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Functional characterization of a RING-type ubiquitin ligase and MYB transcription factors involved in secondary cell wall formation / 二次細胞壁形成に関与するRING型ユビキチンリガーゼおよびMYB転写因子の機能解析

Noda, Soichiro 24 March 2014 (has links)
京都大学 / 0048 / 新制・課程博士 / 博士(農学) / 甲第18345号 / 農博第2070号 / 新制||農||1024(附属図書館) / 学位論文||H26||N4852(農学部図書室) / 31203 / 京都大学大学院農学研究科応用生命科学専攻 / (主査)教授 梅澤 俊明, 教授 矢﨑 一史, 教授 間藤 徹 / 学位規則第4条第1項該当 / Doctor of Agricultural Science / Kyoto University / DGAM
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Transcriptional regulation of wood formation in eucalyptus : Role of MYB transcription factors and protein-protein interactions / Régulation transcriptionnelle de la formation du bois chez l'eucalyptus : rôle des facteurs de transcription MYB et des interactions protéines-protéines

Plasencia Casadevall, Anna 15 December 2015 (has links)
Notre objectif était de mieux comprendre la régulation de la biosynthèse des parois secondaires lors de la formation du bois chez l'Eucalyptus, le feuillu le plus planté au monde et le deuxième dont le génome est séquencé. Nous avons caractérisé trois facteurs de transcription de la famille MYB-R2R3 et montré que EgMYB137 était un nouveau régulateur de la biosynthèse des parois secondaires. Nous avons aussi démontré que l'activité transcriptionnelle de EgMYB1, un répresseur de la biosynthèse des lignines, était régulée par une interaction protéine-protéine impliquant une histone linker (EgH1.3). Enfin, nous avons mis au point une méthode de transformation homologue chez l'Eucalyptus via A. rhizogenes. Les " hairy roots " transgéniques sont adaptées à la caractérisation fonctionnelle de gènes reliés à la formation du xylème. Nos résultats ont permis de découvrir de nouveaux acteurs impliqués dans la régulation des parois secondaires, mettant en lumière la complexité de ce processus mais aussi offrant de nouvelles perspectives pour l'amélioration du bois pour des applications industrielles comme la production de bioéthanol de deuxième génération. / Our objective was to better understand the regulation of the biosynthesis of the lignified secondary cell walls during wood formation in Eucalyptus, the most planted hardwood tree, and the second whose genome has been sequenced. We functionally characterized three Eucalyptus transcription factors of the R2R3-MYB family and identified EgMYB137 as a new regulator of secondary cell wall deposition. We also showed that the transcriptional activity of EgMYB1, a repressor of lignin biosynthesis was modulated by protein-protein interactions involving a linker histone (EgH1.3). Finally, we set up a homologous transformation system for Eucalyptus using Agrobacterium rhizogenes. The transgenic hairy roots are suitable for high throughput functional characterization of cell wall-related genes. Our findings not only allowed getting new insights into the complexity of the network regulating secondary cell walls but also open new avenues to improve wood quality for industrial applications such as second-generation bioethanol.

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