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Titulação de vacinas contra o sorotipo 3 do vírus da doença de marek por pcr em tempo real

Griebeler, Josiane January 2005 (has links)
A Doença de Marek é uma enfermidade linfoproliferativa das aves, causada por um alfaherpesvírus e caracterizada pela infiltração de células em nervos periféricos, gônadas, íris, vísceras, músculos e pele. Desde 1970, vacinas atenuadas têm sido utilizadas como ferramenta principal no controle da doença. Esse trabalho descreve a implantação da Reação em Cadeia da Polimerase em Tempo Real (qPCR) para a titulação de vacinas contra o vírus da doença de Marek do sorotipo 3, herpesvírus dos perus (HVT). A qPCR foi comparada com a técnica tradicional de titulação, baseada no cultivo celular de fibroblastos de embrião de galinha. Foram avaliadas três vacinas vivas (congeladas, cepa FC126) provenientes de distintos fabricantes. A técnica molecular apresentou alta correlação entre os valores de threshold cycle (CT) e respectivas diluições das vacinas (R2 = 0,99), indicando que, dentro desta faixa linear testada (102 a 104 PFU/dose), a qPCR foi capaz de quantificar as vacinas disponíveis no mercado. A reprodutibilidade da titulação em cultivo celular e qPCR foi avaliada pela realização dos testes em três dias distintos a partir de ampolas de um mesmo lote da vacina. Os títulos obtidos por ambos os métodos demonstraram alta reprodutibilidade e coerência com o fornecido pelo fabricante. Caracterizou-se também a proporção de vírus livres e associados às células, onde foi observado que, pelo menos, 90% dos vírus encontravamse na forma associada. Este trabalho indicou que a qPCR é reprodutível, rápida e menos trabalhosa do que a titulação em cultivo celular tradicionalmente utilizada.
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Kvalitativní a kvantitativní změny avifauny v agrocenózách Janovic

Jagošová, Kateřina January 2007 (has links)
No description available.
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Distribuição de aves florestais endêmicas do Cerrado : ocorrência e abundância na escala local e geográfica

Santos, Luane Reis dos 14 December 2014 (has links)
Submitted by Guimaraes Jacqueline (jacqueline.guimaraes@bce.unb.br) on 2015-06-01T14:29:33Z No. of bitstreams: 1 2015_LuaneReisdosSantos.pdf: 3415597 bytes, checksum: cb44b8bfdd601a97a904cb41d092ed9f (MD5) / Approved for entry into archive by Guimaraes Jacqueline(jacqueline.guimaraes@bce.unb.br) on 2015-06-01T14:32:28Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2015_LuaneReisdosSantos.pdf: 3415597 bytes, checksum: cb44b8bfdd601a97a904cb41d092ed9f (MD5) / Made available in DSpace on 2015-06-01T14:32:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2015_LuaneReisdosSantos.pdf: 3415597 bytes, checksum: cb44b8bfdd601a97a904cb41d092ed9f (MD5) / A relação entre uma espécie com seu ambiente pode resultar em diferentes padrões de distribuição, dependendo da escala espacial. Variáveis ambientais e climáticas podem influenciar diferentemente a distribuição e ocorrência das espécies dependendo da escala considerada. Atualmente, pode-se encontrar uma grande quantidade de estudos buscam compreender a ocupação das espécies como função de características ambientais e climáticas, identificando variáveis-chave para as quais as espécies respondem. Na região do Cerrado, estudos que buscam compreender a relação da distribuição e ocorrência das espécies de aves com variáveis ambientais e climáticas ainda são escassos. O Cerrado é uma das maiores savanas tropicais do mundo e a segunda maior formação vegetal da América do Sul. Cerca de 72% das espécies de aves que ocorrem no bioma são total ou parcialmente dependentes de formações florestais e das 30 endêmicas, 13 são florestais. Tendo em vista a importância da relação entre as espécies e seu meio abiótico e de se avaliar como o padrão e a escala influenciam a distribuição e a abundância dos organismos, novos estudos são fundamentais para a compreensão destes processos no Cerrado. O objetivo da tese foi compreender os padrões de distribuição geográfica de espécies de aves endêmicas de matas de galeria no Cerrado e quais fatores influenciam a ocorrência das espécies tanto na escala geográfica como na escala local. Buscamos também, avaliar e comparar métodos de estimativa da distribuição geográfica das espécies que levam em conta a probabilidade de detecção das espécies com métodos que não consideram este parâmetro. No primeiro capítulo nosso objetivo foi estimar a probabilidade de ocupação e detectabilidade de cinco aves florestais endêmicas do Cerrado (Antilophia galeata, Herpsilochmus longirostris, Syndactyla dimidiata, Hylocryptus rectirostris e ! 9! Basileuterus leucophrys), por meio de uma modelagem de ocupação (single-season occupancy models). Avaliamos hipóteses relacionadas a cobertura vegetal (NDVI – Índice de Vegetação por Diferença Normalizada, e desvio-padrão do NDVI) e a composição do habitat ao redor dos pontos amostrados (proporção de vegetação nativa e não-nativa). Ao todo, realizamos 589 amostragens 310 pontos distribuídos em diferentes fragmentos florestais. A probabilidade de ocupação média (ψ) encontrada para as espécies variou de 0,33-0,75. A detectabilidade média (p) variou de 0,29-0,71, sendo menor que um para todas as espécies. A cobertura vegetal (NDVI em um buffer de 100 m) foi importante para prever a detectabilidade de quatro das cinco espécies estudadas. Esta também foi uma importante variável preditiva da probabilidade de ocupação, que apresentou uma relação positiva com o NDVI para três espécies. As variáveis de composição de habitat apresentaram um fraco efeito sobre as probabilidades de ocupação das espécies. Logo, em uma escala local, o efeito da qualidade do habitat sobre a probabilidade de ocupação de aves florestais endêmicas do Cerrado pode ser mais importante do que a quantidade de habitat disponível. No segundo capítulo nosso objetivo foi caracterizar a relação entre a abundância de espécies de aves florestais endêmicas do Cerrado com a sua distribuição geográfica, esperando-se encontrar uma relação negativa entre a abundância e a distância em relação ao centroide da distribuição e positiva da abundância com a adequabilidade ambiental. Além disso, testamos hipóteses relacionadas a variáveis locais (quantidade de habitat florestal e NDVI). Nós calculamos o índice de adequabilidade no programa MAXENT, considerando variáveis bioclimáticas. A abundância média encontrada para Antilophia galeata, Basileuterus leucophrys e Herpsilochmus longirostris foi 5,22 ± 0,72, 2,98 ± 0,88 e ! 10! 4,62 ± 0,71, respectivamente. Nós encontramos relações significativas da distância em relação ao centroide, da adequabilidade de habitat e da quantidade de habitat somente para Basileuterus leucophrys. Contrariamente às nossas expectativas, a abundância diminuiu com o aumento da quantidade de floresta e aumentou com a distância em relação ao centróide da distribuição. Já em relação à adequabilidade ambiental a relação foi positiva. Logo, para pelo menos uma das espécies estudadas, a abundância provavelmente aumenta em relação a periferia da distribuição em áreas com maior adequabilidade de condições climáticas. No terceiro capítulo, nosso objetivo foi compreender o efeito da detectabilidade na modelagem da distribuição de espécies de aves florestais endêmicas do Cerrado e comparar metodologias que não consideram a influencia da detectabilidade nas estimativas de ocorrencia (BIOMOD e MAXENT) com aquelas que levam em conta a detecção imperfeita (modelos de ocupação single-season). Nós modelamos a distribuição geográfica de cinco aves florestais endêmicas do Cerrado (Capítulo 1), com diferentes probabilidades de detecção (p=0.51 to 0.74) e ocupação (ψ=0.28 to 0.89), utilizando as três abordagens citadas. Nós comparamos a performance preditiva entre os modelos de ocupação e os outros por meio do calculo da acurácia relativa de cada método considerando duas medidas: AUC (Area Under the Curve-ROC) e TSS (True Skill statistic). Contrariamente às nossas expectativas, os modelos de ocupação apresentaram a pior performance preditiva, sendo significativa a diferença entre estes e ou outros modelos considerados, tanto para AUC, quanto para TSS. Este resultado pode indicar a baixa qualidade dos dados de validação dos modelos e do método de acurácia utilizado para comparação entre as abordagens. O estudo demonstrou que as abordagens podem resultar em predições distintas, sendo bem evidente quando comparados os modelos de presença e ausência com os modelos que utilizam somente dados de presença. _____________________________________________________________________________________ ABSTRACT / The relationship between a species and its environment may result in different distribution patterns, depending on spatial scale. In this regard, habitat and climatic variables can directly affect species distribution and occurrence. An increasing number of studies seek to understand species occupancy as a function of habitat and climatic factors, identifying key variables to which species respond. In the Cerrado region studies with bird species in this area are lacking. The Cerrado is one of the largest tropical savannas in the world and the second-largest vegetation formation in South America. About 72% of bird species are dependent or partially dependent on forest formations and 43% of the 30 endemic species are forest birds. Assessing the relationship between species and their abiotic environment is important to understand how spacial scale, habitat and climatic variables affect organisms distribution and abundance. Thus, considering the lack of information on the Cerrado biome, studies occupancy patterns are needed. Our aim was to understand distribution patterns of Cerrado endemic forest bird species and which factors affect their occurrence in macro and local scale. Also, we assessed and compared estimation methods of species geographic distribution that account for detection probability with methods that do not accunt for this parameter. Our aim in the first chapter was to estimate occupancy and detection probability of five Cerrado endemic forest bird species (Antilophia galeata, Herpsilochmus longirostris, Syndactyla dimidiata, Hylocryptus rectirostris e Basileuterus leucophrys), using single-season occupancy modeling. We evaluated hypotheses related to forest cover (NDVI – Normalized Difference Vegetation Index, and NDVI Standard Deviation) and to the landscape composition (amount of forest, native and non-native surrounding vegetation). We conducted 589 point counts surveys at a total of 310 points in 59 sites within gallery forests during September to December from 2011 to 2013. Model-averaged occupancy estimates (ψ) ranged from 0.33 to 0.75, and detection probability (p) was less than one (0.29-0.71) for all species. Forest cover (NDVI in a 100-m buffer) was an important predictor variable and occupancy probability increased with NDVI values for three bird species. Landscape composition variables had a weak effect on occupancy probabilities. NDVI is an indirect measure of primary production and sites with higher NDVI values might have more resources available to birds. Considering this, in a local scale, the effect of habitat quality on birds’ occupancy may be more important than the amount of available habitat. Our aim in the second chapter was to assess hypotheses related to bird species abundance across the geographic distribution - centroid-periphery and habitat suitability, and to local variables - forest amount and forest cover (NDVI – Normalized Difference Vegetation Index) in a 1km buffer around survey points. We expected to find a negative relationship between species abundance and the distance to the distribution centroid and a positive relationship with forest amount and forest cover. We estimate a suitability index using program MAXENT, considering bioclimatic variables. The mean abundance was 5.22 ± 0.72 to Helmeted Manakin, 2.98 ± 0.88 to White-striped Warbler and 4.62 ± 0.71 to Larged-billed Antwren. We found significant relationships with the variables considered just to White-striped Warbler. Contrary to our expectations, species abundance decreased with increasing forest amount and increased with distance to the distribution centroid. Regarding habitat suitability the relationship with species abundance was positive, abundance increased in more suitable sites. Thus, we found that at least for one bird species, abundance probably increase towards the periphery of the distribution in areas of suitable climatic conditions. Our aim in the third chapter was to understand the effect of detectability on the species distribution modeling and compare approaches that assume p=1 (MAXENT and BIOMOD) with single-season occupancy models that account for imperfect detection. We modeled the geographic distribution of five Cerrado endemic forest birds species (Chapter 1), with different detection (p=0.51 to 0.74) and occupancy probability (ψ=0.28 to 0.89), using all three approaches. We compared the predictive performance between occupancy models and the others by calculating the relative performance of each approach considering the AUC (Area Under the Curve-ROC) and the TSS (True Skill statistic). Contrary to our expectations occupancy models showed the worst predictive performance with a significant difference between these models and the others, considering AUC and TSS accuracy measures. Possible explanations for these results can be the poor quality of the validation data and the choice of the accuracy method to compare among the approaches. Our results showed that different approaches may result in distinct predictions, and it was evident when presence-absence models were compared with presence-only models.
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Ocupação ambiental e características populacionais de curicacas Theristicus caudatus em linhas de transmissão de alta tensão

Oliveira, Ailton Carneiro de 17 October 2008 (has links)
Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia Animal, 2008. / Submitted by Rosane Cossich Furtado (rosanecossich@gmail.com) on 2010-02-19T13:47:32Z No. of bitstreams: 1 2008_AiltonCarneirodeOliveira.pdf: 670436 bytes, checksum: cd5483d5a3039602fdd375001c173e93 (MD5) / Approved for entry into archive by Marília Freitas(marilia@bce.unb.br) on 2010-02-19T21:22:35Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2008_AiltonCarneirodeOliveira.pdf: 670436 bytes, checksum: cd5483d5a3039602fdd375001c173e93 (MD5) / Made available in DSpace on 2010-02-19T21:22:35Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2008_AiltonCarneirodeOliveira.pdf: 670436 bytes, checksum: cd5483d5a3039602fdd375001c173e93 (MD5) Previous issue date: 2008-10-17 / A curicaca, Theristicus caudatus é uma ave típica de paisagens abertas da América do Sul. No Brasil ocorre em todas as regiões e vive associada a ambientes secos. Entre agosto de 2005 a dezembro 2007 foi monitorada a população de curicacas ao longo das torres e linhas de transmissão de energia elétrica localizadas entre o Distrito Federal e os estados de Goiás e Minas Gerais. As curicacas utilizam as estruturas de transmissão para nidificação e poleiro e, muitas vezes, são responsáveis pela interrupção no fornecimento de energia, gerando impacto financeiro negativo para as empresas devido aos desligamentos provocados. Existem poucos estudos abordando esse tipo de interação no Brasil. Este estudo teve por objetivo avaliar as formas de interação da população de T. caudatus com as torres. Para tanto, foi considerado o perfil ambiental e os aspectos da reprodução e comportamento desta espécie ao longo das linhas de transmissão. Foram avaliadas 535 torres, das quais 21% tinham curicacas sobre a estrutura. Das torres avaliadas 74% encontra-se em áreas antropizadas em campo de cultivo e em pasto e 26% em áreas naturais. Entretanto, não houve diferença significativa quando comparamos o uso das torres por curicacas em paisagens naturais ou antropicas. Encontrei 49 ninhos (46,9% ativos, 30,6% inativos e 22,4% não avaliados), que no total foram usados na produção de 42 ovos e tiveram uma postura média de 2,21 ± 0,63 ovos por ninho. Esse estudo apontou a preferência das curicacas por torres do tipo (design) SB, localizadas em paisagens antrópicas. A partir dos resultados foi possível apresentar sugestões objetivando mitigar os problemas provocados nas linhas de transmissão de energia em decorrência da ocupação das torres pelas curicacas, além de fornecer informações importantes referentes à biologia desta espécie para o Brasil central. _______________________________________________________________________________ ABSTRACT / The Buff-necked Ibis (Theristicus caudatus) is a bird typical of South America’s open landscapes. In Brazil, it occurs throughout the country and is usually associated with dry habitats. From August 2005 to December 2007, Buff-necked Ibises were monitored along electrical transmission lines and towers in the Federal District and in the States of Goiás and Minas Gerais. The Buff-necked Ibises uses the transmission tower structures for nesting and roosting and are frequently responsible for interruptions in the power supply, resulting in a negative financial impact on electrical companies. There are few studies addressing this type of problem in Brazil. Thus, the main objective of this study was to evaluate the forms of interaction that occur between the ibises and the towers. For this, the environmental profile and the reproductive and behavioural aspects of this species were investigated along the transmission lines. A total of 535 towers were evaluated, of which 20.7% were being used by Buff-necked Ibises. Of the towers investigated 74% were located in modified areas including cultivated fields and pastures, and 26% occurred in wild, natural landscapes. However, there was no significant difference in the frequency of occurrence of Buff-necked Ibises between towers in natural and modified landscapes. I found forty-nine nests, of which 46.9% were active, 30.6% were inactive and 22.4% were not evaluated, which yielded a total of 42 eggs, with an average clutch size of 2.21 ± 0.63 eggs. This study showed that Buff-necked Ibises have a preference for towers with an SB design, located in modified landscapes. Results of this study allowed me to present suggestions to attenuate problems caused by T. caudatus on electricity transmission lines. The study also provides important information about the biology of this species for Central Brazil.
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Titulação de vacinas contra o sorotipo 3 do vírus da doença de marek por pcr em tempo real

Griebeler, Josiane January 2005 (has links)
A Doença de Marek é uma enfermidade linfoproliferativa das aves, causada por um alfaherpesvírus e caracterizada pela infiltração de células em nervos periféricos, gônadas, íris, vísceras, músculos e pele. Desde 1970, vacinas atenuadas têm sido utilizadas como ferramenta principal no controle da doença. Esse trabalho descreve a implantação da Reação em Cadeia da Polimerase em Tempo Real (qPCR) para a titulação de vacinas contra o vírus da doença de Marek do sorotipo 3, herpesvírus dos perus (HVT). A qPCR foi comparada com a técnica tradicional de titulação, baseada no cultivo celular de fibroblastos de embrião de galinha. Foram avaliadas três vacinas vivas (congeladas, cepa FC126) provenientes de distintos fabricantes. A técnica molecular apresentou alta correlação entre os valores de threshold cycle (CT) e respectivas diluições das vacinas (R2 = 0,99), indicando que, dentro desta faixa linear testada (102 a 104 PFU/dose), a qPCR foi capaz de quantificar as vacinas disponíveis no mercado. A reprodutibilidade da titulação em cultivo celular e qPCR foi avaliada pela realização dos testes em três dias distintos a partir de ampolas de um mesmo lote da vacina. Os títulos obtidos por ambos os métodos demonstraram alta reprodutibilidade e coerência com o fornecido pelo fabricante. Caracterizou-se também a proporção de vírus livres e associados às células, onde foi observado que, pelo menos, 90% dos vírus encontravamse na forma associada. Este trabalho indicou que a qPCR é reprodutível, rápida e menos trabalhosa do que a titulação em cultivo celular tradicionalmente utilizada.
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Avifauna e chuva de sementes em clareiras de diferentes tamanhos de um fragmento de floresta estacional semidecidual do estado de São Paulo

Pires Neto, Paulo Affonso Fonseca 22 May 2014 (has links)
Dissertação apresentada ao Programa de Pós-Graduação em Ciências Ambientais da Universidade do Extremo Sul Catarinense – UNESC, para a obtenção do título de Mestre em Ciências Ambientais.
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Utilização do espaço arbóreo no forrageio por leptasthenura setaria (Temminck, 1824) e l. striolata (Pelzen, 1856) (furnariidae, aves) em floresta ombrófila mista montana no Rio Grande do Sul, Brasil

Joenck, Cristian Marcelo January 2005 (has links)
Made available in DSpace on 2013-08-07T19:13:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 000381920-Texto+Completo-0.pdf: 876083 bytes, checksum: ceb9bfa254d0505b754ca74de08e4b98 (MD5) Previous issue date: 2005 / According to several authors, the furnariids L setaria (Araucaria Tit-spinetail) and L. striolata (Striolated Tit-spinetail) are strongly associated with the Araucaria angustifolia. (Araucaria trees) In this study, we test hypotheses of association and dependence of A. angustifolia and evaluate the degree of trophic niche overlapping between these furnariids. From November 2003 to August 2004 the behavior of these bird species was studied through the focal-animal sampling method in three transects distributed in areas varying in human disturbance (altered, conserved, and plantation) in northeastern State of Rio Grande do Sul. The variables analyzed were number of individuals foraging together, species and plant structures inspected, foraging height, height of the tree visited, and distance covered during foraging among others. Leptasthenura setaria searches for food in pairs and sometimes in small groups, it shows a strong trend to forage in A. angustifolia, mainly in the upper canopy, and its foraging is concentrated in green leaves (“grimpas”) of this coniferous species. On the other hand, L. striolata tends to forage solitarily in small branches of shrub species (e. g. , Baccharis sp. ). Leptasthenura setaria and L. striolata diverge in several aspects of their ecology that may facilitate their coexistence. Whereas the conservation of L. setaria seems to be related to Araucaria forests, the same is not true for L. striolata. This study provides information that may help elaborating management plans for the conservation of these furnariids. / Segundo vários autores, os furnariídeos L. setaria (grimpeiro) e L. striolata (grimpeirinho) apresentam uma forte associação com a Araucaria angustifolia (pinheiro-do-paraná). Neste estudo, testa-se as hipóteses de associação e dependência da A. angustifolia e avalia-se o grau de sobreposição do nicho trófico destes furnariídeos. Durante o período de novembro de 2003 a agosto de 2004 o comportamento destas espécies foi estudado através do método animal-focal em três transectos em áreas com diferentes níveis de intervenção antrópica (alterada, conservada e plantio) no nordeste do Rio Grande do Sul. As variáveis analisadas foram número de indivíduos forrageando, espécies e estruturas vegetais inspecionadas, altura de forrageio e dos espécimes vegetais visitados e distância percorrida entre outras. Leptasthenura setaria forrageia aos pares e algumas vezes em pequenos grupos, possui uma forte tendência em forragear em A. angustifolia, preferencialmente na parte superior da copa, e o seu substrato de forrageio preferencial são os ramos/grimpas verdes desta conífera. Por outro lado, L. striolata tende a forragear solitária em ramos verdes de espécies arbustivas (p. ex. , Baccharis sp. ). Leptasthenura setaria e L. striolata divergem em vários aspectos de sua ecologia alimentar, o que pode facilitar a sua coexistência. Enquanto a conservação de L. setaria parece estar relacionada às florestas com araucária, o mesmo não ocorre com L. striolata. As informações deste trabalho poderão auxiliar na elaboração de planos de manejo para a conservação destes furnariídeos.
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Parâmetros bioquímicos e hormonais durante o ciclo reprodutivo de Vanellus chilensis (Aves, Charadriiformes)

Pöerschke, Filipe January 2011 (has links)
Made available in DSpace on 2013-08-07T19:13:18Z (GMT). No. of bitstreams: 1 000431513-Texto+Completo-0.pdf: 2239838 bytes, checksum: 492d7c0bdd6ea51921fcdde0c40726b5 (MD5) Previous issue date: 2011 / Vanellus chilensis is highly territorial and aggressive during the breeding period, forming groups of three to four individuals, is one of the most common species in the urban area of Porto Alegre (Fontana, 2004). There are a large number of papers on urban birds, but no using ecophysiology practices in Brazil. This study aimed to analyze in two locations, with a rural character and the other inserted into an urban center, the plasmatic variations in: corticosterone, testosterone and metabolites. The animals were always caught at night, blood samples and data molt were collected. The metabolites (glucose, total lipids, triglycerides, cholesterol, HDL, LDL, VLDL, glycerol, uric acid and total protein) were quantified in plasma using spectrophotometry; corticosterone and testosterone determined by radioimmunoassay. In the juveniles of the Area 1 we verified a predominance of females (2. 7 females: 1 male) in area 2 this relationship is reversed (2 males: 1 female), which seems to relate to higher levels of testosterone and lower corticosterone observed in females (period 1) in Area 2. Comparing the areas of capture, the highest levels of plasma corticosterone were observed in the juveniles of the Area 2 suggesting a greater environmental stress that may be related to a higher predation pressure and/or intense activity and human presence and/or intraspecific competition. In the juveniles, throughout the study, the two localities studied we not observe any variations in the levels of plasmatic metabolites, except for triglycerides of the juveniles in Area 2.However, when comparing the Area 1 with Area 2 a differential behavior is observed throughout the development of juveniles in triglycerides, HDL, VLDL and total proteins; the remaining parameters (glucose, total lipids, cholesterol, LDL, glycerol and uric acid) do not show a differential behavior. In adults we found differences in corticosterone levels in females from Area 2, but in both sexes and localities, we observed a tendency of reduction in hormone levels during the reproductive period. The results showed differences in testosterone levels between males and females from Area 1 when compared with the Area 2 during the study period; however the periods of the breeding season in each location showed differences only in females.In Area 1, the breeding season was about 2 times lower than in Area 2 and the females showed a significant increase of all plasmatic metabolites, with the exception of glycerol, already the males show a rise in glucose, cholesterol, HDL and LDL mainly in period 3. In Area 1, we observe a gradual increase glucose levels in plasma reaching maximal values in males and females in period 3, a period characterized by the presence of defensive behaviors and parental care, and also, the period before the molt of flight feathers. In the Area 2 was not observed variation in levels of plasmatic metabolites, except for glucose in males and triglycerides, glycerol and uric acid in both sexes. This pattern maybe can be explained by greater availability of food and/or less competition and/or increased investment in search of food. The results suggest that Vanellus chilensis capture in Area 2 present an adaptive pattern in relation to human action and relationships of abiotic and biotic of this area. In the final of this work can be concluded that there were differences between the two areas of study, and levels of corticosterone, testosterone, plasmatic metabolites and duration of breeding season are influenced by human action. / Vanellus chilensis é altamente territorial e agressivo durante o período reprodutivo, formando grupos de três a quatro indivíduos é uma das espécies mais freqüentes no ambiente urbano de Porto Alegre (Fontana, 2004). Existe um número grande de trabalhos sobre a avifauna urbana, mas nenhum utilizando a ecofisiologia como ferramenta de trabalho no Brasil. Este estudo teve como objetivo analisar em dois ambientes, um com características rurais e outro inserido dentro de um centro urbano, as variações dos níveis plasmáticos de: corticosterona, testosterona e metabólitos. Os animais foram sempre capturados à noite e amostras de sangue e dados de muda foram coletados. Os metabólitos (glicose, lipídios totais, triglicerídeos, colesterol, HDL, LDL, VLDL, glicerol, ácido úrico e proteínas totais) foram quantificados no plasma utilizando-se espectrofotometria; a corticosterona e a testosterona determinadas por radioimunoensaio. Nos jovens da Área 1 verificamos um predomínio de fêmeas (2,7 fêmeas: 1 macho); na área 2 esta relação se inverte (2 machos: 1 fêmea), o que parece relacionar-se com os maiores níveis de testosterona e menores de corticosterona observados nas fêmeas (período 1) na Área 2.Comparando-se as áreas de captura, os maiores níveis de corticosterona plasmática foram observados nos jovens da Área 2 sugerindo um maior estresse ambiental que pode estar relacionado com uma maior pressão de predação, e/ou pela intensa atividade e presença humana e/ou pela competição intra-específica. Nos jovens, ao longo do estudo, nas duas localidades estudadas não observamos variações para os níveis dos metabólitos plasmáticos, com exceção dos triglicerídeos dos jovens da Área 2. Contudo, ao compararmos a Área 1 com a Área 2 se observa um comportamento diferencial, ao longo do desenvolvimento dos jovens na concentração plasmática de triglicerídeos, HDL, VLDL e proteínas totais; os demais parâmetros analisados (glicose, lipídios totais, colesterol, LDL, glicerol e ácido úrico) não apresentam um comportamento diferencial. Nos adultos houve diferença nos níveis de corticosterona nas fêmeas da Área 2, mas em ambos os sexos e localidades observamos uma tendência de diminuição dos níveis hormonais ao longo do período reprodutivo. Os resultados mostraram diferenças nos níveis de testosterona entre os machos e as fêmeas da Área 1 quando comparadas à Área 2 durante o período de estudo; porém, entre os períodos da estação reprodutiva em cada localidade houve diferenças somente nas fêmeas.Na Área 1, o período reprodutivo foi cerca de 2 vezes menor que na Área 2 e as fêmeas apresentaram um aumento significativo de todos os metabólitos plasmáticos, com exceção do glicerol, já os machos mostram um aumento da glicose, colesterol, HDL e LDL principalmente no período 3. Na Área 1 observamos um aumento gradual dos níveis de glicose no plasma atingindo valores máximos, tanto em machos como em fêmeas, no período 3, período caracterizado pela presença de comportamentos de defesa e cuidado dos filhotes, sendo também, o período que antecede a muda das penas de vôo. Já na Área 2 não foi observada variação nos níveis de metabólitos plasmáticos, exceto para a glicose em machos e triglicerídeos, glicerol e ácido úrico em ambos os sexos. Perfil que talvez possa ser explicado pela maior disponibilidade de alimento e/ou menor competição e/ou maior investimento na procura do alimento. Os resultados sugerem que Vanellus chilensis capturados na Área 2 apresentam um padrão adaptativo em relação à ação humana e as relações bióticas e abióticas desta área. Ao final deste trabalho pode-se concluir que houve diferença entre as duas áreas de estudo, sendo os níveis de corticosterona, de testosterona, de metabólitos plasmáticos e a duração do período reprodutivo influenciados pela ação antrópica.
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Inquérito epidemiológico de doenças respiratórias em aves de subsistência e modelagem de espalhamento de influenza aviária no Rio Grande do Sul

Marks, Fernanda Simone January 2014 (has links)
Patógenos associados a aves migratórias podem causar doenças em aves domésticas. As aves de subsistência são possíveis fontes de disseminação destes patógenos pela ausência de biossegurança na criação e pelo contato com aves silvestres. A região do Parque Nacional da Lagoa do Peixe (PNLP), no Rio Grande do Sul, se caracteriza como um importante sítio de aves migratórias. Devido a isto, é possível uma interface entre aves migratórias e aves de subsistência criadas na região. A influenza aviária (AI) é a principal doença associada a aves migratórias que afeta o sistema respiratório, sendo estas os principais disseminadores do vírus. Estudos prévios indicam que há risco de introdução de um vírus de AI de alta patogenicidade (HPAIV) na região. Porém, o padrão e impacto do espalhamento deste patógeno na região é desconhecido, visto a ausência de relatos. Cabe ressaltar que outras enfermidades respiratórias, como a Doença de Newcasle (ND) e a micoplasmose por Mycoplasma gallisepticum (MG), também são associadas a aves migratórias e podem causar doenças em aves domésticas. Neste contexto, o objetivo deste trabalho é realizar um inquérito epidemiológico de doenças respiratórias associadas a aves migratórias em aves de subsistência e propor um modelo de espalhamento de HPAIV na região do PNLP. Com esta finalidade, realizamos uma avaliação (i) da presença de anticorpos contra AI, ND e MG nas aves de subsistência por ELISA, (ii) da presença dos agentes de AI e ND por RT-PCR em tempo real nas aves de subsistência, (iii) dos possíveis fatores de risco associados aos patógenos e (iv) das consequências da introdução de HPAIV na região através de um modelo matemático de espalhamento. Nas propriedades de aves de subsistência amostradas da região, foi detectada a presença de anticorpos contra AI, ND e MG na frequência de 4,2%, 87,5% e 58,3%, respectivamente. Todas as amostras foram negativas no RT-PCR em tempo real realizado para AI e ND. A avaliação de fatores de risco foi possível nas propriedades soropositivas para ND e MG, possibilitando realizar-se a primeira análise de fatores de risco para estes agentes em aves de subsistência no Brasil. Para ND, o risco foi maior nas propriedades nas quais os criadores adotam a prática de reposição própria para manter a criação (PR=1,64; 95% IC: 1,11 – 2,42). Além disso, o aumento na distância das granjas em relação ao estuário da Laguna do Peixe diminui o risco para ND (PR=0,94; 95% IC: 0,90 – 0,99). Já para MG, foram considerados fatores de risco a prática de confinar as aves (PR = 3,40, 95% IC: 1,93 – 5,99) e a interação entre a “troca de aves ou ovos com outros produtores e vizinhos possuírem aves” (PR = 2,16, 95% IC: 1,24 – 3,76). Nas simulações da modelagem matemática de espalhamento de HPAIV na região, a maioria das propriedades se tornaria infectada até o 30º dia de infecção. Além disso, na média das simulações, a infecção atingiria em torno de 80 a 90% das propriedades, alcançando até 30 km de distância do caso índice. Os resultados indicam a circulação de patógenos associados a aves migratórias na região do PNLP. Devido à detecção destes nas aves de subsistência, estas podem ser consideradas sentinelas destes agentes na região. Além disso, os dados obtidos incrementam o conhecimento sobre o espalhamento e a dinâmica dessas doenças em propriedades com aves de subsistência, bem como sobre os indicadores de risco para ocorrência. Estes dados podem ser utilizados para o estabelecimento de medidas de biossegurança e de manejo adequados para este tipo de criação e de programas de monitoria visando à contenção da disseminação de patógenos. / Pathogens associated with migratory birds can cause disease in domestic birds. Backyard poultry are possible source of pathogens dissemination due to the lack of biosecurity measures and the contact with wild birds. The region of Lagoa do Peixe National Park (PNLP), in Rio Grande do Sul state, Brazil, is characterized as an important site for migratory birds. Thus, it is a possible interface place for migratory and backyard birds. Avian influenza (AI) is the most important respiratory disease associated with migratory birds, the main virus disseminating agents. Previous studies have indicated a risk for introduction of higly pathogenic avian influenza virus (HPAIV) in PNLP region. However, the impact and spreading pattern of AI virus in this region is unknown due to the lack of disease reports. It is noteworthy that other respiratory diseases, such Newcastle Disease (ND) and micoplasmosis due to Mycoplasma gallisepticum (MG), are also associated with migratory birds and can cause disturbances in domestic poultry. In this context, the aims of this work are to perform an epidemiological survey of respiratory diseases associated with migratory birds in backyard poultry and to propose a model of HPAIV spreading in PNLP region. For this, it was evaluated (i) the presence of antibodies against AI, ND and MG in backyard poultry by ELISA, (ii) the presence of AI and ND virus in backyard poultry by real time RT-PCR, (iii) the potential risk factors associated with these pathogens, and (iv) the consequences of HPAIV introduction in PNLP region using a mathematical model of virus spreading. In the sampled properties, frequency of antibodies against AI, ND and MG were 4.2%, 87.5% and 58.3%, respectively. All samples were negative for AI and ND in real time RT-PCR analysis. The first evaluation of risk factors associated to ND or MG in backyard poultry from Brazil was performed in this work. For ND, the risk was increased in the properties in which farmers used their own replacement poultry to restock their flock (PR=1.64; 95% CI: 1.11–2.42). Furthermore, the increasing distance of the household flock to the “Laguna do Peixe” estuary is associated with decreasing NDV seropositivity (PR=0.94; 95% CI: 0.90 – 0.99). For MG, seropositivity was significantly associated with bird confinement (PR = 3.40, 95% CI: 1.93 – 5.99) and with interaction between “poultry/egg exchange and neighbors have poultry” (PR = 2.16, 95% CI: 1.24 – 3.76). In the simulations from the mathematical model of HPAIV spreading in PNLP region, most of the properties of this region would become infected up to 30 days outbreak beginning. Moreover, the infection would affect about 80 to 90% of the properties from the region, reaching up to 30 km distance from the index case. The results showed the circulation of pathogens associated with migratory birds in PNLP region. Since these pathogens were detected in backyard poultry, these birds can be considered sentinels for these agents in this region. Additionally, the data obtained improve the knowledge on spreading and dynamics of these diseases in properties with backyard poultry, as well as on potential risk factors. The set of these results can be useful to development of adequate biosecurity procedures for backyard flocks and surveillance programs to avoid pathogen dissemination.
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Parasitismo experimental em ninhos de aves do Cerrado / "Parasitismo experimental em ninhos de aves do Cerrado"

Miranda, Thiago Filadelfo 04 June 2014 (has links)
Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Ecologia, 2014. / Submitted by Jaqueline Ferreira de Souza (jaquefs.braz@gmail.com) on 2014-11-19T11:03:52Z No. of bitstreams: 1 2014_ThiagoFiladelfoMiranda.pdf: 754848 bytes, checksum: 2e4e75e4e5387b10788255b903ecd74a (MD5) / Approved for entry into archive by Patrícia Nunes da Silva(patricia@bce.unb.br) on 2014-11-19T11:08:39Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2014_ThiagoFiladelfoMiranda.pdf: 754848 bytes, checksum: 2e4e75e4e5387b10788255b903ecd74a (MD5) / Made available in DSpace on 2014-11-19T11:08:39Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2014_ThiagoFiladelfoMiranda.pdf: 754848 bytes, checksum: 2e4e75e4e5387b10788255b903ecd74a (MD5) / O parasitismo de ninhos afeta diretamente o sucesso reprodutivo das espécies hospedeiras, com redução no tamanho da ninhada, sucesso de eclosão e sobrevivência dos ninhegos. A coevolução na interação parasita-hospedeiro se assemelha a uma corrida armamentista evolutiva com hospedeiros e parasitas sempre desenvolvendo novas estratégias de defesa e contra-ataques entre si. O reconhecimento e a rejeição de ovos parasitas são respostas adaptativas usadas por muitas espécies expostas à pressão seletiva do parasitismo de ninhos. Devido ao contínuo processo de fragmentação do cerrado no Brasil Central, mais do habitat freqüentemente utilizado para o estabelecimento do parasita de ninhos (chopim, Molothrus bonariensis) está sendo disponibilizado. Tal expansão permite o contato com espécies que nunca experimentaram o parasitismo de ninho e, portanto, não possuem estratégias de defesa contra ele. O objetivo do presente estudo foi examinar a resposta comportamental de oito espécies de Passeriformes após parasitismo experimental de ninhos, acessando suas tolerâncias ao parasitismo, determinando qual hipótese melhor explicaria a aceitação dos ovos parasitas, Hipótese do Atraso ou Equilíbrio Evolutivo. O experimento foi realizado com 215 ninhos por meio de dois tratamentos: ovos artificiais de chopim (padrão mimético, n=133) ou ovos artificiais azuis (padrão não-mimético, n=82). Chibum (Elaenia chiriquensis), guaracava-de-topete-uniforme (Elaenia cristata), joão-de-pau (Phacellodomus rufifrons) e sabiá-barranco (Turdus leucomelas) aceitaram a grande maioria dos ovos miméticos e não-miméticos, comportamento melhor explicado pela Hipótese do Atraso Evolutivo. O sabiá-poca (Turdus amaurochalinus) e sabiá-do-campo (Mimus saturninus) aceitaram os ovos miméticos e estiveram mais propensos a rejeitar os ovos não-miméticos, padrão melhor suportado pela Hipótese do Equilíbrio Evolutivo. Peitica-de-chapéu-preto (Empidonomus aurantioatrocristatus) mostrou um padrão intermediário que sugere estar próxima de se tornar uma espécie rejeitora, com baixa freqüência de aceitação de ovos miméticos e não-miméticos. A espécie que mais sistematicamente rejeitou os ovos artificiais parasitas foi a tesourinha (Tyrannus savana). Os diferentes estágios de rejeição encontrados mostram que as estratégias de defesa anti-parasitas não são equivalentes entre as espécies. Contraintuitivamente, o joão-de-pau (P. rufifrons), a guaracava-de-topete-uniforme (E. cristata) e o chibum (E. chiriquensis), espécie migratória, não tiveram registros de parasitismo natural pelo chopim embora todas tenham sido classificadas como espécies que aceitariam o parasitismo, comportamento que precisa ser melhor investigado. Este experimento serve como um bom preditor do potencial impacto que o chopim pode produzir às oito espécies testadas. __________________________________________________________________________ ABSTRACT / Brood parasitism directly affects hosts’ reproductive success, with reduction in clutch size, hatching success and nestling survival. The parasite-host coevolution resembles an evolutionary “arms race” with hosts and parasitic birds always developing new defenses and counterattacks to each other. Recognition and rejection of parasitic eggs are adaptive responses used by many species exposed to brood parasitism. Due to the ongoing fragmentation of cerrado vegetation in Central Brazil more of the habitat frequently used for the establishment of the parasitic Shiny Cowbird (Molothrus bonariensis) is being provided. This has led to greater contact between this cowbird and species that never experienced brood parasitism and therefore do not have defence strategies against it. The goal of the present study was to examine the behavioral response of eight passerine species assessing their tolerance to experimental brood parasitism, and determining whether the Evolutionary Lag or the Equilibrium hypotheses better explain the acceptance of parasitic eggs. We parasitized 215 nests using one of two treatments: model cowbird egg (mimetic, n=133) or model blue egg (non-mimetic, n=82). Lesser Elaenia, Plain-crested Elaenia, Rufous-fronted Thornbird and Pale-breasted Thrush accepted the majority of mimetic and non-mimetic eggs, a behavior best explained by the Evolutionary Lag Hypothesis. Creamy-bellied Thrush and Chalk-browed Mockingbird accepted mimetic eggs and were more prone to reject the non-mimetic eggs, a pattern better explained by the Evolutionary Equilibrium Hypothesis. Crowned Slaty Flycatcher seems to be half-way toward becoming a rejecter species, with low rates of acceptance of mimetic and non-mimetic eggs. The only complete rejecter was the Fork-tailed Flycatcher. The different ejection stages of the studied species show how antiparasite defenses are not equivalent in all tested species. Counterintuitively, Rufous-fronted Thornbird, Plain-crested Elaenia and the migrant Lesser Elaenia have not been naturally parasitized by the Shiny Cowbird although classified as accepters in the present study, a result that needs further investigation. This experiment serves as a good predictor of the impact that Shiny Cowbird might produce on these eight tested passerines in Central Brazil.

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