LIMA, Irailde do Nascimento. Amplitude e sobreposição do nicho ecológico de Euglossa cordata e Eulaema nigrita (Hymenoptera, Apidae, Euglossini). 2017. 61 f. Dissertação (Mestrado em Zootecnia)– Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2017. / Submitted by Francisca Gomes (francisbeserra@yahoo.com.br) on 2017-06-27T17:47:46Z No. of bitstreams: 1 2017_dis_inlima.pdf: 1632135 bytes, checksum: 918cc10f876699ef6b93672c3b08316d (MD5) / Approved for entry into archive by Jairo Viana (jairo@ufc.br) on 2017-06-29T18:05:25Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2017_dis_inlima.pdf: 1632135 bytes, checksum: 918cc10f876699ef6b93672c3b08316d (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-29T18:05:25Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2017_dis_inlima.pdf: 1632135 bytes, checksum: 918cc10f876699ef6b93672c3b08316d (MD5) Previous issue date: 2017 / This study was deseloped at four ranches of the urban area of the municipal district of São Carlos – São Paulo, Brazil, in the period of November of 2005 to January of 2007, analyzing pollen loads of females of Euglossa cordata and Eulaema nigrita that have visited flowers of Thevetia peruviana (Apocynaceae) in the streets of the city, and shown points of coccurence of those bees in the Neotropical Region. The objective was to evaluate the overlap of trophic niches for the immatures in collection places and the amplitude of ecological niches between the two species of bees. Qualitative and quantitative analyses were accomplished on 175 pollen load samples for Euglossa cordata and 45 for Eulaema nigrita collected at the four ranches of the urban area, and made modeling the ecological niche starting from the construction maps of potential distribution for the two species of bees and and species of more abundant plants species in their diets. The analysis showed 37 pollen types used in the diet of Euglossa cordata and 12 for Eulaema nigrita, where the species of more abundant plant in the diet of both bees were Psidium guajava L. (Myrtaceae), Tradescantia zebrina Heynh. ex Bosse (Commelinaceae) and Solanum paniculatum L. (Solanaceae). The types more frequent pollen in the diet toEulaema nigrita were of Solanum paniculatum and Psidium guajava, while Euglossa cordatacollected Solanum paniculatum and Tradescantia zebrina, being Solanum paniculatum the plant species shared by both species of bee. The modeling of potential distribution, for Euglossa cordataand Eulaema nigritashowed that both evince potential distribution similar in areas of occurrence in the Neotropical region, and they overlap in the distribution of ecological niche in most areas of occurrence in the region. / O presente estudo foi desenvolvido em quatro sítios da área urbana do município de São Carlos - São Paulo, no período de novembro de 2005 a janeiro de 2007, analisando a carga polínica das fêmeas de Euglossa cordata e Eulaema nigrita que visitaram flores de Thevetia peruviana (Apocynaceae) nas ruas da cidade, e mostrando pontos de ocorrência dessas abelhas na Região Neotropical. O objetivo foi avaliar a sobreposição do nicho trófico para os imaturos, os sítios de coleta e a amplitude do nicho ecológico entre as duas espécies de abelhas. Foram feitas análises qualitativas e quantitativas de 175 amostras de carga polínica para Euglossa cordata e 45 para Eulaema nigrita, coletados nos quatros sítios da área urbana, e feita a modelagem do nicho ecológico a partir da construção de mapas de distribuição potencial para as duas espécies de abelhas e espécies de plantas mais abundantes em suas dietas. As análises mostraram 37 tipos polínicos usados na dieta da Euglossa cordata e 12 para Eulaema nigrita, em que as espécies de plantas mais abundantes na dieta das duas abelhas foram: Psidium guajava L. (Myrtaceae), Tradescantia zebrina Heynh. ex Bosse (Commelinaceae) e Solanum paniculatum L. (Solanaceae). Os tipos polínicos mais frequentes na dieta de Eulaema nigrita foram os de Solanum paniculatum e Psidium guajava, enquanto que Euglossa cordata coletou Solanum paniculatum e Tradescantia zebrina, sendo Solanum paniculatum a espécie de planta compartilhada pelas duas espécies de abelha. O modelo de distribuição potencial para Euglossa cordata e Eulaema nigrita mostrou que ambas exibem distribuição potencial semelhante nas áreas de ocorrência da região Neotropical, e se sobrepõem em distribuição do nicho ecológico na maior parte de ocorrência nessa região.

Ctenomys flamarioni e Ctenomys australis são dois roedores subterrâneos da América do Sul listados como em perigo na IUCN Red List of Threatened Species. Eles pertencem ao grupo mendocinus do gênero Ctenomys e consequentemente algumas características são comuns, por exemplo, cariótipo com 2n=48, a grande quantidade de heterocromatina e a forma assimétrica dos espermatozoides. Além disso, Ctenomys flamarioni e Ctenomys australis ocorrem em restritos e similares habitats: a primeira linha de dunas. O primeiro, no Rio Grande do Sul, extremo sul do Brasil, e o segundo em Buenos Aires, uma província no nordeste da Argentina. Durante o Último Máximo Glacial, estas duas costas eram geograficamente unidas e consequentemente o Rio da Prata não havia sido formado ainda, portanto não atuava como uma barreira reprodutiva. Um estudo sobre especiação alopátrica foi conduzido na presente dissertação, usando modelagem de nicho ecológico para identificar áreas de alta adequabilidade para essas espécies durante o Último Máximo Glacial, Holoceno e o Presente. Além de análises moleculares de sequências da Região Controladora do DNA mitocondrial (mtDNA) Região que foram usadas para identificar padrões filogeográficos e uma estimativa do tempo de divergência das espécies. Nossas analises suportam a hipótese que o surgimento do Rio da Prata durante o período de deglaciação entre o último Máximo Glacial e o Holoceno bloqueou o fluxo gênico e permitiu o processo de especiação entre Ctenomys australis e Ctenomys flamarioni. / Ctenomys flamarioni and Ctenomys australis are two South American rodents listed as endangered on IUCN Red List of Threatened Species. They belong to the mendocinus group of the genus Ctenomys and consequently some characteristics are common, such as the karyotype with 2n=48, the large amount of heterochromatin and the simple asymmetrical form of the spermatozoa. Furthermore, Ctenomys flamarioni and Ctenomys australis occurs at restrict and similar habitats: the first line of sand dunes. The first one is in Rio Grande do Sul, the extreme south of Brazil, and the second one is in Buenos Ayres, the northeastern province of Argentina. During the Last Glacial Maximum, these two coastlines were geographically linked, hence de La Plata River had not been formed yet as a reproductive barrier. A study of allopatric speciation was conducted at the present dissertation, using ecological niche models to identify areas of high suitability of these species during the Last Glacial Maximum, Holocene and Present. Also, Molecular analysis of mitochondrial DNA (mtDNA) control region (D-loop) sequences was used to clarify phylogeographic patterns and divergence time estimation of these species. Our analysis supports the hypothesis that the rising of De La Plata River during the deglaciation period between the Last Glacial Maximum and the Holocene blocked the gene flow and allowed the speciation process among Ctenomys australis and Ctenomys flamarioni.

Ctenomys flamarioni e Ctenomys australis são dois roedores subterrâneos da América do Sul listados como em perigo na IUCN Red List of Threatened Species. Eles pertencem ao grupo mendocinus do gênero Ctenomys e consequentemente algumas características são comuns, por exemplo, cariótipo com 2n=48, a grande quantidade de heterocromatina e a forma assimétrica dos espermatozoides. Além disso, Ctenomys flamarioni e Ctenomys australis ocorrem em restritos e similares habitats: a primeira linha de dunas. O primeiro, no Rio Grande do Sul, extremo sul do Brasil, e o segundo em Buenos Aires, uma província no nordeste da Argentina. Durante o Último Máximo Glacial, estas duas costas eram geograficamente unidas e consequentemente o Rio da Prata não havia sido formado ainda, portanto não atuava como uma barreira reprodutiva. Um estudo sobre especiação alopátrica foi conduzido na presente dissertação, usando modelagem de nicho ecológico para identificar áreas de alta adequabilidade para essas espécies durante o Último Máximo Glacial, Holoceno e o Presente. Além de análises moleculares de sequências da Região Controladora do DNA mitocondrial (mtDNA) Região que foram usadas para identificar padrões filogeográficos e uma estimativa do tempo de divergência das espécies. Nossas analises suportam a hipótese que o surgimento do Rio da Prata durante o período de deglaciação entre o último Máximo Glacial e o Holoceno bloqueou o fluxo gênico e permitiu o processo de especiação entre Ctenomys australis e Ctenomys flamarioni. / Ctenomys flamarioni and Ctenomys australis are two South American rodents listed as endangered on IUCN Red List of Threatened Species. They belong to the mendocinus group of the genus Ctenomys and consequently some characteristics are common, such as the karyotype with 2n=48, the large amount of heterochromatin and the simple asymmetrical form of the spermatozoa. Furthermore, Ctenomys flamarioni and Ctenomys australis occurs at restrict and similar habitats: the first line of sand dunes. The first one is in Rio Grande do Sul, the extreme south of Brazil, and the second one is in Buenos Ayres, the northeastern province of Argentina. During the Last Glacial Maximum, these two coastlines were geographically linked, hence de La Plata River had not been formed yet as a reproductive barrier. A study of allopatric speciation was conducted at the present dissertation, using ecological niche models to identify areas of high suitability of these species during the Last Glacial Maximum, Holocene and Present. Also, Molecular analysis of mitochondrial DNA (mtDNA) control region (D-loop) sequences was used to clarify phylogeographic patterns and divergence time estimation of these species. Our analysis supports the hypothesis that the rising of De La Plata River during the deglaciation period between the Last Glacial Maximum and the Holocene blocked the gene flow and allowed the speciation process among Ctenomys australis and Ctenomys flamarioni.

Ctenomys flamarioni e Ctenomys australis são dois roedores subterrâneos da América do Sul listados como em perigo na IUCN Red List of Threatened Species. Eles pertencem ao grupo mendocinus do gênero Ctenomys e consequentemente algumas características são comuns, por exemplo, cariótipo com 2n=48, a grande quantidade de heterocromatina e a forma assimétrica dos espermatozoides. Além disso, Ctenomys flamarioni e Ctenomys australis ocorrem em restritos e similares habitats: a primeira linha de dunas. O primeiro, no Rio Grande do Sul, extremo sul do Brasil, e o segundo em Buenos Aires, uma província no nordeste da Argentina. Durante o Último Máximo Glacial, estas duas costas eram geograficamente unidas e consequentemente o Rio da Prata não havia sido formado ainda, portanto não atuava como uma barreira reprodutiva. Um estudo sobre especiação alopátrica foi conduzido na presente dissertação, usando modelagem de nicho ecológico para identificar áreas de alta adequabilidade para essas espécies durante o Último Máximo Glacial, Holoceno e o Presente. Além de análises moleculares de sequências da Região Controladora do DNA mitocondrial (mtDNA) Região que foram usadas para identificar padrões filogeográficos e uma estimativa do tempo de divergência das espécies. Nossas analises suportam a hipótese que o surgimento do Rio da Prata durante o período de deglaciação entre o último Máximo Glacial e o Holoceno bloqueou o fluxo gênico e permitiu o processo de especiação entre Ctenomys australis e Ctenomys flamarioni. / Ctenomys flamarioni and Ctenomys australis are two South American rodents listed as endangered on IUCN Red List of Threatened Species. They belong to the mendocinus group of the genus Ctenomys and consequently some characteristics are common, such as the karyotype with 2n=48, the large amount of heterochromatin and the simple asymmetrical form of the spermatozoa. Furthermore, Ctenomys flamarioni and Ctenomys australis occurs at restrict and similar habitats: the first line of sand dunes. The first one is in Rio Grande do Sul, the extreme south of Brazil, and the second one is in Buenos Ayres, the northeastern province of Argentina. During the Last Glacial Maximum, these two coastlines were geographically linked, hence de La Plata River had not been formed yet as a reproductive barrier. A study of allopatric speciation was conducted at the present dissertation, using ecological niche models to identify areas of high suitability of these species during the Last Glacial Maximum, Holocene and Present. Also, Molecular analysis of mitochondrial DNA (mtDNA) control region (D-loop) sequences was used to clarify phylogeographic patterns and divergence time estimation of these species. Our analysis supports the hypothesis that the rising of De La Plata River during the deglaciation period between the Last Glacial Maximum and the Holocene blocked the gene flow and allowed the speciation process among Ctenomys australis and Ctenomys flamarioni.

Vicia villosa ssp. villosa Roth (VV), es una leguminosa forrajera nativa de Europa (EU) y Asia occidental, que cuenta con una alta adopción en la agricultura mundial. Se la cultiva como forraje en ambientes semiáridos, donde sobresale por su notoria tolerancia al frío, sequía y gran plasticidad productiva. En ambientes con alto potencial agrícola, se la emplea como cultivo de cobertura (CC) o cultivo de servicio, debido a que suprime la interferencia de las malezas y aporta nitrógeno (N) al suelo. Dado que su domesticación es incompleta, puede formar poblaciones espontáneas o sub-espontáneas, que se mantienen bajo resiembra natural. Se estudió la distribución geográfica de las poblaciones naturalizadas de VV en el centro de Argentina (AR), y se las caracterizó fenotípicamente, frente a accesiones introducidas de EU. Se desarrolló un modelo predictivo de emergencia y demografía poblacional, para orientar prácticas de manejo integrado. Los nichos ocupados por las poblaciones naturalizadas se hallaron en áreas perturbadas, con suelos neutros a alcalinos, textura gruesa, con buena capacidad de drenaje. Las condiciones cálidas y secas, que ocurren en el verano junto a la dispersión de las semillas, se asociaron a la entrada y salida de la dormición física (PY). Las condiciones frías y húmedas, tal como ocurren en el invierno, se asociaron al aumento del crecimiento vegetativo. Las poblaciones naturalizadas en AR no mostraron divergencias fenotípicas marcadas entre ellas, aunque si se diferenciaron de las provenientes de EU. La variabilidad observada permitió la selección de genotipos con elevada producción de biomasa de invierno-primavera y diversos niveles de PY. Empleando el modelo predictivo se validó la demografía de la VV en secuencias agrícolas cortas, de años consecutivos o intercalados con un cereal de invierno. La producción y dispersión de semillas son las variables que más influyeron en la resiembra de la VV. Si se impidiera la reposición del banco de semilla del suelo, durante tres o más años consecutivos, se minimizará la aparición de plantas voluntarias. En esta Tesis se caracterizaron 70 accesiones y 29 poblaciones de VV naturalizadas en la región central de AR, que se conservarán como germoplasma útil para futuros programas de mejoramiento. Dos accesiones preservadas desde 2008 fueron utilizadas para generar una variedad que fue inscripta en los registros oficiales del país (Ascasubi INTA) y del exterior (Patagonia INTA). / Vicia villosa ssp. villosa Roth (VV) a winter annual legume is native of Europe (EU) and Western Asia, adopted in several agricultural systems around the world. It is cultivated for pasture grazing in semiarid environments; it is winter hardiness, drought tolerance, and high biomass plasticity. Under environments with high agricultural potential, it is used as a cover crop (CC), with high weed suppression capacity and enhances soil nitrogen (N) content by biological fixation. Being an incompletely domesticated species, VV can form spontaneous or semi-spontaneous populations in a new environment, which high natural reseeding capacity. Niche occupancy based on geographic occurrence and environmental data of naturalized populations in central Argentina (AR) was studied, were phenotypically characterized, and compared to introduce accessions from the EU. A field emergence model considering different crop-legume scenarios was developed to guide integrated management practices. Niche occupancy of naturalized populations showed that these populations were distributed mainly on disturbed areas with coarse soil texture and alkaline-type soils. Low rainfall and warm temperatures during pre- and post-seed dispersal explained the potential distribution under sub-humid and semiarid conditions and were associated with the induction and release of physical dormancy (PY). Cold and wet winter conditions were associated with increased vegetative growth. Local adaptation along environmental gradients did not drive the phenotypic divergence among recently established AR populations, although naturalized AR populations showed strong differentiation with the EU accessions. Detected variation in the quantitative traits allowed the selection of genotypes with high winter-spring biomass production and several PY levels. A simulation model was validated to VV self-regeneration capacity considering different VV–winter cereal crop rotation (pasture-crop phase) scenarios. Seed yield and seed rain were the most important variables affecting seed bank replenishment and VV self-regeneration capacity. From a weed management perspective, VV control should not be a considerable problem as a “volunteer plants” if management practices avoid seed production and seed bank replenishment for at least three consecutive years. In this Thesis, 70 accessions and 29 populations of naturalized VV in the central region of AR were characterized, which will be conserved as useful germplasm for future breeding programs. Two landraces preserved since 2008 were used to generate a variety that was registered in the official records of AR (Ascasubi INTA) and EEUU (Patagonia INTA).

Orientador: Ananda Virginia de Aguiar / Resumo: Myracrodruon urundeuva é uma espécie madeireira natural com grande potencial de uso comercial no Brasil, principalmente nas regiões do Pantanal, do Cerrado e da Caatinga, onde ocorre a exploração de espécies nativas. A exploração intensiva tem causado grande perda de indivíduos e o isolamento de populações em ilhas, devido à fragmentação do habitat da espécie. Assim, a adoção de estratégias para conservação ex situ de espécie nativas torna-se indispensável. Duas propostas foram idealizadas neste trabalho. A primeira foi estimar a variabilidade genética e ganho genético com a seleção de um teste de progênies. O teste de progênie consorciado com as espécies Myracrodruon urundeuva, Terminalia argentea e Astronium fraxinifolium, foi instalado em 12 de julho de 1994 na Fazenda de Ensino, Pesquisa e Extensão (FEPE), do campus de Ilha Solteira (FEIS/UNESP) na cidade Selvíria – MS. O delineamento utilizado foi o de blocos completos casualizados, contendo 28 progênies, seis plantas por parcela e quatro repetições para as espécies instaladas. Os caracteres altura e diâmetro a altura do peito (DAP) foram mensurados aos 24 anos após o plantio. Verificou-se a existência de variação genética significativa entre as progênies para os caracteres analisados. A alta taxa de sobrevivência indica boa adaptação da espécie em testes consorciados. As estimativas do coeficiente de variação genética tiveram resultados de 19,41% e 17,26% para DAP e altura, em nível de indivíduo, e de 9,7% e 8,63%, entr... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Myracrodruon urundeuva is a natural timber species with great potential for commercial use in Brazil, especially in the Pantanal, Cerrado and Caatinga regions, where native species are exploited. Intensive exploitation has caused great loss of individuals and the isolation of populations on islands due to the fragmentation of the species' habitat. Thus, the adoption of strategies for ex situ conservation of native species becomes indispensable. Two proposals were conceived in this work. The first was to estimate the genetic variability and genetic gain with the selection of a progeny test. The progeny test consortium with the species Myracrodruon urundeuva, Terminalia argentea and Astronium fraxinifolium, was installed on July 12, 1994 at the Fazenda de Ensino, Pesquisa e Extensão (FEPE), at the campus of Ilha Solteira (FEIS / UNESP) in the city Selvíria MS. The design was a randomized complete block, containing 28 progenies, six plants per plot and four replications for the species installed. The height and diameter of the chest height (dch) were measured at 24 years after planting. There was significant genetic variation between the progenies for the characters analyzed. The high survival rate indicates good adaptation of the species in intercropping tests. Estimates of the coefficient of genetic variation showed results of 19.41% and 17.26% for DBH and height, at the individual level, and of 9.7% and 8.63% among progenies. The individual heritabilities ranged from moderate... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Duas espécies de cetáceos apresentam padrões de distribuição peculiares ao longo da costa brasileira, muito provavelmente em resposta às condições hidrográficas e topográficas que ocorrem entre 20 e 33°S. A primeira espécie, a franciscana ou toninha (Pontoporia blainvillei), é um golfinho de distribuição restrita do Brasil até a Argentina, que ocorre primariamente na plataforma continental interna, raramente ultrapassando os 50 m de profundidade. Já a segunda espécie, o golfinho-pintado-do-Atlântico (Stenella frontalis), é um golfinho de distribuição restrita ao Oceano Atlântico, que ocupa principalmente a plataforma continental. Estas duas espécies apresentam hiatos ao longo da sua distribuição no Brasil que tem consequências na morfologia e estrutura genética das espécies. Através da aplicação de diferentes métodos, o principal objetivo deste estudo foi investigar a influência do ambiente marinho no padrão de distribuição e na estrutura genética destas duas espécies com ênfase na costa brasileira. No primeiro capítulo, investigou-se a relação do ambiente marinho com o padrão de distribuição da franciscana. Para tanto, uma revisão e atualização da distribuição das áreas de manejo da franciscana (FMA), e dos limites dos hiatos, ao longo do Brasil foram realizadas. Análises de nicho ecológico sugerem que os hiatos fazem parte do nicho fundamental da franciscana que seriam, portanto, relativamente adequados para a espécie.No entanto, o estreitamento da plataforma continental parece ser o principal fator que explica a ausência da espécie nos hiatos e, inclusive poderia explicar a diferenciação genética entre algumas FMAs No segundo e terceiro capítulos, a relação entre similaridade genética e distâncias geográficas e ambientais foram investigadas para o golfinho-pintado-do- Atlântico em duas escalas: ao longo de praticamente toda distribuição e em uma escala mais restrita com ênfase no Brasil. Populações geneticamente distintas ao longo de toda distribuição da espécie foram identificadas com base em um marcador mitocondrial, que podem ser resultado Isolamento por Distância e Isolamento por Resistência, relacionados tanto com condições ambientais contemporâneas quanto do passado (Último Glacial Máximo). As análises de estrutura populacional do golfinho-pintado-do-Atlântico no Brasil, investigada mais profundamente com marcadores genômicos, indicam ao menos a existência de três populações (Brasil, Colômbia e Oceânica) suportanto, portanto, a hipótese de uma população isolada no sudeste do Brasil. De forma geral, conclui-se que o ambiente marinho e, principalmente, fatores como extensão da plataforma continental, batimetria e temperatura tem um papel fundamental para explicar o padrão de distribuição destas espécies no Brasil. Além disso, outros processos podem estar envolvidos na estruturação genética do golfinho-pintado-do-Atlântico e também da franciscana como, por exemplo, estrutura social, filopatria e a história evolutiva destas espécies. O maior desafio para conservação da franciscana é seu status de Criticamente Ameaçada no Brasil e, em relação ao golfinho-pintado-do-Atlântico é a deficiência de dados. Uma vez que ambas espécies ocorrem na porção mais desenvolvida do país, os resultados aqui obtidos têm impacto direto na conservação destas espécies, porque trazem informações que podem ser utilizadas em planos futuros de conservação e manejo. / Along Brazilian coastal waters, either franciscana and Atlantic spotted dolphins exhibited distributional gaps, which is most likely resulting from changes in the environmental features between 20 and 33°S. The former species, franciscana (Pontoporia blainvillei), is a river dolphin with restricted distribution from Brazil to Argentina, recorded mainly up to 50 m deep over the inner shelf. The second species, Atlantic spotted dolphin (Stenella frontalis), is a delphinine dolphin distributed across the Atlantic Ocean, being mainly recorded over the continental shelf. The distribution patterns that these species showed in Brazil have a direct influence on the morphology/ecology and genetic struture of both species. Different approaches were applied to address the main goal of this study, which was investigating the influence of marine environment in shaping the distribution pattern, as well as genetic strcuture of franciscana and Atlantic spotted dolphin with emphasis in the Brazilian coastal waters. In the first chapter, I investigated the franciscana distribution in Brazil using an ecological niche modeling approach. In order to do that, I performed a review of records of the species along Brazial and, updated the limits of franciscana management areas (FMAs) and distributional gaps. The results suggested that gaps are within franciscana fundamental niche and, therefore, both gaps would be suitable for franciscana. However, the narrow of continental shelf seems to be the main factor inhibiting the presence of franciscana in these areas. Furthermore, the narrowing of continental shelf play a role to explain the genetic differentiation among FMAs. In the second and third chapters, the relationship between genetic distances and geographic and environmental distances were investigated both in a restrict and a broad scale. I found genetically distinct populations 12 across Atlantic spotted dolphin distribution based on mtDNA, that are probably resulting of Isolation-by-Distance and Isolation-by-Resistance related both with contemporary and past conditions (e.g. Last Glacial Maximum). Furthermore, I investigated population struture using genomic markers (Single Nucleotide Polymorphisms, SNPs) across Western South Atlantic, Caribbean and Eastern Atlantic. The results suggested at least three different populations, and therefore, confirmed previous hypothesis of an isolated population in the southeastern Brazil. Overall, I concluded that marine envinronment, especially the extension of continental shelf, bathymetry and sea surface temperature, are the main factors that explaning the distribution pattern of franciscana and Atlantic spotted dolphin in Brazil. Besides that, other process such as, social structure and phylopatry, as well as biogeographical process might be investigated in further studies. Franciscana is considered “Critically endangered” in Brazil, and Atlantic spotted dolphin has not enough data to determine its conservation status. Since both species are recorded in the most developed region of the country with high anthropic pressure, my results could help in future management and conservation plans for both species in a regional scale.

A estruturação em comunidades biológicas sugere que há fatores que determinam quais espécies poderão ocorrer juntas. Os pequenos mamíferos sul-americanos (marsupiais e roedores cricetídeos) apresentam um padrão de dispersão no continente sul-americano bastante distinto. Os marsupiais chegaram ao continente há cerca de 100 milhões de anos e os roedores cricetídeos o colonizaram apenas na formação do Istmo do Panamá em aproximadamente 2,5 milhões de anos. Atualmente esses dois grupos ocupam nichos bastante diversos e também específicos. O objetivo geral desta dissertação é explorar padrões funcionais entre pequenos mamíferos sul-americanos, apresentando uma nova métrica de análise e discriminando os principais mecanismos que estruturam esses padrões. Assim, ela está dividida em dois capítulos: o primeiro apresenta uma nova abordagem analítica para o cálculo de divergência funcional entre clados coocorrentes na mesma comunidade; o segundo trata de avaliar os principais determinantes da divergência funcional entre marsupiais e roedores cricetídeos sul-americanos. A métrica desenvolvida no primeiro capítulo foi adaptada da abordagem de diversidade beta funcional, entretanto, ao invés de compararmos pares de comunidades, comparamos pares de clados que coocorrem na mesma comunidade, distinguindo o quanto similiar ou diferente funcionalmente esses clados são. No segundo capítulo, verificamos que fatores ambientais, funcionais, históricos e evolutivos influenciam a divergência funcional entre os dois clados aqui estudados. Além disso, nós encontramos uma tendência de aumento da diferenciação de nicho entre marsupiais e roedores cricetídeos em direção ao norte do continente sul-americano. Nós podemos inferir que a porta de entrada da colonização dos roedores cricetídeos no continente determina, ainda hoje, padrões de funcionalidade dos ambientes, além de outros fatores importantes como o clima. / The existence of structure in biological communities suggests that there are factors that determine which species may occur together. Small mammals of South America (marsupials and cricetid rodents) show a pattern of dispersal in this continent quite different and interesting. Marsupials arrived on South American continent about 100 million years and cricetid rodents only colonized it in the formation of the Isthmus of Panama, approximately 2.5 million years. Currently, these two groups occupy several and specific niches. The major goal of this thesis is to explore functional patterns among small mammals in South America, presenting an analytical novelty and discriminating mechanisms that driving these patterns. Thus it is divided into two chapters: the first presents a new functional approach for the calculation of functional divergence among clades co-occurring in the same community; the second evaluates the main drivers of functional divergence between marsupials and cricetid rodents in South America. The metric developed in the first chapter was adapted from the approach of functional beta diversity, however, instead of comparing pairs of communities, we compared pairs of clades co-occurring in the same community, discriminating how functionally similar or different these clades are. In the second chapter, we found that environmental, functional, evolutionary and historical factors determine the functional divergence among two clades studied here. Furthermore, we found a trend of increased niche differentiation between marsupials and cricetid rodents northward South American continent. We may infer that the gateway of cricetid rodents already determines patterns of functionality in environments nowadays, beyond other important factors, like climate.

A estruturação em comunidades biológicas sugere que há fatores que determinam quais espécies poderão ocorrer juntas. Os pequenos mamíferos sul-americanos (marsupiais e roedores cricetídeos) apresentam um padrão de dispersão no continente sul-americano bastante distinto. Os marsupiais chegaram ao continente há cerca de 100 milhões de anos e os roedores cricetídeos o colonizaram apenas na formação do Istmo do Panamá em aproximadamente 2,5 milhões de anos. Atualmente esses dois grupos ocupam nichos bastante diversos e também específicos. O objetivo geral desta dissertação é explorar padrões funcionais entre pequenos mamíferos sul-americanos, apresentando uma nova métrica de análise e discriminando os principais mecanismos que estruturam esses padrões. Assim, ela está dividida em dois capítulos: o primeiro apresenta uma nova abordagem analítica para o cálculo de divergência funcional entre clados coocorrentes na mesma comunidade; o segundo trata de avaliar os principais determinantes da divergência funcional entre marsupiais e roedores cricetídeos sul-americanos. A métrica desenvolvida no primeiro capítulo foi adaptada da abordagem de diversidade beta funcional, entretanto, ao invés de compararmos pares de comunidades, comparamos pares de clados que coocorrem na mesma comunidade, distinguindo o quanto similiar ou diferente funcionalmente esses clados são. No segundo capítulo, verificamos que fatores ambientais, funcionais, históricos e evolutivos influenciam a divergência funcional entre os dois clados aqui estudados. Além disso, nós encontramos uma tendência de aumento da diferenciação de nicho entre marsupiais e roedores cricetídeos em direção ao norte do continente sul-americano. Nós podemos inferir que a porta de entrada da colonização dos roedores cricetídeos no continente determina, ainda hoje, padrões de funcionalidade dos ambientes, além de outros fatores importantes como o clima. / The existence of structure in biological communities suggests that there are factors that determine which species may occur together. Small mammals of South America (marsupials and cricetid rodents) show a pattern of dispersal in this continent quite different and interesting. Marsupials arrived on South American continent about 100 million years and cricetid rodents only colonized it in the formation of the Isthmus of Panama, approximately 2.5 million years. Currently, these two groups occupy several and specific niches. The major goal of this thesis is to explore functional patterns among small mammals in South America, presenting an analytical novelty and discriminating mechanisms that driving these patterns. Thus it is divided into two chapters: the first presents a new functional approach for the calculation of functional divergence among clades co-occurring in the same community; the second evaluates the main drivers of functional divergence between marsupials and cricetid rodents in South America. The metric developed in the first chapter was adapted from the approach of functional beta diversity, however, instead of comparing pairs of communities, we compared pairs of clades co-occurring in the same community, discriminating how functionally similar or different these clades are. In the second chapter, we found that environmental, functional, evolutionary and historical factors determine the functional divergence among two clades studied here. Furthermore, we found a trend of increased niche differentiation between marsupials and cricetid rodents northward South American continent. We may infer that the gateway of cricetid rodents already determines patterns of functionality in environments nowadays, beyond other important factors, like climate.

Submitted by Alison Vanceto (alison-vanceto@hotmail.com) on 2017-02-22T12:21:27Z No. of bitstreams: 1 TeseVSS.pdf: 3644712 bytes, checksum: 52a7af0e0f9047b3892c1fad788e80a2 (MD5) / Approved for entry into archive by Ronildo Prado (ronisp@ufscar.br) on 2017-03-16T19:27:31Z (GMT) No. of bitstreams: 1 TeseVSS.pdf: 3644712 bytes, checksum: 52a7af0e0f9047b3892c1fad788e80a2 (MD5) / Approved for entry into archive by Ronildo Prado (ronisp@ufscar.br) on 2017-03-16T19:27:58Z (GMT) No. of bitstreams: 1 TeseVSS.pdf: 3644712 bytes, checksum: 52a7af0e0f9047b3892c1fad788e80a2 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-16T20:10:18Z (GMT). No. of bitstreams: 1 TeseVSS.pdf: 3644712 bytes, checksum: 52a7af0e0f9047b3892c1fad788e80a2 (MD5) Previous issue date: 2016-11-18 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Community ecology aims to disentangle the relative influence of the drivers of community assembly. My thesis is composed of four chapters with different focus on the drivers of assembly in natural and simulated communities. In the first chapter we studied stream aquatic insects over 600 km extension. We found that the phylogenetic structure of communities had a spatial signature, suggesting dispersal limitation. We found that large insects, with high flight capacity and with univoltine life cycles were the most affected by spatial distance. We suggest that the number of generation per year and hence the number of dispersal events is a strong factor for the distribution of aquatic insects. In the second chapter we studied the assembly of stream insects over a smaller scale in the Itanhaém river basin. We were interested on the influence of competition and environmental filtering on the functional and phylogenetic structure of insects. If environmental filtering was strong, traits of respiration type and pollution sensitivity should be more similar than expected by chance, while if competition was strong we should find less similarity in feeding strategies among co-occurring taxa. We found evidence of environmental filtering but not of strong competition. Additionally, we found common co-occurrence of ancient clades of aquatic insect orders, likely due to the stability of stream habitats along evolutionary scale. In the third chapter we also investigated competition and environmental filtering, but we used odonates, a group with aggressive behavior against visually similar species. This happen because it cannot properly identify if a similar individual is a mate competitor or not. Even in this case, we found more evidence of environmental filtering, likely because related odonates have similar reproductive strategies linked to specific riverine characteristics, forcing these related species to co-occur. In the fourth chapter we were interested again on the signatures of competition, however we used computational simulations to generate communities assembled by competition. We aimed to identify if the observational approach could indeed identify competitive exclusion. Simulated communities were generally composed of similar species, because species with small competitive difference do not exclude each other. Strikingly, we commonly found random patterns owing to the relaxed competition diluted among multiple species. In conclusion, we found that the assembling of natural and simulated communities is influenced by dispersal and history on the regional scale, and by environmental filtering on the local scale. The influence of competition is still open to questioning given the lack of reliability of the traditional observational approach. / A ecologia de comunidade visa separar a influência relativa de diferentes processos na montagem de comunidades naturais. Minha tese é composta por quatro capítulos com diferentes focos sobre os processos de montagem de comunidades naturais e simuladas. No primeiro capítulo, estudamos insetos aquáticos de riachos ao longo de 600 km. Descobrimos que a estrutura filogenética de comunidades tinha uma assinatura espacial, sugerindo limitação de dispersão. Descobrimos que grandes insetos, com capacidade de voo alta e com apenas um ciclo de vida ao ano foram os mais estruturados espacialmente. Sugerimos que o número de gerações por ano e, consequentemente, o número de eventos de dispersão é um forte fator para a distribuição de insetos aquáticos. No segundo capítulo, estudamos a montagem de insetos em uma escala menor, na bacia do rio Itanhaém-SP. Nosso interesse foi na competição e filtragem ambiental sobre a estrutura funcional e filogenética de insetos aquáticos. Se a filtragem ambiental fosse forte, atributos de respiração e sensibilidade à poluição deveriam ser mais semelhantes do que o esperado ao acaso, enquanto que, se a competição fosse forte deveríamos encontrar uma menor semelhança em estratégias de alimentação entre taxa coocorrentes. Encontramos evidências de filtragem ambiental, mas não de forte competição. Além disso, encontramos coocorrência de insetos aquáticos de clados antigos, provavelmente devido à estabilidade dos habitats de riachos ao longo da escala evolutiva. No terceiro capítulo, também investigamos a competição e a filtragem ambiental, mas usamos libélulas, um grupo com o comportamento agressivo contra espécies visualmente semelhantes. Isto acontece porque elas não identificam corretamente se um indivíduo é um competidor por parceiros da mesma espécie, ou não. No mesmo estudo, encontramos mais evidências de filtragem ambiental, provavelmente porque libélulas aparentadas têm estratégias reprodutivas semelhantes ligadas a características específicas dos rios, forçando estas espécies aparentadas a coocorrer. No quarto capítulo estávamos interessados novamente na competição, no entanto, usamos simulações computacionais para gerar comunidades influenciadas pela competição. Objetivamos identificar se a abordagem observacional poderia realmente identificar exclusão competitiva. Comunidades simuladas foram compostas por espécies semelhantes, porque as espécies com poucas diferenças competitivas não se excluem mutuamente. Surpreendentemente, nós comumente encontramos padrões aleatórios, devido à competição relaxada diluída entre múltiplas espécies. Concluindo, nós identificamos que a montagem de comunidades naturais e simuladas é influenciada pela dispersão e história na escala regional, e pela filtragem ambiental na escala local. A influência de competição ainda está aberta a perguntas, dada à falta de confiabilidade que encontramos na abordagem observacional tradicional.