Introdução: Os medicamentos são importantes elementos da maioria dos esquemas terapêuticos cobertos pelo Sistema Único de Saúde (SUS), representando significativa parcela do orçamento no país. O Complexo de Saúde vinculado ao Hospital das Clínicas atende toda a região noroeste do Estado de São Paulo e de outras partes do estado e do país, como centro de referência em tratamentos de alta complexidade, sendo frequente a prescrição de medicamentos de alto custo (MAC). Estima-se que 75,4% do orçamento geral para compra de medicamentos do complexo HCRP-FMRP-USP, são dedicados à aquisição de medicação não padronizada (medicamento especial) num total de aproximadamente R$ 46.313.170,08 (2015). Sendo assim, ferramentas para controle não só da prescrição, como também da aquisição e seu uso são fundamentais para otimizar a gestão do Hospital, evoluindo de um caráter reativo a um proativo, no qual a tomada de decisões tenha como base um histórico e indicadores de casos apresentados no complexo. Objetivo: Desenvolver uma plataforma eletrônica baseada na rede mundial de computadores, que possibilite a gestão entendida como documentação, rastreabilidade e inter-relacionamento entre os componentes da cadeia de decisão de medicamentos considerados especiais no Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo. Métodos: Compreendeu o desenvolvimento de um sistema que tem como características principais monitoramento, acompanhamento e controle da cadeia de decisão de medicamentos que são considerados especiais pela instituição. Este sistema também permite a tomada de decisões, o desenvolvimento de indicadores em tempo real para decisão administrativa e o controle que requer a cadeia de suprimento de medicamentos de alto custo em cada um dos seus componentes. Resultados: Maior e melhor comunicação entre as unidades de farmácia, o solicitante (médico), o Departamento de atenção à Saúde (DAS) e os locais do Complexo HC-FMRP-USP que compõem a cadeia de decisão do suprimento de medicamentos especiais (MAC); além disso, possibilitará organizar um histórico de dados que poderá ser transposto facilmente a indicadores para o plano assistencial à medida, que garanta a presença de um agente transformador. Conclusões: Uma plataforma eletrônica foi desenvolvida que permite armazenamento, gestão e o processamento de dados e informações respeito à cadeia de decisão do fornecimento de medicamentos não padronizados / Introduction: Medicines are important elements in health care, especially those covered by the Brazilian Unified Healthcare System - Sistema Único de Saúde (SUS), representing a significant portion of its budget. The health infrastructure linked to Hospital das Clínicas serves throughout the northwest region of State the São Paulo and other parts of the state and the country. It is, therefore, known as a reference center for highly complex treatments and, for this reason, frequently prescribes treatments with expensive drugs. Is estimated that 75.4% of the general budget of HCRP-FMRP-USP complex is dedicated to the acquisition of this type of medication, i.e., not standardized medication (special medication), that has a value of approximately USD $14.434.300 (2015). Therefore, tools for controlling not only the prescription, as well as the acquisition and use, becomes critical to optimize the management of the hospital, aiming to move from a reactive to proactive role, where decision-making is based on a history and on indicators of the cases presented in the complex. Objective: To develop an electronic platform based on the World Wide Web, which allows the management, documentation, traceability and interrelationship between the components of the considered decision chain of nonstandard medicines in the Clinics Hospital of Ribeirão Preto Medical School of the University of Sao Paulo. Methods: Include a software development that has, as main features, tracking, monitoring and control of decision chain of drugs, which are considered special by the institution. This software also allows making decisions, development of indicators in real-time and administrative decisions that require the regulatory control supply system of high cost of medicines in each of its components. Results: Further and improved communication between the pharmacy units, the applicant (physician), the Department of attention to health (DAS) and places from the HC-FMRP-USP complex that integrate the chain of decision of the special drug supply. Moreover, organize a data history, which easily can be implemented to indicators for the assistance plan as guaranteeing the presence of a transforming agent. Conclusions: Developed an electronic platform that enables storage, management and processing of data and information, considering the chain decision of nonstandard medicines supply.

Introdução: Os medicamentos são importantes elementos da maioria dos esquemas terapêuticos cobertos pelo Sistema Único de Saúde (SUS), representando significativa parcela do orçamento no país. O Complexo de Saúde vinculado ao Hospital das Clínicas atende toda a região noroeste do Estado de São Paulo e de outras partes do estado e do país, como centro de referência em tratamentos de alta complexidade, sendo frequente a prescrição de medicamentos de alto custo (MAC). Estima-se que 75,4% do orçamento geral para compra de medicamentos do complexo HCRP-FMRP-USP, são dedicados à aquisição de medicação não padronizada (medicamento especial) num total de aproximadamente R$ 46.313.170,08 (2015). Sendo assim, ferramentas para controle não só da prescrição, como também da aquisição e seu uso são fundamentais para otimizar a gestão do Hospital, evoluindo de um caráter reativo a um proativo, no qual a tomada de decisões tenha como base um histórico e indicadores de casos apresentados no complexo. Objetivo: Desenvolver uma plataforma eletrônica baseada na rede mundial de computadores, que possibilite a gestão entendida como documentação, rastreabilidade e inter-relacionamento entre os componentes da cadeia de decisão de medicamentos considerados especiais no Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo. Métodos: Compreendeu o desenvolvimento de um sistema que tem como características principais monitoramento, acompanhamento e controle da cadeia de decisão de medicamentos que são considerados especiais pela instituição. Este sistema também permite a tomada de decisões, o desenvolvimento de indicadores em tempo real para decisão administrativa e o controle que requer a cadeia de suprimento de medicamentos de alto custo em cada um dos seus componentes. Resultados: Maior e melhor comunicação entre as unidades de farmácia, o solicitante (médico), o Departamento de atenção à Saúde (DAS) e os locais do Complexo HC-FMRP-USP que compõem a cadeia de decisão do suprimento de medicamentos especiais (MAC); além disso, possibilitará organizar um histórico de dados que poderá ser transposto facilmente a indicadores para o plano assistencial à medida, que garanta a presença de um agente transformador. Conclusões: Uma plataforma eletrônica foi desenvolvida que permite armazenamento, gestão e o processamento de dados e informações respeito à cadeia de decisão do fornecimento de medicamentos não padronizados / Introduction: Medicines are important elements in health care, especially those covered by the Brazilian Unified Healthcare System - Sistema Único de Saúde (SUS), representing a significant portion of its budget. The health infrastructure linked to Hospital das Clínicas serves throughout the northwest region of State the São Paulo and other parts of the state and the country. It is, therefore, known as a reference center for highly complex treatments and, for this reason, frequently prescribes treatments with expensive drugs. Is estimated that 75.4% of the general budget of HCRP-FMRP-USP complex is dedicated to the acquisition of this type of medication, i.e., not standardized medication (special medication), that has a value of approximately USD $14.434.300 (2015). Therefore, tools for controlling not only the prescription, as well as the acquisition and use, becomes critical to optimize the management of the hospital, aiming to move from a reactive to proactive role, where decision-making is based on a history and on indicators of the cases presented in the complex. Objective: To develop an electronic platform based on the World Wide Web, which allows the management, documentation, traceability and interrelationship between the components of the considered decision chain of nonstandard medicines in the Clinics Hospital of Ribeirão Preto Medical School of the University of Sao Paulo. Methods: Include a software development that has, as main features, tracking, monitoring and control of decision chain of drugs, which are considered special by the institution. This software also allows making decisions, development of indicators in real-time and administrative decisions that require the regulatory control supply system of high cost of medicines in each of its components. Results: Further and improved communication between the pharmacy units, the applicant (physician), the Department of attention to health (DAS) and places from the HC-FMRP-USP complex that integrate the chain of decision of the special drug supply. Moreover, organize a data history, which easily can be implemented to indicators for the assistance plan as guaranteeing the presence of a transforming agent. Conclusions: Developed an electronic platform that enables storage, management and processing of data and information, considering the chain decision of nonstandard medicines supply.

Este trabalho faz parte de um projeto maior, o Annotation and Image Markup Project, que tem o objetivo de criar uma base de conhecimento médico sobre imagens radiológicas para identificação, acompanhamento e reasoning acerca de lesões tumorais em pesquisas sobre câncer e consultórios médicos. Esse projeto está sendo desenvolvido em conjunto com o Radiological Sciences Laboratory da Stanford University. O problema específico, que será abordado nesse trabalho, é que a maior parte das informações semânticas sobre imagens radiológicas não são capturados e relacionados às mesmas usando termos de ontologias biomédicas e padrões, como o RadLex e DICOM, o que impossibilita a sua avaliação automática por computadores, busca em arquivos médicos em hospitais, etc. Para tratar isso, os radiologistas precisam de uma solução computacional fácil, intuitiva e acessível para adicionar essas informações. Nesse trabalho foi desenvolvida uma solução Web para inclusão dessas anotações, o sistema ePAD. O aplicativo permite a recuperação de imagens médicas, como as imagens disponíveis em sistemas de informação hospitalares (PACS), o delineamento dos contornos de lesões tumorais, a associação de termos ontológicos a esses contornos e o armazenamento desses termos em uma base de conhecimento. Os principais desafios desse trabalho envolveram a aplicação de interfaces intuitivas baseadas em Rich Internet Applications e sua operação a partir de um navegador Web padrão. O primeiro protótipo funcional do ePAD atingiu seus objetivos ao demonstrar sua viabilidade técnica, sendo capaz de executar o mesmo trabalho básico de anotação de aplicações Desktop, como o OsiriX-iPad, sem o mesmo overhead. Também mostrou a sua utilidade a comunidade médica o que gerou o interesse de usuários potenciais / This work is a part of a larger project, the Annotation and Markup Project, which aims to create a medical knowledge base about radiological images to identify, monitor and reason about tumors in cancer research and medical practices. This project is being developed in conjunction with the Laboratory of Image Informatics at Stanford University. The specific problem that will be addressed in this work is that most of the semantic information about radiological images are not captured and related to them using terms of biomedical ontologies and standards, such as RadLex or DICOM, what makes it impossible to automatic evaluate them by computers, to search for them in hospital databases using semantic criteria, etc. To address this issue, radiologists need an easy, intuitive and affordable computational solution to add this semantic information. In this work, a web solution for adding the information was developed, the ePAD system. It allows the retrieval of medical images, such as images available in hospital information systems (PACS), the creation of contours around tumor lesions, the association of ontological terms to these contours, and the storage of this terms in a knowledge base. The main challenges of this work involved the creation of intuitive interfaces using Rich Internet Applications technology and the operation from a standard Web Browser. The first functional prototype of ePAD reached its goal of proving its technical feasibility. It was able to do the same basic annotation job of desktop applications, such as OsiriX-iPad, without the same overhead. It also showed to the medical community that it was a useful tool and that generated interest of potential early users

Este trabalho faz parte de um projeto maior, o Annotation and Image Markup Project, que tem o objetivo de criar uma base de conhecimento médico sobre imagens radiológicas para identificação, acompanhamento e reasoning acerca de lesões tumorais em pesquisas sobre câncer e consultórios médicos. Esse projeto está sendo desenvolvido em conjunto com o Radiological Sciences Laboratory da Stanford University. O problema específico, que será abordado nesse trabalho, é que a maior parte das informações semânticas sobre imagens radiológicas não são capturados e relacionados às mesmas usando termos de ontologias biomédicas e padrões, como o RadLex e DICOM, o que impossibilita a sua avaliação automática por computadores, busca em arquivos médicos em hospitais, etc. Para tratar isso, os radiologistas precisam de uma solução computacional fácil, intuitiva e acessível para adicionar essas informações. Nesse trabalho foi desenvolvida uma solução Web para inclusão dessas anotações, o sistema ePAD. O aplicativo permite a recuperação de imagens médicas, como as imagens disponíveis em sistemas de informação hospitalares (PACS), o delineamento dos contornos de lesões tumorais, a associação de termos ontológicos a esses contornos e o armazenamento desses termos em uma base de conhecimento. Os principais desafios desse trabalho envolveram a aplicação de interfaces intuitivas baseadas em Rich Internet Applications e sua operação a partir de um navegador Web padrão. O primeiro protótipo funcional do ePAD atingiu seus objetivos ao demonstrar sua viabilidade técnica, sendo capaz de executar o mesmo trabalho básico de anotação de aplicações Desktop, como o OsiriX-iPad, sem o mesmo overhead. Também mostrou a sua utilidade a comunidade médica o que gerou o interesse de usuários potenciais / This work is a part of a larger project, the Annotation and Markup Project, which aims to create a medical knowledge base about radiological images to identify, monitor and reason about tumors in cancer research and medical practices. This project is being developed in conjunction with the Laboratory of Image Informatics at Stanford University. The specific problem that will be addressed in this work is that most of the semantic information about radiological images are not captured and related to them using terms of biomedical ontologies and standards, such as RadLex or DICOM, what makes it impossible to automatic evaluate them by computers, to search for them in hospital databases using semantic criteria, etc. To address this issue, radiologists need an easy, intuitive and affordable computational solution to add this semantic information. In this work, a web solution for adding the information was developed, the ePAD system. It allows the retrieval of medical images, such as images available in hospital information systems (PACS), the creation of contours around tumor lesions, the association of ontological terms to these contours, and the storage of this terms in a knowledge base. The main challenges of this work involved the creation of intuitive interfaces using Rich Internet Applications technology and the operation from a standard Web Browser. The first functional prototype of ePAD reached its goal of proving its technical feasibility. It was able to do the same basic annotation job of desktop applications, such as OsiriX-iPad, without the same overhead. It also showed to the medical community that it was a useful tool and that generated interest of potential early users

Made available in DSpace on 2017-07-10T17:11:51Z (GMT). No. of bitstreams: 1 WILSON JUNG.pdf: 3777203 bytes, checksum: 02dd354bc8c0d25187fd3960d5d56152 (MD5) Previous issue date: 2012-04-25 / Lately, many human knowledge fields use computer systems to support data management which are the foundation to the decision making process. Data Quality (DQ) is a key feature whose absence can undermine the usefulness of the information and the processes that use it. There can be found in the literature several cases of DQ problems with impact in many areas, resulting in economic and social losses. Therefore, DQ research aims to study data problems causes and proposes assessment methods and processes to assist in quality assurance. In healthcare, data constitutes an important element used as the basis for applying medical treatments and procedures to patients, thus requiring a high quality level. The data is also used in the research and application of computational knowledge discovery methods, such as Data Mining. Therefore, the goal of this work is to study the implementation of principles to assist DQ guarantee during the medical software development. This goal motivated the development of a case study related to Coloproctology, in which a surgery data management system prototype was de- veloped in partnership with the Coloproctology Service of FCM - UNICAMP. The interaction with domain experts was a key factor during the development process, providing the adequate data structure modeling that composes the system. A module to monitor specific data problems has also been incorporated into the prototype to assist the appropriate information insertion as much as the control of patients records which have DQ problems. The prototype has been evaluated by computer and healthcare s colaborators, who, after using the system, answered to a qualitative DQ assessment form. The assessment s results pointed out the prototype suitability to the activities it is aimed for, guided specific functionalities review and may support the proposed software evolution and future related work. / Atualmente, diversas áreas do conhecimento humano fazem uso de sistemas computacionais para auxiliar no gerenciamento de dados, que são a base para o processo de tomada de decisão. A Qualidade de Dados (QD) constitui uma característica fundamental cuja ausência pode comprometer a utilidade da informação e os processos que a utilizam. Na literatura são apresentados diversos casos que relatam o impacto de problemas de QD nas mais diversas áreas, represen- tando perdas econômicas e sociais. Assim, a área de QD visa o estudo das causas de problemas nos dados e a proposição de métodos de avaliação e processos que auxiliem na garantia da qualidade. Na área da saúde os dados constituem elementos importantes que são utilizados como base para a aplicação de tratamentos e procedimentos médicos aos pacientes, fatores que exigem um nível elevado de qualidade. Esses dados também são utilizados em pesquisas e aplicações de métodos computacionais de extração de conhecimento, como a Mineração de Dados. Assim, o objetivo deste trabalho consiste em estudar a aplicação de princípios que auxiliem na garantia da QD durante o desenvolvimento de um sistema computacional médico. Tal objetivo motivou a realização de um estudo de caso relacionado à especialidade da Coloproctologia, no qual foi desenvolvido o protótipo de um sistema para gerenciamento de dados de cirurgia coloproctológica em parceria com o Serviço de Coloproctologia da FCM - UNICAMP. A interação com os especialistas de domínio constituiu um fator fundamental durante o processo de desenvolvimento, possibilitando a modelagem adequada da estrutura dos dados que forma o sistema. Também foi incorporado ao protótipo um módulo para monitoramento de problemas específicos nos dados, auxiliando tanto no preenchimento adequado da informação quanto no controle dos registros de pacientes que apresentam problemas de QD. Ao final, o protótipo foi subme- tido à avaliação por colaboradores da área da computação e da saúde, que após a utilização do sistema responderam a um formulário para avaliação qualitativa de QD. Os resultados da avaliação indicaram a adequação do protótipo para as atividades a que é destinado, orientaram para a revisão de funcionalidades específicas e poderão auxiliar na evolução do sistema proposto e em trabalhos futuros.

Pesquisas recentes em medicina genômica sugerem que fatores de risco que incidem desde a concepção de uma criança até o final de sua adolescência podem influenciar no desenvolvimento de doenças crônicas da idade adulta. Artigos científicos com descobertas e estudos inovadores sobre o tema indicam que a epigenética deve ser explorada para prevenir doenças de alta prevalência como doenças cardiovasculares, diabetes e obesidade. A grande quantidade de artigos disponibilizados diariamente dificulta a atualização de profissionais, uma vez que buscas por informação exata se tornam complexas e dispendiosas em relação ao tempo gasto na procura e análise dos resultados. Algumas tecnologias e técnicas computacionais podem apoiar a manipulação dos grandes repositórios de informações biomédicas, assim como a geração de conhecimento. O presente trabalho pesquisa a descoberta automática de artigos científicos que relacionem doenças crônicas e fatores de risco para as mesmas em registros clínicos de pacientes. Este trabalho também apresenta o desenvolvimento de um arcabouço de software para sistemas de vigilância que alertem profissionais de saúde sobre problemas no desenvolvimento humano. A efetiva transformação dos resultados de pesquisas biomédicas em conhecimento possível de ser utilizado para beneficiar a saúde pública tem sido considerada um domínio importante da informática. Este domínio é denominado Bioinformática Translacional (BUTTE,2008). Considerando-se que doenças crônicas são, mundialmente, um problema sério de saúde e lideram as causas de mortalidade com 60% de todas as mortes, o presente trabalho poderá possibilitar o uso direto dos resultados dessas pesquisas na saúde pública e pode ser considerado um trabalho de Bioinformática Translacional. / Genomic medicine has suggested that the exposure to risk factors since conception may influence gene expression and consequently induce the development of chronic diseases in adulthood. Scientific papers bringing up these discoveries indicate that epigenetics must be exploited to prevent diseases of high prevalence, such as cardiovascular diseases, diabetes and obesity. A large amount of scientific information burdens health care professionals interested in being updated, once searches for accurate information become complex and expensive. Some computational techniques might support management of large biomedical information repositories and discovery of knowledge. This study presents a framework to support surveillance systems to alert health professionals about human development problems, retrieving scientific papers that relate chronic diseases to risk factors detected on a patient\'s clinical record. As a contribution, healthcare professionals will be able to create a routine with the family, setting up the best growing conditions. According to Butte, the effective transformation of results from biomedical research into knowledge that actually improves public health has been considered an important domain of informatics and has been called Translational Bioinformatics. Since chronic diseases are a serious health problem worldwide and leads the causes of mortality with 60% of all deaths, this scientific investigation will probably enable results from bioinformatics researches to directly benefit public health.

Pesquisas recentes em medicina genômica sugerem que fatores de risco que incidem desde a concepção de uma criança até o final de sua adolescência podem influenciar no desenvolvimento de doenças crônicas da idade adulta. Artigos científicos com descobertas e estudos inovadores sobre o tema indicam que a epigenética deve ser explorada para prevenir doenças de alta prevalência como doenças cardiovasculares, diabetes e obesidade. A grande quantidade de artigos disponibilizados diariamente dificulta a atualização de profissionais, uma vez que buscas por informação exata se tornam complexas e dispendiosas em relação ao tempo gasto na procura e análise dos resultados. Algumas tecnologias e técnicas computacionais podem apoiar a manipulação dos grandes repositórios de informações biomédicas, assim como a geração de conhecimento. O presente trabalho pesquisa a descoberta automática de artigos científicos que relacionem doenças crônicas e fatores de risco para as mesmas em registros clínicos de pacientes. Este trabalho também apresenta o desenvolvimento de um arcabouço de software para sistemas de vigilância que alertem profissionais de saúde sobre problemas no desenvolvimento humano. A efetiva transformação dos resultados de pesquisas biomédicas em conhecimento possível de ser utilizado para beneficiar a saúde pública tem sido considerada um domínio importante da informática. Este domínio é denominado Bioinformática Translacional (BUTTE,2008). Considerando-se que doenças crônicas são, mundialmente, um problema sério de saúde e lideram as causas de mortalidade com 60% de todas as mortes, o presente trabalho poderá possibilitar o uso direto dos resultados dessas pesquisas na saúde pública e pode ser considerado um trabalho de Bioinformática Translacional. / Genomic medicine has suggested that the exposure to risk factors since conception may influence gene expression and consequently induce the development of chronic diseases in adulthood. Scientific papers bringing up these discoveries indicate that epigenetics must be exploited to prevent diseases of high prevalence, such as cardiovascular diseases, diabetes and obesity. A large amount of scientific information burdens health care professionals interested in being updated, once searches for accurate information become complex and expensive. Some computational techniques might support management of large biomedical information repositories and discovery of knowledge. This study presents a framework to support surveillance systems to alert health professionals about human development problems, retrieving scientific papers that relate chronic diseases to risk factors detected on a patient\'s clinical record. As a contribution, healthcare professionals will be able to create a routine with the family, setting up the best growing conditions. According to Butte, the effective transformation of results from biomedical research into knowledge that actually improves public health has been considered an important domain of informatics and has been called Translational Bioinformatics. Since chronic diseases are a serious health problem worldwide and leads the causes of mortality with 60% of all deaths, this scientific investigation will probably enable results from bioinformatics researches to directly benefit public health.

El análisis sistémico de datos biomédicos procedentes de diferentes niveles biológicos abre amplias expectativas en el proceso de toma de decisiones médicas. Las nuevas tecnologías biomédicas permiten la interpretación del origen de las afecciones que sufren los pacientes, trasladando el paradigma de decisión hacia la medicina basada en la evidencia. Esta Tesis centra su atención en la ayuda al diagnóstico del cáncer asistida por ordenador. El objetivo de nuestro estudio es obtener unos resultados de alto acierto en clasificación, que ofrezcan transparencia en su interpretación mediante conocimiento médico y capacidad de generalización cuando se aplican a pacientes procedentes de múltiples centros estudiados con posterioridad. Los aspectos técnicos cubiertos en esta Tesis incluyen el procesamiento, modelado, extracción de características, y combinación de datos biomédicos; así como la inferencia y evaluación de modelos predictivos de dichos datos y la integración de los modelos predictivos en sistemas de ayuda a la decisión para entornos clínicos. Concretamente, estos puntos se abordan para dos problemas médicos: el diagnóstico de Tumores de Partes Blandas (TPB) y, especialmente, el diagnóstico de Tumores Cerebrales (TC). En los desarrollos realizados para el problema de TPB con hallazgos de imagen se alcanzó una alta eficacia en la clasificación basada en Reconocimiento de Formas de tumores según su carácter benigno o maligno. Un sistema de ayuda a la decisión especializado para el problema de TPB fue diseñado e implementado a partir de los clasificadores aprendidos a partir de una base de datos multicéntrica. Las contribuciones de esta Tesis al estudio de Tumores Cerebrales incluyen el análisis de señales biomédicas in-vivo y ex-vivo del paciente. Ha sido propuesta una nueva aproximación para la combinación de Espectros de Resonancia Magnética (ERM) adquiridos para un mismo paciente con diferentes tiempos de eco (TE corto y TE largo) ha sido propuesta. También se / García Gómez, JM. (2009). Pattern recognition approaches for biomedical data in computer-assisted cancer research [Tesis doctoral]. Universitat Politècnica de València. https://doi.org/10.4995/Thesis/10251/4602