. Estudos anteriores, com marcadores microssatélites e DNA mitocondrial, identificaram a baixa variabilidade genética na espécie, por outro lado, o estudo de loci que se esperam estar sob seleção seria uma ferramenta importante para identificar a relação dos indivíduos com o ambiente e os processos que moldaram a variabilidade genética da espécie ao longo da história. O Complexo Principal de Histocompatibilidade (MHC) é composto por um grupo de genes estreitamente ligados que constituem o componente genético mais importante do sistema imunológico dos mamíferos. Dois principais mecanismos têm sido descritos como responsáveis pela manuntenção da diversidade do MHC e estão relacionados com o combate de parasitas e com mecanismos reprodutivos, que evitam o endocruzamento. Nesse estudo investigamos a variabilidade genética dos loci DRB e DQA do MHC e comparamos os índices de diversidades com os valores encontrados em estudos com outros ctenomídeos e com os encontrados para loci neutros da mesma espécie. A diversidade genética para o locus DRB de C. flamarioni foi menor do que a encontrada em estudos para o mesmo locus em outras espécies do gênero e também foi menor do que a encontrada em estudos para a mesma espécie, com marcadores neutros, inclusive para populações que passaram por reduções recentes (gargalos-de-garrafa). Os resultados indicam que a seleção balanceadora não foi suficiente para manter a diversidade genética nas populações estudadas e que as reduções populacionais, identificadas através dos loci neutros, devem ter sido bastante drásticas, por afetarem também a diversidade de um locus conhecidamente bastante variável (DRB de MHC). Não pudemos avaliar a diversidade do locus DQA devido a alta incidência de sequências muito divergentes encontradas, possivelmente pseudogenes. O estado de conservação de Ctenomys flamarioni é considerado crítico, por todos os fatores que afetam a espécie, como a instabilidade do ambiente em que ocorrem, a fragmentação e destruição do habitat pela ação humana e pela sua baixa diversidade genética, especialmente em um locus importante do sistema imunológico. A perda da diversidade no locus de MHC poderia estar relacionada à diminuição do número de indivíduos por população, que aumenta o risco de endogamia, que por sua vez pode levar à perda da aptidão reprodutiva, expressão de alelos recessivos deletérios e perda da flexibilidade adaptativa. Além disso, a perda da diversidade em um locus importante para a defesa do organismo contra parasitas aumenta a suscetibilidade dos indivíduos a doenças, e todos esses fatores elevam o risco de extinções locais, colocando em perigo o futuro da espécie. / Ctenomys flamarioni is a subterranean rodent, endemic to the coastline of the state of Rio Grande do Sul, Brazil. Due to its strict distribution to the coastal environment, which is constantly changing, and to habitat fragmentation and destruction caused by human actions, this species appears in lists of threatened fauna. Previous studies, using microsatellite markers and mitochondrial DNA, identified the low genetic variability in this species. On the other hand, the study of loci that are expected to be under balancing selection would be an important tool to identify the relation between individuals and their environment and processes which have molded the genetic variability of this species throughout history. The Major Histocompatibility Complex (MHC) is comprised by a closely connected group of genes that constitute the most important genetic component of the immune system of mammals. Two main mechanisms have been described as responsible for maintaining MHC diversity and are associated with parasite combat and reproductive mechanisms for inbreeding avoidance. In this study we investigated the genetic variability of the DRB and DQA loci of the MHC and compared these diversity indices with values found in studies about other ctenomyids and with values found for neutral loci in this species. The genetic diversity for the DRB locus in C. flamarioni was lower than what is found for the same locus in other species of the same genus and it was also lower than what was found in studies with this species using neutral markers, especially in populations which have gone through recent size reductions (bottlenecks). The results indicate that the balancing selection was not sufficient to maintain the genetic diversity in the studied populations and that population size reductions, identified through neutral loci, must have been very drastic, since they also affected the diversity of a loci which is known to be highly variable (DRB of the MHC). We could not evaluate the diversity for the DQA loci due to high incidence of very divergent sequences, possibly pseudogenes. The status of conservation of this species is considered critical due to all the factors that affect the species, such as the instability of the environment on which it occurs, habitat fragmentation and destruction caused by human actions, and its low genetic diversity, especially in an important locus of the immune system. The loss of diversity in the MHC locus could be associated to the decrease in number of individuals per population, which increases the risk of endogamy which, in turn, can lead to the loss of reproductive fitness, expression of deleterious recessive alleles and loss of adaptive flexibility. Moreover, the loss of diversity in a locus which is important in the defense of the organism against parasites increases the susceptibility of the individuals to diseases, and all these factors raise the risk of local extinctions, endangering the future of the species.
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História evolutiva e modelagem de nicho ecológico de Ctenomys flamarioni e Ctenomys australis (Rodentia - Ctenomyidae)

Cruz, Marcelo Merten January 2017 (has links)
Ctenomys flamarioni e Ctenomys australis são dois roedores subterrâneos da América do Sul listados como em perigo na IUCN Red List of Threatened Species. Eles pertencem ao grupo mendocinus do gênero Ctenomys e consequentemente algumas características são comuns, por exemplo, cariótipo com 2n=48, a grande quantidade de heterocromatina e a forma assimétrica dos espermatozoides. Além disso, Ctenomys flamarioni e Ctenomys australis ocorrem em restritos e similares habitats: a primeira linha de dunas. O primeiro, no Rio Grande do Sul, extremo sul do Brasil, e o segundo em Buenos Aires, uma província no nordeste da Argentina. Durante o Último Máximo Glacial, estas duas costas eram geograficamente unidas e consequentemente o Rio da Prata não havia sido formado ainda, portanto não atuava como uma barreira reprodutiva. Um estudo sobre especiação alopátrica foi conduzido na presente dissertação, usando modelagem de nicho ecológico para identificar áreas de alta adequabilidade para essas espécies durante o Último Máximo Glacial, Holoceno e o Presente. Além de análises moleculares de sequências da Região Controladora do DNA mitocondrial (mtDNA) Região que foram usadas para identificar padrões filogeográficos e uma estimativa do tempo de divergência das espécies. Nossas analises suportam a hipótese que o surgimento do Rio da Prata durante o período de deglaciação entre o último Máximo Glacial e o Holoceno bloqueou o fluxo gênico e permitiu o processo de especiação entre Ctenomys australis e Ctenomys flamarioni. / Ctenomys flamarioni and Ctenomys australis are two South American rodents listed as endangered on IUCN Red List of Threatened Species. They belong to the mendocinus group of the genus Ctenomys and consequently some characteristics are common, such as the karyotype with 2n=48, the large amount of heterochromatin and the simple asymmetrical form of the spermatozoa. Furthermore, Ctenomys flamarioni and Ctenomys australis occurs at restrict and similar habitats: the first line of sand dunes. The first one is in Rio Grande do Sul, the extreme south of Brazil, and the second one is in Buenos Ayres, the northeastern province of Argentina. During the Last Glacial Maximum, these two coastlines were geographically linked, hence de La Plata River had not been formed yet as a reproductive barrier. A study of allopatric speciation was conducted at the present dissertation, using ecological niche models to identify areas of high suitability of these species during the Last Glacial Maximum, Holocene and Present. Also, Molecular analysis of mitochondrial DNA (mtDNA) control region (D-loop) sequences was used to clarify phylogeographic patterns and divergence time estimation of these species. Our analysis supports the hypothesis that the rising of De La Plata River during the deglaciation period between the Last Glacial Maximum and the Holocene blocked the gene flow and allowed the speciation process among Ctenomys australis and Ctenomys flamarioni.
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Aspectos da ecologia populacional do tuco-tuco-das-dunas (TRAVI, 1981) (Ctenomis flamarioni - RODENTIA - CTENOMYDAE) na Estação Ecológica do Taim, Rio Grande do Sul, Brasil

Garcias, Felipe Maia January 2013 (has links)
Aspectos da ecologia populacional do tuco-tuco-das-dunas (Ctenomys flamarioni) foram estudados na região costeira da Estação Ecológica do Taim, com o objetivo de determinar características ecológicas, como a estrutura populacional e o tamanho e a forma da área de vida (home-range), utilizando a radiotelemetria numa população de Ctenomys flamarioni. O estudo foi desenvolvido entre dezembro de 2011 a março de 2013, foram realizadas 06 campanhas a cada trimestre de acordo com as estações sazonais com duração de quatro dias consecutivos. A extensão da área de estudo definida abrangeu uma área de 6 ha. O tamanho da área de vida foi calculado pelo software Biotas 2.0, utilizando o estimador de Kernel (95%) e o estimador MCP (100%). Foram capturados 56 indivíduos de Ctenomys flamarioni, 18 machos e 38 fêmeas. Foram realizadas 59 recapturas. A estimativa do tamanho populacional indicou uma pequena oscilação na taxa populacional entre as campanhas de amostragens sazonais. O valor da densidade demográfica média encontrada foi de 3,92 ± 0,5 indivíduos por hectare. No estudo de rádio-telemetria obteve-se 169 localizações dos indivíduos monitorados. Os resultados obtidos demonstraram uma nítida diferença entre estes dois métodos. O tamanho médio de área da vida obtido em Kernel (95%) foi de 1.860,3 m2 ± 832,0 para as fêmeas e 2.168,3 m2 ± 2.597,5 para os machos. Já os resultados obtidos pelo método MCP foram de 707,1 m2 ± 230,1 nos para as fêmeas e 3.334,5 m2 ± 2.632,1 para os indivíduos machos. A utilização da ferramenta de rádio-telemetria se mostrou uma grande aliada para responder algumas questões encontradas no programa de marcação e recaptura, como a taxa de deslocamento, aspectos comportamentais e mortalidade. / I studied aspects of population ecology of the Tuco-tuco of the dunes (Ctenomys flamarioni), such as population structure and home-range size and shape, in the coastal region of the Taim Ecological Station. The study was conducted from December 2011 to March 2013, in six campaigns of four consecutive days. Sampling was stratified along the annual seasons. My study site comprised a strip of sand dunes of 500 X 120 meters, totaling an area of 6 ha. I captured 56 individuals of Ctenomys flamarioni, 18 males and 38 females, and registered 59 recapture events. Population size estimates indicated short term population oscillations between seasons, but a long term equilibrium, with population sizes similar at the beginning and at the end of my study. The average population density was 3.92 ± 0.5 individuals per hectare. Using radio-telemetry, I obtained 169 locations. The results showed a clear difference between the two methods used to estimate home-range. The average home-range obtained with Kernel (95%) was 1860.3 ± 832.0 m2 for females and 2168.3 ± 2597.5 m2 for males. Home-ranges estimated by the MCP were 707.1 ± 230.1 m2 for females and 3334.5 ± 2632.1 m2 for males. The use of radio telemetry proved to be a great ally to answer some questions raised with mark-recapture analyses, such as, the rate of displacement, mortality and behavioral aspects.
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Aspectos da ecologia populacional do tuco-tuco-das-dunas (TRAVI, 1981) (Ctenomis flamarioni - RODENTIA - CTENOMYDAE) na Estação Ecológica do Taim, Rio Grande do Sul, Brasil

Garcias, Felipe Maia January 2013 (has links)
Aspectos da ecologia populacional do tuco-tuco-das-dunas (Ctenomys flamarioni) foram estudados na região costeira da Estação Ecológica do Taim, com o objetivo de determinar características ecológicas, como a estrutura populacional e o tamanho e a forma da área de vida (home-range), utilizando a radiotelemetria numa população de Ctenomys flamarioni. O estudo foi desenvolvido entre dezembro de 2011 a março de 2013, foram realizadas 06 campanhas a cada trimestre de acordo com as estações sazonais com duração de quatro dias consecutivos. A extensão da área de estudo definida abrangeu uma área de 6 ha. O tamanho da área de vida foi calculado pelo software Biotas 2.0, utilizando o estimador de Kernel (95%) e o estimador MCP (100%). Foram capturados 56 indivíduos de Ctenomys flamarioni, 18 machos e 38 fêmeas. Foram realizadas 59 recapturas. A estimativa do tamanho populacional indicou uma pequena oscilação na taxa populacional entre as campanhas de amostragens sazonais. O valor da densidade demográfica média encontrada foi de 3,92 ± 0,5 indivíduos por hectare. No estudo de rádio-telemetria obteve-se 169 localizações dos indivíduos monitorados. Os resultados obtidos demonstraram uma nítida diferença entre estes dois métodos. O tamanho médio de área da vida obtido em Kernel (95%) foi de 1.860,3 m2 ± 832,0 para as fêmeas e 2.168,3 m2 ± 2.597,5 para os machos. Já os resultados obtidos pelo método MCP foram de 707,1 m2 ± 230,1 nos para as fêmeas e 3.334,5 m2 ± 2.632,1 para os indivíduos machos. A utilização da ferramenta de rádio-telemetria se mostrou uma grande aliada para responder algumas questões encontradas no programa de marcação e recaptura, como a taxa de deslocamento, aspectos comportamentais e mortalidade. / I studied aspects of population ecology of the Tuco-tuco of the dunes (Ctenomys flamarioni), such as population structure and home-range size and shape, in the coastal region of the Taim Ecological Station. The study was conducted from December 2011 to March 2013, in six campaigns of four consecutive days. Sampling was stratified along the annual seasons. My study site comprised a strip of sand dunes of 500 X 120 meters, totaling an area of 6 ha. I captured 56 individuals of Ctenomys flamarioni, 18 males and 38 females, and registered 59 recapture events. Population size estimates indicated short term population oscillations between seasons, but a long term equilibrium, with population sizes similar at the beginning and at the end of my study. The average population density was 3.92 ± 0.5 individuals per hectare. Using radio-telemetry, I obtained 169 locations. The results showed a clear difference between the two methods used to estimate home-range. The average home-range obtained with Kernel (95%) was 1860.3 ± 832.0 m2 for females and 2168.3 ± 2597.5 m2 for males. Home-ranges estimated by the MCP were 707.1 ± 230.1 m2 for females and 3334.5 ± 2632.1 m2 for males. The use of radio telemetry proved to be a great ally to answer some questions raised with mark-recapture analyses, such as, the rate of displacement, mortality and behavioral aspects.
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Aspectos da ecologia populacional do tuco-tuco-das-dunas (TRAVI, 1981) (Ctenomis flamarioni - RODENTIA - CTENOMYDAE) na Estação Ecológica do Taim, Rio Grande do Sul, Brasil

Garcias, Felipe Maia January 2013 (has links)
Aspectos da ecologia populacional do tuco-tuco-das-dunas (Ctenomys flamarioni) foram estudados na região costeira da Estação Ecológica do Taim, com o objetivo de determinar características ecológicas, como a estrutura populacional e o tamanho e a forma da área de vida (home-range), utilizando a radiotelemetria numa população de Ctenomys flamarioni. O estudo foi desenvolvido entre dezembro de 2011 a março de 2013, foram realizadas 06 campanhas a cada trimestre de acordo com as estações sazonais com duração de quatro dias consecutivos. A extensão da área de estudo definida abrangeu uma área de 6 ha. O tamanho da área de vida foi calculado pelo software Biotas 2.0, utilizando o estimador de Kernel (95%) e o estimador MCP (100%). Foram capturados 56 indivíduos de Ctenomys flamarioni, 18 machos e 38 fêmeas. Foram realizadas 59 recapturas. A estimativa do tamanho populacional indicou uma pequena oscilação na taxa populacional entre as campanhas de amostragens sazonais. O valor da densidade demográfica média encontrada foi de 3,92 ± 0,5 indivíduos por hectare. No estudo de rádio-telemetria obteve-se 169 localizações dos indivíduos monitorados. Os resultados obtidos demonstraram uma nítida diferença entre estes dois métodos. O tamanho médio de área da vida obtido em Kernel (95%) foi de 1.860,3 m2 ± 832,0 para as fêmeas e 2.168,3 m2 ± 2.597,5 para os machos. Já os resultados obtidos pelo método MCP foram de 707,1 m2 ± 230,1 nos para as fêmeas e 3.334,5 m2 ± 2.632,1 para os indivíduos machos. A utilização da ferramenta de rádio-telemetria se mostrou uma grande aliada para responder algumas questões encontradas no programa de marcação e recaptura, como a taxa de deslocamento, aspectos comportamentais e mortalidade. / I studied aspects of population ecology of the Tuco-tuco of the dunes (Ctenomys flamarioni), such as population structure and home-range size and shape, in the coastal region of the Taim Ecological Station. The study was conducted from December 2011 to March 2013, in six campaigns of four consecutive days. Sampling was stratified along the annual seasons. My study site comprised a strip of sand dunes of 500 X 120 meters, totaling an area of 6 ha. I captured 56 individuals of Ctenomys flamarioni, 18 males and 38 females, and registered 59 recapture events. Population size estimates indicated short term population oscillations between seasons, but a long term equilibrium, with population sizes similar at the beginning and at the end of my study. The average population density was 3.92 ± 0.5 individuals per hectare. Using radio-telemetry, I obtained 169 locations. The results showed a clear difference between the two methods used to estimate home-range. The average home-range obtained with Kernel (95%) was 1860.3 ± 832.0 m2 for females and 2168.3 ± 2597.5 m2 for males. Home-ranges estimated by the MCP were 707.1 ± 230.1 m2 for females and 3334.5 ± 2632.1 m2 for males. The use of radio telemetry proved to be a great ally to answer some questions raised with mark-recapture analyses, such as, the rate of displacement, mortality and behavioral aspects.
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Dinâmica populacional e relações espaciais do tuco-tuco-das-dunas Ctenomys flamarion - (Rodentia - Ctenomyidae) na Estação Ecológica do Taim - RS/Brasil

Stolz, José Francisco Bonini January 2006 (has links)
Como parte de um estudo das interações ecológicas da espécie Ctenomys flamarioni, popularmente conhecido como Tuco-tuco-das-dunas, uma população que habita o sistema de dunas da planície costeira sul do Rio Grande do Sul foi estudada em um programa de captura-marcação-recaptura sazonal durante dois anos consecutivos (2004/2005). As informações espaciais são uma das metas mais importantes para predizer as necessidades de habitat e a dinâmica populacional de uma dada espécie. O gênero Ctenomys é conhecido como sendo de baixa vagilidade, por causa de sua morfologia, do consumo energético em cavar novos túneis e da exposição aos predadores que aumenta em seus deslocamentos acima do solo. Os resultados deste trabalho mostram que esta é uma espécie de roedor de vida longa (pelo menos quatro anos), apresentando um crescimento rápido nos primeiros dois anos de vida. Depois do segundo ano, machos e fêmeas começam a apresentar marcado dimorfismo sexual para massa corpórea, largura dos incisivos e comprimento total do corpo. A variação do peso não tem diferença significativa entre estações do ano para animais adultos. A espécie é solitária, com adultos vivendo em seus próprios túneis e filhotes vivendo com suas mães por um período curto de tempo. A espécie apresenta um ciclo reprodutivo bem marcado, com cópulas no inverno, nascimentos na primavera e no verão, ausência de atividade sexual no outono, com um possível estro pós-parto e prenhês no verão. As análises populacionais mostram que ocorreu uma importante flutuação entre os dois anos de estudo, que existe uma alta mortalidade de jovens, uma baixa densidade, uma proporção sexual balanceada para adultos e para filhotes, uma natalidade moderada, seguida por uma grande mortalidade de filhotes, levando a uma população predominante de adultos. Estes resultados concordam com o que é encontrado para outras espécies do gênero mas apresenta números menores, em geral. A análise espacial fornece importantes informações como um movimento inesperado entre adultos e uma dispersão desviada entre a população jovem, ausência de diferença significativa na área de vida entre machos e fêmeas adultos, uma distribuição uniforme dos indivíduos no habitat e nenhuma organização social entre vizinhos. Mais ainda, a dispersão é analisada nos movimentos entre estações e existe uma marcada diferença mostrando que os dispersores são as fêmeas adultas e os machos não adultos, que deslocam-se entre o verão e a primavera. Os resultados são discutidos em comparação com outros roedores subterrâneos e as informações podem ser utilizadas para saber as necessidades da espécie. O ciclo reprodutivo apresentado mais a dinâmica populacional observada, associados a um ambiente instável onde a espécie habita levam-na a uma situação de baixa resistência e baixa resiliência, tornando-a um importante objeto para a conservação. / As a part of a study on the ecological interactions of the species Ctenomys flamarioni, commonly known as tuco-tuco-das-dunas, a natural population inhabiting the dunes system in the south coast of Rio Grande do Sul/Brazil was live-trapped, in a seasonal capture-mark-release program made over two consecutive years (2004/2005). Spatial relations are one of the most important goal to predict habitat necessities and the population dynamic of a given species. The genus Ctenomys is known as a low vagility group of species, due to their morphology, energetic consumption in excavating new burrows and predators exposition aboveground. The results shown that this is a long living small rodent (at least four years old), having an increased growth time in the first two years post partum. After the second year old, males and females starts to present a markedly sexual dimorphism for body mass, incisives large and total length. Body mass variation have no significant differences among seasons for adult tuco-tucos. The species is a solitary one, with adult animals leaving on their own burrows and pups leaving with their mothers for a restricted time. A markedly reproduction cycle is presented by copula in winter, births on spring and summer and no activity just in autumn, with a possible post-partum estrum and pregnancy in summer. The populations analysis provides that occurred an important fluctuation between the two years, a high mortality over the young population, poor density in space, a balanced sex ratio over and a moderate natality followed by a great mortality of young, leading to an predominant adult population. These results agree with what is found for the genus, but the numbers seems to be less in general. The spatial analysis provides important information like unexpected movements among adults and biased dispersal between young, non significantly differences between male/female home-range, an uniform distribution of individuals in the habitat and no significantly social spacing or space relation among neighbors. Moreover, dispersal is analyzed in the movements among seasons and a markedly difference is found for adult females and non-adult males. Results are discussed in comparison with another subterranean mammals and the data could be used for information about the necessities of the species. The reproductive cycle plus the population dynamics, the instable environment that the species inhabits leads to a low resilience and resistance of the species, turning them on an important conservation focus.

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