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Identificação e caracterização de genes expressos em resposta ao estresse por baixa temperatura em cana-de-açucarNogueira, Fabio Tebaldi Silveira 17 August 2004 (has links)
Orientador : Paulo Arruda / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-04T00:25:29Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 2004 / Resumo: Estresses ambientais representam um dos principais fatores limitantes para a produtividade agrícola. Sendo assim, fazem-se importantes estudos que têm por objetivo
analisar ao nível molecular os efeitos causados por esses estresses. Neste trabalho, analisamos o perfil de expressão gênica em plântulas de cana-de-açúcar submetidas a baixas
temperaturas. Inicialmente, membranas de alta densidade (DNA macroarrays) contendo 1536 ESTs (Etiquetas de Seqüências Expressas) do projeto SUCEST (Sugarcane EST Project) foram hibridadas com sondas de cDNAs obtidas a partir de RNA total de tecido foliar de plântulas de cana-de-açúcar crescidas in vitro e submetidas a 4 oC por 3, 6, 12, 24 e 48 h. Como controle, foram utilizadas plântulas in vitro crescidas a 26 oC. O experimento foi repetido duas vezes, utilizando-se RNA total de novas plântulas tratadas e controle. Somente ESTs que apresentaram padrão de indução ou repressão semelhantes nos dois experimentos foram considerados para posterior análise. Desta forma, os resultados permitiram a identificação de 59 ESTs que foram induzidos ou reprimidos pelo estresse abiótico, dentre os quais alguns ESTs sem homólogos no GenBank. Alguns genes selecionados tiveram seu perfil de expressão confirmado por RNA-blot. Utilizando o banco de dados do SUCEST e seqüências de proteínas oriundas do NCBI, foi gerado um banco de dados contendo 33 proteínas de cana-de-açúcar relacionadas ao frio. Dentre essas proteínas foi identificada proteína similar a PUMP (Plant Uncoupling Mitochondrial Protein), a qual está envolvida em mecanismos de redução da produção de espécies reativas de oxigênio durante estresses abióticos. Posteriormente, quatro outras proteínas pertencentes à família PUMP foram identificadas no banco de dados do SUCEST, além de quatro proteínas pertencentes à família AOx (alternative oxidase). Análises filogenéticas corroboraram a hipótese da existência de novos membros de ambas as famílias de proteínas em cana-de-açúcar (Saccharum sp. PUMPs e AOxs, ou seja, SsPUMPs e SsAOxs, respectivamente) e em Arabidopsis (AtPUMPs e AtAOxs). Análise do perfil de expressão desses genes sugere que PUMPs e AOxs são expressos em órgãos diferentes em cana-de-açúcar e em Arabidopsis. Adicionalmente, resultados de RNA-blot sugeriram que dois membros da família de PUMPs (SsPUMP4 e SsPUMP5) e um membro da família AOx (SsAOx1c) foram induzidos por baixa temperatura (4 oC), enquanto que, em Arabidopsis, dois membros da família PUMP (AtPUMP4 e AtPUMP5) e um membro da família AOx (AtAOx1a) foram também induzidos pelo estresse abiótico, entretanto, com perfis diferentes. Interessantemente, o gene AtAOx1d foi reprimido após exposição das plantas a baixas temperaturas. Análises in silico demonstraram a existência de 26 membros da superfamília de proteínas NAC em cana-de-açúcar, incluindo um gene identificado em estudos de expressão gênica, denominado SsNAC23 (Saccharum sp. NAC23). Este gene foi completamente seqüenciado e posteriormente analisado. Resultados de RNA-blot sugerem que o gene SsNAC23 é regulado por baixa temperatura (4 oC), mas não por 12 °C, além de herbivoria (Diatraea saccharalis) e estresse hídrico (Polietilenoglicol, PEG 6000, 20%). Ensaios de localização subcelular demonstraram que a proteína SsNAC23 localizou-se preferencialmente no núcleo de células epidérmicas de cebola (Allium cepa). A construção de um modelo molecular do domínio NAC da proteína SsNAC23 permitiu a análise de determinantes estruturais possivelmente envolvidos em ligação a DNA, sugerindo seu papel como fator de transcrição. Alinhamento desses determinantes de outras proteínas contendo domínio NAC revelou alta conservação de importantes aminoácidos envolvidos no contato entre proteína e molécula de DNA. Em conjunto, nossos resultados sugerem que a proteína SsNAC23 é um fator de transcrição envolvido em mecanismos de resposta a estresses bióticos e abióticos / Abstract: Environmental stresses represent one of the main factors limiting crop productivity, being very important studies that aim to analyze, at a molecular level, the effects caused by these stresses. In the present project, we analyzed the sugarcane gene expression profiles in response to low temperature. Initially, high-density filter arrays containing 1536 ESTs
(Expressed Sequence Tags) from SUCEST (Sugarcane EST Project) were hybridized with P33-labeled cDNA probes obtained from total RNA of sugarcane plantlets growing at 4 oC during 3, 6, 12, 24, and 48 h. As a control, plantlets growing at 26 oC were utilized. The experiment was repeated twice, being total RNA extracted from novel cold-treated and untreated plantlet sets. Only those ESTs, which presented similar expression profiles in both experiments, were taken into consideration for a further analysis. The results allowed identifying 59 ESTs that were induced or repressed by chilling stress. Selected genes had their expression profiles confirmed by RNA-blot analysis. Using SUCEST database and protein sequences from NCBI, a database containing 33 sugarcane proteins related to cold temperatures was generated. Among those proteins, we identified a PUMP (Plant Uncoupling Mitochondrial Protein) gene family member. This protein was reported to be involved in oxidative stress responses. Further, in SUCEST database, four additional proteins belonging to PUMP and four proteins belonging to AOx family (alternative oxidase) were identified. Phylogenetic analyses confirmed the existence of novel members of both protein families in sugarcane (Saccharum sp. PUMPs and AOxs: SsPUMPs and SsAOxs) and Arabidopsis (AtPUMPs and AtAOxs). Gene expression profile analyses suggested that PUMPs and AOxs are expressed in different plant organs. RNAblot results suggested that two members of sugarcane PUMP gene family (SsPUMP4 and SsPUMP5) and one member of AOx family (SsAOx1c) were induced by low temperature (4 oC). Arabidopsis PUMP4 and PUMP5 orthologs and one member of AOx family (AtAOx1a) were also induced by cold stress. Interestingly, AtAOx1d was down-regulated after plantlets were exposed In silico analyses demonstrated the existence of 26 members of sugarcane NAC domain protein family, including the cold-inducible SsNAC23 (Saccharum sp. NAC23). This gene was completely sequenced and analyzed. RNA-blot results suggested that SsNAC23 is modulated by extreme low temperatures (4 oC), but not at moderate ones (12 oC). SsNAC23 transcripts also accumulated in response to herbivory (Diatraea saccharalis) and PEG-induced water
stress. Nuclear localization essays demonstrated that SsNAC23 was targeted to nucleus of onion cells (Allium cepa). A molecular model of the NAC domain of SsNAC23 allowed analyzing the structural determinants putatively involved in DNA-binding, evidencing the SsNAC23 transcriptional activator nature. Alignment of other NAC domain proteins revealed high structural determinants conservation in different plant species. In summary, our results indicated that the SsNAC23 is a transcription factor involved in biotic and abiotic stress response / Doutorado / Genetica Vegetal e Melhoramento / Doutor em Genetica e Biologia Molecular
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Cefaleia atribuída à ingestão ou inalação de estímulo frio: um modelo experimentalOLIVEIRA, Daniella Araújo de 31 January 2009 (has links)
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Previous issue date: 2009 / A cefaleia induzida por estímulo frio (CIEF) ocorre durante a aplicação deste estímulo
a um indivíduo externamente, ou por ingestão ou inalação. A dor é descrita como de curta
duração e pode ser aguda. A maioria dos estudos mostra maior susceptibilidade de indivíduos
migranosos em desenvolvê-la, porém esses mecanismos ainda não estão bem esclarecidos.
Objetivo: Estimar a prevalência e analisar as características clínicas da CIEF e sua relação
com a migrânea. Avaliar se os critérios da IHS são suficientes para o diagnóstico da CIEF em
uma população utilizando um modelo experimental do teste do gelo.
Método: 414 voluntários foram entrevistados aleatoriamente através de um questionário autoadministrado
identificando idade, sexo e história de cefaleia. O diagnóstico de migrânea foi
feito baseado nos critérios diagnósticos da IHS. Para induzir a cefaleia por estímulo frio,
colocou-se um cubo de gelo padronizado (20x15X35 milímetros) na área do palato, por 90s.
O questionário sobre o impacto da dor de cabeça HIT foi aplicado a essa amostra.
Resultados: Dos 414 voluntários 266 (64,3%) eram mulheres e 148 homens (35,7%). A idade
variou de 8 a 84 (30,6 ± 12,4 anos). Dos indivíduos testados 153/414 (37%) apresentaram
CIEF [106/266 mulheres (39,8%) e 47/148 homens (31.8%)] p = 0,126; c². A região frontal e
temporal foi a mais atingida com predomínio bilateral e do tipo pulsátil. Dos indivíduos que
apresentaram cefaleia prévia 147/379 (38,8%) referiram dor no teste do gelo. Dos que não
tinham história de cefaleia anterior apenas 7/35 (20%) apresentaram dor no teste do gelo; p =
0,028, c². Dos portadores de cefaleia prévia 240/379 (63,3%) eram migranosos e 139/379
(36,7%) eram não migranosos. O teste do gelo foi positivo em 47,9% dos migranosos
(115/240) e em 23% dos não migranosos (32/139); p < 0,0001; c². Os migranosos
apresentaram um percentual mais elevado de sensibilidade ao gelo n = 115 (47,9%) quando
comparado com os não migranosos n = 32 (23%) e com os sem cefaleia prévia n = 7 (20%); p
< 0,0001 c². Dos migranosos 133/240 (55,4%) referiram história prévia de CIEF em relação
aos não migranosos 58/139 (41,7%); p = 0,014, c². Indivíduos com história de CIEF tem
cinco vezes maior risco de desenvolve-la; RP = 5,52 IC (3,76 8,09). Não houve diferença
estatística em relação à idade nos grupos testados (teste positivo 28,6 ± 11,8 versus teste
negativo 31,7 ± 15,7) p = 0,2008 Mann-Whitney. Indivíduos com história de cefaleia anterior
têm duas vezes mais chance de desencadear CIEF. RP=1,939 (0,988 3,807). Dos 147
entrevistados com história prévia de cefaleia que tiveram o teste do gelo positivo, 71 (48,3%)
deles relataram que a CIEF ocorreu no local habitual da cefaleia anterior. Os voluntários com
teste do gelo positivo tinham maiores escores no HIT; p = 0,0001.
Conclusão: a CIEF é predominantemente fronto-temporal bilateral e pulsátil, afetando mais
comumente os pacientes migranosos. Os critérios estabelecidos pela IHS são falhos para o
diagnóstico da CIEF
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Ondas de frio invernais em Santa Catarina e suas relações com as variabilidades climáticas de baixa frequênciaAlves, Maikon Passos Amilton January 2016 (has links)
Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Filosofia e Ciências Humanas, Programa de Pós-Graduação em Geografia, Florianópolis, 2016. / Made available in DSpace on 2016-09-20T04:28:20Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 2016 / Foi desenvolvido um estudo climatológico sobre as ondas de frio invernais em Santa Catarina, e suas possíveis relações com as variabilidades climáticas de baixa frequência como o El Niño Oscilação Sul (ENOS), a Oscilação Antártica (AAO) e a Oscilação Decadal do Pacífico (ODP). Utilizou-se como critério para classificar uma onda de frio o evento no qual a temperatura média diária do ar na superfície estava pelo menos dois desvios padrão abaixo do valor da média durante dois dias consecutivos ou mais. O desvio padrão (S) é igual ao valor médio interanual dos 365 desvios padrões diários de temperatura do ar (1º de janeiro a 31 de dezembro). Este trabalho analisa apenas as ondas de frio dos 92 dias do período de inverno (1º de junho a 31 de agosto). As variabilidades climáticas foram submetidas à análise estatística através dos testes de significância para as médias e variâncias, com um nível de significância de a = 5%. Para comparar as diferenças entre as médias utilizou-se o teste t de Student, e para a variância o teste F. Os resultados encontrados demonstram que as ondas de frio se distribuem de forma desigual nas regiões agroecológicas catarinenses, apresentando limiares de temperatura diferentes em sua caracterização. O mês de junho se destacou com as maiores ocorrências de ondas de frio e julho apresentou as ondas de frio mais extensas. As ondas de frio se correlacionam com as ocorrências de geadas durante o período invernal em Santa Catarina, exceção à estação de São José. Constatou-se que as variabilidades climáticas de baixa frequência (ENOS, OAA e ODP) possuem relação com as ocorrências das ondas de frio em (Itapiranga, Lages, Urussanga e Campos Novos), assim como na duração dos dias frios (Ituporanga) e nos episódios de geadas (Itajaí, São José, Chapecó, Ituporanga e Itapiranga) em Santa Catarina.<br> / Abstract : This thesis presents a climatological study on the winter cold waves in the state of Santa Catarina, Brazil, and their possible connection to low-frequency climate variabilities such as the El Niño Southern Oscillation (ENSO), the Antarctic Oscillation (AAO) and the Pacific Decadal Oscillation (PDO). The criterion adopted for the classification of a cold wave was an event in which the mean daily air temperature at the surface was at least two standard deviations below the mean of at least two consecutive days. The standard deviation (S) is equal to the interannual mean value of the 365 daily air temperature standard deviations in a year (from January 1st to December 31st). This work only analyzes the cold waves that took place during the 92 winter days (from June 1st to August 31st). The climate variabilities were subject to statistical analysis by means of significance tests for means and variances, with a significance level of a = 5%. In order to compare the differences between means, Student's t-test was employed; comparison between variances was carried out with the F-test. Results show that cold waves affect agroecological zones differently, with varying temperature thresholds in their characterization. The month of June was associated with the strongest cold waves, while the longest cold waves were found in July. The cold waves explain frosts during the winter period in the state of Santa Catarina, except at the São José weather station. It was determined that the low-frequency climate variabilities (ENSO, AAO and PDO) are related with occurrences of cold waves (in the cities of Itapiranga, Lages, Urussanga and Campos Novos), as well as with the duration of cold days (Ituporanga) and with frosts in (Itajaí, São José, Chapecó, Ituporanga and Itapiranga) in the state of Santa Catarina.
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Modelagem trófica do ecossistema de ressurgência de Cabo Frio, Rio de Janeiro / Trophic Modeling of upwelling ecosystem in Cabo Frio, Rio de JaneiroVera, Gabriela Rodrigues 05 November 2010 (has links)
Este trabalho teve como objetivos analisar a estrutura e funcionamento do ecossistema de Cabo Frio, levando-se em consideração a variação sazonal do fenômeno de ressurgência, através do modelo trófico Ecopath. Foram elaborados dois modelos sazonais (primavera-verão e outono-inverno) e um modelo médio anual. Os modelos sazonais apresentaram pouca diferença entre si, com exceção da biomassa dos produtores que é muito mais elevada no período de primavera-verão, quando a ressurgência é mais intensa. Essa pequena diferença pode ser explicada pela pouca variação sazonal nas dietas dos grupos do modelo e, possivelmente, pela indisponibilidade de dados de desembarque pesqueiro. O modelo anual foi considerado como representativo do sistema de Cabo Frio, cujos descritores ecológicos permitiram classificá-lo como um sistema em desenvolvimento com grau elevado de desorganização, característica comum para regiões de ressurgência. Caracterizou-se também por apresentar alta conectância e onivoria, caracterizando-o como um sistema de alta resiliência. O Nível trófico calculado pelo modelo foi semelhante ao nível trófico isotópico disponível na literatura de grupos tróficos similares confirmando a confiabilidade ao modelo gerado. / The structure and trophic functioning of the ecosystem of Cabo Frio were analyzed considering the seasonal variation of the upwelling events. Two different seasonal models (Ecopath) and an annual model were constructed. The seasonal models did not show great differences, except for a higher biomass of producers during the spring-summer period, when the upwelling is more intense. Possibly, this difference was due to the small seasonal variation in the diet among trophic groups and lack of information on fishery catch data. The annual model could be considered as representative of the system of Cabo Frio, and according to the ecological descriptors it is a developing system with a high degree of disorganization, common characteristic in upwelling regions. The trophic levels calculated by the model were similar to the isotope trophic levels available in the literature for similar trophic groups, showing the confidence of the obtained results.
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Validação de metodologia analítica para determinação de mercúrio total em amostras de urina por espectrometria de absorção atômica com geração de vapor frio (CV -AAS) / Validation of an analytical method for the determination of total mercury in urine samples using cold vapor atomic absorption spectrometry (CV-AAS)Guilhen, Sabine Neusatz 30 July 2009 (has links)
O merc´urio (Hg) ´e um metal t´oxico empregado em uma variedade de produtos e processos, representando um risco `a sa´ude dos ind´viduos expostos ocupacional ou acidentalmente a este metal. O am´algama dental ´e um material restaurador que cont ´em Hg met´alico e cujo uso tem sido bastante debatido nas ´ultimas duas d´ecadas. Em vista da dubiedade dos estudos cient´ficos acerca do am´algama dental, muitos esfor¸cos tem sido direcionados `a esta questao. Recentemente, a Funda¸cao de Medicina Tropical do Tocantins iniciou um estudo para avaliar os n´veis de exposi¸cao ambiental e ocupacional ao merc´urio no atendimento odontol´ogico de consult´orios p´ublicos da cidade de Aragua´na em Tocantins (TO). Em colabora¸cao com este estudo, as amostras de urina dos indiv´duos expostos foram analisadas quanto ao teor de merc´urio total por espectrometria de absor¸cao atomica nas dependencias do laborat´orio de an´alises qu´micas do Centro de Qu´mica e Meio Ambiente (IPEN). Para isso, foi preciso selecionar uma metodologia anal´tica capaz de gerar resultados confi´aveis e valid´a-la antes de sua efetiva implanta¸cao. A valida¸cao anal´tica comprova, por meio de ensaios pr´aticos, que o laborat´orio tem condi¸coes de atender aos requisitos necess´arios para a aplica¸cao adequada do m´etodo. O desempenho do m´etodo foi avaliado quanto aos seguintes parametros: limite de detec¸cao e limite de quantifica¸cao, seletividade, sensibilidade, linearidade, exatidao e precisao. Os ensaios foram realizados com material de referencia certificado, o que assegura a rastreabilidade dos resultados. Os resultados obtidos comprovaram a adequabilidade do m´etodo ao prop´osito supracitado. A concentra¸cao de Hg encontrada para o material de referencia foi de (95,12 ± 11,70)g.L1 com uma recupera¸cao de 97%. A metodologia tamb´em foi aplicada `a amostras de urina de 39 indiv´duos, seis das quais (15%) apresentaram n´veis de merc´urio urin´ario superiores ao limite considerado normal (10g.L1). Os resultados obtidos encontram-se em uma faixa de concentra¸cao de 1,02 a 23,36g.L1. / Mercury (Hg) is a toxic metal applied to a variety of products and processes, representing a risk to the health of occupationally or accidentally exposed subjects. Dental amalgam is a restorative material composed of metallic mercury, which use has been widely debated in the last decades. Due to the dubiety of the studies concerning dental amalgam, many efforts concerning this issue have been conducted. The Tropical Medicine Foundation (Tocantins, Brazil) has recently initiated a study to evaluate the environmental and occupational levels of exposure to mercury in dentistry attendants at public consulting rooms in the city of Aragua´na (TO). In collaboration with this study, the laboratory of analysis at IPENs Chemistry and Environment Center is undertaking the analysis of mercury levels in exposed subjects urine samples using cold vapor atomic absorption spectrometry. This analysis requires the definition of a methodology capable of generating reliable results. Such methodology can only be implemented after a rigorous validation procedure. As part of this work, a series of tests were conducted in order to confirm the suitability of the selected methodology and to assert that the laboratory addresses all requirements needed for a successful implementation of the methodology. The following parameters were considered in order to test the methods performance: detection and quantitation limits, selectivity, sensitivity, linearity, accuracy and precision. The assays were carried out with certified reference material, which assures the traceability of the results. Taking into account the estimated parameters, the method can be considered suitable for the afore mentioned purpose. The mercury concentration found for the reference material was of (95,12 ± 11,70)g.L1 with a recovery rate of 97%. The method was also applied to 39 urine samples, six of which (15%) showing urinary mercury levels above the normal limit of 10g.L1. The obtained results fall into a range of concentration from 1,02 to 23,36g.L1.
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Teste do cometa como ferramenta de controle da cadeia do frio / COMET ASSAY AS A COLD CHAIN CONTROL TOOLDuarte, Renato César 25 June 2009 (has links)
Tendo em vista um mercado cada vez mais exigente na qualidade dos alimentos, faz-se necessário o desenvolvimento de processos que atendam às expectativas do consumidor. Dentre os processos existentes, destacam-se a cadeia do frio e a irradiação. A cadeia do frio compreende todas as etapas de conservação do alimento, desde a produção, resfriamento, congelamento, armazenamento, e transporte até o consumidor final. A irradiação, como processo de conservação de alimentos, estende a vida de prateleira, inibe o brotamento e reduz a contaminação por patógenos, entre outros benefícios. É importante a identificação da degradação dos alimentos em função de falhas nos processos a que foram submetidos. O teste do cometa (DNA Comet Assay) é um método de varredura largamente estudado, considerado rápido e de baixo custo, pelo fato de identificar quebras no DNA, é possível considerar sua utilização como mais uma ferramenta no controle de falhas na cadeia do frio que podem degradar e prejudicar os alimentos. Algumas etiquetas e selos usados no controle dos processos do frio não consideram a situação anterior do alimento, indicando falhas a partir do momento em que forem colocadas em contato com o mesmo, já o teste do cometa verifica a degradação ocorrida no alimento até o momento de sua realização podendo ainda, acompanhar o aumento da degradação. / Bearing in mind an ever more demanding market regarding the quality of food, it has been necessary to develop processes that meet the demands of consumers. Within the existing processes the cold chain and irradiation stand out. The cold chain comprises all the stages of conserving food from production, cooling, freezing, storing and transportation to the final consumer. Irradiation, as a means of conserving food, prolongs the shelf life, inhibits budding and reduces pathogenic contamination among other benefits. Is very important the identification of food degradation in function of failure on the processes which they were subjected. The comet assay is a screening test widely studied, considerate fast and with low cost. By the fact of the test identify breaks on the DNA, may be possible use the comet test on the control of cold chain failures that degrade de food. The labels and stamp, do not consider the previous food situation and indicate failures from the moment where they be placed in contact with the product. With the comet assay is possible to check the degradation that has occurred in liver chicken samples until the moment of comet´s test realization
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Origem e composição da matéria orgânica sedimentar na margem continental próximo a Cabo Frio (RJ), porção sul da Bacia de Campos, costa sudeste do Brasil / Origin and composition of sedimentary organic matter in continental margin near to Cabo Frio (RJ), southern portion of the Campos Basin (SE, Coast, Brazil)Dulce Raquel Pereira Oliveira 18 March 2011 (has links)
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Lipídios como marcadores moleculares (ácidos graxos, esterois e n- alcoois) e COT foram analisados em 48 amostras de sedimento superficial (0-2 cm) em dois períodos (inverno de 2008/2009 e verão de 2009) ao longo de 12 isóbatas em 2 transectos (25 a 3000 m) na principal região de ressurgência da costa sudeste do Brasil, onde a influência do aporte fluvial é mínima. O objetivo foi (i) avaliar as fontes, transporte e regiões de acúmulo da matéria orgânica (MO) (ii) identificar a fração da MO potencialmente disponível para os orgânismos bentônicos. Este estudo faz parte do Projeto Habitats Heterogeneidade Ambiental da Bacia de Campos coordenado pelo CENPES/PETROBRAS. Lipídios derivados da produção primária (0.058 - 3.1 mg gCOT-1) e secundária (0.015 - 2.2 mg gCOT-1) representaram a maior fração da MO sedimentar, enquanto lipídios derivados de fontes alóctonas (0.043 - 0.40 mg gCOT-1) e bactérias (<0.01 - 0.43 mg gCOT-1) foram menos representativos. O padrão de transporte e acúmulo da MO no sedimento depende da associação entre fatores físicos (hidrodinâmicos) e biológicos (resposta a ressurgência), e não é influenciado sazonalmente como observado em dados prévios na mesma região. Verificou-se que regiões restritas da plataforma continental apresentam acúmulo de MO lábil e esse material é exportado para regiões do talude (400 a 1000 m de profundidade), o que representa uma fonte importante de MO biodisponível para a comunidade bentônica desta região. / Lipid biomarkers [fatty acids (FA), sterols and alcohols] and total organic carbon (TOC) were analyzed in 48 superficial (0-2 cm) sediment samples collected in two periods (winter 2008/2009 and summer/2009) in two transects ranging from 25 m to 3000 m depths and that encompass the major region of occurrence of upwelling events in the southeastern Brazilian continental margin and where the river influence is probably minimal. The objectives were (i) to evaluate the sources, transport and major areas of organic matter (OM) accumulation in the continental margin and (ii) to identify the fraction of OM that is potentially available to secondary benthic producers. This study is part of a larger project entitled "Habitats Project - Campos Basin Environmental Heterogeneity by CENPES /PETROBRAS". As expected, lipids derived from primary (0.058 - 3.1 mg gTOC-1) and secondary (0.015 - 2.2 mg gTOC-1) producers made the major fraction of the sedimentary OM, whereas lipids from allochthonous sources (0.043 - 0.40 mg gTOC-1) and from bacteria (<0.01 - 0.43 mg gTOC-1) were of less importance. The accumulation patter of OM in the sediments is highly dependent of coupling of physical (hydrodynamics) and biological (response to upwelling) properties, and when compared to previous data on the same region have no seasonal trend. It was found that while some restricted areas in the shelf may be a sink of labile OM, the export of this material to the upper and middle slope (400 to 1000 m depths) is significant, which represents an important source of bioavailable OM to the deep-sea benthic community.
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Modelagem trófica do ecossistema de ressurgência de Cabo Frio, Rio de Janeiro / Trophic Modeling of upwelling ecosystem in Cabo Frio, Rio de JaneiroGabriela Rodrigues Vera 05 November 2010 (has links)
Este trabalho teve como objetivos analisar a estrutura e funcionamento do ecossistema de Cabo Frio, levando-se em consideração a variação sazonal do fenômeno de ressurgência, através do modelo trófico Ecopath. Foram elaborados dois modelos sazonais (primavera-verão e outono-inverno) e um modelo médio anual. Os modelos sazonais apresentaram pouca diferença entre si, com exceção da biomassa dos produtores que é muito mais elevada no período de primavera-verão, quando a ressurgência é mais intensa. Essa pequena diferença pode ser explicada pela pouca variação sazonal nas dietas dos grupos do modelo e, possivelmente, pela indisponibilidade de dados de desembarque pesqueiro. O modelo anual foi considerado como representativo do sistema de Cabo Frio, cujos descritores ecológicos permitiram classificá-lo como um sistema em desenvolvimento com grau elevado de desorganização, característica comum para regiões de ressurgência. Caracterizou-se também por apresentar alta conectância e onivoria, caracterizando-o como um sistema de alta resiliência. O Nível trófico calculado pelo modelo foi semelhante ao nível trófico isotópico disponível na literatura de grupos tróficos similares confirmando a confiabilidade ao modelo gerado. / The structure and trophic functioning of the ecosystem of Cabo Frio were analyzed considering the seasonal variation of the upwelling events. Two different seasonal models (Ecopath) and an annual model were constructed. The seasonal models did not show great differences, except for a higher biomass of producers during the spring-summer period, when the upwelling is more intense. Possibly, this difference was due to the small seasonal variation in the diet among trophic groups and lack of information on fishery catch data. The annual model could be considered as representative of the system of Cabo Frio, and according to the ecological descriptors it is a developing system with a high degree of disorganization, common characteristic in upwelling regions. The trophic levels calculated by the model were similar to the isotope trophic levels available in the literature for similar trophic groups, showing the confidence of the obtained results.
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Teste do cometa como ferramenta de controle da cadeia do frio / COMET ASSAY AS A COLD CHAIN CONTROL TOOLRenato César Duarte 25 June 2009 (has links)
Tendo em vista um mercado cada vez mais exigente na qualidade dos alimentos, faz-se necessário o desenvolvimento de processos que atendam às expectativas do consumidor. Dentre os processos existentes, destacam-se a cadeia do frio e a irradiação. A cadeia do frio compreende todas as etapas de conservação do alimento, desde a produção, resfriamento, congelamento, armazenamento, e transporte até o consumidor final. A irradiação, como processo de conservação de alimentos, estende a vida de prateleira, inibe o brotamento e reduz a contaminação por patógenos, entre outros benefícios. É importante a identificação da degradação dos alimentos em função de falhas nos processos a que foram submetidos. O teste do cometa (DNA Comet Assay) é um método de varredura largamente estudado, considerado rápido e de baixo custo, pelo fato de identificar quebras no DNA, é possível considerar sua utilização como mais uma ferramenta no controle de falhas na cadeia do frio que podem degradar e prejudicar os alimentos. Algumas etiquetas e selos usados no controle dos processos do frio não consideram a situação anterior do alimento, indicando falhas a partir do momento em que forem colocadas em contato com o mesmo, já o teste do cometa verifica a degradação ocorrida no alimento até o momento de sua realização podendo ainda, acompanhar o aumento da degradação. / Bearing in mind an ever more demanding market regarding the quality of food, it has been necessary to develop processes that meet the demands of consumers. Within the existing processes the cold chain and irradiation stand out. The cold chain comprises all the stages of conserving food from production, cooling, freezing, storing and transportation to the final consumer. Irradiation, as a means of conserving food, prolongs the shelf life, inhibits budding and reduces pathogenic contamination among other benefits. Is very important the identification of food degradation in function of failure on the processes which they were subjected. The comet assay is a screening test widely studied, considerate fast and with low cost. By the fact of the test identify breaks on the DNA, may be possible use the comet test on the control of cold chain failures that degrade de food. The labels and stamp, do not consider the previous food situation and indicate failures from the moment where they be placed in contact with the product. With the comet assay is possible to check the degradation that has occurred in liver chicken samples until the moment of comet´s test realization
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Feições regionais da região emersa do Alto de Cabo Frio e sua continuação para as Bacias de Campos e Santos. / Regional features of the onshore portion of the Cabo Frio High and its continuation towards the Campos and Santos Basin.Samuel Barbosa de Souza 17 March 2006 (has links)
Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / O presente trabalho apresenta os resultados de um estudo geológico e geofísico que utilizou diversas ferramentas e métodos (particularmente dados de gravimetria, magnetometria e trabalhos de campo) na tentativa de identificar as megaestruturas existentes na região do Alto de Cabo Frio, e suas possíveis continuações para as bacias
costeiras de Campos e Santos. Procurou-se ainda com o uso das mesmas ferramentas, mas a nível de detalhe em mapeamento geológico de campo, identificar e caracterizar
estrutural e petrograficamente uma falha de direção NE-SW, concordante com as principais direções estruturais regionais. Esta falha é aqui reconhecida e nomeada como
Falha do Bico-Preto, e sugere-se que tenha sido reativada no Terciário Superior. Essa falha é paralela à Falha do Pai Vitório, uma importante falha que ocorre na região de
Búzios, e que limita a borda sul do graben de Barra de São João, que ocorre em águas rasas na plataforma continental entre Búzios e Macaé.
Neste estudo foram utilizados levantamentos agnetométricos, aeromagnéticos, gravimétricos, dados de batimetria e topografia, e imagens de satélite de toda a região do Alto de Cabo Frio, entre as Bacias de Campos e Santos. Os trabalhos de campo realizados na região entre Saquarema e Búzios, e também nas Ilhas de Cabo-Frio, fazem parte dessa integração de informações, tendo sido visitadas durante os trabalhos de
campo.
Com os resultados obtidos, pôde-se verificar que a direção NE-SW da porção emersa da região, manifesta em dados de métodos potenciais e também nas direções estruturais de diques de diabásio e falhas, formados no Cretáceo Inferior, durante a fase rift das bacias marginais. Essas estruturas apresentam uma continuidade mar adentro, tanto na direção da bacia de Campos quanto a bacia de Santos. Na região entre Ilha Grande e Cabo Frio, no entanto, essas direções são afetadas pela zona de charneira cretácea da Bacia de Santos, de proeminente direção leste-oeste, que limita tanto a
sequência sin-rift quanto a a sequência transicional evaporítica.
Grande parte das megaestruturas também puderam ser individualizadas na interpretação dos métodos geofísicos, com destaque para os altos de Badejo, baixo de
Corvina e o Graben de Barra de São João na Bacia de Campos. Na Bacia de Santos identifica-se através de métodos potenciais a expressão regional da charneira cretácea, a
quebra da plataforma continental e também os lineamentos de direção NW-SE dos diques do arco de Ponta Grossa, que afetam também a Bacia do Paraná na região emersa. / The present work presents the results of a geological and geophysical study that used several tools and methods (particularly gravimetric data, magnetic data, and field
work) in the attempt to identify the megastructures in the Cabo Frio High province, and their possible continuation towards the Campos and Santos coastal basins. The same
tools were also used, but with a more detailed approach in geological field work, aiming at identifying structurally and petrographically a NE-SW trending fault concordant with the
main regional structural directions. This fault is here recognized and named as "Falha do Bico-Preto", and we suggested that it was tectonically active during the Late Tertiary. This fault is parallel to an importang fault known as "Falha do Pai Vitório", located near Buzios, which limits the southern border of the Barra de São João Graben, and extends
towards the shallow water continental platform between Búzios and Macaé.
In this study several geophysical surveys were analyzed, including magnetic, aeromagnetic, gravity, bathymetry and topography data, which were integrated with satellite images of the Cabo Frio High and along the coastal basins between the Campos and Santos basins. The field work was conducted in the area between Saquarema and Búzios, and also in the Islands of Cabo Frio platform, which were also visited during the integration of all available information.
The results of the integration indicate that the NE-SW trend, which is the main direction of the regional structures observed in the onshore area, is clearly manifested in
the potential field methods, and also coincide with the directions of the diabase dikes and major faults that were formed in the Early Cretaceous synrift phase that affected the
marginal basins. These structures present a continuity towards the offshore area, towards the Campos and Santos basins. In the region between Ilha Grande and Cabo Frio,
however, these directions are affected by the Cretaceous hinge line of the Santos Basin, with a prominent E-W direction, which limits both the synrift sequence and the transitional evaporitic sequence.
Most of the megastructures could also be individualized in the geophysical interpretation, particularly the Badejo High, the Corvina Low, and the Barra de São João Graben in the Campos Basin. In the Santos Basin the potential field methods allowed the identification of the regional expression of the Cretaceous hinge line, the shelfbreak along the continental platform, and also the NW-SE trending lineaments associated with the dikes of the Ponta Grossa Arch, which also affect the onshore Paraná Basin.
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