Submitted by Erika Demachki (erikademachki@gmail.com) on 2015-01-30T17:44:33Z No. of bitstreams: 2 Tese - Lídia Lopes Ferreira - 2014.pdf: 1260925 bytes, checksum: 03a2aa3e9040ec4dda5594021745a719 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Approved for entry into archive by Erika Demachki (erikademachki@gmail.com) on 2015-01-30T17:44:56Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Tese - Lídia Lopes Ferreira - 2014.pdf: 1260925 bytes, checksum: 03a2aa3e9040ec4dda5594021745a719 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-01-30T17:44:56Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Tese - Lídia Lopes Ferreira - 2014.pdf: 1260925 bytes, checksum: 03a2aa3e9040ec4dda5594021745a719 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2014-09-02 / The chlamydiosis or ornithosis is a major zoonosis of avian origin and it is important for poultry breending. This study was carried out in order to investigate the presence of Chlamydophila psittaci in pigeons (Columba livia), turkeys (Meleagris gallopavo domesticus), broilers and free-range chickens (Gallus gallus domesticus) and to estimate the occurrence of infected animals in the Center-Souther region of the State of Goias. Cloacal and tracheal swabs were colleted fron 120 pigeons captured near farms, 300 broiler chickens, 240 turkeys and 240 free-range chickens, analyzed by polymerase chain reaction (PCR). We obtained by the PCR, 6,7% (8/120) positive trachea and cloaca swabs in pigeons, 5,8% (7/120) positive tracheas swabs, and 17,5 % (21/120) positive cloacal swabs, totaling 30% (36/120) of birds infected with C. psittaci. We did not detect the bacterium in samples from broilers and turkeys. We found 17,5% (42/240) positive free-range chickens, being 8,3% (20/240) positive trachea and cloaca swabs, 6,7% (16/240) positive swabs and 2,5% (6/240) cloacal swabs. We concluded that the birds as well free- range chickens are carries of C. psittaci while broilers and turkeys were not infected. / A clamidiose ou ornitose é uma das principais zoonoses de origem aviária e de importância para criações de aves domésticas. O presente trabalho foi realizado com o objetivo de pesquisar a presença de Chlamydophila psittaci em pombos (Columba livia), perus (Meleagris gallopavo domesticus), frangos de corte, galinhas caipiras (Gallus gallus domesticus) e estimar a ocorrência desses animais infectados na região Centro-Sul do Estado de Goiás. Foram capturados 120 pombos nas proximidades de agroindústrias, realizados 120 suabes traqueiais e 120 cloacais, também foram coletadas em 300 frangos de corte, 300 amostras de suabes cloacais e 300 de traqueiais. Em 240 perus foram realizados 240 suabes traqueiais e 240 cloacais e 240 suabes cloacais e 240 traqueais de galinhas caipiras de pequenas propriedades e feiras livres, os quais foram analisados por meio da reação em cadeia da polimerase (PCR). Obteveram-se pela PCR, 6,7% (8/120) pombos positivos para traqueias e cloacas, 5,8% (7/120) apenas para suabes de traqueia, 17,5% (21/120) apenas para suabes de cloacas, totalizando 30% (36/120) de aves infectadas com C. psittaci. Nas amostras oriundas de frangos de corte e de perus não se detectou a bactéria. Foram encontrados 17,5% (42/240) de galinhas caipiras positivas, sendo 8,3% (20/240) amostras positivas para traqueias e cloacas, 6,7% (16/240) apenas para suabes de traqueias e 2,5% (6/240) somente para suabes de cloacas. Conclui-se que os pombos assim como as galinhas caipiras deste estudo são portatores de C. psittaci, enquanto aos frangos e perus avaliados, não estavam infectados.

A avicultura é uma das principais atividades agropecuárias no Brasil, no entanto apresenta grande dependência de material genético importado. Além disso, o crescente interesse por produtos avícolas oriundos de sistemas alternativos de criação, onde as aves são criadas fora das gaiolas, pode exigir animais mais adaptados a esse sistema de criação bem como ao clima tropical brasileiro. Desta forma, dois estudos foram desenvolvidos. No primeiro, o objetivo foi estimar os parâmetros genéticos para características de produção e qualidade dos ovos de oito linhagens de galinhas caipiras. Foram utilizadas as medidas de idade à primeira postura (IPP), produção total de ovos até a 45ª semana (PROD), peso do ovo (PO), altura do albúmen (AA), cor da gema (CG), unidades Haugh (HU), resistência da casca (RC), espessura da casca (EC), peso da gema (PG) e peso da casca (PC) de 2030 ovos, oriundos de 645 aves. Os componentes de variância foram obtidos por meio de um modelo misto animal, onde foram incluídos os efeitos fixos de grupo de contemporâneas, corredor da gaiola e linhagem da galinha e os efeitos genético aditivo, ambiente permanente e residual. As herdabilidades variaram de 0,03 a 0,33. As correlações genéticas entre PROD e as características de qualidade dos ovos foram negativas e variaram entre -0,42 e -0,05. Correlações genéticas altas e positivas, entre 0,36 e 0,69, foram estimadas entre as características de qualidade externa do ovo. No segundo estudo, o objetivo foi estimar os parâmetros genéticos para características de cor da casca do ovo, bem como as correlações genéticas e fenotípicas entre estas características e as características de produção e qualidade dos ovos avaliadas no primeiro estudo. Foram realizadas análises colorimétricas (coordenadas L*, a*, b*, do sistema de cor CIELab) de 1142 ovos oriundos de 597 aves. As herdabilidades estimadas para estas coordenadas variaram de 0,35 a 0,48 e as correlações genéticas entre elas foram altas. No geral, as correlações genéticas entre a cor da casca e as características de qualidade do ovo foram baixas, sugerindo que a cor da casca não influencia a qualidade interna e externa do ovo. / Poultry farming is one of the main agricultural activities in Brazil, but it is highly dependent on imported genetic material. Moreover, the growing interest in poultry products from cage-free systems may require animals better adapted to free- range systems and tropical climate. Regarding this subject, two studies were developed. The aim of the first one was to estimate genetic parameters for egg production and egg quality traits in eight alternative poultry lines. The traits of interest were age at first egg (AFE), total egg production up to the 45th week (PROD), egg weight (EW), albumen height (AH), yolk color (YC), Haugh units (HU), eggshell strength (ESS), eggshell thickness (EST), yolk weight (YW) and eggshell weight (ESW). Phenotypic records of 645 laying hens and 2030 eggs were used. Variance components were estimated from a mixed animal model, which included the fixed effects of contemporary groups, cage location and hen line, and the additive genetic, permanent environmental and residual effects. Heritabilities ranged from 0.03 to 0.33. Genetic correlations between PROD and egg quality traits were negative and varied between -0.42 and -0.05. High and positive genetic correlations were estimated between eggshell quality traits. In the second study, the aim was to estimate genetic parameters for eggshell color and also genetic and phenotypic correlations between eggshell color and egg quality traits which were evaluated in the first study. Color coordinates from CIELab color space L* (brightness), a* (red/green scale) and b* (yellow/blue scale) of 1142 eggs were determined. The estimated heritabilities ranged from 0.35 to 0.48 and the genetic correlations between them were high. In general, the genetic correlations between eggshell color and egg quality traits were low, suggesting that the eggshell color does not influence internal and external egg quality.

Made available in DSpace on 2016-12-23T13:56:05Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Marcus Alexandre Beltrame parte 1.pdf: 1849307 bytes, checksum: 3070da9250f42557e2a1f278080def13 (MD5) Previous issue date: 2010-05-24 / Introduction. The prevalence of Toxoplasma gondii infection in free-range chickens varies in different regions and we do not know the prevalence of this infection in free-range chickens in the state of Espirito Santo. Objective. To study the prevalence of infection by T. gondii in free-range chickens from different municipalities of the E. Santo, to try the isolation of the parasite from tissues of positive chickens and to search the knowledge on the parasite and the disease it produces among people living in the rural properties from which the samples were collected. Methods. Detection of anti-T. gondii in the serum of 510 chickens from rural areas of eight municipalities of E. Santo, using indirect hemagglutination (IHA) and modified agglutination test (MAT). Bioassay was conducted in mice by intra-peritoneal injection of macerated of thigh muscle, brain and heart from 64 positive chickens. Questionnaires were used to assess environmental conditions related to the protozoan in each farm and the knowledge of people on the parasite. Results. Anti-T. gondii antibodies were detected in 40.4% (95% CI: 36.1 to 44.7) by IHA and 38.8% (95% CI: 34.6 to 43) by MAT. Among the 64 chickens submitted to bioassay, the parasite was isolated from 48 (75%, 95% CI: 85.6 to 64.4), with mortality occurring from 10 through 31days after infection, and in two chickens presented seroconversion. Conclusions. (a) A high prevalence of anti-T. gondii antibodies with high frequency of parasite isolation from positive chickens, was observed in free range chickens in E. Santo;(b) The high mortality observed in mice used in the bioassay may be in relationship with the virulence of isolated strains; (c) There was good concordance (82%) between IHA and MAT, therefore IHA may indicated as a screening test for anti-T. gondii antibodies in chickens; (d) presence of cats in promiscuity with birds and other species occurred in 73% of the properties and (e) The questionnaire revealed ignorance of the people living in the visited farms about the protozoan, the disease it produces and its transmission mechanisms. / Introdução. A prevalência de infecção por Toxoplasma gondii em galinhas caipiras varia nas diferentes regiões e não se conhece a prevalência em galinhas caipiras no Estado do Espírito Santo. Objetivo. Estudar a prevalência da infecção por T. gondii em galinhas caipiras de municípios do E. Santo, tentar o isolamento do parasito nos tecidos de aves positivas e aplicar um questionário entre as pessoas que vivem nas propriedades nas quais as amostras foram tomadas, para verificar o conhecimento sobre o parasita e a doença que ele pode causar. Métodos. Pesquisa de anticorpos anti-T. gondii no soro de 510 galinhas de oito municípios do E. Santo, utilizando testes de hemaglutinação indireta (HAI) e aglutinação modificado (MAT). Em 64 aves soropositivas foi realizado o bioensaio em camundongos a partir de macerados do músculo da coxa, coração e encéfalo. Questionários foram aplicados para avaliar variáveis relacionadas a doença. Resultados. De 510 aves, foram soropositivas 40,4% (IC 95%: 36,1-44,7) no HAI e 38,8% (IC 95%: 34,6-43) no MAT. Das 64 galinhas submetidas ao bioensaio, isolou-se em 48 (75%; IC 95%: 85,6-64,4), com mortalidade ocorrendo entre 10 e 31dias após a infecção, e em duas houve soroconversão. Conclusões. (a) Detectou-se alta prevalência de anticorpos anti-T. gondii em galinhas caipiras no E. Santo, com grande freqüência de isolamento do protozoário; (b) A alta mortalidade dos camundongos utilizados no bioensaio pode estar relacionada com a virulência das cepas isoladas; (c) HAI teve concordância de 82% com o MAT, podendo ser indicado como teste de triagem para pesquisa de anticorpos anti-T. gondii em galinhas; (d) A presença de gatos soltos e em promiscuidade com as aves e demais espécies ocorreu em 73% das propriedades avaliadas; (e) O questionário aplicado revelou desconhecimento dos entrevistados sobre o protozoário, a doença que ele pode causar e seus meios de transmissão.

Made available in DSpace on 2016-12-23T13:56:06Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertacao de Marcus Alexandre Vaillant Beltrame.pdf: 2601197 bytes, checksum: 99d4aecebe83edfdd851f8015a17ae7a (MD5) Previous issue date: 2010-05-24 / Introdução. A prevalência de infecção por Toxoplasma gondii em galinhas caipiras varia nas diferentes regiões e não se conhece a prevalência em galinhas caipiras no Estado do Espírito Santo. Objetivo. Estudar a prevalência da infecção por T. gondii em galinhas caipiras de municípios do E. Santo, tentar o isolamento do parasito nos tecidos de aves positivas e aplicar um questionário entre as pessoas que vivem nas propriedades nas quais as amostras foram tomadas, para verificar o conhecimento sobre o parasita e a doença que ele pode causar. Métodos. Pesquisa de anticorpos anti-T. gondii no soro de 510 galinhas de oito municípios do E. Santo, utilizando testes de hemaglutinação indireta (HAI) e aglutinação modificado (MAT). Em 64 aves soropositivas foi realizado o bioensaio em camundongos a partir de macerados do músculo da coxa, coração e encéfalo. Questionários foram aplicados para avaliar variáveis relacionadas a doença. Resultados. De 510 aves, foram soropositivas 40,4% (IC 95%: 36,1-44,7) no HAI e 38,8% (IC 95%: 34,6-43) no MAT. Das 64 galinhas submetidas ao bioensaio, isolou-se em 48 (75%; IC 95%: 85,6-64,4), com mortalidade ocorrendo entre 10 e 31dias após a infecção, e em duas houve soroconversão. Conclusões. (a) Detectou-se alta prevalência de anticorpos anti-T. gondii em galinhas caipiras no E. Santo, com grande freqüência de isolamento do protozoário; (b) A alta mortalidade dos camundongos utilizados no bioensaio pode estar relacionada com a virulência das cepas isoladas; (c) HAI teve concordância de 82% com o MAT, podendo ser indicado como teste de triagem para pesquisa de anticorpos anti-T. gondii em galinhas; (d) A presença de gatos soltos e em promiscuidade com as aves e demais espécies ocorreu em 73% das propriedades avaliadas; (e) O questionário aplicado revelou desconhecimento dos entrevistados sobre o protozoário, a doença que ele pode causar e seus meios de transmissão / Introduction. The prevalence of Toxoplasma gondii infection in free-range chickens varies in different regions and we do not know the prevalence of this infection in free-range chickens in the state of Espirito Santo. Objective. To study the prevalence of infection by T. gondii in free-range chickens from different municipalities of the E. Santo, to try the isolation of the parasite from tissues of positive chickens and to search the knowledge on the parasite and the disease it produces among people living in the rural properties from which the samples were collected. Methods. Detection of anti-T. gondii in the serum of 510 chickens from rural areas of eight municipalities of E. Santo, using indirect hemagglutination (IHA) and modified agglutination test (MAT). Bioassay was conducted in mice by intra-peritoneal injection of macerated of thigh muscle, brain and heart from 64 positive chickens. Questionnaires were used to assess environmental conditions related to the protozoan in each farm and the knowledge of people on the parasite. Results. Anti-T. gondii antibodies were detected in 40.4% (95% CI: 36.1 to 44.7) by IHA and 38.8% (95% CI: 34.6 to 43) by MAT. Among the 64 chickens submitted to bioassay, the parasite was isolated from 48 (75%, 95% CI: 85.6 to 64.4), with mortality occurring from 10 through 31days after infection, and in two chickens presented seroconversion. Conclusions. (a) A high prevalence of anti-T. gondii antibodies with high frequency of parasite isolation from positive chickens, was observed in free range chickens in E. Santo;(b) The high mortality observed in mice used in the bioassay may be in relationship with the virulence of isolated strains; (c) There was good concordance (82%) between IHA and MAT, therefore IHA may indicated as a screening test for anti-T. gondii antibodies in chickens; (d) presence of cats in promiscuity with birds and other species occurred in 73% of the properties and (e) The questionnaire revealed ignorance of the people living in the visited farms about the protozoan, the disease it produces and its transmission mechanisms

Made available in DSpace on 2016-12-08T16:24:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PGCA11MA074.pdf: 600385 bytes, checksum: a494ebf1016e78409c7b3c6a97f69783 (MD5) Previous issue date: 2011-08-12 / The Brazilian caipira chickens egg blue are the result of random mating between different chicken breeds found in Brazil with chickens Araucania, giving rise to Brazilian caipira chicken with characteristic blue eggs. It stands out for its hardiness, disease resistance. And d adverse weather conditions and diet. The disease resistance is related to genetic variability of immune system genes. The immune response of chickens to pathogens is triggered from the presentation of antigens of the effect or cells of the immune system. This action is made by antigen-present cells (B cells, macrophages and a small percentage of T cells) animals that have surface molecules (glycoprotein) in wich these antigens are complexes. These glycoproteins presenting antigens, molecules called Major Histocompatibility Comples (MHC or B complex) can be class I or II. The class II, which present exogenous antigens, are composed of two polypeptide chains, an α chain and a ß chain. The chain is monomorphic α chain and ß is very polymorphic and is considered responsible for encoding different MHC class II molecules inn chickens. This study aimed to investigate the genetic variability of two gene loci of the MHC class II, B-LßI and B-LßII in caipiras chickens Brazilian blue eggs by obtaining sequences of these two genes and thus detect B-Lß existing alleles for these genes in these birds. This work was initially developed with DNA samples from 100 caipiras chickens blue eggs that were amplified from the region of interest and analyzed. From this analysis, the animals were grouped according to the sequence of exon2. Then, 16 animals were (with at least one representative from each group) for the reaction of DNA amplification, cloning and sequencing. The sample were submitted to the initiators of the genes B-LßII. Of these 16 birds were obtained 15 different sequences that were aligned to the standard sequence the B-LB12major (AJ248676) for BLßII and B-LB12c (AJ248578) to B-LßI, being eleven sequences B-LßII and B-LßI four sequences. Of these eleven sequences of the gene B-LßII seven were already described in the literature and four sequences of the gene B-LßII seven were already described in the literature and four sequences are new is not described, the other four sequences of the gene B-LßI three had already been described in the literature and a new . The 15 nucleotide sequences were transformed into sequences of amino acids. In the amino acid sequences of the gene was observed that B-LßI remains much more conserved than gene B-LßII. Thus this paper presents the genetic variability at both the DNA and polypeptide chain, genes B-LßII caipira chickens in Brazil s blue eggs / As galinhas caipiras brasileiras de ovos azuis são o resultado de cruzamentos aleatórios entre diversas raças de galinhas encontradas no Brasil com galinhas Araucanas, dando origem a uma galinha caipira brasileira com característica de ovos azuis. Destaca-se pela sua rusticidade, resistência a doenças e as condições adversas de clima e alimentação. A resistência a doenças esta relacionada à variabilidade genética dos genes do sistema imune. A resposta imune das galinhas a patógenos é desencadeada a partir da apresentação de antígenos as células efetoras do sistema imune. Esta ação é feita pelas células apresentadoras de antígenos (células B, macrófagos e uma pequena porcentagem de células T) dos animais que possuem moléculas de superfície (glicoproteínas) na qual são complexados estes antígenos. Estas glicoproteínas apresentadoras de antígenos, chamadas de moléculas do Complexo Maior de Histocompatibilidade (MHC ou Complexo B), podem ser de classe I ou de classe II. As de classe II, que apresentam antígenos exógenos, são formadas por duas cadeias polipeptídicas, uma cadeia α e uma cadeia β. A cadeia α é monomorfica e a cadeia β é bem polimórfica, e é considerada a responsável por codificar diferentes moléculas MHC classe II em galinhas. Este estudo teve como objetivo investigar a variabilidade genética em dois loci gênicos do MHC de classe II, B-LI e B-LII, em galinhas caipiras brasileiras de ovos azuis através da obtenção das sequências destes dois genes B-L e assim detectar os alelos existentes para estes genes nestas aves. Este trabalho foi desenvolvido inicialmente com amostras de DNA de 100 galinhas caipiras de ovos azuis que foram amplificadas para a região de interesse e analisadas. A partir desta análise, os animais foram agrupados de acordo com a sequência do exon 2. Depois, 16 animais foram selecionados (com pelo menos um representante de cada grupo) para a reação de amplificação do DNA, clonagem e sequenciamento. As amostras foram submetidas aos iniciadores dos genes B-LβI e B-LβII. Destas 16 aves obteve-se 15 diferentes sequências que foram alinhadas a sequência padrão B-LB12major (AJ248576) para o B-LβII e B-LB12c (AJ248578) para o B-LβI, sendo onze sequências B-LβII e quatro sequências B-LβI. Destas onze sequências do gene B-LβII sete já estavam descritas na literatura e quatro são sequências novas ainda não descritas, das outras quatro sequências do gene B-LβI três já haviam sido descritas na literatura e uma nova . As 15 sequências nucleotídicas encontradas foram deduzidas em sequências de aminoácidos. Nas sequências de aminoácidos foi observado que o gene B-LβI se mantém bem mais conservado do que o gene B-LβII. Assim, este trabalho apresenta a variabilidade genética dos genes B-LβI e BLβII tanto em nível de DNA quanto de cadeia polipeptídica, em galinhas caipiras brasileiras de ovos azuis

Made available in DSpace on 2016-12-08T16:24:11Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PGCA11MA083.pdf: 3400558 bytes, checksum: fedbf896e2daef8109b07884eb122a44 (MD5) Previous issue date: 2011-03-03 / Brazilian Caipira chicken are hardy birds that, it is believed, show high genetic diversity. However, there is almost no scientific studies that prove the alleged high genetic variability of the Caipira chicken. Studies that investigate this issue are very important, because the scientific evidence of this polymorphism makes the maintenance and conservation of these animals essential. The gene polymorphism is fundamental to the perpetuation of the species, besides being a source of alleles for genetic improvement programs for livestock. The commercial birds, for example, have lost much of their genetic variability because they have been through strict selection processes. Even though these animals are highly productive, some features related to production still deserve the attention of breeders, such as disease resistance. Some brazilian (blue-egg Caipira) chicken. This coloration of the egg shell is characteristic of a South American breed of chickens that participated in the formation of the native caipira chicken. This study used fifteen microsatellite loci to assess the genetic variability of brazilian (blue egg caipira) chicken. The animals were from the city of Two Lajeados - RS. By PCR, the amplicons obtained using a primer labeled with fluorophores were genotyped in an automatic sequencer and the results analyzed using the statistical program ARLEQUIN. It was detected a total of 168 alleles with an average of 11.2 alleles per locus, 288 genotypes, HE = 0.76 and HO = 0.49. These results confirmed the suspicion of high genetic variability in brazilian (blue egg Caipira) chicken / Galinhas caipiras brasileiras são aves rústicas, que, acredita-se, apresentam elevada diversidade genética. Entretanto, quase não há trabalhos científicos que comprovem a suposta alta variabilidade genética das aves caipiras. Trabalhos que investiguem esta questão são muito importantes, pois a comprovação científica deste polimorfismo transforma a manutenção e conservação destes animais imprescindível. O polimorfismo gênico é fundamental para a perpetuação da espécie, além de ser fonte de alelos para programas de melhoramento genético de animais de produção. As aves comerciais, por exemplo, perderam muito de sua variabilidade gênica por terem passado por rigorosos processos de seleção. Mesmo que estes animais sejam altamente produtivos, algumas características relacionadas à produção ainda merecem atenção dos melhoristas, como é o caso da resistência a doenças. Algumas galinhas caipiras brasileiras colocam ovos azuis. Esta coloração da casca do ovo é característica de uma raça sul-americana de galinhas que participou da formação das aves caipiras nacionais. Este trabalho utilizou quinze loci de microssatélites para avaliar a variabilidade genética de galinhas caipiras brasileiras de ovos azuis. Os animais foram provenientes do município de Dois Lajeados RS. Através da técnica da PCR, os amplicons obtidos com a utilização de iniciadores marcados com fluoróforos foram genotipados em seqüenciador automático e os resultados obtidos analisados através do programa estatístico ARLEQUIN. Foi detectado um total de 168 alelos, com média de 11,2 alelos por locus, 288 genótipos, HE=0,76 e HO=0,49. Estes resultados comprovaram a suspeita de alta variabilidade genética presente em galinhas caipiras brasileiras de ovos azuis