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Cell Cycle Regulation of DNA Mismatch Repair Protein Expression and Activity at the H-ras Oncogenic Hot Spot

Edelbrock, Michael Aaron 13 November 2007 (has links)
No description available.
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Tabu search algorithm for a thermal aware VLSI floorplanning application

Iyer, Krishnakumar R. January 2013 (has links)
No description available.
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Aspectos florísticos, estruturais e fitogeográficos do componente arbóreo em florestas maduras na Serra da Mantiqueira Sul, Minas Gerais, Brasil

Almeida, Vinicius Campos de 28 July 2016 (has links)
Submitted by Renata Lopes (renatasil82@gmail.com) on 2017-05-15T20:02:34Z No. of bitstreams: 1 viniciuscamposdealmeida.pdf: 3230677 bytes, checksum: cc94cfae1c496f3ef9e4cf6b52fcd52f (MD5) / Approved for entry into archive by Adriana Oliveira (adriana.oliveira@ufjf.edu.br) on 2017-05-17T16:05:34Z (GMT) No. of bitstreams: 1 viniciuscamposdealmeida.pdf: 3230677 bytes, checksum: cc94cfae1c496f3ef9e4cf6b52fcd52f (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-17T16:05:34Z (GMT). No. of bitstreams: 1 viniciuscamposdealmeida.pdf: 3230677 bytes, checksum: cc94cfae1c496f3ef9e4cf6b52fcd52f (MD5) Previous issue date: 2016-07-28 / A busca da compreensão da complexidade das florestas tropicais tem relevância cada vez mais reconhecida em políticas de conservação e de recuperação de ecossistemas degradados e qualidade ambiental de paisagens alteradas. A presença humana tornou-se, a partir dos cinco últimos séculos, um fator de destituição da identidade da Floresta Atlântica, tornando-o um dos domínios naturais mais ameaçados do mundo, onde são raros os testemunhos de florestas primitivas. Iniciativas de conservação dos remanescentes florestais representam uma possibilidade de salvaguarda da Floresta Atlântica. Reservas Particulares do Patrimônio Natural (RPPNs) surgem como uma importante instrumento na busca da intermediação de aspectos sociais, econômicos e ambientais. A porção setentrional da Mantiqueira Sul possui poucas Unidades de Conservação e a identidade única e relevância conservacionista de seus ecossistemas florestais ainda não são devidamente reconhecidas. Tal situação provavelmente se deve a uma lacuna no conhecimento desses remanescentes. Visando contribuir para o conhecimento científico dessa região, foram realizados em três RPPNs (Brejo Novo - BN; Mato Limpo - ML; e Fazenda da Serra - FS) inventários fitossociológicos (DAP ≥ 5 cm) de um hectare de floresta em cada uma e análises estratificadas com DAPs ≥ 5, 10 e 30 cm. Foi feita também a comparação de dados obtidos com os de outros levantamentos de trechos da Floresta Atlântica considerados “bem conservados” ou “maduros”. Para a verificação das influências florísticas e fitogeográficas foram compiladas a distribuição geográfica e status de conservação das espécies identificadas e analisados padrões fitogeográficos e influências ambientais dentro de um contexto de 897 áreas da Floresta Atlântica. Foram registrados nas três áreas 5501 indivíduos, pertencentes a 374 espécies. Brejo Novo contabilizou 167 espécies, ML contabilizou 173 espécies e FS contabilizou 227 espécies. O índice de diversidade de espécies (H’) foi, para BN, ML e FS, respectivamente, de 4,36; 4,33; e 4,70 nats.ind-1. A equabilidade (J) foi 0,85; 0,84; e 0,87, respectivamente. A área basal total foi de 32,94; 37,83; e 44,86 m².ha-1, respectivamente. A análise estratificada do componente arbóreo propiciou uma visão menos estática das relações florísticas e estruturais das florestas, favorecendo melhor compreensão do andamento do processo sucessional e demonstrando que interpretações acerca desse processo, baseadas somente no percentual de espécies raras, podem propiciar interpretações equivocadas. Dentro da tendência geral dos dados, conclui-se que os valores percentuais de árvores mortas apresentados pelas três áreas de estudo não se mostraram bons indicadores de seu status de conservação. Os padrões encontrados evidenciam as áreas de estudo como referenciais da variabilidade natural da Floresta Atlântica em seu processo sucessional tardio. A comparação das três áreas com o conjunto das áreas tomadas como referência reforça esse achado. A flora encontrada demonstra forte influência do domínio fitogeográfico atlântico, particularmente da Floresta Ombrófila. O percentual de espécies exclusivas de cada uma das três áreas demonstra o alto valor de substituição de espécies ao longo do gradiente formado entre elas, ao redor do qual se ajuntam influências florísticas variadas. Esse grupo de contribuições exclusivas também é constituído principalmente por espécies pouco representadas em número de indivíduos. Essas características, chave da relevância das áreas de estudo, também apontam para a singularidade dessa porção da Mantiqueira para a conservação da Floresta Atlântica. Assim, também fica evidenciada a importante contribuição das RPPNs como instrumento voluntário, capaz de salvaguardar o que escapa às prioridades estabelecidas pelas políticas públicas de conservação. / The quest to understand the complexity of tropical forests has had its relevance recognized in policies for the conservation and recovery of degraded ecosystems, and of environmental quality in altered landscapes. The presence of man has become, along the past five centuries, a factor of destitution of the identity of the Atlantic Forest, making it one of the most endangered natural domains of the world, where testimonies of primitive forests are rare. Initiatives for the conservation of forest remainders represent an opportunity to safeguard the Atlantic Forest, and the Private Reserves of Natural Heritage (RPPN) emerge as an important tool to pursue intermediation of social, economic, and environmental aspects. The northern portion of the South Mantiqueira has few protected areas, and the unique identity and conservationist importance of its forest ecosystems are not yet duly recognized. This situation is probably due to a lack of knowledge about those forest remainders. In order to contribute to scientific knowledge about the area, phytosociological inventories (DBH ≥ 5 cm) were performed in one hectare of forest in each of the three Private Reserves of Natural Heritage (Brejo Novo - BN, Mato Limpo - ML, and Fazenda da Serra - FS), followed by stratified analyses with DBHs ≥ 5, 10 and 30 cm. A comparison was also made between data thus obtained and data obtained in surveys of other stretches of the Atlantic Forest considered "well-maintained" or "mature". In order to verify the floristic and phytogeographic influences, the geographical distribution and conservation status of the species identified were compiled, then phytogeographic patterns and environmental influences were analyzed within a context of 897 areas of the Atlantic Forest. In the three areas were recorded 5501 individuals belonging to 374 species. BN had 167 species, ML had 173 species and FS had 227 species. The species diversity index (H') was respectively 4.36; 4.33; and 4.70 nats.ind-1 for BN, ML, FS. The evenness (J) was 0.85; 0.84; 0.87, respectively. The total basal area was 32.94; 37.83; and 44.86 m².ha-1, respectively. Stratified analysis of the arboreal component provided a less static view of the floristic and structural relations of forests, fostering a better understanding of the progress of the succession process, and demonstrating that interpretations of this process based only on the percentage of rare species can promote misinterpretations. Within the general trend of data collected, we may conclude that the percentages of dead trees seen in the three areas of study were not good indicators of the conservation status of those areas. The patterns found show that the areas of study are referential of the natural variability of the Atlantic Forest, in their late succession process. The comparison between those three areas and the group of areas taken as a reference reinforces this finding. The flora found shows a strong influence of the Atlantic phytogeographic domain, especially of the Ombrophilous Forest. The percentages of species that are exclusive of each of the three areas demonstrate the high proportion of species replacement along the gradient formed between them, around which varied floristic influences are gathered. This group of unique contributions is also composed mainly of species represented by a small number of individuals. These characteristics, a key of the relevance of the study areas, also point to the uniqueness of this portion of the Mantiqueira for the conservation of the Atlantic Forest. Thus, we hope to highlight the important contribution of private reserves as a voluntary instrument able to safeguard that which is not included in the priorities set by public conservation policies.
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Trådlöst campus i Växjö

Dich, Silas January 2005 (has links)
Internet Service Providers (ISP) har på senare år etablerat ett ökat antal Wi-Fi Hotspots på publika platser för att erbjuda Internettjänster så som e-post, Web och andra Internet-baserade program, till resande användare. Exempel på dessa platser är flygplatser, skolor, parker och städer. Växjö universitet har valt att bygga etttrådlöst nätverk på campus som man ska påbörja under sommaren 2005. Uppsatsen tar upp detta som fallstudie för diskussion av ämnet. / Lately Internet Service Providers (ISP) have established an increased amount of Wi-Fi Hotspots at public places to offer Internet based services like e-mail, web surfing etc to roaming users. Example of places like this are airports, schools, parks and cities. Växjö University has decided to implement a wireless network covering the university campus. This project is planned to start during summer of 2005. This project is the unicase for discussion in this bachelor thesis
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Java jämfört med C#, vilken sorterar snabbast på Raspberry Pi? / Java compared to C#, which sorts fastest on Raspberry Pi?

Olofsson, Christoffer January 2015 (has links)
I denna studie skall Java och C# ställas mot varandra och köras på en Raspberry Pi för att se vilken av dem som kan sortera heltalsvektorer snabbast. Som Java-motor kommer Hot-Spot att användas och Mono för C# och de ska sortera vektorer med sorteringsalgoritmer från språkens stödbibliotek och en implementerad algoritm baserad på urvalssortering. Detta arbete är till för att dem som vill arbeta med ett objektorienterat språk på Raspberry Pi, men inte har bestämt sig än för vilket som skall användas. Resultatet visar att Java presterar bättre än C# i de flesta fall och att det finns undantag då C# presterar bättre. / In this study, Java and C# is set against each other and running on a Raspberry Pi to see if they have similar processing times, or if there is a clear difference between the two languages. As Java-engine HotSpot will be used and Mono for C# and they will sort vectors with sorting algorithms from the language's support library and one implemented algorithm based on selection sort. This work is for those who want to work with an object-oriented language on Raspberry Pi, but has not decided yet on which one to choose. The result shows that Java performs better than C# in most cases, but in some cases C# is performing better.
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Ecologia, conservação e aspectos taxonômicos do gênero neotropical Davilla Vand. (Dilleniaceae) / Distribution Modeling and Conservation of Davilla Vand. (Dilleniaceae Salisb.).

Pereira, Ismael Martins 06 June 2014 (has links)
Neste trabalho realizou-se o estudo de distribuição, riqueza e conservação do gênero Davilla Vand. (Dilleniaceae) no Neotrópico. Para tal utilizou-se a modelagem de distribuição de espécies com o algoritmo Maxent. Este produz distribuição das espécies no espaço geográfico a partir de dados ambiental e de ocorrência. Foram estudadas as espécies de acordo com o bioma de ocorrência: Mata Atlântica; Cerrado; e Amazônia. Este grupo está representado no Neotrópico por 25 espécies. Para o Cerrado incluiu-se além das espécies do gênero Davilla as demais espécies da família Dilleniaceae. Os resultados indicaram que no Cerrado o grupo está representado por nove espécies de Davilla, além de Curatella americana L. e três espécies de Doliocarpus Rol., destas cinco são endêmicas (Doliocarpus elegans Eichler e 4 Davilla spp.). Para a Mata Atlântica ocorrem 12 espécies de Davilla, oito delas são endêmicas, incluindo uma espécie ameaçada de extinção. Para a Floresta Amazônica são conhecidas nove espécies, cinco delas endêmicas. Duas outras espécies são Neotropicais, portanto, compartilhadas por todos os biomas citados anteriormente. As demais espécies são de ocorrência em pelo menos dois biomas. Para estes três biomas produziu-se a distribuição e a riqueza de espécies visando comparar os resultados com as unidades de conservação, objetivando discutir questões relativas à conservação deste grupo. Os parâmetros conservacionistas como espécies raras, zonas de endemismo, zonas de alta riqueza, áreas de preservação ambiental, foram confrontados objetivando indicar áreas prioritárias para a conservação do grupo e da biodiversidade. Os resultados indicaram existir três centros de diversidade para este grupo. O principal deles está localizado na Mata Atlântica, principalmente nas florestas litorâneas do estado da Bahia. Outro centro de diversidade localiza-se na região central do Cerrado, especialmente nos estados de Goiás e Bahia. A outra área de diversidade localiza-se próximo à foz do Rio Amazonas e ao longo de seu curso. Devido ao hábito predominante das espécies serem lianas, estas são importantes componentes das florestas, das quais usamos este referencial para discutir questões relativas à conservação destes habitats, de suas espécies e da biodiversidade. As informações completas estão apresentadas nos capítulos de acordo com os respectivos biomas abordados. / In this study was realized to study the distribution, richness and conservation of the Davilla Vand. (Dilleniaceae) in the neotropics. For this purpose was used to distribution model of species with Maxent algorithm. This produces species distribution in geographic in space based on environmental and occurrence data. Species in accordance with biome of occurrence were studied: Atlantic Forest; Cerrado; and the Amazon. This group is represented by 25 species in the neotropics. For the Cerrado was included in addition to the Davilla species all species of Dilleniaceae family. The results indicated that in the Cerrado this group is represented by nine species of Davilla, and Curatella americana L. and three species of Doliocarpus Rol., to these five are endemic (Doliocarpus elegans Eichler and 4 Davilla spp.). For Atlantic Forest occur 12 Davilla species, eight of which are endemic, including an endangered species. For the Amazon are known nine species, five of these endemic. Two other neotropical species are therefore shared by all biomes mentioned above. The other species are occurring in at least two biomes. For these three biomes produced the distribution and species richness in order to compare the results with the protected areas, aiming to discuss issues relating to the conservation of this group. Conservationists parameters as rare species, areas of endemism, areas of high species richness, conservation areas, were confronted aiming indicate priority areas for conservation of biodiversity and too this group. The results indicated three centers of diversity for this group. The main one is located in the Atlantic Forest in coastal forests of Bahia. Another center of diversity is located in central region of Cerrado, especially in the states of Goias and Bahia. The other area of diversity is located near the mouth of the Amazon River and along its course. Due to the prevailing habit of the species are lianas, these are important components of forests, of which we use this framework to discuss issues relating to the conservation of these habitats, their species and biodiversity. Full details are presented in chapters according to their biomes addressed.
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Tree growth response to climate change in two threatened South American Biomes: Brazilian Atlantic Forest and Chilean Mediterranean Forest / Resposta do crescimento das árvores às mudanças climáticas em dois biomas sul-americanos ameaçados: Mata Atlântica Brasileira e Floresta Mediterrânea Chilena

Venegas González, Alejandro Danilo 06 December 2017 (has links)
Biomes classified as Brazilian Atlantic Forest (BAF) and the Chilean Mediterranean forest (CMF) have been affected by anthropic pressure that has caused a considerable decrease of their forest surfasse. However, they are rich in biodiversity and they provide many ecosystem services and were, therefore, classified as \"hotspots\" (forests in risk). Therefore, is essential to study the natural dynamics and the climatic response of the trees of these forests to include conservation projects and strategic measures. To achieve these objectives, the scientific literature reports that tree growth rings are the only ecological indicators with annual resolution that can be efficient and highly accurate to obtain this information. In this context, the research project has as main objective the retrospective analysis of radial growth of forest species in different vegetation communities of BAF and CMF in response to climatic changes. To achieve this goal, four key questions were elaborated: 1) Which variable explains betterthe variability of radial growth at different spatial and temporal scales? 2) What is the growth resilience to recent climate changes? 3) Is there some more vulnerable population to expected climatic changes?. A total of five sites (seven populations) of Cedrela odorata and C. fissilis in BAF from the State of São Paulo in Brazil, and five sites (10 populations) of Nothofagus macrocarpa (FMC) from the central region of Chile were sampled, using a non-destructive method. Four chapters were developed to answer these questions. Chapter I seek to analyze the resilience in radial growth to changes in regional climate variability and droughts, in temporal and spatial scale, on Atlantic forest remnant forests of biogeographic region Serra do Mar. Results show that radial growth in wet sites (winter rains exceed 240 mm) depend on the moisture conditions in dry season, while the higher population is more sensitive to the favorable summer water condition, which would be explained because this population received a lower temperature than the other Cedrela spp. populations studied. Chapter II analyzed how recent climatic variability affected the radial growth in N. macrocarpa populations. It is observed that all the populations are closely linked to the precipitations of May-November (end of autumn/end of spring) and average temperature of October-December (mid-spring/early summer). In Chapter III, we continued exploring the growth responses to climate in the FMC populations in order to find biogeographic differences. In this sense, we evaluated if this significant decrease in tree growth is differentiated between populations and age classes, and determine if the positive effect of CO2 fertilization compensates the precipitation decrease and temperature increase in the last decades in the growth of older, maturer and younger trees . Results show a significant negative trend in all classes from the year 2000, which would be associated to a decrease in precipitation in all populations while temperature was more associated with the northern and southern populations (distribution limit). We did not find a positive effect of rising CO2. Finally, chapter IV integrated the results of the two biomes comparing the projections of aboveground trees biomass under two climatic scenarios of CMIP5 project (light and severe), in order to know which populations are more vulnerable to rising temperature forecasted by year 2100, using ring width data, wood density and allometric equations. This study will provide an overview of adaptation to recent and projected climatic changes of two hotspot neotropical biomes. Although they are different in structure-biodiversity-climate are in risk. Thus, we can understand the vulnerability of threatened forests in South America to global warming that, although they are in protected areas, does not guarantee their persistence. / Os biomas classificados como Mata Atlancia Brasileira (MAB) e da Floresta Mediterrânea Chilena (FMC) têm sido afetados pela pressão antrópica que tem causado uma diminuição considerável de sua superfície florestal. No entanto são ricas em biodiversidade e providenciam muitos serviços ecossistêmicos, pelo que foram classificadas como hotspot (florestas em risco). Portanto, é fundamental estudar a dinâmica natural e a resposta climática das árvores dessas florestas para incluir em projetos de conservação. Para atingir esses objetivos, a literatura científica reporta que os anéis de crescimento das árvores são os únicos indicadores ecológicos com resolução anual que podem ser eficientes e de elevada precisão para obter essas informações. Neste contexto, o projeto de pesquisa tem como objetivo geral a analise retrospectivo de crescimento radial de espécies florestais em diferentes comunidades vegetacionais da MAB e FMC em resposta às mudanças climaticas. Para atingir esse objetivo foram elaboradas quatro perguntas-chave: 1) Que variable explica melhor a variabilidade do crescimento radial a diferentes escalas espaciais e temporais? 2) Qual é a resiliência em crescimento das árvores às mudanças climáticas recentes? 3) Há alguma população mais vulnerável respeito às mudanças climaticas esperadas?. Foram coletadas amostras de lenho, através de método não destrutivo, de cinco sitios (sete populações) de Cedrela odorata e C. fissilis na MAB no estado de São Paulo em Brasil, e cinco sitios (10 populações) de Nothofagus macrocarpa na FMC na região central do Chile, para aplicação de tecnicas dendrocronologicas. Para responder essas questões foram desenvolvidos quatro capitulos. O capitulo I busca analisar a resiliência em crescimento radial às mudanças na variabilidade climática regional e secas, em escala temporal e espacial, em florestas remanentes da região biogeográfica Serra do Mar da Mata Atlântica, usando as especies bioindicadoras Cedrela fissilis and C. odorata. Os resultados mostram que o crescimento radial dos sítios mais úmidos (chuvas no inverno superam os 240 mm) dependem das condições hidricas da estação seca, enquanto que a população mais alta é mais sensível à condição hídrica favorável do verão, qual seria explicado porque essa população recebi uma menor temperatura respeito às outras populações de cedrela estudadas. No capitulo II analisou-se como a variabilidade climática recente estaria afeitando o crescimento radial in N. macrocarpa populations. Observa-se que todas as populações estão estreitamente ligadas às precipitações de Maio-Novembro (fim de outono/fim de primaveira) e temperatura média de Outubro-Dezembro (mediados de primaveira/inicios do verão). Especificamente, há uma tendencia negativa significativa no crescimento radial apartir de 1980 que esta associada a uma variação do clima regional. No capitulo III, continuo-se explorando as respostas do crescimento radial ao clima nas populações da FMC com objetivo de encontrar diferencias biogeográficas. Neste sentido, foi avaliado se essa diminuição significativa de crescimento é diferenciada entre populações e classes de idade, e analisar se o efeito positivo da fertilização de CO2 compensa a diminuição da precipitação e aumento da temperatura nas ultimas decadas no crescimento de árvores velhos, maduros e jovens. Os resultados mostram uma tendencia negativa significativa em todas as clases apartir do ano 2000, qual estaria associada a diminuição da precipitação em todas as populações enquanto a temperatura teve mais associada às populações do sul. Não foi encontrado um efeito positivo do aumento de CO2. Finalmente, o capitulo IV integrou os resultados dos dois biomas comparando as proyeções de biomasa arborea sob dois escenarios climáticos do projeto CMIP5 (leve e severo), com objetivo de conocer quais populações são mais vulneraveis ao aumento da temperature previsto para o ano 2100, usando crescimento radial, densidade de madeira e ecuações alométricas. Os resultados mostram que a população com maior influencia urbana e a mais seca são as mais vulneráveis ao aumento exarcerbado de temperatura nas regiões de MAB and FMC, respectivamente. O presente estudo permitiu-nos apresentar uma visão da adaptação às mudanças climáticas recentes e projetadas de dois biomas hotspot. Embora sejam diferentes em estrutura-biodiversidade-clima estão em risco. Assim, podemos entender a vulnerabilidade de florestas neotropicais ao aquecimento global, embora estejam em áreas protegidas, não garante sua persistência.
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Biodiversidade e modelagem estatística da comunidade de poliquetas de fundos inconsolidados do complexo recifal Sebastião Gomes, Banco dos Abrolhos (BA, Brasil) / Biodiversity and statistical modeling of polychaete community in soft bottom of Sebastião Gomes reef complex, Abrolhos Bank (BA, Brazil)

Silva, Michele Quesada da 21 August 2013 (has links)
Embora recifes de coral sejam hotspots de biodiversidade para corais e peixes, não se sabe se são para pequenos invertebrados marinhos. Este estudo visou verificar se o complexo recifal Sebastião Gomes é um hotspot de biodiversidade de poliquetas, bem como caracterizar a comunidade estrutural e funcional desses organismos que habitam o sedimento ao redor do recife. Através de modelos lineares generalizados (glm), tendo como variáveis preditoras características do sedimento e/ou posicionamento das estações de coleta ao redor do recife (transectos perpendiculares às faces sul, oeste, norte e leste), buscou-se compreender os padrões de: diversidade alfa; abundância total de poliquetas; abundância das espécies mais representativas; e abundância dos diferentes hábitos tróficos. Foram coletados 2399 indivíduos identificados em 116 espécies, indicando que Sebastião Gomes pode ser um hotspot. Todos descritores da comunidade foram maiores próximos ao recife, onde predominaram sedimentos grossos e carbonáticos. Já a posição ao redor do recife foi importante apenas para alguns descritores, tais como abundância total e dos hábitos tróficos carnívoros e detritívoros, todos maiores nos transectos norte e leste, expostos aos ventos. A abundância de poliquetas foi mais baixa em todo transecto sul, mais suscetível à ressuspensão de sedimento causada pelas frentes frias que atingem essa região / Although coral reefs are biodiversity hotspots for corals and fishes, it is not known whether they are also for small marine invertebrates. The present study aimed to verify if Sebastião Gomes reef complex is a polychaete biodiversity hotspot, as well to describe the structural and functional community of these organisms which inhabit sediments around the reef. Generalized linear models (glm) with sediment features and station position around the reef (perpendicular transects to the South, West, East and North faces) as predictor variables were used to understand the patterns of: alpha diversity; total polychaete abundance; most representative species abundance; and abundance of different trophic habits. 2399 individuals identified in 116 species were collected, indicating that Sebastião Gomes may be a hotspot. All community descriptors were higher near the reef, where coarse and carbonate sediments preponderate. However, the position around the reef was important only for some descriptors, such as total abundance and abundance of carnivorous and deposit feeders. All of them higher in the North and East transects, that are exposed to wind. The polychaete abundance was lower in the whole South transect, nevertheless it is more susceptible to sediment resuspension caused by cold fronts that reach the region
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Modélisation des changements spatio-temporels des communautés de macroinvertébrés benthiques dans les rivières d'Asie et d'Europe / Modelling spatio-temporal changes of benthic macroinvertebrate communities in Asian and European rivers

Sor, Ratha 10 July 2017 (has links)
Objectifs généraux: les systèmes fluviaux tropicaux et tempérés d'eau douce sont connus pour soutenir différentes communautés biotiques. Dans cette étude, menée dans une région d'Asie tropicale et dans une région d'Europe tempérée, j'ai étudié la composition et la diversité de la communauté des macro-invertébrés benthiques ainsi que leurs variations spatiales et temporelles. J'ai également examiné les influences des variables physico-chimiques de la qualité de l'eau sur les variations et la diversité de la composition de la communauté et j'ai modélisé l'occurrence d'espèces sélectionnées. Localisation géographique: Asie tropicale: le bassin aval du Mékong (LMB), couvrant une superficie de 609 000 km2; Europe tempérée: Europe occidentale, fleuves flamands (Belgique), couvrant une superficie de 13 787 km2. Matériel et méthodes: Pour le LMB, les données recueillies de 2004 à 2008 ont été utilisées et les valeurs médianes de cette période ont été analysées. Pour les rivières flamandes, les données collectées de 1991 à 2010 ont été utilisées. Les données ont été divisées en 4 périodes: D1: 1991-1995, D2: 1996-2000, D3: 2001-2005 et D4: 2006-2010. Les médianes de chaque période ont été utilisées pour des analyses spatiales détaillées. Des analyses multivariées ont été appliquées pour relier la composition et la diversité de la communauté aux variables physico-chimiques. Cinq techniques de modélisation, à savoir la régression logistique (LR), les Random Forest (RF), le Support Vector Machine (SVM), les réseaux de neurones artificiels (ANN) et les arbres de classification (CT) ont été utilisées pour modéliser l'occurrence desespèces sélectionnées. Principaux résultats: Variations de la composition des communautés, diversité et relation avec les variables environnementales Dans le cours aval du Mékong LMB, 299 taxons de macro-invertébrés distribués dans 196 genres et 90 familles ont été identifiées; dont 131 insectes, 98 mollusques, 38 crustacés et 32 annélides. / Overall aims: Freshwater tropical and temperate river systems are known to support different biotic communities. In this study, I investigated benthic macroinvertebrate community composition and diversity and its spatial and temporal variation both in tropical Asian and temperate European regions. I also examined the influences of physical-chemical water quality variables on community composition, variations and diversity, and modelled the occurrence of selected species. Locations: Tropical Asia: the Lower Mekong Basin (LMB), covering an area of 609,000 km2; Temperate Europe: Western Europe, Flemish rivers (Belgium), covering an area of 13,787 km2. Materials and Methods: For the LMB, data collected from 2004 to 2008 were used, and median values of this period were analysed. For Flemish rivers, data collected from 1991 to 2010 were used. The data were divided into 4 periods: D1: 1991-1995, D2: 1996-2000, D3: 2001-2005 and D4: 2006-2010. The medians of each period were used for detailed spatial analyses. Multivariate analyses were applied to relate community composition and diversity to physical-chemical variables. Five modelling techniques namely Logistic Regression (LR), Random Forest (RF), Support Vector Machine (SVM), Artificial Neural Network (ANN) and Classification Tree (CT) were used to model the occurrence of selected species. Main results: Community composition variations, diversity and relationship with environmental variables From the LMB, 299 macroinvertebrate taxa belonging to 196 genera and 90 families were identified: 131 insects, 98 molluscs, 38 crustaceans, and 32 annelids.
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Estrutura de metacomunidades de peixes em uma microbacia da Mata Atlântica / Metacommunities structures of fish in a watershed in the Atlantic Forest

Almeida, Rodrigo da Silva 22 October 2013 (has links)
Made available in DSpace on 2016-06-02T19:26:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 ALMEIDA_Rodrigo_Silva_2013.pdf: 2567444 bytes, checksum: 0ebfbd744721cec70932c58cb440d2f2 (MD5) Previous issue date: 2013-10-22 / Universidade Federal de Minas Gerais / The concept of metacommunities incorporates the influence of local and regional factors in structuring communities and has supported recent approaches related to patterns of distribution, abundance and species interactions. Within this concept, the species sorting model that assumes that a community is governed only by local factors, while the mass effect model assumes that a community is governed by local and regional effects. A stream system has a hierarchical dendritic network, in which the upstream water bodies are smaller and tend to increase in the downstream direction due to the connection with other streams. To stream fish, the dispersion process by the channel reveals the importance of regional factors on the structure of metacommunities, while habitat heterogeneity acts locally, and may reveal boundaries between metacommunities. This study aims to determine whether there is the formation of metacommunities along the longitudinal gradient and models which explain this structure. We captured fish populations and raise environmental information in three streams (15 reaches of 70 m) of a small watershed of the Atlantic. A principal component analysis (PCA) was applied to describe the environmental gradient and to verify the occurrence of this metacommunities apply a gradient elements of metacommunities analysis (EMS). The pattern of distance decay relationships (DDR) was used to verify whether metacommunities are influenced by the effects of local and / or regional and so seek explanations for the pattern found. We can say that there are two distinct communities (clementsian pattern of metacommunities), one nearest the mouth with no defined pattern caused by a process mass effect and a more flush with standard board from a species sorting process. Distinguish these communities is of great interest to conservation purposes and the development of strategies for biomonitoring. For example, for communities downstream, where the environmental changes caused by urbanization are more prevalent and there is the possibility of removing this source of environmental impact, ensure connectivity of streams is a good strategy since the species moving more intensely and are very dependent on the source of colonization. On the other hand, communities further upstream, even if there is a disconnect with the region downstream promoted by the damming of streams for water harvesting, these communities will remain theoretically provided that local conditions are guaranteed, ie, there is a pressing conservation environmental integrity of these excerpts. / O conceito de metacomunidades incorpora a influência de fatores locais e regionais na estruturação das comunidades e tem subsidiado abordagens recentes relacionadas aos padrões de distribuição, abundância e interações entre espécies. Dentro deste conceito, o modelo species sorting que assume que uma comunidade é governada somente por fatores locais, enquanto, o modelo mass effect assume que uma comunidade é governada por efeitos locais e regionais. Um sistema de riachos apresenta uma rede dendrítica hierárquica, no qual os corpos d água à montante são menores e tendem a aumentar no sentido jusante devido à conexão com outros riachos. Para peixes de riacho, o processo de dispersão pelo canal revela a importância de fatores regionais sobre a estrutura de metacomunidades, enquanto a heterogeneidade de hábitats age localmente, podendo revelar limites entre as metacomunidades. O presente estudo tem como objetivo verificar se existe a formação de metacomunidades ao longo do gradiente longitudinal e quais modelos explicam esta estrutura. Nós capturamos a ictiofauna e levantamos informações ambientais em três riachos (15 trechos de 70 m) de uma pequena microbacia da Mata Atlântica. Uma análise de componentes principais (PCA) foi aplicada para descrever o gradiente ambiental e, para verificar a ocorrência de metacomunidades neste gradiente aplicamos uma análise de elementos de metacomunidades (EMS - Elements of Metacommunities Analysis). O padrão de decaimento da similaridade pela distância (DDR - Distance Decay Relationships) foi utilizado para verificar se as metacomunidades são influenciadas pelos efeitos locais e/ou regionais e assim buscar explicações para o padrão encontrado. Podemos afirmar que existem duas comunidades distintas (padrão clementsiano de metacomunidades), uma mais próxima da foz sem padrão definido ocasionado por um processo mass effect e outra mais à montante com padrão de tabuleiro proveniente de um processo species sorting. Distinguir estas comunidades é de grande interesse para propósitos conservacionistas e na definição de estratégias de biomonitoramento. Por exemplo, para as comunidades mais à jusante, onde as alterações ambientais causadas pela urbanização são mais preponderantes e não há mais a possibilidade de retirar esta fonte de impacto ambiental, garantir a conectividade dos riachos é uma boa estratégia visto que as espécies se deslocam de maneira mais intensa e são muito dependentes da fonte de colonização. Por outro lado, as comunidades mais a montante, mesmo que ocorra uma desconexão com a região à jusante promovida pelo represamento dos riachos para captação de água, estas comunidades teoricamente se manterão desde que as condições locais sejam garantidas, ou seja, é premente a conservação da integridade ambiental destes trechos.

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