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Relação entre a dieta e o polimorfismo rs9939609 do gene FTO e a interação entre os marcadores bioquímicos e nutricionaisBitello, Adriana Regina 13 March 2014 (has links)
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2014AdrianaReginaBitello.pdf: 740341 bytes, checksum: 3038e78bbc36511e66c5eab91ca5e5f3 (MD5) / Introdução: O aumento da obesidade mundial é motivo de preocupação, sendo considerado fator de risco para o desenvolvimento de diversas doenças crônicas: como obesidade, diabetes mellitus tipo 2, a hipertensão, a hipercolesterolemia e doenças cardiovasculares. A ciência da nutrigenética vem sendo estudada com o intuito de desvendar a forma com que os fatores ambientais, principalmente a dieta se relacionam com os fatores genéticos, influenciando no aparecimento destas patologias. Objetivo: Esta dissertação teve como objetivo investigar a relação entre o consumo alimentar e o polimorfismo rs9939609 no gene Fat Mass and Obesity Associated (FTO). O gene FTO está relacionado com massa gorda e aumento do índice de massa corporal sobre parâmetros bioquímicos e antropométricos. Metodologia: Participaram da pesquisa 346 indivíduos, de ambos os gêneros, frequentadores do ambulatório de nutrição do Universidade do Vale do Taquari Univates-RS-Brasil. Dados do perfil antropométrico (peso, altura, medidas de circunferências e percentual de gordura corporal) e de consumo alimentar (carboidratos, proteínas, gorduras, fibras, colesterol e micronutrientes) dos indivíduos foram coletados por profissionais treinados no ambulatório de Nutrição. As variáveis do consumo alimentar foram obtidas através do método de recordatório alimentar de 24 horas, utilizando o software DietWin Professional (versão 2008). Os parâmetros bioquímicos (glicose de jejum, colesterol e triglicerídeos) foram determinados usando kits comerciais da marca Bioclin®. O Ácido desoxirribonucléico (DNA) dos participantes foi extraído pelo método de sal. O polimorfismo rs9939609 foi genotipados através da técnica de discriminação alélica Taqman (Applied Biosystems). As frequências alélicas foram estimadas por contagem direta e o Equilíbrio de Hardy-Weinberg calculado através do teste do qui-quadrado. A comparação entre o consumo alimentar de macronutrientes e micronutrientes, glicemia de jejum, perfil lipídico e parâmetros antropométricos foram realizada através de modelos lineares gerais univariados. As interações gene-nutriente foram testadas por meio de regressão linear múltipla, com modelagem backward stepwise manual. Resultados: Na população estudada o peso e índice de massa corporal (IMC) apresentaram-se limítrofes. Não foi observado diferenças significativas no consumo alimentar de macronutrientes e micronutrientes, de fibras totais e de colesterol entre os genótipos. Quando analisado glicemia, perfil lipídico, parâmetro antropométricos e gasto calóricos apenas o Colesterol HDL e Colesterol LDL (mg/dl) apresentaram significância (P=0,041 e 0,044) respectivamente em relação ao genótipo heterozigoto TA. Foram detectadas interações significativas entre o genótipo TA e o consumo alimentar elevado de carboidratos em relação ao aumento do Colesterol HDL (P=0,012), assim como a relação do consumo baixo de vitamina B12 em aumento ao percentual de gordura corporal (P=0,0003). Em relação ao genótipo AA observamos uma interação significativa quanto ao consumo baixo de proteínas e o aumento dos níveis de triglicerídeos (P=0,0182), bem como nos parâmetros antropométricos, que os indivíduos homozigotos A que consumiam doses baixas de vitamina A e gorduras, apresentavam relação cintura-quadril (RCQ) aumentada (P=0,020 e 0,0022) respectivamente. Conclusão: O alelo A, inicialmente considerado de risco para obesidade nesta população caracterizada saudável não apresentou risco quanto ao IMC elevado. A variante genética do gene FTO apresentou influencia sobre alguns parâmetros bioquímicos e antropométricos, em relação ao consumo de carboidratos e proteínas sobre o perfil lipídico e também sobre o consumo das gorduras e vitaminas sobre o percentual de gordura corporal e razão cintura-quadril. Considerando os poucos achados nesta área até o momento, ressalta-se a importância da realização de novas pesquisas, de forte impacto estatístico, para confirmar nossos achados.
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Quantitatively Assessing the Genetics of Hair Color in Addition to Identifying Regulatory Elements Impacting Body-Mass Index in the FTO GeneHopkins, Racquel 08 1900 (has links)
Indiana University-Purdue University Indianapolis (IUPUI) / Obesity is a medical condition whose rates have seen a rise in both the United States and worldwide in recent decades. Numerous studies have been done to understand obesity, and through the use of GWAS researchers have been able to find multiple genetic factors that can contribute to obesity in mammals. One proposed cause of obesity are genetic impacts on cilia formation in the CNS, which causes downstream effects on food intake and energy expenditure, causing obesity via overeating and decreased activity.
In the first half of this thesis, I describe a study, in collaboration with the Berbari Lab at IUPUI, that explored the human chromosome 16:53801550-53808600 (GRCh37/hg19), an intron of the FTO alpha-ketoglutarate Dependent Dioxygenase (FTO) gene for transcriptional regulators that impact BMI and obesity. First, using control DNA, PCR, and gel-electrophoresis, we created an assay for 44 primer sets (forward and reverse) covering the genomic region. After optimizing the assay, we then selected 111 human DNA samples across three weight groups (underweight, normal weight, and obese) to sequence using the assay. The samples were selected from subjects enrolled in the Walsh Lab FDP study. Sequencing was completed using the Illumina MiSeq System, and sequenced results were viewed using the Integrative Genomics Viewer (IGV) program. Variants that showed in the results were analyzed across and within the weight groups, and their locations were researched for previously known BMI or enhancer activity using online genome browsers Ensembl and UCSC Genome Browser.
The results of this study revealed two SNPs, rs8055197 and rs11642015, that provided the best correlation with the weight categories among the samples. These results were consistent with literature that previously linked these single-nucleotide polymorphisms (SNPs) to obesity, particularly in relation to genes that are regulated by FTO (CUX1, POMC, and IRX3/5). Both SNPs lie within areas that show high enhancer activity in neural crest cells, important cells for cilia formation. Although there were SNPs in high LD within both regions, these two SNPs were chosen due to their homologous variant locations within the mouse genome (rs8055197 - GRCm38/mm10 8:91376305; rs11642015 - GRCm38/mm10 8:91375651), which provides a means of testing this obesity correlation, with a proposed enhancer relationship through FTO, in mouse models.
In the second half of this thesis, I explored new methods for quantitatively defining natural hair color categories, and attempted to find novel SNPs impacting hair color in a GWAS using the quantitative values as phenotypes. In previous publications, the development and validation of the HIrisPlex-S Prediction Tool for hair prediction was made using categorical hair colors, which were defined and classified by individual researchers or lab personnel. Using spectrophotometer measurements and HSV color values, we used a machine-learning tool to objectively classify sample hair photos into natural hair color classes. We then used this quantitative data as the input phenotype for a GWAS, using both linear regression and linear mixed model regression, to search for new genetic associations with these objectively defined hair color classes. Lastly, we also measured correlations between these hair color phenotypes and a SNP array consisting of all currently known pigment SNPs cited in recent literature.
The results of this study showed that quantitative values can be used as a means of classifying human hair colors. Both models used in the GWAS highlighted previously known SNPs that contributed to quantitative hair color. By utilizing the linear mixed model approach which has the ability to generate more power due to the normalization of hidden population structure, there was one near genome-wide significant SNP found that is currently not linked with hair color, rs2037697 (IQUB), which showed strong associations with light brown hair (p-value = 1.83192E-07), however this would need to be confirmed with increased numbers to validate its association.
The results of the correlation analysis showed that SNPs cited as having impacts on pigmentation (eye, skin, and hair) also show strong associations with these objectively defined quantitative hair color classes and these rankings may prove very useful as the field moves towards quantitative hair color prediction.
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Investigation of the Binding of FTO to the N6-methyladenosine Modification and Evaluating the Ability of the MTR-pep1 Peptide to Inhibit its Demethylase ActivitySchmocker, Stefani P. 26 May 2020 (has links)
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Quantificação de glicose intra e extra-celular por meio de biossensores micro e nanoestruturados / Intra and extra-cellular glucose quantification by micro-nano-structured biosensorsNascimento, Raphael Aparecido Sanches 07 August 2015 (has links)
Segundo dados da Organização Mundial de Saúde, até o ano de 2030 a diabetes será a sétima enfermidade causadora de morte no mundo. A diabetes se caracteriza pela variação do nível de glicose no sangue dada ingestão de alimentos ou realização de certas tarefas. Além disso, já é sabido pela comunidade científica atual que células cancerígenas possuem metabolismo diferente quando comparadas a células normais, consumindo uma maior quantidade de açúcar devido a essa anormalidade. No presente trabalho serão apresentados, basicamente, dois tipos de biossensores que possuem grande potencial para tornarem-se monitores contínuos de glicose. Ambos os biossensores utilizam a enzima glicose oxidase como catalisador específico da reação de oxidação do carboidrato. O primeiro apresenta estrutura em escala micrométrica, tem por objetivo a quantificação de glicose em solução em ambiente extracelular e se baseia no sistema EGFET (Extended Gate Field Effect Transistor) com substrato de Fluorine Tin Oxide (FTO). Além do mais, foram utilizados dois protocolos de imobilização da glicose oxidase: quitosana (com uma janela de detecção de 1 a 5mM de glicose) e glutaraldeído (com janela de detecção de 0 a 15 mM de glicose). O segundo apresenta estrutura em escala nanométrica, tem por objetivo a quantificação de glicose em ambiente intracelular e baseia-se no sistema de nanopipetas de quartzo. Com esse dispositivo foi possível estipular a concentração de glicose livre dentro de três linhas de células distintas: Fibroblastos humanos entre 0 e 2.8mM; MCF-7 maior que 4.7 mM; MDA-MB-231entre 3.6 e 4.5 mM. / According to the World Health Organization, until 2030 diabetes will be the 7th cause of death worldwide. This disease is characterized by variation on blood glucose levels due to ingestion of specific food and tasks performing. Moreover, it is already known that cancer cells have a different metabolism when compared to normal cells and these abnormal cells have a higher sugar intake due to this abnormality. This work will present, basically, two types of biosensors with great potential to become continuous glucose monitors. Both biosensors use the enzyme glucose oxidase as carbohydrate oxidation catalyzer. The first one presents a micro-metric structure and its goal is to quantify glucose concentration in an extracellular solution. This device is based in EGFET (Extended Gate Field Effect Transistor) system and uses FTO as substrate. Furthermore, two immobilization protocols were used to fix the enzyme to the FTO: chitosan (with final range of 1~5mM of glucose) and glutaraldehyde (with final range of 0~15mM of glucose). The second is a nano-structured biosensor based on nanopipette system and its goal is to quantify intracellular glucose concentration. With this device was possible to stipulate free glucose molecules inside different cell lines: between 0 and 2.8mM for human Fibroblasts; greater than 4.7 mM for MCF-7; and between 3.6 and 4.5 mM for MDA-MB-231.
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Análise dos procedimentos de medida de dispositivos EGFET utilizando filmes de FTO / Analysis of measurement procedures of EGFET devices using FTO filmsNascimento, Raphael Aparecido Sanches 26 November 2010 (has links)
Ao longo dos anos a medicina vem se desenvolvendo rapidamente e junto com ela desenvolvem-se os métodos e processos de diagnósticos. Estes métodos ficam mais rápidos, precisos e cada vez menos invasivos graças ao desenvolvimento de dispositivos diagnósticos a cada dia menores e que produzam respostas confiáveis. Os biossensores são, sem dúvida, os grandes responsáveis pela miniaturização, barateamento e rapidez de diversos métodos diagnósticos e procedimentos clínicos utilizados diariamente. Dentre os diferentes tipos de biossensores existentes, destacamos os biossensores embasados em transistores de efeito de campo (FETs), mais precisamente os biossensores a base de transistor de efeito de campo de porta estendida (EGFET). Analisamos nesse trabalho os procedimentos de medida utilizando filmes finos de óxido de estanho dopados com flúor (FTO) como membrana sensível a íons H+ acoplados à porta de um EGFET, que podem servir de base para a construção de um biossensor no futuro. Já existem artigos na literatura atual que fazem uso de FTO como membrana sensível a íons H+ e OH-. Entretanto, nenhum dos artigos disponíveis faz um bom controle de alguns parâmetros, em alguns casos relativamente simples, ou se fazem não deixam claro de que maneira estão controlando esses parâmetros. Tais parâmetros são de fundamental importância na resposta final dos sensores uma vez que eles interferem significativamente no sinal dos mesmos. Mostramos no presente trabalho que parâmetros como a luz, a sequência em que os pHs são medidos pela amostra, o procedimento de limpeza das amostras e até as características morfológicas das amostras são importantes no processo de adsorção e retirada de íons da superfície da membrana. Mostramos também que cada amostra necessita uma rotina diferente quanto à sequência de medidas e até mesmo procedimentos de limpeza para que seu rendimento seja máximo, e como diferentes amostras evoluem ao longo do tempo. Como solução aos problemas citados, descrevemos o uso correto de duas amostras que apresentaram reprodutibilidade em seus dados e invariância entre os resultados coletados por diferentes sequências de medidas. Por fim, deixamos uma proposta sobre a dinâmica que ocorre durante os processos de adsorção e retirada de íons H+ e OH- na superfície dos filmes. Com base em nossa proposta fizemos cálculos teóricos estimados da quantidade de cargas que são adsorvidas na superfície do filme para as diferentes situações encontradas durante os experimentos. / Over the years the medicine has been developing rapidly and along with it develop methods and diagnostic procedures. These methods become faster, more accurate and less invasive thanks to the development of diagnostic devices each day minors and producing reliable answers. The biosensors are undoubtedly the major responsible for miniaturization, cheaper and rapidity of various diagnostic methods and clinical procedures used every day. Among the different types of existing biosensors, we highlight the biosensors grounded in field effect transistors (FETs), more precisely the biosensor based in extended gate field effect transistor (EGFET). We analyzed on this work measurement procedures using tin oxide thin films doped with fluorine (or fluorine tin oxide FTO) as sensitive the membrane to H+ ions bounded to the gate of an EGFET, which can serve as a basis for building a biosensor in the future. Articles has already been written reporting the use of the FTO as sensitive membrane to ion H+ and OH-. However, none article available makes a good control of some parameters, in some cases relatively simple, or if they do not make it clear the way they are controlling these parameters. These parameters are of crucial importance in the final response of the sensors since they interfere significantly in signal of the sensors. So, we shown in this work, which parameters as light, the sequence in which the pHs are measured by the sample, the cleaning procedure of samples and even the morphological characteristics of the samples are important in the process of adsorption and ion withdrawal of membrane surface. We shown also that each sample requires a different routine on the following measures and even cleaning procedures for your maximum income is, and how different samples evolve over time. As a solution to the problems cited, we describe the correct use of two samples that showed reproducibility in your data and invariance between the results collected by different sequences of measures. Finally, we leave a proposal on the dynamics that occurs during adsorption processes and withdrawal ion H+ and OH- on the surface of the films. Based on our proposal did theoretical calculations estimated quantity of loads that are adsorb on the surface of the film for the different situations encountered during experiments.
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Análise do comportamento de sensores EGFET como função do tempo, iluminação, área da superfície e temperatura / Analysis of the behavior of EGFET sensor as a function of time, illumination, surface área and temperature.Fernandes, Jessica Colnaghi 03 October 2011 (has links)
O transistor de efeito de campo de porta estendida (EGFET) é um dispositivo composto por uma membrana sensível a íons e um MOSFET comercial, que pode ser aplicado para a medição do teor de íons em uma solução. O filme fino de óxido de estanho dopado com flúor (FTO) foi utilizado como a membrana seletiva do EGFET, e todo o sistema foi utilizado como sensor de pH. Os sensores de pH desenvolvidos a partir de transistores de efeito de campo (FETs) detectam o campo elétrico criado pelos íons da solução. A alteração do pH no organismo afeta a estrutura e a atividade das macromoléculas biológicas, por isso a detecção da alteração do pH no organismo é de grande importância. O objetivo deste trabalho foi o estudo da influência de alguns agentes externos sobre o FTO para ser utilizado como membrana sensível a íons do EGFET como sensor de pH. O sensor padrão apresentou uma resposta linear no escuro por volta de 37 mV/pH, para uma área de membrana de 230 mm2 . Foram estudados o efeito da evolução da medida no tempo, o efeito da iluminação, o efeito da alteração da área de contato do filme fino de FTO com a solução de pH e o efeito da alteração da temperatura da solução de pH. Para as medições feitas no escuro a dependência do tempo foi diferente das medições feitas na presença de luz UV-VIS. Para pHs ácidos a presença da luz faz com que o valor da corrente Ids diminua em relação a mesma medição no escuro enquanto que para pHs básicos, o valor da corrente aumenta. A sensibilidade na presença da luz altera em torno de 10%. Para o estudo do efeito da área foram utilizadas duas formas diferentes de medições, sendo a primeira forma utilizando diferentes áreas da mesma amostra e a segunda forma utilizando áreas diferentes para diferentes amostras. O aumento da temperatura da solução aumenta o valor da corrente do sensor em até 5% e aumenta a sensibilidade em 60%. / The extended gate field effect transistor (EGFET) is a device composed of a conventional ion sensitive electrode and a commercial MOSFET device, which can be applied for the measurement of ion content in a solution. The fluorine-doped tin oxide thin film (FTO) is used as a sensitive membrane of the EGFET, and the whole system was used as a pH sensor. The pH sensor developed from field effect transistors (FTO) detect the electric field created by the ions of the solution. Changing the pH in the body affects the structure and activity of biological macromolecules, and the detection of pH change in the body is of great importance. The aim of this paper was study the influence of some external agents in the FTO for used as ion sensitive membrane EGFET as pH sensor. The standard sensor presented a linear response in the dark about 37 mV/pH, for a membrane area of 230 mm2 . Was studied the effect of the evolution of the measure in time, the illumination effect, the effect of changing the contact area of the FTO thin film with the solution pH and the effect of changing the temperature of the pH solution. For measurements in the dark the time dependence is different than for the case under UV-VIS illumination. For acids solutions the light presence causes a current value decreases over the same measurement in the dark, whereas for basic solution the current values increases. The sensitivity in light presence changes around 10%. To study the area effect two different studies was applied. The first measure was using different areas of the same sample and the second measure was using different areas of different samples. Increasing the solution temperature the current value of the sensor also increases and the sensitivity increase about 60%.
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Relação da expressão do hsa-mir-150 e do gene FTO com sobrepeso/obesidade, perfil lipídico e glicemia / Relationship between the hsa-mir-150 and FTO gene expression with overweight/obesity, lipid profile and glycemiaMoraes, Vitor Nolasco de 14 December 2018 (has links)
Introdução: O número de indivíduos com sobrepeso e obesidade está aumentando, e a busca por entender mecanismo relacionados a esta doença se mostram cada vez mais importantes. O gene FTO foi o primeiro gene associado à obesidade, mas não se sabe muito a respeito de como é regulado e suas vias. MiRs são pequenos RNAs regulatórios que podem estar associados à obesidade, como também na regulação do gene FTO. Dessa forma, pretendemos identificar a relação do gene FTO e do hsamir-150 com sobrepeso/obesidade, perfil lipídico e glicemia de jejum. Métodos: Homens e mulheres (18 anos ou mais), com IMC > 25 kg/m2 participaram do presente estudo e foram analisadas a expressão do gene FTO, expressão do mir-150, parâmetros bioquímicos do sangue e antropometria. Resultados: Observamos a expressão do gene FTO estar relacionada à obesidade, LDL e glicemia de jejum. Conclusão: O gene FTO parece de fato estar relacionado à obesidade, LDL e glicemia de jejum, diferentemente do mir-150 / Introduction: The overweight population is growing in the entire world, and the search for obesity-associated mechanisms is important for a better understanding of this disease. The FTO gene was the first obesity associated gene. Otherwise, its pathways and how it can be regulated remain unknown. MiRs are small no coding RNAs that may be associated to obesity and FTO gene regulation. Thus, the aim of this study was to verify the relationship among the FTO gene and the mir-150 expression with overweight/obesity lipid profile and fast blood glucose. Methods: Men and woman (18 years older or above), with body mass index > 25 Kg/m2, were enrolled in the present work and the FTO gene and mir-150 expression, biochemical parameters of blood and anthropometric measure were analyzed. Results: The results highlight that the FTO gene expression is associated to obesity, LDL and fasting blood glucose. Conclusion: Indeed, the FTO gene seems to be related to obesity, LDL and blood fasting glucose, differently of the mir-150
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Biossensor de ureia utilizando dispositivo pH-EGFET / Urea biosensor based on pH-EGFET technology.Silva, Guilherme de Oliveira 29 July 2013 (has links)
Sensores são dispositivos capazes de captar um determinado sinal físico -químico do meio e converte-lo num sinal elétrico mensurável por meio de um transdutor. Biossensor é um sensor que tem como parte funcional um receptor biológico específico a determinado analito alvo. Os sinais físico-químicos experimentados por estes dispositivos são convertidos em sinais elétricos de magnitude proporcional à concentração de um ou mais compostos químicos. Neste trabalho, foi construído um sensor de pH utilizando filmes finos comerciais de óxido de estanho dopado com flúor (FTO) como receptor a íons. O sensor foi feito ligando-se amostras de FTO ao terminal de porta de um transistor de efeito de campo do tipo MOS (Metal Oxide Semiconductor). Quando colocado em solução, os íons presentes interagem com a amostra sendo adsorvidos na superfície do filme de FTO. O potencial gerado pelos íons adsorvidos modulam a tensão na porta do transistor e, desta maneira, pode -se determinar a concentração dos íons presentes na solução de acordo com a magnitude da resposta do transistor. A este tipo de dispositivo dá -se o nome de EGFET (Extended Gate Field Effect Transistor). O EGFET construído apresentou responsividade de 55 mV/pH e resposta linear em soluções de pH 2 ao 12. Através de técnicas de imobilização enzimática foi possível ligar covalentemente proteínas urease sobre a superfície dos filmes de FTO, convertendo o sensor de pH em biossensor de ureia. Soluções tampão com diferentes pHs e concentrações foram testadas e determinou -se que as condições ideais para o uso deste biossensor de ureia são soluções tampão com pH = 6 e concentração de 10mM. Nessas condições, o biossensor apresentou uma responsividade de 114,5 mV/p(ureia) e linearidade no intervalo de concentrações de ureia entre 3,2.10 -4 e 3,2.10 -2 mol/L. / Sensors are devices capable of capturing a certain physical-chemical signal from environment and convert it into a measurable electrical signal by a transducer. Biosensor is a sensor which has a biological sensing element as receptor specific to a particular target analyte. The physical-chemical signals experienced by these devices are converted into electrical signals with magnitude proportional to the concentration of one or more chemical compounds. In this work, we built a pH-sensor using commercial thin films of tin oxide doped with fluorine (FTO) as ions receptor. The sensor was made by linking FTO samples to the gate of a field effect transistor MOS type. In solution, the ions interact with the sample being adsorbed on the surface of FTO film. The potential generated by the ions adsorbed on film\'s surface modulate the gate voltage of the transistor and, in this way, we can determine the concentration of ions present in solution correlated with the magnitude of the transistor response. This kind of device is given the name of EGFET (Extended Gate Field Effect Transistor). The EGFET built exhibits sensitivity of 55 mV/pH and linear response in the range of pH 2 to 12. Through enzyme immobilization techniques we could covalently bind urease proteins on the surface of FTO film, changing the pH-sensor in urea biosensor. Buffer solutions with differents pHs and concentrations were tested and was determined that optimal environment conditions for this urea biosensor is buffer solutions with pH = 6 and 10mM of concentration. Under these conditions, the biosensor showed sensitivity of 114.5 mV/p(urea) and linear response in the range of 3,2.10 -4 to 3,2.10 -2 mol/L
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Molekulare Evolution der metabolisch relevanten Gene MTNR1B (Melatoninrezeptor 1B) und FTO (Fat Mass and Obesity Associated)Dietrich, Kerstin 07 February 2013 (has links) (PDF)
Die hier vorliegende Arbeit zeigt die molekulare Evolution des Melatoninrezeptor 1 B-Gens (MTNR1B) und des Fat Mass and Obesity Associated-Gens (FTO). Für beide Gene wurden in genomweiten Assoziationsstudien (GWAS) Varianten entdeckt, welche zu der Entwicklung einer Adipositas bzw. deren Folgeerkrankungen beitragen können. So wurde für Einzelbasenaustausche (SNPs) im MTNR1B (rs10830963, rs4753426) eine Verschlechterung der Nüchternglukose sowie der Insulinausschüttung gezeigt. Zudem wurde für die Allelfrequenz des rs4753426 C-Allels ein Zusammenhang mit der täglichen Sonnenscheindauer beschrieben. Im FTO wurde eine (tagging) Variante im ersten Intron identifiziert (rs9939609), welche einen erhöhten Körpermasseindex (BMI) zu vermitteln scheint und robust repliziert werden konnte. Zusätzlich konnte in den Sorben, einer in der Lausitz ansässigen Volksgruppe, eine Variante im dritten Intron (rs17818902) beschrieben werden, die ein zusätzliches, stärkeres Assoziationssignal mit einem erhöhten BMI zeigte.
Dies führte zu der Fragestellung, ob MTNR1B und FTO einer Konservierung unterlegen sind. Zudem interessierten populationsspezifische Unterschiede, um die Untersuchungen in den Kontext der Hypothese des sparsamen Genotyps stellen zu können. Demnach haben Individuen mit einer genetischen Veranlagung, die ihnen eine effizientere Energiespeicherung ermöglicht, zu Zeiten von Nahrungsmangel einen Fitness-Vorteil gegenüber Nicht-Trägern. Die Konservierung zwischen den Spezies wurde mit Phylogenetic Analysis by Maximum Likelihood (PAML) betrachtet, eine Analyse die auf dem Verhältnis von nichtsynonymen zu synonymen Basenaustauschen innerhalb einer kodierenden Sequenz beruht. Die Selektion innerhalb bzw. zwischen menschlichen Populationen wurde anhand verschiedener populationsgenetischer Variablen näher beleuchtet.
Sowohl für MTNR1B als auch für FTO konnte gezeigt werden, dass sie über die betrachteten Spezies im Durchschnitt stark oder sehr stark konserviert sind, was die physiologische Relevanz dieser Gene untermauert. Für MTNR1B zeigte sich zudem, dass es auf dem Ast zum Menschen nicht konserviert, sondern positiv selektioniert ist. Dies kann als Anzeichen für durch die Umwelt bedingte Einflüsse gedeutet werden. Essentielle Residuen des Rezeptors sind jedoch auch hier hochgradig konserviert. Die populationsgenetischen Variablen implizieren bei beiden Genen eine nicht-neutrale Selektion. Während sich beim MTNR1B insbesondere populationsspezifische Unterschiede anhand des Fixierungsindex Fst zeigten, konnten für FTO marginal signifikante Korrelationen zwischen der Konservierung der Haplotypen und der Stärke der Assoziation mit BMI in den Sorben gezeigt werden. Für beide Gene kann die Hypothese des sparsamen Genotyps nicht prinzipiell ausgeschlossen werden, allerdings sind weitere Untersuchungen diesbezüglich von Nöten.
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Análise do comportamento de sensores EGFET como função do tempo, iluminação, área da superfície e temperatura / Analysis of the behavior of EGFET sensor as a function of time, illumination, surface área and temperature.Jessica Colnaghi Fernandes 03 October 2011 (has links)
O transistor de efeito de campo de porta estendida (EGFET) é um dispositivo composto por uma membrana sensível a íons e um MOSFET comercial, que pode ser aplicado para a medição do teor de íons em uma solução. O filme fino de óxido de estanho dopado com flúor (FTO) foi utilizado como a membrana seletiva do EGFET, e todo o sistema foi utilizado como sensor de pH. Os sensores de pH desenvolvidos a partir de transistores de efeito de campo (FETs) detectam o campo elétrico criado pelos íons da solução. A alteração do pH no organismo afeta a estrutura e a atividade das macromoléculas biológicas, por isso a detecção da alteração do pH no organismo é de grande importância. O objetivo deste trabalho foi o estudo da influência de alguns agentes externos sobre o FTO para ser utilizado como membrana sensível a íons do EGFET como sensor de pH. O sensor padrão apresentou uma resposta linear no escuro por volta de 37 mV/pH, para uma área de membrana de 230 mm2 . Foram estudados o efeito da evolução da medida no tempo, o efeito da iluminação, o efeito da alteração da área de contato do filme fino de FTO com a solução de pH e o efeito da alteração da temperatura da solução de pH. Para as medições feitas no escuro a dependência do tempo foi diferente das medições feitas na presença de luz UV-VIS. Para pHs ácidos a presença da luz faz com que o valor da corrente Ids diminua em relação a mesma medição no escuro enquanto que para pHs básicos, o valor da corrente aumenta. A sensibilidade na presença da luz altera em torno de 10%. Para o estudo do efeito da área foram utilizadas duas formas diferentes de medições, sendo a primeira forma utilizando diferentes áreas da mesma amostra e a segunda forma utilizando áreas diferentes para diferentes amostras. O aumento da temperatura da solução aumenta o valor da corrente do sensor em até 5% e aumenta a sensibilidade em 60%. / The extended gate field effect transistor (EGFET) is a device composed of a conventional ion sensitive electrode and a commercial MOSFET device, which can be applied for the measurement of ion content in a solution. The fluorine-doped tin oxide thin film (FTO) is used as a sensitive membrane of the EGFET, and the whole system was used as a pH sensor. The pH sensor developed from field effect transistors (FTO) detect the electric field created by the ions of the solution. Changing the pH in the body affects the structure and activity of biological macromolecules, and the detection of pH change in the body is of great importance. The aim of this paper was study the influence of some external agents in the FTO for used as ion sensitive membrane EGFET as pH sensor. The standard sensor presented a linear response in the dark about 37 mV/pH, for a membrane area of 230 mm2 . Was studied the effect of the evolution of the measure in time, the illumination effect, the effect of changing the contact area of the FTO thin film with the solution pH and the effect of changing the temperature of the pH solution. For measurements in the dark the time dependence is different than for the case under UV-VIS illumination. For acids solutions the light presence causes a current value decreases over the same measurement in the dark, whereas for basic solution the current values increases. The sensitivity in light presence changes around 10%. To study the area effect two different studies was applied. The first measure was using different areas of the same sample and the second measure was using different areas of different samples. Increasing the solution temperature the current value of the sensor also increases and the sensitivity increase about 60%.
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