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Determinantes de riqueza e padrões de uso de plantas hospedeiras por moscas-das-frutas (diptera:tephritidae)

Gomes, Lucas Gontijo 19 July 2013 (has links)
Submitted by Jaqueline Silva (jtas29@gmail.com) on 2014-10-06T17:46:50Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Lucas Gontijo Gomes - 2013.pdf: 491866 bytes, checksum: e2e59f1185f536c08f62a07a0db31bf8 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Approved for entry into archive by Jaqueline Silva (jtas29@gmail.com) on 2014-10-06T19:17:43Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Lucas Gontijo Gomes - 2013.pdf: 491866 bytes, checksum: e2e59f1185f536c08f62a07a0db31bf8 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-10-06T19:17:43Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Lucas Gontijo Gomes - 2013.pdf: 491866 bytes, checksum: e2e59f1185f536c08f62a07a0db31bf8 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2013-07-19 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / (Sem resumo em inglês) / Maioria dos insetos herbívoros se alimenta de um subconjunto de plantas proximamente relacionadas. Como consequência, locais com maior diversidade filogenética de plantas devem ter maior riqueza de herbívoros. Entretanto o mesmo parece não ser verdade quando o incremento na riqueza local de plantas é devido ao elevado número de espécies de plantas exóticas. Sendo assim, eu perguntei se a riqueza local de herbívoros é predita pela riqueza de plantas nativas, pela riqueza de plantas exóticas e pela diversidade filogenética das plantas hospedeiras. Adicionalmente perguntamos se a diversidade filogenética de plantas de um local tende a aumentar com o aumento do número de plantas exóticas. Para responder essas perguntas eu usei dados secundários de interações entre moscas-das-frutas e plantas frutíferas. Eu encontrei que a riqueza de plantas nativas explica a riqueza local de herbívoros melhor até do que o número total de plantas hospedeiras. Encontramos que a diversidade filogenética das plantas também explica a riqueza de herbívoros, embora fracamente. Plantas exóticas não aumentam desproporcionalmente a diversidade filogenética de plantas de um local. Os resultados indicam que o compartilhamento de história evolutiva entre plantas e herbívoros e restrições filogenéticas no consumo da hospedeira são importantes na determinação de interação entre herbívoros e plantas. Eles sugerem também que usar o número de espécies de plantas nativas e exóticas (sem distinção entre elas) para explicar a riqueza de herbívoros em um local pode não ser a melhor opção.
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Ecologia e conservação de comunidades de lagartos em três parques nacionais do Cerrado no Planalto Central brasileiro

Santoro, Guilherme Ramalho Chagas Cataldi 18 November 2016 (has links)
Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Zoologia, 2016. / Submitted by Raquel Almeida (raquel.df13@gmail.com) on 2017-06-26T16:20:06Z No. of bitstreams: 1 2016_GuilhermeRamalhoChagasCataldiSantoro.pdf: 3452832 bytes, checksum: 19d934f667cb1c423257d010a4674404 (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana (raquelviana@bce.unb.br) on 2017-08-15T14:24:10Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2016_GuilhermeRamalhoChagasCataldiSantoro.pdf: 3452832 bytes, checksum: 19d934f667cb1c423257d010a4674404 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-08-15T14:24:10Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2016_GuilhermeRamalhoChagasCataldiSantoro.pdf: 3452832 bytes, checksum: 19d934f667cb1c423257d010a4674404 (MD5) Previous issue date: 2017-08-15 / O conhecimento sobre como as espécies e linhagens se distribuem é essencial para compreender padrões biogeográficos e para a elaboração de estratégias voltadas à conservação. A distribuição da herpetofauna do Cerrado está fortemente associada à variação horizontal da paisagem. Tanto a distribuição regional quanto local da herpetofauna ainda não são bem conhecidas e existe escassez de informações básicas, especialmente em regiões em bom estado de conservação. Neste estudo, são utilizados dados de três Unidades de Conservação de Proteção Integral (Parques Nacionais de Brasília – PNB e Chapada dos Veadeiros – PNCV e o Parque Estadual de Terra Ronca PETER) para testar padrões ecológicos relevantes no entendimento de processos responsáveis pela distribuição da diversidade de lagartos no Cerrado. Além de gerar informações valiosas para planejamentos voltados a conservação da biodiversidade do bioma. São abordadas questões relacionadas distribuição da diversidade, uso de fitofisionomias, diversidade beta (taxonômica e filogenética), além da utilização de microhábitats pelas espécies e linhagens. Foram registradas 778 indivíduos de 31 espécies, de nove famílias de lagartos, sendo 39% endêmicos. Nove espécies foram registradas exclusivamente em PETER, seis no PNB e cinco no PNCV. A comunidade de lagartos do PNB foi a mais diversa em relação às formações abertas. No total de registros em cada UC, PETER foi a área mais diversa entre as três. Em todas as UCs as espécies foram predominantemente encontradas em áreas abertas. A análise de espécies indicadoras mostrou associações significativas de 15 espécies a fisionomias específicas, sendo que sete foram associadas exclusivamente a uma fitofisionomia. A diversidade beta local foi maior no PNCV provavelmente devido à heterogeneidade maior da paisagem. O turnover foi o componente mais importante para explicar as diferenças, tanto no PNCV quanto no PNB. A diversidade beta regional apresentou valor mais alto que a local e o turnover foi o componente mais importante. Quanto à diversidade beta filogenética, as diferenças foram menores, mostrando que as linhagens que compõem as comunidades nestas áreas compartilham a origem evolutiva. A maioria das espécies não apresentou associação com a disponibilidade de micro-hábitats. Apenas Tropidurus itambere e Micrablepharus atticolus mostraram associação com microhábitats característicos de formações abertas no PNB. A filogenia não explicou a utilização dos micro-hábitats. As espécies foram separadas quanto a sua morfologia, formando quatro grupos (“forrageadores ativos”, “discretivos”, “semi-arborícolas” e “termoreguladores de superfície lisa”). Assim como para as espécies, a abundância destes grupos não foi explicada pela disponibilidade de micro-hábitats. A seleção da morfologia das espécies apresenta tanto um componente filogenético quanto ecológico. Porém, apenas para Gymnophtalmideos a análise mostrou relação entre a filogenia e a morfologia. As espécies foram separadas em grupos morfológicos. A frequência dos grupos morfológicos é diferente nas UC e “forrageadores ativos” são mais frequentes no PNCV e os “semi-arborícolas” no PNB se comparados às outras UCs. A heterogeneidade mostrou grande importância na ocorrência e manutenção das espécies nas localidades. A adição do maior número de fisionomias deve ser uma prioridade no planejamento de UCs no Cerrado e em levantamentos faunísticos. Apesar de uma alta complementariedade entre as UCs, as linhagens que compõem estas comunidades são próximas filogenéticamente, limitando a capacidade de gerar respostas rápidas frente a grandes alterações ambientais. Assim, é preciso que iniciativas voltadas à conservação da biodiversidade do Cerrado, incorporem informações de diversidade filogenética, para garantir a capacidade de resiliência e serviços ecológicos importanes para a manutenção dos ecossistemas. / The knowledge on how species and evolutionary lineages are distributed in space is essential to understand biogeographic patterns and for conservation planning. The Cerrado herpetofauna distribution is strongly associated with the lanscape horizontal variation and the seasonality. Both the regional and local distribution of the herpetofauna is not completely understood. Basic biological information is lacking, especially in well conserved areas. In this study we use results of lizards surveys conducted in three Cerrado protected areas (Brasília - PNB and Chapada dos Veadeiros – PNCV National Parks and Terra Ronca State Park - PETER) to test relevant ecological patterns related to the knowledge of processes responsible for the diversity distribution in Cerrado biome. In addition, we discuss the implication of these informations in conservation planning. We focus on diversity distribution, the use of physiognomies, betadiversity (taxonomic and phylogenetic), and microhabitats use of species and lineages. We registered 778 individuals of 31 species, belonging to nine lizard families, from which were 39% endemic species. Nine species were recorded exclusively in PETER, six in PNB and five in PNCV. Brasília National Park community had the highest number of species inhabiting open formations. Regarding, the total number of lizards recorded in each protected area, PETER was the most diverse of them and lizards were predominantly found in open formations in all areas. The indicator species analysis shows significant associations of 15 species with specific physiognomies, seven being exclusively associated with only one of them. Local beta-diversity is higher in PNCV, probably due to horizontal heterogeneity. Turnover was the most important component to explain the differences, both in PNCV and PNB. Regional beta-diversity (among areas) is higher than local, and the turnover is the most important component to generate differences between areas. The areas presented low phylogenetic beta-diversity, showing that the lineages that compose the communities in these areas share an evolutionary origin, especially PETER and PNCV. Most species do not have significant associations with microhabitat availability. Only Tropidurus itambere and Micrablepharus atticolus showed association with microhabitats from open formations of PNB. Microhabitat use is not explained by species phylogeny in the sampled areas. Lizards were separated according to their morphology, forming four groups ("active foragers", "discretive", "semi-arboreal" and "smooth surface thermoregulators"). As for species, the abundance of these groups is not explained by the availability of microhabitats. Apparently, both phylogeny and ecology act in shaping the morphology of the species. However, the conducted analyses showed that morphology is significantly related to phylogeny only for Gymnophtalmidae. The frequency of morphological groups is different in each area, with "active foragers" being more frequent in PNCV and “semiarboreals” in PNB, compared to the other areas. Our results show that habitat heterogeneity is important for the occurrence and maintenance richness and biodiversity in these areas. Adding as many physiognomies as possible should be a priority in conservation planning in Cerrado, as well as in biodiversity survey programs. Despite a great complementarity among sites, the species that compose these communities are phylogenetically close, limiting the ability to generate rapid responses to great climatic and environmental changes. Thus, informations based on phylogenetic diversity must be incorporated in conservation strategies in Cerrado, to ensure the capacity of resilience and maintain important ecological services in threatned ecossistems.
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Distribuição e conservação de anfíbios no cerrado em cenários atuais e futuros

Silvano, Débora Leite 04 1900 (has links)
Tese (doutorado)—Universidade de Brasília,Instituto de Ciências Biológicas, 2011. / Submitted by Shayane Marques Zica (marquacizh@uol.com.br) on 2011-09-05T19:01:30Z No. of bitstreams: 1 2011_DeboraLeiteSilvano.pdf: 11541396 bytes, checksum: 06305791209d82c6d9c09937389dceca (MD5) / Approved for entry into archive by LUCIANA SETUBAL MARQUES DA SILVA(lucianasetubal@bce.unb.br) on 2011-09-20T15:59:54Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2011_DeboraLeiteSilvano.pdf: 11541396 bytes, checksum: 06305791209d82c6d9c09937389dceca (MD5) / Made available in DSpace on 2011-09-20T15:59:54Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2011_DeboraLeiteSilvano.pdf: 11541396 bytes, checksum: 06305791209d82c6d9c09937389dceca (MD5) / O Brasil é o país que possui a maior diversidade de anfíbios do mundo, mas oconhecimento e, principalmente, as ações de conservação acerca desta fauna ainda émínimo. Os anfíbios são animais globalmente ameaçados, com populações em francodeclínio distribuídas por todo o mundo e com significativa concentração na regiãoneotropical e por isso merecem uma atenção especial. O Cerrado, um dos hotspots paraconservação da biodiversidade mundial, se destaca pela falta de conhecimento epolíticas de conservação adequadas. Este estudo teve como objetivo geral avançar noconhecimento sobre a fauna de anfíbios anuros no Cerrado, avaliar o estado atual efuturo de conservação deste grupo no bioma e fornecer subsídios para políticas eestratégias de conservação necessárias. No primeiro capítulo buscamos determinar osfatores ambientais contemporâneos e histórico-evolutivos que melhor predizem ospadrões de distribuição da riqueza de espécies e diversidade filogenética dos anfíbios noCerrado. Verificamos que riqueza e diversidade filogenética são dois componentesdistintos da biodiversidade e apresentam diferentes respostas a variáveis ambientais e,consequentemente, possuem distribuições geográficas distintas. A riqueza de anurosconcentra-se entre as regiões central e sudeste do Cerrado enquanto que a diversidadefilogenética concentra-se principalmente nas regiões central e norte. O segundo capítuloé uma previsão dos efeitos das mudanças climáticas e da perda de hábitat sobre espéciesde anfíbios endêmicas do bioma. Neste estudo, nós modelamos a distribuição potencialde espécies de anfíbios anuros endêmicas do Cerrado em resposta a uma média decenários de mudanças climáticas previstas para 2050. Estes modelos foram associados amodelos de previsão da degradação de habitat no Cerrado, em 2050, com o objetivo deavaliar não somente os efeitos das mudanças climáticas sobre esses animais, mastambém os efeitos da sinergia entre a perda de habitat e mudanças climáticas. Asanálises foram realizadas em dois cenários distintos: com e sem restrições à dispersãodas espécies. No cenário mais realista (com restrição), a maioria das espécies vai sofrermais contração do que expansão de áreas adequadas à sua ocorrência em 2050. Adireção predominante de deslocamento para o sudeste é preocupante, uma vez que asáreas do sudeste são as mais perturbadas e densamente povoadas do Brasil. Se aocupação humana no Cerrado continuar em direção ao norte, como esperado, aproporção de habitats naturais restantes será tão pequena que a riqueza de anfíbios seráreduzida para menos da metade. O terceiro e último capítulo trata de prioridades para aconservação da diversidade evolutiva dos anfíbios no Cerrado. Neste estudo realizamosuma análise de lacunas para avaliar o estado de proteção de espécies endêmicas deanuros do Cerrado. Em seguida, selecionamos áreas prioritárias para a conservaçãodesse bioma com base em uma abordagem de planejamento sistemático da conservação,incluindo também atributos das espécies como critérios de priorização. Cinquenta eduas espécies são consideradas espécies-lacuna, sendo que 19 delas estãocompletamente fora de Unidades de Conservação. As áreas prioritárias estão localizadasna porção central do Cerrado, e incluem vales de rios e montanhas. As áreas prioritáriasselecionadas aqui são também as regiões mais ricas e que possuem a maior diversidadefilogenética do bioma, demonstrando seu alto potencial para a conservação da históriaevolutiva das linhagens no Cerrado. _______________________________________________________________________________ ABSTRACT / Brazil is well known as the world leader in amphibian diversity and also for the scarcityof knowledge and actions to promote amphibian conservation. Amphibians areexperiencing population decline all over the world, especially in the neotropics bringingto them special attention. Regarding to Cerrado biome, a biodiversity hotspot forconservation, lack of knowledge and appropriate conservation policies stands out. Thiswork aimed to bring and advance on knowledge about the Cerrado anurans’ fauna in theapproaching it through the evaluation of current and future scenarios about amphibianconservation status. The body of knowledge produced here provided information forconservation strategies and policies. In the first chapter we look after historical andcontemporary environmental factors that best predict the distribution patterns of speciesrichness and phylogenetic diversity of amphibians in the Cerrado. We found thatrichness and phylogenetic diversity are two distinct components of biodiversity, whichare differently impacted by environmental variables and consequently showing differentgeographical distributions. The richness is concentrated between the central andsoutheast of Cerrado while the phylogenetic diversity is concentrated mainly in centraland north areas. The second chapter aimed to investigate models that can predict howclimate changes and habitat loss will affect amphibian species endemic to the biome. Inthis study, we modeled the potential distribution of three endemic or nearly endemicspecies to this biome in response to an average of projected climate changes scenariosfor 2050. These models were associated with predictive models of habitat degradationin Cerrado in 2050, aiming to evaluate not only the effects of climate change on theseanimals, but also the effects of synergy between climate changes and habitat loss.Analyses were performed in two different scenarios: with or without species dispersalrestrictions. In the more realistic scenario (with dispersal restrictions), most species willsuffer with contraction of area suitable for their occurrence in 2050. The predominantdirection of dispersal to the southeast is worrying, since the areas of the southeast areamong the most disturbed and densely populated areas of Brazil. If human occupationin the Cerrado continue northward, as expected, the proportion of remaining naturalhabitats will be so small that the richness of amphibians will be reduced to less than halfof what we have right now. The third and final chapter deals with priorities to promoteevolutionary diversity conservation of amphibians in the Cerrado. In this study weapplied the gap analysis methodology to assess the state of endemic species protection.Based on our results, conservation priority areas were selected taking into account asystematic planning approach for conservation, where specie attributes was taken asprioritization criteria. Fifty-two species were considered gap species, with 19 of themcompletely out of protected areas. The priority areas were located in the central portionof the Cerrado, and include river valleys and mountains. The priority areas selected herewere showed the richest and greatest phylogenetic diversity of the biome, demonstratingits high potential for evolutionary history conservation of amphibian lineages in the Cerrado.
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Influência do habitat na seleção de grupos filogenéticos e atributos funcionais de aves em florestas ribeirinhas amazônicas do Rio Branco

Lima, Gisiane Rodrigues 22 January 2016 (has links)
Submitted by bruna ortiz (brunaortiz.f@gmail.com) on 2016-07-04T13:23:51Z No. of bitstreams: 1 Dissertação-Gisiane R. Lima.pdf: 2658393 bytes, checksum: ad7192984a0e2312329813835b3b2a1d (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-07-21T13:17:41Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação-Gisiane R. Lima.pdf: 2658393 bytes, checksum: ad7192984a0e2312329813835b3b2a1d (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-07-21T13:21:38Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação-Gisiane R. Lima.pdf: 2658393 bytes, checksum: ad7192984a0e2312329813835b3b2a1d (MD5) / Made available in DSpace on 2016-07-21T13:22:14Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertação-Gisiane R. Lima.pdf: 2658393 bytes, checksum: ad7192984a0e2312329813835b3b2a1d (MD5) Previous issue date: 2016-01-22 / FAPEAM - Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas / Riverine forests, locally known as varzeas, represent the second main habitat in terms of area of the Amazon basin. The varzeas are directly influenced by the seasonal flooding caused by raise of the level of the rivers, and reveal a series of different riverine habitats which have specific avifaunas and are directly influenced by a flooding gradient. In the rio Branco basin, these habitats include the rivers themselves, as well as beaches, sandbars, riverine florests, flooded and transitional forests. On the upper rio Branco, flooded forests are replaced by gallery forests. The main goal of this study was to describe the association between those different habitats and the avifauna, and understand how these animal assemblages are functionally and phylogenetically structured. Specifically, I aimed to i) describe patterns of species richness across different riverine habitats; ii) describe how the structural complexity of habitats found along a flooding gradient determines patterns of functional and phylogenetic diversity; iii) compare and relate different diversity metrics (species richness, and functional and phylogenetic diversity); and iv) identify which functional traits are selected by the different habitats. To reach these goals, we conducted three expeditions into the rio Branco from 2012 to 2014. Where we conducted systematic avian surveys across the entire length of the river. Overall, we detected 315 bird species during our surveys, and these were used for all the analyses. To define the list of bird species that occur in each habitat, we complemented the result of our surveys with mist-nets and specimen collections. These specimens were used to obtain morphological measurements related to different functional traits of each species, including measurements of mass, bill length, height, and width, lenght of the tarsus, tail, and nail, and the kipp index, a measurement of flying capacity. To describe phylogenetic diversity, I used data from Jetz et al. (2012) to built a tree with all the 315 species. Our results showed that forest habitats presented higher species richness than relatively simpler habitats, such as rivers, beaches and sand banks.However, bird assemblages associated to rivers and beaches presented higher levels of functional and phylogenetic diversity, showing no correlation between species richness and other diversity metrics. Some functional traits were clearly associated to different habitats; for ex., larger birds with longer bills and tarsi were clearly associated to rivers and beaches, likely related to the life style of aquatic birds and shorebirds. On the other hand, taller and wider bills, typical of granivorous birds, dominated sandbar scrubs. Smaller birds with shorter bills and tarsi were associated to forested environments. This study shows that habitats affect bird species composition, filtering morphologic traits and selecting which species can leave in each habitat. In general, we found a high degree of species especialization, given that 1/3 of the species were exc;usive of certain habitats. This habitat especificity turns riverine birds vulnerable to changes in river hydrology, and changes in riverine habitats due to human interventions can affect dramaticaly the avifauna of the varzeas. / As várzeas amazônicas representam o segundo principal habitat da bacia em termos de área, e se caracterizam por serem alagadas anualmente pelo pulso de inundação resultante do padrao de chuvas da região. As várzeas revelam uma série de ambientes ribeirinhos que são diretamente influencidos por um gradiente de alagamento, e que possuem avifaunas específicas, muitas vezes exclusivas de cada ambiente. Na bacia do Rio Branco, estes ambientes incluem os proprios rios, as praias, bancos de areia com gramíneas e arbustos, embaubais, florestas de várzea, e florestas de transição. Na região do alto rio Branco, as florestas de várzea são substituidas pela florestas de galeria. O principal objetivo deste estudo foi descrever a relação entre as espécies de aves e os ambientes ribeirinhos na bacia do rio Branco, e estudar como as comunidades de aves desses diferentes ambientes se estruturam funcional e filogeneticamente. Especificamente, procurou-se i) avaliar a riqueza de espécies de aves associadas aos diferentes ambientes ribeirinhos do rio; ii) descrever como a complexidade estrutural dos ambientes de várzea encontrados ao longo do gradiente de alagamento determina a diversidade filogenética e funcional das assembleias de aves; iii)_comparar e relacionar diferentes métricas de diversidade de aves (riqueza de espécies, diversidade filogenética e funcional) nos ambientes sucessionais de várzea; e iv) identificar as características funcionais que mais se relacionam aos diferentes ambientes. Para atingir esses resultados, foram realizadas três expedições onde foram realizados inventários padronizados de aves na bacia do rio Branco entre 2012 e 2014. Ao todo, foram registradas 315 espécies de aves durante os censos, as quais foram usadas para as análises. Para definir a lista de espécies que ocorre em cada um dos habitats, os dados obtidos dos censos foram complemantados com capturas com redes de neblina e coleta de especimes. Estes especimes foram usados para obter medidas da morfologia, as quais estariam ligadas às características funcionais de cada espécie, incluindo medidas de peso, comprimento, largura, e altura do bico, comprimento do tarso, cauda e unha, e o índice de kipp, um medida relacionada com a capacidade de voo. Para descrever a diversidade filogenética, foi gerada uma ávore filogenética com dados de terceiros, incluindo as 315 espécies. Os ambientes florestais apresentaram maior riqueza de espécies do que ambientes relativamente mais simples, como ambientes aquáticos, as praias e os bancos de areia. Entretanto, as assembleias de aves associadas aos rios e praias apresentaram maior diversidade filogenética e funcional, mostrando que não existe uma correlação clara entre a riqueza de espécies e a diversidade funcional e filogenética. Alguns atributos funcionais estao claramente associados com os diferentes ambientes da várzea; por ex., aves maiores, bicos e tarsos mais compridos estão associados com os ambintes aquáticos e as praias, diretamente relacionados com o estilo de vida das aves piscívoras ou limícolas, que constituem em sua maioria estes ambientes. Por outro lado, bicos mais altos e largos, típicos de aves granívoras, ocorrem principalmente nos bancos de areia com gramíneas. Aves menores, com bicos e tarsos curtos estão claramente associados com os ambientes florestais. Este trabalho mostra que os ambientes afetam a composição de espécies e filtram dimensões morfológicas funcionais das aves, selecionando espécies. Em termos gerais, este estudo aponta um elevado grau de especializacao da avifauna da várzea, pois cerca de 1/3 das espécies são exclusivas de pelo menos um tipo de ambiente. Esta especificidade de ambiente torna as aves ribeirinhas vulneráveis a mudanças na hidrologia dos rios, que pode afetar de forma drástica a avifauna dos ambientes ribeirinhos.
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Um modelo estocástico de coextinções em redes mutualísticas / A stochastic model for coextinctions in mutualistic networks

Vieira, Marcos Costa 09 May 2014 (has links)
Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2015-03-24T13:35:02Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Marcos Costa Vieira - 2014.pdf: 1715363 bytes, checksum: 449f325b503e6bc2088cd4360689e280 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2015-03-24T14:20:15Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Marcos Costa Vieira - 2014.pdf: 1715363 bytes, checksum: 449f325b503e6bc2088cd4360689e280 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-03-24T14:20:15Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Marcos Costa Vieira - 2014.pdf: 1715363 bytes, checksum: 449f325b503e6bc2088cd4360689e280 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2014-05-09 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / (Sem resumo em outra língua) / A compreensão dos processos de extinção e coextinção das espécies, bem como a capacidade de prever esses eventos, são objetivos fundamentais da ecologia moderna. No caso de espécies ligadas entre si por interações mutualísticas, as coextinções tem sido tradicionalmente estudadas utilizando-se modelos simples baseados na topologia das redes de interação. Aqui, apresentamos um modelo estocástico de coextinções em redes mutualísticas que incorpora duas fontes importantes de variação biológica previamente ignoradas pelos modelos existentes: variação na dependência intrínseca das espécies em relação ao mutualismo, e variação no peso das interações entre uma espécie e seus diferentes parceiros mutualistas. Nosso modelo estocástico permite a simulação de cascatas de extinção muito mais complexas do que aquelas geradas pelos modelos topológicos. Simulações realizadas em redes mutualísticas empíricas mostraram que a frequência e o tamanho das cascatas de extinção aumentam conforme a dependência intrínseca das espécies em relação à interação mutualística. Além disso, os resultados sugerem uma relação negativa entre a fragilidade e a conectância das redes mutualísticas, o que contrasta com resultados anteriores. Por fim aplicamos o modelo para estudarmos o declínio da diversidade funcional e filogenética das comunidades vegetais sob um cenário de extinção dos seus polinizadores.
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Padrões de montagem de comunidades : investigando a estrutura funcional e filogenética para inferir processos em comunidades naturais

Saito, Victor Satoru 18 November 2016 (has links)
Submitted by Alison Vanceto (alison-vanceto@hotmail.com) on 2017-02-22T12:21:27Z No. of bitstreams: 1 TeseVSS.pdf: 3644712 bytes, checksum: 52a7af0e0f9047b3892c1fad788e80a2 (MD5) / Approved for entry into archive by Ronildo Prado (ronisp@ufscar.br) on 2017-03-16T19:27:31Z (GMT) No. of bitstreams: 1 TeseVSS.pdf: 3644712 bytes, checksum: 52a7af0e0f9047b3892c1fad788e80a2 (MD5) / Approved for entry into archive by Ronildo Prado (ronisp@ufscar.br) on 2017-03-16T19:27:58Z (GMT) No. of bitstreams: 1 TeseVSS.pdf: 3644712 bytes, checksum: 52a7af0e0f9047b3892c1fad788e80a2 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-16T20:10:18Z (GMT). No. of bitstreams: 1 TeseVSS.pdf: 3644712 bytes, checksum: 52a7af0e0f9047b3892c1fad788e80a2 (MD5) Previous issue date: 2016-11-18 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Community ecology aims to disentangle the relative influence of the drivers of community assembly. My thesis is composed of four chapters with different focus on the drivers of assembly in natural and simulated communities. In the first chapter we studied stream aquatic insects over 600 km extension. We found that the phylogenetic structure of communities had a spatial signature, suggesting dispersal limitation. We found that large insects, with high flight capacity and with univoltine life cycles were the most affected by spatial distance. We suggest that the number of generation per year and hence the number of dispersal events is a strong factor for the distribution of aquatic insects. In the second chapter we studied the assembly of stream insects over a smaller scale in the Itanhaém river basin. We were interested on the influence of competition and environmental filtering on the functional and phylogenetic structure of insects. If environmental filtering was strong, traits of respiration type and pollution sensitivity should be more similar than expected by chance, while if competition was strong we should find less similarity in feeding strategies among co-occurring taxa. We found evidence of environmental filtering but not of strong competition. Additionally, we found common co-occurrence of ancient clades of aquatic insect orders, likely due to the stability of stream habitats along evolutionary scale. In the third chapter we also investigated competition and environmental filtering, but we used odonates, a group with aggressive behavior against visually similar species. This happen because it cannot properly identify if a similar individual is a mate competitor or not. Even in this case, we found more evidence of environmental filtering, likely because related odonates have similar reproductive strategies linked to specific riverine characteristics, forcing these related species to co-occur. In the fourth chapter we were interested again on the signatures of competition, however we used computational simulations to generate communities assembled by competition. We aimed to identify if the observational approach could indeed identify competitive exclusion. Simulated communities were generally composed of similar species, because species with small competitive difference do not exclude each other. Strikingly, we commonly found random patterns owing to the relaxed competition diluted among multiple species. In conclusion, we found that the assembling of natural and simulated communities is influenced by dispersal and history on the regional scale, and by environmental filtering on the local scale. The influence of competition is still open to questioning given the lack of reliability of the traditional observational approach. / A ecologia de comunidade visa separar a influência relativa de diferentes processos na montagem de comunidades naturais. Minha tese é composta por quatro capítulos com diferentes focos sobre os processos de montagem de comunidades naturais e simuladas. No primeiro capítulo, estudamos insetos aquáticos de riachos ao longo de 600 km. Descobrimos que a estrutura filogenética de comunidades tinha uma assinatura espacial, sugerindo limitação de dispersão. Descobrimos que grandes insetos, com capacidade de voo alta e com apenas um ciclo de vida ao ano foram os mais estruturados espacialmente. Sugerimos que o número de gerações por ano e, consequentemente, o número de eventos de dispersão é um forte fator para a distribuição de insetos aquáticos. No segundo capítulo, estudamos a montagem de insetos em uma escala menor, na bacia do rio Itanhaém-SP. Nosso interesse foi na competição e filtragem ambiental sobre a estrutura funcional e filogenética de insetos aquáticos. Se a filtragem ambiental fosse forte, atributos de respiração e sensibilidade à poluição deveriam ser mais semelhantes do que o esperado ao acaso, enquanto que, se a competição fosse forte deveríamos encontrar uma menor semelhança em estratégias de alimentação entre taxa coocorrentes. Encontramos evidências de filtragem ambiental, mas não de forte competição. Além disso, encontramos coocorrência de insetos aquáticos de clados antigos, provavelmente devido à estabilidade dos habitats de riachos ao longo da escala evolutiva. No terceiro capítulo, também investigamos a competição e a filtragem ambiental, mas usamos libélulas, um grupo com o comportamento agressivo contra espécies visualmente semelhantes. Isto acontece porque elas não identificam corretamente se um indivíduo é um competidor por parceiros da mesma espécie, ou não. No mesmo estudo, encontramos mais evidências de filtragem ambiental, provavelmente porque libélulas aparentadas têm estratégias reprodutivas semelhantes ligadas a características específicas dos rios, forçando estas espécies aparentadas a coocorrer. No quarto capítulo estávamos interessados novamente na competição, no entanto, usamos simulações computacionais para gerar comunidades influenciadas pela competição. Objetivamos identificar se a abordagem observacional poderia realmente identificar exclusão competitiva. Comunidades simuladas foram compostas por espécies semelhantes, porque as espécies com poucas diferenças competitivas não se excluem mutuamente. Surpreendentemente, nós comumente encontramos padrões aleatórios, devido à competição relaxada diluída entre múltiplas espécies. Concluindo, nós identificamos que a montagem de comunidades naturais e simuladas é influenciada pela dispersão e história na escala regional, e pela filtragem ambiental na escala local. A influência de competição ainda está aberta a perguntas, dada à falta de confiabilidade que encontramos na abordagem observacional tradicional.
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Nós precisamos de mais espécies de tetrápodas? / Do we need more tetrapod species?

Jardim, Lucas Lacerda Caldas Zanini 28 March 2014 (has links)
Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2018-09-25T12:11:34Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Lucas Lacerda Caldas Zanini Jardim - 2014.pdf: 1922668 bytes, checksum: 8ba35cacc2f1d99252124085bf81a549 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2018-09-26T11:42:18Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Lucas Lacerda Caldas Zanini Jardim - 2014.pdf: 1922668 bytes, checksum: 8ba35cacc2f1d99252124085bf81a549 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2018-09-26T11:42:18Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Lucas Lacerda Caldas Zanini Jardim - 2014.pdf: 1922668 bytes, checksum: 8ba35cacc2f1d99252124085bf81a549 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2014-03-28 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / We have been describing species for a long time and we have been asking about how many of them are left on the Earth. Species are evolutionary lineages and the answer to that question maybe is not in richness estimates, but in how much of the evolutionary tree was already described. Here, we studied how richness and phylogenetic diversity have been accumulated in Tetrapods and how those metrics differ from each other. We also tested if there were biases for particular clades in species describing process, it would mean non-random description along the phylogeny. We found Amphibia and Squamata have ascendant curves for both metrics, Mammals are beginning its stabilization and Birds are stabilizing for about 60 years. Nonetheless, phylogenetic diversity trends to stabilize firstly than richness, due to the convex relationship between them. We also founde that description has been at random about clades. Thus, more efforts are necessary to improve our phylogenetic resolution of Amphibia, Squamata and Mammals. Once we have an ample sample size in Birds and a random sample along phylogeny, we need to resolve Darwinian and Wallacean shortfalls, taking into consideration the phylogenetic relationship among species, the evolutionary model of their traits and where those species occur. Understanding species as lineages permits us to stabilize early the number of species and to infer which species could have been extinct before description, such as what would be their impacts in conservation, community ecology and ecosystem function. / Nós temos descrito espécies há muito tempo e nos perguntamos sobre quantas delas existem na Terra. Espécies são linhagens evolutivas e a resposta à essa pergunta talvez não esteja na estimativa de riqueza, mas em quanto da árvore evolutiva já foi descrita. Aqui nós estudamos como tem sido o acúmulo de riqueza e diversidade filogenética desde 1758 nos Tetrápodas e como essas duas métricas se diferem. Também testamos se havia vieses para descrições de espécies em determinados clados, indicando descrição não aleatória na filogenia. Nós encontramos que Anfíbios e Squamata possuem curvas ascendentes, Mamíferos estão começando a estabilizar e Aves estão estabilizando nos últimos 60 anos. No entanto, apesar de riqueza e diversidade filogenética serem correlacionadas, a segunda tende a estabilizar primeiro que riqueza, devido a relação convexa entre elas, parecida com as relações espécie-área. Nós também encontramos que o processo de amostragem (descrição) ao longo da filogenia tem sido aleatório. Assim, mais esforços são necessários para melhorarmos nossa resolução filogenética de Anfíbio, Squamata e Mamíferos. Já Aves, uma vez que temos grande tamanho amostral necessitamos focar agora nas suas lacunas Darwinianas e Wallaceanas, resolvendo as incerteza sobre a relação de parentesco entre as espécies, quais são os modelos evolutivos que explicam a evolução de suas características e onde essas espécies ocorrem. Entender espécies como linhagens permite-nos estabilizar o número de espécies mais cedo e inclusive inferir quais espécies poderiam ter sido extintas antes de descritas e quais seriam seus impactos em conservação, ecologia de comunidades e funcionamento de ecossistemas.
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Estruturação de comunidade de plantas lenhosas da caatinga: o efeito de distúrbios antrópicos em um gradiente de precipitação

PEREIRA, Kátia Fernanda Rito 31 March 2015 (has links)
Submitted by Fabio Sobreira Campos da Costa (fabio.sobreira@ufpe.br) on 2017-07-27T12:24:49Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) Pereira 2016_Tese(versão atualizada).pdf: 1847194 bytes, checksum: 1bbe90969d40979662752cf1108d5095 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-07-27T12:24:49Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) Pereira 2016_Tese(versão atualizada).pdf: 1847194 bytes, checksum: 1bbe90969d40979662752cf1108d5095 (MD5) Previous issue date: 2016-03-02 / FACEPE / A expansão das populações humanas promove alterações nos ecossistemas naturais. Estas alterações ocorrem desde a perda de hábitat ao nível de paisagem e a extração de recursos a nível local até mudanças climáticas a nível regional e global. No entanto, pouco se sabe acerca das consequências que estas alterações têm à biodiversidade e estrutura das comunidades de plantas e ao empobrecimento biológico dos ecossistemas e distribuição de espécies em florestas tropicais secas. A Caatinga, um bosque seco do Brasil, possui uma grande área modificada pelas ações humanas e os modelos climáticos predizem que nos próximos anos este ecossistema vai sofrer uma importante redução na precipitação e um aumento na temperatura. Esta tese buscou compreender, em uma escala de paisagem, como ações humanas afetam a composição e estrutura da flora lenhosa da Caatinga. Foram estudadas 18 áreas dentro de 214.3 km2 dominados por Caatinga madura exposta a diferentes tipos de distúrbio. O primeiro capítulo avaliou o efeito aditivo e multiplicativo da precipitação (gradiente de 510 a 940 mm), três preditores de distúrbio crônico (i.e. distancia para fazendas e estradas, densidade de trilhas de caprinos) e um preditor de distúrbio agudo (i.e. porcentagem de cobertura vegetal em um raio de 1 km) sobre a diversidade taxonômica, densidade de indivíduos, equabilidade, composição de espécies e biomassa de indivíduos adultos de árvores e arbustos. A precipitação anual foi o melhor preditor da composição e estrutura da vegetação, afetando positivamente a biomassa e riqueza de espécies, mas reduzindo a equabilidade das comunidades devido à perda de espécies raras em áreas com baixa precipitação. Os distúrbios agudos e crônicos tiveram fraco impacto sobre a vegetação, mas a distância para as estradas esteve negativamente relacionada com a riqueza, densidade e equabilidade das comunidades. No segundo capítulo, foi provada se a diversidade β taxonômica e a diversidade filogenética dentro e entre comunidades (α e β 1086 mm) e com os três preditores de distúrbios crônicos. A disponibilidade hídrica foi o melhor preditor da diversidade α – filogenética e as diversidades β taxonômica e filogenética quando consideradas as espécies raras e comuns, porém não para dominantes. Os distúrbios crônicos não foram bons preditores da diversidade α nem β – filogenética. Apenas a diversidade β – taxonômica quando consideradas espécies raras foi explicada pela limitação de dispersão (i.e. distância geográfica) e distância para estradas. Os resultados desta tese mostram que (i) a disponibilidade de água e os distúrbios crônicos são importantes forças estruturadoras das comunidades de Caatinga, (ii) que a perda de espécies não é aleatória ao longo da filogenia das comunidades e qu – filogenética) mudam com a disponibilidade hídrica (déficit hídrico médio anual, 658– 1086 mm) e com os três preditores de distúrbios crônicos. A disponibilidade hídrica foi o melhor preditor da diversidade α – filogenética e as diversidades β taxonômica e filogenética quando consideradas as espécies raras e comuns, porém não para dominantes. Os distúrbios crônicos não foram bons preditores da diversidade α nem β – filogenética. Apenas a diversidade β – taxonômica quando consideradas espécies raras foi explicada pela limitação de dispersão (i.e. distância geográfica) e distância para estradas. Os resultados desta tese mostram que (i) a disponibilidade de água e os distúrbios crônicos são importantes forças estruturadoras das comunidades de Caatinga, (ii) que a perda de espécies não é aleatória ao longo da filogenia das comunidades e que portanto, (iii) as comunidades locais de plantas não representam um subgrupo aleatório das espécies da flora regional e sim um subgrupo de espécies adaptadas ao estresse hídrico e distúrbios antrópicos. / Human population growth promotes changes in natural ecosystems, ranging from landscape level by habitat loss to regional and global level by climatic changes. However, there is a lack of knowledge about the effects of habitat loss and climatic changes on community biodiversity in Seasonally Dry Tropical Forest (STDF) through changes in vegetation structure and species’ distribution. The Caatinga is Brazilian SDTF threatened by climate change (future predictions estimate a decreasing in precipitation and an increasing in temperature) and by anthropogenic disturbance such as overgrazing, continuously collection of forest products and livestock production. In this study, we tested at landscape scale the impacts of precipitation and human disturbances in the composition and the structure of Caatinga wood flora. We carried out 18 0.1 ha plots across 21 430 ha of Brazilian Caatinga dominated by mature forests exposed to different disturbance types. The first chapter, we evaluated the additive and synergic effects of precipitation (510 to 940 mm gradient), plus three predictors of chronic disturbance (i.e. distance to nearest farm and road, and length of goat trails) and one predictor of acute disturbance (i.e. landscape vegetation cover) on the diversity, stem density, evenness, taxonomic composition and biomass of adult trees and shrubs. The annual mean precipitation was the best predictor of vegetation structure and composition, affecting positively the biomass and species richness, but reducing the community equability due to the rare species loss in low precipitation areas. The acute and chronic disturbance had a weaker impact on vegetation, but the distance to nearest roads was negatively related to species richness and density and community equability. In the second chapter, we prove whether taxonomic β diversity and phylogenetic diversity within and between communities (α e β – phylogenetic) change with water availability (annual average water deficit, 658–1086 mm) and with the three chronic disturbance predictors. The water availability was the best predictor of α – phylogenetic and β taxonomic and phylogenetic diversity when considered rare and common species, but not for dominant species. Chronic disturbances were not good predictors to α or β – phylogenetic diversity. Only β – taxonomic diversity, when considering rare species, was explained by dispersion limitation (i.e. geographic distance) and distance to the nearest road. In this thesis, our results show that (i) the water availability and chronic disturbances are important community assembly forces in Caatinga, (ii) the species loss is not random across the phylogeny and, therefore, (iii) the local plant communities do not represent a random subgroup of regional flora but a subgroup of human disturbance and water stress adapted species.
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Diversidade evolutiva de morcegos: padrões geográficos e aplicações em conservação / Evolutive diversity of bats: geographic patterns and conservation applications

Peixoto, Franciele Parreira 18 March 2013 (has links)
Submitted by Erika Demachki (erikademachki@gmail.com) on 2014-09-23T21:19:16Z No. of bitstreams: 2 Peixoto, Franciele Parreira-Dissertação-2013.pdf: 995120 bytes, checksum: 365969ffce47a58af2a011eb0370ed04 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Approved for entry into archive by Jaqueline Silva (jtas29@gmail.com) on 2014-09-23T21:58:54Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Peixoto, Franciele Parreira-Dissertação-2013.pdf: 995120 bytes, checksum: 365969ffce47a58af2a011eb0370ed04 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-09-23T21:58:54Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Peixoto, Franciele Parreira-Dissertação-2013.pdf: 995120 bytes, checksum: 365969ffce47a58af2a011eb0370ed04 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2013-03-18 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Aim: To investigate global patterns of phylobetadiversity (PBD) in bats, with the purpose to better understand the mechanisms underlying current biodiversity patterns. We also aimed to use a metric that allows partitioning PBD into two components to distinguish the relative roles of local (e.g. lineage filtering) and regional processes (e.g. speciation) in shaping broad-scale patterns of PBD. Furthermore, we analyzed the distance-decay relationship of phylogenetic beta diversity to provide more information about factors that act in the PBD patterns. Location: global, delimited by biogeographic regions. Methods: Using the global distribution of bats and a supertree available for most species, we calculated PBD using the complement of phylosor index. We used a null model to test if two assemblages were more or less phylogenetically dissimilar than expected by chance. In addition, we decoupled PBD into turnover and nestednessresultant components, providing information about two factors that produce differences in assemblage phylogenetic composition. We also performed a Mantel analysis to analyze the distance-decay patterns of PBD and its two components. Results: The most striking difference in PBD was found between the Old and New World “phylogenetic composition”. We found the lowest values of PBD between adjacent regions (i.e., Neotropical/Neartic; Indo-Malay/Paleartic), revealing a strong geographical structure in PBD. These values were even lower when the turnover component was analyzed, demonstrating the differences in the role of regional processes in shaping regional diversity. On the other hand, we found out that for some adjacent regions (e.g., Afrotropical/Paleartic), the observed PBD was higher than expected by chance and comparatively different from expected by the distance decay relationship. This value remained high, even when we analyzed just the PBD turnover component. This demonstrates that although these regions are relatively close in space, there are other factors driving phylogenetic differences between them (e.g. an environmental barrier). Main conclusions: Our analyses revealed differences in the expected patterns of bat PBD among regions, suggesting that at broad scales, besides the effects of distance and geographic barriers, we also have to consider the importance of environmental gradients when studying the phylogenetic origin of bat assemblages. / A abordagem mais comum no uso de PD (diversidade filogenética) para conservação é selecionar locais com maior diversidade evolutiva. Essa estratégia parte do pressuposto de que locais com maior quantidade de PD indicam maior potencial para respostas evolutivas a mudanças ambientais futuras. No entanto, há um crescente debate sobre se as prioridades de conservação deveriam também ser voltadas para locais com baixo valor de PD, que podem representar centros de diversificação de espécies ou “berçários de diversidade”. Alguns trabalhos têm testado se os hotspots globais de biodiversidade, baseados em riqueza, também representam locais de desproporcional concentração de história evolutiva. Nós testamos aqui se os hotspots contêm mais, menos ou igual diversidade filogenética (PD) que o esperado por uma amostragem ao acaso de espécies em qualquer posição na filogenia, para a ordem Chiroptera. Buscamos responder qual a real contribuição de cada hotspot para a conservação de padrões e processos relacionados à diversidade filogenética. Nós utilizamos uma supertree disponível para a maioria das espécies da ordem, e dados de distribuição das espécies. Nós calculamos o PD para cada hotspot separadamente e utilizamos um modelo nulo para obter os valores esperados dado a riqueza. De 34 hotspots, apenas um apresentou maior PD do que o esperado, treze apresentaram valores menores e o restante valores iguais ao esperado. Nós demonstramos que a relação entre PD e riqueza varia entre regiões biogeográficas, de modo que não há como fazer generalizações acerca da contribuição dos hotspots para a conservação de diversidade evolutiva. De modo geral nossos resultados demonstram que devido ao fato da história evolutiva variar regionalmente, também devem ser estabelecidas as prioridades de conservação nessa escala.
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Métodos para sistemas CAD e CADx de nódulo pulmonar baseada em tomografia computadorizada usando análise de forma e textura / Methods for CAD and CAD x-node systems Based on tomography Computed using form analysis and texture

Carvalho Filho, Antonio Oseas de 10 October 2016 (has links)
Submitted by Rosivalda Pereira (mrs.pereira@ufma.br) on 2017-06-23T21:24:53Z No. of bitstreams: 1 AntonioCarvalho.pdf: 2731250 bytes, checksum: 35369a74be0aec3dd6b29a792c37fc35 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-23T21:24:53Z (GMT). No. of bitstreams: 1 AntonioCarvalho.pdf: 2731250 bytes, checksum: 35369a74be0aec3dd6b29a792c37fc35 (MD5) Previous issue date: 2016-10-10 / Lung cancer has been identi ed as the leading cause of death among cancer patients worldwide. The high rates of deaths and instances of records of this type of cancer worldwide demonstrate the importance of the development and research in order to produce resources for the detection and early diagnosis of this disease. Because of the exhaustive analysis process, alternatives such as computational tools that use image processing techniques and pattern recognition have been widely explored. Therefore, to assist the expert in the identi cation and diagnosis of nodules, systems are developed Computer-Aided Detection (CAD) and Computer-Aided Diagnostic (CADx). This thesis proposes the development of methods that reduce false positives, and the diagnosis of volumes of interest in computed tomography. The proposed methods are based on image processing techniques and pattern recognition. For this, biology concepts have been adapted and applied to the study of the branch of the diversity of species; such concepts are the phylogenetic diversity indexes used in this thesis as texture descriptors. In another aspect, techniques that measure the properties of the shape of radiological ndings have been developed and adapted. Subsequently, an evolutionary methodology is used for the selection of the best models for training. Finally, a support vector machine is applied to perform the classi cation. Promising results were found in the 833 tests that we performed; these tests were divided into 80% for training and 20% for testing. In general, for the best results, we have false positive reduction methods, an accuracy of 99.57%, sensitivity of 99.45%, speci city of 99.61%, and an ROC curve of 0.992. The results obtained for the classi cation of the degree of malignancy and benignity are: accuracy of 93.46%, sensitivity of 92.95%, speci city of 93.49%, and an ROC curve of 0.931. / O câncer de pulmão é apontado como a principal causa de morte entre os pacientes com câncer. As altas taxas de mortes e registros de ocorrências desse câncer em todo o mundo demonstram a importância do desenvolvimento e investigação, a fi m de produzir meios para a detecção e o diagnóstico precoce dessa doença. Devido ao exaustivo processo de análise, alternativas como ferramentas de cunho computacional que utilizam técnicas de processamento de imagens e do reconhecimento de padrões têm sido amplamente exploradas. Assim, para auxiliar o especialista na identifi cação e diagnóstico de nódulos, são desenvolvidos sistemas Computer-Aided Detection (CAD) e Computer-Aided Diagnostic (CADx). Esta tese propõe o desenvolvimento de métodos para redução de falsos positivos em um sistema CAD e diagnóstico de nódulos em tomografi a computadorizada. Os métodos propostas baseiam-se em técnicas de processamento de imagens e reconhecimento de padrões. Para tanto, foram adaptados e aplicados os conceitos da biologia no ramo do estudo da diversidade entre espécies, sendo esses os índices de diversidade logenética, usados nesta tese como descritores de textura. Em outro aspecto, foram desenvolvidas e adaptadas técnicas capazes de mensurar propriedades de forma dos achados radiológicos. Seguindo, usou-se uma metodologia evolutiva genética para seleção dos melhores modelos de treinamento. E por fi m, foi aplicada a máquina de vetor de suporte para realizar a classificação . Resultados promissores foram encontrados em teste com 833 exames divididos em 80% para treino e 20% para testes. Em linhas gerais, para os melhores resultados tem-se, nos métodos de redução de falsos positivos: uma acurácia de 99,57%, sensibilidade de 99,45%, especificidade de 99.61% e uma curva ROC de 0,992. Já nos resultados para a classificação quanto a taxa de malignidade e benignidade, obtiveram-se os seguintes valores: acurácia de 93,46%, sensibilidade de 92,95%, especificidade de 93,49% e uma curva ROC de 0,931.

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