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Caracterização e análise de diversidade genética em algodoeiro herbáceo por marcadores microssatélites e genealogia / Characterization and analysis of cotton genetic diversity determined by microsatellites and genealogy

Bertini, Cândida Hermínia Campos de Magalhães 10 August 2004 (has links)
Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2017-06-06T17:52:24Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1133276 bytes, checksum: 58925ce395d2c8f7b6595cff56650411 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-06T17:52:24Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1133276 bytes, checksum: 58925ce395d2c8f7b6595cff56650411 (MD5) Previous issue date: 2004-08-10 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / A vulnerabilidade genética tornou-se preocupação constante no melhoramento de qualquer espécie vegetal. A manutenção da diversidade genética entre genótipos em uma cultura torna-se medida de proteção contra potenciais perdas devido ao ataque de pragas e doenças. A diversidade genética entre genótipos também facilita a criação de populações segregantes a partir das quais plantas contendo combinações de genes superiores podem ser selecionadas. Com a aprovação da Lei de Proteção de Cultivares no Brasil (1997), a caracterização genética de cultivares tornou-se importante na proteção do direito intelectual do melhorista, bem como para auxiliar os programas de melhoramento dessas cultivares. Os objetivos gerais desse trabalho foram caracterizar e avaliar a diversidade genética de algumas cultivares de importância tanto comercial quanto para os programas de melhoramento do Brasil, bem como de linhagens, por meio de marcadores microssatélites (SSR). Dessa forma, neste trabalho foram utilizadas cultivares de algodoeiro herbáceo indicadas para plantio em diferentes regiões do Brasil, bem como cultivares provenientes da Argentina e Paraguai. Linhagens de algodoeiro, provenientes do programa de melhoramento da COODETEC, também foram utilizadas. Os resultados evidenciaram que o sistema eletroforético com gel desnaturante de poliacrilamida 7% foi o recomendado para realização de caracterização e análise de diversidade genética de cultivares de algodoeiro herbáceo, por apresentar maior poder de resolução. Ademais, constatou-se o potencial dos marcadores microssatélites em estudos de diversidade genética entre indivíduos da espécie Gossypium hirsutum L., uma base genética estreita entre as cultivares e entre as linhagens de algodoeiro e, como conseqüência a necessidade de se introduzir novos alelos no pool gênico dos algodoeiros melhorados. O conjunto de primers SSR selecionados para as cultivares (11 pares de primers SSR) e linhagens (14 pares de primers) poderão ser úteis nos processos de proteção de cultivares, nas análises de pureza genética e nos programas de melhoramento. A correlação entre as distâncias genéticas obtidas pelos coeficientes de parentesco e marcadores microssatélites tanto para as cultivares quanto para as linhagens foi positiva e significativa (P < 0,001). Entretanto, a magnitude das correlações não foi elevada, com valores iguais a 0,25 entre as cultivares e a 0,29 entre as linhagens. A estimativa da diversidade genética com base em marcadores microssatélites forneceu mais informações sobre as relações genéticas entre os indivíduos. A constatação de que poucos ancestrais contribuem para a constituição genética das cultivares de algodoeiro usadas no Brasil, sugere maior preocupação em introgredir novos alelos no pool gênico dessas cultivares e, assim, aumentar sua base genética. / The genetic vulnerability is a constant concern breeding of any vegetal species. Maintaining genetic diversity among crop genotypes offers a measure of protection against potential widespread losses from crop pests and facilitates the creation of segregating populations from which plants with superior gene combinations can be selected. Along with the development of new cultivars, there has been a growing interest in the genetic characterization, for commercial protection provided by the Brazilian Cultivar Protection Low and regulations (1997). The general purpose of this work were to characterize and to evaluate the genetic diversity of some important cultivars used in breeding program in Brazil through microsatellites (SSR) markers and genealogy. In this work we used cotton cultivars developed and released by Brazilian public and private institutions and cotton cultivars developed in Argentina and Paraguay. Cotton lines from breeding program developed by COODETEC also were used at present work. In conclusion, was evidenced that the eletrophoretic system with denaturing gel of 7% was recommended for characterization and analyze of genetic diversity of cotton cultivars because they present higher resolution. The results revealed the potential of the markers for genetic diversity studies among Gossypium hirsutum L. genotypes, a narrow genetic base among cultivars and among lines and the necessity to introduce new alleles in improved cotton germplasm. The selected SSR primers for the cultivars (11 primers pairs) and lines (14 primers pairs) will be useful for cultivars protection process, analyzes of genetic purity and in breeding program. The correlation evidenced between the estimation used to calculate the genetic distance among cultivars and among lines was positive and significant. However, the correlations are not so high, with values equal to 0,25 among cultivars and 0,29 among lines. The genetic diversity estimation based in molecular markers provided more information about the genetic relationships among individuals. The evidence that few ancestral contribute to genetic constitution of the cotton cultivars used in Brazil suggest a need of introducing new alleles into the gene pool of these cultivars and in this way to increase the cotton genetic base.
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Interação entre genótipos de algodoeiro em ambientes representativos do cerrado brasileiro / Interaction among cotton genotypes in representative environments of the brazilian cerrado

Teodoro, Paulo Eduardo 30 October 2017 (has links)
Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2018-01-15T11:20:58Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 887380 bytes, checksum: a251d2c41bef4579b1bd658d0f876b0d (MD5) / Made available in DSpace on 2018-01-15T11:20:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 887380 bytes, checksum: a251d2c41bef4579b1bd658d0f876b0d (MD5) Previous issue date: 2017-10-30 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / O algodoeiro herbáceo (Gossypium hirsutum L.) fornece cerca de 90% da fibra têxtil mundial e é uma das culturas de maior relevância industrial. A cotonicultura brasileira se concentra no Cerrado, sobretudo nas regiões Centro-Oeste e Nordeste. Devido as características edafoclimáticas distintas destes locais, um importante fator deve ser considerado nas fases finais dos programas de melhoramento: interação genótipos x ambientes (GxE). Desse modo, esta tese teve como objetivo investigar as implicações da interação entre genótipos e ambientes no melhoramento do algodoeiro cultivado no Cerrado brasileiro. Seus objetivos específicos foram: (1) dividir os locais do Cerrado brasileiro em Mega-ambientes quanto a produtividade de fibras de genótipos de algodoeiro; (2) identificar locais essenciais para a condução de ensaios em cada Mega-ambiente; (3) recomendar genótipos de algodão para o Cerrado brasileiro com base na adaptabilidade e estabilidade produtiva; (4) identificar genótipos de algodão que reúnam alta adaptabilidade e estabilidade para qualidade da fibra; (5) realizar uma recomendação de genótipos que reúnam alta adaptabilidade e estabilidade para produtividade e qualidade de fibras. A produtividade de fibras foi avaliada em 19 ensaios de competição de cultivares de algodoeiro nas safras 2013/2014 e 2014/2015. O delineamento experimental utilizado foi o de blocos casualizados com 12 tratamentos e quatro repetições. Os caracteres avaliados foram: produtividade de fibras (PRODF), comprimento de fibras (CF), resistência de fibras (RF) e micronaire (MIC). A interação genótipos x ambientes foi significativa para todos os caracteres avaliados. A identificação dos Mega-ambientes e dos locais essenciais foi realizada pelo método GGE biplot com base na PRODF. Foram identificados dois Mega- ambientes, onde os locais de Primavera do Leste e São Desidério possuem maior capacidade de discriminação dos genótipos no Mega-ambiente 1; no Mega-ambiente 2, os locais que reúnem maior poder de discriminação e representatividade são Chapadão do Sul, Pedra Preta e Trindade. Posteriormente, para cada caráter, o método de Lin e Binns modificado foi utilizado para recomendação dos melhores genótipos para todos ambientes, ambientes favoráveis e desfavoráveis. Esse método também foi utilizado de forma multivariada, visando uma recomendação dos genótipos com base nos múltiplos caracteres avaliados. Foram identificados genótipos com alta adaptabilidade e estabilidade para cada caráter. O índice utilizado identificou que os genótipos IMA 08 WS e BRS 335 são aqueles que reúnem as principais características desejáveis. / The herbaceous cotton (Gossypium hirsutum L.) supplies about 90% of the world's textile fiber and is one of the most important industrial crops. The Brazilian cotton cultivation is concentrated in the Cerrado, especially in the Midwest and Northeast regions. Due to the distinct edaphoclimatic characteristics of these environments, an important factor should be considered in the final stages of breeding programs: genotypes x environments (GxE) interaction. Thus, this thesis aimed to investigate the implications of interaction between genotypes and environments on the breeding of cotton cultivated in the Brazilian Cerrado. Its specific objectives were: (1) to divide the Brazilian Cerrado in Mega-environments in terms of fiber yield of cotton genotypes; (2) identify sites essential to conducting trials in each Mega- environment; (3) recommend genotypes of cotton for the Brazilian Cerrado based on adaptability and stability for fiber yield; (4) identify cotton genotypes that meet high adaptability and stability for fiber quality; (5) make a recommendation of genotypes that meet high adaptability and stability for fiber yield and quality. The fiber yield was evaluated in 19 competition trials of cotton cultivars in the 2013/2014 and 2014/2015 seasons. The experimental design was a randomized block with 12 treatments and four replicates. The evaluated traits were: fiber yield (PRODF), fiber length (CF), fiber resistance (RF) and micronaire (MIC). The interaction genotypes x environments was significant for all evaluated traits. The identification of Mega-environments and essential environments was performed by the GGE biplot method based on PRODF. Two Mega-environments were identified, where the Primavera do Leste and São Desidério have a greater discrimination capacity of the genotypes in Mega-environment 1; in Mega-environment 2, the sites that have the greatest power of discrimination and representativeness are Chapadão do Sul, Pedra Preta and Trindade. Thereafter, for each trait, the method of Lins and Binns modified was used for recommendation of the best genotypes for all environments, favorable and unfavorable environments. This method was also used in a multivariate context, aiming at a recommendation of the genotypes based on the multiple traits evaluated. Genotypes with high adaptability and stability were identified for each traitr. The multivariate index used identified that the genotypes IMA 08 WS and BRS 335 are those that meet the main desirable traits.
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Controle Biológico Conservativo: plantas herbáceas e a diversidade, abundância e distribuição de insetos predadores em algodoeiro colorido / Conservative Biological Control: herbaceous plants on diversity, abundance and distribution of predatory insects in colored cotton

Matta, Danilo Henrique da [UNESP] 20 December 2016 (has links)
Submitted by DANILO HENRIQUE DA MATTA null (danilodamatta@hotmail.com) on 2017-01-07T11:13:21Z No. of bitstreams: 1 Tese de Doutorado 2.pdf: 2602815 bytes, checksum: 60198ff9a9ff9ebdada41fc6c02f0973 (MD5) / Approved for entry into archive by Juliano Benedito Ferreira (julianoferreira@reitoria.unesp.br) on 2017-01-11T12:27:15Z (GMT) No. of bitstreams: 1 matta_dh_dr_bot.pdf: 2602815 bytes, checksum: 60198ff9a9ff9ebdada41fc6c02f0973 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-01-11T12:27:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1 matta_dh_dr_bot.pdf: 2602815 bytes, checksum: 60198ff9a9ff9ebdada41fc6c02f0973 (MD5) Previous issue date: 2016-12-20 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / No presente estudo avaliou-se o efeito de plantas herbáceas floríferas (PHF) e plantas espontâneas (PE) sobre Coccinellidae, Carabidae, Staphylinidae (Coleoptera) e Dermaptera em algodoeiro colorido. O experimento foi conduzido em área com algodoeiro, Gossypium hirsutum L., cultivar BRS verde (Malvaceae), contendo bordas com plantas herbáceas floríferas (PHF) e plantas espontâneas (PE), durante o período de outubro/2011 a maio/2013. As amostragens foram quinzenais utilizando-se armadilhas tipo alçapão. Os dados obtidos foram submetidos às análises de fauna, variância e distribuição espacial. O total de 17.462 indivíduos e 76 espécies de Coccinellidae (148 indivíduos e 8 espécies), Carabidae (13.648 indivíduos e 50 espécies), Staphylinidae (139 indivíduos e 14 espécies) e Dermaptera (3.527 indivíduos e 4 espécies) foram capturados no algodoeiro colorido e plantas herbáceas. As espécies de coccinelídeos predominantes foram: Harmonia axyridis (Pallas, 1773) e Hippodamia convergens (Guérin-Méneville, 1842), entre os carabídeos foram: Selenophorus alternans Dejean, 1829, S. discopunctatus Dejean, 1829, Notiobia cupripennis (Germar, 1824), Galerita brasiliensis Dejean, 1826, Selenophorus sp.1, Selenophorus sp.4 e Selenophorus sp.3. Entre os estafilinídeos, apenas a espécie Eulissus chalybaeus Mannerheim, 1830 foi predominante e para os dermápteros somente Labidura riparia (Pallas, 1773). A maior diversidade de espécies de coccinelídeos ocorreu em Lobularia maritima (H’= 1,696), o mesmo se verificando para carabídeos em Tagetes erecta (H’= 2,605), estafilinídeos em algodoeiro (H’= 1,943) e dermápteros em plantas espontâneas (H’= 0,661). O maior número de indivíduos de carabídeos e estafilinídeos ocorreu em plantas espontâneas e L. maritima, para os dermápteros em Fagopyrum esculentum e plantas espontâneas. Os coccinelídeos, carabídeos, estafilinídeos e dermápteros apresentaram distribuição espacial agregada.
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Lixiviação de amônio e nitrato em um latossolo vermelho distrófico cultivado com algodoeiro (Gossypium hirsutum L. var. latifolium Hutch) em função de doses e fontes de nitrogênio em sistemas irrigado e não irrigado / Lyivation of ammonium and nitrate in a distrophic red latossol cultivated with cotton (Gossypium hirsutum L. var. latifolium Hutch) in the function of nitrogen doses and sources in irrigated and non-irrigated systems

Pereira, Mirella dos Santos 01 March 2018 (has links)
Submitted by Mirella Dos Santos Pereira (mirella.pereira03@yahoo.com.br) on 2018-04-25T01:21:25Z No. of bitstreams: 1 SANTOS ME LIXIVIAÇÃO DE AMÔNIO E NITRATO EM UM LATOSSOLO VERMELHO DISTRÓFICO CULTIVADO COM ALGODOEIRO (Gossypium hirsutum L. var. latifolium Hutch) EM FUNÇÃO DE DOSES E FONTES DE NITROGENIO EM SISTEMA.pdf: 1257009 bytes, checksum: 385811a0387d0bad8e49328df2332608 (MD5) / Approved for entry into archive by Cristina Alexandra de Godoy null (cristina@adm.feis.unesp.br) on 2018-04-25T17:36:55Z (GMT) No. of bitstreams: 1 pereira_ms_me_ilha.pdf: 1120515 bytes, checksum: 1e52b35de3dead43b0a5a28321210e3b (MD5) / Made available in DSpace on 2018-04-25T17:36:55Z (GMT). No. of bitstreams: 1 pereira_ms_me_ilha.pdf: 1120515 bytes, checksum: 1e52b35de3dead43b0a5a28321210e3b (MD5) Previous issue date: 2018-03-01 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / O N é um dos elementos mais dinâmicos no solo, conforme sua transformação no meio. A lixiviação de nitrato e do amônio no solo é considerada a principal perda do N disponível às plantas, quanto maior for à aplicação deste elemento no solo, maior será o potencial de poluição do solo e da água. Objetivou-se, neste trabalho, avaliar a lixiviação de amônio e nitrato em um Latossolo Vermelho em diferentes profundidas do solo, em função de doses e fontes de N distintas, em sistemas irrigado e não irrigado nas condições de campo. O experimento foi conduzido no ano agrícola 2014/15, na área experimental da fazenda de ensino, pesquisa e extensão, localizada no município de Selvíria-MS. Utilizou-se o delineamento em blocos casualizados, com 20 tratamentos dispostos em fatorial 5x2x2, com 4 repetições. Aplicou-se 5 doses de nitrogênio (0 (testemunha); 25; 50; 100 e 150 kg de N ha-1), as fontes de N utilizadas foram: nitrato de amônio e a ureia, aplicados em uma única adubação de cobertura via solo aos 45 após a emergência. As amostras de solo colhidas foram analisadas em laboratório, para a determinação da concentração da lixiviação do NO3- e do NH4+ no solo. Avaliou – se os parâmetros de crescimento, estado nutricional e da produtividade do algodoeiro durante seu ciclo. Os resultados permitiram concluir que o sistema irrigado foi o que propiciou maior lixiviação dos teores de nitrato e amônio nas profundidades de 0 a 0,8 m do solo e o sistema não irrigado foi o que apresentou maior concentração. A profundidade de 0,4 – 0,6 m foi a que constatou a maior acúmulo desses nutrientes no solo. / The N is one of the most dynamic elements in the soil, according to its transformation in the environment. The leaching of nitrate and ammonium in the soil is considered the main loss of the N available to the plants, the greater the application of this element in the soil, the greater the pollution potential of soil and water. The objective of this work was to evaluate the leaching of ammonium and nitrate in a Red Latosol in different depths of the soil, as a function of different N sources and sources, in irrigated and non-irrigated systems under field conditions. The experiment was conducted in the agricultural year 2014/15, in the experimental area of the teaching, research and extension farm, located in the municipality of Selvíria, Brasil state of mato grosso do sul. A randomized complete block design was used, with 20 treatments arranged in 5x2x2 factorial, with 4 replications. Five nitrogen doses (0 (control), 25, 50, 100 and 150 kg of N ha-1) were applied, the N sources used were: ammonium nitrate and urea, applied in a single cover fertilization only at 45 after the emergency. The soil samples collected were analyzed in the laboratory for the determination of the leaching concentration of NO3- and NH4+ in the soil. The parameters of growth, nutritional status and yield of cotton during its cycle were evaluated. The results allowed to conclude that the irrigated system provided the highest leaching of the nitrate and ammonium contents in the 0 to 0,8 m depths of the soil and the non irrigated system presented the higher concentration. The depth of 0,4 – 0,6 m showed the greatest accumulation of these nutrients in the soil.
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Produtividade e qualidade de fibra de cultivares de algodoeiro em função de doses de nitrogênio

Feltrin, Ednaldo Binhardi [UNESP] 06 September 2007 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:29:45Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2007-09-06Bitstream added on 2014-06-13T20:39:19Z : No. of bitstreams: 1 feltrin_eb_me_ilha.pdf: 274810 bytes, checksum: 5b1d471265738f3bcb03eefac9a7e85c (MD5) / Universidade Estadual Paulista (UNESP) / Em função dos altos níveis de produtividade alcançados nos cerrados, têm-se tentado transferir para o cultivo tradicional do sudeste, boa parte da tecnologia adotada nas extensas e essencialmente mecanizadas culturas daquela região. Entre outros fatores, destaca-se a adoção de níveis de adubação próprios daquela realidade e o semeadura de novas cultivares. O nitrogênio é considerado um dos nutrientes mais importantes para o algodoeiro devido a sua interferência nos aspectos de qualidade e quantidade da produção, sendo que os rendimentos maiores foram relatados em plantas que receberam dosagem de até 150 kg ha-1 de nitrogênio em cobertura. O objetivo deste trabalho foi avaliar a influência de doses crescentes de adubação nitrogenada, juntamente com diferentes cultivares quanto à produtividade e características de fibra do algodoeiro, cultivado em Leme-SP. O delineamento experimental empregado foi o de blocos ao acaso, no esquema fatorial 4x2 num total de 8 tratamentos, com 4 repetições, perfazendo 32 parcelas. Foi composto por doses crescentes de nitrogênio em cobertura: 16, 64, 144, e 256 kg ha-1; e duas cultivares de algodão: IAC 24 e Delta Opal. Pode-se concluir que a produtividade, o índice de amarelecimento, a massa de 100 sementes e a massa de 1 capulho tiveram aumento até a dose de 144 kg ha-1 de N. A porcentagem de fibra dos capulhos diminuiu de acordo com o aumento das doses de N. Os maiores teores foliares de N foram obtidos com a máxima aplicação de nitrogênio. / In function of the high reached levels of productivity in the open pasture, they are had attemped to transfer to the southeastern traditional culture, good part of the technology adopted in the extensive and essentially mechanized cultures of that region. Among others factors, it is distinguished adoption of proper levels of fertilization of that new reality and the plantation of cultivating. The nitrogen is considered the one of the most important nutrients for the cotton plant due its interference in the aspects of quality and amount of the production, having been that the incomes biggest it had been told in plants that had received dosage from up to 150 kg ha-1 of nitrogen in covering. The objective of this work was to evaluate the influence of increasing doses of nitrogen fertilization, together different cultivating for that matter to the productivity and fiber characteristic of the cotton plant, cultivated in Leme-SP. The used experimental delineation was of blocks at random, in the factorial project 4x2 in a total of 8 treatments, with 4 repetitions, concluding 32 parcels. It was composed for increasing doses of nitrogen in covering: 16, 64, 144, and 256 kg ha-1; e two cultivates of cotton: 24 IAC and Opal Delta. It can be concluded that the productivity, index of the act of turning yellow, weight of 100 seeds and weight of 1 cotton boll had increase even the dose of 144 kg ha-1 of N. The fiber percentage of cotton boll it diminished in agreement with the increase of the levels of N. The greatest values of N was founded with the high application of nitrogen.
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Expressão de genes responsivos ao déficit hídrico na fase inicial de crescimento do algodoeiro

BATISTA, Vandré Guevara Lyra 29 June 2018 (has links)
Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2018-08-28T12:21:53Z No. of bitstreams: 1 Vandre Guevara Lyra Batista.pdf: 1310502 bytes, checksum: 06ec14bd99e2ba13809e8164894e214e (MD5) / Made available in DSpace on 2018-08-28T12:21:53Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Vandre Guevara Lyra Batista.pdf: 1310502 bytes, checksum: 06ec14bd99e2ba13809e8164894e214e (MD5) Previous issue date: 2018-06-29 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The cotton has high adaptability to adverse conditions, however, one of the main factors for losses in production is the water deficit. The use of molecular tools in conjunction with biochemical and physiological data has elucidated some questions regarding the complexity of plant responses to water stress. In view of the above, the identification of genes that make up this complex chain is of great importance. The objective of this study was to determine the effects of water stress on GUSP1 and MYB60 gene expression and on physiological, biochemical and growth variables in the vegetative (V1) phase of cotton plants. Gossypium hirsutum genotypes from Embrapa Cotton BAG were used. The seeds were planted in tubes. The experimental design was completely randomized, in a factorial scheme 4 (genotypes) x 2 (irrigated and non-irrigated), with 10 replications. The gas exchanges (g, ci, E and A) were performed with an apparatus containing IRGA (Infra Red Gas Analylser). Plant height (ALT), stem diameter (DH), number of leaves (NF), root phytomass (FITOR) and shoot phytomass (FITOA) were measured at 25 DEH. The activities of superoxide dismutase (SOD), catalase (CAT) and gene expression via RT-qPCR were analyzed in leaves. In relation to the first study all variables were significantly affected (p <0.05) by water treatments. Mocó 1 and CNPA Precoce 1 showed significant reductions in the variables NF, DC, FITOA and FITOR. SOD and CAT presented similar behavior in all genotypes, but CNPA Precoce 1 presented the highest level of activity with 80-90% of stomatal closure (phase 2), indicating that this genotype was the most affected by the stress imposed. GUSP1 gradually increased expression in all genotypes, especially Moc 2 in phase 2, while MYB 60 showed a peak expression with 50% of the stomatal closure (phase 1), decreasing with the severity of the stress. In the second study, the variables related to gas exchange were not significantly affected (p <0.05), since they were performed in phase 1. The genotypes adapted to the northeastern semi-arid region presented the smallest reductions in physiological variables, indicating a higher tolerance to water stress. For the study of gene expression, GUSP1 presented the highest levels in these same genotypes, the opposite was observed for the MYB60 gene, where the relatively more sensitive genotypes showed the highest levels of expression, data that corroborate with studies involving the genes studied. According to the results, the genes can contribute to the selection of materials more tolerant to water stress, since they were able to identify the most tolerant genotypes at the beginning of the growth phase V1, making this strategy more practical due to the earlier identification. / O algodoeiro tem alta adaptabilidade a condições adversas, contudo, um dos principais fatores para perdas na produção é o déficit hídrico. A utilização de ferramentas moleculares em conjunto com dados bioquímicos e fisiológicos tem elucidado algumas perguntas a respeito da complexidade de respostas das plantas ao estresse hídrico. Diante do exposto, a identificação de genes que compõem essa complexa cadeia é de grande importância. Objetivou-se nesse estudo determinar os efeitos do estresse hídrico sobre a expressão dos genes GUSP1 e MYB60 e sobre variáveis fisiológicas, bioquímicas e de crescimento na fase vegetativa (V1) de algodoeiros. Foram utilizados genótipos de algodoeiro Gossypium hirsutum oriundos do BAG da Embrapa Algodão. As sementes foram plantadas em tubetes. O delineamento experimental foi inteiramente casualizado, em esquema fatorial 4 (genótipos) x 2 (irrigado e não irrigado), com 10 repetições. As trocas gasosas (g, ci, E e A) foram realizadas com um aparelho contendo IRGA (Infra Red Gás Analylser). Nas avaliações de crescimento foram mensuradas: altura da planta (ALT), diâmetro da haste (DH), número de folhas (NF), fitomassa da raiz (FITOR) e fitomassa da parte aérea (FITOA) aos 25 DEH. As atividades da superóxido dismutase (SOD), catalase (CAT) e a expressão gênica via RT-qPCR foram analisadas em folhas. Em relação ao primeiro estudo todas as variáveis foram afetadas significativamente (p<0.05) pelos tratamentos hídricos. Mocó 1 e CNPA Precoce 1 apresentaram reduções significativas nas variáveis NF, DC, FITOA e FITOR. SOD e CAT apresentaram comportamento semelhante em todos os genótipos, porém CNPA Precoce 1 apresentou o maior nível de atividade com 80-90% do fechamento estomático (fase 2), indicando que esse genótipo foi o mais afetado pelo estresse imposto. GUSP1 aumentou gradativamente a expressão em todos os genótipos, destacando-se o Mocó 2 na fase 2, enquanto que MYB60 apresentou um pico de expressão com 50% do fechamento estomático (fase 1), decaindo com a severidade do estresse. No segundo estudo as variáveis referentes as trocas gasosas não foram afetadas significativamente (p<0.05), pois as mesmas foram realizadas na fase 1. Os genótipos adaptados ao semi árido nordestino apresentaram as menores reduções das variáveis fisiológicas, indicando maior tolerância ao estresse hídrico. Para o estudo de expressão gênica, GUSP1 apresentou os maiores níveis nesses mesmos genótipos, o contrário foi observado para o gene MYB60, onde os genótipos relativamente mais sensíveis apresentaram os maiores níveis de expressão, dados esses que corroboram com trabalhos envolvendo os genes estudados. De acordo com os resultados, os genes podem contribuir para seleção de materiais mais tolerantes ao estresse hídrico, visto que conseguiram identificar os genótipos mais tolerantes logo no início do crescimento (fase V1), tornando tal estratégia mais prática em função da identificação mais precoce.
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Tolerância de genótipos do algodão colorido ao estresse salino / Tolerance of colored cotton genotype to saline stress

Pereira, Elizandra Ribeiro de Lima 28 August 2012 (has links)
Made available in DSpace on 2015-09-25T12:21:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PDF - Elizandra Ribeiro de Lima Pereira.pdf: 2346613 bytes, checksum: 9d8761d22e1c36ab058063d030e55f0e (MD5) Previous issue date: 2012-08-28 / The use of some areas of arid and semi-arid regions goes onto obstacles as water salinity and sodium potentiality in use for irrigation. Saline stress caused by handling not always proper to irrigation is one of the most serious factors limiting culture growth and production, implying on morphological, metabolic and structural changes on plants. About this matter, this work has an aim to evaluate vegetative and physiologic behavior on four varieties and six strains of colored cotton, submitted to three different conditions of saline stress, in a screen house. The experiment was taken in the installations of the Department of Agricultural Engineering in the Technological Center and Natural Resources at UFCG (Federal University of Campina Grande), in a partnership with the State University and EMBRAPA Cotton, all of them located in the city of Campina Grande PB. The treatments got 10 x 3 factorial, constituted of 10 genotypes of colored cotton, (four varieties: BRS ruby, BRS sapphire, BRS green, BRS topaz, and six strains: CNPA/2009-06, CNPA/2009-11, CNPA/2009-13, CNPA/2009-50, CNPA/2009-27, CNPA/2009-42) and three conditions of salinity in the irrigation water, making use of salts NaCl, CaCl2.2H2O e MgCl2.6H2O, in the proportion 7:2:1, diluted in supplying water: 1) without stress, plants irrigated with supplying water with conductivity of 0.6 dSm-1 , during experimental time (up to 43 days after sowing (DAS); 2) usage of water with saline content de 2 dSm-1, in a period of time of 7 to 15 days after sowing (DAS), intensifying saline stress from the 16º DAS, with an increase to 10 dSm-1, until the end of the experiment at 43 DAS; 3) water with saline content of dSm-1 from 7 to 15 days after sowing (DAS), intensifying saline stress from 16º DAS, with an increase to 10 dSm-1 until the end of the experiment at 43 DAS. The experimental lineation was in randomized blocks, with three repetitions, constituting the portion of 10 288mL tubes, having one plant each. The work evaluated: emergency speed index of seedlings, number of leaves, plant height, stalk diameter, phytomass (dry matter of root, stalk, leaves and total plant phytomass), and gas changes (stomatal conductivity, transpiration, photosyntesis and inner carbon). The evaluations were begun on the 15 days and repeated at each 7 day. Obtained data were submitted to variance analyses 10 dSm-1. We checked out that saline stress causes physiological alterations expressed in reduction of the gas changes; the variety BRS sapphire is the most sensitive to saline stress; saline stress inhibits phytomass production of the varieties and strains studied in the cotton plant; varieties BRS green and BRS Topaz and strains CNPA/200906, CNPA/2009-27, CNPA/2009-42 e CNPA/2009-50 are the most tolerant to saline stress. / O aproveitamento de algumas áreas de regiões áridas e semiáridas esbarra em obstáculos como a salinidade e o potencial de sodicidade das águas, utilizadas na irrigação. O estresse salino, causado pelo manejo nem sempre adequado da irrigação, é um dos mais sérios fatores a limitar o crescimento e a produção das culturas, induzindo modificações morfológicas, estruturais e metabólicas nas plantas. Neste aspecto objetivou-se com este trabalho avaliar o comportamento vegetativos e fisiológico de quatro variedades e seis linhagens de algodão colorido, submetidas a três diferentes condições de estresse salino, em ambiente telado. O experimento foi conduzido nas instalações do Departamento de Engenharia Agrícola do Centro de Tecnologia e Recursos Naturais da UFCG, em parceria com a UEPB e EMBRAPA Algodão, todas sediadas em Campina Grande PB. Os tratamentos constaram de fatorial 10 x 3, constituído de 10 genótipos de algodão colorido (quatro variedades: BRS Rubi, BRS Safira, BRS Verde, BRS Topázio, e seis linhagens: CNPA/2009-06, CNPA/2009-11, CNPA/2009-13, CNPA/2009-50, CNPA/2009-27, CNPA/2009-42) e três condições de salinidade da água de irrigação, utilizando-se dos sais NaCl, CaCl2.2H2O e MgCl2.6H2O, na proporção 7:2:1, diluídos na água de abastecimento: 1) sem estresse, irrigadas as plantas com água de abastecimento com condutividade de 0,6 dSm-1 , durante o período experimental (até 43 dias após a semeadura (DAS); 2) uso de água com teor salino de 2 dSm-1, no período de 7 a 15 dias após a semeadura (DAS), intensificando-se o estresse salino a partir do 16º DAS, com aumento para 10 dSm-1, até o final do experimento aos 43 DAS; 3) água com teor salino de 5 dSm-1 de 7 a 15 dias após a semeadura (DAS), intensificando-se a partir do 16º DAS o estresse salino, com aumento para 10 dSm-1 até o final do experimento aos 43 DAS. O delineamento experimental foi em blocos casualizados, com três repetições, constituindo-se a parcela de 10 tubetes de 288 mL, contendo 1 planta cada. Foram avaliados: índice de velocidade de emergência de plântulas, número de folhas, altura da planta, diâmetro de caule, fitomassa (matéria seca de raiz, caule, folhas e fitomassa total da planta), e trocas gasosas (Condutância estomática, transpiração, fotossíntese e carbono interno). As avaliações foram iniciadas aos 15 dias e repetidas a cada 7. Os dados obtidos foram submetidos à análise de variância (p < 0,05). Verificou-se que o estresse salino causa alterações fisiológicas expressas em reduçao das trocas gasosas; a variedade BRS Safira é a mais sensível a estresse salino; o estresse salino inibe a produção de fitomassa das variedades e linhagens estudadas do algodoeiro; as variedades BRS Verde e BRS Topázio e as linhagens CNPA/2009-06, CNPA/2009-27, CNPA/2009-42 e CNPA/2009-50 são as mais tolerantes ao estresse salino.
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Crescimento, fisiologia e produção do algodoeiro sob efeito do silício via foliar / Growth, physiology and yield of cotton on leaf application of silicon

Ferraz, Rener Luciano de Souza 11 July 2012 (has links)
Made available in DSpace on 2015-09-25T12:22:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PDF - Rener Luciano de Souza Ferraz.pdf: 2240951 bytes, checksum: b1db5b1f977cd2955645b6fbb18269de (MD5) Previous issue date: 2012-07-11 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The cotton crop is considered a crop of significant socioeconomic and environmental importance. Its productive chain is on the second economic activity in the world, and the crop is considered trinit y for providing fiber, oil and energy. The productive chain of this oilseed crop still suffers by the lack of full utilization of appropriate technologies, which requires development and implementation of such technologies. The use of silicon in agriculture has shown promise in optimizing morphophysiological and biochemical aspects, as well on yield of plants. Another effective practice is the use of ecologically adapted cultivars to soil and climate conditions from ecosystems of cultivation. The aim of this work was to evaluate the growth, physiology and yield of cotton cultivars on leaf application of silicon. The experiment was carried out at Embrapa Algodão, Campina Grande, PB, Brazil, in a completely randomized design, mounted on 3 x 5 factorial scheme, with three cotton cultivars ( BRS Topázio , BRS Safira and BRS Rubi ), five concentrations of silicon (0 , 50, 100, 150 and 200 mg L -1 ), with four replications, applied weekly, by leaf application. Biometric, physiological, biochemical aspects and yield were evaluated. The data were submitted to analysis of variance, regression, correlation and mean test. Treatments had significant effect on growth, physiological, biochemical and yield variables. Evaluating the effects of factors it was found that the cultivars were different in relation to the analyzed aspects. It was recorded that concentrations of silicon promote significant variations on biometric, physiological and biochemical aspects. There were no differences on production and yield of cotton in response to silicon applications. On BRS Topázio cult ivar, the silicon increased the rate of stem expansion, photosynthesis, fluorescence of chlorophyll a , total chlorophyll and carotenoids. The application of silicon on BRS Safira increased plant height, growth rate, total chlorophyll, carotenoids and relative water content in the leaf. On BRS Rubi , the silicon increased the plant height, stem growth rate, fluorescence of chlorophyll a , photochemical efficiency and relative water content in the leaf. Silicon reduced the cellular extrusion in the three evaluated cultivars. / O algodão é considerado cultura de expressiva importância socioeconômica e ambiental, sua cadeia constitui-se na segunda atividade econômica do mundo, sendo considerada cultura trina por fornecer fibra, óleo e energia. A cadeia produtiva dessa oleaginosa ainda padece pela não utilização plena de tecnologias apropriadas, o que requer desenvolvimento e aplicação de tais tecnologias. A utilização de silício na agricultura tem-se mostrado promissora na otimização de aspectos morfofisiológicos, bioquímicos e rendimento das plantas. Outra prática eficaz é a utilização de cultivares ecoadaptadas às condições edafoclimáticas dos ecossistemas de cultivo. Diante do exposto, objetivou-se com este trabalho avaliar o crescimento, fisiologia e produção de cultivares de algodoeiro sob aplicação de silício via foliar. O experimento foi conduzido na Embrapa Algodão, em delineamento experimental inteiramente casualizado, montado em esquema fatorial 3 x 5, sendo três cultivares de algodoeiro ( BRS Topázio , BRS Safira e BRS Rubi ), cinco concentrações de silício (0, 50, 100, 150 e 200 mg L -1 ), aplicadas semanalmente via foliar e quatro repetições. Avaliaram-se aspectos biométricos, fisiológicos, bioquímicos e rendimento. Os dados foram submetidos à análise de variância, regressão, correlação e teste de médias. Os tratamentos exerceram efeito significativo sobre as variáveis de crescimento, fisiológicas, bioquímicas e produção. Desdobrando-se os efeitos dos fatores, verificou-se que, as cultivares diferiram entre si nos aspectos analisados. Registrou-se que as concentrações de silício promoveram variações significativas sobre os aspectos biométricos, fisiológicos e bioquímicos. Não houve diferenças nos componentes de produção e rendimento do algodoeiro em resposta às aplicações de silício. Na cultivar BRS Topázio , o silício aumentou a taxa de expansão caulinar, fotossíntese, fluorescência da clorofila a , clorofila total e carotenoides. A aplicação de silício, na BRS Safira , aumentou altura de planta, taxa de crescimento, clorofila total, carotenoides e conteúdo relativo de água na folha. Na BRS Rubi , o silício aumentou a altura de planta, taxa de expansão caulinar, fluorescência da clorofila a , eficiência fotoquímica e conteúdo relat ivo de água na folha. O silício reduziu a extrusão celular nas três cultivares avaliadas.
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Produtividade e qualidade de fibra de cultivares de algodoeiro em função de doses de nitrogênio /

Feltrin, Ednaldo Binhardi. January 2007 (has links)
Orientador: Enes Furlani Junior / Banca: Orivaldo Arf / Banca: Luiz Henrique Carvalho / Resumo: Em função dos altos níveis de produtividade alcançados nos cerrados, têm-se tentado transferir para o cultivo tradicional do sudeste, boa parte da tecnologia adotada nas extensas e essencialmente mecanizadas culturas daquela região. Entre outros fatores, destaca-se a adoção de níveis de adubação próprios daquela realidade e o semeadura de novas cultivares. O nitrogênio é considerado um dos nutrientes mais importantes para o algodoeiro devido a sua interferência nos aspectos de qualidade e quantidade da produção, sendo que os rendimentos maiores foram relatados em plantas que receberam dosagem de até 150 kg ha-1 de nitrogênio em cobertura. O objetivo deste trabalho foi avaliar a influência de doses crescentes de adubação nitrogenada, juntamente com diferentes cultivares quanto à produtividade e características de fibra do algodoeiro, cultivado em Leme-SP. O delineamento experimental empregado foi o de blocos ao acaso, no esquema fatorial 4x2 num total de 8 tratamentos, com 4 repetições, perfazendo 32 parcelas. Foi composto por doses crescentes de nitrogênio em cobertura: 16, 64, 144, e 256 kg ha-1; e duas cultivares de algodão: IAC 24 e Delta Opal. Pode-se concluir que a produtividade, o índice de amarelecimento, a massa de 100 sementes e a massa de 1 capulho tiveram aumento até a dose de 144 kg ha-1 de N. A porcentagem de fibra dos capulhos diminuiu de acordo com o aumento das doses de N. Os maiores teores foliares de N foram obtidos com a máxima aplicação de nitrogênio. / Abstract: In function of the high reached levels of productivity in the open pasture, they are had attemped to transfer to the southeastern traditional culture, good part of the technology adopted in the extensive and essentially mechanized cultures of that region. Among others factors, it is distinguished adoption of proper levels of fertilization of that new reality and the plantation of cultivating. The nitrogen is considered the one of the most important nutrients for the cotton plant due its interference in the aspects of quality and amount of the production, having been that the incomes biggest it had been told in plants that had received dosage from up to 150 kg ha-1 of nitrogen in covering. The objective of this work was to evaluate the influence of increasing doses of nitrogen fertilization, together different cultivating for that matter to the productivity and fiber characteristic of the cotton plant, cultivated in Leme-SP. The used experimental delineation was of blocks at random, in the factorial project 4x2 in a total of 8 treatments, with 4 repetitions, concluding 32 parcels. It was composed for increasing doses of nitrogen in covering: 16, 64, 144, and 256 kg ha-1; e two cultivates of cotton: 24 IAC and Opal Delta. It can be concluded that the productivity, index of the act of turning yellow, weight of 100 seeds and weight of 1 cotton boll had increase even the dose of 144 kg ha-1 of N. The fiber percentage of cotton boll it diminished in agreement with the increase of the levels of N. The greatest values of N was founded with the high application of nitrogen. / Mestre
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A Genome-Wide Characterization of Differentially Expressed Genes Encoding mRNAs and miRNAs and Methylation Analysis of Phytochrome Genes in a Cotton Phytochrome A1 RNAi line

Miao, Qing 09 December 2016 (has links)
Silencing phytochrome A1 gene (PHYA1) by RNA interference in upland cotton (Gossypium hirsutum L. cv. Coker 312) had generated PHYA1 RNAi lines with increased fiber length, strength and low micronair (finer fiber). In order to identify and characterize mRNAs and miRNAs that are differentially expressed in the RNAi plants, transcriptome and miRNAome analyses via high-throughput RNA sequencing were performed. Total RNA isolated from 10-DPA (days post anthesis) fibers and small RNAs isolated from 5-, 10-, and 15-DPA fibers of RNAi and Coker 312 lines were used to construct 6 RNA libraries and 18 small RNA libraries, respectively, which were sequenced using the Illumina HiSeq system. A total of 142 differentially expressed genes (DEGs) were identified in PHYA1 RNAi compared to Coker 312. GO analysis showed that these DEGs were mainly involved in metabolic pathways, binding and regulating enzymes (hydrolase, transferase, and oxidoreductase activities), and cell structures which were reported to play important roles in fiber development. Twenty-eight KEGG pathways were mapped for 142 DEGs, and the pathways related to glycolysis/gluconeogenesis and pyruvate metabolism were the most abundant, followed by cytochrome P450-involved pathways. Sixty-one conserved miRNA families and thirtyive novel miRNAs were identified in upland cotton. The targets of 6 conserved miRNAs, which expressed differentially in the RNAi line, were reported to participate in primary cell wall synthesis and phytohormone signaling pathways. The 35 novel miRNAs were identified in cotton for the first time, and their target genes were predicted. Nine novel miRNAs were identified to target cytochrome P450 TBP. Together, the results imply that miRNAs involved in fine-tune gene regulation might confer to the phenotype of the RNAi line with improved fiber quality. Besides characterizing mRNAs and miRNAs, the CpG site methylation status within coding regions of phytochrome genes in RNAi line in leaves and 10-DPA fibers was determined using bisulfite genomic sequencing. The PHYA1, PHYC and PHYE in RNAi line had higher methylation levels in leaves than those in Coker 312, but PHYB had lower methylation levels. In fibers, the methylation levels of PHYB also decreased in RNAi plants. However, the methylation of other phytochrome genes showed no significant changes.

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