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Uso de modelos de regressão aleatória na análise de dados longitudinais no melhoramento genético vegetal / Use of random regression models in longitudinal analysis data in genetic plant breeding

Araújo, Simone Inoe 20 May 2005 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-06-05T18:48:36Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 607753 bytes, checksum: 6c910f242adb58351c752e924cd83694 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-05T18:48:36Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 607753 bytes, checksum: 6c910f242adb58351c752e924cd83694 (MD5) Previous issue date: 2005-05-20 / Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado de Minas Gerais / Os objetivos deste estudo foram analisar, via simulação de dados, o efeito de diferentes pressuposições quanto à variância dos efeitos ambientais, frente a dados com determinada estrutura de variâncias, e verificar o comportamento de diferentes estratégias de análise frente ao desbalanceamento dos dados. Foram simulados dados referentes a um teste de progênie, do cruzamento de 30 progenitores masculinos com três genitores femininos diferentes cada um, onde cada cruzamento deu origem a dez indivíduos, distribuídos em três locais diferentes. O efeito fixo de local foi gerado de forma a não apresentar diferenças estatísticas significativas. Para cada indivíduo da prole foram geradas informações fenotípicas em cinco idades diferentes. Portanto, o arquivo de dados consistiu de 1020 indivíduos no total, sendo que 900 indivíduos apresentaram registros nas cinco idades, totalizando 4500 registros de produção. Para estudar o efeito da heterogeneidade das variâncias ambientais, em modelos de regressão aleatória adotou-se, modelos que ajustaram uma função polinomial de segundo grau para o efeito genético aditivo e de ambiente permanente e que ajustaram uma função polinomial apenas para o efeito genético aditivo foram analisados, considerando-se ou não a heterogeneidade da variância do efeito de ambiente temporário, gerando-se assim, quatro diferentes modelos de regressão aleatória. Além disso, os modelos de regressão aleatória, repetibilidade e multi-característica foram avaliados sob diferentes níveis de desbalanceamento dos dados. O modelo de regressão aleatória mais adequado foi aquele que considerou a heterogeneidade de variâncias dos efeitos de ambiente permanente e temporário. Assumir pressuposições incorretas sobre a estrutura de covariância dos efeitos aleatórios do modelo conduziu à alterações nas estimativas de componentes de covariância e nas estimativas dos parâmetros genéticos. Sob desbalanceamento sem seleção, todos os modelos apresentaram estimativas de herdabilidade bastante semelhantes aos resultados obtidos quando se considerou o conjunto de dados completos. Entretanto, quando se considerou o efeito da seleção, modelos de regressão aleatória com até 10% de desbalanceamento não promoveram alterações nas estimativas de componentes de variância. / The aim of this study was to analyze the effect of assuming different assumptions about environmental variance effects to data with certain variance structure, and verify genetic parameters estimates in different analysis strategies behind unbalanced data. A progeny test data was simulated, by crossing 30 male with three different female, where each crossing originated ten individuals, distributed in three different places. The fixed effect of place was generated in order not to present significant statistical difference. For each individual offspring, phenotypic information were generated in five different ages. Then, the data consisted in a total of 1020 individuals, in what 900 of them presented information in the five ages, computing 4500 observations of production. To verify the importance of consider or not the environmental heterogeneity of variance, in random regression models, models that adjusted a second polynomial function both for the additive genetic as for the permanent environmental effect and adjusted a polynomial function only for the additive genetic effect were analyzed, considering or not the variance heterogeneity of the temporary environmental effect, then generating four different random regression models. Moreover, the single-trait random regression model, the repeatability model and the multiple-trait model were analyzed on different lost of information levels. The most adequate random regression model was the one who considered both, the variance heterogeneity of permanent environmental effect, and the temporary environmental effect. Assuming the incorrect assumptions about the covariance structure of random effects of the model, conducted to change in the covariance components estimates and in the genetic ixparameters estimates. With incomplete data, without selection, all the models presented heritability estimates very similar to the results when complete data were considered. However, when effect of selection was considered, random regression models with less or equal to 10% of lost of information didn’t conduct to change in the covariance components estimates.
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Desempenho de progênies de irmãos completos de cajueiro-anão-precoce / Performance of full-sib progenies of early dwarf cashew

Vale, Egnesio Holanda January 2012 (has links)
VALE, Egnesio Holanda. Desempenho de progênies de irmãos completos de cajueiro-anão-precoce. 2012. 67 f. : Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do Ceará, Centro de Ciência Agrárias, Departamento de Fitotecnia, Mestrado em Agronomia / Fitotecnia, Fortaleza-Ce, 2012 / Submitted by Nádja Goes (nmoraissoares@gmail.com) on 2016-08-19T12:56:11Z No. of bitstreams: 1 2012_dis_ehvale.pdf: 1773164 bytes, checksum: ce4f6308d70d8202db183b33aeb205d7 (MD5) / Approved for entry into archive by Nádja Goes (nmoraissoares@gmail.com) on 2016-08-19T12:56:22Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2012_dis_ehvale.pdf: 1773164 bytes, checksum: ce4f6308d70d8202db183b33aeb205d7 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-08-19T12:56:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2012_dis_ehvale.pdf: 1773164 bytes, checksum: ce4f6308d70d8202db183b33aeb205d7 (MD5) Previous issue date: 2012 / A cultura do cajueiro vem passando por um processo acentuado de expansão, tanto em área de cultivo como, principalmente, em nível tecnológico. O programa de melhoramento genético do cajueiro tem grande responsabilidade nesse incremento do cultivo da espécie. Através do melhoramento genético foi possível obter plantas com o porte reduzido, com maior produtividade, indivíduos mais resistentes às principais pragas e doenças do cajueiro, como antracnose e mofo preto, e com maior qualidade agroindustrial, apresentando maior tamanho de castanhas e amêndoas. Por ser uma planta perene e predominantemente alógama, o cajueiro possui grande variabilidade genética, o que permite maior possibilidade de sucesso quando se pratica o melhoramento genético com a finalidade de selecionar indivíduos promissores. No entanto, o tempo exigido para a seleção de indivíduos superiores até o seu lançamento como clones comerciais é bastante longo, daí a razão de existir poucos clones à disposição dos produtores de castanha, culminando em uma estreita base genética entre os clones tradicionalmente cultivados. A propagação realizada com base no plantio da semente de cajueiro permite a verificação da segregação genética e expressão da variabilidade genética advinda da fecundação cruzada, que representa a oportunidade de combinação de alelos favoráveis, permitindo selecionar novos indivíduos superiores, com a finalidade de cloná-los e colocá-los à disposição dos produtores, aumentando as opções de materiais para cultivo e, consequentemente, ampliando a base genética existente. As estimativas de parâmetros genéticos são fundamentalmente importantes, pois auxiliam no entendimento do potencial genético dos indivíduos em avaliação e no conhecimento da variabilidade genética presente na população, indicando a possibilidade de sucesso do programa de melhoramento e auxiliando na formulação das estratégias de trabalho. Objetivou-se com este trabalho estimar os parâmetros genéticos e o desempenho das progênies oriundas de sete cruzamentos de cajueiro irmãos completo avaliados em duas safras 2010 e 2011. O experimento foi instalado em março de 2007 no Campo Experimental de Pacajus pertencente à Embrapa Agroindústria Tropical, localizado no município de Pacajus, no estado do Ceará. Entre os cruzamentos avaliados, o CCP 76 X BRS 226 foi o que apresentou menor desempenho médio da progênie para altura de planta (2,30 m), enquanto a progênie do cruzamento CCP 76 e Embrapa 51 obteve a maior média (2,92 m). Em relação à produtividade de castanha, o cruzamento que mais se destacou foi o CCP76 x Embrapa 51, com a produtividade média de 486,67 kg de castanha por hectare. Para o peso médio da castanha, destacou-se o cruzamento entre BRS 226 x Embrapa 51, apresentando castanhas com 9,70 g. Na avaliação geral, os híbridos que apresentaram melhor desempenho, associando maior número de fenótipos de interesse para a cultura, foram originados dos cruzamentos entre CCP 76 e Embrapa 51, e entre BRS 226 e Embrapa 51, considerando a altura de planta, diâmetro de copa, produtividade e peso de castanha. As herdabilidades médias (h2) de maior magnitude foram apresentadas pelos caracteres altura de planta, diâmetro de copa e peso médio de castanha (59,85%, 27,80% e 85,44%, respectivamente). As correlações positivas (rP e rG) de maior magnitude foram observadas entre a produtividade de castanha e os caracteres altura de planta (0,70), diâmetro de copa (0,65), número de castanhas (0,79) e peso médio de castanha (0,58)
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Divergência genética entre progênies de meios-irmãos de cajueiro anão precoce / Genetic divergence among half-sib progenies precocious dwarf cashew

Frota Júnior, José Itamar January 2012 (has links)
FROTA JUNIOR, José Itamar. Divergência genética entre progênies de meios-irmãos de cajueiro anão precoce. 2012. 106 f. : Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do Ceará, Centro de Ciências, Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia, Rede Nordeste de Tecnologia, Fortaleza-CE, 2012. / Submitted by demia Maia (demiamlm@gmail.com) on 2016-05-24T13:27:22Z No. of bitstreams: 1 2012_tese_jifrotajunior.pdf: 7557129 bytes, checksum: 6c9f0d978e3d8d53df85c9c6cfa07a24 (MD5) / Approved for entry into archive by demia Maia (demiamlm@gmail.com) on 2016-05-24T13:29:08Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2012_tese_jifrotajunior.pdf: 7557129 bytes, checksum: 6c9f0d978e3d8d53df85c9c6cfa07a24 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-05-24T13:29:08Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2012_tese_jifrotajunior.pdf: 7557129 bytes, checksum: 6c9f0d978e3d8d53df85c9c6cfa07a24 (MD5) Previous issue date: 2012 / The present work was developed in order to characterize and evaluate the genetic diversity of dwarf cashew progenies from Embrapa Agroindústria Tropical using molecular and morphological markers as well as the indication of divergent materials to the breeding program. It was used 50 dwarf cashew progenies from Embrapa Agroindústria Tropical collection located in the Experimental Center of Pacajus, Ceará. In the molecular analysis, each progeny was sampled by collecting leaves from two plants per plot and then analyzed at Embrapa´s molecular biology lab. It was performed DNA´s extractions based on CTAB (Cetyltrimethylammonium bromide) method, adapted by Cavalcanti (2004). ISSR´s markers (Inter Simple Sequence Repeat) were used. Jaccard´s coefficient and UPGMA (Unweighted Pair Group Method with Arithmetic Mean) cluster analysis were applied in the group analysis. Cluster analysis allowed the division into fourteen groups of genetic similarity being the most divergent progenies CNPAT 92-56, 92-62 and 92-385, and the most similar ones CNPAT 92-331 and 92-335. Variables such as plant height, diameter, number of nuts and production, were used in the quantitative analysis. Euclidian distance was used in the genetic distance analysis. UPGMA method were used in cluster analysis. The variable with highest relative contribution to genetic divergence was production, with 97,80%. The UPGMA cluster analysis allowed the division into eleven groups. The most divergent material was CNPAT 92-331 coming from Capisa farm in Piauí state. The most similar materials formed the subgroup I of group I, CNPAT 92-54 and 92-58 with 95% similarity. There is genetic variability, however no direct relationship between molecular and quantitative analysis was found / O presente trabalho foi desenvolvido com o objetivo de caracterizar e avaliar a diversidade genética de progênies de meios-irmãos de cajueiro anão precoce da Embrapa Agroindústria Tropical por meio de marcadores moleculares e morfológicos, assim como, a indicação dos materiais divergentes para o programa de melhoramento genético. Foram utilizadas 50 progênies instaladas no Campo Experimental de Pacajus, CE. Na análise molecular, cada progênie foi amostrada coletando-se folhas de duas plantas/parcela e analisadas no laboratório de Biologia Molecular da Embrapa Agroindústria Tropical. Foram realizadas extrações de DNA baseadas no método CTAB (brometo de cetiltrimetilamônio) ajustado por Cavalcanti (2004) e utilizados marcadores do tipo ISSR (Inter Simple Sequence Repeat). Utilizou-se o coeficiente de Jaccard e análise de agrupamento UPGMA (Método de Média Aritmética Não Ponderada) para análise dos grupos. Doze iniciadores ISSR geraram 71 bandas das quais 27 foram polimórficas. A análise de agrupamento permitiu a divisão em quatorze grupos de similaridade genética, onde as progênies mais divergentes foram CNPAT 92-56, CNPAT 92- 62 e CNPAT 92-385 e as mais similares foram CNPAT 92-331 e CNPAT 92-335. Na análise quantitativa foram utilizadas as seguintes variáveis: altura da planta, diâmetro da copa, número de castanhas e produção. Foi utilizada a Distância Euclidiana para análise da distância genética e UPGMA para a análise de agrupamento. A produção foi a variável que obteve maior contribuição relativa para a divergência genética com 97,80%. A análise de agrupamento UPGMA possibilitou a distribuição de 11 grupos. O material mais divergente foi o CNPAT 92-331 oriundo da Fazenda Capisa (Piauí). Os mais similares formaram o subgrupo I do grupo I, CNPAT 92-54 e CNPAT 92-58 com 95% de similaridade. Há variabilidade genética, no entanto não foram encontradas relações diretas entre a análise molecular e a quantitativa
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Herança de características morfológicas e agronômicas do cruzamento intraespecífico entre couve-flor e couve-brócolo

Zatarim, Mariana [UNESP] 15 February 2005 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:25Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2005-02-15Bitstream added on 2014-06-13T20:03:57Z : No. of bitstreams: 1 zatarim_m_dr_botfca.pdf: 715464 bytes, checksum: dbf6d20b9b3a33bda1fe90a7ff22c799 (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Com objetivo de estudar a herança de características morfológicas e agronômicas em populações progenitoras e diferentes gerações obtidas do cruzamento entre couve-flor e couve-brócolo, foram cruzadas a linhagem de couve-flor de verão Piracicaba Precoce com o híbrido de couve-brócolo de cabeça única, denominado Legacy, obtendo-se as gerações F1 e F2, e os retrocruzamentos para ambas as populações progenitoras. Realizaram-se dois experimentos, denominados de outono-inverno e verão-outono, respectivamente, em 2002 e 2004, na Fazenda Experimental São Manuel, pertencente a Faculdade de Ciências Agronômicas, Campus de Botucatu/UNESP, localizada no município de São Manuel/SP. Utilizou-se o delineamento experimental de blocos ao acaso, com quatro repetições. Os seis tratamentos, constituídos da couve-flor linhagem L-8995-5, da couve-brócolo híbrida Legacy, das gerações F1 e F2, e retrocruzamentos para ambos os progenitores, foram plantados em parcelas de 20 plantas. A geração F2 foi representada por quatro parcelas, as gerações de retrocruzamentos por duas parcelas e os progenitores por uma parcela, as quais foram distribuídas ao acaso dentro de cada bloco. O plantio no campo foi realizado em linhas duplas espaçadas de 0,8 m x 1,0 m e 0,7 m entre plantas dentro da fileira. As avaliações foram feitas antes e durante a colheita das inflorescências, individualmente para todas as plantas da parcela, com exceção do número de folhas. As características avaliadas foram: início de formação da inflorescência (número de dias da semeadura até o aparecimento visual da inflorescência), ciclo (número de dias da semeadura à colheita da inflorescência no ponto comercial), altura de planta (medida do nível do solo até o ápice da inflorescência, somente para o experimento de verão-outono), peso da inflorescência, diâmetro da inflorescência... / With objective of studying the inheritance of morphologic and agronomic characteristics in populations progenitors and different generations obtained of crossing among cauliflower and broccoli, the lineage of summer cauliflower Precocious Piracicaba with the hybrid of broccoli unique head, denominated Legacy were crossed being obtained the generations F1 and F2, and the recrossing for both progenitors populations . Two experiments were accomplished denominated of fall-winter and summer-fall, respectively, in 2002 and 2004, in the São Manuel Experimental Farm, belonging to the Agronomic Science College, Campus of Botucatu/UNESP, located in the municipal district of São Manuel/SP. The randomized blocks design was used with four replications. The six treatments, constituted of the cauliflower lineage L-8995-5, the hybrid broccoli hybrid Legacy, the generations F1 and F2, and retrocrossings for both progenitors, were planted in portions of 20 plants. The generation F2 was represented by four portions, the retrocrossings generations for two portions and the progenitors for a portion, which were distributed in random inside of each block. The planting in the field was accomplished in spaced double lines of 0,8 m x 1,0 m and 0,7 m among plants inside of the array. The evaluations were accomplished before and during the harvest of the flowers, individually for all the plants of the portion, except for the number of leaves. The characteristics evaluated were: beginning of formation of the group of flowers (number of days from the planting to the visual emergence of the group of flowers), cycle (number of days from the planting to the harvest of the group of flowers at commercial point), plant height (measurement of the level of the soil to the apex of the flowers, only for the summer-fall experiment), weigh, diameter of the flowers...(Complete abstract click electronic access below)
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Progresso com seleção nos compostos flintisa e dentado de milho (Zea mays L.) /

Mota, Jôse Aline Nogueira da. January 2006 (has links)
Orientador: João Antonio da Costa Andrade / Banca: Mario Luiz Teixeira de Moraes / Banca: José Branco de Miranda Filho / Resumo: Este trabalho foi desenvolvido com o objetivo de verificar o progresso com seleção recorrente nos Compostos Flintisa e Dentado, além da potencialidade dos mesmos para um possível uso como variedades comerciais. Observou-se que os rendimentos médios dos melhores ciclos de seleção do Flintisa e do Dentado equipararam-se com as melhores cultivares comerciais, apresentando rendimento de 5,5 t/ha e 5,3 t/ha na condição de baixa tecnologia e 7,3 t/ha e 7,7 t/ha na condição de alta tecnologia, respectivamente. O ganho com seleção para menor altura de espigas foi quantificado em um decréscimo de 1,2% ao longo de doze ciclos seletivos no Flintisa e 11,9% ao longo dos quatro últimos ciclos seletivos no Dentado, na avaliação conjunta dos ambientes de alta e baixa tecnologia. Ao longo de todo o processo seletivo houve uma resposta correlacionada de -4,1%/ciclo no acamamento do Flintisa na avaliação em baixa tecnologia e de -5,2%/ciclo no Dentado em alta tecnologia. Os resultados indicam que a seleção foi eficiente em aumentar o rendimento e diminuir a altura de espigas quando o processo seletivo foi voltado especificamente para esses caracteres. A continuidade do programa deve ter como base a seleção entre progênies para REND e AE conjuntamente nos próximos ciclos, em ambos os compostos. / Abstract: This research was developed aiming to verify the progress after recurrent selection in Flintisa and Dentado Composite of maize, as well as the potentiality of the same population for a possible commercial use. It was observed that grain yield representing the best cycles of selection of Flintisa and Dentado (5.5 and 5.3 t/ha, in low technology; and 7.3 and 7.7 t/ha in high technology, respectively) were compared with the best commercial cultivars. The effect of selection on ear height resulted an average decrease of 1.2% after 12 cycles in Flintisa and 11.9% after four cycles in Dentado, evaluated under low and high technology. Along the selective process, the correlated responses for plant lodging were -4.1% per cycle for Flintisa in low technology and -5.2% per cycle in Dentado in high technology. The overall results indicated that selection was effective to increase grain yield and reduce ear height when the selection process was directed specifically for each trait. The continuity of the program shell is based on selection among progenies simultaneously for higher grain yield and lower ear height. / Mestre
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Avaliação de híbridos simples braquíticos de milho super doce (Zea mays L.) portadores do gene shrunken-2 (sh2sh2) utilizando o esquema dialélico parcial /

Aragão, Carlos Alberto, 1970- January 2002 (has links)
Orientador: Norberto da Silva / Resumo: Visando avaliar o potencial produtivo de híbridos simples de milho super doce, bem como, a capacidade de combinação de vinte e cinco linhagens que lhes deram origem, através de um cruzamento dialélico parcial, foram avaliados cento e vinte híbridos, em São Manuel (SP) local 1, SAKATA/Sudameris (SP) local 2 e Arisco (GO) local 3, usando-se látice simples 11x11 com duas repetições por local. Foram tomados os dados de Produção total de espigas com palha corrigida para o estande; Produção comercial corrigida para o estande, Peso de cinco espigas comerciais com palha; Peso de cinco espigas comerciais sem palha; Produção espigas com. Sem palha, corrigida para estande e 76% de água, Comprimento de espigas; Diâmetro de espiga; Atura da planta e Altura de inserção espiga. As análises estatísticas e genéticas mostraram alta significância das interações de híbridos e capacidade geral e específica de combinação com os locais. De maneira geral observou-se maior produção para os caracteres avaliados no local 2 SAKATA/Sudameris. Comparando-se os híbridos testados com o híbrido comercial DO- 04, para todos os locais, observou-se que foi possível o desenvolvimento de híbridos simples (HS) superiores para a maioria dos caracteres avaliados. De maneira geral obteve-se uma boa combinação entre uma bom número de linhagens, sendo que para o caráter PC5Esp (76%), as melhores linhagens quanto à CGC, do grupo 1, foram 657; 750 e 656, do grupo 2, 636; 628 e 333. Foi possível indicar os seguintes híbridos específicos: (44)421x320 e (68)657x320, mostrando grande potencial para programas de melhoramento de milho doce. / Abstract: One hundred and twenty simple hybrids of super sweet corn were evaluated at São Manuel, SP (site 1), SAKATA/Sudameris, SP (site 2) and at Arisco, GO (site 3), using simple lattice 11x11 with two replications aiming to estimate the producing potential of the hybrids, as well as the combination capacity of 25 inbreds that originated them, by a partial diallel crossing. The data assessed were total husked ear production corrected for stand; commercial production corrected for stand; weight of five commercial husked ears; weight of five commercial dehusked ears; dehusked ears production corrected for stand and 76% humidity; ear length; ear diameter; plant height and height of ear insertion. The statistical and genetic analysis showed high significance of hybrids interactions and general and specific combine ability with the sites. In general, an improved production was observed for the evaluated characters at site 2 SAKATA/Sudameris. Comparing the tested hybrids with the commercial hybrid DO-04, at all the sites superior simple hybrids were developed for every evaluated character. In general, there was a good combination between a great number of inbred. For the dehusked ears production corrected for stand and 76% humidity character, the best CGC inbreds of group1 were 657; 750 e 656, and of group 2 were, 636; 628 e 333. It was possible to indicate the specific hybrids: (44)421 x 320 and (68)657 x 320, which have great potential for sweet corn breeding programs. / Doutor
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Descrição morfológica e análise da variabilidade genética para caracteres de frutos, sementes e processo germinativo associado à produtividade de óleo em matrizes de Carapa guianensis Aublet., uma meliaceae da Amazônia /

Pantoja, Tammya de Figueiredo. January 2007 (has links)
Resumo: O objetivo do presente trabalho foi caracterizar a morfologia de frutos, sementes e desenvolvimento pós-seminal e estudar a divergência genética entre árvores matrizes de Carapa guianensis Aublet., em duas populações naturais no Amapá, uma em Mazagão e outra em Macapá, por meio de caracteres biométricos de frutos e sementes, processo germinativo, desenvolvimento inicial de plântulas e teor de óleo. Na descrição morfológica utilizou-se estereomicroscópio para observação das características externas dos frutos, sementes e plântulas nas diversas fases de desenvolvimento pós-seminal. A divergência genética foi avaliada pela análise de agrupamento, através do algoritmo de Tocher e do método UPGMA (Unweighted Pair Group Using an Arithmetic Average), obtido a partir da matriz de dissimilaridade pela Distância Euclidiana. Para verificação da importância relativa de cada variável para a divergência genética utilizou-se a análise de Componentes Principais. Os frutos de C. guianensis são cápsulas septífragas, secas, deiscentes, pluriloculares, polispérmicas e subglobosas. As sementes são grandes, angulosas e convexas na região dorsal. A germinação é do tipo hipógea-criptocotiledonar e as plântulas apresentam metáfilos paripinados, hipocótilo pequeno, epicótilo glabro, sublenhoso, com duas a seis gemas axilares protegidas por catáfilos. Nos dois métodos de agrupamento as 25 árvores matrizes foram distribuídas em cinco e seis grupos, respectivamente, em Mazagão e Macapá. Oito (50%) e 12 (75%) dos 16 caracteres avaliados, repectivamente, em Mazagão e Macapá, foram considerados de pequena importância para a divergência. Dos caracteres mais importantes para a divergência, a massa de sementes, a largura de frutos e o teor de óleo foram comuns nas duas localidades. Há grande variabilidade entre as árvores matrizes de C. guianensis ...(Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The objective of the work was the morphological characterization of the fruits, the seeds, the post-seminal development and to evaluate the genetic divergence among mothers trees of Carapa guianensis of two natural populations located in Amapá, one in Mazagão and another in Macapá, through biometric traits of fruits and seeds, oil production, germination process and formation of the seedlings. To morphological description, the external characteristics of the fruits, the seeds and the seedlings in various stages of postseminal development were observed in a stereomicroscopy. The genetic divergence was evaluated using clusters analysis, by the algorithm of Tocher and method of UPGMA (Unweighted Pair Group Using an Arithmetic Average), obtained by the Euclidian Distance. To verify the relative importance of each variable for divergence was applied the analysis of Principal Components. The fruit of C. guianensis is a septicidal capsule, drought, dehiscent, plurilocular, polyspermic and subglobose. The seeds are large, angulate and convex in the back. The germination is hypogeal cryptocotilar and the seedlings have pinnate metaphylls, small hipocotyl, glabrous epicotyl, subwoody, with two or six axillary buds protected by cataphylls. In clusters analysis the 25 mother trees were distributed in five and six groups, respectively, in Mazagão and Macapá. Eight (50%) in Mazagão and 12 (50%) in Macapá of 16 characters evaluated were considered of presented lower importance for genetic divergence. The more important characters to the study of genetic divergence were the fresh mass of the seeds, fruit width and oil content, common in both locations. The great variability among mother trees of C. guianensis and the genetic divergence studies can xvii possibility the identification of mother trees to seed collection for use in conservation and improvement programs. / Orientador: Rinaldo Cesar de Paula / Coorientadora: Fabíola Vitti Môro / Coorientador: Fabiano Cesarino / Banca: Miguel Luiz Menezes Freitas / Banca: Mario Luiz Teixeira de Moraes / Mestre
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Identificação de SNPs (Single Nucleiotide Polymorphisms) no gene colina monooxigenase relacionado ao metabolismo da glicina betaína em Eucalyptus /

Martin, Leonardo Curi. January 2010 (has links)
Orientador: Celso Luís Marino / Banca: Rinaldo César de Paula / Banca: Ivan de Godoy Maia / Resumo: Estresses abióticos, como a seca, podem reduzir significativamente os rendimentos no cultivo de espécies comercialmente importantes, tais como o eucalipto na produção de celulose e papel. Quando submetidas às condições de déficit hídrico, as plantas desenvolvem alguns mecanismos de defesa. As betaínas participam destes mecanismos, sendo seu soluto mais comum a glicina betaína. Esta é uma amina quaternária distribuída extensamente em diversas espécies de plantas superiores, sintetizada em elevadas taxas, tendo como função, manter a turgescência celular. A identificação e estudo de genes relacionados à tolerância à seca são importantes para os programas de melhoramento florestal. Este estudo teve por objetivo identificar SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms) no gene colina monooxigenase relacionado ao metabolismo da glicina betaína em Eucalyptus. A sequência do gene em estudo foi encontrada em genomas de plantas modelos através do banco de dados GenBank, sendo as mesmas, utilizadas para a procura de similaridades no banco de dados de ESTs de eucalipto FORESTs - FAPESP. Após a constatação de homologia no banco de dados de eucalipto, foram confeccionados oito pares de "primers" para flanquear essas regiões, sendo estes, avaliados, amplificando fragmentos únicos. Depois de realizado o seqüenciamento do gene colina monooxigenase, foi utilizado a ferramenta BLAST no GenBank, confirmando com sucesso a identidade da sequência. Em seguida, as sequências foram alinhadas e os SNPs encontrados. No total, foram identificados 49 SNPs, sendo 12 em regiões codificantes e 37 em regiões UTRs e íntrons. Somente os SNPs localizados nas regiões codificantes foram utilizados neste trabalho, sendo 83,3% deles possuindo mutações sinônimas e 16,7% não-sinônimas. Em seguida, foi utilizada uma população mais abrangente composta de E. grandis... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Abiotic stress, such as drought, can reduce significantly the yield in the important commercially species crop, such as the eucalyptus in the cellulose and paper. When submitted to the water stress conditions, the plants develop some defense mechanisms. The betaines are part of these mechanisms , being their solute more common to the glycine betaine. This is a quaternary amine extensively distributed in several species of higher plants synthesized in high taxes with the function of maintaining the cellular turgescence. Identifying and studying the genes related to the drought tolerance are important for the forest improvement programs. This work aimed at identifying SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms) in choline monooxygenase related to the glycine betaine in Eucalyptus. The gene sequence was found in model plants genomes through the databank GenBank, being used for searching similarities in the databank ESTs of eucalyptus FORESTs - FAPESP. After noticing homology in the eucalyptus databank, eight pairs of primers were made to amplify these regions, being evaluated, amplifying unique fragments. After the choline monooxygenase sequencing was performed, it was used the BLAST in the GenBank, confirming successfully the sequence identity. Then, the sequences were aligned and the SNPs were found. In the total, 49 SNPs were identified, being 12 in coding regions and 37 in UTRs and intron regions. Only the SNPs located in coding regions were used in this work, being 83.3% of the SNPs with synonymous mutation and 16.7% non-synonymous. Following, it was used a wider population made up of de E. grandis, E. Urophylla and the hybrid "Urograndis" to perform the SNPs genotyping, establishing the formation of 18 haplotypes and 16 possible haplotypical combinations which revealed that some genotypes were exclusive for the species E. grandis and E. urophylla. With the objective of decreasing costs... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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Diversidade genética com base em dados fenotípicos avaliada em diferentes populações e linhagens avançadas de soja /

Ferreira Júnior, José Arantes. January 2013 (has links)
Orientador: Antônio OrlandoDi Mauro / Coorientador: Sandra Helena Unêda-Trevisoli / Banca: Everton Luis Finotto / Banca: Gustavo Vitti Moro / Resumo: Atualmente, a soja destaca-se como a mais importante oleaginosa cultivada no mundo, sendo que o Brasil e os EUA se destacam como os maiores produtores mundiais. O Brasil nas últimas três décadas, apresentou aumento significativo tanto no volume de produção, quanto na produtividade desta cultura. Esta evolução é justificada pela melhoria das condições de cultivo nas diversas regiões brasileiras, mas principalmente pela obtenção de novas cultivares merolhadas. O sistema produtivo de soja do país tem exigido dos programas de melhoramento genético o desenvolvimento de cultivares precoces, com altas produtividades e resistentes as diversas doenças que ocorrem na cultura, sendo que a ferrugem asiática, destacou-se na última década como a mais importante. Dentre as várias fases de um programa de melhoramento merece destaque o planejamento e a síntese dos cruzamentos, onde informações referentes à divergência genética são fundamentais, pois estes estudos norteiam a tomada de decisão, na obtenção de populações segregantes superiores e promissoras. Apenas informações referentes à divergência genética não são suficientes para escolha de parentais para hibridação, a mesma deve vir acompanhada de informações referente ao desempenho do genótipo, quanto a algumas características desejáveis. Os capítulos seguintes apresentarão estudos sobre a divergência genética e o desempenho agronômico em genótipos de soja superiores, através da caracterização fenotípica dos mesmos. / Abstract: Today, soybean is the most important oil seed crop in the world, where Brazil and USA are the world's largest producers. In the last three decades, the Brazilian production and yield of soybean increased significantly. This evolution is justified by the improvement of growing conditions in different regions of Brazil, but mainly for the crop breeding programs. The Brazilian soybean production system has required early soybean varieties from the breeding programs with high yield and resistant to many diseases, especially the Asian rust, one of the most important disease in the last decade. Among the several steps of a breeding program, the two steps that deserve attention are the planning and synthesis of crossings, where information about genetic divergence is critical, because these studies guide the decision making to get higher and promising segregating populations. Only information regarding divergence genetic is not enough for choosing parental for hybridization, because the information must be accompanied by information about genotype performance of for some desirable characteristics. The following chapters will present studies on divergence genetic and agronomic performance in higher soybean genotypes by phenotypic characterization. / Mestre
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Estudo genético e influência de caracteres na seleção de genótipos superiores de soja /

Vianna, Viviane Formice. January 2013 (has links)
Orientador: Sandra Helena Unêda-Trevisoli / Coorientador: Janete Apparecida Desidério / Co-orientador: Antonio Orlando Di Mauro / Banca: Ana Cristina Pinto Juhász / Banca: José Baldin Pinheiro / Banca: Ricardo Machado da Silva / Banca: Gustavo Vitti Moro / Resumo: Os programas de melhoramento de soja visam principalmente o incremento na produtividade aliado a resistência a estresses bióticos e abióticos. O objetivo deste trabalho foi a seleção de progênies portadoras de genes de resistência à ferrugem asiática da soja, com caracteres agronômicos de interesse, através de análises univariadas e multivariadas, e definir quais os principais caracteres que influenciaram no processo de seleção destes genótipos. Os experimentos foram realizados com as gerações F4 e F5 de soja conduzidos através do delineamento de blocos aumentados com testemunhas intercalares e a geração F6 por blocos casualizados com duas repetições. Foram avaliadas as principais características de interesse agronômico. Os resultados obtidos com os parâmetros genéticos identificaram maior variabilidade entre os genótipos do que dentro deles. A herdabilidade no sentido amplo e restrito entre genótipos também foi superior à herdabilidade dentro deles. A partir do índice de seleção foi possível realizar seleção entre os genótipos com ganhos principalmente nos componentes primários de produção da soja. Na análise de componentes principais na geração F4 e F5 três autovalores explicaram 85,17% e 83,82%, respectivamente, da variância contida nas informações originais, sendo caracterizados pelas variáveis número de vagens, número de sementes, produção por planta, altura da inserção da primeira vagem... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The soybean breeding programs mainly target the increase in yield coupled with resistance to biotic and abiotic stresses. The objective of this work was the selection of progenies carrying resistance genes to soybean rust with agronomic traits of interest, using univariate and multivariate analyzes, and define what the main characters that influenced the selection process of these genotypes. The experiments were performed with generations F4 and F5 soybean conducted through augmented block with check interim F6 generation and block design with two replications. We evaluated the main characteristics of agronomic interest. The results obtained with the parameters identified greater genetic variability among genotypes than within them. The broad-sense heritability and narrow between genotypes was also higher than the heritability within them. From the index selection was possible selection among genotypes with gains mostly in primary components of soybean production. In principal components analysis to generate F4 and F5 three eigenvalues explained 85.17% and 83.82%, respectively, of the variance contained in the original information, which are characterized by variable number of pods, number of seeds produced per plant, height first pod, plant height at maturity and weight of hundred seeds that allowed ... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

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