Submitted by Alison Vanceto (alison-vanceto@hotmail.com) on 2017-09-05T18:58:38Z No. of bitstreams: 1 TeseMCS.pdf: 1842426 bytes, checksum: 17216a1313f406228d0e6414935cf518 (MD5) / Approved for entry into archive by Ronildo Prado (ronisp@ufscar.br) on 2017-09-20T19:52:43Z (GMT) No. of bitstreams: 1 TeseMCS.pdf: 1842426 bytes, checksum: 17216a1313f406228d0e6414935cf518 (MD5) / Approved for entry into archive by Ronildo Prado (ronisp@ufscar.br) on 2017-09-20T19:53:05Z (GMT) No. of bitstreams: 1 TeseMCS.pdf: 1842426 bytes, checksum: 17216a1313f406228d0e6414935cf518 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-09-20T19:58:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 TeseMCS.pdf: 1842426 bytes, checksum: 17216a1313f406228d0e6414935cf518 (MD5) Previous issue date: 2017-02-21 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / This thesis describes the bio-ecology of Paralonchurus brasiliensis caught as bycatch for the shrimp trawling fishery targeting Xiphopenaeus kroyeri in Penha, Brazil. Series of 30 minute trawls were made between July/2013 and June/2014 at depths of 10, 20 and 30 meters during which 3040 specimens of P. brasiliensis were collected. All specimens were weighed(g) and measured total length (TL in cm) and from a subsample of 1219 specimens data was obtained for sex-ratio, gonad weight, gonadal maturity, stomach repletion and diet. Paralonchurus brasiliensis is abundant and very frequent, in the bycatch of X. kroyeri, with a ratio of approximately 1: 1 kg between its average biomass and that of the targeted shrimp. CPUE both in number and biomass/trawling did not suffer significant variations and there was no population stratification among the isobaths. In the captures, a large amplitude of Lt (2.7- 23.3cm) was obtained, with a higher number of juveniles and females, regardless of depth. Asymptotic length (L∞) was estimated for males at 33.6 cm, females (30.4 cm) and size of first gonadal maturation estimated for males (16.4cm) and females (15.8 cm). The closed period of shrimp trawling for X. kroyeri only protects the early stages of P. brasiliensis, a continuous yearlong breeding species with peaks between autumn (may) and spring (october). There were significant correlations between abundance versus sand and silt, biomass vs. bottom temperature and silt, as well as RGS-M vs. Silt. The positive allometric growth and relative condition factor close to 1.0 (kn=1), indicated a favorable physiological condition of the specie in the three isobaths. This species showed intense foraging activity, evidenced by the high percentage of stomachs with food (95.73%). The diet of P. brasiliensis is diversified, with greater consumption of polychaetes, crustaceans and ophiuroids, which enables us to classify it as a carnivorous species, predominantly invertivorous. Paralonchurus brasiliensis is a key benthic-demersal species and an opportunistic predator over a wide trophic range intersecting with a vast number of macro-benthic species on marine coastal food webs along the South Brazilian shorelines. Besides the characterization important bioecological aspects of P. brasiliensis, this work contributes to the discussion and understanding of the impact of trawling at the local and world level using the case of P. brasiliensis as a study model. / Esta tese descreve a bioecologia de Paralonchurus brasiliensis capturados na pesca de arrasto de camarão sete-barbas (Xiphopenaeus kroyeri), em Penha, Brasil. Foram realizados arrastos mensais, de 30 min cada, nas isóbatas de 10, 20 e 30m, entre julho/2013 e junho/2014. Dos 3040 exemplares capturados obtiveram-se peso (g) e comprimento total (Lt, em cm) e de 1219 exemplares subamostrados, registraram-se sexo, estádios de maturação e peso (Wt, em g) gonadal, repleção estomacal e a dieta. Paralonchurus brasiliensis é muito frequente, abundante no “bycatch” de X. kroyeri, com proporção aproximada de 1:1kg entre as biomassas anuais das duas espécies. As CPUEs em número e biomassa/arrasto não sofreram variações significativas e não se constatou estratificação populacional entre as isóbatas. Nas capturas obteve-se grande amplitude de Lt (2,7-23,3cm), com maior número de juvenis e fêmeas, independentemente da profundidade. O comprimento assintótico (L∞) foi estimado para machos em 33,6 cm, fêmeas (30,4cm) e o tamanho de primeira maturação gonadal estimados para machos (16,4 cm) e fêmeas (15,8 cm). O defeso de X. kroyeri protege apenas o início do ciclo reprodutivo de P. brasiliensis que se reproduz o ano inteiro, porém, com maiores picos entre outono (maio) e primavera (outubro). Ocorreram correlações significativas entre abundância versus areia e silte, biomassa vs. temperatura de fundo e silte, bem como RGS-M vs. silte. O crescimento alométrico positivo e fator de condição relativo próximo a 1,0 (kn=1), indicaram uma condição fisiológica favorável da espécie nas três isóbatas. Essa espécie demonstrou intensa atividade forrageadora, comprovada pelo elevado percentual de estômagos com alimentos (95,73%). A dieta de P. brasiliensis é diversificada, com maior consumo de poliquetas, crustáceos e ofiuróides, destacando-se como uma espécie carnívora, predominantemente invertívora. Paralonchurus brasiliensis é uma espécie-chave demersal bentônica, predadora, oportunista de amplo espectro trófico e que atua no controle de um grande número de espécies macrobênticas das teias tróficas marinhas costeiras, no sul do Brasil. Além de caracterizar aspectos bioecológicos importantes de P. brasiliensis, este trabalho contribui para a discussão e entendimento do impacto da pesca de arrasto em nível local e mundial utilizando-se o caso de P. brasiliensis como modelo de estudo.

Submitted by FABIANA DA SILVA FRANÇA (fabiana21franca@gmail.com) on 2018-02-23T17:33:04Z No. of bitstreams: 1 Arquivo Total.pdf: 2718770 bytes, checksum: 9378d34888dfcacdd356cf58ac71eaa8 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-02-23T17:33:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Arquivo Total.pdf: 2718770 bytes, checksum: 9378d34888dfcacdd356cf58ac71eaa8 (MD5) Previous issue date: 2017-03-22 / The Rufford Foundation / Understanding the ecological role of species within an ecosystem depends largely on knowledge of its trophic relations. Such relations and the position of species within a foodweb are a central step in understanding the dynamics of the communities and the impacts that each species has on the trophic network compartments. The knowledge on the diet of the South American freshwater stingrays has increased considerably over the last years,but still, little is know about their ecological role. Thereby, the aim of this research is to evaluate the importance of the stingray Potamotrygon magdalenae in the structure of a freshwater food web. The feeding habits and the trophic ecology of this species were evaluated using stomach content analysis in combination with stable isotopes of carbon and nitrogen from samples collected in the middle Magdalena river basin, Colombia, and its ecological importance from topological analyzes of trophic networks. Potamotrygon magdalenae showed a specialized diet, feeding primarily on insects. No significant differences of δ13C and δ15N were observed in the muscle of the species between the hydrological periods of high and low waters. The species isotopic niche was intermediate. In terms of ecological importance, it played an intermediary role in the dispersion of indirect effects through the system, due to its intermediate values of centrality and topological importance. These results provide a starting point for further ecological studies about the South American freshwater stingray species, in order to assess their role in the ecosystem. On the other hand, theycomplement the existing studies of Potamotrygon magdalenae. / Compreender o papel ecológico das espécies no ecossistema depende amplamente do conhecimento de suas relações tróficas. Conhecer tais relações e a posição das espécies em umarede é um passo crucial para entender a dinâmica das comunidades e os impactos quecada espécie tem sobre os demais compartimentos. Oconhecimento sobre adieta das espécies de raias de água doce de América do Sul tem aumentado consideravelmente ao longo dos últimos anos, porém, é muito pouco o que se sabe sobre o papel ecológico das espécies nos seus respectivos ecossistemas. Assim, oobjetivo deste trabalho foi avaliar a importânciaecológica da raia Potamotrygon magdalenae na estrutura da rede trófica de um ecossistema de águas continentais. Foram avaliados os hábitos alimentares e a ecologia trófica da espécie através da análise de conteúdos estomacais e isótopos estáveis de carbono e nitrogênio a partir de amostras coletadas na bacia do médio rio Magdalena, Colômbia; e sua importância ecológica a partir de análises topológicas de redes tróficas. A espécie foi considerada um predador especialista de nível trófico intermediário, com preferência pelos insetos.Não foram observadas diferenças significativas de δ13C e δ15N na espécie entre os períodos hidrológicos de cheia e de águas baixas. O seu nicho isotópico foi intermediário. Em relação à importância ecológica, a espécie desempenhou um papel intermediário na dispersão de efeitos indiretos através do sistema, devido aos seus valores intermediários de centralidade e importância topológica. Estes resultadosconstituem um ponto de partida para novos estudos ecológicos das espécies de raias de água doce da América do Sul, que visem avaliar seu papel nos ecossistemas, e complementam os estudos existentes de Potamotrygon magdalenae.

Submitted by Alison Vanceto (alison-vanceto@hotmail.com) on 2017-02-07T10:30:44Z No. of bitstreams: 1 TeseEMO.pdf: 7148427 bytes, checksum: 475fdc271961e45dfdde88a0decfaf60 (MD5) / Approved for entry into archive by Camila Passos (camilapassos@ufscar.br) on 2017-02-08T12:04:18Z (GMT) No. of bitstreams: 1 TeseEMO.pdf: 7148427 bytes, checksum: 475fdc271961e45dfdde88a0decfaf60 (MD5) / Approved for entry into archive by Camila Passos (camilapassos@ufscar.br) on 2017-02-08T12:08:38Z (GMT) No. of bitstreams: 1 TeseEMO.pdf: 7148427 bytes, checksum: 475fdc271961e45dfdde88a0decfaf60 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-08T12:10:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 TeseEMO.pdf: 7148427 bytes, checksum: 475fdc271961e45dfdde88a0decfaf60 (MD5) Previous issue date: 2016-03-09 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / This study examined the ecomorphological pattern ofichthyofauna in two watersheds located on the Upper Paraná River. It was analyzed the ecomorphological variations of species collected from the Beija-Flor stream and Beija-Flor reservoir located in Estação Ecológica de Jataí and Lapa stream located in Área de Proteção Ambiental Corumbataí/Botucatu/Tejubá, to verify interspecific morphological differentiation, the effects oftrophic guilds along the ecomorphological patterns and the effects of water velocity along the ecomorphological standards. Of individuals collected in Estação Ecológica de Jataí, it was selected two Characidium species, on which the ecomorphological variations related to possibility of inter specific morphological differentiation of species of the same genus were analyzed. Considering the common species between the Estação Ecológica de Jataí and the Lapa Stream were observed morphological variables in order to verify the intraspecific morphological differences. Finally these results were related to the meaningof the relation ship between form and function. The main morphological differences found in the individuals of this study were related to the speed of water and feeding habits of the species. The distribution of species in morphological space showed the relation between the ecomorphological attributes and the distribution of species over the water column, where it was possible to characterize the species as demersal, nectobenthicand nektonic species. The relation ship of fish morphology with the water velocity is fundamental. The feeding also contributes with smaller importance in the separation of species in ecomorphological space, but this contribution seems to be because of the presence of these food items is also influenced by the speed of the water. The function of the species in the environmentin which they liveis linked mainly to its trophicniche. / Neste estudo foi analisado o padrão ecomorfológico daictiofauna de duas microbacias localizadas no alto rio Paraná. Foram analisadas as variações ecomorfológicas das espécies coletadas no córrego e represa do Beija-Flor, localizados na Estação Ecológica de Jataí e córrego da Lapa, localizado na Área de Proteção Ambiental Corumbataí/Botucatu/Tejubá, para verificar as diferenças morfológicas interespecíficas, os efeitos das guildas tróficas junto aos padrões ecomorfológicos e os efeitos da velocidade da água junto aos padrões ecomorfológicos. Das espécies coletadas na Estação Ecológica de Jataí, foram selecionadas duas do gênero Characidium, sobre as quais foram analisadas as variações ecomorfológicas relacionadas à possibilidade de existência de diferenciação morfológica interespecífica de espécies pertencentes ao mesmo gênero. Considerando-se as espécies comuns entre a Estação Ecológica de Jataí e o córrego da Lapa, foram observadasas variáveis morfológicas com objetivo deverificar as diferenciações morfológicas intraespecíficas. Por fim, tais resultados foram relacionados ao significado da relação entre forma e função. As principais diferenças morfológicas encontradas nos indivíduos deste estudo foram relacionadas à velocidade da água e ao hábito alimentar das espécies. A distribuição das espécies no espaço morfológico mostrou a relação entre os atributos ecomorfológicos e a distribuição das espécies ao longo da coluna da água, que possibilitou caracterizar as espécies como demersais, nectobentônicas e nectônicas. A relação da morfologia dos peixes com a velocidade da água mostrou-se fundamental. A alimentação aparece com menor importância na separação das espécies no espaço ecomorfológico, mas tal contribuição parece ocorrer devido à presença destes itens alimentares serem influenciados pela velocidade da água. A função das espécies no ambiente em que habitam está ligada, principalmente, ao seu nicho trófico.

Dissertação(mestrado) - Universidade Federal do Rio Grande, Programa de Pós–Graduação em Oceanografia Biológica, Instituto de Oceanografia, 2012. / Submitted by Cristiane Gomides (cristiane_gomides@hotmail.com) on 2013-10-11T12:19:06Z No. of bitstreams: 1 Leandro.pdf: 1098668 bytes, checksum: d672d3888ee8760a698a4ba11e3e1121 (MD5) / Approved for entry into archive by Sabrina Andrade (sabrinabeatriz@ibest.com.br) on 2013-10-17T17:27:18Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Leandro.pdf: 1098668 bytes, checksum: d672d3888ee8760a698a4ba11e3e1121 (MD5) / Made available in DSpace on 2013-10-17T17:27:18Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Leandro.pdf: 1098668 bytes, checksum: d672d3888ee8760a698a4ba11e3e1121 (MD5) Previous issue date: 2012 / Na costa brasileira, o peixe-boi marinho, Trichechus manatus, apresenta distribuição fragmentada e restrita a algumas regiões com características ecológicas distintas. É considerado um herbívoro generalista e oportunista, que consome uma ampla variedade de vegetação de rios, mares e estuários, porém, existem poucas informações sobre a ecologia da espécie no país. O objetivo do presente estudo foi o de estudar a ecologia trófica de T. manatus no Brasil por meio de análise de isótopos estáveis. Amostras de dentes (n=22) e ossos (n=21) de peixes-bois encalhados e amostras de vegetação foram coletadas na região nordeste do país para a análise de isótopos estáveis de carbono (δ13C) e nitrogênio (δ15N). Os animais foram agrupados em cinco regiões: Alagoas, Ceará, Maranhão, Paraíba (que também inclui animais do Rio Grande do Norte e Pernambuco) e Piauí. As plantas, obtidas destas mesmas regiões, foram categorizadas em quatro grupos: fanerógamas marinhas, macroalgas, mangues e de marismas. O modelo de mistura bayesiano para isótopos estáveis SIAR (Stable Isotopes Analysis in R) foi utilizado para estimar as proporções das fontes nas dietas dos grupos de peixesbois. Não foram verificadas diferenças nos valores de δ13C e δ15N entre dentes e ossos, classes de idade ou sexos. Foram verificadas, entretanto, diferenças nas composições isotópicas dos peixes-bois entre as regiões, principalmente com relação ao carbono: os peixes-bois do Ceará (-7,0 ±0,5‰) apresentaram as composições mais enriquecidas em 13C, enquanto os valores mais empobrecidos foram encontrados nos animais do Maranhão (-15,7 ±1,6‰). Valores intermediários foram observados nos indivíduos de Alagoas (-9,3 ±0,4‰), Piauí (-9,3 ±0,6‰) e Paraíba (-11,4 ±2,8‰). Com relação aos isótopos de nitrogênio, os animais da Paraíba (8,8 ±1,2‰) apresentaram composições mais enriquecidas em 15N do que os indivíduos das outras regiões. O modelo de mistura também mostrou diferenças espaciais na ecologia trófica dos peixes-bois. Os animais do Ceará consumiram predominantemente fanerógamas (97,3%), enquanto as fanerógamas (69,4%) e as macroalgas (64,4%) foram mais importantes para os indivíduos de Alagoas e Paraíba, respectivamente. Apesar dos manguezais predominarem no Maranhão, a vegetação de marisma foi a que apresentou a maior contribuição (68,7%) na dieta dos peixes-bois do região. Diferentemente das demais regiões, os indivíduos do Piauí apresentaram uma dieta mais diversificada, na qual os quatro grupos de macrófitas contribuíram em proporções similares (fanerógamas: 28,5%; marismas: 27,1%; macroalgas: 24,0%; mangues: 20,4%). Os resultados demonstram diferenças espaciais nas estratégias alimentares, bem como a importância dos diferentes grupos de macrófitas na dieta dos peixes-bois. O presente estudo é o primeiro a aplicar a análise de isótopos estáveis em peixes-bois marinhos na América do Sul, amplia o conhecimento sobre a ecologia trófica da espécie no país e fornece informações importantes para o estabelecimento de estratégias para a conservação de T. manatus e seu habitat no Brasil. / On the Brazilian coast, the manatee Trichechus manatus has a fragmented distribution, restricted to a few regions with different ecological characteristics. It is considered a generalist and opportunistic herbivore, consuming a wide range of vegetation from rivers, seas and estuaries, however, information about the ecology of the species in the country is scarce. The aim of this study was to study the trophic ecology of T. manatus in Brazil through stable isotopes. Samples of teeth (n=22) and bones (n=21) of stranded manatees and plants were collected in the northeastern region of the country for the analysis of stable isotopes of carbon (δ13C) and nitrogen (δ15N). The animals were grouped in five regions: Alagoas, Ceara, Maranhão, Paraíba (that includes individuals from Pernambuco and Rio Grande do Norte) and Piauí. The plants, obtained from these same areas, were categorized in four main groups: macroalgae, mangroves, seagrasses and saltmarsh plants. The bayesian mixture model for stable isotopes SIAR (Stable Isotopes Analysis in R) was used to estimate the proportions of the sources in the diets of the groups of manatees. There were no differences in the values of δ13C and δ15N among teeth and bones, age classes or between sexes. There were, however, regional differences in isotopic compositions of manatees, especially for δ13C. Carbon stable isotope compositions ranged from depleted in 13C in Maranhão (- 15,7±1.6‰), to more enriched in Ceará (-7.0±0.5‰), whereas Alagoas (-9.3±0.4‰), Piauí (-9.3±0.6‰) and Paraíba (-11.4±2.8‰) presented intermediate values. Manatees from Paraíba had higher 15N values (8.8±1.2‰) than those from other regions. The mixture model also indicated regional variation on the manatees diet. Animals from Ceará feed almost exclusively on seagrasses (97.3%), while manatees from Alagoas and Paraíba graze mainly upon seagrasses (69.4%) and macroalgae (64.4%), respectively. Individuals from Maranhão were feeding mainly on saltmarsh plants (68.7%), despite mangrove dominate the area. Individuals from Piauí, on the other hand, had a more diversified diet, where seagrasses (28.5%), saltmarsh plants (27.1%), macroalgae (24.0%) and mangroves (20.4%) were assimilated in similar proportions. This study i the first to use stable isotopes do investigate the feeding ecology of manatees in South America. The spatial variation in the manatee’s diet demonstrates that proper conservation strategies for the species should include the maintenance of different macrophyte habitats along the northeastern Brazil.

Os ecossistemas marinhos do Estado de São Paulo sofrem intensa pressão antrópica. Considerando que os estudos tróficos de peixes são essenciais para o manejo desses ecossistemas e para a gestão pesqueira, foi construído um banco de dados alimentares de peixes para sintetizar o conhecimento já obtido na área. Foram inseridos, individualmente ou agrupados, dados primários (não-publicados) e secundários (publicados), representando 142 espécies. Com base nesse banco, foi comparada a dieta dos peixes nos sistemas de plataforma continental do litoral Norte, plataforma continental do litoral Centro, canal de São Sebastião, baía de Santos e complexo estuarino-lagunar de Cananéia-Iguape. Foi verificado que a dieta variou entre os sistemas, provavelmente devido à variação na disponibilidade alimentar. Na plataforma Norte, foi analisada a variação sazonal (outono/inverno e primavera/verão) da dieta e verificou-se que a diferença interespecífica sobrepujou a diferença intraespecífica temporal. A dieta da corvina (Micropogonias furnieri), espécie abundante e de grande importância comercial, foi analisada em detalhe e concluiu-se que ela possui estratégia alimentar mista, consumindo majoritariamente alguns itens (poliquetas e camarões) e esporadicamente outros. Foram elaboradas considerações sobre a publicação de dados científicos brutos e sobre a metodologia aplicada aos estudos de conteúdo estomacal. / The marine ecosystems of São Paulo State are under intense anthropic pressure. Considering that trophic studies of fishes are essential to the management of ecosystems and fisheries, a fish stomach content database was built in order to summarize the available data in the region. Primary (unpublished) and secondary (published) data were inserted, representing 142 species. Based on this database, diet compositions of fishes were compared among 5 marine systems of São Paulo State (North continental shelf, Central continental shelf, São Sebastião channel, Santos bay and Cananéia lagoon estuarine system). It was observed that diet composition varied among systems, probably associated to the food resource availability. Seasonal comparison (autumn/winter and spring/summer) performed in the North continental shelf showed that the interspecific variation was larger than the intraspecific temporal variation. Diet of Micropogonias furnieri, an abundant and commercially important species, was analyzed in detail and it was concluded that it has a mixed feeding strategy, consuming mostly few items (polychaetes and shrimps) and sporadically many others. Some considerations on scientific raw data publication and on methodology of stomach content studies were made.

Os ecossistemas marinhos do Estado de São Paulo sofrem intensa pressão antrópica. Considerando que os estudos tróficos de peixes são essenciais para o manejo desses ecossistemas e para a gestão pesqueira, foi construído um banco de dados alimentares de peixes para sintetizar o conhecimento já obtido na área. Foram inseridos, individualmente ou agrupados, dados primários (não-publicados) e secundários (publicados), representando 142 espécies. Com base nesse banco, foi comparada a dieta dos peixes nos sistemas de plataforma continental do litoral Norte, plataforma continental do litoral Centro, canal de São Sebastião, baía de Santos e complexo estuarino-lagunar de Cananéia-Iguape. Foi verificado que a dieta variou entre os sistemas, provavelmente devido à variação na disponibilidade alimentar. Na plataforma Norte, foi analisada a variação sazonal (outono/inverno e primavera/verão) da dieta e verificou-se que a diferença interespecífica sobrepujou a diferença intraespecífica temporal. A dieta da corvina (Micropogonias furnieri), espécie abundante e de grande importância comercial, foi analisada em detalhe e concluiu-se que ela possui estratégia alimentar mista, consumindo majoritariamente alguns itens (poliquetas e camarões) e esporadicamente outros. Foram elaboradas considerações sobre a publicação de dados científicos brutos e sobre a metodologia aplicada aos estudos de conteúdo estomacal. / The marine ecosystems of São Paulo State are under intense anthropic pressure. Considering that trophic studies of fishes are essential to the management of ecosystems and fisheries, a fish stomach content database was built in order to summarize the available data in the region. Primary (unpublished) and secondary (published) data were inserted, representing 142 species. Based on this database, diet compositions of fishes were compared among 5 marine systems of São Paulo State (North continental shelf, Central continental shelf, São Sebastião channel, Santos bay and Cananéia lagoon estuarine system). It was observed that diet composition varied among systems, probably associated to the food resource availability. Seasonal comparison (autumn/winter and spring/summer) performed in the North continental shelf showed that the interspecific variation was larger than the intraspecific temporal variation. Diet of Micropogonias furnieri, an abundant and commercially important species, was analyzed in detail and it was concluded that it has a mixed feeding strategy, consuming mostly few items (polychaetes and shrimps) and sporadically many others. Some considerations on scientific raw data publication and on methodology of stomach content studies were made.