This thesis explores the possibilities of dyslexia prediction at primary children. It is divided into two parts a theoretical one and a practical one. The introduction of the theoretical part is focused on the children reading skills development. However, the possibilities of reading failure prediction and diagnosis of dyslexia are the key content of this part. In this respect I focus on the preschoolers and children at the beginning of the school attendance. I mention a few predictive batteries. The theoretical part is concluded with the current information about dyslexia prevalence in the Czech Republic and abroad. The practical part is based on the theoretical part. It contains the results of the research investigation. I got these results during the testing of morphological and phonological abilities as well as reading tests. The research was performed in the second class of primary school. The main objective of the thesis was to find out what is the relationship between performance in reading and morphological and phonological abilities.The test method of the quantitative investigation was used in this research.

The thesis focused on specific learning disabilities.

Les troubles du spectre autistique (TSA) touchent approximativement 1% de la population générale. Ces troubles se caractérisent par un déficit de la communication sociale, ainsi que des comportements stéréotypés et des intérêts restreints. Plusieurs gènes impliqués dans le déterminisme des TSA ont été identifiés, comme par exemple les gènes NLGN3-4X, NRXN1-3 et SHANK1-3. Au cours des années précédentes, les TSA ont été considérés comme un ensemble complexe de troubles monogéniques. Cependant, les études récentes du génome complet suggèrent la présence de gènes modificateurs (« multiple hits model »). La dyslexie est caractérisée par un trouble dans l’apprentissage de la lecture et de l’écriture qui touche 5--‐15% de la population générale. Les facteurs génétiques impliqués restent pour l’instant inconnus car seuls des gènes ou loci candidats ont été identifiés. Mon projet de thèse avait pour objectif de poursuivre l’identification des facteurs génétiques impliqués dans les TSA et de découvrir un premier facteur génétique pour la dyslexie. Pour cela, deux types de populations ont été étudiés : d’une part des patients atteints de TSA (N>600) provenant de France, de Suède et des Iles Faroe, d’autre part des patients atteints de dyslexie (N>200) provenant de France, en particulier une famille de 11 personnes atteintes sur 3 générations. J’ai utilisé à la fois la technologie des puces à ADN Illumina (600 K et 5M) et le séquençage complet du génome humain pour effectuer des analyses de liaison et d’association. Pour les TSA, grâce aux analyses de CNVs, j’ai pu identifier des gènes candidats pour l’autisme et confirmer l’association de plusieurs gènes synaptiques avec l’autisme. En particulier, l’étude d’une population de 30 patients des îles Faroe a pu confirmer l’implication des gènes NLGN1 et NRXN1 dans l’autisme et identifier un nouveau gène candidat IQSEC3. En parallèle, j’ai exploréPRRT2 localisé en 16p11.2. PRRT2 code pour un membre du complexe SNARE synaptique qui permet la libération des vésicules synaptiques. Je n’ai pas pu mettre en évidence d’association avec les TSA, mais j’ai montré que ce gène important pour certaines maladies neurologiques était sous pression de sélection différente selon les populations. Pour la dyslexie, j’ai effectué une analyse de liaison (méthode des lod-scores) pour une grande famille de 11 individus atteints sur trois générations. Cette étude a permis d’identifier CNTNAP2 comme un gène de vulnérabilité à la dyslexie. Cette découverte est importante car ce même gène est aussi associé aux TSA. Par contre, aucune des 20 variations rares découvertes par le séquençage complet du génome n’est localisée dans les parties codantes du gène. Plusieurs variations localisées dans des régions régulatrices sont candidates. En conclusion, les résultats de ma thèse ont permis d’identifier des gènes candidats pour les TSA, de confirmer le rôle des gènes synaptiques dans ce trouble, de montrer pour la première fois grâce à une analyse de liaison le rôle de CNTNAP2 dans la dyslexie. / Autism spectrum disorders (ASD) affect 1% of the general population. These disorders are characterized by deficits in social communication as well as stereotyped behaviors and restricted interests. Several genes involved in the determination of ASD have been identified, such as NLGN3-4, NRXN1-3 and SHANK1-3. In the previous years, ASD have been considered as a complex set of monogenic disorders. Recent studies on the complete genome nevertheless suggest the presence of modifier genes ("multiple hits model"). Dyslexia is characterized by difficulties in learning to read and write. It affects 5-15 % of the general population. Genetic factors involved remain unknown. Only candidate genes or loci have been identified. My thesis had two main objectives: pursuing the identification of genetic factors involved in ASD, and discovering a first genetic factor for dyslexia. I therefore studied two types of populations: on the one hand a group of patients with ASD (N > 600) from France, Sweden and the Faroe Islands, and on the other hand another group of patients with dyslexia (N > 200) from France, and more specifically a family of 11 people followed over 3 generations. I used both Illumina microarrays technology (600K and 5M) and the complete human genome sequencing to conduct linkage and association analyses. Regarding ASD, CNVs (copy number variants) analyses allowed me to confirm the association of several synaptic genes with autism and to identify new candidate genes. In particular, the study of a population of 30 patients from the Faroe Islands confirmed the involvement of NLGN1 and NRXN1 genes in autism and identified a new candidate gene, IQSEC3. At the same time, I explored PRRT2 located in 16p11.2. PRRT2 encodes a member of the synaptic SNARE complex that allows the release of synaptic vesicles. I have not been able to demonstrate any association with ASD, but I showed that this gene, which is important for some neurological diseases, was under different selection pressures according to the population considered. Regarding dyslexia, I realized a linkage analysis (lod-score method) for a large family of 11 individuals, with three generations affected. This study identified the CNTNAP2 gene as a vulnerability factor for dyslexia. This finding is important because this gene is also associated with ASD. Nevertheless, none of the 20 rare variations discovered by whole genome sequencing is localized in the coding parts of the gene. Only several variations localized in regulatory regions are robust candidates. To conclude, my findings enabled the identification of new candidate genes for ASD, the confirmation of the role of synaptic genes in this disorder, and the highlight for the first time of the role of CNTNAP2 in dyslexia through linkage analysis.

The aim of this diploma thesis is to find what stance the particular teachers of primary and secondary schools (N=50) adopt on the problem of learning disability, especially dyslexia. Very important is to study their awareness and knowledge of this issue, their opinions and especially their personal experience. In the theoretical part of the work the history and characteristics of learning disabilities are introduced, then there is the focus on dyslexia particularly where causes, diagnostics and possibilities of reeducation are presented as well. The important part of these issues is a help of specialists which is also a component of the theoretical part. The next section is focused on teaching of foreign languages, especially English language, where the suitable methods and possible teaching aids for learning disabilities are mentioned. In the practical part of this thesis three case interpretations of pupils/students with learning disabilities are presented as well as the research - the questionnaire survey - itself. There is good knowledge of teachers in this topic which is obvious from the result of this research, at the same time their experience with these children is significant, their opinions on mixed classes are predominantly positive. On the other hand, there is a majority of answers...

This diploma thesis deals with the issue of reeducation of specific learning disorders of pupils at elementary schools in Kutná Hora district. The goal of this paper is to gain insight into contemporary practice in SLD reeducation, more specifically to find out whose job it is to provide reeducation, what their qualification is, and how they are further educated on this issue. Another goal is to find out how reeducation is carried out at selected schools, what study materials and aids are used, and this paper will also attempt to compare the quality of special pedagogical care at urban and village schools. The paper is divided into two parts, theoretical and research part. Theoretical part is dedicated to specific learning disorders, especially general characteristics of specific learning disorders, diagnostics, reeducation, and also education and care of children with SLD. Research part then deals with research survey at selected schools with the usage of qualitative method.

TITLE: Teaching English and Pupils with Special Educational Needs AUTHOR: Janka Kociánová DEPARTMENT: Department of Special Education SUPERVISOR: PhDr. Lenka Felcmanová, Ph.D. ABSTRACT: The thesis deals with the teaching of English of pupils with special educational needs, focusing on pupils with specific learning disabilities (SLD). The issue of pupils with SLD and didactics of English language are described in the theoretical part. The aim of the practical part was to find out how pupils with SLD are taught English in primary schools, which forms of education, the most frequently aids (textbooks, materials, etc.) and methods are used. Quantitative as well as qualitative methods were chosen for the research - the questionnaire survey (the questionnaire for teachers), aids and analysis of materials, interviews with teachers and case studies. On the basis of the obtained data, the effectiveness of the various activities is evaluated and a list of the recommended teaching aids, materials and resources is presented. KEYWORDS: English, dyslexia, Foreign Language, special educational needs, specific learning difficulties

Cette thèse a eu pour objectif de contribuer à la compréhension de deux troubles du langage: ceux associés aux troubles du spectre autistique et la dyslexie. Les récentes avancées sur les mécanismes neuraux de segmentation acoustique du signal de parole indiquent le rôle majeur des oscillations qui offrent des fenêtres d'intégration temporelle à l'échelle de la syllabe et du phonème, unités linguistiques ayant un sens. À l'aide d'enregistrements simultanés d'EEG et d'IRM fonctionnelle durant la visualisation d'un film et au repos, nous avons étudié les rythmes corticaux auditifs et leur topographie chez des sujets sains, autistes et dyslexiques. Nous avons montré que les sujets dyslexiques et les sujets autistes montrent une sensibilité atypique à la structure syllabique et à la structure phonémique. L'activité gamma et l'activité thêta ne s'engagent pas de façon synergique dans l'autisme. L'activité thêta dans le cortex auditif gauche échoue à suivre les modulations de l'enveloppe temporelle du signal de parole dans l'autisme et à potentialiser l'activité gamma qui encode les détails acoustiques. Les troubles du langage dans l'autisme résultent d'une altération du couplage des oscillations lentes et rapides, perturbant le décodage neural du signal de parole. Dans la dyslexie, l'activité corticale auditive thêta n'est pas altérée, et l'activité de modulation de l'activité gamma par l'activité thêta préservée, rendant possible le décodage phonémique, bien qu'atypique. Dans les deux pathologies, ces altérations de l'activité oscillatoire dans le cortex auditif entraînent une altération de la connectivité fonctionnelle entre le cortex auditif et les autres aires du langage. / This research aimed to better understand two language disorders : those associated with autism spectrum disorder and dyslexia. Recent advances indicate how cortical collective neural behaviour intervene in speech segmentation and decoding. Cortical oscillations allow integration temporal windows at syllabic (4-7 Hz) and phonemic (25-35 Hz) time scale, resulting in chunking continuous speech signal into linguistically relevant units. We measured slow fluctuations of rhythmic cortical activity and their topography in healthy subjects, in subjects with autism spectrum disorder and in dyslexic subjects using combined fMRI and EEG. We showed that the sensitivity to syllabic and phonemic density is atypical in dyslexia and in autism. In autism gamma and theta activity do not engage synergistically in response to speech. Theta activity in left auditory cortex fails to track speech modulations and to down-regulate gamma oscillations that encode speech acoustic details. The language disorder in autism results from an altered coupling of slow and fast oscillations that disrupts the temporal organization of the speech neural code. In dyslexia, theta activity is not altered and theta-paced readout of gamma activity is preserved, enabling the phonemic decoding, even atypical (faster). In both pathologies, auditory oscillatory anomalies lead to atypical oscillation-based connectivity between auditory and other language cortices.

Ce travail de recherche s'intéresse à l'inclusion scolaire des élèves en situation de handicap et plus particulièrement aux élèves reconnus porteurs d'une dyslexie sévère. Ce sujet est, de nos jours, une réelle question sociale et un enjeu au sein de l'éducation nationale. En effet, depuis la loi du 11 février 2005 pour "l'égalité des droits et des chances, la participation et la citoyenneté des personnes handicapées", l'inclusion scolaire, en milieu ordinaire, est un droit pour chaque personne en situation de handicap. Cette recherche prend comme objet d'étude les pratiques enseignantes ainsi que les conceptions des enseignants lorsqu'un élève dyslexique, reconnu handicapé, par la Maison Départementale des Personnes Handicapées (MDPH), est scolarisé au sein de leur classe. A partir de l'association de divers outils de recherche (entretiens, observations, recueil de données), il s'agit de voir en quoi la scolarisation d'un élève à Besoins Éducatifs Particuliers engendre une évolution des pratiques et des conceptions des enseignants sur leurs élèves ainsi que sur leur métier. Les résultats de cette enquête permettent de penser comment la corporation éducative évolue, modestement mais de façon concrète, par l'accommodation des pratiques enseignantes face à un public de plus en plus hétérogène. / This research work deals with the school inclusion of special needs pupils and more specifically those who have been recognized as severely dyslexic. This subject is, nowadays, a real social question and an issue facing the "National Education". Since the law of February 11th, 2005 on the "Equality of rights, opportunity, partication and citizenship of handicapped persons", school inclusion in normal environments has indeed been a right for each disabled person. This research focuses on the study of teaching practices as well as teacher's perceptions when a dyslexic pupil, recognized by the "Maison Départementale des Personnes Handicapées" as disabled, is enrolled in their class (MDPH : Support centers for disabled individuals located in each department in France). In combining several resarch instruments (interviews, observations, data collection), it shows the effect of how the schooling of pupils with special educational needs, generates and develops teaching pratices and teachers' perceptions of their students and their own profession. This investigation suggests how the educational corporate body is evolving, modestly but in a tangible way, by modifying teaching practices to better an increasingly heterogeneous public.

Cette recherche traite de la prise en charge de la dyslexie chez les élèves du cycle primaire en France et en Côte d'Ivoire. La dyslexie est un trouble spécifique et durable de l'apprentissage de la lecture. Elle concerne 5% de la population scolaire. Dans cette étude, il est question d'établir le diagnostic de la dyslexie avec des outils d'évaluation spécifiques et de mettre enplace un protocole de prise en charge. L'hypothèse principale de cette étude était que lescauses de la dyslexie seraient d'ordre psycho-Affectif. La pédagogie relationnelle du langageest l'approche thérapeutique adoptée pour la prise en charge des enfants dyslexiques. Il ressort de cette étude que les étiologies de la dyslexie varient selon le cadre d' étude et la langue maternelle. En France, ou le français est la langue maternelle de nos sujets, il a été prouvé que les causes de la dyslexie sont d'ordre psycho-Affectif. En revanche en Côte d'Ivoire, ou le français est une langue seconde, les causes de la dyslexie sont d'ordre socio-Environnemental / This research deals with taking care of primary pupils in Côte d'Ivoire. Dyslexia is a lastingand specific trouble of learning reading. That trouble is frequent in education area andconcours about 5% children according the expertise of INSERM. In order to lead our researchtwo fields are chosen: France, Côte d'Ivoire. We identified the typs of dyslexia and we settleda taking care of dyslexic children. According relational pedagogy of language, dyslexia has apsycho-Affective origin. To a first time the accent is put at the relational during reeducationbefore working a its technical aspects. It springs of analysis that causes of dyslexia changeaccording the area. In France, french is the mother tongue of our sample. Dyslexia wouldhave a psycho affective origins to 4/5 children. In Côte d'Ivoire, where French is a secondlanguage, the origin of dyslexia seems to be socio environnnemental and psycho affective

Mon thème de recherche est d’étudier l’influence de l’apprentissage de la musique sur le traitement acoustique et phonologique de la syllabe chez des enfants normolecteurs et dyslexiques. Dans ce but, j’ai conduit plusieurs expériences basées sur l’utilisation conjointe des méthodes issues de la psychologie expérimentale (Temps de Réaction, TRs, et pourcentage d’erreurs, %err) et de l’électrophysiologie chez l’homme (Potentiels Evoqués, PEs). En comparant des enfants musiciens et non-musiciens de 9 ans, j’ai d’abord testé les effets de l’expertise musicale sur les traitements attentif (TRs et %err) et pré-attentif (en utilisant la Mismatch Negativity, MMN) de paramètres acoustiques, fréquence et durée des syllabes, et d’un paramètre phonologique, le Voice Onset Time (VOT; Expérience I). Les résultats montrent que l'expertise musicale améliore les traitements pré-attentif et attentif de la durée et du VOT dans les syllabes et le traitement attentif des variations de fréquence. Dans une seconde étude, j’ai utilisé la MMN pour comparer le traitement de ces mêmes paramètres chez des enfants dyslexiques et normolecteurs. Les enfants dyslexiques montrent un déficit du traitement de la durée des syllabes et du VOT comparés aux enfants normolecteurs. Enfin, dans les deux dernières études, j’ai utilisé la méthode longitudinale pour tester l’influence de l’apprentissage de la musique sur le traitement pré-attentif (MMN) de ces mêmes paramètres chez des enfants normolecteurs (Expérience III) et dyslexiques (Expérience IV). Les résultats de l’Expérience III montrent que 12 mois d’apprentissage de la musique améliorent le traitement pré-attentif de la durée et du VOT chez les enfants normolecteurs. En reproduisant les effets trouvés dans l’Expérience I, ces résultats soulignent que l’avantage mis en évidence chez les enfants musiciens ne résulterait pas uniquement de prédispositions génétiques pour la musique mais serait causalement lié à l’apprentissage musical. Enfin, les résultats de l’Expérience IV montrent que 6 mois d’apprentissage de la musique améliorent le traitement pré-attentif du VOT chez les enfants dyslexiques, suggérant que l’apprentissage musical pourrait être utilisé comme une aide à la remédiation de la dyslexie.Pris dans leur ensemble, ces résultats démontrent une relation forte entre traitements acoustique et phonologique. L’apprentissage de la musique, en améliorant la sensibilité des enfants aux paramètres acoustiques dans la musique et dans le langage (processus communs), augmenterait également leur sensibilité aux paramètres phonologiques associés et permettrait ainsi la construction de représentations phonologiques plus robustes (transfert d’apprentissage de la musique vers le langage). / My research is aimed at studying the influence of musical training on the acoustic and phonological processing of syllables in children with dyslexia and in normal-reading children. To this aim, I conducted several experiments by using methods issued from experimental psychology (Reaction Times, RTs, and error rates, %err) and from human electrophysiology (Event-Related brain Potentials, ERPs)By comparing 9-year-old musician and non-musician children, I first tested for the effects of musical expertise on attentive (RTs and %err) and preattentive processing (by using the Mismatch Negativity, MMN) of the acoustical parameters, frequency and duration, of syllables and of a phonological parameter, the Voice Onset Time (VOT; Experiment I). Results showed enhanced preattentive and attentive processing of syllables’ duration and VOT in musicians compared to nonmusician children. Secondly, I compared the processing of these same parameters in dyslexic and normal-reading children (Experiment II) by using the MMN. Results revealed that children with dyslexia showed deficits for the processing of duration and VOT in syllables compared to normal-readers. Finally, in the last two studies, I used the longitudinal method to test for the influence of musical training on the processing of the same acoustic and phonological parameters of syllables, in normal-reading children (Experiment III) and in children with dyslexia (Experiment IV). Results of Experiment III showed that 12 months of musical training enhanced duration and VOT processing in syllables, thereby demonstrating that the effects of musical expertise shown in Experiment I are not likely to only result from specific genetic predispositions for music but are causally linked to musical training. Finally, results of Experiment IV revealed that 6 months of musical training in children with dyslexia enhanced their sensitivity to VOT processing, suggesting that musical training could be an aid for the remediation of dyslexia.These results highlight the relationship between acoustical and phonological processing. Musical training, by refining the acoustical network responsible for the acoustic processing in music and speech sounds (common processing) also enhances sensitivity to phonological associated features and, consequently, the building-up of more robust phonological representations (transfer of training effect from music to language processing).