Thesis (M.S.)--Rutgers University, 2007. / "Graduate Program in Ecology and Evolution." Includes bibliographical references (p. 62-64).

Thesis (Ph. D.)--Oregon State University, 1994. / Typescript (photocopy). Includes bibliographical references (leaves 108-121). Also available on the World Wide Web.

Thesis (Ph.D.)--Memorial University of Newfoundland, 1999. / Bibliography: leaves 212-224.

A heterogeneidade do habitat pode afetar diretamente ou indiretamente a disponibilidade de recursos necessários para a sobrevivência e reprodução das aves, uma vez que estas selecionam micro-habitats para forrageamento e sítios reprodutivos. As corujas são aves noturnas que desempenham um importante papel no equilíbrio do ecossistema, por evitar superpopulações de presas e eliminar indivíduos defeituosos. Essas aves são de pouquíssimo conhecimento e principalmente em relação ao uso de habitat. Entretanto, alguns trabalhos mostraram relações entre a distribuição e presença de corujas com características da estrutura da vegetação e com diferentes paisagens. Realizamos um estudo de revisão sobre o status da pesquisa cientifica em relação as corujas e podemos confirmar a carência em estudos com corujas que ocorrem no Brasil. A maior parte das pesquisas relacionadas com esse grupo de aves foram realizadas na América do Norte com apenas a citação de 4 espécies das 21 que ocorrem no Brasil. O tema seleção de habitat, genética e evolução, sistemática e técnicas foram pouquíssimos relatados nas publicações utilizadas nesta revisão. Por outro lado os nossos resultados sobre a influência de algumas variáveis da vegetação em relação à presença de corujas em diferentes fisionomias de Floresta Atlântica, mostraram a importância do uso de micro-habitats na floresta diferenciado por algumas corujas. As diferentes fisionomias da vegetação suportaram assembléias de corujas diferentes e as espécies Corujinha do mato (Ottus choliba), Murucututu da barriga amarela (Pulsatrix koeniswaldiana), Caburé miudinho (Glaucidium minutissimum) e a Coruja do mato (Ciccaba virgata) utilizaram significativamente alguns componentes da estrutura da vegetação. Os nossos resultados sugerem que diferentes fisionomias e estrutura da vegetação influenciam na ocorrência e na variação de espécies de corujas. Isso indica que a estrutura e a densidade da vegetação são importantes para a escolha de alguns tipos de micro-habitats na floresta produzidos por variações na distribuição espacial nos componentes de estrutura e densidade da vegetação. / The habitat heterogeneity can affect directly or indirect resources availability of necessary for the survival and reproduction the birds, a time that these selection micro-habitats for foraging and nest-sites. The owls are nocturnal birds that to play an important role in the balance of ecosystem, for preventing overpopulations of preys and eliminate faulty individuals. These birds were of very little knowledge and mainly in relation to the habitat use. However, some research had show to relations among the owls distributions and presence with characteristics of the structure of the vegetation and different landscape. We carry through a revision study about the status of scientific research in relations the owls and can confirm the really poor of the studies with owls that occur in Brazil. The great part of the research founded had been realized in North American with only the citation 4 species of the 21 that its occur in Brazil. The subject habitat selection, genetc and evolution, systematic and methods are very little related in publications used in this revision. However ours results on the influence among the owls presence with components of the structure of the vegetation in different Atlantic forest physiognomy, showed the importance of the use the microhabitat in the florest. The different physiognomy of the vegetation had supported assemblies of different owls composition of owls and the species Tropical screech-owl, Tawny-browed, Least pygmy-owl, Mottled owl had used significantly some components of the structure of the vegetation. Ours results suggest that different physiognomy and structure of the vegetation influence in the occurrence and variation of the composition of the owls. This indicates that the structure and the density of the vegetation are important for the choice of this habitat in the forest, so that the species can satisfy its biologic cycle and keep its populations.

Social behavior and habitat selection of river otters (Lontra canadensis) are highly variable among populations and there is limited information on how space use of this mustelid changes in human-modified environments. Understanding the spatial ecology of river otters is important for efforts focused on habitat management and preventing human-wildlife conflicts. My objectives were to quantify: (1) home ranges and core areas, (2) second- and third-order habitat selection, and (3) relationships between home-range size and intensity of human development for river otters in southern Illinois. VHF transmitters were used to track river otters during 2014-2016. Home-range and core-area sizes then were compared between males (n = 8) and females (n = 10), as was home-range overlap. I also compared the frequency individuals were located <25 m from a conspecific between sexes. Habitat selection at the second and third orders was analyzed with an eigen-analysis of selection ratios. Male river otters had larger home ranges and core areas than females. Home ranges of males overlapped frequently; lack of core-area overlap among females suggested they may be territorial. Males also were located <25 m from a conspecific more frequently than females (P = 0.023), and male-male dyads shared space more than male-female and female-female dyads (P = 0.002). Herbaceous and wooded wetlands were most strongly selected for at both second- and third-order scales, but streams and ponds also were selected. Regarding terrestrial cover types, river otters selected land with vegetative cover over areas with impervious surface (e.g., parking lots and shopping centers). Forests were selected over crop fields at the third-order, but not second-order, scale. Use of urbanized land was uncommon for river otters, and there was a positive relationship (P = 0.004) between home-range size and the percentage of home range within developed open space (e.g., roads and residential lawns). The habitat selection and sociality of river otters in southern Illinois varied among individuals, as it does among river otter populations throughout North America. By recording sex differences in social behavior and selection of aquatic and upland habitat, my study provides wildlife biologists with a better understanding of river otter space use throughout a rural-urban gradient.

A relação entre a paisagem e a distribuição da ocorrência e abundância das espécies no espaço é uma das questões centrais em ecologia, com importantes aplicações diretas em tempos de intenso uso da terra e mudanças climáticas por atividades humanas. Contudo, para inferirmos sobre essas relações, temos que descrever a paisagem da forma mais próxima possível de como as espécies realmente a percebem. Uma paisagem pode ser descrita em diferentes níveis hierárquicos de organização do ambiente (e.g. quantidade de um mineral no solo, número de plantas em uma parcela, área de cobertura de floresta...), e cada nível pode ser descrito em diferentes escalas (resolução e extensão de descrição). Os níveis e escalas com maior poder de previsão da ocorrência/abundância de uma espécie são chamados de nível de efeito e escala (extensão) de efeito. Nesta tese, utilizo armadilhas fotográficas e modelos hierárquicos para avaliar relações entre a paisagem e espécies de mamíferos e aves. Meus objetivos são: (1) avaliar se existe relação entre nível e extensão de efeito para prever a abundância de espécies e a área de vida ou massa das mesmas; (2) investigar características do solo que possam ser determinantes da distribuição de mamíferos e aves que consumem solo (geofagia); e (3) a partir de ralações espécie-paisagem, estimar a distribuição da densidade de uma espécie, o veado-catingueiro, para diferentes datas. Não há suporte para que a área de vida ou a massa de uma espécie sejam relevantes para o nível ou extensão em que uma paisagem deva ser descrita a fim de prever a abundância de uma espécie. Isso implica na importância de se avaliar diferentes níveis e extensões de uma paisagem quando na busca por relações espécie-paisagem. Fatores locais, como a argila ou minerais do solo, podem ser importantes para algumas espécies. Descobri que o veado-mateiro e o caititu selecionam solos para consumo com base na quantidade e tipo de argila. O caititu também seleciona solos com base na concentração de microminerais, assim como a juriti-azul, a arara-azul-grande, o mutum, o aracuã e a pomba-galega. Uma descrição da paisagem em nível de composição do solo pode ser relevante para avaliar a distribuição destas e outras espécies. Relações espécie-paisagem podem ser usadas para prever a abundância de espécies no espaço. Estimei a densidade do veado-catingueiro em 1992 (2,07 ind/km2) e em 2011 (7,31 ind/km2), para uma região de pecuária extensiva no nordeste do Pantanal onde foi criada uma reserva em 1997. A densidade desta espécie aumentou 3,5 vezes entre 1992 e 2011, com o fim da pecuária no local. Investigações multinível e multiescala de relações espécie-paisagem ainda são incipientes, embora importantes aplicações destas relações já venham sendo feitas há décadas. / The relationship between the landscape and the distribution of species’ occurrence and abundance is one of the main questions in ecology, with important applications for the current period of intense land use and climate change. However, to infer about these relationships, we have to describe the landscape as closely as possible to how species actually realize it. We can describe landscapes at different hierarchical levels of the environment (e.g. mineral amount in soil, number of plants in a plot, forest cover area…), and each level can be described at different scales (resolution and extent). The best levels and scales to predict species’ occurrence/abundance are known as level of effect and scale (extent) of effect. In this PhD thesis, I use camera traps and hierarchical models to assess relationships between the landscape and mammals or birds. My goals are: (1) to evaluate possible relationships between the level and extent of effect to predict species’ abundance and species’ home range or mass; (2) to investigate soil features important to the distribution of mammals and birds engaged on geophagy (soil consumption); and (3) from species-landscape relations, to estimate the density of a species, the Gray Brocket in space for different dates. There is no support for species’ home range or mass as relevant traits related to the level and scale that a landscape should be described in order to predict species’ abundance. This highlight the importance of evaluating different levels and scales of a landscape when searching for species-landscape relationships. Local factors such as clay or minerals may be important for some species. I found that the Red Brocket and Collared Peccary select soils for consumption based on clay amount and type. The Collared Peccary also selects soil based on the concentration of trace minerals, as well as Blue Ground-dove, Hyacinth Macaw, Bare-faced Curassow, Chaco Chachalaca, and Pale-vented Pigeon. Describing the landscape at soil composition level may be important to evaluate the distribution of these and another species. Species-landscape relationships can be used to predict the abundance of species in space at different dates. I estimated the density of the Gray Brocket in 1992 (2.07 ind/km2) and 2011 (7.31 ind/km2), in a livestock region in northeastern Brazilian Pantanal where a reserve was established in 1997. Gray Brocket density increased 3.5 times between 1992 and 2011, after livestock ban. Multi-level and multi-scale approaches to investigate species-landscape relationships are still emerging, though important applications of such relationships have been done for decades.

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio de Janeiro / Em estudos ecológicos é importante entender os processos que determinam a distribuição dos organismos. O estudo da distribuição de animais com alta capacidade de locomoção é um desafio para pesquisadores em todo o mundo. Modelos de uso de habitat são ferramentas poderosas para entender as relações entre animais e o ambiente. Com o desenvolvimento dos Sistemas de Informação Geográfica (SIG ou GIS, em inglês), modelos de uso de habitat são utilizados nas análises de dados ecológicos. Entretanto, modelos de uso de habitat frequentemente sofrem com especificações inapropriadas. Especificamente, o pressuposto de independência, que é importante para modelos estatísticos, pode ser violado quando as observações são coletadas no espaço. A Autocorrelação Espacial (SAC) é um problema em estudos ecológicos e deve ser considerada e corrigida. Nesta tese, modelos generalizados lineares com autovetores espaciais foram usados para investigar o uso de habitat dos cetáceos em relação a variáveis fisiográficas, oceanográficas e antrópicas em Cabo Frio, RJ, Brasil, especificamente: baleia-de-Bryde, Balaenoptera edeni (Capítulo 1); golfinho nariz-de-garrafa, Tursiops truncatus (Capítulo 2); Misticetos e odontocetos em geral (Capítulo 3). A baleia-de-Bryde foi influenciada pela Temperatura Superficial do Mar Minima e Máxima, no qual a faixa de temperatura mais usada pela baleia condiz com a faixa de ocorrência de sardinha-verdadeira, Sardinella brasiliensis, durante a desova (22 a 28C). Para o golfinho nariz-de-garrafa o melhor modelo indicou que estes eram encontrados em Temperatura Superficial do Mar baixas, com alta variabilidade e altas concentrações de clorofila. Tanto misticetos quanto os odontocetos usam em proporções similares as áreas contidas em Unidades de Conservação (UCs) quanto as áreas não são parte de UCs. Os misticetos ocorreram com maior frequência mais afastados da costa, em baixas temperaturas superficiais do mar e com altos valores de variabilidade para a temperatura. Os odontocetos usaram duas áreas preferencialmente: as áreas com as menores profundidades dentro da área de estudo e nas maiores profundidade. Eles usaram também habitats com águas frias e com alta concentração de clorofila. Tanto os misticetos quanto os odontocetos foram encontrados com mais frequência em distâncias de até 5km das embarcações de turismo e mergulho. Identificar habitats críticos para os cetáceos é um primeiro passo crucial em direção a sua conservação / A major problem in ecological studies is the understanding of what factors drive animals distribution. Studies investigating the distribution of high mobility animals is a challenge for scientists all over the world. In that sense, habitat use models are powerful toolsto understand relationship between animals and their environment. With Geographical Information System (GIS) development, habitat use models have been used in ecological studies. However, habitat use models, in several times, are built with misspecification, such as the independence assumption, that must be corrected. Spatial autocorrelation is a common problem in ecological studies. In this thesis, generalized linear models with spatial eigenvectors were used to investigate habitat use in cetaceans using physiographic, oceanographic and anthropogenic co-variates in Cabo Frio, RJ, Brazil, specifically: Brydes whale, Balaenoptera edeni (Chapter 1); bottlenose dolphins, Tursiops truncatus (Chapter 2); Misticetes and odontocetes (Chapter 3). Brydes whale was influenced by sea surface temperature minimum and maximum, in which the most common used strip correlates with Sardinella brasiliensis habitat use during reproduction periods (22 to 28C). For common bottlenose dolphin, the best model indicated they were more frequently found in low sea surface temperature, with high standard deviation and high chlorophyl concentration. Both misticetes and odontocetes used in similar proportion the Conservation Unit areas and non- Conservation Unit areas. Misticetes occurred more often more distant from coast, in low sea surface temperature with high standard deviation. Odontocetes used areas with lowest and highest depths. They also used cold waters and with high chlorophyll concentration. Both misticetes and odontocetes were found more frequently up to 5km from tour and scuba dive boats. Identifying critical habitats for cetaceans is a first crucial step towards their conservation

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / The small-mammal community structure of two conservation unit (CUs), Taim Ecological Station (TES) and Espinilho State Park (ESP), of the Pampa biome in southern Brazil, was investigated and compared regarding species richness, composition and abundance. Additionally, a Deciduous forest area was compared with those ones. For this purpose, ten transects with live-traps pitfall traps were used. In addition, sixteen environmental variables were measured in the TES to verify the small-mammal micro-spatial distribution. During six field phases in each area, 11 species were capture at TES, while nine species were captured in the ESP. The two areas of the Pampa biome showed high species richness when compared to forested areas, since both are influenced by other biomes: TES by the Atlantic Forest, as it is close to the coastal region, and the ESP by the interior of the continent biomes, Chaco and Espinal. The abundance and composition were different due to environmental heterogeneity, biogeography effect, size areas and degree of disturbance. However, environmental heterogeneity allows both areas to have similar species richness. When compared with the Atlantic forest CU, they differ in species richness, composition and abundance of individuals due to greater homogeneity and complexity of the forested area. With respect to the microspatial distribution, species richness and abundance were associated with sites close to water, with greater availability of arthropods and herbs. Since there is great variability of environments at TES, the heterogeneity is primarily responsible for the variation in richness and abundance of small mammals among microhabitats. The analysis indicated a significant effect of environmental variables on species abundance, showing the selection of some environments more often than others. / A estrutura da comunidade de pequenos mamíferos de duas Unidades de Conservação (UCs), a Estação Ecológica do Taim (ESET) e o Parque Estadual do Espinilho (PEE), do bioma Pampa no sul do Brasil, foi investigada e comparada quanto à riqueza, composição e abundância de espécies. Adicionalmente, uma área de Floresta Estacional Decidual, foi comparada com essas duas. Para tanto, foram utilizadas transecções com armadilhas convencionais e de queda. Ainda, na ESET dezesseis variáveis ambientais foram mensuradas para verificar a distribuição micro-espacial de pequenos mamíferos. Durante seis fases de campo em cada área, 11 espécies foram capturadas na ESET, enquanto nove foram capturadas no PEE. As duas áreas do bioma Pampa apresentaram alta riqueza de espécies quando comparadas a áreas florestadas, já que ambas sofrem influência de outros biomas: a ESET da Mata Atlântica, por se situar na região costeira, e o PEE dos biomas do interior do continente, Chaco e Espinal. A abundância e a composição foram diferentes, devido à heterogeneidade ambiental, efeito biogeográfico, diferença no tamanho das áreas e grau de perturbação. Porém, a heterogeneidade ambiental permite que ambas as áreas possuam riqueza de espécies similar. Quando comparadas com a UC de Floresta Atlântica, diferem na riqueza, composição e abundância de espécies devido à maior homogeneidade e complexidade da área florestada. Com relação à distribuição micro-espacial, a riqueza e a abundância estiveram associadas a locais próximos à água, maior disponibilidade de artrópodes e herbáceas. Uma vez que existe uma grande variabilidade de ambientes na ESET, a heterogeneidade é a principal responsável pela variação na riqueza e abundância de pequenos mamíferos entre os microhabitats. As análises mostraram um efeito significativo das variáveis ambientais na abundância das espécies, evidenciando a seleção de alguns ambientes mais favoráveis em detrimento a outros.

Habitat fragmentation is a fundamental process that determines trends and patterns of distribution and density of organisms. These patterns and trends have been the focus of numerous terrestrial and marine studies and have led to the development of several explanatory hypotheses. Systems and organisms are dynamic and no single hypothesis has adequately accounted for these observed trends. It is therefore important to understand the interaction of these processes and patterns to explain the mechanisms controlling population dynamics. The main aim of this thesis was to test the effect of patch size and isolation on organisms with different modes of dispersal. Mode of dispersal has previously been examined as a factor influencing the effects that habitat fragmentation has on organisms. Very few studies have, however, examined the mode of dispersal of marine organisms because it has long been assumed that marine animals are not directly influenced by habitat fragmentation because of large-scale dispersal. I used two co-occurring species of siphonariid limpets with different modes of dispersal to highlight that not only are marine organisms affected by habitat fragmentation but that they are affected in different ways. The two species of limpet, Siphonaria serrata and Siphonaria concinna, are found within the same habitat and have the same geographic range along the South African coastline, however, they have different modes of dispersal and development. The effect of patch size on organism density has been examined to a great extent with varied results. This study investigated whether habitat patch size played a key role in determining population density and limpet body sizes. The two species are found on the eastern and southern coasts of South Africa were examined across this entire biogeographic range. Patch size was found to have a significant effect on population density of the pelagic developer, S. concinna, but not the direct developing S. serrata. Patch size did play a role in determining limpet body size for both species. S. concinna body size was proposed to be effected directly by patch size whilst S. serrata body size was proposed to be affected indirectly by the effects of the S. concinna densities. The same patterns and trends were observed at five of the seven examined regions across the biogeographic range. The trends observed for S. concinna with respect to patch size conform to the source-sink hypothesis with large habitat patches acting as the source populations whilst the small habitat patches acted as the sink populations. Many previous studies have focused on the effects of habitat patch size at one point in time or over one season. I tested the influence of habitat patch size on the two species of limpets over a period of twelve months to determine whether the trends observed were consistent over time or whether populations varied with time. S. concinna showed a consistently significant difference between small and large patches; whilst S. serrata did not follow a consistent pattern. The mode of dispersal for the two limpets was used to explain the different trends shown by the two species. This examination allowed for the determining of source and sink populations for S. concinna through the examination of fluctuations in limpet body sizes and population densities at small and large habitat patches over twelve months. The direct developing S. serrata trends could not be explained using source-sink theory, as populations were independent from one another. S. serrata demonstrated body size differences at small and large patches which, may be explained by interspecific and intraspecific competition. Habitat isolation is known to play an important role in determining the structure of assemblages and the densities of populations. In this study the population density of the pelagic developing S. concinna showed a weak influence of degree of isolation whilst that of the direct developing S. serrata did not, which may be because of habitat patches along the South African coastline not having great enough degrees of isolation. The population size-structure was influenced directly influenced by isolation for S. concinna, whilst the different population size structure for S. serrata may be explained by assemblage co-dependence. The mode of dispersal showed effects on the relationship of population density and population size-structure with habitat size and isolation. This study indicates the importance of investigating patterns and processes across a range of spatial and temporal scales to gain a comprehensive understanding of factors effecting intertidal organisms.

A heterogeneidade do habitat pode afetar diretamente ou indiretamente a disponibilidade de recursos necessários para a sobrevivência e reprodução das aves, uma vez que estas selecionam micro-habitats para forrageamento e sítios reprodutivos. As corujas são aves noturnas que desempenham um importante papel no equilíbrio do ecossistema, por evitar superpopulações de presas e eliminar indivíduos defeituosos. Essas aves são de pouquíssimo conhecimento e principalmente em relação ao uso de habitat. Entretanto, alguns trabalhos mostraram relações entre a distribuição e presença de corujas com características da estrutura da vegetação e com diferentes paisagens. Realizamos um estudo de revisão sobre o status da pesquisa cientifica em relação as corujas e podemos confirmar a carência em estudos com corujas que ocorrem no Brasil. A maior parte das pesquisas relacionadas com esse grupo de aves foram realizadas na América do Norte com apenas a citação de 4 espécies das 21 que ocorrem no Brasil. O tema seleção de habitat, genética e evolução, sistemática e técnicas foram pouquíssimos relatados nas publicações utilizadas nesta revisão. Por outro lado os nossos resultados sobre a influência de algumas variáveis da vegetação em relação à presença de corujas em diferentes fisionomias de Floresta Atlântica, mostraram a importância do uso de micro-habitats na floresta diferenciado por algumas corujas. As diferentes fisionomias da vegetação suportaram assembléias de corujas diferentes e as espécies Corujinha do mato (Ottus choliba), Murucututu da barriga amarela (Pulsatrix koeniswaldiana), Caburé miudinho (Glaucidium minutissimum) e a Coruja do mato (Ciccaba virgata) utilizaram significativamente alguns componentes da estrutura da vegetação. Os nossos resultados sugerem que diferentes fisionomias e estrutura da vegetação influenciam na ocorrência e na variação de espécies de corujas. Isso indica que a estrutura e a densidade da vegetação são importantes para a escolha de alguns tipos de micro-habitats na floresta produzidos por variações na distribuição espacial nos componentes de estrutura e densidade da vegetação. / The habitat heterogeneity can affect directly or indirect resources availability of necessary for the survival and reproduction the birds, a time that these selection micro-habitats for foraging and nest-sites. The owls are nocturnal birds that to play an important role in the balance of ecosystem, for preventing overpopulations of preys and eliminate faulty individuals. These birds were of very little knowledge and mainly in relation to the habitat use. However, some research had show to relations among the owls distributions and presence with characteristics of the structure of the vegetation and different landscape. We carry through a revision study about the status of scientific research in relations the owls and can confirm the really poor of the studies with owls that occur in Brazil. The great part of the research founded had been realized in North American with only the citation 4 species of the 21 that its occur in Brazil. The subject habitat selection, genetc and evolution, systematic and methods are very little related in publications used in this revision. However ours results on the influence among the owls presence with components of the structure of the vegetation in different Atlantic forest physiognomy, showed the importance of the use the microhabitat in the florest. The different physiognomy of the vegetation had supported assemblies of different owls composition of owls and the species Tropical screech-owl, Tawny-browed, Least pygmy-owl, Mottled owl had used significantly some components of the structure of the vegetation. Ours results suggest that different physiognomy and structure of the vegetation influence in the occurrence and variation of the composition of the owls. This indicates that the structure and the density of the vegetation are important for the choice of this habitat in the forest, so that the species can satisfy its biologic cycle and keep its populations.