Siekiant papildyti žinias apie genetinę koronarinės širdies ligos (KŠL) architektūrą, užsibrėžta atlikti žinomų genetinių sričių siejamų su KŠL analizę ir naujų genetinių sričių siejamų su šia liga paiešką Lietuvos populiacijoje. Pagal atrinktas žinomas 60 genetinių sričių, siejamų su rizika susirgti KŠL, tiriamiems asmenims nustatyti genotipų ir alelių dažniai, sukonstruoti haplotipų blokai, atliktas vidupopuliacinis alelių dažnių ir haplotipų blokų palyginimas, tarppopuliacinis alelių dažnių palyginimas, nustatytas rizikos alelių tenkančių asmeniui pasiskirstymas populiacijoje. Nustatyta, kad skirtingoms populiacijoms yra būdingi tiek bendri, tiek ir unikalūs genetinės architektūros vienetai, o bendros Lietuvos lietuvių populiacijos genetinę struktūrą ir įvairovę pagal tirtus žymenis galima orientuoti gradientiškai Europos Šiaurės-Pietų kryptimi, tai aiškinant geografinių platumų lemiama klimato ir ekologijos įtaka genofondui evoliucijos eigoje. Pagal tirtų rizikos alelių skaičių tenkantį asmeniui, daugiausia asmenų tirtoje Lietuvos lietuvių populiacijoje turi vidutinę riziką susirgti KŠL. Genetinės asociacijos analize nustatytos aštuonios potencialios naujos kandidatinės su KŠL asocijuotos genetinės sritys, iš jų patvirtintos – keturios, o ITPR2 ir FBXL17 genai yra galimi genai kandidatai dalyvaujantys KŠL ir aterosklerozės patogenezėje. / This dissertation should supplement the knowledge of the genetic coronary heart disease (CHD) architecture by analysing known common variation as well as finding novel associated loci and genes. Genotype and allele frequencies, also haplotype blocks were determined in the Lithuanian population according to the list of 60 SNPs associated with CHD. The number of risk alleles per person was determined. The intrapopulation comparison of allele frequencies and haplotype blocks was performed. Allele frequencies were compared with different populations of European ancestry. The association analyses for new loci and candidate gene identification were performed. It was revealed that the common and unique genetic disease architecture variants for different populations exist. Regarding the genetic structure and diversity of the risk SNPs of CHD, Lithuanian population as compared with the European populations falls into the Northern-Southern gradient showing that the Lithuanian gene pool could have experienced the geographical climate and ecological influence during the evolution process. Considering the risk allele number per person of the investigated SNPs, the majority of Lithuanian population individuals have a relatively average risk of developing CHD. Association analyses showed eight new loci associated with CHD, four of which were confirmed and ITPR2 and FBXL17 were found to be the putative candidate genes that could participate in the pathogenesis of CHD and atherosclerosis.

The research object is probabilistic properties of non-coding DNA (nucleotide) sequences. Available models of DNA sequences are reviewed and their basic assumptions are verified by statistical analysis of bacterial DNA sequences. On the ground of this analysis, the definition of non-informative genetic sequence is introduced and a mathematical model of “genetic noise” is proposed. Computer simulations of non-coding (non-informative) nucleotide sequence evolution are performed and resulting sequences are compared with native ones. The task of visualisation of genetic sequences is an important part of the work. The main tasks of the work are the following: 1. to analyse the statistical features (independence, Markovity, long-range dependence, etc.) of bacterial DNA sequences, especially non-coding ones, 2. to formulate a definition of a non-informative nucleotide sequence (“genetic noise”) and to propose its mathematical model, 3. using the methodology of functional data analysis and the distance metrics between oligonucleotides, to propose an efficient method for nucleotide sequence visualisation. General Conclusions: 1. The probability model of non-informative nucleotide sequence or, in other words, “genetic noise” (an analogue of the “white noise”) is proposed and its properties are studied mainly by computer simulation. The long-range dependence in DNA sequences has been extensively studied and is considered as an evidence of their complexity and hierarchical structure... [to full text]

Genetic material of Lithuanian origin varieties, breeding lines and wild ecotypes representing P. pratense, P. bertolonii and P. phleoides species were studied for the most important agro-morphological and feeding value indicators as well as at the genetic level employing different biochemical–molecular markers. The water stress experiment clearly demonstrated the existence of different levels of water stress response in Phleum species, suggesting that P. phleoides might have evolved under conditions of limited water availability. “Blind” mapping by HRM was used successfully to map water stress response genes of timothy in the perennial ryegrass mapping population. In total, 12 putative water stress response genes were mapped in seven perennial ryegrass linkage groups. / Pasitelkus agromorfologinius, kokybės ir biocheminius – molekulinius metodus ištirtos lietuviškos kilmės pašarinių, žemaūgių bei stepinių motiejukų veislės, selekcinės linijos bei laukiniai ekotipai. Fiziologiniai sausros atsparumo tyrimų rezultatai įrodė, kad stepiniai motiejukai turi geriau išvystytą atsparumo sausrai mechanizmą. Pirmą kartą motiejukuose aptikti ekspresuojami atsparumo sausrai kandidatiniai genai HRM metodu sužymėti daugiametės svidrės genolapyje.

For the first time in Lithuania the foliage spectral reflectance properties of common tree species were investigated using hyperspectral imaging. The methodological outline was formulated and the procedures of practical hyperspectral imaging application were developed to stimulate the progress of hyperspectral remote sensing in Lithuanian forestry. Information extracted from foliage hyperspectral reflectance data was used to accurately determine forest tree species and the provenances of Scots Pine trees. The satisfactory results of determination of Scots Pine crown defoliation and the concentration of some needles chemical constituents were achieved investigating the foliar hyperspectral reflectance, too. The first spectral libraries of common Lithuanian tree species foliar reflectance were built considering the growing season. / Suformuoti hiperspektrinio skenavimo naudojimo įvairioms miško medžių savybėms tirti metodiniai ir praktiniai pagrindai – sukurtos ir išbandytos mėginių paėmimo, jų paruošimo skenuoti, skenavimo atlikimo ir gautos informacijos apdorojimo metodikos, kurios aprobuotos vykdant mokslinius tyrimus. Nustatyti vegetacijos sezono momentai, kuriais skirtingų miško medžių rūšių atpažinimas nuotoliniu būdu pagal jų spektrinus atspindžius būtų tiksliausias, o tai sudaro prielaidas tobulinti kitas nuotoliniais. Pasiūlyti metodai paprastosios pušies spyglių kai kurių cheminių elementų koncentracijai nustatyti naudojant hiperspektrinį skenavimą. Sukurtos Lietuvos miškuose augančių pagrindinių medžių rūšių lapijos spektrinio atspindžio kreivių bibliotekos, naudotinos miškų inventorizacijoje, kalibruoti ir klasifikuoti orlaiviuose sumontuotais jutikliais išgautus Lietuvos medynų hiperspektrinius vaizdus.