A mudança de administração, no município de São Paulo em 1989, ordenou, particularmente para o setor saúde, uma série de inovações na gestão dos serviços de saúde, objetivando a implementação do Sistema Único de Saúde - SUS. Para tanto, uma das principais estratégias consistiu na qualificação dos trabalhadores da saúde. Este estudo, de natureza qualitativa, teve o objetivo de analisar como os princípios políticos do SUS foram incorporados aos cursos promovidos para a formação de auxiliares de enfermagem - Programa de Formação de Pessoal em Larga Escala - PLE -. Partindo dos conceitos que nutriram a construção dos princípios e diretrizes do SUS, derivados do ideário da Reforma Sanitária, o caminho metodológico empreendido neste estudo consistiu de: 1) análise documental e 2) entrevista com os coordenadores do PLE - níveis central e regional - da Secretaria Municipal da Saúde. A análise dos dados permitiu reconhecer que: 1) a política e as práticas dessa gestão municipal estavam comprometidas com o ideário da Reforma Sanitária: priorizou a qualificação dos trabalhadores da saúde que não haviam tido essa oportunidade antes e adotou uma pedagogia voltada à condução de um processo de "transformação" dos agentes relativa a ambas: sua prática em saúde e sua compreensão sobre direitos sociais como trabalhador e como cidadão; 3) os coordenadores, de uma maneira geral, mostraram-se motivados para desenvolver a proposta de qualificação e viram o processo como uma ferramenta importante para implementar o SUS; 4) os coordenadores do nível regional mostraram um entendimento limitado do processo de qualificação, isolando a dimensão técnica da dimensão política. / The change or São Paulo city administration in 1989, had ordered, particularly to the health sector, many innovations related to the management of the health services aiming at the implementattion of the Brazilian Public Health System - BPHS - To accomplish that, one of the main strategies was the qualification of health workers. This qualitative study has the objective of analyzing how the political principles of the BPHS were incorporated to the courses promoted to form nurses auxiliaries throug the Large Scale Formation program. Using the concepts that had nurtured the constrution of the health system political principles, derived from the Sanitary Reform movement, the methodology of the study consisted of: 1) a document research; 2) interviews with program coordinators of the central and regional levels of the Municipal Department of Health. Data analysis allows to recognize that: 1) the policies of this administration were compromised with the Sanitary Reform movement: it had prioritized the qualification of health workers that did not had this opportunity before; and it had adopted a pedagogical practice in order to conduct a process of transformation of the health agents towards their health practice and their rights as workers and citizens; 3) most of the coordinators were motivated to develop this qualification proposal and they had viewed the process as an important tool to implement the public health system; 4) the regional level coordinators had a limited understanding of the qualification process, isolating the technical from the political dimension.

The present work aims to provide a contribution to improve the efficiency the design flow of integrated systems, focusing, specifically, on the performance evaluation of its communication structures. The use of Transaction Level Modeling (TLM) is proposed, in order to take advantage of the reduction of design effort and time. Within the performance evaluation approaches, the utilization of traffic generators instead of full system simulations started to be adopted due to its higher time efficiency. Initial works on on-chip traffic generation focused on Poisson processes and classic Markovian models, which are unable to capture Long Range Dependence (LRD). This fact led to the adoption of fractal/self-similar models. Later advancements have shown that the traffic produced in multiprocessed systems can show higher degrees of complexity, what can be attributed to the presence multifractal characteristics. In this work, a methodology to evaluate the on-chip traffic and to the development of a transaction level traffic generator is proposed. The main contributions of this work are a detailed analysis of traffic time series obtained by TLM simulations and the study of the effects of the traffic generator on these simulations, concerning, mainly, the speedup-accuracy trade-off. The proposed analysis follow the multifractal paradigm, allowing system developers to (1) understand the statistical nature of on-chip traffic, (2) to obtain accurate representations of this traffic and (3) to build traffic generators that mimic processing elements realistically. Another contribution of this work is a comparison of the performance, considering the accuracy of the obtained synthetic traffic time series, between monofractal and multifractal models. All of the mentioned contributions were grouped throughout the detailed methodology presented on the present document, for which experiments were carried out. / O presente trabalho visa oferecer uma contribuição para o aumentar a eficiência do fluxo de projeto de sistemas integrados, focando, especificamente, na avaliação do desempenho de suas estruturas de comunicação. É proposta a utilização de simulações com modelos no nível de transações (TLM), com o objetivo de se obter vantagens da redução de esforço e tempo de projeto oferecidos por esta abordagem. Dentro das propostas de análise de desempenho, a utilização de geradores de tráfego ao invés simulações de sistema completo tem sido adotada devido a sua maior eficiência no tempo. Trabalhos iniciais na geração de tráfego intrachip focaram-se em processos de Poisson e em modelos de Markov clássicos, os quais não capturam Dependência de Longa Duração (LRD). Este fato levou a adoção de modelos fractais/auto-similares. Avanços posteriores mostraram que o tráfego produzido pelos elementos de sistemas multiprocessados podem apresentar maior grau de complexidade, que pode ser atribuída à presença de características multifractais. Neste trabalho, é proposta uma metodologia para a avaliação de tráfego intrachip para o desenvolvimento de um gerador de tráfego TLM. As principais contribuições deste trabalho são uma análise detalhada das séries temporais de tráfego obtidas nas simulações TLM e o estudo dos efeitos que o gerador de tráfego exerce sobre estas simulações, se concentrando, principalmente, na relação entre precisão e aceleração da simulação. As análises propostas se baseiam no paradigma multifractal, o qual permite (1) um maior entendimento da natureza estatística do tráfego pelos desenvolvedores de sistemas, (2) a obtenção de uma representação precisa deste tráfego e (3) a construção de geradores de tráfego que substituam elementos processantes de maneira realista. Outra contribuição deste trabalho é a comparação do desempenho, no que concerne a precisão das séries de tráfego sintéticas obtidas, de modelos monofractais e multifractais. Todas as contribuições mencionadas foram agrupadas na metodologia detalhada, apresentada no presente documento, sobre a qual experimentos foram realizados.

A introdução de software em sistemas de aplicações críticas traz consigo questões relacionadas à segurança (safety) que, durante muito tempo recaíram predominantemente sobre o desenvolvimento do hardware que compunha tais sistemas. Atualmente, padrões relacionados à segurança de software avaliam qualitativamente o impacto do seu uso sobre sistemas suscetíveis a falhas de natureza randômica. A pesquisa aqui desenvolvida visa, em complemento a outras investigações já realizadas, avaliar quantitativamente diversas técnicas de programação defensiva em função de sua representatividade no quesito segurança de sistemas de aplicação crítica tolerantes a erros. Como objetivo essencial, buscou-se avaliar o comportamento adquirido por um sistema tolerante a erros quando submetido a um processo de injeção de falhas por software. A tolerância a erros do sistema de aplicação crítica em estudo é alcançada, através de técnicas de programação defensiva aplicadas ao software original. Foram aplicadas diversas técnicas de programação defensiva e diversas combinações entre elas, de modo que foi possível avaliar quantitativamente e identificar possíveis padrões de níveis de segurança adquiridos em cada caso. / The introduction of software systems for critical applications raises safety issues that have long fell predominantly on the development of the hardware composing such systems. Currently, standards related to safety software qualitatively assess the impact of their use on systems sensitive to random errors. The research developed here seeks, in addition to other previous investigations, to quantitatively evaluate different techniques of defensive programming in function of their safety level in fault-tolerant safety critical systems. As a key objective, we sought to evaluate the behavior acquired by a fault-tolerant system when subjected to a software fault injection process. The fault-tolerance system, in a typical critical application under study, is achieved through the application of defensive programming techniques over the original software. Many defensive programming techniques and various combinations among them were applied, hence making it possible to quantitatively assess and identify possible patterns of safety levels acquired in each case.

Submitted by SBI Biblioteca Digital (sbi.bibliotecadigital@puc-campinas.edu.br) on 2016-05-10T19:33:58Z No. of bitstreams: 1 Karla Oliveira Franco.pdf: 1221586 bytes, checksum: 0c45f3f2ae3f0f3cf0e12dd46f9383d6 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-05-10T19:33:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Karla Oliveira Franco.pdf: 1221586 bytes, checksum: 0c45f3f2ae3f0f3cf0e12dd46f9383d6 (MD5) Previous issue date: 2016-02-25 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior - CAPES / This master?s dissertation is inserted in the scope of the studies produced on assessment state systems on large-scale, and specifically researched the Sistema Mineiro de Avalia??o da Educa??o P?blica (SIMAVE) through a qualitative study developed from bibliographic search. The objective was to conduct a study about the State of The Art directed to SIMAVE, focusing on the identification of the respective evaluation system impacts in the school units from Minas Gerais, whose object of study was the masters and doctoral dissertations produced in Brazil during the years 2000 to 2013. The specific objectives was designed to study the path of the evaluation system of the implementation process on a large-scale for Basic Education in the State of Minas Gerais, in order to identify the key steps in the consolidation process of SIMAVE; the mapping of the scientific production, expressed through dissertations and doctoral theses produced since the implementation of SIMAVE in 2000-2013; and, the identification of the impacts of SIMAVE on the school units from Minas Gerais. To describe the trajectory of SIMAVE, three stages were identified in the process of consolidation, and verified that they go to three generations of large-scale assessments of Basic Education of Brazil, proposed by Bonamino and Sousa (2012), which are differentiated from the consequences attached to schools and the school curriculum. The systematization of scientific production resulted in 33 studies, in which 28 were dissertations and 5 doctoral theses, which were developed, mostly in post-graduate programs in Education. Through the research problem, which was to verify what were the impacts caused by SIMAVE at schools of Minas Gerais, it concludes that the SIMAVE caused impacts on Minas Gerais school units, and these were characterized from effects, weaknesses, risks and strategies. The identified impacts were subject to valuation both positive and negative, trough a confrontation of ideas in the context of the consensus paradigm and the conflict paradigm, reaffirming polysemy of the evaluation area, which is characterized by political and ideological tensions that were evident in the studies analyzed in this dissertation. / A presente disserta??o de mestrado enquadra-se no ?mbito dos estudos produzidos sobre os sistemas estaduais de avalia??o em larga escala, e tratou, especificamente, sobre o Sistema Mineiro de Avalia??o da Educa??o P?blica (SIMAVE) por meio de abordagem qualitativa desenvolvida a partir de pesquisa bibliogr?fica. O objetivo foi realizar um estudo do tipo Estado da Arte em torno do SIMAVE, com foco na identifica??o dos impactos do respectivo sistema de avalia??o nas unidades escolares mineiras, tendo como objeto de estudo disserta??es de mestrado e teses de doutorado produzidas no Brasil, no per?odo de 2000 a 2013. Estudos do tipo Estado da Arte permitem visualizar o que vem sendo produzido em determinada ?rea do conhecimento e realizar uma ordena??o que possibilita a percep??o da evolu??o cient?fica, bem como delimitar suas caracter?sticas e foco, al?m de possibilitar a identifica??o de lacunas existentes por meio de levantamento, an?lise e avalia??o de produ??es cient?ficas. Como objetivos espec?ficos desta pesquisa foi delineado o estudo da trajet?ria do processo de implanta??o do sistema de avalia??o em larga escala para Educa??o B?sica no Estado de Minas Gerais, visando identificar as principais etapas existentes no processo de consolida??o do SIMAVE; o mapeamento da produ??o cient?fica brasileira, expressa por meio de disserta??es de mestrado e teses de doutorado; e, a identifica??o dos impactos do SIMAVE nas unidades escolares mineiras. Ao tra?ar a trajet?ria do SIMAVE foram identificadas tr?s etapas no seu processo de consolida??o, e verificado que o mesmo se articula com as tr?s gera??es de avalia??es em larga escala da Educa??o B?sica do Brasil, propostas por Bonamino e Sousa, as quais s?o diferenciadas a partir das consequ?ncias atribu?das para as escolas e para o curr?culo escolar. Durante a pesquisa bibliogr?fica foram identificadas 33 produ??es acad?micas sobre o SIMAVE, sendo 28 disserta??es de mestrado e cinco teses de doutorado, que foram desenvolvidas, em sua maioria, em programas de p?s-gradua??o em Educa??o. Diante do problema de pesquisa, o qual consistiu em verificar quais foram os impactos provocados pelo SIMAVE nas unidades escolares de MG, conclui-se que o SIMAVE causou impactos nas unidades escolares mineiras, e estes foram caracterizados a partir de efeitos, fragilidades, riscos e estrat?gias de melhorias desenvolvidas em prol de melhor rendimento dos estudantes nos testes avaliativos do SIMAVE. Os impactos identificados foram pass?veis de valora??o tanto positiva quanto negativa, a partir de um confronto de ideias no contexto do paradigma do consenso e do paradigma do conflito, reafirmando a polissemia do campo da avalia??o, o qual ? caracterizado por tens?es pol?ticas e ideol?gicas que ficaram evidentes nos estudos analisados nesta disserta??o.

Submitted by Rosina Valeria Lanzellotti Mattiussi Teixeira (rosina.teixeira@unisantos.br) on 2017-02-21T18:23:21Z No. of bitstreams: 1 Karla A. dos Reis Mehanna.pdf: 23364770 bytes, checksum: b752a9829dff02e2a50dfcaf3975177c (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-21T18:23:21Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Karla A. dos Reis Mehanna.pdf: 23364770 bytes, checksum: b752a9829dff02e2a50dfcaf3975177c (MD5) Previous issue date: 2016-12-13 / The present dissertation presents results of a research that analyzed the uses of the ¿Prova Brasil¿ in two municipal schools of a metropolitan region, with the objectives of investigating its utilization for the school planning and to analyze if the continued formation of the teachers in the school, in the Schedule of Pedagogical Work (HTP), contemplates the study of this instrument of evaluation in large scale, the analysis of the results of the ¿Prova Brasil¿ and the proposition of actions to remedy any difficulties found by the school or improve the quality of work there. The research adopts a qualitative approach, involves two public primary schools (1st to 5th year), its school administrators and teachers. It adopts as methodological procedures: bibliographical survey and elaboration of reference on the subject; analysis of official and school documents; and semi-structured interviews. The findings of the bibliographical survey point to the diversification of the uses of the ¿Prova Brasil¿, among them: continued formation of the teachers; encouraging the creation of own systems for evaluation of networks and assistance in the selection of contents; policies of teacher accountability for student achievement; loss of school autonomy and curriculum reduction; pedagogical actions that only aim at the preparation for the tests; elaboration of rankings; and, even, the inexistence of the use of the ¿Prova Brasil¿ in schools. The findings in the documents of the studied schools indicate that there was no specific training work on the ¿Prova Brasil¿ during the year 2015 and that the time allocated to the training of teachers in the school is divided with questions of school organization, which occupy more space in the difficult to deepen the issues surrounding the evaluation. However, it was verified the use of the ¿Prova Brasil¿ as an evaluation model by the teachers and, for a plot, as a reference for self-evaluation of the work done in the classroom. Based on the constructed benchmark, it¿s considered that ¿Prova Brasil¿ permeates school planning, but its reports are not observed for the elaboration of the Political Pedagogical Project. As for continuing education in the school, the analysis of the minutes of meetings of the HTPs indicates that this activity needs to be rethought, since it does not fulfill its formative role. Teachers and managers consider the analysis of ¿Prova Brasil¿ and its results important, but they understand that this work becomes impracticable due to the short time available for this purpose. Considering the results, it¿s concluded that if the teacher training time in the school was better optimized, it would be possible to use the ¿Prova Brasil¿ as a subsidy in the school planning process and the continuous training of teachers in the school, due to the positive receptivity of this external evaluation instrument in schools, both by managers and teachers. / A presente dissertação apresenta resultados de uma pesquisa que analisou os usos da Prova Brasil por duas escolas municipais de uma região metropolitana, com os objetivos de investigar o seu emprego para o planejamento escolar e analisar se a formação continuada dos professores na escola, no Horário de Trabalho Pedagógico (HTP), contempla o estudo desse instrumento de avaliação em larga escala, a análise dos resultados da Prova Brasil e a proposição de ações para sanar eventuais dificuldades encontradas pela escola ou melhorar a qualidade do trabalho ali desenvolvido. A pesquisa adota abordagem qualitativa, envolvendo duas escolas públicas de Ensino Fundamental I (1º ao 5º ano), com seus gestores escolares e professores. Como procedimentos metodológicos, foram empregados: levantamento bibliográfico e elaboração de referencial sobre o tema; análise de documentos oficiais e escolares; e entrevistas semiestruturadas. Os achados do levantamento bibliográfico apontam para a diversificação dos usos da Prova Brasil, dentre eles: formação continuada dos professores; incentivo à criação de sistemas próprios de avaliação das redes e auxílio na seleção de conteúdos; políticas de responsabilização dos professores pelo rendimento dos alunos; perda de autonomia da escola e redução do currículo; ações pedagógicas que visam somente à preparação para os testes; elaboração de rankings; e, inclusive, inexistência do uso da Prova Brasil em escolas. Os achados nos documentos das escolas estudadas indicam que não houve trabalho de formação específico sobre a Prova Brasil durante o ano de 2015 e que o horário destinado à formação dos professores na escola é dividido com questões de organização escolar, as quais ocupam maior espaço nas reuniões, dificultando o aprofundamento dos assuntos que envolvem a avaliação. Entretanto, foi verificado o uso da Prova Brasil como modelo de avaliação pelos professores e, para uma parcela, como referência para autoavaliação do trabalho realizado em sala de aula. A partir do referencial construído, considera-se que a Prova Brasil permeia o planejamento escolar, mas seus relatórios não são observados para a elaboração do Projeto Político-Pedagógico. Quanto à formação continuada na escola, a análise das atas de reuniões dos HTP¿s indica que essa atividade precisa ser repensada, pois não cumpre seu papel formador. Professores e gestores consideram importante a análise da Prova Brasil e de seus resultados, mas entendem que esse trabalho se torna inviável em virtude do pouco tempo disponibilizado para tal finalidade. Diante dos resultados, conclui-se que, se o tempo de formação do professor na escola fosse mais bem otimizado, seria possível a utilização da Prova Brasil como subsídio no processo de planejamento escolar e de formação continuada de professores na escola, considerando a receptividade positiva desse instrumento de avaliação externa nas escolas, tanto por gestores quanto por professores.

O diabetes mellitus tipo MODY (maturity-onset diabetes of the young) é caracterizado por defeito na secreção de insulina, herança autossômica dominante, hiperglicemia de início precoce e anticorpos anti-células beta negativos. Até o momento, já foram descritas mutações em 14 genes diferentes. A confirmação do diagnóstico de MODY é feita por estudo genético-molecular, tradicionalmente pelo método de Sanger. Diante da grande heterogeneidade genética de MODY, acrescida da dificuldade de estudo de alguns genes por seu grande tamanho e ausência de hotspots, o sequenciamento em larga escala (SLE) mostra-se promissor para uma análise genética custo-efetiva na suspeita de MODY. No Brasil, existem poucos estudos genéticos de rastreamento de MODY e uma alta prevalência de casos sem mutações identificadas nos genes testados (MODY X). Os objetivos deste estudo foram: 1) analisar simultaneamente todos os genes associados a MODY em uma coorte de pacientes com suspeita clínica, utilizando um painel de SLE; 2) avaliar a patogenicidade das variantes alélicas identificadas de acordo com os critérios da Sociedade Americana de Genética Médica (ACMG). Foram selecionados 80 casos com fenótipo de MODY e análise prévia negativa dos 2 genes mais prevalentes, GCK e HNF1A, pelo método de sequenciamento de Sanger. Estes casos foram analisados pelo método de SLE, direcionado para regiões gênicas alvo, por meio de um painel customizado, com sequenciamento simultâneo de 51 genes nucleares e do genoma mitocondrial. As mutações identificadas foram correlacionadas com o fenótipo e foi realizada a segregação familiar. Uma cobertura de no mínimo 20x foi obtida em 98% das regiões alvo. Dos 80 pacientes avaliados, foram detectadas variantes patogênicas/potencialmente patogênicas em 16 casos (20%), confirmando o diagnóstico genético de MODY. Em 15 dos 80 pacientes foram identificadas 16 variantes de significado incerto, restando ainda 42 casos com diagnóstico molecular não esclarecido. Dos 16 casos confirmados geneticamente: 6 foram no gene GCK, 1 no HNF1A, 1 no HNF4A, 1 no HNF1B, 6 em genes raros associados a MODY (1 no ABCC8, 1 no KCNJ11, 1 no PDX1, 2 no PAX4, 1 no NEUROD1), e 1 no NEUROG3, gene associado a diabetes neonatal. Dentre estas 16 variantes, 2 não haviam sido descritas previamente. As 6 mutações no GCK não tinham sido detectadas na análise prévia por: a) 4 casos falso negativos no sequenciamento por Sanger (3 devido ao fenômeno genético de allelic dropout e 1 por erro na leitura do eletroferograma); b) 2 erros na hipótese clínica inicial do subtipo de MODY (baseada no padrão glicêmico e na resposta terapêutica dos pacientes), levando ao sequenciamento prévio de outro gene. A variante no HNF1A não foi detectada previamente por erro na leitura do eletroferograma (caso falso negativo no Sanger). Uma variante foi identificada no gene HNF4A, que não tinha sido sequenciado anteriormente e apresenta fenótipo semelhante ao do HNF1A. O paciente com variante no HNF1B não apresentava relato prévio de cistos renais ou malformações genito-urinárias e por isso não tinha sido considerada a hipótese clínica de MODY5. Além disso, o SLE confirmou o diagnóstico genético de 6 pacientes com variantes em genes de MODY considerados raros, que habitualmente não são sequenciados na rotina de Sanger e ainda detectou uma variante em um gene de diabetes neonatal (sendo necessário maiores estudos para estabelecer uma relação causal com MODY). Em 13 dos 16 casos índices diagnosticados, os familiares encontravam-se disponíveis para exame genético e a co-segregação foi concordante em 8 famílias. Todos os probandos avaliados apresentavam características clínico-laboratoriais típicas de MODY. Os achados deste estudo mostraram que o SLE foi capaz de aumentar a acurácia no diagnóstico de MODY, permitindo a confirmação molecular de 20% dos casos antes negativos e reduzindo, assim, o número de casos MODY X no Brasil. A abordagem genética por painel de SLE para diagnosticar casos com suspeita clínica de MODY mostrou-se promissora para elucidar as bases genéticas desse tipo de diabetes monogênico / Diabetes mellitus type MODY (maturity-onset diabetes of the young) is characterized by defects in insulin secretion, autosomal dominant inheritance, early onset of hyperglycemia, and negative anti-beta cell antibodies. To date, mutations in 14 genes are associated with MODY. The definitive diagnosis relies on genetic tests, traditionally by Sanger sequencing. However, given the genetic heterogeneity of this condition, added to the difficulty of studying some genes due to their large size and lack of hotspots, large-scale sequencing (LSS) seems promising for cost-effective genetic analysis on suspicion of MODY. In Brazil, there are few cohorts screened for MODY and a high prevalence of MODY X (unclear genetic diagnosis). This study aimed to analyze simultaneously all MODY genes in a cohort of clinically suspected patients using a LSS panel; and to evaluate the pathogenicity of identified allelic variants according to the criteria of the American College of Medical Genetics and Genomics (ACMG). We selected 80 subjects with MODY phenotype and negative previous analysis of the 2 most prevalent genes, GCK and HNF1A, by Sanger sequencing method. These cases were analyzed by LSS method, with simultaneous sequencing of target genes. We designed a customized panel, including 51 nuclear genes and the mitochondrial genome. The identified mutations were correlated to the phenotype and family segregation was evaluated. At least 20x coverage was obtained in 98% of the targeted regions. Of 80 evaluated subjects, pathogenic/probably pathogenic variants were detected in 16 cases (20%), confirming the genetic diagnosis of MODY. In 15 of 80 patients, 16 variants of uncertain significance were identified, remaining 42 cases with unexplained molecular diagnosis. Of the 16 genetically confirmed cases: 6 were in the GCK gene, 1 in HNF1A, 1 in HNF4A, 1 in HNF1B, and 6 in rare genes associated with MODY (1 in ABCC8, 1 in KCNJ11, 1 in PDX1, 2 in PAX4 and 1 in NEUROD1), and 1 in NEUROG3, a gene associated with neonatal diabetes. Of these 16 variants, 2 had not been previously described. Those 6 variants in GCK were not detected in the prior analysis because of: a) 4 false negative cases in Sanger sequencing (allelic dropout had occurred in 3 cases and one variant was overlooked, due to electropherogram interpretation failure); b) 2 errors in the initial clinical hypothesis of the MODY subtype (based on the glycemic pattern and therapeutic response), leading to the prior sequencing of another gene. The variant in HNF1A was not previously identified due to misinterpretation in electropherogram (Sanger false negative case). One variant were detected in the HNF4A gene, not formerly sequenced, and had a similar phenotype to that of HNF1A. The patient with HNF1B variant did not have a previous report of renal cysts or genito-urinary malformations and therefore the clinical hypothesis of MODY5 was not considered. In addition, LSS confirmed the genetic diagnosis of 6 patients harboring variants in MODY genes considered to be rare, which are not usually sequenced in the Sanger routine, and also detected one variant in a neonatal diabetes gene (further studies are necessary to establish a causal relationship with MODY). Relatives were available for genetic testing in 13 of these 16 index cases diagnosed and co-segregation was concordant in 8 families. All probands evaluated showed typical clinical and laboratory characteristics of MODY. These study findings showed that targeted-LSS could increase accuracy in MODY diagnosis, enabling molecular confirmation of 20% of previous negative cases and thus reducing the number of MODY X cases in Brazil. The genetic approach of LSS panel to diagnose cases with clinical suspicion of MODY has shown promise for elucidating the genetic basis of this type of monogenic diabetes

Resumo: O cultivo intensivo agrícola, apesar de altamente produtivo, possui diversos pontos questionáveis, como suplementação acentuada de insumos sintéticos, além da aplicação de defensivos para o controle de pragas que muitas vezes são danosos ao meio ambiente. Como alternativa, a agricultura orgânica propõe uma forma de manejo menos agressiva, que promove o uso sustentável dos recursos naturais renováveis, como o aproveitamento de resíduos orgânicos, além de possuir um maior valor agregado no produto final. No presente estudo, investigamos por meio de uma abordagem metagenômica os efeitos do manejo (orgânico ou convencional) na microbiota da rizosfera de cana-de-açúcar, região da planta que notoriamente causa um grande impacto no seu desenvolvimento e produtividade. Identificamos a abundância maior na rizosfera com manejo orgânico de porções genômicas que codificam enzimas associadas ao metabolismo do nitrogênio e enxofre, sendo que estes são nutrientes fundamentais para o sucesso da planta e assim, seu desenvolvimento e produtividade em campo. Contraditoriamente, encontramos também que os genomas da microbiota orgânica possuem conteúdo ligado a um potencial mais acentuado para a degradação de compostos xenobióticos, que são ativamente aplicados no manejo convencional. De acordo com nossa predição, os microrganismos dessa microbiota poderiam realizar sua completa mineralização, o que é muito favorável na remoção desses resíduos no ambiente. Esses achados indicam que há um potencia... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Modern industrialized agriculture although highly productive, has several sustainability problems such as the for intense supplementation of synthetic inputs, beyond the application of pesticides for pest control. Which are often harmful to environment. As an alternative to this system, organic agriculture is considered more environmentally progressive, having several characteristics favorable to the crop producer, promotes sustainable use of renewable natural resources, such as the use of organic waste, besides that a higher aggregated value in the final product. This study investigates the changes that an organic system brings when compared to conventional management for the sugarcane rhizosphere microbiome, a plant region known to be determinant of plant development and associated with net productivity, using a metagenomic approach. We identified a higher abundance of genomic portions which encode enzymes associated with nitrogen and sulphur metabolism, which are fundamental nutrients for plant success and subsequently, crop productivity. Conversely, we also found that genomes of the organic microbiome contain higher portions linked to xenobiotic degradation, compounds that are actively applied in conventional management. Microorganisms from this sequenced microbiome could perform complete mineralization of these damaging compounds, which is desirable in their removal from the environment. These findings indicate that there is a unique potential for exploitation of organic... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Submitted by FÁBIO PERBONI null (fabioperboni@terra.com.br) on 2016-03-28T18:43:23Z No. of bitstreams: 1 TESE 24.3.2016.pdf: 3713104 bytes, checksum: c1aacdc90ff199dcc5b02fb7c5e0a539 (MD5) / Rejected by Ana Paula Grisoto (grisotoana@reitoria.unesp.br), reason: Solicitamos que realize uma nova submissão seguindo as orientações abaixo: O título informado na folha de rosto do trabalho está diferente do informado na capa e ficha catalográfica. Por favor, corrija as informações e realize uma nova submissão Agradecemos a compreensão. on 2016-03-29T14:17:26Z (GMT) / Submitted by FÁBIO Perboni (fabioperboni@terra.com.br) on 2016-03-29T14:38:43Z No. of bitstreams: 1 TESE 24.3.2016.pdf: 3718649 bytes, checksum: e8085aeccb71339bce61a8e3c470516e (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Paula Grisoto (grisotoana@reitoria.unesp.br) on 2016-03-29T17:46:04Z (GMT) No. of bitstreams: 1 perboni_f_dr_prud.pdf: 3718649 bytes, checksum: e8085aeccb71339bce61a8e3c470516e (MD5) / Made available in DSpace on 2016-03-29T17:46:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 perboni_f_dr_prud.pdf: 3718649 bytes, checksum: e8085aeccb71339bce61a8e3c470516e (MD5) Previous issue date: 2016-02-04 / A presente tese, desenvolvida junto ao Programa de Pós-Graduação em Educação da Faculdade de Ciências e Tecnologia/Universidade Estadual Paulista, encontra-se vinculada a linha de pesquisa “Formação dos Profissionais da Educação, Políticas Educativas e Escola Pública”, teve como objeto de análise as avaliações externas e em larga escala das redes estaduais de educação básica. O cenário contemporâneo, marcadamente nas três últimas décadas, esteve pontuado por reformas estruturantes dos Estados Nacionais, acompanhadas ou inspiradas, sobretudo, por uma concepção neoliberal que coaduna a redução de seu tamanho. No campo educacional, essas reformas se deram de forma paradoxal. A atuação dos Estados Nacionais foi caracterizada pelo aumento do controle centralizado sobre questões fundamentais e estruturantes e descentralização da execução das políticas para as escolas ou instâncias administrativas intermediárias, o que exigiu a criação de novos mecanismos para cumprir essas tarefas. Consideramos a avaliação externa e em larga escala como um dos eixos centrais desse processo e propomos, nesta investigação, analisar como se apresentam as políticas de avaliação nos diversos estados brasileiros, identificando as tendências e as singularidades de aspectos variados dessas avaliações, passando pelo questionamento sobre o nível de influência dos partidos políticos e suas plataformas nesses processos, para adentrar em seus elementos internos e chegando até os usos dos resultados. A pesquisa tem por objetivo analisar as propostas de avaliação externa e em larga escala nos estados brasileiros, mapeando suas principais características, elementos estruturantes e propostas de usos/consequências de seus resultados para definição de políticas públicas, analisando as principais tendências e as singularidades, tendo como referencial metodológico uma abordagem qualitativa, é de natureza descritiva analítica. Tem como instrumentos e procedimentos de coleta de dados: a pesquisa bibliográfica e a pesquisa documental. A análise dos dados será feita a partir do referencial teórico adotado, a partir da elaboração de categorias de análise abrangendo as características das avaliações que serão classificadas dentro de um sistema explicativo mais amplo. Como recorte temporal, situamos a investigação no período que compreende os três últimos governos estaduais eleitos, situados entre 2003 a 2014. Esse recorte justifica-se por buscar captar as tendências nacionais em relação às avaliações estaduais, diante das transformações do Sistema de Avaliação da Educação Básica (SAEB) e a criação do Índice de Desenvolvimento da Educação Básica (IDEB). Identificamos, entre outras questões, a pequena relação entre os partidos no poder e a criação das avaliações próprias, demonstrando que as mesmas se configuram como tendência incorporada às políticas públicas educacionais, com tendência crescente de vinculação de seus resultados à premiação das escolas e bonificação de seus funcionários. / This thesis, developed in the Post-Graduation in Education Program of the Faculty of Science and Technology/Universidade Estadual Paulista, is linked to the line of research "Training of Education Professionals, Educational Policies and Public School". It had as its object of analysis the external and on large-scale evaluations of basic education state networks. The contemporary scene, markedly in the last three decades, have been punctuated by structural reforms of nations, accompanied or inspired, above all, by a neoliberal conception that defends the reduction of the size of government. In the educational field, these reforms have ocurred paradoxically. The role of government was characterized by increased centralized control over fundamental and structural issues and decentralization of policy implementation for schools or intermediate administrative instances, which required the creation of new mechanisms to fulfill these tasks. We consider the external and on a large scale evaluation as a central tenet of this process and we propose in this study to analyze the policies of evaluation in all Brazilian states, identifying trends and singularities of various aspects thereof, through the questioning of the level the influence of political parties and their platforms in these proceedings, to enter into its internal elements and reaching the uses of the results. The research aims to examine the proposals for external and on a large scale evaluation in the Brazilian states, mapping its main features, structural elements and proposed uses/consequences of its results for the definition of public policies, analyzing key trends and singularities, and as a methodological reference it has a qualitative approach and it is analytical descriptive. Its instruments and data collection procedures are: a literature search and information retrieval. Data analysis will be made from the theoretical framework adopted, from the elaboration of categories of analysis covering the characteristics of evaluations which will be placed within a broader explanatory system. As time frame, we situate the research in the period that includes the last three elected state governments, situated between 2003 and 2014. This cut is justified by seeking to capture national trends regarding the state assessments, given the changes in the Education Evaluation System Basic (SAEB) and the creation of the Basic Education Development Index (IDEB). We identify, among other things, the small relationship between the ruling parties and the creation of own evaluations, showing that they are by their tendency incorporated into educational policies, with growing trend of linking their results to the award of schools and bonus its employees.

Made available in DSpace on 2015-05-07T15:09:07Z (GMT). No. of bitstreams: 1 arquivototal.pdf: 1443735 bytes, checksum: 10aa8ce77c0ccd1eec44fe164180a872 (MD5) Previous issue date: 2013-11-01 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Esta investigación tiene como objetivo reflexionar sobre el desempeño académico y sobre las políticas de evaluación de la calidad de la educación y de las dinámicas desarrolladas en interior de las escuelas, teniendo como parámetro analítico los resultados del Índice de Desarrollo de la Educación Básica (IDEB), con base en pruebas aplicadas en los años 2007, 2009 y 2011. El IDEB considera el flujo de la escuela y el rendimiento promedio de los estudiantes en las pruebas estandarizadas, sin dedicar mucha atención a las características cualitativas de los procesos educativos y las particularidades de cada escuela. Entendemos que los resultados de la evaluación deben ser analizados considerando los aspectos específicos del ambiente escolar, como su geografía, sus condiciones sociales, económicas y de infraestructura, la gestión y formación de los profesionales de la educación, que son factores que interfieren de manera efectiva en el proceso educativo. Para realizar este estudio, se seleccionaron dos escuelas de la Red Municipal de Enseñanza de João Pessoa, quien obtuvo el mejor resultado en IDEB y la que se puso peor, respectivamente EMEF Dr. José Novais y EMEF Prof. Analice Gonçalves Carvalho. Buscamos a través de sus características y peculiaridades identificar los elementos cualitativos que, junto con los conceptos de flujo y el rendimiento escolar promedio, ayudaron a promover este tipo de resultados. A la luz de la teoría de Oliveira (2001), Dourado (2007), Gentilli (1995), Franco (2007), Fernandez (2007), Carnoy (2009), Ravitch (2011), Casassus (2007), Afonso (2005) Freitas (2007), Gatti (2011), entre otros, habló sobre el concepto de calidad en la educación, así como la construcción y el desarrollo de la evaluación de políticas públicas en Brasil, colocándolos en la legislación brasileña. La investigación presentada en este documento es de carácter cualitativo. Se utilizó como observación de los recursos de investigación y cuestionarios a profesores y administradores de cada escuela. Creemos que las evaluaciones a gran escala no puede ser el único parámetro para analizar la calidad de la educación. Los indicadores más allá de los considerados por IDEB son tan importantes como la gestión democrática, la formación docente, las condiciones de trabajo, la infraestructura, las condiciones socioeconómicas, el acceso, la permanencia y el éxito académico, la planificación de proyectos educativos, entre otros. Las escuelas encuestadas perciben diferencias significativas con respecto a estos indicadores que influyeron en el resultado de cada uno de los exámenes. Los resultados de IDEB por lo tanto no pueden ser considerados un fin en sí mismos. Los sistemas educativos, directores, maestros, entrenadores y toda la comunidad escolar deben reflexionar sobre la posibilidad de transformar las figuras importantes en subvenciones para iniciativas que mejoren el propio sistema educativo, las unidades escolares y las aulas, proporcionando a los estudiantes el derecho a la educación calidad. / Esta pesquisa busca refletir sobre o desempenho escolar e as políticas de avaliação da qualidade da educação a partir das dinâmicas desenvolvidas no interior das escolas, tendo como parâmetro de análise os resultados do Índice de Desenvolvimento da Educação Básica (IDEB), com base nos testes aplicados nos anos de 2007, 2009 e 2011. O IDEB considera o fluxo escolar e as médias de desempenho dos estudantes em testes padronizados, sem conferir tanta ênfase aos traços qualitativos do processo educacional e das peculiaridades vivenciadas em cada escola. Entendemos que o resultado da avaliação deve ser analisado considerando as especificidades quanto aos aspectos geográficos, sociais, econômicos, infraestruturais, de gestão e de formação dos profissionais da educação, fatores que interferem de forma efetiva no processo pedagógico. Para a realização da pesquisa, selecionamos duas escolas da Rede Municipal de Ensino de João Pessoa, a que obteve o melhor resultado no IDEB e a que obteve o pior, respectivamente a EMEF Dr. José Novais e a EMEF Profª Analice Gonçalves Carvalho. Buscamos através de suas características e peculiaridades identificar os elementos considerados qualitativos, que, junto com os conceitos de fluxo escolar e médias de desempenho, contribuíram para promover tais resultados. À luz do referencial teórico de Oliveira (2001), Dourado (2007), Gentilli (1995), Franco (2007), Fernandez (2007), Carnoy (2009), Ravitch (2011), Casassus (2007), Afonso (2005), Freitas (2007), Gatti (2011), dentre outros, discutimos o conceito de qualidade na educação, bem como a construção e o desenvolvimento das políticas públicas de avaliação do Brasil, situando-as na legislação brasileira. A pesquisa que ora apresentamos é de cunho qualitativo. Utilizamos como recurso de investigação a observação e aplicação de questionários aos professores e gestores de cada escola. Consideramos que as avaliações em larga escala não podem ser o único parâmetro para analisar a qualidade da educação. Indicadores além daqueles considerados pelo IDEB são igualmente importantes como, a gestão democrática, formação de professores, condições de trabalho, infraestrutura, condições socioeconômicas, acesso, permanência e sucesso escolar, projeto pedagógico, planejamento, entre outros. Percebemos nas escolas pesquisadas diferenças relevantes no tocante a estes indicadores, que influenciaram o resultado de cada uma nos exames realizados. Os resultados do IDEB, portanto, não podem ser considerados um fim em si mesmos. Sistemas educacionais, gestores, professores, técnicos e toda a comunidade escolar devem refletir sobre as possibilidades de transformar tais números em subsídios importantes para iniciativas de aperfeiçoamento do próprio sistema educacional, das unidades escolares e das salas de aula, garantindo aos estudantes o direito à educação de qualidade.

A maioria dos casos de puberdade precoce central (PPC) em meninas permanece idiopática. A hipótese de uma causa genética vem se fortalecendo após a descoberta de alguns genes associados a este fenótipo, sobretudo aqueles implicados com o sistema kisspeptina (KISS1 e KISS1R). Entretanto, apenas casos isolados de PPC foram relacionados à mutação na kisspeptina ou em seu receptor. Até recentemente, a maioria dos estudos genéticos em PPC buscava genes candidatos selecionados com base em modelos animais, análise genética de pacientes com hipogonadismo hipogonadotrófico, ou ainda, nos estudos de associação ampla do genoma. Neste trabalho, foi utilizado o sequenciamento exômico global, uma metodologia mais moderna de sequenciamento, para identificar variantes associadas ao fenótipo de PPC. Trinta e seis indivíduos com a forma de PPC familial (19 famílias) e 213 casos aparentemente esporádicos foram inicialmente selecionados. A forma familial foi definida pela presença de mais de um membro afetado na família. DNA genômico foi extraído dos leucócitos do sangue periférico de todos os pacientes. O estudo de sequenciamento exômico global realizado pela técnica ILLUMINA, em 40 membros de 15 famílias com PPC, identificou mutações inativadoras em um único gene, MKRN3, em cinco dessas famílias. Pesquisa de mutação no MKRN3 realizada por sequenciamento direto em duas famílias adicionais (quatro pacientes) identificou duas novas variantes nesse gene. O MKRN3 é um gene de um único éxon, localizado no cromossomo 15 em uma região crítica para a síndrome de Prader Willi. O gene MKRN3 sofre imprinting materno, sendo expresso apenas pelo alelo paterno. A descoberta de mutações em pacientes com PPC familial despertou o interesse para a pesquisa de mutações nesse gene em 213 pacientes com PPC aparentemente esporádica por meio de reação em cadeia de polimerase seguida de purificação enzimática e sequenciamento automático direto (Sanger). Três novas mutações e duas já anteriormente identificadas, incluindo quatro frameshifts e uma variante missense, foram encontradas, em heterozigose, em seis meninas não relacionadas. Todas as novas variantes identificadas estavam ausentes nos bancos de dados (1000 Genomes e Exome Variant Server). O estudo de segregação familial em três dessas meninas com PPC aparentemente esporádica e mutação no MKRN3 confirmou o padrão de herança autossômica dominante com penetrância completa e transmissão exclusiva pelo alelo paterno, demonstrando que esses casos eram, na verdade, também familiares. A maioria das mutações encontradas no MKRN3 era do tipo frameshift ou nonsense, levando a stop códons prematuros e proteínas truncadas e, portanto, confirmando a associação com o fenótipo. As duas mutações missenses (p.Arg365Ser e p.Phe417Ile) identificadas estavam localizadas em regiões de dedo ou anel de zinco, importantes para a função da proteína. Além disso, os estudos in silico dessas duas variantes demonstraram patogenicidade. Todos os pacientes com mutação no MKRN3 apresentavam características clínicas e hormonais típicas de ativação prematura do eixo reprodutivo. A mediana de idade de início da puberdade foi de 6 anos nas meninas (variando de 3 a 6,5) e 8 anos nos meninos (variando de 5,9 a 8,5). Tendo em vista o fenômeno de imprinting, análise de metilação foi também realizada em um subgrupo de 52 pacientes com PPC pela técnica de MS-MLPA, mas não foram encontradas alterações no padrão de metilação. Em conclusão, este trabalho identificou um novo gene associado ao fenótipo de PPC. Atualmente, mutações inativadoras no MKRN3 representam a causa genética mais comum de PPC familial (33%). O MKRN3 é o primeiro gene imprintado associado a distúrbios puberais em humanos. O mecanismo preciso de ação desse gene na regulação da secreção de GnRH necessita de estudos adicionais / Most cases of central precocious puberty (CPP) in girls remain idiopathic. The hypothesis of a genetic cause has been strengthened after the discovery of some genes associated with this phenotype, particularly those involved with the kisspeptin system (KISS1 and KISS1R). However, genetic defects in KISS1 and its receptor are rare and have been identified in only a few patients with CPP.over the past years. To date, most genetic studies in CPP was based mainly on a candidate gene approach, including genes selected in animal studies, human models of patients with hypogonadotropic hypogonadism or in genome wide association studies. In the present study, we used whole exome sequencing, a more advanced method of sequencing, to identify variants associated with CPP. Thirty-six patients with the familial form of CPP (19 families) and 213 apparently sporadic cases were initially selected. The familial form was defined by the presence of more than one member affected in the family. Genomic DNA was extracted from peripheral blood leukocytes in all patients. Whole exome sequencing performed by ILLUMINA technique in 40 members of 15 families with CPP, identified inactivating mutations in a single gene, MKRN3, in five out of these families. Analysis of MKRN3 mutations performed by automatic sequencing in two additional families (four patients) identified two novel mutations. MKRN3 is an introless gene located on chromosome 15, in the Prader Willi syndrome critical region, and it is expressed only by the paternal allele due to the maternal imprinting. Following the initial findings, we searched for MKRN3 mutations in 213 patients with apparently sporadic CPP using polymerase chain reaction followed by direct enzymatic purification and automated sequencing (Sanger). Three new mutations and two previously reported, including four frameshifts and one missense variant was identified in six unrelated girls with CPP. All variants were not described in the two databases (1000 Genomes and Exome Variant Server). The familial segregation analysis performed in three out of these girls with apparently sporadic CPP and MKRN3 mutations confirmed the autosomal dominant inheritance with complete penetrance and exclusive transmission through the paternal allele, revealing familial inheritance in apparently sporadic cases. Most of these MKRN3 mutations were frameshifts or nonsense, leading to premature stop codons and truncated proteins, thus demonstrating positive genotype- phenotype correlation. The two missense mutations (p.Arg365Ser and p.Phe417Ile) identified were located within zinc finger motifs, regions predicted to be essential for the protein function. Besides that, all missense mutations were predicted to be pathogenic by in silico analysis. All patients carrying MKRN3 mutations exhibited typical clinical and hormonal features of premature activation of the reproductive axis. The median age of puberty onset was 6.0 years in girls (ranging from 3.0 to 6.5) and 8.0 years in boys (ranging from 5.9 to 8.5). In view of the imprinting phenomenon, methylation analysis was also performed in a subgroup of 52 patients with CPP by MSMLPA technique, but no methylation abnormalities were detected. In conclusion, our work has identified a new gene associated with CPP. Currently, inactivating mutations in MKRN3 represent the most common genetic cause of familial CPP (33%). MKRN3 is the first imprinted gene associated with pubertal disorders in humans. However, its precise mechanism of action in the regulation of GnRH secretion needs further studies