Submitted by Jean Medeiros (jeanletras@uepb.edu.br) on 2016-05-11T13:46:12Z No. of bitstreams: 1 PDF - Ubieli Alves Araújo Vasconcelos.pdf: 1747559 bytes, checksum: 9c92c8208f13fd0636cc2431631976dc (MD5) / Approved for entry into archive by Secta BC (secta.csu.bc@uepb.edu.br) on 2016-07-21T20:46:01Z (GMT) No. of bitstreams: 1 PDF - Ubieli Alves Araújo Vasconcelos.pdf: 1747559 bytes, checksum: 9c92c8208f13fd0636cc2431631976dc (MD5) / Approved for entry into archive by Secta BC (secta.csu.bc@uepb.edu.br) on 2016-07-21T20:46:10Z (GMT) No. of bitstreams: 1 PDF - Ubieli Alves Araújo Vasconcelos.pdf: 1747559 bytes, checksum: 9c92c8208f13fd0636cc2431631976dc (MD5) / Made available in DSpace on 2016-07-21T20:46:10Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PDF - Ubieli Alves Araújo Vasconcelos.pdf: 1747559 bytes, checksum: 9c92c8208f13fd0636cc2431631976dc (MD5) Previous issue date: 2016-02-24 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Cotton is a crop of large economic value at worldwide. The Brazilian production is around 1.5 million tons, coming mainly from the Mid West, Southeast and Northeast region, specially Cerrado areas. Despite to importance of crop to Brazil, there is a broad demand to investment in breeding area focusing on selection of promising genotypes as to yield and regional adaptation. In order to attend this demand, breeding programs have focused on generation of different lines by hybridization, using robust genitors, aiming broaden the genetic background of the lines and to favor the selection procedures. In this study we used 20 cotton lines, obtained through diallel crosses with parents of Moco and herbaceous types, aiming to estimate the GCC and SCC in materials tolerant to drought, based on agronomic traits. The study was carried out in semiarid environment, at Barbalha Station, CE, in dry season, using water supplementation. After the appearance of the first buds, plants were subjected to 23 days of water suppression, and re-established watering thereafter. The experimental design was randomized blocks, with 20 treatments and factorial scheme (20 x 2), and three replications. The variables evaluated were: plant height, Productivity, fiber percentage, Boll weight, Rising of first flower and Rising of first boll. Additionally, total chlorophyll content in leaves was determined. The statistical analysis wasperformed by GENE program. Analyses of combinatorial capacities were performed according to the method adapted by Griffing (1956), which estimates the effects of GCC of each parent and the effects of SCC. There was wide variation between the parents for the analyzed variables. The follow parents showed best estimates of GCA, and therefore, have more favorable alleles, based on traits studied: BRS 286, CNPA 5M and CNPA 7MH. To SCC, the hybrids BRS 286 X CNPA 5M, BRS RUBI X CNPA 5M and BRS 286 X BRS Serido demonstrated complementarity Plant hight and porductivity. The estimates of GCC and SCC presented in this paper provided valuable inputs to cotton improvement, as to both parents and hybrid selections. / O algodão é uma cultura de grande importância econômica mundialmente. No Brasil a produção encontra-se na faixa de 1,5 milhões de toneladas, oriundas principalmente das regiões Centro - Oeste, Sudeste e Nordeste, com maior área situada nos Cerrados. Apesar do crescimento da cultura em nível nacional, há necessidade de investimento na área de melhoramento genético com fins de selecionar genótipos promissores para produção e adaptação regional. Para tanto, os programas de melhoramento têm focalizado na geração de linhagens divergentes, por meio de hibridações com progenitores robustos, de modo a ampliar a base genética das linhagens e favorecer os procedimentos de seleção. Nesse trabalho utilizou-se uma população composta de 20 híbridos de algodão, obtida via cruzamentos dialelicos com genitores dos tipos arbóreo e herbáceo, objetivando estimar as CGC e CEC dos materiais tolerantes a seca, focalizando em caracteres agronômicos. O trabalho foi conduzido em ambiente semiárido, em Barbalha, CE, em regime de sequeiro com complementação hídrica.Após o surgimento dos primeiros botões florais, as plantas foram submetidas a 23 dias de supressão hídrica, sendo restabelecidas as regas após esse período. O delineamento experimental adotado foi de blocos ao acaso, com 20 tratamentos, com esquema fatorial 20 x 2, e três repetições. As variáveis avaliadas foram: Altura de planta, Produtividade, Percentagem de fibras, Peso de um capulho, Surgimento da primeira flor e Surgimento da primeira maçã. Adicionalmente, determinou-se o teor de Clorofila total nas folhas. As analises estatísticas foram realizadas pelo programa GENES. As análises das capacidades combinatórias foram realizadas de acordo com o modelo adaptado por Griffing (1956), que estima os efeitos da capacidade geral de combinação CGC de cada parental e os efeitos da capacidade específica de combinação CEC. Verificou-se ampla variabilidade entre os genitores para as variáveis analisadas. Os genitores que apresentaram as melhores estimativas de CGC e com maior número de alelos favoraveis para as principais características estudadas foram BRS 286, CNPA 5M e CNPA 7MH, enquanto que para CEC, os híbridos BRS 286 X CNPA 5M, BRS RUBI X CNPA 5M e BRS 286 X BRS SERIDO destacaram-se por demonstrar melhores estimativas de CEC e complementaridade para ALT e PROD em condições de estresse hídrico. As estimativas de CGC e CEC ofereceram contribuições valiosas no processo de seleção no melhoramento genético, tanto de genitores como de combinações hibridas.

Gramíneas do gênero Brachiaria apresenta importância econômica como forrageiras no Brasil. O melhoramento genético, entretanto, é restrito devido a diferenças de ploidia entre os genótipos e a reprodução por apomixia. A indução de haplóides e duplo-haploides pelo cultivo in vitro de anteras ou de micrósporos isolados é relatada em diversas espécies. Além da criação de novos genótipos linhagens duplo-haplóides podem ser utilizadas como ferramentas para o estudo de marcadores moleculares. Dentre os fatores essenciais para o sucesso da técnica está o estádio do desenvolvimento do micrósporo, sendo o estádio uninucleado, geralmente, o mais responsivo. Um dos objetivos deste trabalho foi contribuir para a definição de parâmetros para a cultura de haplóides em Brachiaria. Flores e anteras isoladas de B. brizantha (B105) em diferentes estádios de desenvolvimento foram processadas para microscopia de luz. Os eventos observados foram associados a marcadores morfologicos. Experimentos de cultura de anteras foram estabelecidos e estruturas semelhantes a calos ocorreram em pouco explantes. Secções histológicas revelaram a ocorrência de micrósporos com divisão simétrica, indicando um possível desvio da rota do micrósporo para a rota esporofítica. Genes definidos como marcadores de embriogênese como SERK (SOMATIC EMBRYOGENESIS RECEPTOR-LIKE KINASE), podem ser utilizados para identificar o potencial embriogênico de células ou grupo de células, possibilitando monitorar a resposta in vitro. Duas seqüências parciais de cDNA isoladas de B. brizantha apresentaram alta identidade com homólogos de SERK1 e SERK2 de monocotiledôneas. Análise filogenética confirmou a alta similaridade sugerindo serem os possíveis ortólogos de SERK em Brachiaria, sendo nomeados como BbrizSERK1 e BbrizSERK2. Clones parciais da seqüência genômica foram obtidos. Análise de Southern blot identificou duas cópias deste gene tanto na planta apomítica como na sexual. A análise da expressão de BbrizSERK2 por RT-qPCR na planta apomítica e sexual e durante a embriogênese somática revelou que este gene não é específico de tecidos reprodutivos. Expressão diferencial de BbrizSERK entre ovários apomíticos e sexuais, especialmente durante a megasporogênese, foi observada por hibridização in situ. Detectou-se forte sinal na célula-mãe do megásporo em ovários sexuais e ausência de sinal em ovários apomíticos. Após a antese, a expressão na planta apomítica foi observada apenas na região micropilar e proembriões. Na sexual, foi observada nas antípodas e aparato da oosfera. Em anteras o mesmo padrão de expressão foi observado entre a planta apomítica e sexual, com forte expressão no tapete e nas células-mãe do grão de pólen, o que sugere um importante papel deste gene na esporogênese em Brachiaria. Em calos embriogênicos forte sinal foi observado em massas proembriogênicas, em embriões globulares e também em embriões somáticos mais desenvolvidos, confirmando a função de SERK como marcador de embriogênese em Brachiaria. Em anteras cultivadas in vitro, forte sinal foi observado em micrósporos binucleados com divisão simétrica e em alguns micrósporos vacuolados. Experimentos futuros com genes desta família poderão contribuir para monitorar processos in vitro em Brachiaria, indicando células ou grupos de células com potencial embriogênico, ajudando na definição das melhores condições de cultivo para a embriogênese e também para o estudo da reprodução neste gênero / Brachiaria, gramineae present economic importance as forage in Brazil. The genetic breeding, however, is restricted by differences in ploidy among the genotypes and the apomixis. The development of a haploid and double haploid production has been reported for several species. Besides the production of new genotypes the development of double haploid lineages may be used for studies with molecular markers. Among important factors for the success of haploid plant development relies on the microspore developmental stage, with the uninucleate stage being usually the most responsive. One of the objectives of this work was to contribute for the definition of parameters for the development of haploid cultures in Brachiaria. B. brizantha (B105) flowers and isolated anthers were collected in different stages of development and processed for light microscopy. The events observed were associated to morphological markers. Anther culture experiments were established and calli formation ocurred to a few explants. Histological sections of anthers cultivated in vitro, however, revealled the occurrence of microspores with symmetrical divisions, indicating a possible alternative to the sporophytic route. Genes defined as markers of embryogenesis, such as SERK (SOMATIC EMBRYOGENESIS RECEPTOR-LIKE KINASE), may be utilized to identify the embryogenic potential of cells, or cell clusters, in an attempt to monitor the in vitro response. Two partial sequences of cDna isolated from B. brizantha (B30) showed high identity of these two sequences to SERK1 and SERK2 homologs from monocots. The phylogenetic analysis confirmed high similarity with these genes, indicating that these sequences are possible orthologs of SERK in Brachiaria, hence these were named BbrizSERK1 and BbrizSERK2. Partial clones of genomic sequences were obtained. Southern blot analysis suggested two copies of this gene in both apomictic and sexual B. brizantha. The expression analysis of BbrizSERK2 by RT-qPCR revealed that this gene is not specific to reproductive tissues. Differential expression of BbrizSERK between apomictic and sexual ovaries, especially during megasporogenesis, was observed by in situ hybridization. A strong signal was detected in the megaspore mother cell in sexual ovaries, with absence in apomictic ovaries. After anthesis, the expression in the apomictic plant was observed only in the micropylar region and proembryos, however, in the sexual plant, the expression was observed in the antipodals and egg apparatus. In anthers, the same in situ pattern was observed in the apomictic and the sexual plant, with a strong expression in the tapetum and the pollen grain mother cell, suggesting an important role of this gene in the sporogenesis in Brachiaria. In embryogenic calli, strong signal was observed in proembryogenic masses, globular embryos and somatic embryos in later stages of development, confirming the role of SERK as an embryogenic marker in Brachiaria. In cultivated anthers, a strong signal was observed in binuclear microspores with symmetric division and vacuolated microspores. Further studies with this gene family may contribute to monitoring the in vitro processes in vitro in Brachiaria, defining cells or cell clusters with an embryogenic potential, helping for the definition of culture conditions for embryogenesis and also for reproductive studies in this genus

Submitted by Jean Medeiros (jeanletras@uepb.edu.br) on 2016-03-09T17:56:17Z No. of bitstreams: 1 PDF - Geisenilma Maria Gonçalves da Rocha.pdf: 891700 bytes, checksum: 6a3a21e49105289a64a7197232dd50c3 (MD5) / Approved for entry into archive by Secta BC (secta.csu.bc@uepb.edu.br) on 2016-03-10T17:00:05Z (GMT) No. of bitstreams: 1 PDF - Geisenilma Maria Gonçalves da Rocha.pdf: 891700 bytes, checksum: 6a3a21e49105289a64a7197232dd50c3 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-03-10T17:00:41Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PDF - Geisenilma Maria Gonçalves da Rocha.pdf: 891700 bytes, checksum: 6a3a21e49105289a64a7197232dd50c3 (MD5) Previous issue date: 2015-02-09 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The demand for colored cotton fibers has grown internationally, especially motivated by ecological appeal that management provides. In Brazil, especially in the Northeast, agricultural niches are concentrated in small areas of family-based farmers who adopt both the conventional management as the organic, generating employment and income. The cotton breeding program of Embrapa Cotton has made efforts in developing new varieties of colored fibers in order to contribute to the regional agribusiness growth, nowadays with five cultivars, with fibers of colors ranging from green to various shades of brown. The challenge for researchers, however, is to generate varieties with new shades that can contribute to move the competitive market of the textile industry, especially the natural and dyes free. To advance in this segment, it is essential to understand the molecular basis of the metabolites involved in the synthesis of the color of the fibers so that we can establish strategies for genetic improvement, both by conventional means such as by genetic engineering. It is known that flavonoids are secondary metabolites which confers color to fibers and that depending on the route of biosynthesis, various color tones can be synthesized by events cascade. Being a component of biochemical nature, it is estimated that the identification of genotypes holders of biosynthesized by associated molecular markers, directly or not, to flavonoids. This strategy can configure a useful tool to identify genotypes colored fibers, helping to reduce the time the selection procedures that take between 120 to 150 days for the character can be phenotyped. Seeking to generate information that may help with the colored cotton fiber improvement aimed this work a study of genetic and molecular approaches in colorful cotton accesses, based on analysis of divergence and molecular expression, focusing on fiber specific genes involved in flavonoid biosynthesis. For analysis of genetic diversity, twelve genotypes were phenotyped by ISSR-PCR, using 12 commercial oligonucleotides. The methods of Tocher, UPGMA and 2D Projection were adopted for cluster analysis based on the standard of 50 polymorphic bands. In light of the results, proceeded to the analysis of transcripts expression, using the genes PP2A1, C4H, DFR, ANR and ANS in cDNAs fibers collected at 8, 10 and 18 DPA (after anthesis days) from BRS Rubi, BRS Topázio, BRS 200 and V3 access. In the cluster analysis by UPGMA, there was the formation of six groups being groups B, D and E only those clustered colored materials. The results of the expression through semiquantitative RT-PCR, the amplicons were observed of approximately 200, 290, 1100, 1024 and 1067 bp for PP2A1, C4H, DFR, ANS and ANR, respectively, as expected. We observed increased expression of genes C4H, DFR and ANR in brown color genotypes, suggesting that these genes may be involved in flavonoid biosynthesis brown fibers. The results obtained in this study can be applied in the cotton breeding program aimed at obtaining varieties with new colors or new shades. / A demanda por fibras de algodão colorido tem crescido em nível internacional, motivada especialmente pelo apelo ecológico que o manejo proporciona. No Brasil, especialmente na região Nordeste, os nichos agrícolas se concentram em pequenas áreas de agricultores de base familiar, que adotam tanto o manejo convencional quanto o orgânico, gerando emprego e renda. O programa de melhoramento de algodão da Embrapa Algodão tem envidado esforços no desenvolvimento de novas cultivares de fibras coloridas com o intuito de contribuir com o crescimento do agronegócio regional, detendo atualmente cinco cultivares, com tonalidades de fibras variando do verde até várias tonalidades de marrom. O desafio dos pesquisadores, contudo, é gerar cultivares com novas tonalidades que possam contribuir para movimentar o competitivo mercado da indústria têxtil, especialmente o de fibras naturais e isentas de corantes para fixação da cor. Para avançar nesse segmento, é imprescindível que se entenda a base molecular dos metabólitos envolvidos na síntese da cor das fibras para que se possa estabelecer estratégias para o melhoramento genético, tanto por vias convencionais como por meio de engenharia genética. Sabe-se que os flavonoides são metabólitos secundários que conferem cor as fibras e que, dependendo da rota de sua biossíntese, várias tonalidades de cores podem ser sintetizadas ao final da cascata de eventos. Por ser um componente de natureza bioquímica, estima-se que a identificação de acessos detentores de diferentes biossintetizados possam ser discriminados por meio de marcadores moleculares associados, diretamente ou não, aos flavonoides. Tal estratégia pode se configurar em uma ferramenta útil para contribuir posteriormente na identificação de acessos de fibras coloridas, auxiliando a reduzir o tempo nos procedimentos de seleção, que levam entre 120 a 150 dias para que o caráter possa ser fenotipado. Com intuito de gerar informações que possam contribuir com o melhoramento de fibras de algodão colorido, objetivou-se nesse trabalho proceder um estudo envolvendo abordagens genética e molecular em acessos de algodão colorido, baseando-se em análise de divergência e de expressão molecular, focalizando em genes específicos de fibra envolvidos na biossíntese de flavonoides. Para análise da diversidade genética, doze acessos foram fenotipados por meio de PCR-ISSR, utilizando-se 12 oligonucleotídeos comerciais. Os métodos de Tocher, UPGMA e Projeção 2D foram adotados para análise de agrupamento, baseado no padrão de 50 bandas polimórficas. Em função dos resultados obtidos, procederamse as análises de expressão de transcritos, utilizando-se os genes PP2A1, C4H, DFR, ANR e ANS em cDNAs de fibras coletadas aos 8, 10 e 18 DPA (dias pós antese) dos acessos BRS Rubi, BRS topázio, BRS 200 e V3. Na análise de agrupamento via UPGMA, verificou-se a formação de seis grupos, sendo os grupos B, D e E os que aglomeraram apenas os materiais coloridos. Nos resultados da expressão via RT-PCR semiquantitativa, observaram-se amplicons de aproximadamente 200, 290, 1100, 1024 e 1067 pb para PP2A1, C4H, DFR, ANR e ANS, respectivamente, como esperado. Observou-se maior expressão dos genes C4H, DFR e ANR nos acessos de coloração marrom, sugerindo que estes genes podem estar envolvidos na biossíntese de flavonoides de fibras marrons. Os resultados obtidos neste trabalho podem ser aplicados no programa de melhoramento do algodão visando a obtenção de cultivares com novas cores ou novas tonalidades.

A introdução de culturas de sequeiro em solos de várzea é importante para o desenvolvimento da região sul do Brasil, uma vez que estas áreas estão sub aproveitadas com a cultura de arroz irrigado e a pecuária extensiva. O milho é uma alternativa para o melhor aproveitamento destas terras, logo o desenvolvimento de genótipos tolerantes ao encharcamento do solo é fundamental para viabilizar esta exploração. Neste sentido, os objetivos deste trabalho foram estudar a genética da tolerância ao encharcamento e identificar marcadores de DNA associados a esse caráter. O trabalho foi conduzido em casa de vegetação, sendo analisados genitores, híbridos F1 e populações segregantes provenientes de cruzamentos entre linhagens tolerantes e sensíveis ao encharcamento do solo. A análise molecular, através de marcadores de microssatélites, foi realizada com uma população F3, resultante do cruzamento entre os genótipos mais contrastantes para a tolerância ao encharcamento. A seleção dos marcadores obedeceu ao critério de amostrar todos os cromossomos, com preferência aos que estivessem ligados a genes pertencentes a rotas metabólicas envolvidas com a glicólise e a fermentação. Os genitores demonstraram a existência de variabilidade genética para os caracteres matéria seca de parte aérea (MSP) e matéria seca de raiz (MSR), sendo que os coeficientes de herdabilidades estimados foram elevados. Ambos os caracteres revelaram complexidade quanto ao número de genes envolvidos, onde a análise de QTL indicou a presença de pelo menos três locos envolvidos na manifestação da tolerância ao encharcamento. A ação gênica predominante foi a de dominância e o efeito materno foi pronunciado. Três marcadores explicaram conjuntamente 33,3% da variação para MSP e 19,9% para MSR, podendo ser úteis na seleção assistida para a tolerância ao encharcamento na fase de planta jovem em milho De maneira geral, a seleção fenotípica para MSP e MSR poderá ser uma alternativa eficiente na seleção de genótipos de milho com tolerância ao encharcamento do solo.

Spodoptera frugiperda, uma das principais pragas do milho, tem grande importância pelos danos e dificuldades de controle. A ausência de informações sobre seu impacto em milho doce motivou a comparação de sua biologia entre os genótipos ELISA, BR 400 (milho doce) e BR PAMPA (milho comum). Parcelas com estes genótipos foram estabelecidas em área experimental do Departamento de Fitossanidade, UFRGS, Porto Alegre, RS, de outubro-novembro/2000 e de outubro-novembro/2001. Em condições de laboratório (25±1ºC; 70±10%UR; fotofase 12 horas), lagartas foram individualizadas e alimentadas com seções de 3,14 cm2 de milho, totalizando 60 indivíduos/genótipo. Diariamente, avaliou-se a área foliar consumida, peso das lagartas, indivíduos mortos e recolheram-se as cápsulas cefálicas. As pupas foram sexadas e pesadas, computando-se os indivíduos mortos. Os adultos foram mantidos aos casais, registrando-se períodos de pré-oviposição, oviposição e pós-reprodutivo, número de posturas e de ovos/postura, período de incubação, intervalo entre oviposições e longevidade. A preferência alimentar foi avaliada quantificando-se o consumo foliar em observações de 12, 36 e 72 horas. Foram calculados índices nutricionais. Os dados foram submetidos à análise de variância e as médias comparadas por Tukey a 5%. Não se registrou diferença na largura das cápsulas, nos três primeiros ínstares. No quarto e quinto ínstares, as cápsulas das lagartas mantidas em BR 400 foram menores O consumo foliar, o peso das lagartas e das pupas, a duração dos ínstares e a razão sexual não diferiram entre os genótipos. A duração da fase pupal foi menor nas fêmeas mantidas em BR 400. A mortalidade foi maior, na fase larval, em ELISA e na pupal, em BR PAMPA. Na fase reprodutiva constatou-se diferença apenas no período de incubação, que em BR 400 foi mais longo. Não se observou preferência alimentar. Em relação aos índices nutricionais, somente a taxa de crescimento relativo (RGR) diferiu entre os genótipos, sendo que em BR 400 e ELISA foram observados valores superiores.

O milho doce poderá ser uma alternativa econômica, principalmente, parapequenos agricultores que produzem para consumo in naturae para a indústria. Noentanto, os genótipos de milho doce atualmente cultivados no Rio Grande do Sul,apresentam deficiências de adaptação às condições de ambiente do sul do Brasil,causando instabilidade de produção. Com o objetivo de estudar a variabilidadegenética, estimar os parâmetros genéticos e verificar a possibilidade de ganho genéticoatravés da seleção para cinco caracteres adaptativos, foram avaliadas quatropopulações de milho doce (BR400, BR401, BR402 e HT-1). Os experimentos foramconduzidos durante os anos agrícolas 2000/2001 e 2001/2002 na EstaçãoExperimental Agronômica da UFRGS em Eldorado do Sul, RS. Os resultados obtidosindicaram a existência de variabilidade genética para a maioria dos caracteresavaliados nas populações. De maneira geral, a seleção realizada foi ineficiente, devidoao uso de práticas culturais inadequadas que contribuíram para o aumento da interaçãogenótipoXambiente. As populações BR400 e BR401 não demonstraram ganhogenético neste ambiente para os caracteres desejados. Por outro lado, nos genótiposHT-1 e, principalmente, na BR402, foram observados ganhos genéticos favoráveis naestatura de planta e florescimento masculino, indicando a possibilidade de ajuste daspopulações às condições de ambiente do sul do Brasil.

A tolerância ao frio é altamente desejável em genótipos brasileiros de arroz cultivados no sul do País, onde as temperaturas baixas prejudicam o estabelecimento da lavoura e diminuem o rendimento de grãos. No entanto, as dificuldades da seleção a campo, aliadas ao desconhecimento da genética do caráter no germoplasma local, limitam o progresso a nível de melhoramento. Assim, este trabalho teve por objetivos caracterizar a reação ao frio de diferentes genótipos de arroz em dois períodos de desenvolvimento e determinar as bases genéticas da tolerância ao frio neste germoplasma. É possível diferenciar os genótipos quanto à tolerância ao frio na germinação por meio da porcentagem de redução no comprimento e recrescimento do coleóptilo e verificar que existe variabilidade para tolerância nos grupos Indica e Japônica. Com base na capacidade geral de combinação (CGC) para a porcentagem de redução no comprimento e recrescimento do coleóptilo, o genótipo Quilla 66304 é o mais indicado para incrementar a tolerância ao frio na germinação e os efeitos gênicos mais importantes na determinação destas características são os de dominância e as interações gênicas. No período reprodutivo, a temperatura de 17°C por sete dias na antese é suficiente para distinguir genótipos tolerantes dos sensíveis ao frio quanto à porcentagem de redução no peso de 100 grãos. A exerção completa da panícula em condições de campo é determinada por um gene recessivo nos genótipos Japônica e a herdabilidade do caráter é moderada. A diversidade molecular entre os seis genótipos estudados é elevada, porém com base na caracterização fenotípica, os genótipos mais adequados como genitores da população de mapeamento da tolerância ao frio são o sensível IRGA 417 e o tolerante Quilla 64117. / Cold tolerance is highly desirable in Brazilian genotypes grown in Southern Brazil where cold temperatures damage crop establishment and reduce grain yield. However, the difficulties in selecting under field conditions and the lack of knowledge about the genetics of the character in the local germplasm limit breeding progress. So, the objectives of this study were to characterize different rice genotypes for their cold reaction in two stages of development and to determine genetic basis of cold tolerance in this germplasm. It is possible to differentiate genotypes cold reaction at the germination stage under controlled temperature by means of the percentage reduction in coleoptile length and its regrowth and to verify that exists variability for tolerance in Indica and Japonica groups. Based on the general combining ability (GCA) for percentage reduction in coleoptile length and regrowth, Quilla 66304 is the most indicated genotype to increment cold tolerance at the germination stage, and the most important genic effects del.ermining these characters are dominance and genic interactions. In the reproductive stage, temperature of 17°C for seven days at anthesis is enough to distinguish cold tolerant from cold sensitive genotypes, in what refers to percentage reduction 100 grains weight. Complete panicle exsertion in field conditions is determined by a recessive gene in the Japonica genotypes and the character heritability is moderate. Molecular diversity among the six genotypes is high, but based on the phenotypic characterization, the most adequate genotypes as genitors for the cold tolerance mapping population are the sensitive IRGA 417 and the tolerant Quilla 64117.

Visando a determinar se a seleção para características que são incluídas em um índice de seleção utilizado no programa de melhoramento genético poderia aumentar o peso adulto (PA) das fêmeas, procurou-se analisar a associação entre o PA e as quatro características do índice, a saber: peso à desmama (PD), ganho de peso pós desmama em 345 dias (GP), perímetro escrotal (PE) e musculosidade (MUSC). Visando também a determinar a relação entre o PA e a precocidade sexual, analisou-se a relação entre o PA e a probabilidade de prenhez aos quatorze meses (PP14). O banco de dados utilizado incluiu 134.185 animais da raça Nelore nascidos entre 1984 e 2012, pertencentes à Agropecuária CFM, em fazendas situadas nos Estados de São Paulo, Mato Grosso do Sul e Goiás. Foram estimados os coeficientes de herdabilidade para as seis características e as correlações entre essas características, principalmente o coeficiente de correlação entre o PA e as outras cinco características. Os componentes de (co) variância foram estimados por máxima verossimilhança restrita, utilizando o pacote computacional VCE. As estimativas dos coeficientes de herdabilidade encontradas foram 0,22; 0,19; 0,50; 0,20 e 0,50 para PD, GP, PE, MUSC, PP14, respectivamente. As correlações genéticas entre PA e as características de desenvolvimento ponderal foram positivas, 0,55 (PD); 0,67 (GP); 0,07 (PE); 0,46 (MUSC). A seleção para PD e para GP poderia estar relacionada com aumento do PA das vacas. A correlação entre o peso adulto e a probabilidade de prenhez aos quatorze meses foi negativa e de baixa magnitude ( -0,03). O coeficiente de herdabilidade estimado para PP14 mostra que esta característica pode ser incluída em programas de melhoramento genético para aumentar a precocidade e fertilidade da população. O pequeno aumento constatado no peso adulto não foi suficiente para causar alteração na precocidade sexual da população. As referências na literatura sobre a correlação entre as estimativas do peso adulto e PP14 são escassas. Recomendam-se outros estudos, usando diferentes conjuntos de dados e outras abordagens. As tendências genéticas demonstram o progresso no programa de seleção ao longo dos anos para as características de crescimento estudadas aqui. / In order to determine whether selection for traits included in the selection index used in a breeding program would increase the mature weight (MW) of females, this study analyzed the association between MW and four traits composing the index: weaning weight (WW), post-weaning weight gain in 345 days (PWG), scrotal circumference (SC), and muscling score (MUSC). Additionally, the genetic relationship of MW with probability of pregnancy at 14 months (PP14) was analyzed to evaluate the association between MW and sexual precocity. The database included 134,185 Nellore animals from Agropecuária CFM born between 1984 to 2012 on farms in the states of São Paulo, Mato Grosso do Sul, and Goiás. The heritability for the six traits and the correlations between them were estimated, with special importance being given to the correlation of MW with the other five traits. The (co)variance components were estimated by the restricted maximum likelihood method. The heritability coefficients were 0.22, 0.19, 0.50, 0.22 and 0.50 for WW, PWG, SC, MUSC and PP14, respectively. The genetic correlations of MW with the growth traits were positive: 0.55 (WW), 0.67 (PWG), 0.07 (SC), and 0.46 (MUSC). Selection for WW, PWG and MUSC might be related to an increase in the MW of cows. The correlation between MW and PP14 was negative and of low magnitude (-0.03). The heritability estimates and the genetic correlations of MW with the growth traits were moderate and positive. Thus, the current selection for WW, PWG and MUSC should contribute to increase the MW of cows. MW monitoring of females is important because heavy and larger animals can be associated with higher maintenance costs. The correlation between MW and PP14 was negative and of low magnitude. This association suggests that the increase in MW of cows has no important effect on reproductive performance of the heifers and vice versa. The genetic trends obtained here demonstrate that the adopted selection index has been effective to promote genetic progress for traits related to growth.

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Entretanto, este processo pode levar a alterações significativas na estrutura genética da população resultando num aumento da homozigose, endogamia e diminuição da diversidade genética da população. Esta é muito importante pois otimiza a capacidade de adaptação e chance de sobrevivência, sendo fundamental para manter o progresso genético.. Por estes motivos, é fundamental monitorar a estrutura genética das populações sob seleção para manter baixas as taxas de endogamia e garantir o progresso genético. A partir dessa premissa se objetivou caracterizar a estrutura populacional da raça Braford, com um histórico de seleção de mais de 30 anos, verificando as principais variáveis influenciadas pelas estratégias de seleção como endogamia, tamanho efetivo populacional (Ne) e intervalo de gerações. Verificar o perfil genético dos dez principais touros pais através da comparação das médias das diferenças esperadas na progênie (DEPs) dos seus descendentes (7.142 filhos) com a população avaliada no programa genético PampaPlus para as características de peso ao nascer (PN), peso a desmama (PD), peso ao sobreano (PS), perímetro escrotal (PE) e para o índice de classificação final do programa (IQG), verificando os níveis médios de endogamia fornecidos pelo programa. O arquivo de pedigree contêm 278.095 informações e os resultados da análise populacional foi obtido através do programa de análise populacional POPREP. O estudo demonstrou que a integridade do pedigree está melhorando no decorrer dos anos, o que beneficia a acurácia das avaliações genéticas. O intervalo médio de gerações foi de 5,8 anos e se observou um gradual aumento da idade média dos pais ao nascimento dos filhos, maior longevidade reprodutiva das matrizes e baixa reposição dos reprodutores. O aumento do coeficiente de endogamia por ano é consideravelmente baixo, 0,000116, porém o número de animais endogâmicos está crescendo com um coeficiente médio de endogamia nos últimos cinco anos (2008 a 2013) de 4,8%, e deve ser monitorado para não afetar o progresso genético da população. O Ne através do censo dos pais e coeficiente de endogamia individual foi de 3.363 e 160 respectivamente, valores estes distantes do limite considerado preocupante, indicando haver variabilidade genética. No perfil genético dos touros pais se observou superioridade em 50% dessas linhagens mostrando progresso genético dentro da raça. O nível médio de endogamia dos descendentes apurado (0,0085) indica que os criadores ainda podem utilizar a genética destas linhagens, pois há diferenças entre elas. O aumento do número de criadores e de animais registrados indica expansão da raça, porém apenas 30% dos criatórios de Braford fazem avaliação genética. Concluindo-se que muito ainda pode ser feito no melhoramento genético do Braford, pois os parâmetros populacionais encontram-se preservados e os ganhos genéticos podem ser incrementados através de um trabalho de seleção orientado. / Synthetic breeds produced by crossing Bos taurus indicus and Bos taurus taurus, as the Braford, have gained many breeders due to their resilience to perform under harsh environments and good productive and reproductive performance. Currently, due to high production costs, the search for efficiency in beef cattle production systems is increasing and selection of animals for performance, prioritizing traits of higher economic value has proved to be extremely important. The tool used to increase the frequency of favorable alleles in a population is the genetic improvement. However, this process can lead to significant changes in the genetic structure of populations resulting in increased homozygosity, inbreeding and reduction of genetic diversity, which is very important to optimize the adaptability and allow sustained genetic progress. For these reasons, it is essential to monitor the genetic structure of populations under selection in order to maintain low inbreeding rates and ensure genetic progress. Given this premise, the main goal of this work was to characterize the population structure of Brazilian Braford breed included in its studbook in order to quantify the variables that might be influenced by the selection strategies such as inbreeding, effective population size (Ne) and generation interval; assess the genetic profile of the top ten Braford bulls by comparing the averages of expected progeny differences (EPDs) with the population evaluated in the genetic program PampaPlus for birth weight (BW), weaning weight (WW), yearling weight (YW), yearling scrotal (SC), final index ranking (FIR) and the average levels of inbreeding provided by the program. The pedigree file containing 278,095 records was analyzed and the parameters were computed using the program POPREP. The study showed that pedigree integrity is improving over the years, which benefits the accuracy of genetic evaluations. The average generation interval was 5.8 years and it was observed a gradual increase in the average age of parents at the birth of their progeny, an increase in reproductive longevity of dams and low sire replacement. The increase in the inbreeding coefficient over the years is considerably low (F = 0.000116, but the number of inbred animals is growing with an average coefficient of inbreeding in the last five years years (2008 to 2013) of 4.8% and it should be monitored in the population to not affect the genetic progress. The effective population size calculated trough the census of parents and individual inbreeding coefficient were 3.363 and 160 respectively, being distant from the limit considered dangerous and indicating the existence of good genetic variability for effective selection. The genetic profile of the ten main bulls showed superiority in 50% of the lines indicating genetic progress within the breed. The progenies´ inbreeding coefficient (F = 0.0085) indicates that breeders can use these genetic lines since there are genetic variation among them. The increase in the number of breeders and purebred animals indicates expansion of the breed. Notwithstanding, only 30% of the Braford breeders are enrolled in the Braford improvement program. In conclusion, the Braford population studied has plenty of genetic variation to be used in selection and there is a good potential of genetic gains to be achieved through genetic improvement programs.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Agronomia e Medicina Veterinária, 2016. / O estudo teve como objetivo verificar a resposta fisiológica de fêmeas da raça Curraleiro Pé- Duro submetidas a diferentes protocolos de sincronização e indução da ovulação, buscando-se o aumento da eficiência reprodutiva. Três experimentos foram realizados para avaliar o melhor momento de indução da ovulação e o tempo de exposição à progesterona. No Experimento 1, 12 vacas receberam um dispositivo intravaginal de progesterona (P4) e 2 mg de benzoato de estradiol (BE) intramuscular (IM) no dia zero (D0). Após oito dias (D8) os animais tiveram o implante de P4 removido e receberam 150 μg de D-cloprostenol Sódico (PGF2α) e 300 UI de gonadotrofina coriônica equina (eCG) via IM, sendo então separadas em dois grupos. Grupo 8D (n=6), as vacas receberam 1mg de BE IM no D8, e no grupo 9D (n=6), receberam BE no D9. No Experimento 2, cinco vacas foram submetidas ao mesmo protocolo usado no Grupo 9D do Experimento um, e seis vacas no D8 receberam 150 μg de PGF2α e 300 UI de eCG e no D9 receberam 1 mg de BE e tiveram o dispositivo de P4 retirado (Grupo P4D9). Em ambos os experimento, após a retirada do implante de P4 foram realizadas avaliações ovarianas ultrassonográficas. No Experimento 3, 88 matrizes foram submetidas aos protocolos utilizados nos grupos 8D (n=43) e P4D9 (n=45) e inseminadas em tempo fixo. No Experimento 1, os grupos 8D e 9D levaram a uma taxa de sincronização do folículo dominante de 92% (11/12) e 83% (10/12) e uma taxa de ovulação de 73% (8/11) e 100% (10/10), respectivamente. O tempo para ovulação após a retirada da P4 foi menor nas fêmeas do 8D. No Experimento 2, os grupos 9D e P4D9, levaram a uma taxa de sincronização do folículo dominante de 72% (8/11) e 100% (11/11), respectivamente e a uma taxa de ovulação de 87,5% (7/8) e 91% (10/11), não havendo diferença nos demais parâmetros foliculares estudados. No experimento 3, a taxa de gestação nos grupos 8D e P4D9 foram de 23% (10/43) e 20% (9/45; P>0,05) respectivamente. Conclui-se que, os protocolos utilizados neste trabalho tiveram resultados de desenvolvimento folicular satisfatórios, mas não refletiram em uma boa taxa de prenhes após inseminação artificial em tempo fixo (IATF). Nesse contexto, há necessidade de mais estudos em relação à fisiologia reprodutiva das fêmeas Curraleiro Pé- Duro e quanto à aplicação de protocolos de IATF para animais desta raça. / This study aimed to determine the physiological response of locally adapted females Curraleiro Pé-Duro race under different synchronization protocols and ovulation induction, evaluating the efficiency of these, as well as the determination of ovulation time, ovulatory follicle size, emergency wave and finally the pregnancy rate of females submitted to TAI programs. In one experiment, all females (n=12) on day zero (D0) received an intravaginal device containing 1g of progesterone (P4) which remained for eight days and 2 mg of estradiol benzoate (EB) intramuscular (IM). After that the animals were randomly divided into two groups; 8D treatment (n=6) and 9D treatment (n=6). On removal day of the implant P4 (D8) cows in the 8D group received IM 150 μg of Sodium D-cloprostenol, 300 IU eCG and 1 mg of EB. In 9D treatment group the cows had the implant removed in D8 and received IM 150 μg of D-cloprostenol Sodic and 300 IU eCG, and in contrast to the control group, the animals received IM in D9 1mg EB. The treatments differed among themselves as to the BE application day. For the second experiment, all animals (n=11) in D0 received the same pharmacological treatment of the previous experiment and were randomly divided into two groups; 9D treatment (n=5) and P4D9 treatment (n=6). The animals 9D treatment group had P4 implant removed in D8 and received IM 150 μg of D-cloprostenol Sodic and 300 IU eCG, and D9 received IM, 1mg EB. In contrast the P4D9 treatment group the females received D8 IM 150 μg of D-cloprostenol Sodium and 300 IU eCG and D9 were removed P4 implant followed by IM administration of 1mg of EB. The treatments differed on the withdrawal time of P4 implants. In both experiments, on the P4 implant removal day was also initiated ovarian ultrasound assessment every 24h up to 24h after removal of the P4 implant. After this period, the evaluations were performed every 8 hours for up to 96 hours in the attempt to monitor from the FD to the ovulation. Experiments one and two occurred in crossover format. For the third experiment we used the protocols for the treatment 8D and P4D9 to TAI. Where, for the 8D treatment group (n=43) insemination occurred in the period of 40/42 hours and P4D9 for the treatment group (n=45) 24/26 hours after removing the P4 implant. For the experiment one, the 8D and 9D treatments led to a sync rate of the dominant follicle 92% (11/12) and 83% (10/12) and ovulation rate of 73% (8/11) and 100% (10/10), respectively. There was no effect of treatments on group and interaction day VS group (P> 0.05) in follicular development, only daily growth (P<0.05). The time of ovulation was early in the 8D treatment and variation of ovulation tended to differ (P=0,06). In the second experiment, the treatments 9D and P4D9 led to a sync rate of the dominant follicle 72% (8/11) and 100% (11/11) and ovulation rate of 87,5% (7/8) and 91% (10/11), respectively. For both experiment there was no difference in the luteal volume (P>0,05). As for the three experiments where animals were submitted to TAI, it is found to 8D treatment group and P4D9 treatment group pregnancy rates of 23% (10/43) and 20% (9/45) respectively (P>0,05), concluding that there is still need for more studies on the reproductive physiology of females Curraleiro Pé-Duro, is the hormonal and ultrasonographic control of follicular development, or the development of new methodologies in TAI specific protocols for animals of this breed.