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Demografia e estrutura populacional da raça caprina murciano-granadina na Espanha com base em análise de pedigree

OLIVEIRA, Rejane Rodrigues de 27 December 2012 (has links)
Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2017-07-03T13:04:37Z No. of bitstreams: 1 Rejane Rodrigues de Oliveira.pdf: 1165760 bytes, checksum: 80f04a5414f3c6a357ac1aa597c0719c (MD5) / Made available in DSpace on 2017-07-03T13:04:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Rejane Rodrigues de Oliveira.pdf: 1165760 bytes, checksum: 80f04a5414f3c6a357ac1aa597c0719c (MD5) Previous issue date: 2012-12-27 / Aiming at studying the structure of population and demography of Murciano-Granadina goat breed, 24,444 data on pedigree, from Asociación Nacional de Criadores de Caprino de Raza Murciano-Granadina – CAPRIGRAN, were analyzed. In order to set population structure the following population data were analyzed: complete generations; complete generation equivalent; effective number of founders (fe); effective number of ancestors (fa); inbreed coefficient (F-statistics) and average relatedness coefficient (AR). The conclusion was that the levels of genetic variability in the studied population of Murciano-Granadina goat breed were in satisfactory level, allowing its utilization in programs of genetic improvement and conservation of genetic resources. As for demographic census, quantitative data were studied regarding: number of males and females; medium generation intervals (GI); effective number (Ne). The conclusion was that low depth of pedigrees limits getting more precise parameters. Smaller herds presented sex rate under recommended and the medium GI observed (2.77 years) demonstrates that population is under intense improvement work that can compromise genetic variability in the future. / Com o objetivo de estudar a estrutura de populações e a demografia da raça caprina Murciano-Granadina, foram avaliadas 24.444 informações de pedigree, pertencentes ao banco de dados da Asociación Nacional de Criadores de Caprino de Raza Murciano-Granadina - CAPRIGRAN. Para compor a estrutura da população, foram avaliados os seguintes parâmetros populacionais: número de gerações completas; número de gerações equivalentes; número efetivo de animais fundadores (fe); número efetivo de ancestrais (fa); coeficiente de consanguinidade (estatísticas F de Wright) e coeficiente médio de parentesco (AR), concluindo-se que a existência de variabilidade genética nas populações estudadas da raça caprina Murciano-Granadina da Espanha encontra-se em níveis satisfatórios, permitindo sua utilização em programas de melhoramento e de conservação de recursos genéticos. Para o censo demográfico, foram analisadas informações quantitativas sobre número de macho e fêmeas; intervalo médio de gerações (IG); tamanho efetivo da população (Ne), resultando na baixa profundidade dos pedigrees limitante na obtenção de parâmetros mais acurados e mais precisos. Os rebanhos menores apresentaram taxa sexual inferior ao recomendado, ao passo que o IG médio observado (2,77 anos) demonstra que a população está sob intenso trabalho de melhoramento genético, o que pode comprometer a variabilidade genética no futuro.
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Regeneração natural em uma área de campo de agricultura abandonada em ambiente semi-árido / Natural regeneration in an area in the abandoned field of agriculture semiarid environments

LOPES, Clarissa Gomes Reis 16 June 2011 (has links)
Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2016-06-15T16:10:24Z No. of bitstreams: 1 Clarissa Gomes Reis Lopes (1).pdf: 1021119 bytes, checksum: 8d291962a84690e30bd756708155fc47 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-06-15T16:10:24Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Clarissa Gomes Reis Lopes (1).pdf: 1021119 bytes, checksum: 8d291962a84690e30bd756708155fc47 (MD5) Previous issue date: 2011-06-16 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Tropical dry forests have been intensively disturbed, however knowledge of their regenerating processes is still restrict. The aim of this study is to evaluate if 16 years of regeneration in an area which the agriculture was descontinued are sufficient for the regeneration of structural and floristic features of an abondoned agricultural field and if the time of abandonment, the precipitation and the distance from a preserved fragment influence the regeneration of this area in Caruaru, PE, Brazil. All individuals with diameter ≥ 3 cm a level of soil were marked and had the height and diameter measured. Structure and floristic data were compared with secondary data of the forest fragment and of other regenerating areas of dry forest, and also to test the influence of the fragment upon the regeneration of the abandoned field. The population dynamics of aroeira, braúna and catingueira were evaluated in 105 plots (5 X 5 m) during two years. All individuals of these three species within the plots were counted and marked; the plots were monitored mensaly to record births and deaths. The field presented lower density, basal area and number of species than the forest fragment; however the number of families and the diversity were similar. Species composition and population density in altered areas of caatinga were more influenced by the precipitation than by the time of abandonment. The density, mean height and maximum diameter of individuals within the plots were not related to the distance from the forest, except for some species. The distance from the forest influenced the number of births and the density of aroeira and braúna, but it was not true for catingueira. The number of births and deaths and the population density varied between years. The total density of the area is one of the parameters of faster recuperation, whereas the basal area and the composition of species are slower ones. The results indicated that 16 years of abandonment were not sufficient for the regeneration of area. Role of preserved fragment on regeneration of antropized area influenced the species differently and this relation is stronger in M. urundeuva and S. brasiliensis. Annual variation in demography of tre species may be related to variations on rainfall. This study confirms the importance of forest fragments in the regeneration of altered areas, and suggests the importance of their preservation. / As florestas tropicais secas têm sido intensamente degradadas. Apesar disso, o conhecimento sobre o seu processo regenerativo em áreas abandonadas ainda é restrito. Objetivou-se avaliar se 16 anos de regeneração em uma área onde a agricultura foi descontinuada são suficientes para que volte a apresentar caracterísiticas estruturais e florísticas similares à encontrada na floresta madura e se o tempo de abandono, a precipitação e a distância de um fragmento preservado influenciam na regeneração em Caruaru, PE, Brasil. Todos os indivíduos com diâmetro maior ou igual a 3 cm a nível do solo foram marcados e medidos quanto a altura e diâmetro. Os dados estruturais e florísticos foram comparados com dados secundários tanto do fragmento florestal próximo quanto de outras áreas em regeneração. Os estudos floristicos e fitossociológicos em áreas antropizadas da caatinga publicados em periódicos que disponibilizaram os dados de composição e riqueza de espécies, densidade, área basal, precipitação anual e tempo de regeneração foram selecionados. As dinâmicas populacionais de Myracrodruon urundeuva Allemão, Schinopsis brasiliensis Engl. e Poincianella pyramidalis (Tul.) L.P.Queiroz foram avaliadas em 105 parcelas (5 X 5 m) durante dois anos. No interior das parcelas, todos os indivíduos destas três espécies foram contados e marcados e, mensalmente, as parcelas foram monitoradas para contagem dos nascimentos e mortes. O campo apresentou menor densidade, área basal e número de espécies que o fragmento preservado próximo, porém não diferiu significativamente em relação a número de famílias e diversidade. A composição de espécies e a densidade das populações nas áreas antropizadas da caatinga mostraram-se mais influenciada pela precipitação dos habitats do que pelo tempo de abandono. A densidade, a altura média e o diâmetro máximo dos indivíduos nas parcelas não tiveram a distância da mata, mas nas populações de algumas espécies houve relações significativas. A distância da mata influenciou o número de nascimentos e a densidade populacional de M. urundeuva e S. brasiliensis, mas não de P. pyramidalis. O número de nascimentos, mortes e densidade populacional variaram bastante entre os anos. A densidade total da área é um dos parâmetros de rápida recuperação, enquanto a área basal e a composição de espécies são mais lentos. Mesmo numa área pouco perturbada, 16 anos de abandono não foram suficientes para recuperação de uma área de agricultura em um ambiente semiárido. O papel do fragmento preservado na regeneração da área antropizada influenciou de forma diferenciada as espécies, sendo mais forte em M. urundeuva e S. brasiliensis. A variação anual na demografia das três espécies pode estar relacionada com variações nos totais de precipitação. Este estudo confirma a importância dos fragmentos florestais na regeneração de áreas antropizadas, sendo importante o desenvolvimento de políticas públicas voltadas para proteção destes fragmentos.
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Diversidade genética e estrutura de população entre isolados de Corynespora cassiicola no Estado do Amazonas

Ferreira, Ana Francisca Tibúrcia Amorim Ferreira e 28 February 2014 (has links)
Submitted by Geyciane Santos (geyciane_thamires@hotmail.com) on 2015-10-23T15:45:25Z No. of bitstreams: 1 Dissertaçao - Ana Francisca Tibúrcia Amorim Ferreira e Ferreira.pdf: 1305242 bytes, checksum: 1127ee4c263f9ff4d20ed1b5e301cccb (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2015-10-26T20:05:26Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertaçao - Ana Francisca Tibúrcia Amorim Ferreira e Ferreira.pdf: 1305242 bytes, checksum: 1127ee4c263f9ff4d20ed1b5e301cccb (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2015-10-26T20:10:46Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertaçao - Ana Francisca Tibúrcia Amorim Ferreira e Ferreira.pdf: 1305242 bytes, checksum: 1127ee4c263f9ff4d20ed1b5e301cccb (MD5) / Made available in DSpace on 2015-10-26T20:10:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertaçao - Ana Francisca Tibúrcia Amorim Ferreira e Ferreira.pdf: 1305242 bytes, checksum: 1127ee4c263f9ff4d20ed1b5e301cccb (MD5) Previous issue date: 2014-02-28 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The fungus Corynespora cassiicola is a plant pathogen that has worldwide distribution and has been reported causing disease on leaves, fruits, branches, nematode eggs, and even human skin. In Brazil, this pathogen has already caused serious damage to soybeans, papaya, acerola, and the northern region of the country, this pathogen has great importance in papaya, cucumber and tomato crops. Develop control strategies for a disease depends, among other factors, an understanding of the genetic variability and structure of the pathogen population, these being the goals of this work. We collected 169 isolates from papaya, tomato and cucumber, coming from the cities of Manaus, Iranduba and Presidente Figueiredo, Amazonas state, Brazil, 9 populations totaling.The genetic diversity was analyzed with 8 ISSR primers, 191 polymorphic locus getting, and the polymorphism rate was 100%. The genetic diversity was high in all populations, where the highest genetic diversity index was found in MA2 population (M= 0.43), and the smallest in population of Presidente Figueiredo: PE3 (H = 0.13) and MA3 (H = 0.15). All genotypes showed similar frequencies in the population (E5 = 1.0). Genotypic diversity (G0) ranged from 0.7 to 2.2, and in general was low in all populations, thus proving the absence of recombination. Random association tests detected high levels of linkage disequilibrium, eliminating the null hypothesis (IA> 0), being significant at 1% probability, the highest rates were found in MA1 populations (IA= 6.08) and MA2 (IA= 5:24). Bayesian analysis detected four genetic groups with mixture of genotypes in groups 2 and 3, suggesting gene flow and structure in a host in group 1 (papaya) and 4 (tomato). The population is structured with great distinction between them. MA3 and TO1 populations had higher (θ = 0.27), and the lowest value was found in TO3; TO2 and PE3, PE2 (θ= 0.05). Analysis of AMOVA, the biggest change is occurring within populations (84.3%), while 15.70% is occurring among populations. / O fungo ascomyceto Corynespora cassiicola é um fitopatógeno de ampla distribuição mundial, e já foi relatado causando doenças em folhas, frutos, ramos, ovos de nematóide, e inclusive na pele humana. No Brasil, C. cassiicola já causou sérios danos à soja, mamão e acerola, e na região norte do país, este patógeno tem grande importância nas culturas do mamão, pepino e tomate. Desenvolver estratégias de controle para uma doença, depende, entre outros fatores, de uma compreensão acerca da variabilidade e da estrutura genética de população do patógeno, sendo esses os objetivos desse trabalho. Foram coletados 169 isolados obtidos de mamão, tomate e pepino, oriundos dos municípios de Manaus, Iranduba e Presidente Figueiredo, do estado do Amazonas, Brasil, totalizando 9 populações. A diversidade genética de C. cassiicola foi analisada com 8 primers ISSR, obtendo 191 locus polimórficos, e o percentual de polimorfismo foi 100%. A diversidade gênica foi alta em todas as populações, onde o maior índice de diversidade gênica foi encontrado na população MA2 (H=0,43), e os menores em populações do município de Presidente Figueiredo: PE3 (H=0,13) e MA3 (H=0,15). Todos os genótipos tiveram frequências idênticas na população (E5= 1,0). Diversidade genotípica (G0) variou de 0.7 a 2.2, e em geral foi baixa em todas as populações, provando assim ausência de recombinação nas populações. Os testes de associação aleatória detectaram altos níveis de desequilíbrio de ligação, dispensando a hipótese nula (IA>0), sendo significativo a 1% de probabilidade, os índices mais altos foram encontrados nas populações MA1 (IA= 6.08) e MA2 (IA=5.24). Pela análise bayesiana detectou-se 4 grupos genéticos com mistura de genótipos nos grupos 2 e 3, sugerindo fluxo gênico e com estruturação por hospedeiro no grupo 1(mamão) e 4(tomate). A população está estruturada, com grande diferenciação entre elas. Populações MA3 e TO1 apresentaram maior valor (θ= 0,27), e o menor valor de foi encontrado em TO3;TO2 e PE3;PE2 (θ=0,05). A análise da AMOVA mostrou que a maior variação esta ocorrendo dentro das populações (84,3%), enquanto que 15.70% esta ocorrendo entre as populações.
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Dinâmica de população de Tapirira guianensis AUBL. (Anacardiaceae), em áreas de restinga e cerradão do Estado de São Paulo

Baldoni, Raquel Negrão 03 March 2010 (has links)
Made available in DSpace on 2016-06-02T19:31:50Z (GMT). No. of bitstreams: 1 3006.pdf: 1341440 bytes, checksum: fae98217cd72e30df97045d459945022 (MD5) Previous issue date: 2010-03-03 / Universidade Federal de Minas Gerais / The situation of a population can only be assessed through demographic studies, considering its dynamics in terms of changes on fecundity, recruitment and mortality of individuals. Considering the peculiarities of the vegetation in State of Sao Paulo and the ability that some plant species have to occupy some of these different ecosystems, this study aims to assess the ecology of two populations of Tapirira guianensis Aubl. (Anacardiaceae), in the restinga located at the Parque Estadual da Ilha do Cardoso and in the cerrado at the Estação Ecológica de Assis. This project was carried out within the permanent plots of the project funded by Biota. There, were randomly allocated 50 plots of 20m x 20m (total area of 2 ha/environment) and all individuals of Tapirira guianensis found within these plots were identified and measured. Individuals were classified into ontogenetic stages in accordance with the Troll´s Model. We found allometric differences between the populations that might be related to the phenotypic plasticity to environmental variations. The population structure of T. guianensis was significantly different between restinga and cerrado (t-test, p <0.001). In the restinga, the structure shows the form of "j" reverse while in the cerrado, the population does not present this form of distribution. The difference between the populations is mainly due to the absence of seedlings in the cerrado. We found no differences between plant density and soil types, which suggest that T. guianensis is indifferent to soil caracteristics. The population growth rate indicated that both populations from restinga (&#955; = 0.96) and from cerrado (&#955; = 0.91) are close to 1.0, so these two populations seems to be in equilíbrium. However, we verified differences on demographic parameters between these populations. We suggest that variation between populations is related to phytogeographic conditions in restinga and cerrado, and to the interaction between various environmental factors. / A ecologia de uma população pode ser avaliada substancialmente por meio de um estudo demográfico, principalmente quando são realizados estudos da sua dinâmica, incluindo o acompanhamento da fecundidade dos indivíduos, recrutamento e taxa de mortalidade. Diante da peculiaridade das formações vegetais no Estado de São Paulo e do interessante ponto de vista de distribuição de ochloespecies, este trabalho tem o objetivo de avaliar a ecologia de duas populações de Tapirira guianensis Aubl. (Anacardiaceae), uma ocorrente em área de restinga, no Parque Estadual da Ilha do Cardoso e outra em área de cerradão, na Estação Ecológica de Assis. Este projeto foi desenvolvido dentro das parcelas do projeto temático Parcelas Permanentes - BIOTA/FAPESP. Foram sorteadas 50 parcelas de 20m x 20m (totalizando uma área de 2 ha/ambiente), dentro das quais todos os indivíduos foram individualizados e medidos trimestralmente. Estabelecemos a estrutura da população por estádios ontogenéticos de acordo com o Modelo de Troll. Encontramos diferenças nas relações alométricas das populações, relacionadas com plasticidade fenotípica nos diferentes ambientes. Encontramos diferenças para a estrutura de população de T. guianensis na restinga e cerradão (t-test, p<0.001). A população de T. guianensis da restinga apresenta forma de j invertido , diferentemente da população de cerradão, que não apresenta esta distribuição na forma de j invertido . A diferença entre as populações está principalmente na ausência de plântulas no cerradão. A taxa de crescimento populacional indicou que tanto as populações da restinga (&#955; = 0.96) quanto as do cerradão (&#955; =0.91) apresentam valores próximos de 1, portanto, estando as duas populações em estase. A dinâmica das populações de T. guianensis apresenta diferenças na restinga e cerradão estudados. Embora as taxas de crescimento populacionais sejam similares para as duas populações, as estratégias de crescimento são diferentes nos dois ambientes. Enquanto a população de T. guianensis que ocorre na restinga prioriza a sobrevivência, a população de T. guianensis no cerradão investe mais em crescimento. Portanto, podemos reconhecer diferenças nos parâmetros demográficos que compõem a dinâmica das populações de T. guianensis em diferentes ambientes. Este resultado, assim, pode demostrar a ocorrencia de plasticidade fenotipica em nível populacional para esta espécie, á partir do uso de estratégias diferenciadas de crescimento em ambientes diferentes de forma a alcançar estabilidade.

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