Orientador: Anita Jocelyne Marsaioli / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Quimica / Made available in DSpace on 2018-08-13T13:31:18Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Martins_LucasGelain_M.pdf: 1200827 bytes, checksum: 8708dd4e868d8749ef0f4a5d27b03248 (MD5) Previous issue date: 2009 / Resumo: Técnicas de RMN de H foram aplicadas no estudo de metabolômica de Theobroma cacao e interações proteínas ¿ ligantes. Esses dois tópicos são reportados em dois capítulos. O primeiro descreve a análise quantitativa por RMN de H de 8 metabolitos de Theobroma cacao endógenos ou produzidos durante a fermentação de 10 diferentes variedades resistentes ao fungo Moniliophthora perniciosa. Os espectros foram obtidos de extratos aquosos saturando o sinal da água com pressaturação. Os metabólitos monitorados foram: glicose, sacarose, frutose, etanol, cafeínas e os ácidos acético, lático e succínico. O teor dos metabólitos presentes em 7 dessas variedades são similares àqueles de T. cacao comum e análise sensorial selecionou aquelas com maior teor de cafeína como as melhores. O segundo capítulo descreve as interações acetilcolinesterase/alcalóides de Amaryllidaceae e proteína de membrana bacteriana/fosfomicina, com os mapas de epitopo de interação dos ligantes com as macromoléculas determinados por RMN de H ¿ STD (Saturation Transfer Difference). O mapa de epitopo para acetilcolinesterase/fisostigmina foi confirmado por cálculos de ¿doking¿ molecular. A constante de dissociação aparente da fisostigmina com acetilcolinesterase foi obtida através das medidas de T1 seletivo. Interação entre células integras de Escherichia coli CCT 5050, Serratia liquefaciens CCT 7262 e fosfomicina indicaram que microrganismo resistente ao antibiótico (Serratia liquefaciens) não apresentaram sinais no experimento de RMN de H ¿ STD enquanto que o microrganismo não resistente (Escherichia coli) apresenta sinais no mesmo experimento. Esses resultados certamente contribuirão para a elucidação do mecanismo de ação da fosfomicina / Abstract: H NMR tecniques were applied to study Theobroma cacao metabolomics and protein-ligand supramolecular interactions. These two topics are reported in two chapters. First chapter describes the H NMR quantitative analysis of 8 Theobroma cacao secondary metabolites which are endogenous or produced during the fermentation process of 10 different varieties resistent to the Moniliophthora perniciosa fungus. The spectra were obtained from the aqueous extracts saturating the water signal with the PRESAT tecnique. The monitored metabolites were: glucose, sacharose, fructose, ethanol, cafeine and the acids acetic, latic and succinic. The abundance of the metabolites present in 7 of these varieties were similar to those in comon T. Cacao and sensory analysis selected those with high cafeine content as the best. The second chapter describes the supramolecular interactions of acetylcholisterase/Amaryllidaceae alkaloids and bacterial membrane protein /fosfomicine, with the epitope mapping of the interactions of the ligands to the macromolecules obtained by H NMR STD (saturation transfer difference). The epitope mapping of acetylcholisterase/Amaryllidaceae alkaloids was confirmed by molecular docking calculations. The apparent dissociation constant of the fisostigmine which is an acetylcholinesterase inhibitor was obtained by applying selective T1. Interactions of Escherichia coli CCT 5050, Serratia liquefaciens CCT 7262 whole cells and fosfomycin indicated that microorganisms resistent to this antibiotic (Serratia liquefaciens) did not show signal in the H NMR STD experiment while non resistent microorganism (Escherichia coli) showed signals in the same experiment. This data will certainly contribute to the elucidation of fosfomycin action mechanism / Mestrado / Quimica Organica / Mestre em Química

Submitted by Renata Lopes (renatasil82@gmail.com) on 2017-05-09T12:17:20Z No. of bitstreams: 1 gilsonrodriguesferreira.pdf: 5148853 bytes, checksum: 05b9d7e4c0fed65676449cf1f4319a45 (MD5) / Approved for entry into archive by Adriana Oliveira (adriana.oliveira@ufjf.edu.br) on 2017-05-17T14:05:39Z (GMT) No. of bitstreams: 1 gilsonrodriguesferreira.pdf: 5148853 bytes, checksum: 05b9d7e4c0fed65676449cf1f4319a45 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-17T14:05:39Z (GMT). No. of bitstreams: 1 gilsonrodriguesferreira.pdf: 5148853 bytes, checksum: 05b9d7e4c0fed65676449cf1f4319a45 (MD5) Previous issue date: 2014-08-22 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Esta tese apresenta o estudo espectroscópico teórico e experimental sobre o equilíbrio tautomérico em corantes derivados do 1-fenil-azo-2-naftol conhecido como Sudan I. O estudo envolveu os azocorantes (Sudan I, Sudan II, Para Red e Sudan Red G) além de dois diazocorantes (Sudan III e Sudan IV) e foi fundamentado em técnicas espectroscópicas; Raman, Infravermelho e UV/vis além de RMN de 13C e 1H. Todo o estudo envolveu a aplicação de metodologias teóricas B3LYP/6-311++G(d,p) na elucidação estrutural e espectroscópica das espécies azo (OH) e hidrazo (NH) para esta família de azocorantes. Foi possível determinar através dos resultados experimentais baseados em evidências teóricas que o tautômero NH é a forma predominante em fase gás, em solução e em estado sólido. Azocorantes derivados do fenil-1-azo-2-naftol também foram usados com sucesso na síntese de novos compostos de coordenação envolvendo íons de metais de transição Ni2+, Cu2+ e Co3+ e seis novos complexos foram completamente caracterizados sendo estes: bis-1-(fenil-azo)-2-naftolatoniquel(II) (1), bis-1-fenil-azo-2-naftolatocobre(II) (2) e tris-1-(fenil-azo)-2-naftolatocobalto(III) (3), bis-1-(2,4-Xylyl-azo)-2-naftolatoniquel(II) (4) e bis-1-(2,4-Xylyl-azo)-2-naftolatocobre(II) (5) e bis-1-(2-metoxi-fenil-azo)-2naftolatocobalto(III).etanol (6). Através dos dados de difração de raios X, associados à química computacional e aos dados espectroscópicos, foi possível sugerir que nos sistemas sintetizados, as forças intermoleculares responsáveis pelo empacotamento supramolecular são de fraca intensidade. Sendo que nos complexos (1), (2) e (3) prevalece às interações do tipo π-stacking, nos complexos (4) e (5) interações de do tipo CH...π não convencionais e no complexo (6) ocorre ligação de hidrogênio. A análise espectroscópica foi utilizada como uma importante ferramenta para a caracterização e confirmação da coordenação dos blocos construtores, sobretudo pela intensidade de muitas bandas que foram alteradas pela perda do próton (NH) para formação dos compostos de coordenação. / This thesis presents the theoretical and experimental spectroscopic study on the tautomeric equilibrium in azo dyes derivatives from 1-phenyl-azo-2-naphthol known as Sudan I. The study involved azo dyes (Sudan I, Sudan II, Para Red and Sudan Red G) besides two diazodyes (Sudan III and Sudan IV) and was based on spectroscopic techniques; Raman, IR and UV/vis also 1H and 13C NMR. All study involved the application of theoretical methods B3LYP/6-311++G (d,p) in the elucidation structural and spectroscopic of the species azo (OH) and (NH) hidrazo for this family of azo dyes. Experimental results based on theoretical evidence pointed the NH tautomer as predominant form in the gas phase, in solution and in solid state. Azo derivatives from phenyl-1-azo-2-naphthol also been successfully used in the synthesis of new coordination compounds involving ions of transition metals Ni2+, Cu2+ and Co3+ and six new compounds were fully characterized these being: bis-1-(phenyl-azo)-2-naftolatoniquel (II) (1), bis-1-phenyl-azo-2-naftolatocobre (II) (2), 1 tris-(phenyl-azo)-2-naftolatocobalto (III) (3), bis-1-(2,4-xylylazo)-2-naftolatoniquel (II) (4), bis-1-(2,4-xylyl-azo)-2-naftolatocobre (II) (5) and bis-1-(2methoxy-phenyl azo)-2-naftolatocobalto (III). ethanol (6). Through the association between crystallographic data, of the computational chemistry and spectroscopic data, we can suggest that the intermolecular forces responsible for the supramolecular packing are of the low intensity. Since the complexes (1), (2) and (3) prevails interaction type π-stacking, in the complexes (4) and (5) interactions of the type CH ... π unconventional and complex (6) occurs hydrogen bond. Spectroscopic analysis was used as an important tool for the characterization and confirmation of the coordination of builder blocks, particularly by the intensity of many bands that were altered by the loss of the proton (NH) for the formation of coordination compounds.

Orientador: Anita Jocelyne Marsaioli / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Quimica / Made available in DSpace on 2018-08-14T13:21:19Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Cabeca_LuisFernando_D.pdf: 3225246 bytes, checksum: 72eb5893bd2c7122d9aa7e2215c4d03e (MD5) Previous issue date: 2009 / Resumo: A encapsulação de drogas, em particular anestésicos locais (ALs), em sistemas carreadores como lipossomas (EPC) ou ciclodextrinas (b-CD) é uma metodologia desenvolvida para diminuição da toxicidade sistêmica, aumento da analgesia e maior absorção do que os correspondentes ativos livres. O estudo das interações dos complexos (ALs/b-CD, AL/EPC e ALs/ b-CD/EPC) foi realizado utilizando técnicas de RMN de H (ROESY 1D, DOSY e STD). Através destas, observou-se que o ALs proparacaína (PPC) interage com a b-CD e que na presença de vesículas de lipossomas (MLV, 400nm e 100nm) as moléculas de PPC deixam a b-CD para formar um novo complexo (PPC/EPC). Entretanto, espectros de RMN-STD revelaram sinais de b-CD quando lipossomas foram saturados em -0,5 ppm, que é consistente com a existência de um complexo ternário PPC/b-CD/EPC. Em um segundo momento do trabalho, foi avaliado a topologia de complexos formados entre o ALs prilocaína (PLC), b-CD e vesículas de lipossomas de EPC variando o pH (10,0, 7,0 e 5,5). Os experimentos de STD mostraram que a liberação da PLC da b-CD para o lipossoma e formação do complexo PLC/EPC foi maior a pH 10,0 do que a pH 5,5. Espectros de DOSY forneceram constantes de associações maiores em pH 10,0, indicando maior interação da PLC/EPC e preferência da PLC pela fase aquosa em pH 5,5. A técnica de RMN-STD também foi aplicada pioneiramente para o estudo do Quorum Sensing usando (S)-N-(3-oxo-octanoyl)-HSL e cepas de A. tumefaciens NTL4(pZLR4). Vesículas de lipossomas foram usadas como modelo de membrana para o estudo do mecanismo de Quorum Sensing. Concluiu-se então que a difusão da HSL através da parte lipídica da membrana celular é um importante evento para o sucesso da comunicação bacteriana. / Abstract: Encapsulation of local anesthetics (Als) in drug delivery systems as liposomes (EPC) or cyclodextrins (b-CD) is a known methodology to decrease toxicity, increase anesthetic effect duration and absorption than the free drug. Thus evaluation of the stability of supramolecular complexes is important and here several complexes (ALs/b-CD, AL/EPC e ALs/ b-CD/EPC) were evaluated using H NMR techniques (ROESY 1D, DOSY e STD). We observed that proparacaine (PPC) interacts with b-CD and in the presence of liposomes (MLV, 400 or 100 nm) that PPC molecules migrate from the b-CD to the liposome producing new binary complexes (PPC/EPC). Additionally, STD H NMR revealed b-CD signals upon liposome saturation at -0.5 ppm which was consistent with the existence of a ternary complex PPC/b-CD/EPC. We have also evaluated the topologies of PLC/b-CD/EPC complexes at different pHs (10.0, 7.0, 5.5). The STD¿NMR experiments revealed that more PLC is released to liposome from the PLC/b-CD complex at pH 10.0 than at pH 5.5. The association constants determined by diffusion experiments (DOSY) revealed that PLC/EPC interactions are larger at pH 10.0 than at pH 5.5 due to an increase in PLC/EPC interaction and the PLC preference for the aqueous phase at pH 5.5. The STD-NMR technique was also applied to a pioneer study of the Quorum Sensing using (S)-N-(3-oxo-octanoyl)-HSL and a strain of A. tumefaciens NTL4(pZLR4). Liposome vesicles were used as membrane model to study the Quorum Sensing mechanism. Finally, it was concluded that of diffusion acyl-HSLs through the lipidic part of the bacterial cell membrane is an important event for a successful bacterial communication. / Doutorado / Quimica Organica / Doutor em Ciências