Orientadores: Anete Pereira de Souza, Ronan Xavier Corrêa / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-26T11:09:01Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Barreto_MarianaAraujo_D.pdf: 4149474 bytes, checksum: c40ae80305102971c31380d30afb3dc0 (MD5) Previous issue date: 2014 / Resumo: O cacaueiro (Theobroma cacao L.) é uma árvore perene cultivada principalmente nas explorações de pequenas fazendas nos trópicos. O produto de principal interesse são as suas sementes, matéria-prima para a fabricação de chocolate. No entanto, o sucesso econômico das lavouras é limitado pela ocorrência de doenças como a Podridão-parda e Vassoura-de-bruxa, as quais, juntas, são responsáveis pela perda de 30% da safra mundial. O objetivo deste estudo foi avaliar a resistência genética de uma progênie F1 segregante (TSH 1188 X CCN 51) em resposta a infecção por Phytophthora spp. e identificar QTLs associados à resistência a Podridão-parda e a Vassoura-de-bruxa. No total, 262 genótipos de uma progênie F1 segregante (TSH 1188 X CCN 51) foram usados neste estudo. O gradiente de resistência genética foi avaliado por meio de inoculação de Phytophthora spp. em disco foliar. O mapa genético foi construído utilizando a abordagem multiponto baseado em Hidden Markov Models (HMM). Um mapa físico "in silico" foi construído valendo-se dos resultados obtidos com a construção do mapa genético. A avaliação da caracterização fenotípica para Podridão-parda e Vassoura-de-bruxa foi realizada com base na abordagem de modelos mistos. O mapeamento de QTLs foi realizando utilizando o modelo mapeamento por intervalo composto (CIM). A resistência genética à Podridão-parda segregou entre os genótipos da progênie F1 indicando a existência de variabilidade genética na população e mostrando a importância desta progênie para a realização de estudos de mapeamento genético que visem à identificação de QTLs. Os parâmetros genéticos foram significativos (p<0,01) e uma elevada herdabilidade foi observada em Phytophthora Spp. (h^2 = 0,799). Grupos homogêneos estatisticamente distintos quanto ao índice de doença (p<0,01; teste Scott-Knott) foram observados permitindo a identificação de 10 genótipos resistentes à Phytophthora spp.. A frequência de indivíduos dentro de cada grupo homogêneo sugere que a resistência à Podridão-parda é provavelmente causada por poucos genes. O mapa genético-molecular integrado apresentou 286 marcadores microssatélites distribuídos em 10 grupos de ligação cobrindo 974,4 cM. O mapa físico "in silico" cobre 210 Mb do genoma do cacaueiro (430-445 Mb). O mapeamento de QTLs detectou 3 QTLs associados com a resistência à Podridão-parda e 7 associados com a resistência à Vassoura-de-bruxa. Os QTL detectados neste estudo foram mapeados em outras progênies sugerindo que as regiões mapeadas possuem genes comuns ou um conjunto de genes envolvidos na resistência a doenças e que podem ser utilizados por seleção assista por marcadores direcionados na seleção de cultivares resistentes. Os resultados obtidos nesse estudo direcionaram a seleção de genótipos prioritários para ganho genético com relação à resistência Phytophthora spp. e possibilitaram a identificação de regiões genômicas que apresentam resistência a doenças de interesse, ampliando a base genética para busca de genótipos elite / Abstract: Cacao tree (Theobroma cacao L.) is a perennial tree grown mostly on farms of small farms in the tropics. The product of primary interest is its seeds, raw material for the manufacture of chocolate. However, the economic success of crops is limited by the occurrence of the black pod and witches' broom diseases, which together are responsible for the loss of 30% of the world crop. The aim of this study was to evaluate the genetic resistance of a progeny from the cross between the clones TSH 1188 and CCN 51 in response to infection by Phytophthora spp. and to identify QTLs associated with resistance to black pod and witches' broom. In total, 262 genotypes from a segregating F1 progeny (TSH 1188 X CCN 51) were used in this study. The genetic resistance gradient was evaluated by inoculation of Phytophthora spp. in leaf disc. The genetic map was constructed using the multipoint approach based on Hidden Markov Models (HMM). A physical map "in silico" was constructed, also, drawing upon the results obtained with the construction of the genetic map. Evaluation of phenotypic characterization for black pod and witches' broom was based on the mixed model approach. The QTL mapping was performing using the composite interval mapping (CIM). The genetic resistance to black pod segregated between genotypes of F1 progeny, indicating that exist genetic variability in the population and showing the importance of this progeny to perform genetic mapping studies aimed at QTLs identification. The descriptive estimates were significative (p <0.01) and a high heritability was observed in Phytophthora spp. (h^2= 0.799). Homogeneous groups statistically distinct with respect to disease index (p <0.01; Scott-Knott) were observed allowing the identification of 47 resistant genotypes to Phytophthora spp.. The frequency of the individuals within each homogeneous group suggests that resistance to black pod is probably caused by a few genes. Integrated molecular-genetic map presented 286 microsatellite markers distributed in 10 linkage groups covering 974.4 cM of caco genome. The physical map "in silico" covers 210 Mb of cacao genome (430-445 Mb). The mapping of QTLs allowed detection of 3 QTLs associated with resistance to black pod and 7 associated with resistance to witches' broom. The QTL detected in this study were mapped in other progenies of cacao. This suggest that this region has common genes or genes set involved in resistance to both diseases and can be used for marker-assisted selection directed to resistant cultivars selection. The results of this study guide the selection of priority genotypes for genetic gain in terms of resistance to Phytophthora spp. and identified genomic regions that exhibit resistance to diseases of interest broadening the genetic basis for seeking superior genotypes / Doutorado / Genetica Vegetal e Melhoramento / Doutora em Genética e Biologia Molecular

Submitted by Nathália Faria da Silva (nathaliafsilva.ufv@gmail.com) on 2017-06-12T11:34:55Z No. of bitstreams: 1 resumo.pdf: 14683 bytes, checksum: 031a660f530792989291494b96b6dc49 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-12T11:34:55Z (GMT). No. of bitstreams: 1 resumo.pdf: 14683 bytes, checksum: 031a660f530792989291494b96b6dc49 (MD5) Previous issue date: 2001-08-13 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Este trabalho teve por objetivo definir os parâmetros para a obtenção e regeneração de protoplastos de Crinipellis perniciosa. O melhor estabilizador osmótico para a liberação de protoplastos foi KCl 0.8M em tampão fosfato 10 mM, pH 5.8, contendo 20 mg.mL -1 da enzima lítica Glucanex e 10 mg.mL -1 de BSA, após 1 a 2 horas de digestão enzimática do micélio. Os protoplastos foram liberados nestas condições, na ordem de 2,0 x 10 7 por mL de estabilizador osmótico, a partir de 300mg de micélio secundário de C. perniciosa crescido em meio BDA. A melhor freqüência de regeneração obtida foi de 2,0% quando sacarose 0,5M foi utilizada como estabilizador osmótico. A coloração de núcleos dos protoplastos revelou que 58,8% dos protoplastos eram anucleados, 37,5% uninucleados e 3,7% binucleados. Uma análise genética por RAPD de C. perniciosa e das colônias regeneradas a partir de protoplastos não revelou polimorfismos entre elas, embora diferenças, como crescimento lento e aspecto morfológico do micélio de algumas colônias tenham sido observadas. O micélio do isolado de C. perniciosa, bem como das colônias regeneradas a partir de protoplastos, são dicarióticas e apresentam grampos de conexão. / The conditions for the production and regeneration of protoplasts from the fungus Crinipellis perniciosa were studied. The highest release of protoplasts was obtained with 0.8 M KCl in phosphate buffer, pH 5.8, as an osmotic stabilizer; 20 mg.mL -1 of the lytic enzyme Glucanex; 10 mg.mL -1 of BSA and 1 to 2 hours of enzymatic digestion. Under these conditions, about 2.0 x 10 7 prtoplast.mL -1 were released from the secondary mycelium of C. perniciosa grown in BDA. The best regeneration frequency was achieved when 0.5M sucrose was used as an osmotic stabilizer. Nuclear Giensa staining revealed that 58,8% of the protoplasts were anucleate, 37,5% uninucleate, and 3,7% binucleate. Although differences in colony growth and mycelial aspect had been observed, RAPD analysis of colonies regenerate form protoplasts did not reveal any genetic polymorphism. The mycelium of C. perniciosa as well as those from colonies regenerate from protoplasts were dikaryotic and possessed clamp connections.

Submitted by Nathália Faria da Silva (nathaliafsilva.ufv@gmail.com) on 2017-06-14T18:42:49Z No. of bitstreams: 1 resumo.pdf: 22408 bytes, checksum: e3f5068222be03351cd7ba5bce93b7f8 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-14T18:42:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 resumo.pdf: 22408 bytes, checksum: e3f5068222be03351cd7ba5bce93b7f8 (MD5) Previous issue date: 2005-12-20 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Neste trabalho, elementos transponíveis da Classe I e da Classe II foram caracterizados no genoma do fungo Crinipellis perniciosa, agente causal da enfermidade conhecida como vassoura-de-bruxa no cacaueiro. C. perniciosa apresenta uma alta variabilidade genética e elementos transponíveis têm sido relatados como um dos principais agentes responsáveis pela alta plasticidade e adaptabilidade apresentada por fungos fitopatogênicos. Buscas preliminares feitas no banco de dados do Projeto Genoma da Vassoura-de-Bruxa revelaram a presença de uma seqüência de DNA com similaridade a transcriptase reversa de elementos da Classe I pertencente ao grupo gypsy/Ty3. Esta seqüência foi amplificada em diferentes isolados de C. perniciosa que pertencem aos biótipos C, S e L e distintas regiões geográficas. Seqüenciamento de fragmentos amplificados revelaram a ocorrência de vários eventos de transição G:C para A:T, indicando a existência de um possível mecanismo de silenciamento tipo RIP. Análises de hibridização mostraram a presença de um alto número de cópias da região que codifica a transcriptase reversa e diferentes perfis de hibridização nos isolados dos biótipos C, S e L, indicando que os elementos que contém estas seqüências podem ter um importante papel na variabilidade de C. perniciosa. O fragmento de DNA contendo a seqüência de transcriptase reversa foi utilizado para o isolamento de fagos recombinantes em um banco genômico de C. perniciosa. Retrotransposons do grupo gypsy/Ty3, denominados CpSaci1 e CpSaci2, foram caracterizados a partir de uma nova seqüência presente no banco de dados do Projeto Genoma da Vassoura-de- Bruxa e de um dos fagos recombinantes obtidos. CpSaci1 possui 6.856 pares de bases (pb) e contém longas repetições terminais (LTRs) diretas de 423 pb que não apresentam regiões normalmente encontradas em LTRs de retrotransposons. Duas seqüências de leitura aberta (ORFs) foramidentificadas codificando peptídeos similares à GAG e à poliproteína POL contendo os domínios protease, transcriptase reversa, RNase H e integrase. A seqüência de DNA de CpSaci2, que foi parcialmente caracterizada, possui cerca de 82% de identidade com CpSaci1. Estas duas cópias apresentam inserções de bases e códons de parada na região estrutural indicando que se tratam de cópias inativas. Entretanto, análises por RT-PCR revelaram a presença de transcritos CpSaci normalmente expressos em C. perniciosa cultivado em meio mínimo, e que, sob condições de estresse nutricional, apresentaram uma maior expressão. CpSaci está presente em alto número de cópias no genoma dos biótipos C, S e L de C. perniciosa, sendo que isolados do biótipo C originados do estado da Bahia apresentam dois perfis de hibridização, e alguns fragmentos de DNA em comum com isolados da região amazônica. Por possuir alto número de cópias e ser ativo, o retrotransposon CpSaci provavelmente está relacionado com a geração de variabilidade genética em C. perniciosa. Além do retrotransposon CpSaci, elementos transponíveis da Classe II também foram caracterizados. As cópias denominadas Boto1 e Boto2 foram obtidas a partir do banco de dados do Projeto Genoma da Vassoura-de-Bruxa e a partir de um fago recombinante isolado de um banco genômico de C. perniciosa, respectivamente. Boto1 é flanqueado por uma duplicação de 3 pb (TAA) e possui duas ORFs, uma que codifica uma transposase e outra que codifica uma proteína com baixa similaridade a um regulador da transcrição de plantas. As regiões estruturais que codificam as transposases de Boto1 e Boto2 são interrompidas por um intron de 53 pb com alto conteúdo A+T. As transposases de Boto1 e Boto2 são altamente similares à transposases de elementos PIF-like. Estas transposases são relacionadas à transposases de seqüências de inserção do grupo IS5 de bactérias e fazem parte de uma nova família de transposons da Classe II denominada PIF/IS5. A superfamília PIF/IS5 é raramente encontrada em fungos, e como análises filogenéticas indicam que as transposases Boto-like formam um ramo evolutivo independente, estas seqüências parecem ter sido transferidas horizontalmente para o genoma de C. perniciosa. Transcritos Boto- like foram amplificados por RT-PCR em C. perniciosa normalmente cultivado em meio de cultura, mas não foram ativados por estresse nutricional. Este é o primeiro relato de elementos da superfamília PIF/IS5 em um fungo fitopatogênico. / In this work, Class 1 (RNA) and Class 2 (DNA) transposable elements were characterized in the genome of Crinipellis perniciosa, the causal agent of the witches’ broom disease of cocoa. C. perniciosa presents a high genetic variability and transposable elements have been reported as the main agents responsible for the high plasticity and adaptability presented by phytopathogenic fungi. Once the genome of this fungus has been sequenced, preliminary searches in the database of the witches’ broom genome project revealed the presence of a DNA sequence with similarity to the reverse transcriptase of gypsy/Ty3-like retrotransposons. This sequence was amplified in different C. perniciosa isolates that belong to the C-, S-, and L-biotypes and to different geographical areas. The sequencing of the amplified fragments revealed the occurrence of several G:C to A:T transitions, indicating the existence of a possible RIP-like silencing mechanism. Southern analyses showed a high copy number of the reverse transcriptase gene with different profiles among the C-, S- and L- biotypes, indicating that the elements that contain these sequences may have an important role in C. perniciosa genetic variability. The DNA fragment containing the reverse transcriptase gene sequence was used to isolate different recombinant phages from a C. perniciosa genomic library. Gypsy/Ty3-like retrotransposons, named CpSaci1 and CpSaci2, were characterized from a new sequence present in the sequencing project database and from one recombinant phage. CpSaci1 contains 6.856 bp and long direct terminal repeats (LTRs) of 423 bp that do not present regions usually found in LTRs. Two open reading frame (ORFs) were identified and they code proteins with similarity to GAG and to a POL polyprotein showing protease, reverse transcriptase, RNase H, and integrase domains. Partially characterized DNA sequence of CpSaci2 possesses about xi82% of identity to CpSaci1. The copies CpSaci1 and CpSaci2 present punctual base insertions and stop codons in the structural region indicating that they are inactive copies. However, RT-PCR analyses revealed the presence of CpSaci- like transcripts expressed in C. perniciosa, presenting a higher expression under nutritional stress conditions. CpSaci is present in high copy number in the genome of the C-, S- and L-biotypes. The C-biotype isolates from Bahia state, Brazil, present two hybridization profiles and some DNA fragments similar to those of the isolates from the Amazon region. Once CpSaci presents a high copy number and activity, it is probably related to the generation of genetic variability in C. perniciosa. Besides the CpSaci retrotransposon, a Class II transposable element was also characterized. Two copies, named Boto1 and Boto2, were obtained from the genome sequencing database and from a recombinant phage obtained from a C. perniciosa genomic library, respectively. Boto1 is flanked by a 3 bp duplication (TAA) and possesses two ORFs, one that codes a transposase and another that codes a protein with low similarity to a plant transcription regulator. The structural regions that code the transposases of Boto1 and Boto2 are interrupted by a 53 bp intron with high A+T content. The aminoacid sequence of Boto1 and Boto2 transposases are highly similar to plant PIF-like transposases. These transposases are related to those of bacterial insertion sequences of the group IS5 and they are members of a new superfamily of Class II transposons named PIF/IS5. Once this superfamily is rarely found in fungi and phylogenetic analyses indicate that Boto1 and Boto2 transposases present an independent evolutionary branch, it seems that these sequences were horizontally transferred to C. perniciosa genome. Although Boto-like transcripts were amplified in C. perniciosa normally cultivated in culture medium, they were not activated by nutritional stress. This is the first report of elements of the PIF/IS5 superfamily in a phytopathogenic fungus.

Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Programa de Pós-Garduação em Desenvolvimento Sustentável, 2011. / Submitted by Albânia Cézar de Melo (albania@bce.unb.br) on 2012-02-10T14:31:06Z No. of bitstreams: 1 2011_FloraBonazziPiasentin.pdf: 2962611 bytes, checksum: 7270dce18c64c72d173ee4d6de1d6972 (MD5) / Approved for entry into archive by Marília Freitas(marilia@bce.unb.br) on 2012-02-15T12:36:38Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2011_FloraBonazziPiasentin.pdf: 2962611 bytes, checksum: 7270dce18c64c72d173ee4d6de1d6972 (MD5) / Made available in DSpace on 2012-02-15T12:36:38Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2011_FloraBonazziPiasentin.pdf: 2962611 bytes, checksum: 7270dce18c64c72d173ee4d6de1d6972 (MD5) / O sistema cabruca, sistema de cultivo de cacau prevalente no Sudeste da Bahia, foi nas últimas décadas alçado à categoria de sistema agrícola sustentável, merecendo atenção crescente de pesquisadores tanto da área ambiental quanto daquela agronômica. Seu estudo torna-se ainda mais importante, considerando-se as pressões existentes para a sua conversão em outras culturas mais rentáveis cultivadas a pleno sol. Esse trabalho visou analisar diferentes aspectos relacionados à promoção da sustentabilidade desse sistema. Foi realizada extensa revisão bibliográfica, análise de dados secundários provenientes do Cadastro de Produtores de Cacau da Comissão Executiva do Plano da Lavoura Cacaueira (CEPLAC) e de dados primários derivados de pesquisa de campo em 160 estabelecimentos rurais em 14 municípios da Região Econômica Litoral Sul. Os dados primários dos questionários coletados na pesquisa de campo foram analisados quantitativamente e qualitativamente sob a luz do conceito de desenvolvimento sustentável e dos princípios de sustentabilidade em agroecossistemas. No primeiro capítulo, foi caracterizado o contexto histórico do sistema cabruca no Sudeste da Bahia ao longo do século XX, onde constatouse que esse sistema foi aquele que melhor se adaptou as necessidades socioeconômicas dos cacauicultores da região, enquanto demandava menos mão-de-obra e capital. No segundo capítulo, foram examinadas as principais características e a sustentabilidade do agroecossistema cacaueiro nos diferentes tipos de estabelecimentos rurais identificados nos municípios da Região Econômica Litoral Sul do Sudeste da Bahia. O agroecossistema cacaueiro apresentou nos vários tipos de estabelecimentos rurais uma baixa produtividade média e, em geral, uma elevada dependência econômica na cultura do cacau. A concentração média no cultivo do cacau variou entre os diferentes tipos de estabelecimentos, sendo que as empresas tiveram o maior valor nesse item. Os lotes em assentamentos rurais apresentaram os maiores valores do índice de sustentabilidade do agroecossistema cacaueiro, seguidos dos estabelecimentos de empresas. O pior desempenho nesse índice se deu nos estabelecimentos familiares, seguido daqueles patronais com mão-de-obra em regime de parceria. No terceiro capítulo, foram analisadas as preferências e percepções de dirigentes rurais em relação às espécies arbóreas e as práticas de manejo adotadas em 160 estabelecimentos rurais de 14 municípios da região Litoral Sul. Com base nessa análise, foi identificado que existe uma inclinação por parte dos dirigentes rurais em priorizar a regeneração de três espécies nativas madeireiras com elevado valor econômico e o plantio de espécies exóticas, indicando a necessidade de estimular a promoção da regeneração natural de um número maior de espécies nativas assim como o plantio de espécies nativas. Por fim, no quarto capítulo, o estudo da interação entre fatores agronômicos e ambientais no âmbito da avaliação da aptidão agroecológica de terras no Estado da Bahia mostrou que as áreas mais aptas para o cultivo de cacau localizam-se em sua grande parte fora da zona cacaueira tradicional, principalmente ao norte dessa zona. ______________________________________________________________________________ ABSTRACT / The cabruca system, which is the predominant cacao cultivation system in Southeast Bahia, has been in the last decades raised to the category of a sustainable agricultural system,deserving crescent attention from researchers of the environmental and agronomic areas alike. The study of the system becomes even more important, considering the existing pressures towards its conversion to more rentable sun-grown crops. This work aimed at analyzing different aspects related to the promotion of the sustainability of this system. Extensive literature review, analysis of secondary data of the Cacao Producers Cadastre of the Comissão Executiva do Plano da Lavoura Cacaueira (CEPLAC) and of primary data collected from field research in 160 rural farms of 14 municipalities in the Litoral Sul Region were carried out. Primary data from questionnaires collected in the field research were analyzed quantitatively and qualitatively under the light of the sustainable development concept and of sustainability principles in agroecosystems. In the first chapter, the historical context of the cabruca system in Southeast Bahia during the XX century was characterized. It was shown that the cabruca was the system that adapted best to the socioeconomic needs of cacao farmers of the region, since it required lower amounts of labor and capital. In the second chapter, the main characteristics and the sustainability of the cacao agroecosystem in the different farm types identified in the municipalities of the Litoral Sul Economic Region of Southeast Bahia were examined. The cacao agroecosystem in the different farms types showed a low average productivity and, in general, a high economic dependence on the cacao crop. The average concentration on cacao varied among the different farm types, where farms owned by firms obtained the higher value on this item. The allotments in rural settlements presented the higher values in the cacao agroecosystem sustainability index, followed by the farms owned by firms. The worst performance in this index occurred in family farms, followed by patronal farms that employed sharecropping labor. In the third chapter, the preferences and perceptions of farm managers regarding tree species and the management practices adopted in 160 farms in 14 municipalities in the Litoral Sul region were analyzed. Based on this analysis, it was verified that there is an inclination for these farm managers to prioritize the regeneration of three native timber species with high economic value and the planting of exotic species, indicating the need to stimulate the promotion of the natural regeneration of a great number of native species as well as the planting of native species. Finally, in the fourth chapter, the study of influence cacao productivity within the agroecological land suitability assessment in Bahia State showed that the most suitable areas for cacao cultivation are located in its greatest part outside the traditional cacao zone, especially in the northern part of this zone.

Orientador: José Eduardo Corá / Banca: Antonio Baldo Geraldo Martins / Banca: Carlos Ruggiero / Banca: Paulo Cesar Lima Marrocos / Banca: Carolina Fernandes / Resumo: O objetivo geral deste trabalho foi preparar substratos com base orgânica formada de composto do tegumento da amêndoa do cacau CTAC e serragens, misturados à areia, e utilizá-los na produção de mudas de cacaueiro por miniestaquia. Dessa forma, realizaram-se cinco experimentos. Inicialmente foram determinados modelos para retenção de água usando os métodos do funil de tensão e força centrífuga em equivalente de umidade e conclusão de que a centrifugação expressa valores da retenção de água próximos ou iguais àqueles encontrados com o funil. Em outro experimento sobre monitoramento químico verificou-se que a serragem pode ser usada sem pré-lavagem enquanto o CTAC depende desta prática. Ao comparar o crescimento de miniestacas com 4 e 8 cm de comprimento, enraizadas em meio arenoso e transplantadas para sacos de polietileno de 3,4 dm3, verificou-se não haver diferenças significativas entre os comprimentos testados. Outro trabalho cujo objetivo foi verificar a influência de substratos no enraizamento dos clones CCN-51, Cepec-2006, TSA -792 e TSH-1188, usando miniestacas de 4 a 6 cm de comprimento, concluiu que a serragem para o clone TSA -792 e a mistura serragem + CTAC para Cepec-2006 foram superiores ao TSH -1188 para a massa da matéria seca da parte aérea. Finalmente, realizou-se trabalho de caracterização física e avaliação do efeito de substratos à base de serragem e dois recipientes no crescimento de mudas de cacaueiro, no qual verificou-se que o transplante para sacos de 840 cm3 possibilitou maior crescimento das plantas comparado à manutenção em tubetes de 288 cm3 e que a serragem do município de Una-BA, misturada na proporção serragem: areia em 4:1 e 2:1 (v:v), pode ser recomendada para produção de mudas do clone TSH 1188. / Abstract: The objective of this work was to prepare substrates with an organic base formed from composted cacao hulls (CTAC), and sawdust mixed with sand and to use these in the production of cacao saplings from mini-cuttings. Five experiments were conducted. In the first experiment, water retention curves were determined for the substrates using two methods, tension funnels and centrifugation by moisture equivalent method. It was found that centrifugation exhibits retention water values close to or equal to those determined by the funnel method. The following experiment on the chemical properties of substrates verified that sawdust could be used without pre-washing whereas CTAC required rinsing. The comparison of the growth of mini-cuttings of 4 and 8 cm lengths rooted in a sandy medium and transplanted into polyethylene bags of 3.4 dm3 showed no significant differences between the two lengths tested. Other experiment whose aim was to verify the influence of substrates on the rooting of clones CCN-51, Cepec 2006, TSA 792 and TSH 1188, concluded that sawdust for clone TSA 792, and a mixture of sawdust and CTAC for clone Cepec 2006, performed better than TSH 1188 in terms of aboveground dry biomass production. The last work on the physical characterization and the evaluation of the effect of substrates and containers on the growth of the cuttings showed that transplanting into bags of 840 cm3 enabled greater growth compared to tubettes of 288 cm3. Furthermore, the sawdust derived from the Una-BA district mixed in pure sand at a ratio 4:1 and 2:1 (v:v) could be recommended for the production of cuttings of the clone TSH 1188. / Doutor

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:33:40Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2007-05-03Bitstream added on 2014-06-13T20:25:33Z : No. of bitstreams: 1 sodre_ga_dr_jabo.pdf: 511681 bytes, checksum: 617ee1c509ff5eaaa47745dbd396855d (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Funep / O objetivo geral deste trabalho foi preparar substratos com base orgânica formada de composto do tegumento da amêndoa do cacau CTAC e serragens, misturados à areia, e utilizá-los na produção de mudas de cacaueiro por miniestaquia. Dessa forma, realizaram-se cinco experimentos. Inicialmente foram determinados modelos para retenção de água usando os métodos do funil de tensão e força centrífuga em equivalente de umidade e conclusão de que a centrifugação expressa valores da retenção de água próximos ou iguais àqueles encontrados com o funil. Em outro experimento sobre monitoramento químico verificou-se que a serragem pode ser usada sem pré-lavagem enquanto o CTAC depende desta prática. Ao comparar o crescimento de miniestacas com 4 e 8 cm de comprimento, enraizadas em meio arenoso e transplantadas para sacos de polietileno de 3,4 dm3, verificou-se não haver diferenças significativas entre os comprimentos testados. Outro trabalho cujo objetivo foi verificar a influência de substratos no enraizamento dos clones CCN-51, Cepec-2006, TSA -792 e TSH-1188, usando miniestacas de 4 a 6 cm de comprimento, concluiu que a serragem para o clone TSA -792 e a mistura serragem + CTAC para Cepec-2006 foram superiores ao TSH -1188 para a massa da matéria seca da parte aérea. Finalmente, realizou-se trabalho de caracterização física e avaliação do efeito de substratos à base de serragem e dois recipientes no crescimento de mudas de cacaueiro, no qual verificou-se que o transplante para sacos de 840 cm3 possibilitou maior crescimento das plantas comparado à manutenção em tubetes de 288 cm3 e que a serragem do município de Una-BA, misturada na proporção serragem: areia em 4:1 e 2:1 (v:v), pode ser recomendada para produção de mudas do clone TSH 1188. / The objective of this work was to prepare substrates with an organic base formed from composted cacao hulls (CTAC), and sawdust mixed with sand and to use these in the production of cacao saplings from mini-cuttings. Five experiments were conducted. In the first experiment, water retention curves were determined for the substrates using two methods, tension funnels and centrifugation by moisture equivalent method. It was found that centrifugation exhibits retention water values close to or equal to those determined by the funnel method. The following experiment on the chemical properties of substrates verified that sawdust could be used without pre-washing whereas CTAC required rinsing. The comparison of the growth of mini-cuttings of 4 and 8 cm lengths rooted in a sandy medium and transplanted into polyethylene bags of 3.4 dm3 showed no significant differences between the two lengths tested. Other experiment whose aim was to verify the influence of substrates on the rooting of clones CCN-51, Cepec 2006, TSA 792 and TSH 1188, concluded that sawdust for clone TSA 792, and a mixture of sawdust and CTAC for clone Cepec 2006, performed better than TSH 1188 in terms of aboveground dry biomass production. The last work on the physical characterization and the evaluation of the effect of substrates and containers on the growth of the cuttings showed that transplanting into bags of 840 cm3 enabled greater growth compared to tubettes of 288 cm3. Furthermore, the sawdust derived from the Una-BA district mixed in pure sand at a ratio 4:1 and 2:1 (v:v) could be recommended for the production of cuttings of the clone TSH 1188.

Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2017-01-03T12:27:54Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 682821 bytes, checksum: 252f4f3303c2480d714227ccfa7bc851 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-01-03T12:27:54Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 682821 bytes, checksum: 252f4f3303c2480d714227ccfa7bc851 (MD5) Previous issue date: 2016-07-27 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / As sementes fermentadas e secas do cacaueiro (Theobroma cacao L.) constituem a matéria-prima para a produção de chocolate, cuja cadeia produtiva envolve 60 bilhões de dólares anuais. A coleta, avaliação e conservação de germoplasma de cacau são muito importantes para os programas de melhoramento. Todavia, o nível e a distribuição da variação em populações silvestres são pouco conhecidos. Dessa forma, os objetivos do presente estudo foram: Avaliar a diversidade e o padrão de distribuição da mesma, entre e dentro de populações de cacau de diferentes bacias hidrográficas; avaliar a hipótese de diferenciação das populações por bacia e avaliar o potencial dos acessos clonais de cacau para o melhoramento. Para a avaliação foram coletados, durante quatro anos consecutivos, dados morfológicos de 145 acessos clonais provenientes de nove bacias hidrográficas: 1. Delta/estuário-PA, 2. Ji-Paraná- RO, 3. Solimões/Amazonas-PA, 4. Jamari-RO, 5. Clones alienígenas-TTO, 6. Clones alienígenas-PER, 7. Solimões/Amazonas-AM, 8. Acre-AC e 9. Clones melhorados-RO. Foram avaliadas 11 características, das quais nove relativas ao fruto, por planta: NTFC (Número total de frutos colhidos), NTFS (Número total de frutos sadios), MSUFS (Massa de sementes úmidas dos frutos sadios, em g), MMUSFS (Massa média de sementes úmidas por fruto sadio, em g), MSSFS (Massa de sementes secas dos frutos sadios, em g), MMSSFS (Massa média de sementes secas por frutos sadios, em g), PFVB (Percentagem de frutos com vassoura-de-bruxa), PFBR (Percentagem de frutos com broca), PFGE (Percentagem de frutos com sementes germinadas), NRVB (Número de ramos com vassoura-de-bruxa) e NAFVB (Número de almofadas florais com vassoura- de-bruxa). Os acessos pertencem ao Banco Ativo de Germoplasma da Estex- OP, localizado em Ouro Preto do Oeste-RO. Dados de oito das 11 características foram submetidos às análises de variância (ANAVAs) e ao cálculo distância de Mahalanobis (D2) entre as bacias. Com base nas ANAVAs, houve diferenças significativas (P<0,05) para todas as características e a maior variabilidade foi detectada dentro das populações de cacau. Sendo assim, recomenda-se que a coleta de materiais botânicos silvestres priorize maior número de plantas de poucas populações das bacias mais divergentes. Valores significativos (P<0,05) de D2 evidenciaram maior divergência entre as bacias Ji- Paraná-RO e Solimões/Amazonas-PA (27,7) e maior semelhança entre Ji- Paraná-RO e Jamari-RO (1,39), com relação as suas populações. A análise multivariada revelou também que a diferenciação dos acessos ocorreu de acordo com o sistema de bacias hidrográficas. Utilizando-se dados das 11 características foram processadas a correlação de Pearson e as análises de variância (ANAVAs). As maiores correlações significativas (P<0,05) foram observadas entre NTFC e NTFS (0,94), NTFS e MSUFS (0,86), NRVB e NAFVB (0,542) e entre NTFC e MSUFS (0,84). Com base nas ANAVAs, houve diferenças significativas (P<0,05) entre acessos para todas as características, o que amplia as possibilidades de ganho com a seleção. / The fermented and dried seeds of the cacao tree (Theobroma cacao L.) are the raw material for the production of chocolate, whose production chain involves 60 billion annually. The collection, evaluation and cocoa germplasm conservation are very important for breeding programs. However, the level and distribution of variation in wild populations are unknown. Thus, the objectives of this study were to evaluate the diversity and distribution pattern of the same, between and within cacao populations in different river basins; assess the possibility of differentiation of populations by basin and assess the potential of clonal cocoa accessions to improvement. For the evaluation were collected for four consecutive years, morphological data of 145 clonal access from nine river basins: 1. Delta/estuário- PA, 2. Ji-Paraná-RO, 3. Solimões/Amazonas-PA, 4. Jamari-RO, 5. Clones alienígenas-TTO, 6. Clones alienígenas-PER, 7. Solimões/Amazonas-AM, 8. Acre-AC e 9. Clones melhorados-RO. We evaluated 11 characteristics, nine of which related to fruit, per plant: NTFC (Total number of fruits), NTFS (total number of healthy fruits), MSUFS (Mass wet seeds of healthy fruits, g), MMUSFS (Massa average wet seed for healthy fruit, g), MSSFS (Mass dry seeds of healthy fruits, g), MMSSFS (average mass of dry seeds for healthy fruits, g), PFVB (fruit Percentage of witches' -bruxa) PFBR (Percentage of fruit with drill), PFGE (Percentage of fruits with seeds germinated), NRVB (number of branches with witch's broom) and NAFVB (number of flower cushions with witch's broom). Accesses belong to the Active Germplasm Bank of Estex-OP, located in Ouro Preto do Oeste-RO. Data from eight of the 11 characteristics were submitted to analysis of variance (ANAVAs) and calculate Mahalanobis distance (D2) between the basins. Based on ANAVAs, there were significant differences (P <0.05) for all features and greater variability was detected within the cocoa populations. Therefore, it is recommended that the collection of wild botanical materials prioritizes greater number of plants of a few populations of the different basins. Significant values (P <0.05) D2 showed greater divergence between basins Ji- Paraná-RO and Solimões/Amazonas-PA (27.7) and greater similarity between Ji- Paraná-RO and Jamari-RO (1.39 ), regarding their populations. Multivariate analysis also revealed that the differentiation of access took place according to the system of watersheds. Using data from 11 characteristics were processed Pearson's correlation and analysis of variance (ANAVAs). The higher significant correlation (P <0.05) were observed between NTFC and NTFS (0.94), NTFS and MSUFS (0.86), and NRVB NAFVB (0.542) and between NTFC and MSUFS (0.84). Based on ANAVAs, there were significant differences (P <0.05) access to all features, which increases the gain of possibilities with the selection.

Cocoa Agroflorestry Systems (AFS) of the BR-230 road in addition to being an alternative to the recovery of deforested and degraded areas of the Amazon are able to integrate forest and agriculture providing environmental services such as the maintenance of biodiversity, the water cycle and the carbon stocks. However, the economic logic of market of cocoa does not take into consideration the market failures, especially not internalize the positive externalities of environmental services, mainly cocoa Agroforestry systems carbon of the BR-230 road. Therefore, the farmer is not compensated for this effort in maintaining the environmental service carbon in your activity. Thus, in this paper we present a compensation mechanism with a methodology for the REDD to productive activities from the study of the Marginal Private Cost and Marginal Private Benefit of the cocoa market in the Satate of Pará, using parameters of the productive activity of cocoa AFSs of the BR-230 road, as the Carbon stocked in time to compose the Socioenvironmental Benefit. This Socioenvironmental Benefit is composed by the Productivity of the activity, the value of Carbon Stocked and primarily by the Carbon Stocked in time of cocoa AFSs for a period of thirty years. As a result of the study we have the the Socioenvironmental Benefit tool to solve the problems of market failure for the deployment of REDD to the farmers of AFS, this compensation mechanism is based on a Positive Socioenvironmental Externality policy justified by Pigouviana Tax. Therefore, the compensation mechanism presents a vision of integration between the social, economic and environmental dimensions as different logic to farmers of AFSs of transamazonian highway that promotes benefits for conservation and preservation without deforestation and without degradation to which the farmer to keep perpetuating the conservation allowing an increase in income of farmers in the period where there is greater activity cost and no revenue return and in the last years as a form of investment for a renewal of the area in use with a new planting or maintenance of an old area or new area deployment of AFS. Thus, this compensation mechanism is an important factor in the financing of a new development model of Amazon with a REDD policy. / Os Sistemas Agroflorestais (SAFs) de cacaueiro da BR-230 além de ser uma alternativa para a recuperação de áreas desmatadas e degradadas da Amazônia são capazes de integrar floresta e agricultura proporcionando serviços ambientais como a manutenção da biodiversidade, o ciclo da água e o estoque de carbono. Porém, a lógica econômica do mercado de cacau não leva em consideração as falhas de mercado, sobretudo não internaliza as externalidades positivas dos serviços ambientais, principalmente o carbono dos Sistemas Agroflorestais de cacaueiro da BR-230. Portanto, o produtor rural não é compensado por este esforço em manter o serviço ambiental carbono em sua atividade. Assim, neste trabalho apresentamos um mecanismo de compensação com uma metodologia para o REDD para atividades produtivas a partir do estudo do Custo Marginal Privado e do Benefício Marginal Privado do mercado de cacau do Estado do Pará e, usando parâmetros da atividade produtiva dos SAFs de cacaueiro da BR-230, como o Carbono Estocado no Tempo para compor o Benefício Socioambiental. Este Benefício Socioambiental é composto pela Produtividade da Atividade, Valor do Carbono Estocado e primordialmente pelo Carbono Estocado no Tempo dos SAFs de cacaueiro para um período de trinta anos. Do estudo resultou a ferramenta do Benefício Socioambiental para solucionar os problemas da falha de mercado para a implantação do REDD para o produtor rural da SAF, mecanismo de compensação baseado na política de externalidade socioambiental positiva justificado pela Taxa Pigouviana. Portanto, o mecanismo de compensação apresenta uma visão de integração entre as dimensões social, econômica e ambiental como lógica diferente para os produtores rurais de SAFs da rodovia Transamazônica que promove benefícios para a conservação e preservação sem desmatamento e sem degradação para que o produtor continue perpetuando a conservação possibilitando um acréscimo na renda do produtor rural no período onde há maior custo da atividade e nenhuma receita de retorno e, nos últimos anos como forma de investimento de uma renovação da área em uso com um novo plantio ou com a manutenção de uma área antiga ou implantação de nova área de SAF. Desta forma, este mecanismo de compensação é um importante fator no financiamento de um novo modelo de desenvolvimento da Amazônia com uma política de REDD.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Ciência dos Alimentos, Florianópolis, 2016. / Made available in DSpace on 2016-09-20T04:43:55Z (GMT). No. of bitstreams: 1 340537.pdf: 3500283 bytes, checksum: 773ef1050240049b4f170ade579736c7 (MD5) Previous issue date: 2016 / O setor produtivo do cacau tem obtido resultados positivos com o aumento de seu consumo no país e no exterior, resultando em crescimento na produção e aumento dos preços no mercado interno e externo. A qualidade das amêndoas de cacau pode ser alterada no cultivo e armazenamento por insetos, ácaros e fungos, podendo atingir a parte comestível. O objetivo deste trabalho foi avaliar a qualidade e segurança de amêndoas de cacau e seus produtos, com o intuito de otimizar etapas de cultivo, processamento, armazenamento e, consequentemente, propiciar maiores ganhos econômicos, através do aumento da qualidade do chocolate. Além disso, avaliar o efeito do gás ozônio na descontaminação de fungos em amêndoas de cacau. Foram realizados três trabalhos (1) [Título: Qualidade dos ovos de Páscoa e outros produtos de cacau (Theobroma cacao L.): insetos, ácaros, fungos e embalagens versus pontos críticos de controle]; (2) [Titulo: Controle de condições de armazenamento e processamento de amêndoas de cacau (Theobroma cacao L.) para a produção de chocolates seguros] e (3) [Titulo: Descontaminação pelo gás ozônio de amêndoas de cacau (Theobroma cacao L.) inoculadas com Aspergillus flavus]. No trabalho (1) foram avaliadas características do produto interno e suas embalagens de produtos de chocolate de diferentes marcas, coletados em supermercados de Florianópolis, no período de Março / 2013 a Março / 2014. As amostras foram coletadas randomicamente e transportadas para o LABMICO, para análises de sujidades, micológicas, embalagens, umidade e atividade de água. Com relação aos resultados obtidos, os produtos de chocolate apresentaram 53% de amostras com contaminantes biológicos, incluindo insetos, larvas, ácaros e fungos. Fungos foram encontrados em 41% das amostras, predominando Penicillium, Aspergillus e Rhizopus. Em relação as embalagens, 9% estavam em desacordo, com a presença de manchas, perfurações, insetos e larvas. Além disso, um total de 15% dos conteúdos internos apresentaram oxidação, odor rançoso, manchas, perfurações e larvas vivas na massa do chocolate. A presença de contaminantes biológicos nos alimentos é um indicativo de descuido com o controle higiênico-sanitário durante o processamento.Embalagens impróprias podem permitir a passagem destes contaminantes para o próprio chocolate, o que reduz substancialmente a sua qualidade. No trabalho (2) foram avaliadas a segurança das amêndoas de cacau (etapas de processamento, instalações de armazenagem contra sua exposição às condições ambientais), coletados de diferentes fazendas produtoras de cacau e armazéns, no sul da Bahia, no período de Março / 2014 a Julho / 2014. Com relação aos resultados obtidos, foi possível observar que 67% das instalações nas fazendas e armazéns avaliados não apresentam ambiente automático, incluindo as configurações de controle (ou seja, equipamento de aeração e temperatura). É importante ressaltar que os danos mecânicos ou biológicos provenientes do ataque de insetos e roedores nas amêndoas favorecem a absorção de umidade e facilitam a invasão e a penetração de fungos na parte comestível das amêndoas, levando ao rápido desenvolvimento de fungos e produção de micotoxinas. No trabalho (3) foram avaliados o efeito do ozônio (O3) utilizado como método químico de descontaminação em amêndoas de cacau contaminadas artificialmente com cepas de fungos de armazenamento. Com relação aos resultados obtidos, este mostrou eficiência com a inibição imediata de 87% de esporos de A. flavus após tratamento com gás ozônio na concentração de 60 µmol/mol e 180 min de exposição. Além disso, as amêndoas não apresentaram rancidez oxidadiva após a sua aplicação. Sob as condições de estudo, o tratamento mais eficaz, obtendo inibição de 100% dos esporos ocorreu após 30 dias de armazenamento das amêndoas. O gás O3 tem vantagens por ser internacionalmente reconhecido como seguro, além de ser considerado um método promissor de descontaminação em indústrias e unidades armazenadoras por não deixar resíduos nos alimentos. O presente estudo pode servir de interesse e subsídio para os produtores de cacau, armazéns e indústrias de chocolate entender as suscetibilidades de deterioração, frente aos contaminantes, como sujidades, fungos e micotoxinas, além de despertar interesse das agências reguladoras para futuros ajustes e aplicações sobre medidas preventivas e de controle para melhorar a qualidade e segurança do produto.<br> / Abstract : The production of the cocoa sector has obtained positive results with an increase in its consumption in the country and abroad, resulting in a growth of production and the prices improvement in the domestic and foreign markets. Cocoa beans can be attacked during cultivation and storage by insects, mites and fungi, and can reach the edible part, as well as being incorporated into chocolate products. The objective of this study was to evaluate the quality and safety of cocoa beans and their products, in order to optimize stages of cultivation, processing, storage and consequently provide greater economic gains by increasing the quality of the chocolate. They conducted three studies (1) [Title: Easter eggs and other cocoa (Theobroma cacao L.) products quality: insects, mites, fungi and packaging versus control points]; (2) [Title: Cocoa (Theobroma cacao L.) beans processing and storage conditions control for safe chocolate products] and (3) [Title: Decontamination of cocoa beans (Theobroma cacao L.) inoculated with Aspergillus flavus by ozone gas]. In (1) characteristics were evaluated domestic product and its packaging of chocolate products of different brands, collected in Florianopolis supermarkets, from March / 2013 to March / 2014. The samples were collected randomly transported to the LABMICO to analysis of light filth, mycological, packaging, moisture and water activity. Regarding the results, the chocolate products showed 53% of samples with biological contaminants. Fungi were found in 41% of samples, predominantly Penicillium, Aspergillus and Rhizopus. Despite this, the packaging, 9% were at odds with the presence of stains, holes, insects and larvae. In addition, a total of 15% of the internal contents showed oxidation, rancid odor, staining, and live larvae perforations in the chocolate mass, quite disgusting to consumers. In (2) were evaluated the safety of cocoa beans (processing steps, storage facilities against their exposure to environmental conditions), collected from different farms producing cocoa and warehouses in the south of Bahia, in the period March / 2014 to July / 2014. Regarding the results, the facilities of the farms and evaluated warehouses, 67% have no automatic environment, including control settings (ie, aeration and temperature). Importantly, biological or mechanical damage from the attack of insects and rodents in almonds favor moisture absorption and facilitate the invasion and penetration of fungi in the edible part of cocoa beans, leading to the rapid development of mold and mycotoxin production. In (3) were evaluated the effect of ozone (O3) used as a chemical decontamination method in cocoa beans artificially infected with strains of storage fungi Aspergillus flavus. Regarding the results, it showed efficiency with immediate inhibition of 87 % of spores of A. flavus. In addition, coco beans showed no rancidity oxidadiva after application. Under the study conditions, the most effective treatment was 60 µmol/mol concentration of O3 with longer exposure time (180 min) to give 100% inhibition of the spores. O3 gas has advantages because it is internationally recognized as safe, and is considered a promising method of decontamination in industrial and storage units not leave residues in food. This study can serve as interest and benefit to cocoa producers, warehouses and chocolate industries understand the deterioration of susceptibilities, against the growth of light filth, fungi and mycotoxins, and regulatory agencies for future adjustments and applications on preventive measures and control to improve the quality and safety of the product.

Orientador: Anita Jocelyne Marsaioli / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Quimica / Made available in DSpace on 2018-08-13T13:31:18Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Martins_LucasGelain_M.pdf: 1200827 bytes, checksum: 8708dd4e868d8749ef0f4a5d27b03248 (MD5) Previous issue date: 2009 / Resumo: Técnicas de RMN de H foram aplicadas no estudo de metabolômica de Theobroma cacao e interações proteínas ¿ ligantes. Esses dois tópicos são reportados em dois capítulos. O primeiro descreve a análise quantitativa por RMN de H de 8 metabolitos de Theobroma cacao endógenos ou produzidos durante a fermentação de 10 diferentes variedades resistentes ao fungo Moniliophthora perniciosa. Os espectros foram obtidos de extratos aquosos saturando o sinal da água com pressaturação. Os metabólitos monitorados foram: glicose, sacarose, frutose, etanol, cafeínas e os ácidos acético, lático e succínico. O teor dos metabólitos presentes em 7 dessas variedades são similares àqueles de T. cacao comum e análise sensorial selecionou aquelas com maior teor de cafeína como as melhores. O segundo capítulo descreve as interações acetilcolinesterase/alcalóides de Amaryllidaceae e proteína de membrana bacteriana/fosfomicina, com os mapas de epitopo de interação dos ligantes com as macromoléculas determinados por RMN de H ¿ STD (Saturation Transfer Difference). O mapa de epitopo para acetilcolinesterase/fisostigmina foi confirmado por cálculos de ¿doking¿ molecular. A constante de dissociação aparente da fisostigmina com acetilcolinesterase foi obtida através das medidas de T1 seletivo. Interação entre células integras de Escherichia coli CCT 5050, Serratia liquefaciens CCT 7262 e fosfomicina indicaram que microrganismo resistente ao antibiótico (Serratia liquefaciens) não apresentaram sinais no experimento de RMN de H ¿ STD enquanto que o microrganismo não resistente (Escherichia coli) apresenta sinais no mesmo experimento. Esses resultados certamente contribuirão para a elucidação do mecanismo de ação da fosfomicina / Abstract: H NMR tecniques were applied to study Theobroma cacao metabolomics and protein-ligand supramolecular interactions. These two topics are reported in two chapters. First chapter describes the H NMR quantitative analysis of 8 Theobroma cacao secondary metabolites which are endogenous or produced during the fermentation process of 10 different varieties resistent to the Moniliophthora perniciosa fungus. The spectra were obtained from the aqueous extracts saturating the water signal with the PRESAT tecnique. The monitored metabolites were: glucose, sacharose, fructose, ethanol, cafeine and the acids acetic, latic and succinic. The abundance of the metabolites present in 7 of these varieties were similar to those in comon T. Cacao and sensory analysis selected those with high cafeine content as the best. The second chapter describes the supramolecular interactions of acetylcholisterase/Amaryllidaceae alkaloids and bacterial membrane protein /fosfomicine, with the epitope mapping of the interactions of the ligands to the macromolecules obtained by H NMR STD (saturation transfer difference). The epitope mapping of acetylcholisterase/Amaryllidaceae alkaloids was confirmed by molecular docking calculations. The apparent dissociation constant of the fisostigmine which is an acetylcholinesterase inhibitor was obtained by applying selective T1. Interactions of Escherichia coli CCT 5050, Serratia liquefaciens CCT 7262 whole cells and fosfomycin indicated that microorganisms resistent to this antibiotic (Serratia liquefaciens) did not show signal in the H NMR STD experiment while non resistent microorganism (Escherichia coli) showed signals in the same experiment. This data will certainly contribute to the elucidation of fosfomycin action mechanism / Mestrado / Quimica Organica / Mestre em Química