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Implicações da seleção recorrente para caracteres adaptativos de uma população de arroz irrigado

Fagundes, Paulo Ricardo Reis January 2004 (has links)
O objetivo do trabalho foi de avaliar a aptidão da população CNA 11 para melhoramento dos caracteres ciclo vegetativo e estatura de planta através de um ciclo de seleção recorrente, estimar parâmetros genéticos desses caracteres e verificar possíveis alterações nas freqüências alélicas da população.
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Avaliação genético-estatística de genótipos RB de cana-de-açúcar e proteômica associada ao estresse hídrico em genótipos oriundos de autofecundação em Pernambuco

DUTRA FILHO, João de Andrade 31 January 2014 (has links)
Submitted by Amanda Silva (amanda.osilva2@ufpe.br) on 2015-03-13T15:39:41Z No. of bitstreams: 2 TESE João de Andrade Filho.pdf: 1945201 bytes, checksum: 44d3299355bfac41e74d7acf09a4157a (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-03-13T15:39:41Z (GMT). No. of bitstreams: 2 TESE João de Andrade Filho.pdf: 1945201 bytes, checksum: 44d3299355bfac41e74d7acf09a4157a (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Previous issue date: 2014 / CAPES / O Estado de Pernambuco é o segundo maior produtor de cana-de-açúcar da Região Nordeste. Entre os principais fatores que dificultam o incremento na produtividade estão a elevada interação genótipo x ambiente que se expressa na heterogeneidade dos solos, relevos acidentados e irregularidade das chuvas com longos períodos de estiagem. Objetivou-se com este trabalho avaliar o desempenho agroindustrial e proteoma de genótipos RB (República do Brasil) de cana-de-açúcar associado ao estresse hídrico nas microrregiões canavieiras do Estado de Pernambuco. Os experimentos foram conduzidos nas áreas agrícolas das usinas parceiras do Programa de Melhoramento Genético da Cana-de-açúcar da Universidade Federal Rural de Pernambuco integrante da Rede Interunivertária para o Desenvolvimento do Setor Sucroenergético (PMGCA/UFRPE/RIDESA). A estatística genética e os modelos biométricos experimentais: Análise de variância, agrupamento de médias, decomposição da interação genótipo x ambiente e estratificação, estimação de parâmetros genéticos, de adaptabilidade e estabilidade e coeficiente de repetibilidade, foram aplicados. Foram realizadas análises bioquímicas, fisiológicas e moleculares (genômica funcional). As análises biométricas identificaram genótipos promissores a serem cultivados na região canavieira do Estado de Pernambuco contribuindo para um aumento de produtividade, através do coeficiente de repetibilidade verificou-se que é possível, reduzir, em até três anos agrícolas, o tempo de liberação de novos cultivares nas condições edafoclimáticas em estudo. Nos processos fisiológicos, não foram verificados efeitos indesejáveis da depressão endogâmica no clone de autofecundação em relação ao cultivar comercial. Desta forma a autofecundação pode ser utilizada no melhoramento genético da cana-de-açúcar no desenvolvimento de novos genótipos tolerantes ao estresse hídrico.
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Desenvolvimento de marcadores de DNA para mapeamento genético e caracterização da diversidade em Feijão-caupi

Onofre, Alberto Vinicius Casimiro 31 January 2012 (has links)
Submitted by Chaylane Marques (chaylane.marques@ufpe.br) on 2015-03-13T17:49:52Z No. of bitstreams: 2 TESE_ALBERTO VINICIUS + Ficha.pdf: 1935294 bytes, checksum: 033dcc1254e3fb1696da0979cf81b236 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-03-13T17:49:52Z (GMT). No. of bitstreams: 2 TESE_ALBERTO VINICIUS + Ficha.pdf: 1935294 bytes, checksum: 033dcc1254e3fb1696da0979cf81b236 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Previous issue date: 2012 / MCT/RENORBIO (Rede Nordeste de Biotecnologia); FINEP (Financiadora de Estudos e Projetos); BNB (Banco Nordeste do Brasil); FACEPE (Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Pernambuco). / O feijão-caupi é uma das principais leguminosas cultivadas em todo o mundo. Além da importância econômica e social, essa espécie possui atributos biológicos que a tornam um interessante organismo para a pesquisa em biotecnologia. O uso de marcadores moleculares tem contribuído para os estudos de diversidade dos acessos depositados em bancos de germoplasma e das cultivares mais utilizadas pelos produtores, bem como no desenvolvimento de mapas de ligação. O presente trabalho teve como objetivo saturar o mapa genético, previamente estabelecido, com a população de interesse para o melhoramento da cultura de feijão-caupi no Brasil (BR 14-Mulato x IT85F2687). O mapa de ligação foi construído com base em marcadores SSR (Simple Sequence Repeats), ISSR (Inter Simple Sequence Repeat), AFLP (Amplified Fragment Length Polymorphism) e DAF (DNA Amplification Fingerprinting). O mapa de ligação foi construído através do programa MapMaker 2.0. Adotando o valor do limite de detecção (LOD) de 3,0 e uma frequência máxima de recombinação de 0,35, foram mapeadas 216 marcas em onze grupos de ligação cobrindo uma distância de recombinação total de 2064,6 cM. Os grupos de ligação variaram de 68,8 cM (Grupo 11) a 323,3 cM (Grupo 1). A distância entre marcadores adjacentes variou entre 0 e 39,5 cM, com média de 9,7 cM. Os resultados encontrados indicam as bases para o desenvolvimento de mapas específicos saturados para identificação de locos de herança quantitativa de utilidade em programas de melhoramento do feijão-caupi, bem como para estudos comparativos de mapeamento a partir da integração entre espécies do gênero Vigna. Esses marcadores representam uma ferramenta útil para isolamento de genes de resistência a estresses bióticos e abióticos desta espécie via clonagem baseada em mapeamento genético.
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Análise estrutural e funcional do genoma do feijão--caupi:mapa genético e elementos transponíveis

AMORIM, Lidiane L Barbosa 31 January 2013 (has links)
Submitted by Luiz Felipe Barbosa (luiz.fbabreu2@ufpe.br) on 2015-04-17T13:54:06Z No. of bitstreams: 2 Tese Amorim Lidiane.pdf: 2912606 bytes, checksum: 8b1da6453bb7abfc598b124aecb89609 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-04-17T13:54:06Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Tese Amorim Lidiane.pdf: 2912606 bytes, checksum: 8b1da6453bb7abfc598b124aecb89609 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Previous issue date: 2013 / MCT RENORBIO FINEP BNB FACEPE e CNPq / O feijão-caupi é uma das principais culturas alimentares de subsistência no planeta tendo, no Brasil, maior importância nas regiões Norte e Nordeste, pela sua adaptabilidade a condições edafoclimáticas estressantes. Apresenta destacada importância social na agricultura familiar destas regiões, sendo notadamente a principal fonte de proteína para as populações de áreas semiáridas do Brasil e do norte da África. Apesar de sua rusticidade e capacidade de crescer onde outras leguminosas não se adaptam, a produtividade desta cultura pode ser afetada por fatores abióticos (como seca e salinidade) e bióticos, com ênfase para as viroses no caso do Brasil. Neste país, o melhoramento do feijão-caupi baseia-se até o momento em técnicas convencionais, havendo poucos estudos efetivamente associados às técnicas moleculares modernas, supondo-se que ferramentas moleculares possam ajudar na superação dessas adversidades. Neste contexto, o projeto Brasileiro do Transcriptoma do Feijão-Caupi (rede NordEST) gerou um número significativo de transcritos, os quais começam a ser aplicados no sentido de reverter este cenário. Adicionalmente, neste trabalho foi desenvolvido um mapa genético do genoma do feijão-caupi, onde a versão atual inclui 237 loci mapeados em doze grupos de ligação (GL), correspondentes ao número haploide do feijão-caupi. Além disso, foram realizadas análises bioinformáticas envolvendo elementos transponíveis (TEs) de forma comparativa entre soja e feijão-caupi, revelando uma diversidade significativa desses elementos em cada táxon ou entre as citadas espécies. Tais polimorfismos figuram muitas vezes associados a genes, mostrando um potencial para o desenvolvimento de marcadores moleculares. No conjunto, os dados gerados servirão como base para o desenvolvimento de estratégias visando ao conhecimento da diversidade genética e de seu potencial para o melhoramento na cultura do feijão-caupi pela associação com características fenotípicas de interesse agronômico. Novos marcadores estão sendo obtidos para cobrir melhor o genoma, devendo ser úteis em experimentos in vitro e in vivo visando ao melhoramento genético de leguminosas de interesse econômico.
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A contribuição das pesquisas em ciências agrárias da Universidade Federal Rural de Pernambuco para o aumento do rendimento da cana-de-açúcar em Pernambuco: o caso da Estação Experimental de Cana-de-açúcar de Carpina

VIANA, Maria da Penha da Silva 03 June 2013 (has links)
Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2016-06-02T14:05:46Z No. of bitstreams: 1 Maria da Penha da Silva Viana.pdf: 686335 bytes, checksum: a0cc411433bbbabca2873a8125b1ecfe (MD5) / Made available in DSpace on 2016-06-02T14:05:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Maria da Penha da Silva Viana.pdf: 686335 bytes, checksum: a0cc411433bbbabca2873a8125b1ecfe (MD5) Previous issue date: 2013-06-03 / This paper deals with the contribution that the Federal Rural University of Pernambuco, through the Experimental Station cane sugar Carpina, performs with the intention of effecting improvements in the cultivation of sugar cane in the state of Pernambuco. These surveys are developed and passed on to eleven plants in the state, as well as for others in four states in the Northeast. The research is built on a public-private partnership with the RIDESA and eleven universities in Brazil, which perform genetic improvement, adapting to the culture of sugarcane suitable soil, also checking the best conditions of irrigation and drainage, biological control pest management, fertilization and after, on average, twelve years, the varieties are released for sale. Through an econometric model of multiple linear regression showed that the EECAC contribute, through their research, to increase the efficiency of cultivation of sugar cane in the state of Pernambuco. It is shown in this way that UFRPE fulfills its formative role of human resources in the areas of agricultural sciences, particularly through the courses of graduate Strictly speaking, to be appointed the number of graduates of several area courses agricultural sciences, at undergraduate and postgraduate, as well as various research on the genetic improvement of cane sugar. / O presente trabalho trata da contribuição que a Universidade Federal Rural de Pernambuco, através da Estação Experimental Cana-de-açúcar de Carpina, realiza com a intenção de efetuar melhorias no cultivo da cana-de-açúcar no estado de Pernambuco. Essas pesquisas são desenvolvidas e repassadas para onze usinas do estado, bem como, para outras em mais quatro estados da região Nordeste. As pesquisas são desenvolvidas a partir de uma parceria público-privada com a RIDESA e mais onze universidades do Brasil, as quais efetuam o melhoramento genético, adequando a cultura da cana ao solo apropriado, verificando também as melhores condições de irrigação e drenagem, controle biológico de pragas, adubação e após, em média, doze anos as variedades são liberadas para comercialização. Através de um modelo econométrico de regressão linear múltiplo, mostrou-se que a EECAC contribui, através de suas pesquisas, para o aumento da eficiência de cultivo da cana-de-açúcar do estado de Pernambuco. Mostra-se, dessa maneira, que a UFRPE cumpre com o seu papel formador de recursos humanos nas áreas das ciências agrárias, particularmente, através dos cursos de pós-graduação Stricto sensu, ao ser apontado o número de egressos dos diversos cursos da área de ciências agrárias, na graduação e na pós-graduação, bem como as diversas pesquisas realizadas sobre o melhoramento genético da cana-de-açúcar.
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Identificação e validação de transcritos SuperSAGE de cana-de-açúcar diferencialmente expressos sob déficit hídrico

SILVA, Manassés Daniel da 23 May 2017 (has links)
Submitted by Pedro Barros (pedro.silvabarros@ufpe.br) on 2018-08-29T20:59:38Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) TESE Manassés Daniel da Silva.pdf: 11375215 bytes, checksum: 27f229afc3d4c007749af6102bfa4a9f (MD5) / Approved for entry into archive by Alice Araujo (alice.caraujo@ufpe.br) on 2018-09-10T19:45:50Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) TESE Manassés Daniel da Silva.pdf: 11375215 bytes, checksum: 27f229afc3d4c007749af6102bfa4a9f (MD5) / Made available in DSpace on 2018-09-10T19:45:50Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) TESE Manassés Daniel da Silva.pdf: 11375215 bytes, checksum: 27f229afc3d4c007749af6102bfa4a9f (MD5) Previous issue date: 2017-05-23 / CAPES / A cana-de-açúcar é uma cultura de importância industrial, cultivada em países tropicais e subtropicais. Dentre os fatores abióticos, a seca é o que mais negativamente impacta a produtividade vegetal. Portanto, o desenvolvimento de variedades tolerantes à seca está relacionado com a sustentabilidade e a viabilidade econômica da cultura. O presente trabalho pretende contribuir para um melhor entendimento dos processos envolvidos na resposta da cana-de-açúcar à seca, através da identificação e validação de alvos moleculares diferencialmente expressos após tratamento de supressão de rega (24 h), com vistas ao desenvolvimento futuro de marcadores moleculares funcionais. Para tanto, análises in silico de bibliotecas HT-SuperSAGE (de raízes de variedades tolerantes e sensíveis sob estresse e sem estresse) possibilitaram identificar alvos moleculares relacionados a diferentes estratégias de resposta e a genes de fatores de transcrição (FTs). Destes, 26 alvos foram validados via RT-qPCR (dentre os quais, duas aquaporinas e cinco fatores de transcrição), com ao menos dois dos cinco genes de referência padronizados. Adicionalmente, a análise in silico identificou 94 genes FTs enriquecidos que controlam a expressão dos transcritos HT-SuperSAGE mais induzidos nos dois conjuntos de cultivares contrastantes em resposta ao estresse. Também foram identificados os elementos regulatórios atuantes em Cis (cis-Acting regulatory elements - CARE) mais prevalentes em regiões promotoras de nove dos 146 FTs induzidos. Dessa forma, os resultados aqui apresentados fornecem recursos valiosos de genômica funcional para aplicação no melhoramento da cana-de-açúcar frente ao déficit hídrico, cujo desdobramento biotecnológico auxiliará na sustentabilidade da manutenção e expansão dessa cultura. / Sugarcane is a significant industrial crop and it is grown in tropical and subtropical countries. Among the abiotic factors, drought is the one that most negatively impacts plant productivity. Therefore, the development of drought-tolerant varieties is related to the sustainability and economic viability of the crop. This paper aims to contribute to a better understanding of the processes involved in the response of sugarcane to drought, through the identification and validation of differentially expressed molecular targets after irrigation suppression (24 h) treatment, with a view to the future development of functional molecular markers. To this end, in silico analyzes of HT-SuperSAGE libraries (from roots of tolerant and sensitive cultivars under stress and without stress) made it possible to identify molecular targets related to different response strategies and genes of transcription factors (TFs). Of these, 26 targets were validated via RT-qPCR, (including two aquaporins and five transcription factors), with at least two of the five standardized reference genes. In addition, in silico analysis identified 94 enriched TFs genes that control the expression of the most induced HT-SuperSAGE transcripts in the two sets of contrasting cultivars in response to stress. The most prevalent cis-Acting regulatory elements (CARE) of nine of the 146 induced TFs were also identified. Thus, the results presented here provides valuable functional genomics resources for application in sugarcane breeding against water deficit, whose biotechnological development will help in the sustainability of the maintenance and expansion of this crop.
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Golias: software para análises estatística e biométrica de grande conjunto de dados utilizando as linguagens Júlia e R / Golias: software for statistical and biometric analysis of a large dataset using the languages Julia and R

Oliveira, Cristiano Ferreira de 21 February 2018 (has links)
Submitted by Nathália Faria da Silva (nathaliafsilva.ufv@gmail.com) on 2018-07-10T20:14:54Z No. of bitstreams: 1 textocompleto.pdf: 660296 bytes, checksum: 3ddfa0bd00c9a41014d5aa9058baa8be (MD5) / Made available in DSpace on 2018-07-10T20:14:54Z (GMT). No. of bitstreams: 1 textocompleto.pdf: 660296 bytes, checksum: 3ddfa0bd00c9a41014d5aa9058baa8be (MD5) Previous issue date: 2018-02-21 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / A utilização de informações de marcadores moleculares para identificação de indivíduos geneticamente superiores para características de interesse é uma as principais contribuições da genética molecular no melhoramento genético. Assim, em programas de melhoramento genético, é crescente o uso de marcadores moleculares dispostos em matrizes de alta densidade, que necessitam de controle de qualidade e uso de metodologias adequadas para realizar a predição dos valores genéticos. Diante do exposto este trabalho tem como objetivo apresentar o software Golias, que é um software livre destinado ao processamento de dados de marcadores SNPs de alta dimensão. O Golias é integrado com os ambientes de programação R e Julia, utilizando o poder de processamento da linguagem Júlia e de pacotes do R otimizados em código C. Todas as análises são realizadas sem fazer necessário que o usuário tenha qualquer conhecimento em programação. O software proposto dispõe de procedimentos para o controle de qualidade de SNPs como call rate, MAF, teste de equilíbrio de Hardy-Weinberg, descarte de variáveis via componentes principais, um procedimento para imputação de informações genotípicas perdidas e algumas técnicas de predição utilizando métodos bayesianos. O Golias está disponível em português; pode ser baixado da Internet (https://www.dropbox.com/sh/ql92mzjed8735wq/AADfVadXY3oYM_3qe84Vb N-Ea?dl=0) e é compatível com sistema operacional Windows. / The use of molecular marker information to identify genetically superior individuals for traits of interest is one of the main contributions of genomic selection in breeding. Thus, in genetic breeding programs is increasing the use of molecular markers arranged in high density matrices which require quality control and the use of appropriate methodologies to predict genetic values. The work aims to present the Golias software that is a free software for processing data from high- size SNPs. Golias is integrated with the R and Julia programming environments, using the processing power of the Júlia language and R-optimized C-packets. All analyzes are performed without making it necessary for the user to have any programming knowledge. The proposed software has procedures for quality control of SNPs such as call rate, MAF, Hardy-Weinberg equilibrium test, variables discarding via principal components, a procedure for imputation of lost genotype information and some prediction techniques using Bayesian methods. Golias is available in Portuguese; can be downloaded from the Internet (https://www.dropbox.com/sh/ql92mzjed8735wq/AADfVadXY3oYM_3qe84Vb N-Ea?dl=0) and is compatible with Windows operating system.
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Espectroscopia NIR na seleção de clones de Eucalyptus dunnii para produção de celulose / NIR spectroscopy in the selection of Eucalyptus dunnii clones for cellulose production

Gallo, Ricardo 11 May 2018 (has links)
Submitted by MARCOS LEANDRO TEIXEIRA DE OLIVEIRA (marcosteixeira@ufv.br) on 2018-07-19T13:28:40Z No. of bitstreams: 1 textocompleto.pdf: 2286622 bytes, checksum: 93b5d96cee25f270279c55a4dad8f812 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-07-19T13:28:40Z (GMT). No. of bitstreams: 1 textocompleto.pdf: 2286622 bytes, checksum: 93b5d96cee25f270279c55a4dad8f812 (MD5) Previous issue date: 2018-05-11 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Em um programa de melhoramento florestal deve ser inserido caracteres da madeira para ganhos expressivos na seleção de genótipos. Com base nisso, objetivou-se a seleção de clones de Eucalyptus dunnii em caracteres da madeira estimados via espectroscopia do infravermelho próximo (NIR). Este trabalho visou estimar a herdabilidade e as correlações genéticas das características de crescimento e da madeira, e estabelecer critérios de seleção visando o aumento da produção de celulose em clones de E. dunnii em diferentes ambientes. Visou também verificar as diferenças dos parâmetros genéticos e seleção de clones de E. dunnii com base em caracteres da madeira gerados via espectroscopia NIR com uso de amostras de serragem moídas e amostras de serragem sem moer. Foi utilizado uma rede experimental que pertence à empresa CMPC Celulose Riograndense, em delineamento experimental em blocos ao acaso, com parcela de árvore única, em três ambientes. Aos três anos e meio foram obtidos valores de crescimento, e com espectroscopia do infravermelho próximo, obtido valores de características da madeira. Foram observados incremento médio anual, densidade básica, rendimento de celulose, teor holocelulose, lignina Klason, lignina total, extrativos em água, extrativos totais e cinzas, bem como criado o índice fenotípico IMACel e o índice de rank médio. Foi utilizado um modelo linear misto via REML/BLUP para obtenção dos parâmetros genéticos e ordenamento dos valores genotípicos. Foi possível verificar que existe variância genética para os caracteres da madeira, portanto há possibilidade de ganhos genotípicos com a seleção dos clones de E. dunnii. Os caracteres da madeira em E. dunnii apresentam valores moderados a altos de herdabilidade, com acurácias seletivas altas. Foi possível obter correlações genéticas favoráveis para a seleção com base em caracteres da madeira para produção de celulose e papel. Houve interação do tipo simples para clones x ambientes, podendo ser selecionados clones nos três ambientes testados. Foram observadas diferenças nos parâmetros genéticos entre as amostras de serragem moídas e sem moer. A utilização do índice de rank médio possibilitou a seleção de genótipos superiores com base em todas as características da madeira. A seleção com base em amostras sem moer pode ser realizada desde que, levadas em consideração a acurácia seletiva para avaliação com base em um único caráter. Com isso, esse trabalho verificou que há possibilidade de seleção visando o aumento da produção de celulose em clones de E. dunnii com base em caracteres de crescimento e da madeira estimados com uso de amostras sem moer por meio da espectroscopia NIR / In tree breeding program, wood traits should be used for significant gains in genotype selection. Based on this, we aimed the selection of Eucalyptus dunnii clones in wood traits estimated by near infrared spectroscopy (NIRS). The present study aimed to estimate genetic parameters and correlations of growth and wood traits; and establish a selection criteria to increase pulp yield in E. dunnii clones in different environments. It was also aimed to verify differences in genetic parameters and selection of E. dunnii clones through wood traits generated by NIRS with the use of ground sawdust samples and sawdust samples without milling. It was used an experimental network belonging to the company CMPC Celulose Riograndense, in a randomized block design, with a single tree plot, in three environments. Growth values were obtained from 3.5-year- old trees. Wood traits values were measured by near-infrared spectroscopy. Mean annual increment, basic density, cellulose yield, holocellulose content, Klason lignin, total lignin, extractives in water, total extractives, and ashes, as well as the MAICel phenotype index and the average rank index were observed. A mixed linear model was used via REML/BLUP to obtain the genetic parameters and genotypic value ordering. It was possible to verify that genetic variance exists for wood traits, so there is a possibility of genotypic gains with the selection of E. dunnii clones. The traits of the wood in E. dunnii present moderate to high values of heritability, with high selective accuracy. It was possible to obtain favorable genetic correlations for trait-based selection of wood for pulp and paper production. There was a simple type interaction for clones x environments, and clones could be selected in the three environments tested. Differences were observed in the genetic parameters between the sawdust samples and sawdust without milling. The use of the average rank index allowed the selection of superior genotypes based on all the traits of the wood. Selection based on sawdust without milling may be performed provided that, considering the selective accuracy for evaluation based on a single trait. Therefore, this work verified that there is possibility of selection aiming at increasing cellulose production in E. dunnii clones based on growth and wood traits estimated using samples without milling through NIR spectroscopy
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Caracterização molecular de cultivares e progênies de maracujazeiro azedo / Molecular characterization of cultivars and progenies of passion fruit sour

Araújo, Wellingson Assunção 28 February 2018 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2018-08-29T14:00:51Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 857048 bytes, checksum: c7bcf222c766535b9be418b403ebedb5 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-08-29T14:00:51Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 857048 bytes, checksum: c7bcf222c766535b9be418b403ebedb5 (MD5) Previous issue date: 2018-02-28 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / O maracujazeiro azedo (Passiflora edulis Sims.) pertence à família Passifloraceae e ao gênero Passiflora, sendo a América tropical seu centro de origem. O Brasil destaca-se no cenário mundial como maior produtor, propiciando o interesse de cultivo da espécie, porém se faz necessário o desenvolvimento de cultivares que possuam desempenho superior às já existentes. O programa de melhoramento de maracujazeiro da Universidade Federal de Viçosa desenvolve continuamente genótipos superiores por meio de cruzamentos entre indivíduos contrastantes como premissa de obter cultivares comerciais que atendam aos interesses do mercado. Nesse estudo, objetivou-se caracterizar molecularmente as cultivares comerciais de maracujazeiro azedo utilizadas no Brasil e progênies elite advindas do programa de melhoramento da Universidade Federal de Viçosa - UFV, além de obter informações sobre indivíduos contrastantes e verificar a possível ocorrência de variabilidade genética entre e dentro das cultivares/progênies avaliadas. Foram utilizadas 14 cultivares comerciais advindas de nove programas de melhoramento e 14 progênies elite do programa de melhoramento da UFV. Para cada cultivar/progênie coletou-se dados de sete plantas. Foram testados 12 primers microssatélites, dos quais 10 amplificaram e apresentaram polimorfismo. Foram identificados 26 alelos, com media de 2,6 alelo/loco. As analises de diversidade mostraram que a heterozigosidade observada é menor que a esperada e que o conjunto das cultivares/progênies possui coeficiente de endogamia positivo. Observou-se a formação de três grupos a partir da construção do dendrograma, onde foi possível discriminar quase todos os indivíduos das cultivares/progênies. / The passion fruit (Passiflora edulis Sims.) belongs to the family Passifloraceae and to the genus Passiflora, being tropical America its center of origin. Brazil stands out in the world scenario as a major producer, favoring the interest of cultivating the species, but it is necessary to develop cultivars that perform better than those already existing. The passion fruit breeding program of the Federal University of Viçosa continually develops superior genotypes through crosses between contrasting individuals as a premise to obtain commercial cultivars that meet market interests. The objective of this study was to characterize the commercial cultivars of passion fruit cultivars used in Brazil and elite progenies from the breeding program of the Federal University of Viçosa - UFV, as well as obtaining information on contrasting individuals and verifying the possible occurrence of genetic variability between within the evaluated cultivars / progenies. Fourteen commercial cultivars from nine breeding programs and 14 elite progenies from the UFV breeding program were used. For each cultivar / progeny data were collected from seven plants. Twelve microsatellite primers were tested, 10 of which amplified and showed polymorphism. 26 alleles were identified, with a mean of 2.6 allele / locus. The diversity analyzes showed that the observed heterozygosity is lower than expected and that the set of cultivars / progenies has a positive inbreeding coefficient. It was observed the formation of three groups from the construction of the dendrogram, where it was possible to discriminate almost all the individuals of the cultivars / progenies.
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Seleção de famílias de feijão carioca visando extração de linhagens por modelos mistos / “Carioca” bean families selection aiming lineages extraction using mixed models

Nunes, Kharenn Vailant 18 December 2017 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2018-09-03T13:56:52Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 334287 bytes, checksum: df1e61532c2f6aab384cf8621f7e550c (MD5) / Made available in DSpace on 2018-09-03T13:56:52Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 334287 bytes, checksum: df1e61532c2f6aab384cf8621f7e550c (MD5) Previous issue date: 2017-12-18 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / O feijoeiro-comum é suscetível à várias doenças, dentre elas a murcha-de-Fusarium. A murcha-de-Fusarium é uma doença muito presente nas áreas de plantio de feijão e pode levar a perdas de até 100%. Além da resistência a doenças, o objetivo do melhoramento do feijoeiro é a obtenção de linhagens que sejam produtivas, com arquitetura de plantas ereta e grãos comercialmente aceitáveis. Assim, o objetivo deste trabalho foi a seleção de famílias endogâmicas de feijoeiro, visando a extração de linhagens superiores quanto à resistência a murcha-de-Fusarium, arquitetura de plantas, aspecto comercial de grãos e produtividade. As famílias avaliadas foram provenientes de duas populações selecionadas a partir de um conjunto de híbridos oriundos de um cruzamento dialélico. As populações oriundas dos cruzamentos CVIII 8511 x VC 25 (população 1) e Pérola x VC 25 (população 2) foram as que se mostraram promissoras quanto a produtividade de grãos e resistência à murcha-de-Fusarium. Noventa famílias oriundas da população 1 e 34 famílias oriundas da população 2 juntamente com 7 testemunhas (genitores e variedades comerciais) foram avaliadas por três gerações/safras (F 2:3 , F 2:4 e F 2:5 ) em experimentos de campo. As características avaliadas foram dias da emergência ao florescimento (DEF), arquitetura de plantas (ARQ), produtividade de grãos (PROD), aspecto comercial de grãos (GRÃO), severidade de murcha-de-Fusarium (FUS), crestamento bacteriano (CREST) e mofo-branco (MOFO). Os dados obtidos foram analisados utilizando-se metodologia de modelos mistos. Observou-se significância para o efeito de famílias sobre a maioria dos caracteres, com exceção de DEF, ARQ (F 2:5 ) e PROD (F 2:5 ), o que indica variabilidade genética entre as famílias avaliadas. Por meio do índice de seleção FAI-BLUP ranqueou-se as 124 famílias com o intuito de selecionar as 20 melhores que sofrerão extração de linhagens. A partir das 20 famílias selecionadas foram estimados, para todos os caracteres significativos, ganhos de seleção direta (- 5.73% a -27.36%) e simultânea pelo FAI-BLUP (-0.15% a -9.34%). As 124 famílias foram agrupadas pelo método de Tocher em 3 grupos de diversidade e um destes grupos foi dividido em 30 subgrupos pelo mesmo método. As 20 famílias selecionadas pelo índice foram alocadas em 11 subgrupos de dissimilaridade genética, o que mostra que o índice considera, em parte, a diversidade genética na seleção. As 20 melhores e as 20 piores famílias também apresentaram diversidade genética pelo gráfico biplot. Assim, conclui-se que as populações oriundas dos cruzamentos CVIII 8511 x VC 25 e Pérola x VC 25 apresentam potencial para a extração de linhagens superiores considerando as características resistência a murcha-de-Fusarium, arquitetura de plantas, produtividade de grãos e aspecto comercial de grãos. / Common bean is susceptible to several diseases, among them Fusarium wilt. Fusarium wilt is a very common disease in the areas of bean planting and can lead to losses of up to 100%. In addition to resistance, bean breeding seeks for lineages that are productive, with erect plant architecture and commercially acceptable grains. Thus, the objective of this work was the identification of inbred families of common bean, aiming the extraction of superior inbred lines considering resistance to Fusarium wilt, plant architecture, grain commercial aspect and grain yield. The families evaluated were obtained from two populations selected from a set of hybrids originated from a diallel cross. The populations obtained from the crosses CVIII 8511 x VC 25 (population 1) and Pérola x VC 25 (population 2) were the ones that showed potential regarding grain yield and resistance to Fusarium wilt. Ninety population 1 inbred families and 34 population 2 inbred families along with 7 controls (breeders and commercial varieties) were evaluated in three field harvests / generations (F 2:3 , F 2:4 and F2 :5 ). The evaluated characteristics were days of emergence to flowering (DEF), plant architecture (ARQ), grain yield (PROD), commercial aspect of grain (GRÃO), and severity of Fusarium wilt (FUS), bacterial blight (CREST) and white-mold (MOFO). The data obtained were analyzed using a mixed model methodology. Significance was observed for the effect of families on most of the characters except for DEF, ARQ (F 2:5 ) and PROD (F 2:5 ). This indicates genetic variability among the evaluated families. Using the FAI-BLUP selection index, the 124 families were ranked in order to select the 20 best that will undergo inbred line extraction. From the 20 families selected, considering all the significant characters, direct selection gains (-5.73% to -27.36%) and simultaneous FAI- BLUP gains (-0.15% to -9.34%) were estimated. The 124 families were grouped by the Tocher method into 3 diversity groups and one of these groups was divided into 30 subgroups by the same method. The 20 families selected by the index were allocated in 11 subgroups of genetic dissimilarity, which shows that the index considers the genetic diversity in the selection. The 20 best and the 20 worst families also presented genetic diversity by the biplot graph. Therefore, it is concluded that the populations obtained from the crossings CVIII 8511 x VC 25 and Pérola x VC 25 shows potential for the extraction of superior inbred lines considering resistance to Fusarium wilt, plant architecture, grain commercial aspect and grain yield.

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