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Desenvolvimento de um software para planejamento in silico de fármacos Multimol

OLIVEIRA FILHO, Jorge Ferraz de January 2011 (has links)
Submitted by Caroline Falcao (caroline.rfalcao@ufpe.br) on 2017-04-04T19:08:22Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) 2011-Dissertação-JorgeOliveiraFIlho.pdf: 1509169 bytes, checksum: 3a60c3845f5f2566418cca7bb188df7e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-04T19:08:22Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) 2011-Dissertação-JorgeOliveiraFIlho.pdf: 1509169 bytes, checksum: 3a60c3845f5f2566418cca7bb188df7e (MD5) Previous issue date: 2011 / A área de Modelagem Molecular vem despertando interesse crescente desde que surgiu. O uso de métodos computacionais na previsão de estruturas e propriedades moleculares, particularmente aplicados na inovação terapêutica através do planejamento de fármacos, por exemplo, tem adquirido crescente espaço e confiabilidade na comunidade científica e na grande indústria farmacêutica mundial. Dentre as diversas abordagens computacionais aplicáveis ao desenvolvimento de fármacos, destacam-se os estudos da relação quantitativa entre estrutura molecular e atividade biológica. Esta técnica permite construir modelos estatísticos de regressão capazes de oferecer, a partir das estruturas de moléculas, uma previsão confiável de uma propriedade de interesse, como por exemplo, a atividade biológica (QSAR), a toxicidade (QSTR) ou a solubilidade (QSPR). O MultiMOL, desenvolvido no Laboratório de Química Teórica Medicinal (LQTM) da UFPE, é um software implementado em linguagem de programação C/C++, que oferece as técnicas de estatística multivariada mais comumente utilizadas nos problemas de QSAR. As suas funcionalidades incluem algoritmos de pré-processamento de dados (escalonamento, centrar na média, seleção de variáveis), diversos métodos de regressão (MLR, PCR, PLS e QPLS), a validação de modelos por validação cruzada (LOO-FCV) ou por utilização de série de testes e a exibição dos resultados dos modelos por meio de gráficos bidimensionais. Importa ressaltar que o método de PLS quadrático (Q-PLS) não é facilmente encontrado em outros softwares disponíveis, tornando-se assim um importante diferencial do MultiMOL. Todas estas funcionalidades encontram-se disponíveis para o usuário por meio de uma interface gráfica (GUI) de fácil utilização. O programa foi construído com ênfase em desempenho, robustez e precisão numérica, a fim de ser uma alternativa satisfatória como ferramenta de evidente interesse para a inovação terapêutica. Os testes realizados, com três conjuntos de dados distintos (QSAR Tradicional, QSAR-3D e dados espectroscópicos), ofereceram indicativos satisfatórios da eficácia do software na construção de modelos de regressão. Dentre os modelos obtidos, podem ser destacados (i) PCR para QSAR Tradicional [Q² = 0,70]; (ii) PLS para QSAR-3D [Q² = 0,75]; e (iii) Q-PLS para os dados espectroscópicos [Q² = 0,93]. Estes resultados, aliados à precisão e ao bom desempenho do programa, demonstram que o MultiMOL é uma ferramenta adequada para tratar problemas típicos de estatística multivariada. Versões futuras do software poderão incluir opções de processamento paralelo (Grid-Computing) para cálculos que exijam maiores demandas computacionais, bem como a implementação de algoritmos classificatórios (HCA, SIMCA, KNN), com o intuito de aumentar o leque de aplicabilidade do programa. / The molecular modeling area has an increasing interest since it appeared. The application of computational methods in order to predict molecular structures and properties, particularly applied in therapeutic innovation by drug design, for example, has acquired increasing space and reliability in the scientific community and big pharma industry. Among the various computational approaches applied to drug development, it can be highlighted the study of quantitative structure-activity relationship (QSAR). This technique allows the building of statistical regression models which are capable to offer a reliable prediction of a property of interest, e.g., biological activity (QSAR), toxicity (QSTR) or solubility (QSPR). The MultiMOL program, developed at the Laboratório de Química Teórica Medicinal (LQTM), UFPE, is implemented in the programming language C / C++, which offers the multivariate statistical techniques most commonly used in QSAR problems. The features available on it include algorithms for data preprocessing (scaling, mean-centering, variable selection), a variety of regression methods (MLR, PCR, PLS and QPLS), techniques to validate models by cross validation (LOO- FCV) or by use of series of tests, and features to display the results in a graphical way. It should be emphasized that the method of quadratic PLS (QPLS) is not easily found in other softwares, becoming so an important implementation for MultiMOL. All these features are available to the user through a graphical user interface (GUI) for easy use. The program was built with an emphasis on performance, robustness and numerical accuracy, in order to be a satisfactory alternative as a tool of obvious interest for medicinal chemistry and therapeutic innovation. Tests performed with the program, using three different data sets (traditional QSAR, 3D-QSAR and spectroscopic data) have given satisfactory indications of its effectiveness in building regression models. Generated results were obtained with the performance and accuracy characteristics of the program. Among the models obtained, can be detached (i) PCR for traditional QSAR [Q ² = 0.70], (ii) PLS for 3D-QSAR [Q ² = 0.75] and (iii) Q-PLS for spectroscopic [Q ² = 0.93]. These results demonstrate that MultiMOL is a suitable tool for solving typical problems of multivariate statistics, accomplishing therefore with the previously established objectives. Future versions of software may include parallel processing options (Grid-Computing), for calculations that require greater computational demands, as well as the implementation of classification algorithms (HCA, SIMCA, KNN), in order to increase the range of applicability of the program.
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Modelos não lineares parciais generalizados superdispersados

ARAÚJO, Yuri Alves de 20 February 2017 (has links)
Submitted by Alice Araujo (alice.caraujo@ufpe.br) on 2018-05-07T22:34:45Z No. of bitstreams: 1 DISSERTAÇÃO Yuri Alves de Araújo.pdf: 758815 bytes, checksum: d5dcd9d661e8145ae2ace6d8e4d10444 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-05-07T22:34:45Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DISSERTAÇÃO Yuri Alves de Araújo.pdf: 758815 bytes, checksum: d5dcd9d661e8145ae2ace6d8e4d10444 (MD5) Previous issue date: 2017-02-20 / CAPES / Os modelos de regressão são amplamente utilizados quando desejamos avaliar o comportamento de uma ou mais características de interesse (variáveis respostas), em função de outras características observadas (variáveis explicativas). No entanto, os modelos usuais em geral são bastante restritivos e, naturalmente, ocorre uma busca por modelos cada vez mais flexíveis. Neste contexto, Dey et al. (1997) propõem uma classe de modelos lineares generalizados superdispersados, os quais tem a capacidade de controlar a vari-abilidade modelando também sua dispersão de forma independente de sua média. Por outro lado, classes de modelos semiparamétricos estão cada vez mais relevantes na literatura, visto que estes apresentam grande flexibilidade na relação entre a variável resposta e suas correspondentes variáveis explicativas. Nesta dissertação estendemos a classe de modelos superdispersados propostos por Dey et al. (1997) para o âmbito semiparamétrico, ao considerar que a média e a dispersão da variável resposta dependem de componentes paramétricos não lineares e de componentes não paramétricos. Propomos um processo de estimação conjunto dos parâmetros do modelo, e adicionalmente, um critério para a seleção dos parâmetros associados à suavidade das funções não paramétricas. Desenvolvemos técnicas de diagnóstico baseadas em medidas de alavancagem, análise de resíduos e influência local. Na análise de influência local, foram considerados três esquemas de perturbação: perturbação na variável resposta, perturbação nos preditores e ponderação de casos. Por fim, foram realizadas implementações computacionais das técnicas de diagnóstico com o auxilio do software R, as quais são relacionadas com propostas de aplicações práticas envolvendo análise de dados reais. / Regression models are widely used when we want to evaluate the behavior of one or more characteristics of interest (response variables), according to other observed charac-teristics (explanatory variables). However, usual models are so restrictive and, naturally, a search for models is becoming increasingly flexible. In this context, Dey et al. (1997) proposed a class of overdispersed generalized linear models, which has the capacity to controls variability the also modeling a dispersion independently of the mean. On the other hand, are increasingly relevant in literature, since they have great flexibility in the rela-tionship between the response variable and their corresponding explanatory variables. In this work, we extend to the class of models proposed by Dey et al. (1997) for semiparame-tric context, considering that the mean and the dispersion for response variable depend on nonlinear parametric components and nonparametric components. We propose the joint parameter estimation process, and in addition, a selection criteria for the smooth param-eters associated with nonparametric functions. We develop diagnostic techniques based on leverage measures, residuals analisys and local influence under different perturbation schemes. Finally, applications to real data are presented.
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Modelos de regressão sob mistura de escala normal: um enfoque não paramétrico para a variável de mistura

MATOS JÚNIOR, Francisco Jucelino 23 February 2017 (has links)
Submitted by Alice Araujo (alice.caraujo@ufpe.br) on 2018-05-07T23:10:11Z No. of bitstreams: 1 DISSERTAÇÃO Francisco Jucelino Matos Júnior.pdf: 980212 bytes, checksum: 3dadbbaf0fdfb58f20bf3335dee9a4a1 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-05-07T23:10:11Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DISSERTAÇÃO Francisco Jucelino Matos Júnior.pdf: 980212 bytes, checksum: 3dadbbaf0fdfb58f20bf3335dee9a4a1 (MD5) Previous issue date: 2017-02-23 / CNPQ / Martin e Han (2016) propuseram o modelo de regressão linear (MRL-MEN), utilizando o algoritmo Predicte Recursive (PR) para estimar a distribuição da variável aleatória de mistura, considerando o parâmetro de escala conhecido e igual a um. Nesta dissertação estendemos o trabalho desenvolvido por Martin e Han (2016) propondo o modelo de regressão não linear (MRL-MEN) cujo erro tem distribuição de mistura de escala normal (MEN) não especificando uma distribuição para a variável de mistura. A principal motivação em trabalhar com a subclasse de distribuições MEN, é que esta permite trabalhar com distribuições com caudas mais pesadas, uma vez que os estimadores de máxima verossimilhança dos parâmetros do modelo são menos sensíveis a observações atípicas. Especificamente, desenvolvemos um processo para estimar os parâmetros no MRNL-MEN, considerando o parâmetro de escala conhecido e igual a um. Além disso, baseado em duas abordagens apresentadas em Efron (1979) e Louis (1982), estimamos a matriz de variâncias e covariâncias para os estimadores do modelo abordado. Por meio de estudos de simulação, avaliamos empiricamente as propriedades assintóticas dos estimadores em vários cenários, como por exemplo, as estimativas dos parâmetros na presença de observações atípicas e analisamos um conjunto de dados reais por meio da metodologia desenvolvida. / Martin and Han (2016) proposed the linear regression model (LRM-SMN), using the Predictive Recursive (PR) algorithm to estimate the distribution of the mixing random variable, considering a scale parameter known and equal to one. In this present work, we extend the work developed by Martin and Han (2016) proposing the nonlinear regression model (NLRM-SMN) with a distribution error of a normal scale (SMN) not specifying a distribution for a mixture variable. The main motivation for working with the subclass of SMN, is that it allows practitioners to work with heavy tailed distributions, where maximum likelihood estimators of the model parameters are less sensitive to atypical observations. Specficaly, we developed a new estimation process to estimate the parameters in NLRM-SMN, considering known and equal to one. In addition, based on two approaches given in Efron (1979) and Louis (1982) we estimated the covariance matrix of the estimators of the model addressed. Through simulation studies, we evaluated empir-ically the asymptotic properties of the estimators in different scenarios, for example, the parameters estimates in the presence of outliers and analyzed a real data set through the developed methodology.
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Analytic solutions to stochastic epidemic models

SOUZA, Danillo Barros de 24 February 2017 (has links)
Submitted by Fernanda Rodrigues de Lima (fernanda.rlima@ufpe.br) on 2018-07-26T20:39:13Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) DISSERTAÇÃO Danillo Barros de Souza.pdf: 7642919 bytes, checksum: 6768e6fd189bd85a95913caab91d956c (MD5) / Approved for entry into archive by Alice Araujo (alice.caraujo@ufpe.br) on 2018-08-09T22:43:44Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) DISSERTAÇÃO Danillo Barros de Souza.pdf: 7642919 bytes, checksum: 6768e6fd189bd85a95913caab91d956c (MD5) / Made available in DSpace on 2018-08-09T22:43:44Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) DISSERTAÇÃO Danillo Barros de Souza.pdf: 7642919 bytes, checksum: 6768e6fd189bd85a95913caab91d956c (MD5) Previous issue date: 2017-02-24 / CNPq / Even the simplest outbreaks might not be easily predictable. Fortunately, deterministic and stochastic models, systems differential equations and computational simulations have proved to be useful to a better understanding of the mechanics that leads to an epidemic outbreak. Whilst such systems are regularly studied from a modelling viewpoint using stochastic simulation algorithms, numerous potential analytical tools can be inherited from statistical and quantum physics, replacing randomness due to quantum fluctuations with low copy number stochasticity. Here, the Fock space representation, used in quantum mechanics, is combined with the symbolic algebra of creation and annihilation operators to consider explicit solutions for the master equations describing epidemics represented via the SIR model (Susceptible-Infected-Recovered), originally developed via Kermack and McKendrick’s theory. This is illustrated with an exact solution for a short size of population, including a consideration of very short time scales for the next infection, which emphasises when stiffness is present even for small copy numbers. Furthermore, we present a general matrix representation for the SIR model with an arbitrary number of individuals following diagonalization. This leads to the solution of this complex stochastic problem, including an explicit way to express the mean time of epidemic and basic reproduction number depending on the size of population and parameters of infection and recovery. Specifically, the project objective to apply use of the same tools in the approach of system governed by law of mass action, as previously developed for the Michaelis-Menten enzyme kinetics model [Santos et. al. Phys Rev. E 92, 062714 (2015)]. For this, a flexible symbolic Maple code is provided, demonstrating the prospective advantages of this framework compared to Gillespie stochastic simulation algorithms. / Mesmo os surtos mais simples podem não ser facilmente previsíveis. Felizmente, modelos determinísticos e estocásticos, equações diferenciais de sistemas e simulações computa- cionais provaram ser úteis para uma melhor compreensão da mecânica que leva a um surto epidêmico. Enquanto tais sistemas são regularmente estudados a partir de um ponto de vista de modelagem usando algoritmos de simulação estocástica, inúmeras ferramentas analíticas potenciais podem ser herdadas da física estatística e quântica, substituindo aleatoriedade devido a flutuações quânticas com baixa estocástica de número de cópias. Aqui, a representação do espaço de Fock, usada na mecânica quântica, é combinada com a álgebra simbólica dos operadores de criação e aniquilação para considerar soluções explícitas para as equações mestra que descrevem epidemias representadas via modelo SIR (Suscetível-Infectado-Recuperado), originalmente desenvolvido pela teoria de Kermack e McKendrick. Isto é ilustrado com uma solução exata para um tamanho pequeno de população, considerando escalas de tempo muito curtas para a próxima infecção, que enfatiza quando a rigidez está presente mesmo para números de cópias pequenos. Além disso, apresentamos uma representação matricial geral para o modelo SIR com um número arbitrário de indivíduos após diagonalização. Isto nos leva à solução deste problema es- tocástico complexo, além de ter uma maneira explícita de expressar o tempo médio de epidemia e o número básico de reprodução, ambos dependendo do tamanho da população e parâmetros de infecção e recuperação. Especificamente, o objetivo é utilizar as mesmas ferramentas na abordagem de um sistema regido por lei de ação das massas, como anterior- mente desenvolvido para o modelo de cinética enzimática de Michaelis-Menten [Santos et. Al PRE 2015]. Para isso, é fornecido um código Maple simbólico flexível, demonstrando as vantagens potenciais desta estrutura comparados aos algoritmos de simulação estocástica de Gillespie.
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Formulação matematica dos fenomenos de segregação e mistura de particulas solidas polidispersas em leito fluidizado gasoso

Garcia, Helenice Leite 01 November 1996 (has links)
Orientador: Katia Tannous / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia Quimica / Made available in DSpace on 2018-07-21T22:23:48Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Garcia_HeleniceLeite_M.pdf: 3539605 bytes, checksum: 4f41bc0025b731277126220958c9ddbf (MD5) Previous issue date: 1996 / Resumo: Neste trabalho é realizada uma análise matemática sobre os fenômenos de segregação e mistura de partículas polidispersas, pertencentes aos grupos B e D da classificação de Geldart, em leito fluidizado gasoso. Os sistemas experimentais considerados foram constituídos de partículas de diferentes tamanhos e diferentes índices de dispersão. Foram aplicados modelos matemáticos da literatura, elaborados para sistemas binários, para descrever os perfis de concentração dos sólidos imergíveis em estado estacionário. Os resultados obtidos através dos modelos testados concordam razoavelmente vem com os experimentais. Um novo modelo foi proposto baseado na aplicação dos modelos de Gibilaro e Rowe (1974) e Abanades et al. (1994). Neste modelo foi analisada a influencia de parâmetros clássicos (circulação, segregação e troca de sólidos entre as fases do leito) que descrevem os fenômenos de segregação e mistura, considerando o leito em regime empistonado. Os perfis de concentração do sólido imergível apresentam boa concordância com os perfis experimentais. Com a análise individual e combinada da influência dos parâmetros clássicos, o fenômeno de segregação apresentou melhores resultados do que o fenômeno de mistura / Abstract: This work concerns the mathematical analysis about particles segregation and mixing phenomena of polydispersed particles, that belong to B and D groups of Geldart¿s Classification, in gas fluidized bed. The experimental systems was constituted of different sizes of particles and different dispersion indexes. In this case, mathematical models from literature have been applied to describe the attainment of the concentration imergibles profiles in the steady state, to binary systems. The models tested presented a reasonable agreement with experimental profiles. A new model was proposed based in the Gibilaro and Rowe (1974) and Abanades et al. (1994) models. In this new model, it was analyzed the influence of classical parameters (circulation, segregation and exchange of solids among the phases of bed),that describe segregation and mixing phenomena, taking in a count slugging fluidized bed. The imergible solid concentration profiles present a good agreement with the experimental profiles. The segregation phenomenon presented better results abouts about it representation than mixing phenomenon / Mestrado / Engenharia de Processos / Mestre em Engenharia Química
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Calculo do coeficiente de transferencia de calor convectivo incorporando o efeito intra-particula em regeneradores de calor de leito fixo

Hasan, Wajdi Mahamoud 22 July 2018 (has links)
Orientador: Alberto Luiz de Andrade / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia Quimica / Made available in DSpace on 2018-07-22T22:58:55Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Hasan_WajdiMahamoud_M.pdf: 3050706 bytes, checksum: f50ec15b7f9f4852ba2955fb503f2a9c (MD5) Previous issue date: 1995 / Resumo: Uma metodologia de cálculo para o coeficiente de transferência de calor foi utilizada, baseado em um modelo de condução intrapartícula. O cálculo foi feito para o regenerador operando em equilíbrio cíclico, a partir da minimização da diferença entre as temperaturas do sólido, calculadas e medidas experimentalmente, na região de saída do regenerador. Neste cálculo se emprega as equações obtidas por LUPORINI [1994], resultantes de uma solução analítica para a distribuição de temperatura no sólido, levando-se em conta o seu comportamento transiente. Uma montagem experimental foi especialmente construída, propiciando a obtenção de dados experimentais com três regeneradores de calor de diâmetros diferentes, todos eles constituídos em um leito de partículas esféricas de vidro. O equipamento permitiu a operação do regenerador tanto em escoamento contracorrente com em escoamento unidirecional, sendo os dados obtidos para a condição de equilíbrio cíclico. Foram obtidos coeficientes de transferência de calor para o período de aquecimento como para o período de resfriamento, operando-se com diferentes vazões de escoamento, e diferentes duração dos períodos. A partir dos coeficientes de transferência de calor determinados para as diversas condições de operação foram obtidas correlações do tipo 'j IND. H¿¿fi¿ = c¿Re IND. m POT. n¿, para os escoamentos contracorrentes e unidirecional. Uma análise comparativa com trabalhos já publicados foi realizada, demonstrado a validade do método empregado / Abstract: A calculation methodology for heat transfer coefficients was utilized in intraparticle conduction model. This determination was done for a regenerator operating in ciclic equilibrium, through minimization of the differences between theoric and experimental solid temperature, in the outer part of the regenerator. This methodology employ the equation obtained by LUPORINI [1994], provenient from an analytical solutions for solid temperature distribuition, taking account the transient behavior. An equipment was specially constructed, to obtain experimental data, with three different diameters of heat regenerators, containing a bed of spherical glass particles. In this equipment counter and parallel flows were possible. Heat transfer coefficients were obtained for both heating and cooling periods, operating with differents flows and time periods. From the known heat transfer coefficients for the different operating conditions correlations in the form 'j IND. H¿¿fi¿ = c¿Re IND. m POT. n¿ were obtained, for counter and parallel flows. A comparative analyses with others works was done showing the validity of the method employed. / Mestrado / Sistemas de Processos Quimicos e Informatica / Mestre em Engenharia Química
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Conexões entre os espalhamentos elástico e inelástico de Hádrons numa abordagem geométrica

Beggio, Paulo Cesar 29 May 1998 (has links)
Orientador: Marcio Jose Menon / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Fisica Gleb Wataghin / Made available in DSpace on 2018-07-23T16:55:30Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Beggio_PauloCesar_D.pdf: 4124808 bytes, checksum: 440db131d7f642f27879854894cb8300 (MD5) Previous issue date: 1998 / Resumo: Utilizando a unitaridade da matriz S distinguem-se estados intermediários elásticos e inelásticos no espalhamento hádron-hádron. Isso conduz à definição da função de recobrimento inelástica em termos da função de perfil ( eiconal), a qual é associada aos observáveis físicos do canal elástico. Investigam-se duas abordagens geométricas (parâmetro de impacto) que possibilitam estudos das distribuições de multiplicidades das partículas carregadas produzidas nas interações hadrônicas (pp e pp) a altas energias, aqui denominadas abordagens de Finkelstein e de Valin e St. Hilaire, as quais utilizam a função de recobrimento inelástica como "entrada". Nesse estudo consideram-se previsões para essa função provenientes de três modelos fenomenológicos para o canal elástico (modelos de difração dispersiva, difração múltipla e geométrico), desenvolvendo-se uma análise comparativa envolvendo as duas abordagens, os três modelos e observáveis físicos do canal inelástico. Mostra-se que, para os três modelos do canal elástico, a abordagem de Finkelstein não reproduz os dados experimentais de multiplicidades hadrônicas nas energias mais altas. Por outro lado, a partir da abordagem original de Valin e St. Hilaire, estabelecem-se novas conexões entre as multiplicidades hadrônicas e elementares, estas inferidas de parametrizações associadas às informações experimentais mais recentes sobre aniquilação e+ e- .Com esse novo formalismo obtém-se uma excelente descrição das multiplicidades hadrônicas inelásticas sem nenhum parâmetro livre / Abstract: Through the S-matriz unitarity the elastic and inelastic states in hadron-hadron scattering are distinguished. This leads to the definition of the inelastic overlap function in terms of the profile (eikonal) function, which is associated with physical observables of the elastic channel. Two geometrical (impact parameter) approaches for the study of hadronic (pp and pp) multiplicities distribuitions are investigated, referred as Finkelstein and Valin and St. Hilaire approaches, and both use the inelastic overlap function as input. In this study it is considered the predictions for this function from three phenomenological models for the elastic channel ( dispersive diffraction, multiple diffraction and geometrical models) and it is performed a comparative analysis envolving the two approaches, the three models and the physical observables of the inelastic channel. It is shown that for all the three elastic channel models the approach by Finkelstein does not reproduce the hadronic multiplicity distributions at the highest energies. On the other hand, starting from the original approach by Valin and St. Hilaire, new connections between hadronic and elementary multiplicities are established. The elementary distributions are inferred through parametrizations of the most recent experimental information on e+e- annihilation. With this novel formalism an excellent description of the inelastic hadronic multiplicities distributions is acchieved, without free parameters / Doutorado / Física / Doutor em Ciências
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Metodos quantitativos para construção, calibragem e solução de modelos computaveis de equilibrio geral de grande porte

Bordoni, Orlando Frederico José Godoy 03 June 2001 (has links)
Orientador: Jose Antonio Scaramucci / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Matematica, Estatistica e Computação Cientifica / Made available in DSpace on 2018-07-27T11:49:31Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Bordoni_OrlandoFredericoJoseGodoy_D.pdf: 3234952 bytes, checksum: 9a6d18fc583a13c861daf53f52329ab5 (MD5) Previous issue date: 2001 / Resumo: É crescente a demanda por análises quantitativas de questões econômicas globais em áreas como comércio internacional, desenvolvimento e crescimento econômico, agricultura e meio ambiente. A resolução de modelos computáveis de equilíbrio geral (CEG) para modelos de grande porte é a principal contribuição deste trabalho. Métodos quantitativos para a construção, calibragem e solução de modelos CEG de grande porte são apresentados na forma de rotinas computacionais destinadas ao pesquisador em economia. O algoritmo ACI (Atualização de uma Coluna por Iteração) - um método quase-newtoniano secante para resolução de sistemas não-lineares de grande porte (Gomes-Ruggiero [27], Martínez [41]) - é aqui acrescentado ao Pegasus - um sistema de arquitetura aberta de suporte computacional à análise aplicada de equilíbrio geral (Scaramucci [56], Bordoni [5]). Algumas características introduzidas nessa imple mentação, como o uso de alocação dinâmica de memória, o armazenamento das equações do modelo em forma simbólica, o cálculo do jacobiano do sistema não-linear por diferenças finitas e o armazenamento esparso de matrizes viabilizam a resolução de modelos econômicos de grande porte de maneira eficiente e flexível. Outra contribuição apresentada aqui é um conjunto de procedimentos para construir modelos CEG de grande porte a partir de informações do banco de dados do GTAP (Global Trade Analysis Project) [34] / Abstract: There has been a growing interest for quantitative analysis of global economic issues in areas such as international trade, economic development and growth, agriculture and environment. The main contribution of this work is to offer tools for solving large-scale computational general equilibrium (CGE) models. Quantitative methods for constructing, calibrating, and solving large-scale CGE models are presented as computational routines for the economic equilibrium practitioner. The one-column updating (ACI) algorithm - a quasi-Newton secant method for solving large-scale nonlinear systems (Gomes-Ruggiero [27], Martínez [41]) has been added to Pegasus an open-ended computational system for applied general equilibrium (AGE) analysis (Scaramucci [56], Bordoni[5]). Features introduced in this implementation include the use of dynamic memory allocation, symbolic storage of model equations, finite difference evaluation of the system Jacobian, and sparse matrix storage make it feasible to solve large-scale economic models in a efficient and flexible way. Another contribution presented here is a collection of procedures for constructing large-scale CGE models using the GTAP database / Doutorado / Doutor em Matemática Aplicada
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Otimização de layout de plantas quimicas utilizando o problema de designação quadratico

Franceira, Sergio Norival 04 February 2001 (has links)
Orientador: Reginaldo Guirardello / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia Quimica / Made available in DSpace on 2018-07-27T15:25:01Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Franceira_SergioNorival_M.pdf: 3731488 bytes, checksum: d7857c421064b5382fefae40ea456256 (MD5) Previous issue date: 2001 / Resumo / Abstract / Mestrado / Desenvolvimento de Processos Químicos / Mestre em Engenharia Química
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Espacialização de duas microbacias hidrograficas do Rio Piracicaba para modelagem hidrologica

Hein, Marcia 27 July 2018 (has links)
Orientador : Jose Teixeira Filho / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia Agricola / Made available in DSpace on 2018-07-27T22:40:16Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Hein_Marcia_M.pdf: 2468608 bytes, checksum: 97ea9ba6b434a2861cb7cad47a0b9dea (MD5) Previous issue date: 2000 / Mestrado

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