Programa de Pós-Graduação em Ecologia de Biomas Tropicais. Departamento de Biodiversidade, Evolução e Meio Ambiente, Instituto de Ciências Exatas e Biológicas, Universidade Federal de Ouro Preto. / Submitted by Oliveira Flávia (flavia@sisbin.ufop.br) on 2014-12-11T17:08:45Z No. of bitstreams: 1 DISSERTAÇÃO_AnáliseEspécieBibimys.pdf: 3001700 bytes, checksum: cf9066df7d203cd589f35f1d83f52a30 (MD5) / Approved for entry into archive by Gracilene Carvalho (gracilene@sisbin.ufop.br) on 2014-12-14T12:24:41Z (GMT) No. of bitstreams: 1 DISSERTAÇÃO_AnáliseEspécieBibimys.pdf: 3001700 bytes, checksum: cf9066df7d203cd589f35f1d83f52a30 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-12-14T12:24:41Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DISSERTAÇÃO_AnáliseEspécieBibimys.pdf: 3001700 bytes, checksum: cf9066df7d203cd589f35f1d83f52a30 (MD5) Previous issue date: 2014 / Bibimys labiosus é um roedor sigmodontíneo pertencente à Tribo Scapteromyni, caracterizado pela região labial proeminente e de coloração rosada. De acordo com a literatura, a espécie está distribuída ao longo de cinco estados brasileiros, Minas Gerais, São Paulo, Rio de Janeiro, Paraná e Santa Catarina, além de algumas localidades na Província de Misiones, na Argentina. Nos últimos anos, houve um aumento no número de espécimes depositados em coleções zoológicas. Contudo, esse material ainda não havia sido analisado, visando atualizar o conhecimento sobre a espécie. Nesse sentido, a partir da análise dos novos exemplares e localidades disponíveis, o presente estudo buscou avaliar as variações morfológicas, morfométricas, ontogenéticas e sexuais ao longo da distribuição geográfica da espécie no Brasil e apontar regiões onde deverão ser intensificados os esforços de coleta em estudos futuros. Foram levantadas informações em todas as coleções científicas brasileiras, onde estão depositados espécimes de B. labiosus. Para as análises morfológicas e morfométricas, foram utilizadas 20 medidas cranianas. A variação ontogenética dos caracteres foi avaliada através do teste de Análise de Variância e o teste de Comparações Múltiplas de Tukey. A Análise de Componentes Principais foi empregada no estudo da variação geográfica dos caracteres. Após o sequenciamento do gene mitocondrial citocromo b, foi elaborada, por meio do método da Máxima Verossimilhança, uma árvore filogenética. Por meio do software Maxent, e considerando 19 variáveis bioclimáticas, foi proposto o mapa de distribuição potencial para a espécie. Foi reunido, para o presente estudo, um total de 81 espécimes, provenientes de 26 localidades nos estados de Minas Gerais, São Paulo, Rio de Janeiro e Santa Catarina. Não foi observado dimorfismo sexual. A variação ontogenética foi maior entre as classes etárias 2 e 5. As análises de variação geográfica e molecular demonstram que não ocorre separação geográfica entre as populações de B. labiosus. Foi elaborado um novo mapa de distribuição geográfica, contendo todas as localidades registradas para a espécie. A distribuição potencial apontou as regiões maior probabilidade de encontro de B. labiosus nas regiões do sudeste, nos estados de São Paulo, Rio de Janeiro e São Paulo. ______________________________________________________________________________________________ / ABSTRACT: Bibimys labiosus is a sigmodontine rodent belonging to Scapteromyni tribe, characterized by prominent labial region and pinkish. According to the literature, the species is distributed over five Brazilian states, Minas Gerais, São Paulo, Rio de Janeiro, Paraná and Santa Catarina, and some localities in the province of Misiones, Argentina. In recent years, there has been an increase in the number of specimens deposited in zoological collections. However, this material had not yet been analyzed, aiming to update the knowledge of the species. In this sense, the analysis of new specimens and locations available, this study sought to evaluate the morphological, morphometric, ontogenetic and sex variations along the geographic distribution of the species in Brazil and point out areas where collection efforts in future studies should be intensified. Information was used in all Brazilian scientific collections, which are deposited specimens of B. labiosus. 20 cranial measurements were used for morphological and morphometric analyzes. The ontogenetic variation of characters was evaluated by Analysis of Variance test and Tukey's Multiple Comparison test. A Principal Component Analysis was employed in the study of geographic variation of characters. After sequencing the mitochondrial cytochrome b gene, was drafted by the Maximum Likelihood method, a phylogenetic tree. Through the Maxent software, and considering 19 bioclimatic variables, was proposed a map of the potential distribution of the species. Was gathered for this study, a total of 81 specimens from 26 localities in the states of Minas Gerais, São Paulo, Rio de Janeiro and Santa Catarina. No sexual dimorphism was observed. The ontogenetic variation was higher among age classes 2 and 5. The analyzes of geographic and molecular variation show that there is geographical separation between populations of B. labiosus. A new map of geographical distribution, containing all localities recorded for the species was prepared. The potential distribution indicated the regions most likely to encounter B. labiosus in areas of the southeast, in the states of Minas Gerais, Rio de Janeiro and São Paulo.

Submitted by Elizabete Silva (elizabete.silva@ufes.br) on 2015-05-20T19:54:03Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Modelagem da distribuição geográfica atual e futura de Guerlinguetus (Rodentia, Sciuridae) no Brasil.pdf: 1578291 bytes, checksum: f5b4e38fff1023fd5fdda5e584b21067 (MD5) / Approved for entry into archive by Elizabete Silva (elizabete.silva@ufes.br) on 2015-08-13T19:29:49Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Modelagem da distribuição geográfica atual e futura de Guerlinguetus (Rodentia, Sciuridae) no Brasil.pdf: 1578291 bytes, checksum: f5b4e38fff1023fd5fdda5e584b21067 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-08-13T19:29:49Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Modelagem da distribuição geográfica atual e futura de Guerlinguetus (Rodentia, Sciuridae) no Brasil.pdf: 1578291 bytes, checksum: f5b4e38fff1023fd5fdda5e584b21067 (MD5) Previous issue date: 2013-03 / O gênero Guerlinguetus, pertencente à família Sciuridae, possui sete espécies existentes no Brasil. Essas espécies têm sido tratadas como sinônimos de Sciurus aestuans, mas foram distinguidas em um gênero próprio com base nas revisões taxonômicas mais abrangentes disponíveis até recentemente. Apesar disso, pouco há na literatura sobre a distribuição das espécies desse gênero no Brasil e nenhuma pesquisa visando o conhecimento de sua distribuição futura havia sido realizada. A modelagem de distribuição potencial de espécies tem se tornado um componente importante dos planos de conservação e uma grande quantidade de técnicas têm sido desenvolvidas com esta finalidade. Ela pode ser uma ferramenta importante para determinar o grau de ameaça principalmente em espécies ou grupos com poucas informações disponíveis sobre sua distribuição. Com isso, o objetivo do presente trabalho foi verificar a influência das possíveis mudanças climáticas na distribuição das espécies de Guerlinguetus no Brasil, através da modelagem potencial das distribuições atual e futura dessas espécies. Para isso foram utilizados dados climáticos e topográficos e o cenário pessimista de emissão de CO2 (A2) para o ano 2070, do Modelo de Circulação Geral CSIRO, com base no quarto relatório do Painel Intergovernamental de Mudanças Climáticas. Os modelos gerados apresentaram perda significativa de áreas consideradas ambientalmente adequadas, do modelo de distribuição atual para o modelo de distribuição futura para as espécies de Guerlinguetus, com exceção de G. aestuans. Apesar da expansão da região potencial de distribuição de G. aestuans para o ano de 2070, a média dos valores de adequabilidade ambiental diminuiu em relação ao modelo de distribuição atual. A localização dessas espécies de hábito arborícola em áreas geograficamente espalhadas dentro da Amazônia, Cerrado e Mata Atlântica é preocupante, devido a grande perda de área original desses biomas, tornando possível a hipótese de ameaça à sobrevivência das espécies devido a mudanças ambientais futuras. / The genus Guerlinguetus, belonging to the family Sciuridae, has seven extant species in Brazil. These species have been treated as synonyms of Sciurus aestuans, but were distinguished in a genus based on the most comprehensive taxonomic revisions available until recently. Nevertheless, there is little in the literature on the distribution of species of this genus in Brazil and there was no research in order to know their future distribution. The modeling potential distribution of species is becoming an important component of conservation schemes and a lot of techniques have been developed for this purpose. It can be an important tool to determine the degree of threat especially in species or groups with little information available about their distribution. Thus, the objective of this study was to investigate the possible influence of climate change on Guerlinguetus species distribution in Brazil, through modeling potential of current and future distributions of these species. For this we used topographic and climatic data and the pessimistic scenario of CO2 emissions (A2) for the year 2070, of the General Circulation Model CSIRO, based on the fourth report of the Intergovernmental Panel on Climate Change. The models showed significant loss of areas considered environmentally appropriate, from the current distribution model to the future distribution model for Guerlinguetus species except for G. aestuans. Despite the expansion on potential region distribution for G. aestuans for the year 2070, the average values of environmental suitability decreased compared to the current distribution model. The location of these species of arboreal habit in geographically dispersed areas within the Amazon, Cerrado and Atlantic Forest is of concern due to the large loss of the original area of these biomes, making possible the threat hypothesis to the survival of these species due to future environmental changes.

Made available in DSpace on 2014-07-29T16:21:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Mary Joyce Ribeiro.pdf: 665396 bytes, checksum: f1e4d38b059e9f7c743bb957bf13c73f (MD5) Previous issue date: 2009-06-22 / The questions around species niche have sought to unveil why a species is where it is and it is not where it is not, so it is well known that a lot of factors can be determinant in this discussion. Thus, in this study we examined the relationship between niche and geographical distance, life history and phylogenetic components to the New World carnivores. The data used in our analyses were obtained from datasets available online and from literature sources. We used Mantel s test to evaluate the correlation among the data matrices in NTSys software. Significant correlations were found between niche and geographical distance (r =-0,4068 e P <0,0001) and between life history and geographical distance (r = -0,1136 e P= 0,0024). These results suggest that species that are spatially close are more similar in terms of niche and life history. We also observed that, among others factors, interespecific interactions has an important effect in structuring ecological communities. New tests are still necessary in future to generate new information about carnivore s niche and their components. / As questões acerca do nicho das espécies procuram entender por que uma espécie está onde está e não está onde não está, e é certo que vários fatores poderiam ser determinantes nessa discussão. Nesse sentido, esse estudo analisou a relação do nicho com os componentes geográficos, filogenéticos e de história de vida das espécies de carnívoros do Novo Mundo. Dados da história de vida, filogenia, distribuição geográfica (co-ocorrência) e nicho dos carnívoros foram obtidos em fontes informatizadas e na literatura e a partir de então correlações foram estabelecidas. Com a utilização do software NTSys realizou-se o teste de Mantel entre os dados coletados, esse mostrou que as únicas relações significativas foram encontradas entre nicho e co-ocorrência geográfica (r =-0,4068 e P <0,0001) e entre história de vida e co-ocorrência geográfica (r = -0,1136 e P= 0,0024). Os resultados sugerem que quanto mais similares sejam os nichos ou histórias de vida dos carnívoros, mais próximos geograficamente eles se encontram, o que surpreende devido entre outros fatores, ao papel das interações interespecíficas na estruturação das comunidades. Novos estudos e uso de outras técnicas estatísticas se mostram necessários em estudos futuros no intuito de prover novas informações acerca do nicho dos carnívoros, seus componentes e a maneira como os mesmos interagem.

MATOS, Rafael Pereira de. Estudos fitogeográficos e modelagem ecológica do gênero Dimorphandra Schott (Leguminosae, Caesalpinioideae). 2015. 79 f. Dissertação (Mestrado em Ecologia e Recursos Naturais)-Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2015. / Submitted by Vitor Campos (vitband@gmail.com) on 2016-09-26T23:15:14Z No. of bitstreams: 1 2015_dis_rpmatos.pdf: 22298599 bytes, checksum: 27e3572d95bd054957b2112cc860b0b2 (MD5) / Approved for entry into archive by Jairo Viana (jairo@ufc.br) on 2016-09-27T23:45:53Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2015_dis_rpmatos.pdf: 22298599 bytes, checksum: 27e3572d95bd054957b2112cc860b0b2 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-09-27T23:45:53Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2015_dis_rpmatos.pdf: 22298599 bytes, checksum: 27e3572d95bd054957b2112cc860b0b2 (MD5) Previous issue date: 2015 / Studying patterns of distribution of organisms is relevant in ecology, biogeography and conservation studies under even to understand the evolution of biodiversity. Dimorphandra Schott. is a widespread neotropical genus with 25 taxa in Brazil, occurring in savanna (Cerrado) and ombrophylous vegetation (Amazonia and Atlantic Rain Forest). This work aims to understand the factor that drives the richness and diversity of Dimorphandra. We used SIG, ecological modeling and databank of SpeciesLink and bibliography. These data were classified within biogeographic provinces according to a biogeographically regionalization scheme and according to groups generated by a cluster analysis in the PC-ORD program and a Parsimony Analysis of Endemicity (PAE) by PAUP program. At the same time, ecological distribution models were formulated to the past, present and future based on algorithms (BIOCLIM and CCSM) using the softwares MAXENT and DIVA-GIS, referring to each group according to the UPGMA results. The richness and diversity centers were in the Amazon region. The species more widespread were D. mollis Benth. and D. gardneriana Tul., occurring in the Seasonal Tropical Dry Forests (STDFs) in the northeast-southeast direction. Three phytogeographic groups were determined by the cluster analysis: A) Amazon and its two subgroups: Broad Amazon and North of Negro River Basin; B) Ecotones Brazilian Savanna/Atlantic Forest; and C) Guyana Highlands. PAE analysis pointed two major clades with good support (>80% bootstrap). Some distribution patterns were determined: 1) Broad Amazon Pattern, 2) Restricted to northern Amazon Pattern, 3) Guyana Shield Pattern, 4) Ecotones Brazilian Savanna/Atlantic Forest Pattern and 5) Micro Endemic Minas Gerais’ Brazilian Savanna Pattern. Predictive modeling results demonstrated a trend on reduction of most potential occurrence areas, except in small regions in Guyana Highlands, which expanded in a future scenario. Finally, we can conclude that distribution of the genus through South America was known as well its richness and diversity centers, besides it has been checked a general trend on reduction of potential occurrence area of this genus in a future scenario except in high areas which are considered refugia. / Estudar padrões de distribuição dos organismos é relevante na ecologia, biogeografia e biologia da conservação fornecendo subsídios para compreender a evolução da biodiversidade. Dimorphandra Schott é um gênero de distribuição neotropical com 25 espécies no Brasil, distribuídas tanto em formações savânicas (Cerrado) como ombrófilas (Floresta Amazônica e Atlântica). Este trabalho objetivou entender como está distribuída e quais os fatores ambientais estão associados à riqueza e a diversidade de Dimorphandra. Foram utilizadas ferramentas de Sistemas de Informação Geográfica, modelagem ecológica e dados de ocorrência obtidos da rede SpeciesLink, informações bibliográficas e visitas à herbários. Esses dados foram classificados dentro de províncias biogeográficas de acordo com um esquema de regionalização biogeográfica e com os grupos gerados por uma análise de agrupamento – UPGMA realizada no programa PC-ORD e uma análise parcimoniosa de endemicidade (PAE) feita por meio do programa PAUP. Paralelamente, modelos ecológicos de distribuição baseados em algoritmos (BIOCLIM e CCSM) foram formulados para opassado, presente e futuro em ambiente do MAXENT e DIVA-GIS. Ambos os centros de riqueza e diversidade foram a região amazônica. As espécies com mais ampla distribuição foram D. mollis Benth. e D. gardneriana Tul., ambas ocorrendo no corredor de formações vegetacionais abertas e secas no sentido nordeste-sudeste. Três blocos fitogeográficos foram determinados pela análise de agrupamento: A) Amazônia; B) Ecótono Cerrado/Floresta Atlântica; e C) Escudo das Guianas. A análise de PAE evidenciou dois grandes clados com suporte estatístico (bootstrap) acima de 80%. Foram estabelecidos os seguintes padrões de distribuição: 1) Amplo na Amazônia, 2) Restrito ao Norte da Amazônia (acima do Rio Negro), 3) Escudo das Guianas, 4) Ecótono Cerrado/Floresta Atlântica, e 5) Microendêmico aos Cerrados de Minas Gerais. Os resultados da modelagem preditiva demonstraram uma tendência de redução da maior parte da área de ocorrência potencial do gênero em um cenário futuro, com exceção de pequenas regiões no Escudo das Guianas, as quais teriam condições de expandir a distribuição das espécies. Como conclusões, conheceu-se a distribuição do gênero pela América do Sul, seus centros de riqueza e diversidade, no caso a região amazônica, além de ter sido verificada uma tendência geral na redução da área potencial de ocorrência do gênero no futuro e expansão em áreas de altas altitudes, consideradas refúgios.

Made available in DSpace on 2016-06-02T19:26:20Z (GMT). No. of bitstreams: 1 KORTZ_Alessandra_2012.pdf: 9274749 bytes, checksum: d0ff255829e7affe4ffbd746dcdef364 (MD5) Previous issue date: 2012-05-15 / Financiadora de Estudos e Projetos / Durante o Pleistoceno, os neotrópicos passaram por fases de flutuações climáticas, e muitos estudos sugerem que havia condições mais frias e mais secas do que as atuais em algumas regiões, e que houve expansão e/ou retração na distribuição das formações vegetais. Entretanto, a maior parte do debate sobre as mudanças na vegetação durante o Quaternário teve foco nas florestas úmidas e pouca atenção tem sido dada ao papel das mudanças climáticas no Pleistoceno na diversificação de espécies da América do Sul tropical, com enfoque nas áreas secas. As florestas tropicais sazonalmente secas (SDTFs, na sigla em inglês) apresentam um alto nível de endemismo e permanecem pobremente caracterizadas em termos biogeográficos, sendo um dos ecossistemas mais ameaçados. Os dados de ocorrência atual de espécies do gênero Aspidosperma (Apocynaceae), que possuem espécies representativas do dossel em formações de SDTFs, foram utilizados para a produção de modelos de distribuição potencial, em cenários climáticos atual e do último máximo glacial (LGM) para verificar a existência de áreas potenciais historicamente estáveis. Os modelos de distribuição gerados indicaram padrões de distribuição peculiares para as espécies, relacionados a condições climáticas e ambientais específicas em formações de SDTFs, o que aponta que essas formações devem ser tratadas como heterogêneas. De maneira geral, as áreas potenciais foram maiores e mais contínuas, relacionando diferentes populações das espécies para os cenários climáticos do pleistoceno quando comparadas às atuais. As espécies foram confirmadas como representativas de formações de SDTFs, em dois padrões gerais: um mais associado à caatinga e ao carrasco no nordeste do Brasil e outro localizado preferencialmente na porção sudeste, em formações de floresta estacional semidecidual. As áreas historicamente estáveis mostraram particularidades para cada espécie que, analisadas em conjunto, apresentaram notável semelhança com essas áreas estáveis de SDTFs apontadas recentemente na literatura, ainda que tenha sido utilizada uma metodologia diferente. Essas áreas também foram de modo geral coincidentes com localidades onde há registros de condições semiáridas no LGM.

Made available in DSpace on 2014-07-29T16:21:16Z (GMT). No. of bitstreams: 1 dissertacao_eduardo_pacifico.pdf: 1146266 bytes, checksum: 35376f6282f701f0d901fd00680cea93 (MD5) Previous issue date: 2011-02-11 / Endemic species have higher risk of extinction and are the focus of conservation efforts because they are confined to specific areas. Evidently, extinction vulnerability variation among endemic species should be mainly explained by their range distribution. Because they have specific eco-physiological traits, anurans are particularly sensitive to global climate change (GCC). Thus, the goals of this study are to present a new anuran endemic species list of Cerrado, to discuss issues related to endemism and to determine if the current potential distribution is able to predict the species extinction vulnerability in GCC. We analyze anuran species that were considered endemic in previous studies plus recently described species. We used two modeling procedures (Maxent and Mahalanobis distance method), three climate models (CCCma, CSIRO and HadCM3) and two carbon emissions scenarios (A2 and B2). Analyses were performed separately for each set of conditions (method, model and scenario) and then we analyzed the emergent pattern. There are 33 Cerrado endemic anuran species, belonging to ten families, representing 20.4% of Cerrado s anurans and 3.8% of Brazilian anurans. Most species have few occurrence points (mean ± standard deviation: 4.9 ± 4.6). Twelve endemic species have all their occurence points near to the boundaries of Cerrado and twelve have all their occurence points in the center of the biome. Small changes in biome boundaries alter the number of endemic species. Therefore, the endemism concept is strongly linked to the biome definition, the sampling effort, the correct species identification and the existing information released. Using the biome limits defined by the Brazilian government, Cerrado endemic anurans with small range distribution have less overlap between the current and the future distributions than Cerrado endemic anurans with large range distribution, indicating that species with small range have a higher risk of extinction. Nevertheless, Cerrado endemic anurans with small range distribution have more proportional gain of suitable area in the future than Cerrado endemic anurans with large range distribution. Consequently, there will be adequate area for all species. However, only species that could move to suitable places will persist. Hence, species persistence, mainly for species with small range size, depends largely on the connectivity of suitable habitat and dispersal rates that allow the colonization of new areas. / Por estarem restritas a um determinado local, é esperado um maior risco de extinção para as espécies endêmicas, sendo elas o foco de ações conservacionistas. A variação da vulnerabilidade à extinção entre espécies endêmicas deve ser principalmente explicada pelo tamanho de suas distribuições. Por possuírem características eco-fisiológicas específicas, os anuros são especialmente sensíveis às mudanças climáticas globais (MCG). Assim, o objetivo geral é apresentar uma nova lista de espécies de anuros endêmicos do Cerrado, discutir questões relacionadas ao endemismo e determinar se a distribuição potencial atual é capaz de predizer a vulnerabilidade das espécies às MCG. Analisamos as espécies de anuros que foram consideradas endêmicas em estudos prévios e as espécies descritas recentemente. Utilizamos dois procedimentos de modelagem (Maxent e o método de distância de Mahalanobis), três modelos climáticos (CCCma, CSIRO e HADcm3) e dois cenários de emissão de carbono (A2 e B2). As análises foram feitas separadamente para cada conjunto de condições (método, modelo e cenário) e depois analisamos o padrão global. São 33 espécies de anuros endêmicos do Cerrado, de dez famílias, representando 20.4% das espécies que ocorrem no Cerrado e 3.8% das espécies que ocorrem no Brasil. A maioria das espécies possui poucos pontos de ocorrência (média de registros ± desvio padrão: 4.9 ± 4.6). Das espécies endêmicas, 12 têm distribuição exclusivamente marginal no bioma e 12 têm distribuição exclusivamente central. Pequenas mudanças nos limites do bioma alterariam o número de espécies endêmicas. Portanto, o conceito de endemismo está fortemente ligado à definição do bioma, ao esforço amostral, à correta identificação das espécies e à disponibilização e agrupamento das informações existentes. Para os anuros endêmicos do Cerrado, quanto menor o tamanho da distribuição atual da espécie, menor é a sobreposição com sua distribuição futura, indicando que estas espécies estarão expostas a um maior risco de extinção. Entretanto, quanto menor a distribuição atual, maior o ganho proporcional de área adequada no futuro e maior o deslocamento da distribuição em relação presente. Desta forma, existirá área adequada para as espécies, entretanto somente as que se deslocarem persistirão. Portanto, a persistência das espécies, principalmente as de menor tamanho de distribuição atual, dependerá em grande parte da conectividade dos habitats adequados e das taxas de dispersão que permitirão a colonização de novas áreas.

Made available in DSpace on 2014-07-29T16:21:18Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertacao Nayara P R de Sousa.pdf: 966173 bytes, checksum: 6479d4ecf0e29c925ca2a8e6c8b59c9d (MD5) Previous issue date: 2011-03-27 / The climate can be considered an extremely important factor in vegetation distribution and its characteristics in a global context. Climate changes affect the global distribution of vegetation in the distant past and probably will affect in the future. Spatial distribution models of species (SDMs), also known as niche models are one of the best current tools for predicting climate-induced changes on the distribution of species. In general, studies of the consequences of climate changes on the distribution of biomes include only the geographic distribution of the biome or the species are analyzed individually. The availability of climatic and ecological data on a large scale, in addition to more efficient procedures for obtaining data from geographic information systems, optimization programs and greater computing power favor the process of modeling the potential distribution, and broaden the effectiveness of results available by the SDMS. The main objective of this study is to evaluate whether there is a shift in the hierarchical structure of future distributions of biome, phytoeeological regions and plants species of the biome under the effect of climate changes. Consequently, we evaluate some effects of climate changes on the pattern of species richness and pattern of future distributions of the biome, phytoeeological regions and species. This study shows that there is a hierarchical structure in the response of vegetation distribution faces climate changes predictions for the year 2080 in the Brazilian Cerrado. In general, in the three scales studied their distributions are moving toward to southeast of Brazil, thus this region is replaced by a diversity gain while the rest of the local Cerrado suffers from the impoverishment of their diversity. This study also shows that in the near future, the Cerrado species will show habitat loss, due to both the loss of fragments and area reduction of these. / O clima pode ser considerado um fator extremamente importante na distribuição da vegetação e suas características em um contexto global. Mudanças climáticas afetaram a distribuição global da vegetação em um passado distante e, provavelmente, afetarão no futuro. Os modelos de distribuição geográfica potencial de espécies (spatial distribution model SDM), conhecidos também como modelos de nicho, são uma das melhores ferramentas atuais para predizer mudanças induzidas pelo clima sobre a distribuição das espécies. Em geral, estudos sobre as consequências das mudanças climáticas na redistribuição dos biomas englobam apenas a distribuição geográfica do bioma ou analisam as espécies individualmente. A disponibilidade de dados climáticos e ecológicos em larga escala, além dos procedimentos mais eficientes de obtenção de dados a partir de sistemas de informação geográfica, programas de otimização e maior poder computacional favorecem o processo de modelagem de distribuição potencial, além de ampliarem a eficiência dos resultados disponíveis pelos SDMs. O objetivo principal deste trabalho é avaliar se existe uma estrutura hierárquica no deslocamento das distribuições futuras do bioma Cerrado, das regiões fitoecológicas e das espécies de plantas do bioma, sob o efeito de mudanças climáticas. Consequentemente, pode-se evidenciar alguns efeitos dessas alterações climáticas sob o padrão de riqueza das espécies e o padrão das distribuições geográficas futuras do bioma, das regiões fitoecológicas e das espécies. Este estudo demonstrou que não existe uma estrutura hierárquica na resposta da distribuição vegetacional frente às previsões de mudanças climáticas para o ano de 2080 no Cerrado brasileiro. Em geral, nas três escalas estudadas as respectivas distribuições deslocam-se para o sudeste do Brasil, de modo que essa região passa a ter um ganho de diversidade local enquanto o restante do Cerrado será afetado com o empobrecimento de sua diversidade. Este estudo aponta ainda, que num futuro próximo, as espécies do Cerrado serão afetadas com a perda de habitat, decorrente tanto da perda de fragmentos como da redução de área destes.

Na presente dissertação eu estudei a distribuição potencial dos corais de águas profundas ao longo da margem continental brasileira e o efeito da resolução das variáveis ambientais em modelos de adequabilidade de habitat (MAH). Primeiramente foi determinada a distribuição potencial de corais de águas profundas a partir de modelos de adequabilidade de habitat de máxima entropia (MaxEnt). Os modelos foram alimentados com diversas camadas de dados SIG de variáveis ambientais e dados de ocorrência de espécies extraídos de bancos de dados e de novos registros. Foram estudados os grupos Scleractinia e Octocorallia, assim como quatro espécies de corais formadores de recifes (Solenosmilia variabilis, Lophelia pertusa, Madrepora oculata e Enallopsammia rostrata) e duas espécies de escleractínios não formadores de recifes (Cladocora debilis e Deltocyathus spp.). O nicho ambiental ocupado pelos táxons foi representado a partir de uma análise multivariada, sendo determinada a sobreposição entre os nichos. A partir disso foi avaliada a similaridade e equivalência de nicho ambiental entre as espécies. Os modelos resultantes indicaram que Scleractinia apresenta distribuição potencial na margem continental leste e sudeste do Brasil (porção Central e Sul), enquanto que Octocorallia apresenta uma distribuição potencial mais ampla abarcando toda a margem continental brasileira, com maior adequabilidade nas margens norte e nordeste. Assim, as áreas de distribuição potencial compartilhada entre octocorais e escleractínios foram aquelas ao largo da porção leste e sudeste do Brasil, sendo estas prioritárias para futuras pesquisas. Os nichos ambientais específicos indicaram menos tolerância de Scleractinia a altas temperaturas em comparação com Octocorallia. Os octocorais ocuparam uma maior amplitude do gradiente ambiental, principalmente relacionado às condições de carbono orgânico particulado, oxigênio dissolvido e temperatura. Isto possivelmente permite aos octocorais habitar a porção norte da margem continental brasileira, onde os modelos de escleractínios indicaram baixa adequabilidade de habitat. A margem continental sudeste do Brasil teve a maior adequabilidade para as espécies de escleractínios formadores de recifes profundos. Isto é de grande valor para planos de conservação nesta área que atualmente apresenta atividades de extração de óleo e gás e que, futuramente, pode ser explotada para a extração de minério. Além disso, as espécies formadoras de recifes ocuparam nichos ambientais similares e, portanto, mudanças nas condições ambientais, como por exemplo as associadas às mudanças climáticas, podem afetar todas elas. Contudo, seus nichos não são equivalentes e, portanto, cada uma delas faz um uso diferente do espaço ambiental da margem continental brasileira. Por último, foram desenvolvidos modelos MaxEnt para Solenosmilia variabilis, Lophelia pertusa, Madrepora oculata e Enallopsammia rostrata em duas resoluções de análise, uma de baixa (i.e., com um tamanho de pixel de aproximadamente 1000 m2) e uma de alta resolução (i.e., pixel de aproximadamente 100 m2) para determinar o efeito da resolução das variáveis ambientais utilizadas na performance e na extensão de área predita de modelos de adequabilidade de habitat. A diferença na extensão da área adequada predita por ambas resoluções foi medida de acordo a três limiares de corte diferentes. Os resultados indicaram diferenças na performance dependendo da resolução, com maior performance nos modelos de alta resolução. Além disso, a extensão de área adequada predita foi geralmente maior nos modelos de baixa resolução, com algumas exceções dependendo da espécie e do limiar de corte. Estes resultados ressaltam a importância da resolução das variáveis ambientais e suas implicações no uso de MAH no planejamento e manejo de Áreas Marinhas Protegidas (MPAs). / In this thesis I studied the deep-sea coral distribution along the Southwestern Atlantic Ocean and the effect of the environmental variables resolution on habitat suitability models (HSM). In the second chapter, I developed HSM based on the Maximum Entropy (MaxEnt) algorithm to identify the potential distribution of deep-water corals. To perform the models, I have used species presence data from existing datasets together with new species records and global environmental variables. I used the main environmental variables to identify suitable areas by modeling niches of different coral taxa. The studied taxa were Scleractinia and Octocorallia, as well as four reef-forming scleractinian species (Solenosmilia variabilis, Lophelia pertusa, Madrepora oculata and Enallopsammia rostrata), and two non-reef-building scleractinians (Cladocora debilis and Deltocyathus spp.). Furthermore, I used multivariate approach to compare their environmental occupied niche in order to assess the spatial niche overlap and test niche similarity and equivalence. The resulting cold-water coral models showed that the most suitable areas occur along the west and southwestern continental margin of Brazil, which permitted to determine areas of priority for future exploration/research to determine conservation areas. Specific environmental niches suggested lower tolerance to high temperatures for Scleractinia than for Octocorallia. Besides, octocorals occupied a wider range of the environmental gradient, which was mainly related to particulate organic carbon, oxygen and temperature. This probably enables them to inhabit the northern part of Brazil where scleratinian models classified as poor habitats for this group. In addition, the Southwestern Brazilian continental margin encloses the most suitable habitats for deep reef-building species. This has important implications for conservation plans in that area already facing gas and oil exploitation and probably future mineral extraction. On the other hand, results suggest that different scleractinian cold-water coral species occupy similar environmental niches and, for this reason, I concluded that changes in environmental conditions, such as those associated to climate change, may affect them all. However, their niches are not equivalent and this suggests that each environmental factor could affect each species in different ways. In the third chapter, I performed HSM based on Maximum Entropy for Solenosmilia variabilis, Lophelia pertusa, Madrepora oculata and Enallopsammia rostrata with two different environmental variables resolution, a low (i.e., a coarse resolution data with pixel size of ca. 1000 m2) and a high resolution (pixel of ca. 100 m2) to determine the effect of the environmental variables resolution on habitat suitability model performances and spatial extent of predicted suitable areas. From the final suitability maps, the changes in area extent depending of both resolution models were measured based in different thresholds. The results showed different performances of the models depending on data resolution, with higher performance at higher resolution. Furthermore, the predicted area varied between resolutions and threshold chosen. These results highlight the importance of environmental variables resolution and their implications for the use of HSM in planning and managing Marine Protected Areas (MPAs).

Predadores de topo desempenham um papel importante na manutenção dos sistemas em que eles ocorrem porque influenciam diretamente a estrutura e a dinâmica de comunidades. Desta forma, este estudo descreveu alguns mecanismos de co-ocorrência espaço-temporal entre a onça-pintada (Panthera onca) e duas espécies de mesopredadores (Puma concolor e Leopardus pardalis), o seu controle top-down na comunidade de mamíferos e os requerimentos ambientais que determinam a sua distribuição no bioma Amazônia. Para as análises de co-ocorrência espaço-temporal foram utilizados o modelo de ocupação e a densidade de Kernel utilizando os registros de armadilhamento fotográfico (2008-2011). Para descrever o controle top-down foi elaborada uma rede trófica utilizando os itens alimentares consumidos pelas espécies e disponíveis na literatura (1983-2014). Para indicar quais as áreas mais adequadas foi utilizado o modelo de distribuição de espécies utilizando as localizações geográficas de ocorrência da espécie que foram compiladas de três diferentes bases de dados (2000-2013). A ocorrência das duas espécies de mesopredadores não foi diferente nos sítios com e sem a onça-pintada nas quatro temporadas de amostragem. A probabilidade de detecção da jaguatirica foi maior nos sítios com a presença da onça-pintada em apenas uma temporada de amostragem. A sobreposição no período de atividade das espécies de mesopredadores com a onça-pintada foi baixa, com cerca de 55% de sobreposição. Também ocorreu uma mudança razoável no período de atividade das espécies entre as temporadas de amostragem, com mínima de 32% e máxima de 56% de sobreposição. As maiores diferenças na detecção e na sobreposição temporal ocorreram na terceira temporada quando teve o maior número de capturas e recapturas da onça-pintada. A rede trófica apresentou seis níveis e grande riqueza de espécies e densidade de interações. Após a remoção da onça-pintada, houve a perda de um nível trófico e de aproximadamente 20% de interações. Quando comparada a distribuição atual da onça-pintada com a histórica, foi possível constatar a perda de espaço ambiental em áreas mais frias (< 6,3 °C), mais secas (< 288 mm), mais úmidas (> 7517 mm) e com maior elevação (> 3597 m). O modelo de distribuição também indicou que muitas áreas potenciais estão disponíveis à ocorrência da onça-pintada e que algumas merecem atenção, especialmente, nas porções leste e sul da Amazônia onde a espécie corre maior risco de desaparecimento local devido à antropização acelerada. Este estudo forneceu significativa contribuição para a compreensão da população de onça-pintada na Amazônia, bioma que ainda possui a maior lacuna de conhecimento sobre a biologia e ecologia da espécie. Demonstrou o efeito da sua presença na detectabilidade e no período de atividade de outras espécies. Também demonstrou seu papel ecológico como predador de topo exclusivo porque foi a única espécie que predou todas as outras de níveis tróficos inferiores. Descreveu o espaço ambiental originalmente ocupado (distribuição histórica) e o perdido (distribuição atual). Indicou as áreas mais adequadas à sua ocorrência e aquelas potenciais ao seu desaparecimento. / Apex predators play an important role in the maintenance of systems in which occur because they directly influence the structure and dynamics of communities Thus, this thesis aims to describe some of the mechanisms of spatio-temporal co-occurrence between the jaguar (Panthera onca) and mesopredators (Puma concolor and Leopardus pardalis), their top-down control on the community and environmental requirements that determine their distribution. To the analyses of spatio-temporal co-occurrence were used the occupancy model and the Kernel density with records derived from camera trapping (2008-2011). To the analysis of trophic networks was used a foodweb model with prey spectra of felids compiled from the available literature (1983-2014). To indicate the most suitable areas to its occurrence was used a species distribution model with geographic location of the species compiled from three different databases. The occupation of the two species of mesopredators was not different among sites with and without jaguar. The probability of detection was different for ocelot, with higher detection on sites with than without jaguar. The overlap in the activity pattern among jaguar and mesopredators was low, with approximately 55% of overlapping. Also there was a reasonable change in the overlap between sampling seasons, with a minimum of 32% and maximum of 56% of the difference in the activity pattern. The differences in the detection and temporal overlap occurred in the third season when occurred the highest number of jaguar captures and recaptures. The trophic network presented six levels and, a high species richness and links density. After removal of the jaguar, a trophic level and approximately 20% of links were lost. When compared historical and current distributions, the loss of environmental space occurred in areas colder (< 6.3 ° C), drier (< 288 mm), wetter (> 7517 mm) and at higher elevation (> 3597 m). The distribution model also indicated that there is many potential suitable areas available to the jaguar occurrence and, some of them deserve attention, particularly, in eastern and southern portions of Amazonia where the species is most at risk of local extinction. This study provided a significant contribution to the knowledge of the population of jaguar in the Amazon biome which still has the largest gap of information on the biology and ecology of the species. It demonstrated the effect of the presence of the species in the detectability and the activity pattern of others. Also, it demonstrated their ecological role as an apex predator exclusive because it was the only one that ate all other species of lower trophic levels. It described the environmental space originally occupied (historical distribution) and lost (current distribution). It indicated potential suitable areas to its occurrence and threatened areas to its disappearance.

Na presente dissertação eu estudei a distribuição potencial dos corais de águas profundas ao longo da margem continental brasileira e o efeito da resolução das variáveis ambientais em modelos de adequabilidade de habitat (MAH). Primeiramente foi determinada a distribuição potencial de corais de águas profundas a partir de modelos de adequabilidade de habitat de máxima entropia (MaxEnt). Os modelos foram alimentados com diversas camadas de dados SIG de variáveis ambientais e dados de ocorrência de espécies extraídos de bancos de dados e de novos registros. Foram estudados os grupos Scleractinia e Octocorallia, assim como quatro espécies de corais formadores de recifes (Solenosmilia variabilis, Lophelia pertusa, Madrepora oculata e Enallopsammia rostrata) e duas espécies de escleractínios não formadores de recifes (Cladocora debilis e Deltocyathus spp.). O nicho ambiental ocupado pelos táxons foi representado a partir de uma análise multivariada, sendo determinada a sobreposição entre os nichos. A partir disso foi avaliada a similaridade e equivalência de nicho ambiental entre as espécies. Os modelos resultantes indicaram que Scleractinia apresenta distribuição potencial na margem continental leste e sudeste do Brasil (porção Central e Sul), enquanto que Octocorallia apresenta uma distribuição potencial mais ampla abarcando toda a margem continental brasileira, com maior adequabilidade nas margens norte e nordeste. Assim, as áreas de distribuição potencial compartilhada entre octocorais e escleractínios foram aquelas ao largo da porção leste e sudeste do Brasil, sendo estas prioritárias para futuras pesquisas. Os nichos ambientais específicos indicaram menos tolerância de Scleractinia a altas temperaturas em comparação com Octocorallia. Os octocorais ocuparam uma maior amplitude do gradiente ambiental, principalmente relacionado às condições de carbono orgânico particulado, oxigênio dissolvido e temperatura. Isto possivelmente permite aos octocorais habitar a porção norte da margem continental brasileira, onde os modelos de escleractínios indicaram baixa adequabilidade de habitat. A margem continental sudeste do Brasil teve a maior adequabilidade para as espécies de escleractínios formadores de recifes profundos. Isto é de grande valor para planos de conservação nesta área que atualmente apresenta atividades de extração de óleo e gás e que, futuramente, pode ser explotada para a extração de minério. Além disso, as espécies formadoras de recifes ocuparam nichos ambientais similares e, portanto, mudanças nas condições ambientais, como por exemplo as associadas às mudanças climáticas, podem afetar todas elas. Contudo, seus nichos não são equivalentes e, portanto, cada uma delas faz um uso diferente do espaço ambiental da margem continental brasileira. Por último, foram desenvolvidos modelos MaxEnt para Solenosmilia variabilis, Lophelia pertusa, Madrepora oculata e Enallopsammia rostrata em duas resoluções de análise, uma de baixa (i.e., com um tamanho de pixel de aproximadamente 1000 m2) e uma de alta resolução (i.e., pixel de aproximadamente 100 m2) para determinar o efeito da resolução das variáveis ambientais utilizadas na performance e na extensão de área predita de modelos de adequabilidade de habitat. A diferença na extensão da área adequada predita por ambas resoluções foi medida de acordo a três limiares de corte diferentes. Os resultados indicaram diferenças na performance dependendo da resolução, com maior performance nos modelos de alta resolução. Além disso, a extensão de área adequada predita foi geralmente maior nos modelos de baixa resolução, com algumas exceções dependendo da espécie e do limiar de corte. Estes resultados ressaltam a importância da resolução das variáveis ambientais e suas implicações no uso de MAH no planejamento e manejo de Áreas Marinhas Protegidas (MPAs). / In this thesis I studied the deep-sea coral distribution along the Southwestern Atlantic Ocean and the effect of the environmental variables resolution on habitat suitability models (HSM). In the second chapter, I developed HSM based on the Maximum Entropy (MaxEnt) algorithm to identify the potential distribution of deep-water corals. To perform the models, I have used species presence data from existing datasets together with new species records and global environmental variables. I used the main environmental variables to identify suitable areas by modeling niches of different coral taxa. The studied taxa were Scleractinia and Octocorallia, as well as four reef-forming scleractinian species (Solenosmilia variabilis, Lophelia pertusa, Madrepora oculata and Enallopsammia rostrata), and two non-reef-building scleractinians (Cladocora debilis and Deltocyathus spp.). Furthermore, I used multivariate approach to compare their environmental occupied niche in order to assess the spatial niche overlap and test niche similarity and equivalence. The resulting cold-water coral models showed that the most suitable areas occur along the west and southwestern continental margin of Brazil, which permitted to determine areas of priority for future exploration/research to determine conservation areas. Specific environmental niches suggested lower tolerance to high temperatures for Scleractinia than for Octocorallia. Besides, octocorals occupied a wider range of the environmental gradient, which was mainly related to particulate organic carbon, oxygen and temperature. This probably enables them to inhabit the northern part of Brazil where scleratinian models classified as poor habitats for this group. In addition, the Southwestern Brazilian continental margin encloses the most suitable habitats for deep reef-building species. This has important implications for conservation plans in that area already facing gas and oil exploitation and probably future mineral extraction. On the other hand, results suggest that different scleractinian cold-water coral species occupy similar environmental niches and, for this reason, I concluded that changes in environmental conditions, such as those associated to climate change, may affect them all. However, their niches are not equivalent and this suggests that each environmental factor could affect each species in different ways. In the third chapter, I performed HSM based on Maximum Entropy for Solenosmilia variabilis, Lophelia pertusa, Madrepora oculata and Enallopsammia rostrata with two different environmental variables resolution, a low (i.e., a coarse resolution data with pixel size of ca. 1000 m2) and a high resolution (pixel of ca. 100 m2) to determine the effect of the environmental variables resolution on habitat suitability model performances and spatial extent of predicted suitable areas. From the final suitability maps, the changes in area extent depending of both resolution models were measured based in different thresholds. The results showed different performances of the models depending on data resolution, with higher performance at higher resolution. Furthermore, the predicted area varied between resolutions and threshold chosen. These results highlight the importance of environmental variables resolution and their implications for the use of HSM in planning and managing Marine Protected Areas (MPAs).