Orientador: Mário Luiz Teixeira de Moraes / Banca: Alexandre Magno Sebbenn / Banca: Enes Furlani Junior / Banca: Carla Renata Silva Baleroni guerra / Banca: Daniela Silvia de Oliveira Canuto / Resumo: A crise do petróleo das últimas décadas, aliada à necessidade de desenvolvimento das economias com o consequente aumento da demanda por combustíveis e a crescente preocupação com o meio ambiente, revitalizou a busca por fontes alternativas de energia no Brasil e no mundo. No capítulo I é apresentado o pequi (Caryocar brasiliense Camb.) , é uma das espécies das quais podem ser extraídos óleos para produção de biodiesel, produzido a partir de óleos vegetais, passou a ser fonte mais amplamente discutida, porém devido ao avanço das fronteiras agrícolas, os remanescentes desta espécie, símbolo do Cerrado, encontra-se em extinta em muitas regiões do Brasil. Diante disto, os objetivos deste estudo foram investigar por marcadores microssatélites o sistema de reprodução em amostras de progênies de polinização aberta de duas populações de C. brasiliense, uma localizada no interior de um talhão de eucalipto (POP-TE) e outra em um fragmento florestal que constitui a Reserva Legal (POP-RL), da Fazenda Curucaca, visando o melhoramento genético desta espécie que pode ser utilizada na produção de biodiesel. Assim, em termos gerais, os resultados obtidos demonstram que o isolamento espacial do fragmento da Reserva legal das árvores isoladas no interior do Talhão de Eucalipto pode aumentar a endogamia nas futuras gerações. No capítulo II, apresenta-se o pinhão-manso (Jatropha curcas L.), no qual ganha destaque no Programa nacional de Produção e Uso do Biodiesel criado pelo governo brasileiro. O pinhão-manso possui alto teor e qualidade de óleo presente em suas sementes para a produção do biodiesel. Porém, existe pouca informação disponível em relação à base genética e ao cultivo de J. curcas. Assim, o trabalho apresentado tem como objetivo avaliar, por meio de marcadores microssatélites, a diversidade genética e o sistema de reprodução em uma população de J. curcas, que formam uma população base, que ... / Abstract: The oil crisis in decades, coupled with the need for development of the economies and the consequent increase in demand for fuel and the growing concern for the environment, has revitalized the search for alternative energy sources in Brazil and worldwide. In Chapter I Pequi (Caryocar brasiliense Camb.) Is presented, is a species of which oils to produce biodiesel, produced from vegetable oils, can be extracted became more widely discussed source, however due to the advancement of the frontiers farm, the remnants of this species, symbol of the Cerrado, is in extinct in many regions of Brazil. Given this, the objectives of this study were to investigate microsatellite markers for the playback system in samples of open-pollinated progenies of two populations of C. brasiliense, one located within a stand of eucalyptus (POP-TE) and another in a fragment forest which is the legal (POP-RL) Reserve, Treasury Curucaca, targeting the genetic improvement of this species that can be used to produce biodiesel. Thus, in general, the results show that spatial isolation of the fragment cool reservation of individual trees inside the stand Eucalyptus inbreeding can increase in future generations. In Chapter II, we present the jatropha (Jatropha curcas L.), which is highlighted in the National Program for Production and Use of Biodiesel created by the Brazilian government. The jatropha has high content and quality of this oil in its seeds for biodiesel production. However, little information is available regarding the genetic basis and the cultivation of J. curcas. Thus, the work presented is to evaluate, using microsatellite markers, genetic diversity and the mating system in a population of J. curcas, which form a base population, which can provide support for a genetic improvement program, this species, in the pocket-South Mato Grosso region. Thus, the presence of genetic diversity and the high rate of unrelated individuals, despite high rates of ... / Doutor

Orientador: Sandra Helena Unêda-Trevisoli / Coorientador: Antonio Orlando Di Mauro / Banca: Cibele Chalita Martins / Banca: Andréia da Silva Meyer / Banca: Viviane Formice Vianna / Banca: José Baldin Pinheiro / Resumo: A soja vem assumindo importância crescente em áreas canavieiras do Estado de São Paulo, como opção para cultivo em áreas de rotação/sucessão da cana-de-açúcar e para isso, faz-se necessário que o cultivar de soja possua ciclo curto, além de bons atributos agronômicos e alto teor de óleo visando a produção de biodiesel. O objetivo de presente trabalho foi a detecção e mapeamento de QTL's associados aos conteúdos de óleo na soja, em populações F2 derivadas do cruzamento entre linhagens precoces e adaptadas ao sistema de rotação cana-soja (baixo teor de óleo) e genótipos não adaptados a este sistema (alto teor de óleo), visando a utilização de tais QTL's no processo seletivo de populações segregantes. Além disso, objetivou-se ainda a construção de uma curva de calibração para ser utilizada em leituras de teor de óleo por espectroscopia do infravermelho próximo (NIR), em programas de melhoramento de soja. O mapeamento de QTL's foi realizado por marcadores microssatélites (SSR) em população segregante de soja F2 proveniente do cruzamento bi-parental entre a Linhagem 69 (baixo teor de óleo) e o cultivar Tucunaré (alto teor de óleo), onde as leituras de teor de óleo das progênies foram obtidas por NIR. Os modelos de espectroscopia utilizados apresentaram coeficientes de correlação e os erros quadrático médio (RMSEC) respectivamente, de 76% e 0,33 para umidade e 57% e 1,27 para óleo, indicando a viabilidade da metodologia NIR para predição dos parâmetros de umidade e teor de óleo em sementes de soja. Foram detectados dois QTLs associados ao conteúdo de óleo, nos grupos de ligação K e H. A variação fenotípica explicada pelos QTL variou de 7,8% a 46,75%, para o conteúdo de óleo. Foram detectados novos QTL associados ao conteúdo de óleo, divergindo daqueles previamente relatados em outros estudos / Abstract: Soy has become increasingly important in sugarcane areas of São Paulo, as an option for cultivation in areas of rotation / succession of cane sugar and for this, it is necessary that the soybean cultivar has a short cycle, as well as good agronomic traits and high oil content in order to produce biodiesel. The aim of this study was the detection and QTL mapping associated with the soybean oil content in F2 populations derived from the cross between early lines and adapted to cane soybean rotation system (low oil content) and genotypes not adapted to this system (high oil content), to the use of such QTL in the selection of segregating populations. In addition, aimed to further the construction of a calibration curve for use in oil content readings by near infrared spectroscopy (NIR) in soybean breeding programs. The QTL mapping was performed by microsatellite markers (SSR) in segregating population from F2 soybean bi-parental cross between Line 69 (low) oil and cultivar Tucunaré (high oil content), where the content of readings oil progenies were obtained by NIR. The models used spectroscopy showed correlation coefficients and root mean square errors (RMSEC) respectively, and 0.33 to 76% moisture and 57% oil and 1.27 for indicating the feasibility of NIR method for predicting the moisture parameters and oil content in soybean seeds. Two QTLs were detected associated with the oil content in linking groups K and H. The phenotypic variation explained by QTLs varied from 7.8% to 46.75%, for oil content. New QTL was associated with the oil content, unlike those previously reported in other studies / Doutor

Orientador: Alexandre Magno Sebbenn / Banca: Mário Luiz Teixeira de Moraes / Banca: Daniela Sílvia de Oliveira Canuto / Resumo: Em programas de melhoramento florestal a seleção de espécies e procedências dentro das melhores espécies são os dois mais importantes passos, pois são nestas fases que os maiores ganhos genético são capitalizados. Isso é feito utilizando-se teste de espécies e procedências, estabelecidos nos locais de interesse e avaliando-se caracteres de crescimento e sobrevivência. Este trabalho teve como por objetivo a seleção de espécies e procedências de Pinus para a região de Assis, estado de São Paulo. O teste de espécie e procedências foi instalado na Floresta Estadual de Assis, na região oeste do estado de São Paulo. O delineamento experimental utilizado foi o de blocos casualizados, com três tratamentos representado as espécies (Pinus oocarpa, P. maximinoi e P. tecunumanii) e duas a três procedências, quatro repetições (blocos) e parcelas quadradas com 49 plantas (7 x 7), obedecendo o espaçamento de 3 x 2,5 m. Aos 21 anos após o plantio foram mensurados os caracteres diâmetro a altura do peito (DAP), altura total (ALT), volume real individual (VOL) e a taxa de sobrevivência (SOB). Diferenças significativas entre as espécies foram detectadas apenas para o caractere SOB, indicando a possibilidade de seleção entre espécies. A divergência genética entre espécies variou entre os caracteres de zero a 0,4326, indicando que a maior parte da variabilidade genética para os caracteres se encontra distribuída dentro das espécies e que as diferenças genéticas entre as espécies para ALT, VOL e SOB são maiores do que as diferenças entre as procedências estudadas. Embora não há diferenças significativas, comparando a média dos caracteres entre as espécies, P. oocarpa apresentou os maiores valores para os caracteres ALT, VOL e SOBRE e P. maximinoi o maior crescimento em DAP. Foram observadas correlações fenotípicas significativas, positivas e altas entre os caracteres ... / Abstract: In forest breeding programs the selection of species and provenances of the best species are the two most important steps because in these steps the largest genetic gains are capitalized . This is done by using species and provenance test established in the sites of interest and evaluating growth and survival traits. This work aimed the selection of species and provenances of Pinus species for the region of Assis, state of São Paulo. The test was installed in Assis State Forest, in the western region of São Paulo. The experimental design was a randomized complete block design with three treatments represented species (Pinus oocarpa, P. maximinoi and P; tecunumanii) and two to three provenances, represented the provenances within species, four replications (blocks) and square plots with 49 plants (7 x 7), in a spacing of 3 x 2.5 m. After 21 years of planting, were measured the diameter at breast height (DBH), total height (ALT), individual real volume (VOL) and the survival rate (SOB) in the trial. Significant differences among species were detected only for SOB, indicating the possibility of selection among species. The genetic divergence between species varied between zero to 0.4326, which indicates that most of genetic variability for the traits is distributed within species and that the genetic differences between species for ALT, VOL and SOBRE are more salient than the difference between the provenances studied. Although no significant differences comparing the average of traits among species, P. oocarpa showed the highest values for ALT; VOL and SOB and P. maximinoi the highest growth in DBH. Significant positive correlations were observed between the DAPxALT (0,403; p<0,05), DAPxVOL (0,792; p<0,01), ALTxVOL (0,874; p<0,01). Thus, there is the possibility to select individuals of three species based on phenotypic observations in a trait and indirectly change the average phenotypic of other ... / Mestre

Orientador: Rinaldo Cesar de Paula / Banca: Gustavo Vitti Moro / Banca: Mario Luiz Teixeira de Moraes / Resumo: Os objetivos deste trabalho foram determinar o número ideal de repetições, de plantas por parcela e de avaliações para características de crescimento e a viabilidade do uso da seleção precoce em testes clonais de eucalipto, com vistas a inferir de maneira fidedigna sobre o valor real do indivíduo no ambiente que o mesmo se encontra, permitindo assim, precisão nas estimativas de parâmetros genéticos e ganhos com a seleção precoce. Foram utilizados dados de três testes clonais de híbridos de eucalipto, avaliando-se o diâmetro à altura do peito (DAP), altura e volume comercial sem casca. O delineamento experimental utilizado para os três testes clonais foi o de blocos casualizados com seis repetições, dois testes com 30 clones e um com dez clones, com parcelas de seis ou 10 plantas. Para todas as características foram estimados o coeficiente de repetibilidade, o número ideal de repetições, de plantas por parcela e avaliações para inferir sobre o valor real do indivíduo e ganhos genéticos para a característica volume na idade adulta (72 meses) com a seleção precoce de indivíduos. Testes clonais de eucalipto, visando o melhoramento no curto prazo, cujo objetivo da seleção é maximizar o ganho na geração atual para as três características avaliadas neste trabalho (diâmetro, altura e volume) simultaneamente, necessitam de 3 repetições com 6 plantas por parcela e avaliada em três idades para uma acurácia seletiva em torno de 90%. A seleção de indivíduos superiores nas idades juvenis (acima de dois anos), em testes clonais de eucalipto, possibilita ganhos genéticos na idade adulta, sendo vantajoso principalmente a seleção para o caráter diâmetro a altura do peito (DAP), para se obter ganhos futura e indiretamente para o caráter volume / Abstract: The objectives of this study were to determine the optimal number of replications of plants per plot and the number of evaluations for growth traits and the viability of early selection in eucalyptus clonal tests, in order to infer reliably on the actual value of the individual the environment that it is, thus allowing precision in estimates of genetic parameters and selection gains. The data of three eucalyptus hybrid clonal tests, evaluating the diameter at breast height (DBH), height and wood commercial volume. The experimental design for the three clonal tests was randomized blocks with six replications, two tests with 30 clones and one with ten clones, with six or ten plants per plot. For full features were estimated the repeatability coefficient, the optimal number of replications of plants per plot and evaluations to infer about the real value of the individual and genetic gains for the characteristic volume in adulthood (72 months) with the early selection of individuals. Eucalyptus clonal tests, intended to improve in the short term, the objective of selection is to maximize the gain in the current generation for both traits in this work (diameter, height and volume) both require 3 replications with 6 plants per plot and evaluated in three ages for a selective accuracy around 90%. The selection of superior individuals in juvenile ages (over two years) in eucalypt clonal tests allows genetic gain in rotation age, being advantageous especially selection for diameter at breast height (DBH) to obtain future gains and indirectly to the volume character / Mestre

Orientador: Sandra Helena Unêda-Trevisoli / Banca: Ivana Marino Bárbaro / Banca: Rogério Farinelli / Banca: Rinaldo Cesar de Paula / Banca: Andréia da Silva Meyer / Resumo: A soja é considerada uma cultura de grande importância econômica, devido ao fato de ser a oleaginosa mais consumida no mundo. O crescimento da produção de soja no Brasil, se deve, principalmente, aos esforços dos programas de melhoramento genético de plantas. A eficiência na seleção dependerá, portanto, do ganho genético e dos métodos de melhoramento adotados para a condução das populações por ocasião da avaliação das famílias. De acordo com a conveniência do melhorista, algumas modificações podem ser efetuadas nos métodos tradicionais de condução das populações segregantes. Neste contexto, o método bulk com seleção em F3 é uma alternativa. Além disso, as técnicas univariadas e multivariadas de análises de dados podem acelerar o progresso do melhoramento genético da soja, devido à possibilidade de predição de ganhos e a aplicação de metodologias eficientes que auxiliam na seleção de genótipos promissores. Devido à escassez de estudos que comprovam a eficiência do método bulk com seleção em F3 em soja, objetivou-se com o presente trabalho avaliar a eficiência do método bulk com seleção em F3 em relação ao método tradicional bulk, para características de interesse agronômico no melhoramento genético da soja, visando comparar qual estratégia de condução é mais eficiente em termos de ganho genético, bem como selecionar as famílias superiores por meio de análises univariada e multivariada. Para a realização do trabalho foram utilizadas 20 populações segregantes, conduzidas por dois métodos, bulk com seleção em F3 (bulkF3) e bulk, as quais originaram as respectivas famílias nas gerações F3, F4 e F5. Foram selecionadas 60 melhores famílias de cada método, de acordo com a performance média agronômica. Foram avaliadas as seguintes características agronômicas: altura da inserção da primeira vagem (AIV), altura da planta na maturidade (APM), número de ramos (NR), número... / Abstract: Soybean crop is considered a culture of great economic importance, due to the fact that this crop is the most consumed oilseed in the world. The improvement in the Brazilian soybean production is mostly due to the effort of plant breeding programs. Therefore, the efficiency of selection will depend on the genetic gain and on the breeding methods adopted to conduct the populations on the occasion of progenies evaluation. According to the breeder convenience, some modifications may be made on the traditional methods for conducting the segregating populations. Within this context, the bulk method with selection on F3 is an alternative. Furthermore, the univariate and multivariate techniques of data analyses may improve the soybean breeding progress, due to the possibility to predict the genetic gain and to applicate efficient methodologies which may assist to select promising genotypes. Due to the few numbers of studies that show the efficiency of bulk method with selection in F3, the aim of this study was to evaluate the efficiency of bulk method with selection in F3 in comparison to the traditional bulk method, for traits of agronomic interest in soybean, seeking to compare which conducting strategy is more efficient in terms of genetic gain, as well to select superior families using univariate and multivariate analyses. For conducting the study, 20 segregating populations were used and conducted by two methods, bulk and bulk with selection in F3 (bulkF3), which originated its families in generations F3, F4 and F5.The 60 best families were selected within each method, according to their agronomic performance. The following traits were evaluated: height of the first hull (HFH), plant height at maturity (PHM), number of hulls per plant (NHP), number of branches per plant (NBP), hundred seeds weight (HSW) and grains yield (GY). The two methods were compared by the estimated genetic components, the predicted genetic gain and the predicted ... / Doutor

Orientador: Gustavo Vitti Môro / Banca: Rinaldo Cesar de Paula / Banca: Marcelo Marchi Costa / Resumo: A descoberta da heterose proporcionou o desenvolvimento de híbridos de milho altamente produtivos. Entretanto, questionamentos são levantados com relação à eficiência de testadores para a seleção de linhagens superiores. Assim, este trabalho teve por objetivo estimar a capacidade de combinação de genótipos utilizando testadores de diferentes origens e a aplicação dessa informação para seleção de genótipos superiores. O ensaio foi conduzido na safra 2012/2013 na área experimental da Fazenda de Ensino, Pesquisa e Extensão (FEPE) da Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias da UNESP, câmpus de Jaboticabal - SP. O experimento constou de seis testadores que foram cruzados em esquema topcross com uma população de 39 genótipos de milho. Esses topcrosses foram avaliados, para a produtividade de grãos (kg·ha-1), em delineamento experimental de blocos ao acaso com duas repetições para cada tratamento. Os dados obtidos foram submetidos à análise de variância e estimadas as capacidades de combinação dos 39 genótipos. Em seguida, realizou-se a correlação para verificar o nível de semelhança entre os topcrosses dos diferentes testadores. Também foi utilizado o método REML/BLUP, para comparação com os dados das capacidades de combinação. Concluiu-se que as informações da capacidade de combinação e REML/BLUP podem ser utilizadas para a seleção de genótipos de milho. A associação entre as informações das capacidades de combinação e dos BLUPs variou em função do testador utilizado, mas, de forma geral, apresentaram valores elevados. As metodologias de capacidade de combinação e REML/BLUP podem ser utilizadas de forma alternativa para comparar um testador, mas, serão complementares quando o objetivo for comparar mais de um testador. Embora correlações significativas tenham sido encontradas entre os testadores, as estimativas são de baixa magnitude, não sendo suficientes para descartar... / Abstract: The heterosis discovery enabled the development of highly productive corn hybrids. However, some questions about the efficiency of testers for selection of superior lines are found. This work aims to study the combining ability of testers from different genetic structures with a population of inbred lines. The trial was conducted in 2012/2013 in the experimental area of Fazenda de Ensino, Pesquisa e Extensão (FEPE) of Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias da UNESP, Jaboticabal - SP. The experiment consisted of six different testers that were crossed in topcross scheme with a population of 39 maize genotypes. These topcrosses were evaluated in experimental design of randomized blocks with two replications for each treatment. The agronomic trait evaluated was grain yield obtained by the average grain weight of the portions of each topcross. Data were subjected to variance analysis. With the averages for the different testers, the combining abilities of the 39 genotypes were estimated. Then the data were subjected to correlation analysis to check the level of similarity between the testers. Data were also subjected to analysis by REML/BLUP method and compared with data from the combining abilities. It was concluded that the combination ability information and REML/BLUP can be used for selecting maize genotypes. The association between the information of the combining ability and BLUP varied depending on the tester used, but, in general, showed high values. The combining ability and REML/BLUP can be used alternatively to compare a tester, but, they will be complementary when the objective is to compare more than one tester. Significant correlations were found between the testers, but the estimates are low magnitude, thus, this is not sufficient to exclude the combining ability, even with related testers. The testers classified differently the genotypes and could be necessary to use more than one tester for greater efficiency ... / Mestre

Orientador: Fabíola Vitti Môro / Coorientador: Gustavo Vitti Môro / Banca: Andreia da Silva Meyer / Banca: Eduardo Custódio Gasparino / Banca: João Antônio da Costa Andrade / Banca: Juliana Lischka Sampaio Mayer / Resumo: Aspectos agronômicos como produtividade, estatura da planta, altura de inserção da espiga, suscetibilidade ao acamamento e quebramento do colmo apresentam herança quantitativa, sendo altamente influenciados pelo ambiente, o que dificulta a obtenção de genótipos superiores através da seleção direta desses caracteres. Já as estruturas anatômicas são mais estáveis e a sua avaliação, além de simples e de baixo custo, pode ser feita em estágios precoces da planta, diferente dos aspectos agronômicos que há necessidade de espera para que sejam expressos e assim avaliados. Sendo assim objetivou-se identificar a existência de associações entre os caracteres anatômicos da raiz, colmo e folha, e agronômicos em variedades de milho. Foram realizados estudos de parâmetros genéticos, correlação genotípica, correlação canônica, análise de fatores e de trilha através dos caracteres agronômicos (altura da planta, altura de inserção da espiga, posição relativa da espiga, acamamento, quebramento de planta e produtividade de grãos), anatômicos da raiz (área total da raiz, área do cilindro central, espessura da epiderme, espessura da exoderme, espessura do parênquima cortical, espessura da endoderme, número de vasos do metaxilema, área do floema, espessura do córtex e área do metaxilema), do colmo (área média do xilema, área média do floema, área média dos feixes vasculares e o números de feixes vasculares) e da folha (espessura das células buliformes, espessura da epiderme adaxial, espessura da epiderme abaxial, espessura do mesofilo, área do xilema, área do floema, área do esclerênquima, área média dos feixes vasculares). No estudo de associações entre os caracteres anatômicos da raiz e agronômicos observou-se através da análise da correlação canônica a existência de relação entre a altura de planta e os caracteres anatômicos área total da raiz, área do cilindro central, espessura... / Abstract: Agronomic aspects such as productivity, plant height, the ear height, susceptibility to lodging and stem breakage have quantitative inheritance, being highly influenced by the environment, making it difficult to obtain superior genotypes through direct selection of these characters. The anatomical structures are more stable and their assessment, beyond simple and low cost, can be held in the early stages of the plant, different from the agronomic aspects that need to wait for it to be expressed and evaluated. Therefore, the objective of this work was to identify the associations between the anatomical characteristics of root, stem and leaf, and agronomic in maize varieties. Studies of genetic parameters, genotypic correlation, canonical correlation, factors analysis and path analysis across the agronomic characters (plant height, ear height, ear placement, lodging, plant breakage and grain yield), anatomic root (total área of root, central cylinder area, epidermal thickness, exodermis thickness, cortical parenchyma thickness, endoderm thickness, number of metaxylem vessels, phloem area, cortex thickness and metaxylem area), the stem (average area of xylem, average area of phloem, average area of vascular bundles and number of vascular bundles) and the leaf (bulliform cells thickness, adaxial epidermis thickness, abaxial epidermis thickness, mesophyll thickness, xylem area, phloem area, sclerenchyma area, average area of vascular bundles) were performed. In the study of associations between the anatomical characters of root and agronomic observed through the canonical correlation analysis the existence of relationship between plant height and anatomical characters total area of root, central cylinder area, cortex thickness and cortical parenchyma thickness. In the study of associations between the anatomical characters of stem and agronomic, based on factors analysis, strong association between number of vascular bundles, plant height ... / Doutor

Orientador: Luciana Rossini Pinto / Coorientador: Maximiliano Salles Scarpari / Banca: Michael dos Santos Brito / Banca: Elisson Antônio da Costa Romanel / Banca: Maria Inês Tiraboschi Ferro / Banca: Miguel Angelo Mutton / Resumo: Com o intuito de aumentar o conhecimento da rede gênica envolvida no controle do florescimento em cana-de-açúcar, diferentes cultivares de cana-de-açúcar foram submetidos a tratamentos fotoperiódicos de indução e não indução do florescimento em câmara de fotoperíodo. Aos 5, 10 e 20 dias de indução, a folha +1 e a bainha foliar foram coletadas para a identificação de fragmentos diferencialmente expressos (FDEs) por meio da técnica de cDNA-AFLP entre e dentro dos tratamentos fotoperiódicos. Um total de 162 fragmentos foram selecionados e reamplificados. Destes, 63 FDEs tiveram sucesso na reação de reamplificação e foram clonados e sequenciados. As sequências foram confrontadas com seis bancos de sequências: 1. Transcritos do projeto SUCEST ;2. Proteínas do genoma de sorgo; 3. BAC de cana-de-açúcar; 4. Proteínas do genoma de arroz, 5. Proteínas presentes no Phytozome e 6. NCBI. A busca por similaridade se deu pelo uso da ferramenta BLASTn (e-value 1e-5) nos casos do banco SUCEST e dos BACs de cana-de-açúcar e BLASTx (e-value 1e-5) para os demais bancos. Dentre os 63 FDEs, 23 corresponderam a sequências de genes enquanto os outros 40 representam sequências que não estão depositadas nestes bancos (no hits). A maioria das 23 sequencias apresenta similaridade com genes que codificam proteínas hipotéticas ou preditas em diversos organismos. Com base na análise do domínio da proteína realizada pelo Pfam, seis sequências podem estar associadas ao metabolismo da indução do florescimento. Dentre estas as sequencias LM-19, LM-40 e LM-53 se destacaram. A LM-19 possui similaridade com o gene que codifica uma proteína com o domínio DNAJ sendo que proteína com este domínio é considerada mediador da integração dos sinais do florescimento em Arabidopsis thaliana. LM-40 possui similaridade com o gene que codifica proteína de domínio (F-BOX); estudos indicam forte... / Abstract: In order to increase the knowledge of the gene network involved in sugarcane flowering induction, sugarcane cultivars were submitted to different photoperiod treatments of flowering induction and non-induction in a photoperiod facility. At 5, 10 and 20 days of induction, the +1 leaf and the leaf sheath were collected for the identification of different transcript-derived fragments (TDFs) within and between the photoperiod treatments to apply the cDNA-AFLP technique. A total of 162 TDFs were selected and re-amplified. Of these, 63 TDFs were successful in re-amplification and were cloned and sequenced. The sequences were confronted against 6 sequence databanks (SUCEST transcripts; Sorghum genome proteins; Sugarcane BACs; proteins from rice genome; Phytozome and NCBI). Similarity search was done by using the BLASTn (e-value 1e-5) tool for the SUCEST databank and sugarcane BACs while BLASTx (e-value 1e-5) was use for the other banks. Among the 63 TDFs, 23 corresponded to gene sequences while the remaining 40 represent sequences that are not deposited in these banks (no hits). The majority of the 23 sequences showed similarity with genes coding for hypothetical or predicted proteins of different organisms. Based on the protein domain analysis conducted by Pfam, six sequences may be associated with flowering induction metabolism. Among these: LM-19, LM-40 and LM-53 sequences stood out. LM-19 has similarity to the gene encoding a protein with DnaJ domain. Proteins having this domain are considered as an integrating floral signals mediator in Arabidopsis thaliana. LM-40 has similarity to the gene encoding a protein with (F-BOX) domain. This domain has a strong relationship in flowering induction processes. LM-53 has one of the predicted protein domain similar to the domain of the protein encoded by the CONSTANS gene which governs the expression of FLOWERING LOCUS T (FT), this later one encodes the florigen / Doutor

Orientador: Leila Trevisan Braz / Resumo: O míldio da alface, causado por Bremia lactucae, é uma das doenças mais importantes dessa cultura, causando inúmeros prejuízos. O surgimento de novas raças torna seu controle desafio constante para os melhoristas de alface, devido à necessidade de sempre buscar novos genes de resistência para o controle da doença. O objetivo deste trabalho foi monitorar as raças de B. lactucae presentes em regiões produtoras de alface do estado de São Paulo, no ano de 2014, e avaliar a sua distribuição no período de 2003 a 2014, a fim de dar suporte ao programa de melhoramento genético de alface da UNESP - FCAV. Amostras de folhas com sintomas de B. lactucae foram coletadas em regiões produtoras do estado de São Paulo, a partir das quais os esporângios foram multiplicados na cultivar Solaris, para então iniciar a fase de diferenciação das raças. A avaliação das diferenciadoras foi realizada quando houve esporulação na cultivar suscetível Green Towers, sendo atribuídos sinais +, (+), - e (-), de acordo com a esporulação observada. Já em relação à distribuição de B. lactucae no período de 2003 a 2014, foi realizado o levantamento da frequências das raças e dos fatores de virulência identificados nesse período. Em 2014, encontraram-se seis raças: SPBl:13, SPBl:14, SPBl:15, SPBl:16, Bl:21 e SPBl:01. No total, foram identificadas 17 raças no estado de São Paulo, entre 2003 e 2014, nos 33 municípios avaliados. A SPBl:01, ocorreu em 35% dos 514 isolados avaliados. Dos 19 fatores de virulência avalia... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The downy mildew of lettuce caused by Bremia lactucae is one of the most important diseases of this crop, causing major damage during the winter season. The occurrence of new races is a constant challenge for lettuce breeders, due the need of always search for new resistance genes for genetic disease control. The aim of this study was to survey the B. lactucae races, in lettuce producing regions in Sao Paulo State in 2014, and its distribution from 2003 to 2014, to support the lettuce genetic breeding program of the UNESP - FCAV. Leaf samples containing symptoms of B. lactucae were collected from producing regions of Sao Paulo State, from which the sporangia were multiplied in Solaris cultivar, and thereafter it was started the stage of races differentiation. The assessment was performed when the differentiating susceptible cultivar Green Towers showed sporulation, being attributed the signs +, (+) - and (-), according to sporulation observed. To assess the distribution of B. lactucae from 2003 to 2014, it was performed a study of the frequency of the races and virulence factors identified in this period. In 2014, it was found six races - SPBl:13, SPBl:14, SPBl:15, SPBl:16, Bl:21 e SPBl:01. In total, 17 races were identified in Sao Paulo State between 2003 and 2014, in 33 municipalities assessed. The race SPBl:01 occurred in 35% of the 514 isolates tested. From the 19 virulence factors assessed, the ones that did not occur in the population of B. lactucae, in Sao Paulo state,... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Orientador: Gustavo Vitti Môro / Banca: Sandra Helena Unêda Trevisoli / Banca: Ivana Marino Barbaro / Resumo: Nos programas de melhoramento de milho, a avaliação das linhagens em cruzamentos é uma etapa de alto custo, sendo que o uso e a escolha dos testadores mais adequados podem reduzir a demanda de recursos. Assim, o objetivo desse trabalho foi utilizar a abordagem REML/BLUP de modelos mistos para predição de valores genotípicos de topcrosses, combinando testadores com estruturas genéticas diversificadas. Foram avaliados 234 topcrosses (39 linhagens x 6 testadores), no ano agrícola 2012/13, no delineamento experimental de blocos ao acaso para o caráter produtividade de grãos de milho (t ha-1), altura de plantas (cm) e acamamento e quebramento de plantas (%). Foram realizadas análises de variância e, com as médias fenotípicas dos topcrosses, obteve-se os valores dos BLUPs considerando diferentes níveis de eliminação de testadores. Para verificar a eficiência dos BLUPs foram estimadas as correlações entre as médias fenotípicas e os valores genotípicos preditos com diferentes números e combinação de testadores, bem como os coeficientes de determinação, a coincidência no ordenamento dos topcrosses para seleção e descarte, com 10 e 20% de intensidade, e classificações dos topcrosses quanto à média fenotípica. O método de REML/BLUP se mostra adequado na predição dos valores genotípicos dos topcrosses nas situações com todos os testadores e com diferentes níveis de eliminação de testadores, com resultados variados em função das diversas combinações obtidas, para todos os caracteres avali... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: In maize breeding programs the evaluation of lines at crosses is a costly step, and the use and the choice of the most appropriate testers can reduce the demand for resources. The objective of this work was to use the REML/BLUP approach of mixed models to predict genotypic values of topcrosses using testers with diverse genetic structures. Were evaluated 234 topcrosses (39 lines x 6 testers) in the agricultural year of 2012/13, under the experimental design of randomized blocks for the traits as grain yield (t ha-1 ), plant height (cm) and lodging and breakage of plants (%). Analyses of variance were conducted, and with the phenotypic means of topcrosses were obtained BLUPs values considering different levels of elimination of the testers. In order to check the efficiency of BLUPs, the correlations were estimated between the average phenotypic and the genotypic predicted values with different numbers and combination of the testers, as well as the coefficients of determination, the coincidence in the ranking of topcrosses for selection and discard, with 10 and 20% of intensity, and the classification of the topcrosses as to the phenotypic average. The method of REML/BLUP shown adequate to predict the genotypic values of topcrosses in situations with all testers and with different levels of testers elimination, with varying results depending on the various combinations obtained for all traits. Is possible to set a standard as to the origin and genetic structure of the most reco... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre