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Análise de características parentais e do produto no desempenho esportivo de cavalos puro sangue de corrida.

Brito, Enio Luis Ribeiro January 2001 (has links)
O objetivo deste estudo foi avaliar a influência de características parentais e do produto, como sexo, idade materna ao parto, número do parto em que nasceu o animal, número de irmãos mais velhos vencedores de páreos especiais, origem geográfica e idade do garanhão por ocasião da cobertura, sobre o desempenho esportivo de cavalos Puro Sangue de Corrida no Brasil. Foi estudado um total de 7.601 animais, sendo 7.449 participantes (vencedores e não vencedores) da temporada turfística de 1997/1998, dos quais 129 foram vencedores de páreos especiais, e 152 animais vencedores de páreos especiais nas temporadas turfísticas de 1995/1996 e 1996/1997. Dados de nascimento foram analisados usando Regressão Logística e teste de Qui-quadrado. Animais vencedores (3.496) e não vencedores (3.953) na temporada 1997/1998 foram avaliados quanto ao sexo, idade na temporada em questão, idade materna ao parto, número do parto em que nasceu o animal, número de irmãos maternos vencedores de páreos especiais, origem e idade do garanhão. Entre os machos, a percentagem de vencedores (48,4%) foi significativamente superior (p<0,05) à percentagem de fêmeas (44,7%). O percentual de animais vencedores que nasceram no segundo parto (50,7%) também foi significativamente superior ao dos nascidos no primeiro e do terceiro parto em diante (p <0,05). A média de idade dos vencedores (4,8 anos) foi significativamente (p<0,05) inferior à idade dos não vencedores O número médio de páreos disputados (8,6 páreos) foi significativamente superior nos vencedores (p<0,05). Entre os vencedores de páreos especiais na temporada 1997/1998, foram significativamente superiores (p<0,05) os animais com dois ou mais irmãos maternos mais velhos vencedores de páreos especiais (7,8%), os filhos de garanhões norte-americanos (2,58%) e os que obtiveram, na mesma temporada, duas ou mais vitórias comuns (3,34%), bem como a idade paterna média e o número médio de páreos disputados. A idade média dos vencedores de páreos especiais (4,5 anos) foi significativamente inferior à dos não vencedores. Entre os vencedores de provas de Grupo 1, apenas a ordem do parto influenciou positivamente, de forma significativa, as vitórias nesse tipo de páreo. Conclui-se que, para a obtenção de vitórias em páreos comuns, o sexo, a idade, a ordem do parto e o número de apresentações têm influência significativa. Já para a obtenção de vitórias em páreos especiais, observa-se novamente a influência da idade e do número de apresentações, associadas à idade paterna, número de vitórias comuns, número de irmãos vencedores de páreos especiais e a origem paterna, enquanto o sexo do animal e a ordem do parto não têm influencia sobre as vitórias em páreos especiais. No momento em que o universo estudado se restringe a cavalos com vitórias em provas de Grupo I, somente o número de irmãos com vitória clássica influenciou.
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Análise de características parentais e do produto no desempenho esportivo de cavalos puro sangue de corrida.

Brito, Enio Luis Ribeiro January 2001 (has links)
O objetivo deste estudo foi avaliar a influência de características parentais e do produto, como sexo, idade materna ao parto, número do parto em que nasceu o animal, número de irmãos mais velhos vencedores de páreos especiais, origem geográfica e idade do garanhão por ocasião da cobertura, sobre o desempenho esportivo de cavalos Puro Sangue de Corrida no Brasil. Foi estudado um total de 7.601 animais, sendo 7.449 participantes (vencedores e não vencedores) da temporada turfística de 1997/1998, dos quais 129 foram vencedores de páreos especiais, e 152 animais vencedores de páreos especiais nas temporadas turfísticas de 1995/1996 e 1996/1997. Dados de nascimento foram analisados usando Regressão Logística e teste de Qui-quadrado. Animais vencedores (3.496) e não vencedores (3.953) na temporada 1997/1998 foram avaliados quanto ao sexo, idade na temporada em questão, idade materna ao parto, número do parto em que nasceu o animal, número de irmãos maternos vencedores de páreos especiais, origem e idade do garanhão. Entre os machos, a percentagem de vencedores (48,4%) foi significativamente superior (p<0,05) à percentagem de fêmeas (44,7%). O percentual de animais vencedores que nasceram no segundo parto (50,7%) também foi significativamente superior ao dos nascidos no primeiro e do terceiro parto em diante (p <0,05). A média de idade dos vencedores (4,8 anos) foi significativamente (p<0,05) inferior à idade dos não vencedores O número médio de páreos disputados (8,6 páreos) foi significativamente superior nos vencedores (p<0,05). Entre os vencedores de páreos especiais na temporada 1997/1998, foram significativamente superiores (p<0,05) os animais com dois ou mais irmãos maternos mais velhos vencedores de páreos especiais (7,8%), os filhos de garanhões norte-americanos (2,58%) e os que obtiveram, na mesma temporada, duas ou mais vitórias comuns (3,34%), bem como a idade paterna média e o número médio de páreos disputados. A idade média dos vencedores de páreos especiais (4,5 anos) foi significativamente inferior à dos não vencedores. Entre os vencedores de provas de Grupo 1, apenas a ordem do parto influenciou positivamente, de forma significativa, as vitórias nesse tipo de páreo. Conclui-se que, para a obtenção de vitórias em páreos comuns, o sexo, a idade, a ordem do parto e o número de apresentações têm influência significativa. Já para a obtenção de vitórias em páreos especiais, observa-se novamente a influência da idade e do número de apresentações, associadas à idade paterna, número de vitórias comuns, número de irmãos vencedores de páreos especiais e a origem paterna, enquanto o sexo do animal e a ordem do parto não têm influencia sobre as vitórias em páreos especiais. No momento em que o universo estudado se restringe a cavalos com vitórias em provas de Grupo I, somente o número de irmãos com vitória clássica influenciou.
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Análise de características parentais e do produto no desempenho esportivo de cavalos puro sangue de corrida.

Brito, Enio Luis Ribeiro January 2001 (has links)
O objetivo deste estudo foi avaliar a influência de características parentais e do produto, como sexo, idade materna ao parto, número do parto em que nasceu o animal, número de irmãos mais velhos vencedores de páreos especiais, origem geográfica e idade do garanhão por ocasião da cobertura, sobre o desempenho esportivo de cavalos Puro Sangue de Corrida no Brasil. Foi estudado um total de 7.601 animais, sendo 7.449 participantes (vencedores e não vencedores) da temporada turfística de 1997/1998, dos quais 129 foram vencedores de páreos especiais, e 152 animais vencedores de páreos especiais nas temporadas turfísticas de 1995/1996 e 1996/1997. Dados de nascimento foram analisados usando Regressão Logística e teste de Qui-quadrado. Animais vencedores (3.496) e não vencedores (3.953) na temporada 1997/1998 foram avaliados quanto ao sexo, idade na temporada em questão, idade materna ao parto, número do parto em que nasceu o animal, número de irmãos maternos vencedores de páreos especiais, origem e idade do garanhão. Entre os machos, a percentagem de vencedores (48,4%) foi significativamente superior (p<0,05) à percentagem de fêmeas (44,7%). O percentual de animais vencedores que nasceram no segundo parto (50,7%) também foi significativamente superior ao dos nascidos no primeiro e do terceiro parto em diante (p <0,05). A média de idade dos vencedores (4,8 anos) foi significativamente (p<0,05) inferior à idade dos não vencedores O número médio de páreos disputados (8,6 páreos) foi significativamente superior nos vencedores (p<0,05). Entre os vencedores de páreos especiais na temporada 1997/1998, foram significativamente superiores (p<0,05) os animais com dois ou mais irmãos maternos mais velhos vencedores de páreos especiais (7,8%), os filhos de garanhões norte-americanos (2,58%) e os que obtiveram, na mesma temporada, duas ou mais vitórias comuns (3,34%), bem como a idade paterna média e o número médio de páreos disputados. A idade média dos vencedores de páreos especiais (4,5 anos) foi significativamente inferior à dos não vencedores. Entre os vencedores de provas de Grupo 1, apenas a ordem do parto influenciou positivamente, de forma significativa, as vitórias nesse tipo de páreo. Conclui-se que, para a obtenção de vitórias em páreos comuns, o sexo, a idade, a ordem do parto e o número de apresentações têm influência significativa. Já para a obtenção de vitórias em páreos especiais, observa-se novamente a influência da idade e do número de apresentações, associadas à idade paterna, número de vitórias comuns, número de irmãos vencedores de páreos especiais e a origem paterna, enquanto o sexo do animal e a ordem do parto não têm influencia sobre as vitórias em páreos especiais. No momento em que o universo estudado se restringe a cavalos com vitórias em provas de Grupo I, somente o número de irmãos com vitória clássica influenciou.
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Hibridação intraespecífica em Paspalum notatum Flügge / Intraspecific hybridization of Paspalum notatum Flügge

Weiler, Roberto Luis January 2013 (has links)
Paspalum notatum (grama forquilha) é uma espécie reconhecida como de excelente valor forrageiro para o Rio Grande do Sul. A maioria dos biótipos de P. notatum são autotetraplóides (2n=4X=40) e se reproduzem através de apomixia do tipo aposporia (pseudogamia). Foi descrita uma raça diplóide sexual (2n=2X=20), Capim Pensacola, onde a duplicação cromossômica e utilização destas plantas sexuais em cruzamentos intraespecíficos oferecem novas possibilidades para os programas de melhoramento. Através de uma colaboração com o IBONE (Instituto de Botânica da Universidade do Nordeste da Argentina), foram obtidos três genótipos nominados ‘Q4188’, ‘Q4205’ e ‘C44X’ tetraplóides e sexuais que foram cruzados com o germoplasma elite tetraplóide nativo do Estado do Rio Grande do Sul (ecótipos ‘Bagual’ e ‘André da Rocha’). Foram obtidos híbridos intraespecíficos de P. notatum os quais foram avaliados quanto a produtividade, sendo estes passíveis de registro e proteção varietal junto ao Ministério da Agricultura, Pecuária e Abastecimento. Em cruzamentos entre plantas apomíticas e sexuais pode ocorrer plantas dos dois modos de reprodução, portanto foi determinado o modo de reprodução desta progênie. Paralelamente foi induzida a duplicação cromossômica de plantas diplóides da cultivar Capim Pensacola, utilizando colchicina, para igualar a ploidia com os acessos apomíticos tetraplóides, como se trata de outro germoplasma do já disponível estes poderão ser utilizado em futuros cruzamentos. Dos híbridos produzidos, 196 foram levados ao campo para avaliações agronômicas, nos anos de 2011 e 2012, sendo realizados cinco cortes para avaliação de produção de massa seca. A planta híbrida que mais produziu, nominada “D3”, apresentou 597 gramas de matéria seca total, o que representa cerca de 42% a mais do que o genitor mais produtivo (ecótipo ’Bagual’), o qual produziu 420 gramas por planta. As análises citoembriológicas permitiram identificar o modo de reprodução de 23 plantas, de um total de 28 que foram selecionadas após as avaliações agronômicas de produtividade. Destas, 15 apresentaram morfologia do saco embrionário compatível com o modo de reprodução apomítico e oito com o modo de reprodução sexual. As três plantas que confirmaram número cromossômico tetraplóide, nominadas k3, alfa 63 e delta 92 serão avaliadas quanto ao modo de reprodução. Esta estratégia de hibridações intraespecíficas é inédita no sul do país e permitirá a obtenção de híbridos e viabilizará o registro e a proteção varietal. / The native pastures with Paspalum notatum (bahiagrass) exhibit an excellent forage value in Rio Grande do Sul. Most biotypes of P. notatum are autotetraploid (2n = 4x = 40) and reproduce through apomixis (apospory -pseudogamy).There is a sexual diploid race (2n = 2x = 20), Pensacola, that can be duplicated and used in intraspecific crosses offering new possibilities for breeding programs. Through a collaboration with the IBONE (Instituto de Botânica del Nordeste), three tetraploid and sexual genotypes were obtained ('Q4188', 'Q4205' and 'C44X'), that were crossed with the ecotypes 'Bagual' and 'André da Rocha'. The intraspecific hybrids of P. notatum were evaluated for forage yield and agronomic traits, those materials that can be register at the Ministério da Agricultura Pecuária e Abastecimento. In crosses between sexual and apomictic plants can occur plants of two modes of reproduction, so it was necessary to determine the reproductive mode. Beside it was induced plant to duplicate the chromosomal number by using colchicine, Pensacola was used to duplicate and mach the ploidy level with apomictic tetraploid accessions, providing a germplasm different from that available now, that can be use in future crosses. One hundred ninety-six hybrid were evaluated, "D3" had the higher production with 597 grams of total dry matter, which represents about 42% more production than the parent most yield (ecotype 'Bagual'), which produced 420 grams per plant, accumulated in the five cuts. This hybrid produced about seven times more than 'Pensacola' cultivar (87 g). Cytogenetic analyzes were used to determine the reproductive mode of 23 plants, among a total of 28 that were selected after agronomic productivity evaluations, 15 of these had the morphology of the embryonic sac compatible with the apomictic and eight with the sexual mode of reproduction. Three plants confirmed tetraploid chromosome number after induction of replication, k3, alpha 63 and delta 92, those will be evaluated for mode of reproduction. This intraspecific hybridization strategy is unprecedented in the South of Brazil, would result in hybrids and that will be enable to register and protection of future varieties.
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Associação entre polimorfismos no gene candidato Leptina e características quantitativas em suínos / Association between leptin candidate gene polymorphisms and quantitative traits in swine

Peixoto, Jane de Oliveira 30 July 2004 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-06-02T12:58:01Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 416709 bytes, checksum: 2bb727f4c0fb775d57edba4fdab8f115 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-02T12:58:01Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 416709 bytes, checksum: 2bb727f4c0fb775d57edba4fdab8f115 (MD5) Previous issue date: 2004-07-30 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Neste estudo investigou-se a associação entre polimorfismos no gene da Leptina e características quantitativas em suínos produzidos pelo cruzamento divergente entre machos da raça naturalizada brasileira Piau e matrizes comerciais. Foram avaliadas características de desempenho, carcaça, cortes de carcaça e qualidade da carne. Os polimorfismos detectados por seqüenciamento nos animais parentais foram reconhecidos pelas enzimas Pvu II, Dde I, Bam HI, Fok I e Hinf I, respectivamente nas posições do gene 798, 828, 2411, 3266 e 3469 pb. Apenas o polimorfismo T3469C estava localizado em região de exon; os demais polimorfismos se encontravam em regiões não- expressas do gene. Os genótipos para cada polimorfismo foram obtidos pela técnica de PCR-RFLP. Nas análises estatísticas de associação entre os polimorfismos e as características foi utilizado o modelo com efeitos fixos de genótipo, sexo, lote, interação genótipo x sexo e efeito aleatório de pai. Foram consideradas diferentes covariáveis para cada grupo de características. As médias dos genótipos foram comparadas pelo teste F ou t. Quando a interação genótipo x sexo foi significativa, realizou-se a comparação entre as médias dos genótipos dentro de sexo por meio do teste t. Os efeitos médios da substituição alélica e os desvios da dominância dos genótipos foram determinados. O polimorfismo C798T apresentou associações com as características número total de tetas (p=0,02), número de tetas esquerdas (p=0,03), espessura de toucinho UL (p=0,06), comprimento de intestino (p=0,02) e peso total de carré (p= 0,01). O sítio polimórfico C828T esteve associado a variações nas características peso da banda direita (p=0,06) e banda esquerda (p=0,06), peso da copa limpa (p= 0,07), peso total de paleta (p=0,03) e peso de bacon (p=0,03). O polimorfismo T2411C esteve associado a variações nas características espessura de toucinho P2 (p=0,06), peso de paleta limpa (p=0,06), peso de copa (p=0,08), peso do filezinho (p=0,01) e peso do rim (p=0,01). O polimorfismo T3266G apresentou associações significativas com as características idade ao abate (p=0,08), espessura de toucinho medida imediatamente após a última costela, a 6,5 cm da linha dorso-lombar (p=0,07), espessura de toucinho imediatamente após a última costela, na linha dorso- lombar (p=0,04), espessura de toucinho entre a última e a penúltima vértebra lombar, na linha dorso-lombar (p=0,07), peso de costela (p=0,09), peso de copa limpa (p= 0,08) e peso de bacon (p=0,04). O polimorfismo T3469C apresentou associação com as características peso aos 21 (p=0,03), 42 (p=0,05), 63 (p=0,02) e 77 dias de idade (p=0,04), peso ao abate (p=0,03), consumo de ração (p=0,01), ganho de peso médio diário (p< 0,01), conversão alimentar (p<0,01), comprimento de carcaça medido pelos métodos brasileiro (p=0,09) e americano (p=0,04), índice de vermelho (p=0,02) e tonalidade da carne (p=0,03). Foi observada a interação entre sexo e os genótipos para muitas características. Os efeitos médios da substituição alélica e os desvios da dominância foram determinados somente para os polimorfismos T828C e T2411C. Os resultados sugerem que os polimorfismos são potenciais marcadores para características produtivas de importância econômica como taxa de crescimento, consumo de ração e espessura de toucinho. No entanto, as associações foram detectadas em população experimental, sendo necessária a validação desses resultados em populações comerciais. / The association of polymorphisms in the porcine Leptin gene and quantitative traits in pigs produced by initial mating of native Brazilian boars and commercial sows was investigated. Performance, carcass, carcass cuts and meat quality traits were analyzed. The polymorphic sites detected by sequencing parental animals DNA were recognized by the enzymes Pvu II, Dde I, Bam HI, Fok I e Hinf I, respectively observed in the positions 798, 828, 2411, 3266 e 3469 pb. Only T3469C polymorphism was observed in exonic region; the other ones were observed at a not expressed region of Leptin gene. Genotypes were identified by PCR – RFLP. Association analyses were performed using a model that included genotype, sex, group and genotype x sex interaction as fixed effects and sire as random effect. Different covariates were assumed according to different trait groups. Genotypes means were compared by F test or t test. The existence of interaction between genotype and sex was evaluated and genotypes means were compared for each sex by t test. The polymorphism C798T was associated with variation in total number (p=0.02) and left number of teats (p=0.03), backfat thickness between last and last but one lumbar vertebrae (p=0.06), intestine length (p=0.02) and total loin ix(bone-in) weight (p=0.01). The polymorphic site C828T was associated with variation on right half carcass weight (p=0.06), left half carcass weight (p=0.06), boston shoulder weight (p=0.07), picnic shoulder weight (p=0.03) and bacon weight (p=0.04). The polymorphism T2411C was associated with variation in backfat thickness after last rib, at 6.5 cm from the midline (p=0.06), skinless and fatless picnic shoulder weight (p=0.06), boston shoulder weight (p=0.08), sirloin weight (p=0.01) and kidney weight (p=0.01). The polymorphism T3266G was associated with slaughter age (p=0.08), backfat thickness after last rib, at 6.5 cm from the midline (p=0.07), backfat thickness after last rib (p=0.04), and backfat thickness between last and last but one lumbar vertebrae (p=0.07), spareribs weight (p=0.09), skinless and fatless boston shoulder weight (p=0.08) and bacon weight (p=0.04). The T3469C polymorphism was associated with weight at 21 (p=0.03), 42 (p=0.05), 63 (p=0.02) and at 77 days of age (p=0.04), slaughter weight (p=0.03), feed intake (p=0.01), average daily gain (p<0.01), feed/gain ratio (p<0.01), carcass length by the Brazilian carcass classification method (p=0.09) and by the American carcass classification method (p=0.04), redness (p=0.02) and hue (p=0.03). Association between genotype and sex was observed for many traits. Allelic substitution and dominance effects were estimated for polymorphisms T828C and T2411C. The observations suggest that these Leptin polymorphisms may be considered potential molecular markers for economically important production traits such as feed intake, growth rate and back fat in swine. However, associations need to be confirmed in commercial populations.
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O gene da Síndrome do Estresse Suíno e sua relação com características de importância econômica em suínos / The Porcine Stress Syndrome gene and its relationships with traits of economic importance in swines

Band, Guilherme de Oliveira 07 February 2003 (has links)
Submitted by Nathália Faria da Silva (nathaliafsilva.ufv@gmail.com) on 2017-07-11T10:51:51Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 993006 bytes, checksum: d6a0e872e24eb36ce9bebd55844acea7 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-07-11T10:51:51Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 993006 bytes, checksum: d6a0e872e24eb36ce9bebd55844acea7 (MD5) Previous issue date: 2003-02-07 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Os genótipos do gene PSS foram caracterizados para 596 suínos procedentes de um cruzamento F 2 entre fêmeas comerciais e suínos nativos brasileiros, por meio da técnica de PCR-RFLP. As características de carcaça, desempenho e qualidade da carne foram avaliadas. Entre os 596 animais analisados, 493 (82,72%) foram caracterizados como NN e 103 (17,28%), como Nn. Animais Nn, quando comparados com animais NN, apresentaram, para as características de carcaça, maiores (P<0,05) valores de peso da banda direita (27,30±2,67 vs. 26,85±2,67), peso da banda esquerda (27,21±2,60 vs. 26,74±2,60), profundidade do lombo (45,48±4,34 vs. 43,43±4,34) e área de olho de lombo (28,14±2,74 vs. 26,09±2,74) e menores espessuras de toucinho na região da copa (39,08±5,43 vs. 40,86±5,43), espessuras de toucinho entre a última e a penúltima vértebra lombar (27,30±5,94 vs. 28,92±5,94) e espessuras de toucinho após a última costela, a 6,5cm da linha dorso-lombar (15,51±3,74 vs. 17,24±3,74), o que indica maior peso ao abate, menor deposição de gordura na carcaça e maior deposição de carne na carcaça, para animais portadores do alelo n. Animais Nn, quando comparados com animais NN, apresentaram, para cortes, maiores (P<0,05) valores de peso da banda direita resfriada (26,99±2,90 vs. 26,45±2,90), peso do pernil (7,40±0,82 vs. 7,29±0,82), peso do pernil sem pele e sem gordura (5,23±0,60 vs. 4,96±0,60), peso da copa sem ivpele e sem gordura (1,75±0,27 vs. 1,68±0,27), peso da paleta (5,00±0,61 vs. 4,88±0,61), peso da paleta sem pele e sem gordura (2,87±0,39 vs. 2,68±0,39), peso do lombo (1,11±0,18 vs. 1,01±0,18), peso da cabeça (1,56±0,21 vs. 1,51±0,21) e peso do filezinho (0,24±0,04 vs. 0,22±0,04), o que indica maiores rendimentos de cortes para animais portadores do alelo n, confirmando os resultados de características de carcaça, e menores valores para espessura do bacon (23,68±6,63 vs. 25,38±6,63), confirmando a menor deposição de gordura na carcaça. Animais Nn, quando comparados com animais NN, apresentaram menores (P<0,05) valores para a característica de desempenho peso aos 105 dias (36,01±6,28 vs. 36,82±6,28), indicando menor taxa de crescimento para animais portadores do alelo n, nesta idade. Os animais dos dois genótipos (NN e Nn, respectivamente) não diferiram (P>0,05) para pH 24 horas após o abate (5,71±0,15 vs. 5,70±0,15), porcentagem de gordura intramuscular (1,55±0,64 vs. 1,65±0,64), força de cisalhamento (5551,60±871,95 vs. 5506,60±871,95), luminosidade (44,96±2,02 vs. 45,01±2,02), índice de vermelho (0,64±0,60 vs. 0,79±0,60), índice de amarelo (6,62±0,55 vs. 6,65±0,55), tonalidade de cor (84,28±5,56 vs. 83,41±5,56) e índice de saturação (6,68±0,52 vs. 6,73±0,52). No entanto, animais Nn, quando comparados com animais NN, apresentaram (P<0,05) menores valores de pH 45 minutos após o abate (6,41±0,26 vs. 6,51±0,26) e maiores valores para perda d água por gotejamento (3,92±1,68 vs. 3,06±1,68), cozimento (33,29±2,54 vs. 32,50±2,54) e perda de água total (35,67±2,67 vs. 34,01±2,67). Os resultados obtidos mostram que mesmo animais originados de cruzamento divergente, portadores do gene PSS, apresentaram maior rendimento de carne magra, maior rendimento de cortes, menor deposição de gordura na carcaça e carne de qualidade inferior. / The PSS gene genotypes of 596 F 2 pigs produced by initial mating of Brazilian commercial sows and native boars were characterized by the PCR-RFLP technique and their carcass, performance and meat quality traits were evaluated. Among the 596 analyzed animals, 493 animals (82.72%) were characterized as NN and 103 animals (17.28%) as Nn. Nn animals, compared to NN animals, presented, for the carcass traits, higher (P<0.05) values for right half carcass weight (27.30±2.67 vs. 26.85±2.67), left half carcass weight (27.21±2.60 vs. 26.74±2.60), loin depth (45.48±4.34 vs. 43.43±4.34) and loin eye area (28.14±2.74 vs. 26.09±2.74), and lower values for shoulder backfat thickness (39.08±5.43 vs. 40.86±5.43), backfat thickness between last and last but one lombar vertebrae (27.30±5.94 vs. 28.92±5.94), backfat thickness after last rib, at 6.5 cm from the midline (15.51±3.74 vs. 17.24±3.74), indicating higher slaughter weight, lower carcass fat deposition and higher carcass lean content for animals carrying the n allele. Nn animals, compared to NN animals, presented, for carcass cuts yields, higher (P<0.05) values for cold right half carcass weight (26.99±2.90 vs. 26.45±2.90), ham weight (7.40±0.82 vs. 7.29±0.82), skinless and fatless ham weight (5.23±0.60 vs. 4.96±0.60), skinless and fatless boston shoulder weight (1.75±0.27 vs. 1.68±0.27), picnic shoulder weight vi(5.00±0.61 vs. 4.88±0.61), skinless and fatless picnic shoulder weight (2.87±0.39 vs. 2.68±0.39), loin weight (1.11±0.18 vs. 1.01±0.18), head weight (1.56±0.21 vs. 1.51±0.21) and sirloin weight (0.24±0.04 vs. 0.22±0.04), indicating greater cuts yields for n allele carrying animals, confirming the carcass traits results, and lower values for bacon depth (23.68±6.63 vs. 25.38±6.63), confirming lower carcass fat deposition. Nn animals, compared to NN animals, presented lower (P<0.05) values for the performance trait weight at 105 days of age (36.01±6.28 vs. 36.82±6.28), indicating a lower growth rate for animals carrying the n allele, at this age. Both genotypes animals (NN and Nn, respectively) did not differ (P>0.05) for pH at 24 hours after slaughter (5.71±0.15 vs. 5.70±0.15), marbling (1.55±0.64 vs. 1.65±0.64), shear force (5551.60±871.95 vs. 5506.60±871.95), lightness (44.96±2.02 vs. 45.01±2.02), redness (0.64±0.60 vs. 0.79±0.60), yellowness (6.62±0.55 vs. 6.65±0.55), hue (84.28±5.56 vs. 83.41±5.56) and chroma (6.68±0.52 vs. 6.73±0.52). However, Nn animals, compared to NN animals, presented lower (P<0.05) pH at 45 minutes after slaughter (6.41±0.26 vs. 6.51±0.26), and higher drip (3.92±1.68 vs. 3.06±1.68), cooking (33.29±2.54 vs. 32.50±2.54) and total (35.67±2.67 vs. 34.01±2.67) water losses. These results show that animals carrying the PSS gene, even those from divergent crossing, generate leaner carcasses, with higher cutting yields and lean content. On the other hand, they produce meat of inferior quality.
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Hibridação intraespecífica em Paspalum notatum Flügge / Intraspecific hybridization of Paspalum notatum Flügge

Weiler, Roberto Luis January 2013 (has links)
Paspalum notatum (grama forquilha) é uma espécie reconhecida como de excelente valor forrageiro para o Rio Grande do Sul. A maioria dos biótipos de P. notatum são autotetraplóides (2n=4X=40) e se reproduzem através de apomixia do tipo aposporia (pseudogamia). Foi descrita uma raça diplóide sexual (2n=2X=20), Capim Pensacola, onde a duplicação cromossômica e utilização destas plantas sexuais em cruzamentos intraespecíficos oferecem novas possibilidades para os programas de melhoramento. Através de uma colaboração com o IBONE (Instituto de Botânica da Universidade do Nordeste da Argentina), foram obtidos três genótipos nominados ‘Q4188’, ‘Q4205’ e ‘C44X’ tetraplóides e sexuais que foram cruzados com o germoplasma elite tetraplóide nativo do Estado do Rio Grande do Sul (ecótipos ‘Bagual’ e ‘André da Rocha’). Foram obtidos híbridos intraespecíficos de P. notatum os quais foram avaliados quanto a produtividade, sendo estes passíveis de registro e proteção varietal junto ao Ministério da Agricultura, Pecuária e Abastecimento. Em cruzamentos entre plantas apomíticas e sexuais pode ocorrer plantas dos dois modos de reprodução, portanto foi determinado o modo de reprodução desta progênie. Paralelamente foi induzida a duplicação cromossômica de plantas diplóides da cultivar Capim Pensacola, utilizando colchicina, para igualar a ploidia com os acessos apomíticos tetraplóides, como se trata de outro germoplasma do já disponível estes poderão ser utilizado em futuros cruzamentos. Dos híbridos produzidos, 196 foram levados ao campo para avaliações agronômicas, nos anos de 2011 e 2012, sendo realizados cinco cortes para avaliação de produção de massa seca. A planta híbrida que mais produziu, nominada “D3”, apresentou 597 gramas de matéria seca total, o que representa cerca de 42% a mais do que o genitor mais produtivo (ecótipo ’Bagual’), o qual produziu 420 gramas por planta. As análises citoembriológicas permitiram identificar o modo de reprodução de 23 plantas, de um total de 28 que foram selecionadas após as avaliações agronômicas de produtividade. Destas, 15 apresentaram morfologia do saco embrionário compatível com o modo de reprodução apomítico e oito com o modo de reprodução sexual. As três plantas que confirmaram número cromossômico tetraplóide, nominadas k3, alfa 63 e delta 92 serão avaliadas quanto ao modo de reprodução. Esta estratégia de hibridações intraespecíficas é inédita no sul do país e permitirá a obtenção de híbridos e viabilizará o registro e a proteção varietal. / The native pastures with Paspalum notatum (bahiagrass) exhibit an excellent forage value in Rio Grande do Sul. Most biotypes of P. notatum are autotetraploid (2n = 4x = 40) and reproduce through apomixis (apospory -pseudogamy).There is a sexual diploid race (2n = 2x = 20), Pensacola, that can be duplicated and used in intraspecific crosses offering new possibilities for breeding programs. Through a collaboration with the IBONE (Instituto de Botânica del Nordeste), three tetraploid and sexual genotypes were obtained ('Q4188', 'Q4205' and 'C44X'), that were crossed with the ecotypes 'Bagual' and 'André da Rocha'. The intraspecific hybrids of P. notatum were evaluated for forage yield and agronomic traits, those materials that can be register at the Ministério da Agricultura Pecuária e Abastecimento. In crosses between sexual and apomictic plants can occur plants of two modes of reproduction, so it was necessary to determine the reproductive mode. Beside it was induced plant to duplicate the chromosomal number by using colchicine, Pensacola was used to duplicate and mach the ploidy level with apomictic tetraploid accessions, providing a germplasm different from that available now, that can be use in future crosses. One hundred ninety-six hybrid were evaluated, "D3" had the higher production with 597 grams of total dry matter, which represents about 42% more production than the parent most yield (ecotype 'Bagual'), which produced 420 grams per plant, accumulated in the five cuts. This hybrid produced about seven times more than 'Pensacola' cultivar (87 g). Cytogenetic analyzes were used to determine the reproductive mode of 23 plants, among a total of 28 that were selected after agronomic productivity evaluations, 15 of these had the morphology of the embryonic sac compatible with the apomictic and eight with the sexual mode of reproduction. Three plants confirmed tetraploid chromosome number after induction of replication, k3, alpha 63 and delta 92, those will be evaluated for mode of reproduction. This intraspecific hybridization strategy is unprecedented in the South of Brazil, would result in hybrids and that will be enable to register and protection of future varieties.
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Hibridação intraespecífica em Paspalum notatum Flügge / Intraspecific hybridization of Paspalum notatum Flügge

Weiler, Roberto Luis January 2013 (has links)
Paspalum notatum (grama forquilha) é uma espécie reconhecida como de excelente valor forrageiro para o Rio Grande do Sul. A maioria dos biótipos de P. notatum são autotetraplóides (2n=4X=40) e se reproduzem através de apomixia do tipo aposporia (pseudogamia). Foi descrita uma raça diplóide sexual (2n=2X=20), Capim Pensacola, onde a duplicação cromossômica e utilização destas plantas sexuais em cruzamentos intraespecíficos oferecem novas possibilidades para os programas de melhoramento. Através de uma colaboração com o IBONE (Instituto de Botânica da Universidade do Nordeste da Argentina), foram obtidos três genótipos nominados ‘Q4188’, ‘Q4205’ e ‘C44X’ tetraplóides e sexuais que foram cruzados com o germoplasma elite tetraplóide nativo do Estado do Rio Grande do Sul (ecótipos ‘Bagual’ e ‘André da Rocha’). Foram obtidos híbridos intraespecíficos de P. notatum os quais foram avaliados quanto a produtividade, sendo estes passíveis de registro e proteção varietal junto ao Ministério da Agricultura, Pecuária e Abastecimento. Em cruzamentos entre plantas apomíticas e sexuais pode ocorrer plantas dos dois modos de reprodução, portanto foi determinado o modo de reprodução desta progênie. Paralelamente foi induzida a duplicação cromossômica de plantas diplóides da cultivar Capim Pensacola, utilizando colchicina, para igualar a ploidia com os acessos apomíticos tetraplóides, como se trata de outro germoplasma do já disponível estes poderão ser utilizado em futuros cruzamentos. Dos híbridos produzidos, 196 foram levados ao campo para avaliações agronômicas, nos anos de 2011 e 2012, sendo realizados cinco cortes para avaliação de produção de massa seca. A planta híbrida que mais produziu, nominada “D3”, apresentou 597 gramas de matéria seca total, o que representa cerca de 42% a mais do que o genitor mais produtivo (ecótipo ’Bagual’), o qual produziu 420 gramas por planta. As análises citoembriológicas permitiram identificar o modo de reprodução de 23 plantas, de um total de 28 que foram selecionadas após as avaliações agronômicas de produtividade. Destas, 15 apresentaram morfologia do saco embrionário compatível com o modo de reprodução apomítico e oito com o modo de reprodução sexual. As três plantas que confirmaram número cromossômico tetraplóide, nominadas k3, alfa 63 e delta 92 serão avaliadas quanto ao modo de reprodução. Esta estratégia de hibridações intraespecíficas é inédita no sul do país e permitirá a obtenção de híbridos e viabilizará o registro e a proteção varietal. / The native pastures with Paspalum notatum (bahiagrass) exhibit an excellent forage value in Rio Grande do Sul. Most biotypes of P. notatum are autotetraploid (2n = 4x = 40) and reproduce through apomixis (apospory -pseudogamy).There is a sexual diploid race (2n = 2x = 20), Pensacola, that can be duplicated and used in intraspecific crosses offering new possibilities for breeding programs. Through a collaboration with the IBONE (Instituto de Botânica del Nordeste), three tetraploid and sexual genotypes were obtained ('Q4188', 'Q4205' and 'C44X'), that were crossed with the ecotypes 'Bagual' and 'André da Rocha'. The intraspecific hybrids of P. notatum were evaluated for forage yield and agronomic traits, those materials that can be register at the Ministério da Agricultura Pecuária e Abastecimento. In crosses between sexual and apomictic plants can occur plants of two modes of reproduction, so it was necessary to determine the reproductive mode. Beside it was induced plant to duplicate the chromosomal number by using colchicine, Pensacola was used to duplicate and mach the ploidy level with apomictic tetraploid accessions, providing a germplasm different from that available now, that can be use in future crosses. One hundred ninety-six hybrid were evaluated, "D3" had the higher production with 597 grams of total dry matter, which represents about 42% more production than the parent most yield (ecotype 'Bagual'), which produced 420 grams per plant, accumulated in the five cuts. This hybrid produced about seven times more than 'Pensacola' cultivar (87 g). Cytogenetic analyzes were used to determine the reproductive mode of 23 plants, among a total of 28 that were selected after agronomic productivity evaluations, 15 of these had the morphology of the embryonic sac compatible with the apomictic and eight with the sexual mode of reproduction. Three plants confirmed tetraploid chromosome number after induction of replication, k3, alpha 63 and delta 92, those will be evaluated for mode of reproduction. This intraspecific hybridization strategy is unprecedented in the South of Brazil, would result in hybrids and that will be enable to register and protection of future varieties.
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Avaliação genética do crescimento em bovinos da raça nelore por meio de modelos multicaracterísticos e de regressão aleatória / Genetic evaluation of growth in Nellore beef cattle via multi-trait and random regression models

Teixeira, Bruno Bastos 15 May 2015 (has links)
Submitted by Amauri Alves (amauri.alves@ufv.br) on 2015-11-20T10:44:52Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 542026 bytes, checksum: 2ca363eb8fda9e4793dc1753fbf56056 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-11-20T10:44:52Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 542026 bytes, checksum: 2ca363eb8fda9e4793dc1753fbf56056 (MD5) Previous issue date: 2015-05-15 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Objetivou-se, com o presente trabalho estimar componentes de (co)variância e parâmetros genéticos para pesos obtidos por modelos de regressão aleatória (MRA) via polinômios ortogonais de Legendre e compará-los a modelos multicaracterísticos; e comparar o MRA de melhor ajuste (via polinômio ortogonal de Legendre), com funções ajustadas por modelos B- spline com segmentos lineares, quadráticos ou cúbicos. Foram avaliados registros de peso dos 60o o 499o dias de idade de bovinos da raça Nelore nascidos entre 2005 e 2012. Os dados para as análises multicaracterísticas foram compostos por pesos ajustados aos 120 (P 120 ), 210 (P 210 ), 365 (P 365 ) e 450 (P 450 ) dias de idade, já para os MRA continha os mesmo dados porem não ajustados. A estimação dos componentes de (co)variância e parâmetros genéticos foram realizadas pelo método da máxima verossimilhança restrita (REML). Foram testados 12 diferentes MRA, utilizando-se de polinômios ortogonais de Legendre, de ordens dois (linear), três (quadrático) ou quatro (cúbico). Da mesma forma, para as funções B-spline, polinômios lineares (L), quadráticos (Q) e cúbicos (C), foram testados, porém variando o número de nós. Os critérios de informação de Akaike (AIC), informação bayesiano de Schwarz (BIC), valores do logaritmo da função de verossimilhança (Log e L) e teste da razão de verossimilhança (LRT) foram utilizados para a escolha do melhor modelo. O modelo (6) - Leg34444 com ordem 3 para o efeito fixo e 4 para os efeitos aleatórios (aditiva direta, materna e ambiente permanente direto e materno) ajustado pelo polinômios de legendre apresentou um menor número de parâmetros, maior valor de Log e L e menor de AIC e BIC. As estimativas de variância genética aditiva direta 2 do animal (σ gad ), variância genética aditiva materna (σ gam ), variância de ambiente permanente 2 ), variância de ambiente permanente direto (σ pd ), variância fenotípica (σ f 2 ) e materno (σ pm variância residual composta (σ rc ) obtidas pelos modelos multicaracterístico e MRA (modelo 6-ajustado por polinômios de Legendre), apresentaram tendências semelhantes para o peso ao longo da curva de crescimento. No entanto, as estimativas mais acuradas foram obtidas via MRA. Em relação as estimativas de herdabilidades direta (h2 d ), de maneira geral, foram semelhantes e variaram de 0,09 a 0,28 e 0,15 a 0,39 para os modelos multicaracterístico e o MRA. De mesmo modo, as herdabilidades materna (h2 m ) foram similares, porém de baixa magnitude, com estimativas que variaram de 0,01 a 0,03 e 0,08 a 0,11 para os modelos vi multicaracterístico e o MRA. A função B-spline do modelo A1- BSL33322 (CL4) sendo linear, ordem 3 para os coeficientes de regressão fixos, aleatórios genético aditivo e materno e ordem 2 para os coeficiente de regressão aleatória de ambiente permanente direto e materno, com quatro classes de variância residual (CL 4 ) e 27 parâmetros, propiciou melhor ajuste em relação ao polinômio de Legendre de modelo 6 - Leg34444 (CL4), que continha com 43 parâmetros. As estimativas de (co)variância e parâmetros genéticos estimadas tanto para MRA (ajustada por polinômios de Legendre) quanto para os modelos multicacteristico foram biologicamente semelhantes. No entanto, o modelo com função polinomial de Legendre de ordem três para os efeitos fixos e quatro para os efeitos aleatórios foi o que apresentou as melhores acurácias para os parâmetros avaliados. O uso de uma função B-Spline linear com coeficientes de regressão de ordem três para os (efeitos fixos, aleatórios genético aditivo e materno) com três nós e ordem dois para os (efeitos aleatórios de ambiente permanente direto e materno) com dois nós no extremo da curva, proporcionaram um melhor ajuste no modelo em comparação com o modelo ajustado com polinômios ortogonais de Legendre. / The objective of the present study was to estimate (co)variance components and genetic parameters for weight records (WR) using an orthogonal Legendre polynomials random regression model (MRA) and to compare with multi-trait models adjusted for weight records at 120 (P 120 ), 210 (P 210 ) 365 (P 365 ) and 450 (P 450 ) days old, and to compare the MRA best-fitting model with B-spline models fitted by different orders of segment (linear, quadratic or cubic). We provided weight records from 60 to 499 days old from Nellore cattle born between 2005 and 2012. WR for multi-trait analyses were adjusted at 120 (P 120 ), 210 (P 210 ), 365 (P 365 ) and 450 (P 450 ) days old, whereas the original WR was used in the MRA. The estimation of (co)variance and genetic parameters were performed by the REML. Twelve (12) different MRA using orthogonal Legendre polynomials were fitted (linear, quadratic or cubic) as well as via B-spline function, linear (L), quadratic (Q), and cubic (C) polynomials were fitted differing from the number of nodes assumed in each model. Akaike information criterion (AIC), Bayesian information criterion of Schwarz (BIC), logarithm values of the likelihood function (Log e L) and the likelihood ratio test (LRT) were used for model choice. The model (6) - Leg34444 with order 3 for the fixed effect and 4 for the random effects (direct additive, maternal and direct permanent environmental and maternal) adjusted by the Legendre polynomials had a small number of parameters, higher value Log e L and lower AIC and BIC values. Estimates ), maternal direct additive genetic of direct additive genetic variance of the animal (σ gad 2 variance (σ gam ), maternal permanent environmental variance (σ pm ), direct permanent 2 environmental variance (σ pd ), phenotypic variance (σ f 2 ) and composed residual variance (σ rc ) obtained by multi-trait models and MRA (model-6 adjusted for Legendre polynomials) were similar along the growth curve. However, MRA presented higher accuracy compared to multi- trait models. The estimates of direct heritability (h2 d ) were, in general, similar for both models (range 0.09-0.28 and 0.15-0.39) for multi-trait and MRA, respectively. The maternal heritability (h2 m ) were low magnitude and showed the same trend, with estimates ranging from (0.01 to 0.03) and (0.08 to 0.11) for multi-trait and MRA. The B-spline model function A1-BSL33322 (CL 4 ) being linear, order 3 for fixed regression coefficients, random genetic and maternal and order 2 for the random regression coefficient of direct and maternal permanent environment, with four classes of residual variance (CL 4 ) and 27 parameters, provided better fit compared to viii the Legendre polynomial model 6-Leg34444 (CL 4 ), which contained 43 parameters. Covariance and genetic parameters estimates for MRA (adjusted for Legendre polynomials) and multi-trait models presented the same behavior along the growth curve. However, the model assuming Legendre polynomials of order three for the fixed and four for random effects showed higher accuracies. The use of a B-Spline Linear function of order three for fixed effects, random genetic animal and maternal with three nodes and order two for direct and maternal permanent environmental effects with two nodes best fit in comparison with Legendre polynomials orthogonal models.
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Gene networks from genome wide association studies for pigs reproductive traits / Redes gênicas a partir de estudos de associação genômica ampla para características reprodutivas de suínos

Verardo, Lucas Lima 31 July 2015 (has links)
Submitted by Amauri Alves (amauri.alves@ufv.br) on 2015-11-20T15:05:04Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 16390235 bytes, checksum: bf9c167c7ae478892635d42c1cdc9bff (MD5) / Made available in DSpace on 2015-11-20T15:05:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 16390235 bytes, checksum: bf9c167c7ae478892635d42c1cdc9bff (MD5) Previous issue date: 2015-07-31 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Características reprodutivas em suínos como numero de natimortos (SB), numero total de nascidos (TNB) e numero de tetos (NT) são amplamente incluídos em programas de melhoramento devido suas importâncias na indústria. Ao contrário da maioria dos estudos de associação, que consideram fenótipos contínuos com um enfoque Gaussiano, estas características são conhecidas como variáveis discretas, podendo assim, potencialmente seguir outras distribuições como a Poisson. Além disso, apesar de haver vários estudos de associação genômica ampla (GWAS) sendo realizados, somente alguns vem explorando os significados biológicos dos genes identificados nestes estudos. O presente trabalho, usando análises pós-GWAS, fornece uma valiosa fonte de informações sobre genes identificados a partir de estudos de associação para características reprodutivas. As analises de distribuição em modelos genômicos demonstraram a importância em considerar modelos de contagem para SB. Além do mais, diferentes grupos de SNPs e blocos de QTL relevantes entre e dentro de cada estudo foram identificados, direcionando para a possibilidade de diferentes grupos de genes estarem desempenhando funções biológicas relacionadas a uma única característica. Deste modo, destacamos que a diversidade genômica entre populações/ambientes deve ser observada em programas de melhoramento de modo que populações de referência especificas para cada população/ambiente sejam consideradas em estudos genômicos. Com base nestes resultados, nós demonstramos a importância das análises pós-GWAS aumentando o entendimento biológico de genes relevantes para características complexas. / Reproductive traits in pigs, such as number of stillborn (SB), total number born (TNB) and number of teats (NT), are widely included in breeding programs due their importance to the industry. As opposite to most association studies that consider continuous phenotypes under Gaussian assumptions, these traits are characterized as discrete variable, which could potentially follow other distributions, such as the Poisson. In addition, even though many genome wide association studies (GWAS) have been performed, only a few studies have explored biological meanings of genes identified. The present study provided a rich information resource about genes identified using genome wide association approaches for reproductive traits. The distribution analyses in genomic models, highlighted the importance in consider counting models for SB. Moreover, different sets of relevant SNPs and QTL blocks across and within the studies were identified leading to the possibility of different set of genes playing biological roles related to a single complex trait. Thereby, we highlighted the genomic diversity across population/environments to be observed in breeding programs in such a way that population/environments specific reference populations might be considered in genomic analyses. Based on these results, we demonstrated the importance of post-GWAS analyses increasing the biological understanding of relevant genes for complex traits.

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