Orientador: Mario Luiz Teixeira De Moraes Moraes / Coorientador: Ana Veruska Cruz da Silva / Banca: Alexandre Magno Sebbenn / Banca: Celso Luis Marino / Banca: Bruno Cesar Rossini / Banca: Evandro Vagner Tambarussi / Resumo: Estudos sobre ecologia e genética de populações são fundamentais para entender os efeitos da fragmentação sobre espécies florestais. Um estudo baseado em genética quantitativa e marcadores microssatélites foi realizado para investigar a diversidade genética, estrutura genética espacial, sistema de reprodução e a dispersão de pólen em uma população natural e em um teste de progênies de Genipa americana L. para fins de conservação e melhoramento genético. As coletas foram realizadas em duas populações: a primeira localizada no nordeste do Brasil, em uma área de transição entre a Mata Atlântica e a Caatinga (POP-SE) e a segunda no sudeste, em um Banco Ativo de Germoplasma estabelecido em área de transição entre a Mata Atlântica representada pela Florestal Estacional Semidecidual e o Cerrado (POP-SP). Foram coletados tecidos foliares de 30 árvores matrizes e 20 plantas/progênie em cada uma das populações. As análises do sistema de reprodução foram realizadas com base no modelo misto de reprodução e modelo de cruzamentos correlacionados. Como esperado em espécies dióicas, todas as progênies foram originadas de cruzamento (tm = 1). A taxa de cruzamento entre parentes (tm - ts) e a correlação de paternidade (rp) foram variáveis entre famílias (tm - ts= 0,03-0,19; rp= 0,04-0,40). O índice de fixação (F) foi significativamente menor em adultos que em progênies, indicando seleção contra indivíduos endogâmicos. A correlação de paternidade dentro de frutos (0,40) foi maior que entre ... / Abstract: Studies about ecology and population genetics are essential to understand the effects of fragmentation on forest species. A study based on quantitative genetics and microsatellite markers was conducted to investigate the genetic diversity, spatial genetic structure, mating system and pollen dispersal in a natural population and onan progenies test of Genipa americana L. aiming conservation and breeding. Samples were collected in two populations: the first located in the northeast of Brazil, in a transition area between the Atlantic Forest and Caatinga (POP-SE) and the second in the southeast, in an Active Germplasm Bank established in area transition between the Atlantic represented by Forest Semideciduous and the Cerrado (POPSP). Leaf tissues were collected from 30 seed-trees and 20 plants/progeny in each of the populations. The analysis of the mating system were performed based on the mixed mating model and correlated crosses model. As expected in dioecious species, all offspring were originated from outcrossing ( m t = 1). The mating among relatives rate ( m s t t ) and paternity correlation ( p r ) were variable among families ( m s t t = 0.03-0.19; p r = 0.04-0.40), especially in NP. Fixation index ( F ) was generally significant lower in the adults than offspring, indicating selection against inbreed individuals. The paternity correlation within fruits (0.40) was higher than among fruits (0.26), indicating that lower effective number of pollen donors ( ep N ) within fruit (2.5) than among fruits (3.8). Due to the highest p r in NP, the effective size within families ( e N ) was lower in NP (2.69) than PT (3.27). The Spearman ranking correlation showed that the increase in ep N increase the genetic diversity and e N within families. The pollen dispersal pattern was strongly leptokurtic, suggesting long pollen dispersal distance (mean= 179 m). ... / Doutor

Orientador: Leila Trevisan Braz / Coorientador: Pedro Luiz Martins Soares / Banca: Vanessa dos Santos Paes-Takahashi / Banca: Walter Maldonado Junior / Resumo: Devido ao potencial danoso e existência de inúmeras raças de míldio da alface (Bremia lactucae Regel), vários países realizam a identificação e monitoramento destas raças através do uso de cultivares diferenciadoras de alface. A identificação de resistência a outras doenças importantes nestas cultivares seria de grande valia para o melhoramento da alface, permitindo a seleção simultânea para doenças. Dentre os patógenos de solo, destacam-se os nematoides de galha (Meloidogyne spp.) por seus danos e dificuldade de controle. O presente trabalho teve como objetivo avaliar a resposta das cultivares diferenciadoras de míldio (C-Set) à M. javanica e M. incognita. O experimento foi conduzido em delineamento inteiramente casualizado, com oito repetições e população inicial de 1.000 ovos e juvenis. As avaliações foram realizadas pelos critérios fator de reprodução e índice de reprodução, 75 dias após a inoculação. Os dados foram submetidos à análise de variância e as médias comparadas pelo teste de Scott-Knott a 5% de probabilidade. Todos as cultivares são suscetíveis a M. incognita. As cultivares Argelès, Kibrille, Balesta, Colorado, Design, Bartoli e NunDm15 são classificados como resistentes a M. javanica pelo fator de reprodução e podem ser explorados para seleção simultânea ao míldio e a esta espécie de nematoide. / Abstract: Due to the harmful potential and existence of numerous races of lettuce downy mildew (Bremia lactucae Regel), several countries perform the identification and monitoring of these races through the use of differential lettuce cultivars. The identification of resistance to other important diseases in these cultivars would be of great value for the lettuce's breeding, allowing the simultaneous selection for diseases. Among the soil pathogens, the most important are the root-knot nematodes (Meloidogyne spp.) due to their damage and difficulty of control. In the present work it was evaluated the response of these differential cultivars (C-Set) to M. javanica and M. incognita. The experiment was conducted in a completely randomized design, with eight replications and initial population of 1.000 eggs and juveniles. The evaluations were performed by the criteria of reproduction factor and reproduction index, 75 days after inoculation. Data were submitted to analysis of variance and the means were compared by Scott-Knott test at 5% probability. All cultivars are susceptible to M. incognita. The cultivars Argelès, Kibrille, Balesta, Colorado, Design, Bartoli and NunDm15 are classified as resistant to M. javanica by the reproduction factor and can be exploited for simultaneous selection to mildew and this species of nematode. / Mestre

Orientador: Gustavo Vitti Môro / Coorientador: Cristiano Zerbato / Coorientador: Antonio Sergio Ferraudo / Banca: Teresa Cristina Tarlé Pissarra / Banca: Viviane Formice Vianna / Resumo: O melhoramento vegetal, além de buscar as características de interesse, busca também otimizar o processo. Sendo assim, quando há correlação entre as características de interesse e uma de fácil avaliação, abre-se a vertente para a seleção indireta. A utilização de sensores na agricultura possibilita a avaliação sem contato físico, podendo ser uma nova ferramenta na seleção indireta, visando otimizar tempo, mão de obra, custo e o processo. Objetivou-se estudar a relação entre o Índice de Vegetação por Diferença Normalizada (NDVI) e os caracteres agronômicos, na seleção indireta em milho e selecionar os genótipos superiores utilizando técnicas multivariadas. O experimento foi conduzido na segunda safra de 2016, sendo realizadas as medições de NDVI via sensor ativo terrestre, a cada 15 dias após a emergência das plântulas e as avaliações agronômicas de campo considerando os caracteres: altura de planta, altura da espiga principal, acamamento, quebramento, estande e produtividade. O conjunto de variáveis obtidas foram submetidas as análises multivariadas de fatores e de componentes principais. A análise de fatores detectou, no primeiro fator, correspondências positivas entre as variáveis, altura de planta, altura de espiga e produtividade, no segundo fator NDVI-80, NDVI-95 e acamamento mais quebramento e no terceiro fator NDVI-15 e estande. Os gráficos biplots gerados pelos componentes principais, juntamente com análise de ganho de seleção permitiram identificar o genótip... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The plant breeding look beyond the characteristics of interest, look to optimize process, so when there is a correlation between the characteristics of interest and one of easy evaluation, a strand is opened for indirect selection. The use of sensors in agriculture makes possible to evaluate without physical contact and it can be a new tool in the indirect selection, aiming to optimize time, work, cost and optimize process. The objective of this study was to analyse the relationship between Normalized Difference Vegetation Index (NDVI) and agronomic traits, in the indirect selection and to select superior genotypes of maize by multivariate analyse. The experiment was conducted in the second crop of 2016, and NDVI was measurements by an active sensor every 15 day after seedling and field agronomic traits were evaluated considering the following characteristics: plant height, ear height, stalk lodging, stalk breakage, stand and yield. With these data were processed the factor analyzes, principal component and gain selection. The factor analysis detected positive correspondences between the variables, plant height, ear height and yield with factor 1; NDVI-80, NDVI-95 and stalk lodging plus stalk breakage with factor 2; NDVI- 15 and stand with factor 3. The graphics biplots generated by the principal components with gain selection analyze allowed to identify the best genotype, where we could identify the genotype 3 as the most promising, because it present lower lodgin... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Orientador: Gustavo Vitti Môro / Coorientador: Fabíola Vitti Môro / Banca: Ivana Marino Bárbaro Torneli / Banca: Sandra Helena Unêda Trevisoli / Banca: Gustavo Hugo Ferreira de Oliveira / Banca: Viviane Formice Vianna / Resumo: A pesquisa teve como principais objetivos estudar a correlação entre caracteres, estimar a capacidade de combinação e discriminar grupos em linhagens de milho. Para isso, foram avaliadas três safras (2015/2016; 2016; 2016/2017), nas quais 85 linhagens de milho foram cruzadas com um testador de base ampla em topcross. O delineamento experimental utilizado foi o de blocos casualizados, com duas repetições. Foram analisados os caracteres produtividade, prolificidade, altura de planta e de espiga, posição relativa de espiga, acamamento e quebramento. O programa computacional GENES foi utilizado para a realização das análises de variância individual e conjunta, bem como análise de trilha. Com o programa computacional Statsoft foram feitas duas análises multivariadas, uma de agrupamento hierárquico de Ward e outra de agrupamento não hierárquico de K-means. A partir dos resultados da análise de trilha, observou-se que nenhuma variável seria adequada para seleção indireta dos genótipos, sendo indicada a seleção pela produtividade. A capacidade geral de combinação para produtividade foi realizada e esta permitiu destacar genótipos superiores e com bom desempenho nas três safras. As análises multivariadas possibilitaram a separação dos genótipos em grupos distintos e foram complementares para direcionar a escolha dos cruzamentos mais divergentes. / Abstract: The aim of this study was to evaluate the correlation between traits, estimate the combining ability and discriminate groups in maize lineages. For this, three harvest seasons (2015/2016, 2016, 2016/2017) were evaluated, in which 85 maize lineages were crossed with a broad genetic base tester by topcross. The experimental design was a randomized block design, with two replicates. The studied traits were grain yield, prolificacy, plant height and ear height, ear placement, lodging and breaking. The GENES software was used to perform individual and joint analysis of variance, as well as pathway analysis. The Statsoft software was used to perform two multivariate analysis, Ward hierarchical cluster analysis and K-means nonhierarchical cluster analysis. The results from pathway analysis revealed that no variable would be suitable for indirect selection of the genotypes, so that selection by the grain yield is indicated. The general combining ability for grain yield was obtained, highlighted the superior genotypes with good performances in the three harvest seasons. Multivariate analysis allowed the separation of the genotypes into distinct groups and were complementary to point out the most divergent crosses. / Doutor

Orientador: Rinaldo Cesar de Paula / Banca: Otávio Camargo Campoe / Banca: Gustavo Vitti Môro / Banca: Paulo Henrique Muller da Silva / Banca: Mário Luiz Teixeira de Moraes / Resumo: O estresse hídrico é um dos principais fatores que limitam a produtividade e alteram a adaptação de espécies florestais no mundo. Apesar de espécies de eucalipto possuírem boa capacidade adaptativa, os riscos inerentes de vulnerabilidade climática implicarão na seleção genética e direcionamentos adequados para as regiões de plantio. Assim, um programa de melhoramento florestal deve considerar a interação genótipo x ambiente, uma vez que sua existência exige do melhorista um estudo detalhado do comportamento dos genótipos nos diferentes ambientes, por meio da análise de adaptabilidade e estabilidade. Sendo o tempo um dos grandes desafios para os melhoristas florestais, a adoção de procedimentos que permitam antecipar a identificação de genótipos produtivos e tolerantes ao déficit hídrico é desejável. Logo, a inserção de avaliações biométricas e fisiológicas na fase jovem das plantas, com vista a encontrar relações com a produtividade frente à restrição hídrica, pode ser relevante nos programas de melhoramento com eucalipto; ou de outro modo, pode se tornar indispensável nas estratégias dos melhoristas, tendo em vista o cenário de mudanças climáticas que poderá afetar a adaptação dos genótipos nos plantios de eucalipto em todo o mundo. O objetivo geral do presente trabalho foi estudar a interação G x A de clones de Eucalyptus em diferentes locais e idades, consequentemente verificar a adaptabilidade e estabilidade dos genótipos e, além disso, avaliar características biométricas... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Water stress is one of the main factors responsible for limiting productivity and changing the adaptation of forest species in the world. Although planted eucalyptus forests have good adaptive capacity, the inherent risks of climate vulnerability will imply genetic selection and proper directions for the planting regions. In this sense, a forest improvement program should consider the genotype x environment interaction, since its existence requires the breeder to a detailed study of the behavior of individuals throughout the environments, through the analysis of adaptability and stability. In view of the time as one of the great challenges for the forest improvers, the adoption of procedures that allow to anticipate the identification of productive genotypes and tolerant to the water deficit is desirable. Therefore, the insertion of biometric and physiological evaluations in the young phase of the plants, in order to find relationships with genotype productivity against water restriction, may be relevant in breeding programs with eucalyptus; or otherwise, may become indispensable in the strategies of the breeders in view of the alarming scenario of climate change that may affect the adaptation of genotypes to eucalyptus plantations around the world. The general objective of the present work was to study the G x A interaction of Eucalyptus clones at different sites and ages, thus verifying the adaptability and stability of the genotypes and, in addition, to evaluate biometric and physiological characteristics in different irrigation regimes in the seedling stage, under controlled conditions, in order to investigate the possibility of correlating the observations obtained with the performance in the field. For this, 11 clones were evaluated in 11 sites in the Brazilian territory, and joint evaluation methods were applied for the stu... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Orientador: Dilermando Perecin / Coorientador: Gabriela Aferri / Coorientador: Mauro Alexandre Xavier / Banca: Ivan Antônio dos Santos / Banca: Gustavo Vitti Môro / Resumo: Os programas de melhoramento genético de cana-de-açúcar, na busca por novas cultivares, desenvolvem métodos e estratégias para acelerar a seleção nas fases iniciais de indivíduos superiores. Dentro deste contexto, o objetivo do presente trabalho consistiu na avaliação do uso de Mudas Pré-brotadas - MPB, nas fases iniciais do programa de melhoramento genético, como ferramenta para o aumento da taxa de multiplicação vegetativa. E, comparar os resultados de rendimento por área de três séries de hibridação, 2009/2010 e 2012, e de clones em validação na fase de ensaio Regional. Assim, espera-se um rápido aumento na quantidade de material propagativo, possibilitando partir de uma touceira na fase inicial para a instalação de ensaio na fase avançada do programa. Na série de hibridação 2012 do Programa Cana do Instituto Agronômico de Campinas, após a seleção massal dos genótipos superiores na Fase I priorizando indivíduos filhos de dois genitores de interesse, foi selecionado um grupo de genótipos e produzidas as MPB's para instalação de um ensaio na fase subsequente. Antes da primeira colheita, foram avaliados os parâmetros qualitativos como: porte, fechamento de entrelinha e fitossanidade. A partir dessa avaliação foram selecionados 5 genótipos (G1 - redução temporal, série 2012) para compor um agrupado de clones da fase intermediária de 17 genótipos (G2 - anos sucessivos de plantio de colmos, séries 2009 e 2010). Em seguida, foram produzidas as mudas para a instalação de Ensaio Re... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Sugarcane breeding programs, in the search for new cultivars, develop methods and strategies to accelerate selection in the early stages of higher individuals. In this context, the objective of this work was to evaluate the use of pre-budded seedlings - PBS, in the initial stages of the genetic improvement program, as a tool to increase the rate of vegetative multiplication. And, compare yield results by area of three hybridization series, 2009/2010 and 2012, and clones in validation in the regional testing phase. Thus, a rapid increase in the amount of propagation material is expected, making it possible to start from a clump in the initial phase for the test facility at the advanced stage of the program. In the 2012 hybridization series of the Cana Program of the Agronomic Institute of Campinas, after the mass selection of the superior genotypes in Phase I prioritizing individuals born to two parents of interest, a group of genotypes was selected and the PBS were produced for the installation of a test in the phase subsequent. Before the first harvest, the qualitative parameters were evaluated as: size, interlining closure and phytosanity. From this evaluation, 5 genotypes (G1 - temporal reduction, series 2012) were selected to form a group of clones of the intermediate phase of 17 genotypes (G2 - successive years of planting of stalks, 2009 and 2010 series). The seedlings were then produced for the installation of a Regional Trial in 4 locations, in a completely randomized block design, with 3 replicates, providing a greater uniformity in the experimental field installation. The use of PBS increased the evaluation area by 1,340% and reduce evaluation time. In the cane cycle of the Regional Trial there was no increment for the TSH attribute in the 2009 and 2010 series, and small gain in the series 2012. With highlig... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Orientador: Dilermando Perecin / Coorientador: Mauro Alexandre Xavier / Coorientador: Marcos Guimarães de Andrade Landell / Banca: Ivan Antônio dos Anjos / Banca: Gustavo Vitti Môro / Resumo: Os programas de melhoramento de cana de açúcar, tem como objetivo principal gerar novos cultivares que sejam melhores adaptadas às condições edafoclimaticas a eles impostas, gerando ganhos em algum aspecto seja, em produtividade de colmos e açúcar por hectare, acúmulo de sacarose, sanidade, entre outros, aos produtores que os adotam. Sabendo disso e ciente da importância que a cana de açúcar representa para o Brasil, o presente trabalho compara diferentes métodos de seleção de famílias Blup relativo (Blup rel) e Blup sequencial Australiano (Blupseq) comparadas com a seleção Massal, aplicadas à primeira fase (Fs1) do programa de melhoramento, mantendo os comparativos junto a segunda fase (Fs2), em dois locais, Assis-SP e Ribeirão Preto-SP. Foram avaliados 65 famílias da série 2014 do programa de melhoramento genético do IAC Na primeira fase (Fs1), os ensaios foram instalados em dois blocos casualizados sendo cada unidade experimental constituída inicialmente por 96 indivíduos, avaliados no ciclo de cana soca. No experimento segunda fase (Fs2) foram avaliados no total 274 indivíduos em Ribeirão Preto e 217 em Assis. Os resultados do experimento primeira fase (Fs1) apontam similaridade entre os métodos avaliados, em Assis não foram observadas diferenças significativas entre os métodos, já em Ribeirão Preto os métodos Massal e Blupseq apresentaram as maiores concentrações de indivíduos superiores. No experimento segunda fase (Fs2), o método Blupseq apresenta as maiores concentraç... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The Sugar cane breeding programs have as main objective to generate new cultivars that are better adapted to the edaphoclimatic conditions imposed by them, generating gains in some aspect be it yield of stalks and sugar per hectare, accumulation of sucrose, health, among others, to the producers who adopt them. Knowing this and aware of the importance that sugar cane represents for Brazil, the present work compares different methods of selection of Relative Blup (Bluprel) and Australian Blupseq (Blupseq) compared to Massal selection, applied to the first phase (Fs1) of the breeding program, maintaining the comparatives next to the second phase (Fs2), in two locations, Assis-SP and Ribeirão Preto-SP. We evaluated 65 families from the 2014 series of the breeding genetic program the IAC. In the first phase (Fs1), the trials were installed in two randomized blocks, each experimental unit initially composed of 96 individuals, evaluated in the cane soca cycle. In the second phase experiment (Fs2), a total of 274 individuals were evaluated in Ribeirão Preto and 217 in Assis. The results of the first phase experiment (Fs1) show similarity between the evaluated methods, in Assis no significant differences were observed between the methods, whereas the Massal and Blupseq methods presented the highest concentrations of superior individuals in Ribeirão Preto. In the second phase experiment (Fs2), the Blupseq method presents the highest concentrations of higher individuals in both sites,... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Orientador: Celso Luís Marino / Coorientador: Edson Luís Marino / Banca: Leonardo Novaes Rosse / Banca: Izabel Christina Gava de Souza / Resumo: O setor florestal brasileiro, em grande maioria advindos de plantios de eucalipto, é destaque no mercado de florestas plantadas, tornando-se um dos mais relevantes no cenário global, para produção de matéria-prima para diversas indústrias e consequentemente movimentando a economia do país. Assim, é crescente a necessidade de estudos que visem compreender fatores que afetam diretamente a produção da cultura. Dentre estes fatores, destacam-se os ligados diretamente as doenças bióticas, sendo causadas por diferentes patógenos fúngicos e bacterianos. Nos últimos anos observa-se o aumento gradativo de doenças de origem bacteriana, como as causadas por Ralstonia solanacearum, Xanthomonas sp. e Pseudomonas sp. e mais recente a seca de ponteiros causada por bacterioses. Sendo assim, o presente trabalho realizou a diferenciação entre essas, bem como, buscou o entendimento através da caracterização bioquímica, molecular, patogênica e epidemiológica da bacteriose causadora de seca de ponteiros em eucalipto, a fim de servir como base para tomadas de decisão em práticas de manejo para controle e erradicação. Através desse estudo, conclui-se que o sintoma de necrose apical seguida de seca dos ponteiros do eucalipto é causado pelo complexo de enterobactérias Erwinia psidii e Pantoea eucalypti e que esse causa danos e prejuízos consideráveis para mudas e árvores do gênero. / Abstract: The Brazilian forestry sector in its majority coming from plantations of Eucalyptus has been highlighted in a global scenario due to the large production of raw material to various industries and, thus, driving the economy. Thus, studies aimed at understanding factors that directly affect crop production are extremely relevant. Among these factors, those directly linked to biotic diseases are highlighted, being caused by different fungal and bacterial pathogens. In recent years, it is possible to observe the gradual increase of bacterial diseases, such as those caused by Ralstonia solanacearum, Xanthomonas sp. and Pseudomonas sp. and more recently the die back caused by a bacteriosis. Therefore, the present work seeks to differentiate bacterioses, as well as to understand through the biochemical, molecular and pathogenic characterization of the bacteriosis whith causes die back in eucalyptus, in order to serve as a basis for decision-making in management practices for control and eradication of this disease. Throughout this study, it was possible to conclude that the symptom of apical necrosis followed by the die back in eucalyptus is caused by the complex of enterobacteria Erwinia psidii and Pantoea eucalypti and it causes considerable damages and losses to seedlings and trees of this genus. / Mestre

Orientador: Celso Luis Marino / Coorientador: Zengjian Jeffrey Chen / Banca: Jesus Aparecido Ferro / Banca: Claudia Barros Monteiro Vitorello / Banca: Carlos Alberto Labarte / Banca: Ivan de Godoy Maia / Resumo: O Eucalyptus é um dos gêneros mais importantes no setor florestal mundial. Por esse motivo, programas de melhoramento genético florestal são desenvolvidos no intuito de aumentar a produtividade, introduzir características desejáveis e reduzir impactos ambientais. No entanto, características deletérias podem ser incorporadas em determinados cruzamentos nos ciclos de melhoramento, seja por endogamia biparental ou segregação de loci heterozigóticos. As anomalias são um exemplo deste efeito e podem acarretar perdas na produção de mudas, na produtividade e atrasos no desenvolvimento de genótipos elite. Portanto, a identificação e caracterização de genes relacionados às anomalias são muito importantes nos programas de melhoramento. Ao realizar um cruzamento controlado entre dois indivíduos de Eucalyptus grandis, a empresa Suzano Papel e Celulose detectou uma anomalia com segregação mendeliana de 3 (normais) :1 (anormais) na progênie. As plântulas anômalas morrem em poucos meses e diferem significativamente em algumas características morfológicas, como altura, diâmetro da base do caule, dimensões e forma do limbo foliar e número de ramificações laterais. Estudos prévios permitiram identificar uma marca molecular ligada à anomalia que apresentou identidade com genes da superfamília Bet v1, família PR10 (pathogenesis-related protein 10). No entanto, não era claro o envolvimento desta família gênica no desenvolvimento da anomalia. Neste cenário, o presente trabalho teve como objetivo a identificação e caracterização dos genes envolvidos na anomalia detectada. Genes e vias metabólicas, diferencialmente expressos entre os fenótipos contrastantes, demonstraram elevada atividade em processos relacionados à resposta de defesa nas plantas anormais. Tais resultados sugerem que a anomalia é causada pela ativação inadequada do sistema imune da planta (resposta autoimune) associado à incompatibilidade ... / Abstract: Eucalyptus is one of the most important genus in worldwide forestry culture. For this reason forest improvement programs are developed aiming the increase of productivity, the introduction of desirable traits and the reduction of environmental impacts. However deleterious traits can be incorporated in certain crossings through the recurrent improvement cycles either by biparental inbreeding or by segregation of the heterozygous loci. Anomalies are an example of this deleterious effect and they can cause losses in seedling production, productivity and delays in the elite genotypes development. Thus, the identification and characterization of genes related to the anomalies are very important in forest improvement programs. In a controlled cross between two Eucalyptus grandis individuals, the Suzano Papel and Celulose SA company has detected an anomaly with Mendelian segregation ratio of 3 (normal) :1 (abnormal) in the progeny. Abnormal seedlings die in a few months and show significant difference in some morphological characteristics, such as height, stem-base diameter, dimensions and shape of leaf lamina, and number of branches. Previous studies allowed the identification of a molecular marker related to the anomaly that showed identity with Bet v1 superfamily genes, PR10 family (pathogenesis-related protein 10). However, it was not clear the involvement of this gene family in the anomaly. In this scenario, the present study aimed to identify and characterize the genes involved in the detected anomaly. Genes and metabolic pathways, differentially expressed between the contrasting phenotypes, showed high activity of process related to defense response in abnormal plants. These results suggest that the anomaly is caused by the inappropriate activation of the immune system of the plant (autoimmune response) associated with genetic incompatibility. The gene families of thaumatin-like proteins, Bet v1 proteins, and chitinase class I proteins ... / Doutor

A realização deste estudo teve como objetivo a estimação de componentes de (co) variância e parâmetros genéticos das características: peso (PES18), perímetro escrotal (PE18), precocidade de acabamento (PREC), musculosidade (MUSC) e altura (ALT), mensuradas aos 18 meses de idade, ganho de peso da desmama ao sobreano (GP345) e idade ao primeiro parto (IPP) de bovinos Nelore, utilizando-se modelos multicaracterísticas. Foram avaliados dados de 107.332 mil bovinos criados entre os anos de 1994 e 2009 em fazendas localizadas nos estados de São Paulo, Mato Grosso do Sul e Goiás, e pertencentes ao Programa de Seleção da raça Nelore da Agropecuária CFM Ltda. Utilizaram-se três diferentes modelos: modelo multicaracterísticas padrão, modelo de componentes principais e de análise de fatores, esses dois últimos contemplando os três primeiros componentes e fatores, os quais foram comparados por critérios de informação de Akaike (AIC) e Bayesiano de Schwarz (BIC). O modelo que utilizou a técnica da análise de fatores contemplando os dois primeiros fatores (MFA2) apresentou melhor ajuste, seguido do modelo que contemplou os 3 primeiros fatores (MFA3). Estes possibilitaram estimativas próximas das realizadas pelos modelos multicaracterísticas padrão, às quais se mostraram parecidas com os valores já relatados e estimados no Brasil. / This study was objectified the estimation of (co)variance components and genetics parameters of traits: weight (W18), scrotal circumference (SC18), precocity finishing (PREC), muscularity (MUSC) and height (H), measured at 18 months of age, weight gain from weaning to yearling (WG345) and age at first calving (AFC) from Nellore cattle, using multi trait models, with analysis multi trait standard, analysis of principal components and factor analysis. Were evaluated data from 107,332 bovines, managed between the years of 1994 and 2009 in farms localized on states of São Paulo, Mato Grosso do Sul and Goias, and were participants in Nellore Selection Program from CFM Company Ltda. Was utilized three different models, multi trait model, model of principal components and factor analytic, these two last contemplating the four first principal components and factors analytics and that was compared by information criteria of Akaike (AIC) and Bayesian of Schwarz (BIC). The model that used the factor analysis technique contemplating the first two factors (MFA2) presented better adjustment, followed by the model that contemplated the first 3 factors (MFA3). These allowed close estimates to those performed by the standard multi trait models, which were similar to the values already reported and estimated in Brazil.