Les récepteurs couplés aux protéines G (RCPG) constituent la plus grande famille de protéines transmembranaires et régulent une panoplie de processus physiologiques. La densité de récepteurs exprimés à la surface d'une cellule dicte l’intensité de la réponse cellulaire suite à l’activation par un ligand. Un débalancement dans les niveaux d’expressions protéiques est la cause de plusieurs pathologies. C’est pourquoi il est d’une importance capitale de comprendre les mécanismes qui régissent les niveaux d’expressions totaux et membranaires des RCPG. Dans un premier temps, nos travaux ont permis de caractériser la dynamique d’internalisation et de recyclage du récepteur CRTH2. Nous avons identifié les domaines qui sont impliqués dans la régulation du trafic du récepteur. Des essais d’expression de surface ont révélé les cibles majeures des GRK2, GRK5, de la PKC et de l’arrestine-3 pour l’internalisation de CRTH2 suite à une stimulation du récepteur. De plus, nous rapportons la présence d’un motif de recyclage interne de type PDZ dans la queue cytoplasmique de CRTH2. Avant de se rendre à la membrane plasmique, les RCPG doivent être synthétisés au réticulum endoplasmique (RE), subir des étapes de maturation au Golgi et être transportés à la membrane plasmique. Les évènements coordonnant ces processus sont encore très peu étudiés. La dernière partie de nos travaux a permis d’élucider différents mécanismes régulant le contrôle qualité des RCPG à un stade précoce de synthèse. Tout d’abord, une nouvelle stratégie de purification protéomique a été développée et validée dans le but d’identifier des nouveaux partenaires d’interaction des RCPG dans un contexte cellulaire. Les résultats des criblages ont montré une interaction entre le récepteur [beta indice inférieur 2]AR et l’ubiqutine ligase RNF5. Ceci a conduit à la découverte d’un nouveau mécanisme de contrôle qualité des RCPG faisant intervenir les protéines RNF5 et JAMP comme étant des composantes importantes d’un système de régulation qui module la stabilité des RCPG. En dernier lieu, une nouvelle protéine, ANKRD13A, régulerait l’expression des RCPG par un mécanisme encore inconnu. Des évidences nous permettent de croire que les protéines RNF5, JAMP et ANKRD13A feraient partie d’un complexe protéique régulant le contrôle qualité des RCPG au RE.

Made available in DSpace on 2016-06-02T19:05:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DissLAFB.pdf: 1617842 bytes, checksum: 0e04147b28caae9983df30e2b3a878bd (MD5) Previous issue date: 2006-12-14 / This master thesis deals with the involved aspects for the creation of a framework for connectivity in JAMP (Java Architecture for Media Processing). The conception of this framework aims to make possible the use of mobile devices by means of other wireless network technologies. Such technologies, as Bluetooth, used for the publication/localization of services registered in the JBroker, the broker of JAMP Platform developed in Java/RMI, as well as the communication of devices that make use of such technologies through this broker, had been used in the implementation and tests of the framework developed. The implementation aims to access, from devices with Bluetooth network interface, the available remote services in the Internet. These services are requested by mobile devices, such as PDAs, cellular or smartphones, that they consult access points, in Bluetooth communication. The access points consult the JBroker that returns a reference for the service to be consumed. The access points then direct the result to the mobile devices. The experiments developed in this work had been based on scenes where a mobile device, in Bluetooth communication, requests services to a point of access in a PC and this, saw TCP/IP, invokes remote methods in the servers who disponibilizam the services, saw Java/RMI. JAMP already all presented the mechanism of localization of services saw Java/RMI, however it did not present the extension developed with this work, where they had been created one proxy, that it is executed in the access point, and the use of services of the JAMP to break mobile devices that if communicate through technology of different net of TCP/IP. Being thus, its innovation is in the capacity of use of devices that make use of technology of Bluetooth net, being able to be extended to other technologies, without needing would reengeneering previously existing in the architecture. / Esta dissertação de mestrado trata dos aspectos envolvidos para a criação de um framework de conectividade na JAMP (Java Architecture for Media Processing). A concepção desse framework tem por objetivo possibilitar a utilização de dispositivos móveis por meio de outras tecnologias de rede sem fio. Tais tecnologias, como Bluetooth, usadas para a publicação/localização de serviços registrados no JBroker, broker da Plataforma JAMP desenvolvido em Java/RMI, bem como a comunicação de dispositivos que dispõem de tal tecnologia, foram empregadas na implementação e testes do framework desenvolvido. A implementação visa ao acesso, a partir de dispositivos com interface de rede Bluetooth, a serviços remotos disponíveis na Internet. Esses serviços são requisitados por dispositivos móveis, tais como PDAs, celulares ou smartphones, que consultam pontos de acesso, via Bluetooth. Os pontos de acesso consultam o JBroker que retorna uma referência para o serviço a ser consumido. Os pontos de acesso então encaminham o resultado aos dispositivos móveis. Os experimentos desenvolvidos neste trabalho basearam-se no cenário onde um dispositivo móvel, em comunicação Bluetooth, requisita serviços a um ponto de acesso em um PC e este, via TCP/IP, invoca métodos remotos nos servidores que disponibilizam os serviços, via Java/RMI. A JAMP já apresentava todo o mecanismo de localização de serviços via Java/RMI, porém não apresentava a extensão desenvolvida neste trabalho. Nesta, foram criados um proxy, que é executado no ponto de acesso, e a utilização de serviços da JAMP a partir de dispositivos móveis que se comunicam através de tecnologia de rede diferente de TCP/IP. Sendo assim, sua inovação está na capacidade de utilização de dispositivos que dispõem de tecnologia de rede Bluetooth, podendo ser estendido a outras tecnologias, sem necessitar da reengenharia previamente existente na arquitetura

Made available in DSpace on 2016-06-02T19:05:35Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2592.pdf: 1999742 bytes, checksum: 8e5aad7d487acff1acad9e2f0dff4dd9 (MD5) Previous issue date: 2004-02-26 / Financiadora de Estudos e Projetos / This work presents the information distribution model adopted within OpenReality architecture (OR), and the related issues of its structures integration. Distributed Visualization Applications can be created using OR framework, which permits redefinitions, specializations and customizations. During distributed visualization application development, it s possible to choose the communication protocol to be used and its parameters. The consistency and interactivity concepts and their behavior for each information distribution model are also discussed. Among the main used structures is JAMP Platform (Java Architecture for Media Processing), which was upgraded to support OR requirements. JNDS application domain framework and JAMP2C development tool were added to JAMP development package. In a general way, the contribution of this project is to offer a new method for creating distributed visualization applications. Besides, this work improves the maturity of JAMP Platform, which now has a new framework and a new development tool available. / Este trabalho apresenta o modelo de distribuição de informação adotado na arquitetura OpenReality (OR), bem como as questões envolvidas na integração das estruturas nela adotadas. Aplicações de Visualização Distribuída podem ser criadas a partir do uso do framework OR, que aceita redefinições, especializações e personalizações. Durante o desenvolvimento de uma aplicação de visualização distribuída, é possível a escolha do protocolo de comunicação a ser utilizado, bem como suas parametrizações. Os conceitos de consistência e de interatividade e seus comportamentos diante de cada modelo de distribuição de informação também são discutidos. Entre as principais estruturas utilizadas, encontra-se a Plataforma JAMP, que sofreu significativas expansões para suportar os requisitos impostos pela arquitetura OR. O framework de domínio de aplicação JNDS e a ferramenta de auxílio ao desenvolvimento JAMP2C foram adicionados ao pacote que compõe a JAMP. De maneira geral, a contribuição do projeto do Subsistema de Comunicação e Distribuição e da Camada de Serviços da arquitetura OR é a disponibilização de um novo mecanismo para a criação de aplicações de visualização distribuída. Além disso, este trabalho avança mais um passo no processo de amadurecimento da Plataforma JAMP, que passa a contar com mais um framework e uma ferramenta para auxílio no desenvolvimento de suas aplicações.

Made available in DSpace on 2016-06-02T19:06:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1 4732.pdf: 3415662 bytes, checksum: 0b118a8a41e64b0a67c7b0956df6d970 (MD5) Previous issue date: 2012-09-12 / Universidade Federal de Sao Carlos / Immersive, interactive, and collaborative distributed applications, due to their real time and multi-platform characteristics, require a monitoring structure of their functionalities during the development period, which is not fully available in the current monitoring systems, which are usually specific of the languages and platforms in which they are made available. Monitoring systems that require synchronism of distributed objects during the processing is a complex task. Especially in distributed systems from multi-projection where timing is critical to its operation. It is often difficult to check the correct execution of the system. It might be useful for developers and users of such systems to have the ability of identifying, for example, if the reason for the system delay is due to the abusive use of a resource or due to programming mistakes; the identification of which object has crashed, compromising the system as a whole. Distributed object systems, also known as SOA (Service Oriented Architecture), generally use middleware of the broker type in their infrastructure and can have a dynamic number of connected clients or servers when running. There are, in the literature, several tools for the monitoring of performance, resources, debugging, and support, among others, of such systems. Nevertheless, the tools available in the literature are limited to programming languages or platforms that are able to process the monitoring agents related to them. In this work, a tool for the monitoring of distributed object systems is proposed, based on communication described in XML documents, which allows language and platform independence in the such systems development. A structure for the design of tools for the monitoring of distributed object systems is proposed, based on communication described in XML documents, which allows language and platform independence in the such systems development. In addition to the structure that is theoretically founded, the conception of a tool is structured in the manner described and proven in monitoring data from a case study. / Aplicações Distribuídas Imersivas, Interativas e Colaborativas, dadas suas características de tempo real e multiplataformas, demandam uma estrutura de monitoramento de suas funcionalidades, não plenamente disponíveis nos sistemas atuais de monitoramento, em geral específicos das linguagens e plataformas em que são disponibilizadas. Monitorar sistemas que necessitam de sincronismo no processamento de objetos distribuídos é uma tarefa complexa. Principalmente em sistemas distribuídos e de multiprojeção, onde o sincronismo é fundamental para seu funcionamento. Muitas vezes, é difícil apurar o correto funcionamento dos mesmos. Pode ser útil a desenvolvedores e usuários de tais sistemas a capacidade de se identificar, por exemplo, se a lentidão do sistema está sendo ocasionada por: uso abusivo de um recurso; por um erro na programação de um objeto ou; a identificação de qual objeto travou, comprometendo o sistema como um todo. Sistemas de objetos distribuídos, também conhecidos como SOA (Service Oriented Archtecture), geralmente utilizam mediadores do tipo broker em sua infraestrutura e podem ter um número dinâmico de clientes ou servidores conectados quando estão em execução. Existem na literatura diversas ferramentas destinadas ao monitoramento de performance, recursos, depuração, auxílio, manutenção de tais sistemas, etc. Porém, as ferramentas encontradas na literatura são restritas a linguagens ou plataformas que possam processar os agentes de monitoramento vinculados às mesmas. Neste trabalho, é proposta uma estrutura para a concepção de ferramentas para o monitoramento de sistemas de objetos distribuídos baseados em comunicações descritas em documentos XML, o que permite independência de linguagem ou plataforma na concepção de tais sistemas. Além da estrutura que é teoricamente fundamentada, a concepção de uma ferramenta nos moldes estruturados é descrita e provada no monitoramento de um estudo de caso.

This thesis describes techniques for defining independent tasks in Java programs forparallelization. Existing Java parallelization APIs like JOMP, Parallel Java,Deterministic Parallel Java, JConqurr and JaMP are discussed. We have seen that JaMPis an implementation of OpenMP for Java, and it has a set of OpenMP directives andruntime library functions. We have discussed that JaMP has source to byte codecompiler, and it does not help in debugging the parallel source codes. There is no designtime syntax checking support of JaMP directives, and we know about mistakes onlywhen we compile the source code with JaMP compiler. So we have decided tocontribute JaMP with adding an option in the compiler to get parallel source code. Wehave created an eclipse plug-in to support design time syntax checking of JaMPdirectives too. It also helps the programmers to get quickly parallel source code withjust one click instead of using shell commands with JaMP compiler.