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Développement d'anticorps monoclonaux humains de type IgA dirigés contre la partie C-terminale de la protéine d'enveloppe gp41 du VIH-1 / Development of human monoclonal IgA antibodies directed against the C-terminal region of the gp41 envelope protein of HIV1Benjelloun, Fahd 08 July 2013 (has links)
La transmission du Virus de l’Immunodéficience Humaine (VIH) par voie sexuelle représente le mode majoritaire de contamination (80%) (UNAIDS). Ce mode de contamination implique le passage du virus à travers les muqueuses et une interaction avec les cellules épithéliales et les cellules immunitaires présentes au sein de ces muqueuses (cellules dendritiques, macrophages ou lymphocytes). Les muqueuses représentent le principal site d'exposition de l’organisme aux antigènes de l’environnement. Les SIgA (IgA sécrétoires) présentes dans la lumière de ces muqueuses représentent la première ligne de défense immunitaire contre l’infection et la colonisation des muqueuses. Les IgA sont capables d’interagir avec les glycoprotéines (gp) exprimées à la surface du VIH et de bloquer l’infection et/ou la transcytose à travers l’épithélium muqueux. Nous avons pu étudier la prévalence des SIgA anti-gp41 et plus précisément anti-MPER présentes dans la salive parotidienne de personnes Exposées au VIH Séronégatives (ESN) et leur rôle dans l’inhibition de l’infection par le virus in vitro. Nous avons pu démontrer que ces sujets présentaient un taux plus important de SIgA anti-MPER neutralisantes. Ce premier travail nous a permis de valider la gp41 comme immunogène d’intérêt pour la génération de SIgA neutralisantes. Nous avons pu générer des IgA1 dans un modèle murin α1Kl chimérique capable de produire des anticorps IgA1 humanisés. L’immunisation de ces souris a permis la production de 6 anticorps monoclonaux spécifiques de la région MPER capables de reconnaître des épitopes conformationnels élargis, correspondant aux épitopes reconnus par le 2F5 et le 4E10. Les IgA1 présentaient de fortes capacités neutralisantes pour différentes souches de laboratoire et de souches primaires du VIH. Les études de caractérisation des fonctions antivirales de ces anticorps permettront de mieux définir le mode d’action de ces anticorps. A notre connaissance, ces IgA1 neutralisantes anti-MPER sont les premières décrites à ce jour dans la littérature. De par leur faible immunogénicité et leur faible autoréactivité, ces anticorps peuvent facilement être intégrés dans des approches thérapeutiques locales ou par sérothérapie passive pour la protection après administration de SHIV dans des modèles animaux comme le macaque. L’ensemble de mes travaux de thèse ont confirmé l’intérêt thérapeutique potentiel des SIgA dans la lutte contre le VIH et notamment celles dirigées contre la partie gp41 de l’enveloppe / Sexual transmission of the Human Immunodeficiency Virus is the major mode of contamination (80%) for this pathogen (UNAIDS). This mode of transmission involves a passage of the virus though the mucosa and an interaction with epithelial cells and immune cells present in the mucosa (dendritic cells, macrophages and lymphocytes). Mucosa represents the major site of exposure for the organism to environmental antigens. The IgA expressed in the lumen of mucosa are the first line of immune defence against infection and colonization of mucosa. IgA are able to interact with glycoproteins (gp) expressed on the surface of HIV and prevent infection and/or block epithelial transcytosis. In this study we have investigated the prevalence of SIgA anti-MPER present in the parotid saliva of Exposed to HIV but Seronegative individuals (ESN). This study has allowed us to validate gp41 as an immunogen of interest for the generation of neutralizing IgA. IgA1 were generated in a chimeric mice model α1Kl that produced humanized IgA1 type antibodies. Immunizations of these mice has led to the elicitation of six monoclonal antibodies specific to the MPER region able to recognize extended conformational neutralizing epitopes of 2F5 and 4E10, two broadly neutralizing monoclonal antibodies specific to MPER. Elicited IgA1 have potent neutralizing properties for both laboratory and primary HIV strains. Characterization studies of the antiviral functions of these antibodies will further define the mode of action of these antibodies. To our knowledge, these anti-MPER humanized monoclonal neutralizing IgA1 antibodies are the first of this type described to date in the literature. By their low immunogenicity and autoreactivity, these antibodies can be easily integrated into local therapeutic approaches or passive serotherapy for protection in animal models such as the macaque challenged with SHIV. All the results of my PhD work confirm the great interest of gp41-specific SIgA as therapeutic agents against HIV
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Navigating in a dynamic world : Predicting the movements of othersThorarinsson, Johann Sigurdur January 2009 (has links)
The human brain is always trying to predict ahead in time. Many say that it is possible to take actions only based on internal simulations of the brain. A recent trend in the field of Artificial Intelligence is to provide agents with an “inner world” or internal simulations. This inner world can then be used instead of the real world, making it possible to operate without any inputs from the real world. This final year project explores the possibility to navigate collision-free in a dynamic environment, using only internal simulation of sensor input instead of real input. Three scenarios will be presented that show how internal simulation operates in a dynamic environment. The results show that it is possible to navigate entirely based on predictions without a collision.
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Développement d'anticorps monoclonaux humains de type IgA dirigés contre la partie C-terminale de la protéine d'enveloppe gp41 du VIH-1Benjelloun, Fahd 08 July 2013 (has links) (PDF)
La transmission du Virus de l'Immunodéficience Humaine (VIH) par voie sexuelle représente le mode majoritaire de contamination (80%) (UNAIDS). Ce mode de contamination implique le passage du virus à travers les muqueuses et une interaction avec les cellules épithéliales et les cellules immunitaires présentes au sein de ces muqueuses (cellules dendritiques, macrophages ou lymphocytes). Les muqueuses représentent le principal site d'exposition de l'organisme aux antigènes de l'environnement. Les SIgA (IgA sécrétoires) présentes dans la lumière de ces muqueuses représentent la première ligne de défense immunitaire contre l'infection et la colonisation des muqueuses. Les IgA sont capables d'interagir avec les glycoprotéines (gp) exprimées à la surface du VIH et de bloquer l'infection et/ou la transcytose à travers l'épithélium muqueux. Nous avons pu étudier la prévalence des SIgA anti-gp41 et plus précisément anti-MPER présentes dans la salive parotidienne de personnes Exposées au VIH Séronégatives (ESN) et leur rôle dans l'inhibition de l'infection par le virus in vitro. Nous avons pu démontrer que ces sujets présentaient un taux plus important de SIgA anti-MPER neutralisantes. Ce premier travail nous a permis de valider la gp41 comme immunogène d'intérêt pour la génération de SIgA neutralisantes. Nous avons pu générer des IgA1 dans un modèle murin α1Kl chimérique capable de produire des anticorps IgA1 humanisés. L'immunisation de ces souris a permis la production de 6 anticorps monoclonaux spécifiques de la région MPER capables de reconnaître des épitopes conformationnels élargis, correspondant aux épitopes reconnus par le 2F5 et le 4E10. Les IgA1 présentaient de fortes capacités neutralisantes pour différentes souches de laboratoire et de souches primaires du VIH. Les études de caractérisation des fonctions antivirales de ces anticorps permettront de mieux définir le mode d'action de ces anticorps. A notre connaissance, ces IgA1 neutralisantes anti-MPER sont les premières décrites à ce jour dans la littérature. De par leur faible immunogénicité et leur faible autoréactivité, ces anticorps peuvent facilement être intégrés dans des approches thérapeutiques locales ou par sérothérapie passive pour la protection après administration de SHIV dans des modèles animaux comme le macaque. L'ensemble de mes travaux de thèse ont confirmé l'intérêt thérapeutique potentiel des SIgA dans la lutte contre le VIH et notamment celles dirigées contre la partie gp41 de l'enveloppe
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Machine Learning for Air Flow Characterization : An application of Theory-Guided Data Science for Air Fow characterization in an Industrial Foundry / Maskininlärning för Luftflödeskarakterisering : En applikation för en Teorivägledd Datavetenskapsmodell för Luftflödeskarakterisering i en IndustrimiljöLundström, Robin January 2019 (has links)
In industrial environments, operators are exposed to polluted air which after constant exposure can cause irreversible lethal diseases such as lung cancer. The current air monitoring techniques are carried out sparely in either a single day annually or at few measurement positions for a few days.In this thesis a theory-guided data science (TGDS) model is presented. This hybrid model combines a steady state Computational Fluid Dynamics (CFD) model with a machine learning model. Both the CFD model and the machine learning algorithm was developed in Matlab. The CFD model serves as a basis for the airflow whereas the machine learning model addresses dynamical features in the foundry. Measurements have previously been made at a foundry where five stationary sensors and one mobile robot were used for data acquisition. An Echo State Network was used as a supervised learning technique for airflow predictions at each robot measurement position and Gaussian Processes (GP) were used as a regression technique to form an Echo State Map (ESM). The stationary sensor data were used as input for the echo state network and the difference between the CFD and robot measurements were used as teacher signal which formed a dynamic correction map that was added to the steady state CFD. The proposed model utilizes the high spatio-temporal resolution of the echo state map whilst making use of the physical consistency of the CFD. The initial applications of the novel hybrid model proves that the best qualities of these two models could come together in symbiosis to give enhanced characterizations.The proposed model could have an important role for future characterization of airflow and more research on this and similar topics are encouraged to make sure we properly understand the potential of this novel model. / Industriarbetare utsätts för skadliga luftburna ämnen vilket över tid leder till högre prevalens för lungsjukdomar så som kronisk obstruktiv lungsjukdom, stendammslunga och lungcancer. De nuvarande luftmätningsmetoderna genomförs årligen under korta sessioner och ofta vid få selekterade platser i industrilokalen. I denna masteruppsats presenteras en teorivägledd datavetenskapsmodell (TGDS) som kombinerar en stationär beräkningsströmningsdynamik (CFD) modell med en dynamisk maskininlärningsmodell. Både CFD-modellen och maskininlärningsalgoritmen utvecklades i Matlab. Echo State Network (ESN) användes för att träna maskininlärningsmodellen och Gaussiska Processer (GP) används som regressionsteknik för att kartlägga luftflödet över hela industrilokalen. Att kombinera ESN med GP för att uppskatta luftflöden i stålverk genomfördes första gången 2016 och denna modell benämns Echo State Map (ESM). Nätverket använder data från fem stationära sensorer och tränades på differensen mellan CFD-modellen och mätningar genomfördes med en mobil robot på olika platser i industriområdet. Maskininlärningsmodellen modellerar således de dynamiska effekterna i industrilokalen som den stationära CFD-modellen inte tar hänsyn till. Den presenterade modellen uppvisar lika hög temporal och rumslig upplösning som echo state map medan den också återger fysikalisk konsistens som CFD-modellen. De initiala applikationerna för denna model påvisar att de främsta egenskaperna hos echo state map och CFD används i symbios för att ge förbättrad karakteriseringsförmåga. Den presenterade modellen kan spela en viktig roll för framtida karakterisering av luftflöden i industrilokaler och fler studier är nödvändiga innan full förståelse av denna model uppnås.
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Penser la collaboration dans les organisations à partir des communautés virtuelles sur le réseau social d’entreprise : rapports sociaux et modes de régulation émergents : continuités, contradictions et/ou ruptures / Thinking about collaboration in organizations from virtual communities on the Enterprise Social Network (ESN)Imhoff, Camille 16 March 2018 (has links)
Il semble admis aujourd'hui, tant dans les discours d’entreprise, la littérature managériale et de conseil que dans les études scientifiques, que la performance des organisations repose essentiellement sur la capacité à innover, à constituer une intelligence collective, à capitaliser sur les savoirs et pratiques des collaborateurs dans une société de l’information. Pour cela, les plateformes collaboratives de type réseau social d’entreprise (RSE) se déploient massivement afin d’offrir un outil performant pour la formalisation, la centralisation et la gestion des connaissances. Elles s’inscrivent dans la continuité des transformations des organisations vers des organisations collaboratives, dans le sens où la collaboration désigne un mode d’activité collective où les interactions se font directement, sans intermédiaire, par opposition à la coordination extérieure des tâches. Cependant, la collaboration au sein de communautés en ligne semble à première vue relativement spécifique et cela pour deux raisons. Premièrement parce qu’il s’agit de pratiques collaboratives se référant à un idéal communautaire dans un contexte organisé, hiérarchisé avec des règles instituées. Deuxièmement, il s’agit de pratiques collaboratives spécifiques parce qu’il s'agit d’une collaboration animée et que les problématiques d’animation sur les communautés en ligne semblent être prioritaires pour permettre et assurer la collaboration. En effet, le rôle du community manager, manager / animateur / gestionnaire de la communauté virtuelle apparaît comme central dans les stratégies de collaboration en organisation et cela non seulement dans le lancement, l’alimentation, l’incitation à la logique collaborative, derrière l’apparence de spontanéité et de prise en main par les acteurs, mais également et de façon plus structurelle, dans l’instrumentalisation marketing et managériale de la socialisation. / Today it seems to be commonly recognized in corporate communication, business publications, as well as in scientific publications, that in our information society the ability to innovate, to build collective intelligence and to capitalize on the knowhow and behavior of the coworkers are essential to the organization performance. For that purpose, collaborative platforms such as Enterprise Social Network (ESN) are massively deployed to provide a powerful tool for formalization, centralization and knowledge management. They support the continuous transformation of the current organizations towards collaborative organizations, in the sense that collaboration means a collective approach of the activity with direct interactions without intermediates at the opposite of the coordination by a third party. However, the collaboration within online communities seems at first rather specific for two main reasons. The first reason is that these collaborative practices indeed refer to a community idealistic model but within a well-organized and hierarchized context with its established rules. The second reason is that we are talking of specific collaborative practices in the sense it is a facilitated collaboration and that finding the right way to manage online communities is key to enable and to ensure collaboration. Indeed, the role of the community manager, manager / facilitator / administrator of the virtual community appears to be a central role in the collaboration strategy of a given organization. Behind the appearance of spontaneity and self-sufficiency of the members, it is a central role not only to launch the community but also to keep it up and running as well as to motivate the members to collaborate. It is also essential and in a more structural way in the marketing and managerial instrumentalization of socialization.
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Sociální sítě v podnikové praxi a problematika jejich implementace / The issue of implementation of social networking in business practiceUhlíř, Michal January 2013 (has links)
The aim of this paper is to provide insight into the issue of enterprise social networking (ESN), other collaborative tools , and instruments of social interaction that can facilitate users their individual work tasks as well as contribute to the overall increase in enterprise efficiency. Futhermore, it offer the familiarization with their available functions and features, robustness and simplicity, advantages and disadvantages. It also offers practical guidance for the implementation of enterprise social networks, or other instrument of enterprise social interaction and what to avoid. The entire paper is conceived to three parts that are logically linked. The first part is theoretical, which is discussed fundamental issues what are social networks about. The second part discussed the concept of corporate social networks, the issue of implementation and at the same time this paper shows the major products to the market. The third part is a survey which evaluate the use of social networking in business practice. The paper thus provides a comprehensive
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Extrémní učící se stroje pro předpovídání časových řad / Extreme learning machines for time series predictionZmeškal, Jiří January 2018 (has links)
Thesis is aimed at the possibility of utilization of extreme learning machines and echo state networks for time series forecasting with possibility of utilizing GPU acceleration. Such predictions are part of nearly everyone’s daily lives through utilization in weather forecasting, prediction of regular and stock market, power consumption predictions and many more. Thesis is meant to familiarize reader firstly with theoretical basis of extreme learning machines and echo state networks, taking advantage of randomly generating majority of neural networks parameters and avoiding iterative processes. Secondly thesis demonstrates use of programing tools, such as ND4J and CUDA toolkit, to create very own programs. Finally, prediction capability and convenience of GPU acceleration is tested.
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