No description available.

No description available.

In the absence of X-ray structure of L-type Ca²⁺ channel (LCC), we have built a homology model of LCC based on the crystal structure of KcsA channel and have performed a series 0° docking simulations. The search for lowest-energy conformations was performed by the Monte Carlo energy-minimization method. To obtain the conformation with the lowest energy where dihydropyridine (DHP) ligand forms optimal contacts with the DHP-sensing residues of the channel, we have tested different sequence alignments between KcsA and LCC, and have docked the ligand inside the pore of the channel as well as into the interface between repeats IIIS5-IIIS6-IVS6. The LCC ligand tetrandrine was used during the studies of the selectivity filter of the channel. Conformational studies of the drug and its interaction with Ca²⁺ ions in a non-polar solution were performed by NMR spectroscopy. These experiments have demonstrated the binding of Ca²⁺ ions to the ligand. In the model based on the alignment proposed by Lipkind and Fozzard (2000), the DHP ligand nifedipine fits inside the pore and forms favorable contacts with several hydrophobic DHP-sensing residues, and forms hydrogen bonds with conserved tyrosines in repeats HI and IV. These interactions stabilize the portside-down docking mode of nifedipine, in which this blocker exposes its hydrophobic methoxy group to the bracelet of hydrophobic residues forming the gate of the channel near the crossing of the bundle of helices. The stabilizes the closed state of the channel. In contrast, the agonist has the hydrophilic group at its portside. The favorable interaction of this group with hydrated Ca²⁺ ion facilitates its permeation through hydrophobic gate. We have simulated the passage of the hydrated ion along the pore with the agonist bound inside and determined several residues crucial for this passage. The role of these residues can be tested experimentally. / Thesis / Master of Science (MSc)

No description available.

Made available in DSpace on 2015-05-14T12:59:40Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Arquivototal.pdf: 9152844 bytes, checksum: 69f8038e5d051487e0ebade769dd78d9 (MD5) Previous issue date: 2012-02-10 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Medicinal plant is any plant that has, in one or more organs, substances that can be used for therapeutic purposes or which are precursor of semi-synthetic drugs. Natural products and their derivatives represent more than 50% of all drugs in clinical use worldwide, being higher plants supplying at least 25% of the total. Although the growing use of medicinal plants has been very large in recent decades, there is still a significant lack of research data in this area, especially with regard to quality control of herbal drugs. This work aimed the pharmacobotanical study of six angiosperms medicinal species commonly used in northeastern Brazil, in order to support the quality control of their herbal drugs, since the morphological and anatomical data for these species are scarce, although the pharmacological importance of each is well-defined. For this purpose, we performed morphological and anatomical studies of roots, stems and leaves and ultra-structural study of leaves surfaces of Ageratum conyzoides, Justicia pectoralis, Cnidoscolus urens, Cnidoscolus infestus, Aristolochia papillaris e Aristolochia birostris. The results showed, especially the anatomical data, such as contour epidermal cell wall, types of stomata, trichome type and distribution and organization of vascular bundles, showed particular and distinctive characters of each species. The morphoanatomic analysis of the species in study allowed the characterization of each one, providing basis for their correct identification and distinction of closely related and morphologically similar species. / Planta medicinal é todo e qualquer vegetal que possui, em um ou mais órgãos, substâncias que podem ser utilizadas com fins terapêuticos ou que sejam precursores de fármacos semissintéticos. Os produtos naturais e seus derivados representam mais de 50% de todas as drogas de utilização clínica em todo o mundo, sendo as plantas superiores fornecedoras de pelo menos 25% desse total. Embora o crescimento do uso de plantas medicinais tenha sido evidente nas últimas décadas, há ainda uma significante carência de dados de pesquisas nesta área, especialmente no que diz respeito ao controle de qualidade de drogas vegetais. Este trabalho teve por objetivo o estudo farmacobotânico de seis espécies de angiospermas medicinais de uso comum no nordeste brasileiro, de forma a subsidiar o controle de qualidade de suas drogas vegetais, uma vez que os dados morfoanatômicos para essas espécies são escassos, embora a importância farmacológica de cada uma esteja bem definida. Para tanto, foram realizados estudos morfológicos e anatômicos de raízes, caules e folhas, e estudo ultraestrutural das superfícies foliares de Ageratum conyzoides, Justicia pectoralis, Cnidoscolus urens, Cnidoscolus infestus, Aristolochia papillaris e Aristolochia birostris. Os resultados encontrados, especialmente os dados anatômicos, como contorno da parede celular epidérmica, tipos de estômatos, tipo e distribuição de tricomas e organização dos feixes vasculares, evidenciaram caracteres particulares e distintivos de cada espécie. As análises morfoanatômicas das espécies em estudo possibilitaram a caracterização de cada uma delas, fornecendo subsídio para sua correta identificação e distinção das espécies próximas e morfologicamente semelhantes.

Conselho Nacional de Desenvolvimento CientÃfico e TecnolÃgico / O consÃrcio consiste no cultivo simultÃneo de duas ou mais culturas na mesma Ãrea, como estratÃgia para reduzir o risco da atividade diante da irregularidade climÃtica muito frequente nas regiÃes semiÃridas. Este trabalho objetivou avaliar caracterÃsticas agronÃmicas e Uso Eficiente da Terra (UET) de plantas de mamona com feijÃo caupi em monocultivo e consorciadas e mamona com milho em monocultivo e consorciados em diferentes arranjos de plantio em regime de sequeiro na regiÃo semiÃrida do sertÃo central cearense. Foram conduzidos dois experimentos na Fazenda Lavoura Seca, pertencente à Universidade Federal do Cearà em QuixadÃ/CearÃ, Brasil, entre os meses de abril e agosto de 2011. O delineamento utilizado para ambos os experimentos foi em blocos ao acaso com seis tratamentos e quatro repetiÃÃes. As populaÃÃes desejadas foram obtidas variando o nÃmero de plantas dentro da fileira, sendo fileiras simples alternadas. As parcelas foram compostas por quatro fileiras de cada cultura, na qual usou-se como parcela Ãtil apenas as duas fileiras centrais. Os tratamentos consistiram de monocultivo de mamona, caupi e milho, usando 10.000, 40.000 e 40.000 plantas ha-1 respectivamente e dos demais consÃrcios: (mamona 10.000 + 40.000 caupi ou milho); (mamona 5.000 + 40.000 caupi ou milho); (mamona 10.000 + 20.000 caupi ou milho); (mamona 5.000 + 20.000 caupi ou milho) plantas ha-1. A maior produtividade de mamona foi obtida usando-se 10.000 plantas ha-1 tanto consorciada como em monocultivo com caupi, independente da populaÃÃo de feijÃo. Jà quando consorciada com o milho, o fator que mais interferiu no rendimento foi o aumento da populaÃÃo de milho, em detrimento da reduÃÃo da populaÃÃo da mamoneira. As mais elevadas produtividades de feijÃo caupi foram constatadas no monocultivo e nÃo diferiu estatisticamente dos consÃrcios (mamona 5.000+40.000 caupi) e (mamona 5.000+20.000 caupi) plantas ha-1. A mamona mesmo na mÃxima populaÃÃo nÃo competiu significativamente em nÃvel de comprometer o rendimento do cereal. Todos os arranjos entre mamona e feijÃo caupi foram eficientes no uso da terra, jà o milho dominou a mamoneira em todos os consÃrcios, sendo mais competitivo e comprometendo o rendimento da mesma. / The consortium consists of the simultaneous cultivation of two or more crops in the same area, as a strategy to reduce the risk of activity before the irregularity climatic very common in semiarid regions. This study aimed to evaluate productive characteristics, gross income and Efficient Use of Land (UET) of the castor bean plants with cowpea bean in monocrop and intercropped with castor bean and maize monocrop and intercrop under different planting arrangements in a regime rainfed semiarid region in the central interior of CearÃ. Two experiments were conducted in Farm Lavoura Seca, owned by the Federal University of Cearà in Quixadà / CearÃ, Brazil, between April and August 2011. The experimental delineate for both experiments was a randomized block with six treatments and four repetitions. Populations desired been obtained varying the number of plants within the row, with alternate single rows. The plots were composed by four rows of each crop, which was used as a useful plots just the two central rows. The treatments consisted of monoculture castor bean, cowpea and maize, by using 10,000, 40,000 and 40,000 plants ha-1 respectively and other consortiums: (castor bean 10,000 + 40,000 cowpea or maize); (castor bean 5,000 + 40,000 cowpea or maize); (castor bean 10,000 + 20,000 cowpea or maize); (castor bean 5,000 + 20,000 cowpea or maize) plants ha-1. The higher productivity of castor bean was obtained using 10,000 plants ha-1 both consortia with cowpea as an in monocrop, independent of population of beans. Since when consortia with maize, the factor that most affect the yield was the increase of maize population, in detriment of reducing the population of the castor bean. The highest yields of cowpea were found in the monoculture and did not differ statistically from consortiums (castor bean 5,000 +40,000 cowpea) and (castor bean 5,000 +20,000 cowpea) plants ha-1. All of the arrangements between castor bean and cowpea were efficient in land use, have dominated the castor bean in all consortia, being more competitive and compromising the quality of the same.

No description available.

O objetivo do presente estudo foi avaliar a capacidade de isolados de Listeria monocytogenes em formar biofilmes em superfícies inertes, bem como sua resistência a agentes sanitizantes. Foram utilizados 37 isolados provenientes de ambiente de laticínios, amostras de queijos e salmoura, pertencentes à coleção do Laboratório de Microbiologia e Micotoxicologia de Alimentos (LMMA) do Departamento de Engenharia de Alimentos da FZEA/USP. Dos 37 isolados avaliados, 67,6% eram pertencentes ao sorotipo 4b. Três isolados de L. monocytogenes foram obtidos de salmoura, 5 foram obtidos de caixas plásticas, 1 de queijo Prato, 1 da mão de manipulador de embalagens, e 27 foram isolados de superfícies sem contato com alimentos (piso da sala de pasteurização, piso da câmara fria, ralo da câmara fria ou estrado da câmara fria). Os isolados de L. monocytogenes apresentaram maior capacidade de produzir biofilme nos ensaios com cupons de aço inox (43,2% dos isolados), seguido dos ensaios em microplaca de poliestireno (16,2%), cupons de borracha (13,5%) e discos de silicone (2,7%). As células de L. monocytogenes aderidas nas superfícies do aço inox foram visualizadas sob microscopia eletrônica de varredura após 48 horas de incubação a 37ºC. Dezenove isolados de L.monocytogenes, os quais produziram biofilmes nos ensaios com aço inox, borracha ou silicone, foram testados para determinação da eficiência de sanitizantes pelo método de concentração inibitória mínima (CIM), utilizando-se ácido peracético (2%), cloreto de banzalcônio (1%), digluconato de clorexidina (2%), hipoclorito de sódio (2%) e tintura de iodo (2%). Os isolados de L. monocytogenes analisados apresentaram resistência a ácido peracético, hipoclorito de sódio e tintura de iodo, cujos valores de CIM foram 3,12%, 6,25% e 6,25%, respectivamente. Nenhum isolado apresentou resistência a cloreto de benzalcônio e digluconato de clorexidina, os quais foram eficientes para inibição de isolados de L. monocytogenes provenientes de amostras de queijos e ambientes de laticínios. A L. monocytogenes apresenta capacidade de persistir em ambiente de laticínios sob a forma de biofilme em várias superfícies inertes como aço inox, borracha e silicone, o que pode representar uma fonte permanente de contaminação para produtos e processos de obtenção de leite e derivados. / The objective of the present study was to evaluate the ability of isolates of Listeria monocytogenes to form biofilms and their resistance to sanitizers. Thirty seven strains belonging to the collection of the Laboratory of Microbiology and Food Mycotoxicology (LMMA), Department of Food Engineering of FZEA / USP, were used. Of the 37 isolates, 67.6% belonged to serotype 4b. Three isolates of L. monocytogenes were obtained from brine, 5 were obtained from plastic boxes, one of Prato cheese, one from the packaging handler\'s hand, and 27 were isolated from non-food contact surfaces (pasteurization room floor, the floor of the cold room, the drain cold or pallet from the cold chamber). The isolates of L. monocytogenes showed greater ability to produce biofilm in the assays with stainless steel coupons (43.2% of isolates), followed by polystyrene micro plate (16.2%), rubber coupons (13.5%) and silicone disks (2.7%) assays. Cells of L. monocytogenes attached to stainless steel surfaces were viewed under scanning electron microscopy after 48 hours incubation at 37°C. Nineteen strains of L. monocytogenes, which were considered biofilms producers in the assays with stainless steel, rubber or silicone, have been tested to evaluate the efficiency of the sanitizing method by means of the minimum inhibitory concentration (MIC), using peracetic acid (2%), sodium chloride benzalkonium (1%), chlorhexidine digluconate (2%), sodium hypochlorite (2%) and iodine solution (2%). The isolates of L. monocytogenes analyzed showed resistance to peracetic acid, sodium hypochlorite and iodine tincture, with MIC values of 3.12%, 6.25% and 6.25%, respectively. No isolate showed resistance to benzalkonium chloride and chlorhexidine digluconate, which were effective for inhibiting the isolates of L. monocytogenes from samples of cheeses and dairy environments. In conclusion, L. monocytogenes has the ability to persist in the environment of dairy products by forming biofilms in several inert surfaces such as stainless steel, rubber and silicone, which may represent a continuing source of contamination to manufacture processes of dairy products.

Submitted by Nayara Fernanda Siviero Garcia null (nayaragarcia.agro@gmail.com) on 2017-03-27T15:53:43Z No. of bitstreams: 1 Dissertação_Nayara_F_S_Garcia.docx: 5783562 bytes, checksum: 96991caf24ea2205403970813df47675 (MD5) / Rejected by Luiz Galeffi (luizgaleffi@gmail.com), reason: Solicitamos que realize uma nova submissão seguindo as orientações abaixo: A versão final da dissertação/tese deve ser submetida no formato PDF (Portable Document Format). O arquivo PDF não deve estar protegido e a dissertação/tese deve estar em um único arquivo, inclusive os apêndices e anexos, se houver. Por favor, corrija o formato do arquivo e realize uma nova submissão. Agradecemos a compreensão. on 2017-03-29T19:01:33Z (GMT) / Submitted by Nayara Fernanda Siviero Garcia null (nayaragarcia.agro@gmail.com) on 2017-03-29T21:55:00Z No. of bitstreams: 1 Dissertação_Nayara_F_S_Garcia.pdf: 3991651 bytes, checksum: a711929970ccc2436829f10c78ae5af5 (MD5) / Approved for entry into archive by Luiz Galeffi (luizgaleffi@gmail.com) on 2017-03-30T16:37:43Z (GMT) No. of bitstreams: 1 garcia_nfs_me_ilha.pdf: 3991651 bytes, checksum: a711929970ccc2436829f10c78ae5af5 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-30T16:37:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1 garcia_nfs_me_ilha.pdf: 3991651 bytes, checksum: a711929970ccc2436829f10c78ae5af5 (MD5) Previous issue date: 2017-02-03 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Dentre os cereais de importância no cenário mundial merecem destaque o arroz e feijão fazendo parte da alimentação básica dos brasileiros. A integração de métodos como a diversificação de culturas e a utilização da biotecnologia que aumentem a produtividade de grãos do arroz e feijão pode contribuir ambientalmente e economicamente na adoção de sistemas de produção agrícolas mais sustentáveis. Assim, o objetivo do trabalho foi avaliar o efeito de diferentes culturas antecessoras (milho e/ou Urochloa ruziziensis) e inoculação de Azospirillum brasilense sobre o desenvolvimento e a produtividade do arroz de terras altas e do feijão cultivado em sucessão, além da inoculação de Rhizobium tropici na cultura do feijão de inverno. O estudo foi realizado no município de Selvíria-MS, em um LATOSSOLO VERMELHO Distrófico em área de plantio direto há mais de 10 anos. O delineamento experimental utilizado foi o de blocos casualisados, disposto em esquema de faixas, com quatro repetições. Os tratamentos foram constituídos pelo arranjo de oito combinações de milho e Urochloa ruziziensis e ausência ou presença de inoculação com Azospirillum brasilense. Durante a condução do experimento foram realizadas as seguintes avaliações: características agronômicas, componentes de produção e produtividade das culturas do arroz e feijão. O cultivo antecessor de Urochloa ruziziensis propiciou plantas mais altas e com maior teor de nitrogênio e plantas de feijão com maior número de vagens. As diferentes culturas antecessoras utilizadas não influenciaram na produtividade de grãos do arroz de terras altas e do feijão de inverno. A inoculação de sementes de arroz com Azospirillum brasilense promoveu incremento de 19% na produtividade de grãos de arroz de terras altas e, consequentemente, seu efeito resultou em incremento de aproximadamente 25% na produtividade do feijoeiro de inverno inoculado com Rhizobium tropici. / Among the grains of importance in the world scenario, rice and common bean should be highlighted as part of the basic diet of Brazilians. The integration of methods such as crop diversification and the use of biotechnology that increase grain yield of rice and common bean can contribute environmentally and economically to the adoption of more sustainable agricultural production systems. The objective of this work was to evaluate the effect of different predecessor crops (corn e/ou Urochloa ruziziensis) and inoculation of Azospirillum brasilense on the development and productivity of upland rice and common bean grown in succession, as well as the inoculation of Rhizobium tropici on winter common bean crop. The study was carried out in Selvíria-MS country, in a Red Latosol Distrofic in no-tillage area for more than 10 years. The experimental design was randomized blocks, arranged in strips scheme, with four replications. The treatments were constituted by the arrangement of eight combinations of the corn and Urochloa ruziziensis and absence or presence of inoculation with Azospirillum brasilense. During the conduction of the experiment the following evaluations were carried out: agronomic characteristics, production components and yield of rice and bean crops. The predecessor crop of Urochloa ruziziensis provided higher plants with higher nitrogen content and bean plants with higher number of pods. The different predecessor crops used did not influence grain yield of upland rice and winter common bean. The inoculation of rice seeds with Azospirillum brasilense promoted a 19% increase in the productivity of upland rice grains and, consequently, its effect resulted in an increase of approximately 25% in the yield of winter common bean inoculated with Rhizobium tropici.

Orientador: Orivaldo Arf / Resumo: Dentre os cereais de importância no cenário mundial merecem destaque o arroz e feijão fazendo parte da alimentação básica dos brasileiros. A integração de métodos como a diversificação de culturas e a utilização da biotecnologia que aumentem a produtividade de grãos do arroz e feijão pode contribuir ambientalmente e economicamente na adoção de sistemas de produção agrícolas mais sustentáveis. Assim, o objetivo do trabalho foi avaliar o efeito de diferentes culturas antecessoras (milho e/ou Urochloa ruziziensis) e inoculação de Azospirillum brasilense sobre o desenvolvimento e a produtividade do arroz de terras altas e do feijão cultivado em sucessão, além da inoculação de Rhizobium tropici na cultura do feijão de inverno. O estudo foi realizado no município de Selvíria-MS, em um LATOSSOLO VERMELHO Distrófico em área de plantio direto há mais de 10 anos. O delineamento experimental utilizado foi o de blocos casualisados, disposto em esquema de faixas, com quatro repetições. Os tratamentos foram constituídos pelo arranjo de oito combinações de milho e Urochloa ruziziensis e ausência ou presença de inoculação com Azospirillum brasilense. Durante a condução do experimento foram realizadas as seguintes avaliações: características agronômicas, componentes de produção e produtividade das culturas do arroz e feijão. O cultivo antecessor de Urochloa ruziziensis propiciou plantas mais altas e com maior teor de nitrogênio e plantas de feijão com maior número de vagens. As diferentes cul... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Among the grains of importance in the world scenario, rice and common bean should be highlighted as part of the basic diet of Brazilians. The integration of methods such as crop diversification and the use of biotechnology that increase grain yield of rice and common bean can contribute environmentally and economically to the adoption of more sustainable agricultural production systems. The objective of this work was to evaluate the effect of different predecessor crops (corn e/ou Urochloa ruziziensis) and inoculation of Azospirillum brasilense on the development and productivity of upland rice and common bean grown in succession, as well as the inoculation of Rhizobium tropici on winter common bean crop. The study was carried out in Selvíria-MS country, in a Red Latosol Distrofic in no-tillage area for more than 10 years. The experimental design was randomized blocks, arranged in strips scheme, with four replications. The treatments were constituted by the arrangement of eight combinations of the corn and Urochloa ruziziensis and absence or presence of inoculation with Azospirillum brasilense. During the conduction of the experiment the following evaluations were carried out: agronomic characteristics, production components and yield of rice and bean crops. The predecessor crop of Urochloa ruziziensis provided higher plants with higher nitrogen content and bean plants with higher number of pods. The different predecessor crops used did not influence grain yield of upland ric... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre