Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2017-08-31T16:43:51Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1571624 bytes, checksum: 532bd28b48be76bfcc011401faf8fee6 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-08-31T16:43:51Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1571624 bytes, checksum: 532bd28b48be76bfcc011401faf8fee6 (MD5) Previous issue date: 2017-07-13 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / O cultivo do tomateiro possui relevante importância sócio-econômica na agricultura brasileira. Mesmo diante deste cenário favorável, a tomaticultura é considerada uma atividade de elevado risco econômico e de grande complexidade agronômica. Dentre os principais problemas, destaca-se a requeima, causada pelo oomiceto Phytophthora infestans (Mont.) de Bary. O controle da doença é altamente dependente do uso de agrotóxicos, pois a maioria dos cultivares de tomateiro não são resistentes. Na tentativa de reverter esse quadro, a principal alternativa é a transferência de genes de resistência presentes em acessos de tomateiro conservados em Bancos de Germoplasma. Assim, após oito anos de pesquisas foi selecionado o acesso BGH-2127 (Solanum lycopersicum), como fontes de resistência a requeima, dentre os 870 acessos de tomateiro do Banco de Germoplama de Hortaliças da Universidade Federal de Viçosa (BGH-UFV). Pelo fato da resistência ser quantitativa, torna-se difícil a avaliação e seleção fenotípica de genótipos superiores, feita apenas no campo ou em associação com marcadores moleculares genéticos tipo QTL. Neste contexto, a metodologia da análise proteômica torna-se uma alternativa viável, pois pode fornecer importantes informações e ferramentas para maior entendimento das rotas metabólicas da interação planta-patógeno e assim auxiliar no desenvolvimento de futuras estratégias para o desenvolvimento de cultivares de tomateiro resistentes. Com o auxílio de ferramentas proteômica, os objetivos deste estudo foram: analisar possíveis diferenças entre os proteomas constitutivos de genótipos de tomateiro contrastantes quanto a resistência à requeima; e identificar proteínas frente a infecção do patógeno que possam explicar possíveis mecanismos moleculares de resistência do tomateiro a esta doença. Foram avaliados o acesso BGH-2127 e o cultivar Santa Clara, resistente e suscetível à requeima, respectivamente. Para avaliação do proteoma constitutivo, as proteínas foram extraídas de amostras das folhas dos genótipos sem que tivesse ocorrido a inoculação, apenas comparando a constituição proteica do BGH-2127 e do Santa Clara. Na avaliação à resposta ao patógeno, as plantas foram inoculadas com uma mistura de esporângios de P. infestans, na concentração de 1x10 3 esporângios mL -1 , coletados em regiões da Zona da Mata Mineira, e as proteínas foram extraídas de folhas de cada genótipo inoculado e não inoculado (controle) coletadas nos tempos 0, 2 e 48 horas. Na análise proteômica foi utilizada a técnica da eletroforese bidimensional (2-DE), com a primeira dimensão (focalização isoelétrica) realizada em tiras IPG de 24 cm, pH 3-10, e a segunda dimensão em SDS-PAGE, em gel 12,5%T. Foram obtidos três géis por tratamento, correspondendo a três repetições biológicas. Em seguida, os géis foram revelados por coloração com azul de coomassie coloidal. Posteriormente as imagens dos géis foram digitalizadas usando o equipamento Image Scanner III e analisadas no software ImageMaster 2D Platinum 7.5. Spots com variação de sobreposição acima de 1,5 e ANOVA p<0,05 foram considerados diferencialmente abundantes. Os spots das proteínas diferencialmente abundantes foram identificados em espectrômetro de massas do tipo MALDI-TOF/TOF Ultraflex III. As listas de massas obtidas foram confrontadas contra os bancos de dados de proteínas obtidos do UNIPROT, com auxílio do software MASCOT e os resultados obtidos, validados pelo aplicativo SCAFFOLD com pelo menos 90% de probabilidade. As proteínas identificadas foram categorizadas funcionalmente usando o software Mapman. Uma vez listadas as proteínas diferencialmente abundantes para os genótipos BGH-2127 e Santa Clara foi realizada a construção de uma rede de interação proteína-proteína utilizando o software STRING. Ensaios de PCR em Tempo Real (RT-PCR) foram realizados para confirmar os níveis de abundância de algumas proteínas identificadas. O RNA total foi extraído de amostras de folhas e o cDNA obtido foi quantificado pelo equipamento SpectraMax M5 microplate/cuvette reader. A amplificação dos fragmentos alvo foi realizada utilizando o equipamento StepOneTM Real-Time PCR System e para a quantificação da expressão gênica foi utilizado o software REST. Na avaliação do proteoma constitutivo, 19 proteínas foram identificadas, e estão relacionadas com metabolismo e energia, fotossíntese, estresse e defesa e à transcrição. Aproximadamente 90% destas proteínas foram mais abundantes no cultivar Santa Clara. As proteínas endoquitinase ácida de 26 kDa e ribonuclease T2 foram mais abundantes no BGH-2127. Atividade enzimática confirmou maior abundância de quitinase no acesso BGH-2127 em relação à Santa Clara. Os padrões de expressão avaliados por PCR em tempo real diferiram dos resultados da análise proteômica. Na avaliação da resposta ao patógeno, 56 proteínas diferencialmente abundantes foram identificadas, sendo 39 referentes ao genótipo resistente e 17 ao suscetível. Estas proteínas foram categorizadas em grupos de funções biológicas de energia e metabolismo, fotossíntese, estresse e defesa, transcrição, outras proteínas e não caracterizadas. Para o acesso BGH-2127, proteínas do estresse oxidativo (2-cis peroxirredoxina BAS1 e 2-cis peroxirredoxina) e relacionadas à patogênese da família PR-5 (taumatina) tiveram os níveis de abundancia relativa aumentados nos tempos 0 e 48 horas após a inoculação, respectivamente, e foram consideradas importantes para o mecanismo de defesa deste genótipo. Os padrões de expressão avaliados por PCR em tempo real diferiram dos resultados da análise proteômica. Redes de interações proteína-proteína forneceram importantes informações sobre atividades celulares envolvidas na resistência do BGH-2127 à requeima. Diferenças na abundância das proteínas endoquitinase ácida de 26 kDa e ribonuclease T2 entre os proteomas constitutivos dos genótipos avaliados podem contribuir para o mecanismo de resistência do BGH-2127 à requeima. Proteínas relacionadas ao estresse oxidativo (PR-9) e família taumatina (PR-5) possuem papel importante no mecanismo de defesa do acesso BGH- 2127 resistente a requeima do tomateiro. / Growing tomatoes has significant economic and social importance in brazilian agriculture. Nevertheless, the tomato production is considered an activity of high economic risk and major agronomic complexity. Among the main problems with regard to pests and diseases, there is the late blight, caused by the oomycete Phytophthora infestans (Mont.) de Bary. Disease control is highly dependent on the use of pesticides and there is no resistant cultivars. The main strategy to reverse that one situation is the introgression of resistance genes present in tomato accessions stored in germplasm banks. So, after eight years of research, BGH-2127 access (Solanum lycopersicum) was selected as a source of resistance to late blight, among the 870 tomato accessions of Vegetable Germplasm Bank of the Federal University of Viçosa (BGH-UFV). Due to the resistance to be quantitative it becomes difficult to practice selection of superior genotypes, made only in the field or associated with genetic molecular markers. In this context, the methodology of proteomics becomes viable alternative to provide valuable information and tools to better understanding the different ways of plant-pathogen relationship, thus this methodology can help future proposals genetic strategies to develop resistance cultivars of tomatoes. With the help of proteomic tools, the objectives of this study were: to analyze differences between the constitutive proteomes of tomato genotypes contrasting in resistance to late blight; and identify proteins against infection of the pathogen that may explain possible molecular mechanisms of resistance of tomato to this disease. The BGH-2127 and Santa Clara cultivar, resistant and susceptible to late blight respectively, were evaluated. For the evaluation of the constitutive proteome, proteins were extracted from leaf samples of the genotypes without inoculation, only comparing the protein constitution of BGH-2127 and Santa Clara. In evaluating the response to the pathogen, the plants were inoculated with a mixture of sporangia of P. infestans sporangia at a concentration of 1 x 10 3 sporangia mL −1 from different regions of Zona da Mata. Proteins were extracted from leaves of each genotype inoculated and non-inoculated (control) collected at time 0, 2 and 48 hours. In the proteomic analysis, the two-dimensional electrophoresis technique (2-DE) was used, with the first dimension (isoelectric focusing) performed using a 24-cm strip containing an immobilized pH gradient (IPG) ranging from 3 to 10 and the second dimension was performed on SDS-PAGE 12.5%T. Three gels were obtained by treatment, corresponding to three biological replicates. Then the gels were stained with colloidal coomassie blue. Posteriorly the gels were scanned with the aid of Image Scanner III and analyzed using ImageMaster 2D Platinum 7.0 software. The expression values were considered significant according to the analysis of variance (ANOVA) at p<0.05. Proteins in which the abundance ranged at least 1.5 times were considered to be differentially abundant. Protein identification was performed using the MALDI- TOF/TOF Ultraflex III type mass spectrometer. The standard list of proteins was obtained UNIPROT, through the use of the MASCOT application. The result obtained by MASCOT was validated by the SCAFFOLD application, with a minimum of 90% probability. Identified proteins were functionally categorized using Mapman program. Once the differentially abundant proteins for BGH-2127 and Santa Clara genotypes were listed, the construction of a protein-protein interaction network was carried out using the STRING software. Real-time PCR assays (RT-PCR) were performed to confirm the levels of abundance of some identified proteins. Total RNA was extracted from leaf samples and the cDNA obtained was quantified by the SpectraMax M5 microplate/cuvette reader. The PCR reaction was performed using StepOneTM Real- Time PCR System. Quantification of gene expression was performed using REST software. In evaluation of the constitutive proteome, nineteen proteins were identified, which were then related to metabolism and energy, photosynthesis, transcription, stress and defenses. Approximately 90% of these proteins were more abundant in Santa Clara, a susceptible cultivar. Acidic 26 kDa endochitinase and ribonuclease T2 proteins were more abundant in BGH-2127 access. The enzymatic activity confirmed a greater abundance of chitinase in the BGH-2127 access as compared to the cultivar Santa Clara. Gene expression analyses by real time PCR demonstrated that the mRNA levels were not correlated with the respective protein levels. Abundance of the acidic 26 kDa endochitinase and ribonuclease T2 proteins in the constitutive proteomes of BGH-2127 may be associated with the answer to the resistance of this access. In evaluating the response to the pathogen, fifty-six differentially abundant proteins were identified, with thirty-nine referring to the resistant genotype and seventeen to the susceptible genotype. These proteins were categorized into functional groups of energy and metabolism, photosynthesis, stress and defense, transcription, other proteins and not characterized. For access BGH-2127, oxidative stress proteins (2-cis peroxiedoxin BAS1 and 2-cis peroxiredoxin) and thaumatin-like protein had levels of relative abundance increased at times 0 and 48 hours after respectively, and were considered important for the defense mechanism of this genotype. The expression standards evaluated by RT-PCR differed from the results of the proteomic analysis. Protein-protein interaction networks provided important information on cellular activities involved in the resistance of BGH-2127 late blight. Abundance of the acidic 26 kDa endochitinase and ribonuclease T2 proteins in the constitutive proteomes of BGH-2127 may be associated with the answer to the resistance of this access. Proteins related to oxidative stress (PR-9) and thaumatin-like family (PR-5) play an important role in the BGH-2127 access defense mechanism resistant to tomato late blight.

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-09-01T11:01:04Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1539110 bytes, checksum: 761b38941e676292b160b2328156a0ae (MD5) / Made available in DSpace on 2017-09-01T11:01:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1539110 bytes, checksum: 761b38941e676292b160b2328156a0ae (MD5) Previous issue date: 2017-02-16 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / O cafeeiro é uma das culturas mais importantes no mundo, porém, é atacada por diversas doenças, sendo a ferrugem, causada pelo fungo Hemileia vastatrix, considerada a principal doença em todas as regiões produtivas. O estudo do transcriptoma do cafeeiro durante a interação com H. vastatrix pode auxiliar no controle dessa doença pelo entendimento de quais mecanismos de defesa a planta esta ativando. Em um patossistema, entender a expressão gênica é essencial para a identificação dos genes relacionados com os mecanismos de defesa e resistência da planta, que são ativados pelos genes de patogenicidade do agente causal. Esses genes identificados podem ser utilizados para obtenção de cultivares resistentes. Para estudar o transcriptoma de um organismo, o método que tem sido utilizado é o sequenciamento de mRNA, denominado RNA-Seq. Esta abordagem permite monitorar a expressão de genes da planta e do patógeno em diferentes etapas ao longo do processo infeccioso. Desta forma, o objetivo deste trabalho foi estudar o transcriptoma do cafeeiro durante a interação com H. vastatrix, fungo causador da ferrugem, a fim de identificar os genes que são ativados ou reprimidos em resposta à infecção. Folhas dos cafeeiros C. arabica cv. Caturra CIFC 19/1 (suscetível) e Híbrido de Timor CIFC 832/1 (resistente) foram inoculadas com urediósporos da raça XXXIII de H. vastatrix e coletadas em diferentes tempos após a inoculação (12, 24, 96 horas e 17 dias). Como controle, foram utilizadas folhas dos dois genótipos de café inoculados com água. Após a extração do RNA das amostras, foram obtidas as bibliotecas de cDNA, que foram sequenciadas usando a plataforma Illumina Miseq. As análises dos dados foram realizadas utilizando ferramentas de bioinformática e consistiram em: i) avaliação da qualidade das sequências com o programa FastQC; ii) limpeza dos dados e sobreposição de reads de acordo com os critérios de qualidade, usando Pear e Clean Solexa; iii) mapeamento dos transcritos com o genoma de referência de Coffea canephora e montagem de novo como estratégia complementar; iv) analise de expressão diferencial de genes; v) anotação; e vi) validação de genes candidatos por PCR em tempo real. Um total de 43.159 contigs foram obtidos após o mapeamento contra C. canephora e a montagem de novo. Os resultados sugerem que durante a infecção inicial (12 e 24 hai), o Híbrido de Timor (HdT) foi mais responsivo ao ataque de H. vastatrix em relação ao Caturra por apresentar maior número de genes up-regulated. Foram selecionados treze genes (up- regulated) exclusivos do HdT, para avaliar o padrão de expressão com o uso de qPCR. As estratégias utilizadas para a montagem do transcriptoma foram eficientes e permitiram a obtenção de um banco de dados com qualidade, o qual poderá ser utilizado para mineração de genes expressos no patossistema C. arabica-H. vastatrix durante a infecção. / Coffee is one of the most important crops in the world; however, several diseases, among which coffee rust, caused by the fungus Hemileia vastatrix, is considered the main disease in all producing regions. The study of coffee transcriptome during the interaction with H. vastatrix can help in the control of this disease as it reveals the mechanism of activation of genes involved in defense. In a pathosystem, understanding gene expression is essential for the identification of genes related to plant defense and resistance mechanisms, which are activated by the presence of the pathogen as well as the pathogenicity genes of the microorganism. To study the transcriptome of an organism, the method that has been used is the sequencing of next generation sequencing of mRNA, called RNA-Seq. This approach allows monitoring the gene expression of an organism at different stages throughout the infection process. Thus, the objective of this work was to study the coffee transcriptome during interaction with Hemileia vastatrix, rust-causing fungus, in order to identify genes that are activated or repressed in response to infection. Leaves of two Arabica coffee cultivars, Caturra CIFC 19/1 (susceptible) and Híbrido de Timor CIFC 832/1 (resistant), were inoculated with H. vastatrix race XXXIII and collected at different times after inoculation (12, 24, 96 hours and 17 days). As a control, leaves of the two coffee cultivars were inoculated with water. After extraction of the RNA from the samples, cDNA libraries were constructed and sequenced using the Illumina Miseq platform. Data analyzes were performed using bioinformatics tools and consisted of: i) evaluation of sequence quality with FastQC program; ii) data cleaning and overlapping of reads according to the quality criteria, using Pear and Clean Solexa; iii) mapping of transcripts with the reference genome of Coffea canephora and de novo assembly as a complementary strategy; iv) analysis of differential gene expression; v) annotation; and vi) validation of candidate genes by real-time PCR. A total of 43,159 contigs were obtained after mapping against C. canephora and de novo assembly. The results suggest that during the initial infection (12 and 24 hai), Híbrido de Timor (HdT) was more responsive to H. vastatrix attack than Caturra because it had a higher number of up-regulated genes. Thirteen (up-regulated) genes unique to HdT were selected to evaluate the expression pattern by qPCR. The strategies used to assemble the transcriptome were efficient and allowed to obtain a high quality database, which will be used for mining of genes expressed in the C. arabica-H. vastatrix interaction.

O bioma pampa apresenta uma grande variabilidade de forrageiras nativas com bom valor nutritivo, indicando o potencial do desenvolvimento de pesquisas com o intuito de preservar este meio e apresentar alternativas de pastagens para os produtores rurais. Entretanto, esta imensa diversidade vem sendo substituída por espécies exóticas, provocando uma diminuição da comunidade campestre natural. Uma das espécies nativas que merece mais estudos é o Paspalum nicorae Parodi, espécie perene, apomítica, que apresenta uma ampla adaptação a diferentes tipos de solos, especialmente a solos arenosos, sendo tolerante a geadas e a secas moderadas, com alta tolerância ao pastejo. O presente estudo teve como objetivos avaliar uma coleção de 53 genótipos de P. nicorae, conduzidos em duas regiões fisiograficamente distintas durante dois anos, buscando caracterizar o comportamento produtivo da espécie e selecionar genótipos superiores através da analise de estabilidade e adaptabilidade, para etapas subseqüentes do Programa de Caracterização de Germoplasma e Melhoramento de Plantas Forrageiras. Um dos experimentos foi implantado na Área Experimental da Embrapa Pecuária Sul em Bagé e o outro na Estação Experimental Agronômica da Universidade Federal do Rio Grande do Sul, em Eldorado do Sul. As avaliações ocorreram de outubro de 2007 a fevereiro de 2009 através de linhas e de parcelas, adotando o delineamento de blocos causalizados com três repetições. Houve variação das produções forrageiras entre os tratamentos ao longo do tempo e entre diferentes locais. A maioria dos acessos de P. nicorae apresentaram elevados rendimentos ao serem comparados com os da testemunha (cv. Pensacola) tanto na avaliação em linhas, como na avaliação por hectare. Os acessos 28 B e 26 A de P. nicorae apresentando elevada produção, respectivamente para MST e MSF em g.linha-1 e previsibilidade, demonstrando serem estáveis e adaptados nas regiões estudas. Em relação à qualidade nutricional, os percentuais de PB e FDN obtidos pela coleção em estudo, apresentaram semelhanças aos encontrados na testemunha. Os resultados apontam perspectivas de trabalhos futuros visando explorar a variabilidade encontrada entre os acessos da coleção. A coleção de P. nicorae apresentou produção de forragem superior a cv. Pensacola, e alguns acessos apresentaram desempenhos bem expressivos. Para o rendimento de MST e MSF, destacaram-se, respectivamente, os acessos 28 B e 26 A de P. nicorae, demonstrando previsibilidade nos comportamentos. Sugere-se estes dois acessos para etapas subseqüentes em um programa de melhoramento de plantas forrageiras. / The Pampas Bioma presents a wide variability of native forages with good nutrition value, indicating a potential development of researches aiming at preserving this environment and presenting alternative forages to farmers. However, this large diversity has been replaced by exotic species, leading to a decreased natural field community. One of the native species requiring more studies is Paspalum nicorae Parodi, a perennial, apomitic species showing high adaptation to different kinds of soil, especially to sandy soils; it also tolerates hoarfrortr and mild drought, with high tolerance to grazing. This study aimed at assessing a collection of 53 genotypes of P. nicorae, introduced in two physiographically distinct regions along two years, in an attempt to both characterize the productive behavior of this species and select superior genotypes for subsequent phases of a program for forage improvement. This research is part of a more comprehensive project of characterization of a collection of P. nicorae belonging to the Department of Forages and Agrometeorology of UFRGS. One of the experiments was carried out in Bagé, at the Experimental área of Embrapa Pecuária Sul, and the other at the Experimental Agronomic Station of Universidade Federal do Rio Grande do Sul, in Eldorado do Sul. The assessments were performed from October 2007 to February 2008 through lines and plants, using the delineation of causal blocks with three repetitions. There was variation of forage production among treatments over time and in both sites. Most genotypes of P. nicorae presented high yields when compared to the clock (cv. Pensacola) both in the line and hectare assessments. Genotypes 28 B and 26 A of P. nicorae showed high yield to MST and MSF in g.line-1, respectively, as well as predictability, showing stability and adaptation in the regions studied. Regarding the bromatological quality, percentages of PB and FDN in the collection studied were similar to those found in the witness. Results have pointed out perspectives of future studies aiming at exploring the variability found among genotypes of the collection of P. nicorae. The performance of the collection of P. nicorae was higher than that of cv. Pensacola, and some genotypes presented quite significant yields. For the yield of MST and MSF, genotypes 28 B and 26 A of P. nicorae, respectively, were outstanding, showing predictability in behavior. These two genotypes have been suggested for subsequent phases of a program of forage improvement.

Made available in DSpace on 2016-08-29T15:38:10Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_6295_Clemilton Divergência genética entre acessos de mamoeiro e correlações entre suas características no norte do Espírito Santo Clemilton Alves da Silva.pdf: 606247 bytes, checksum: 27a1357f4fd3905e4a8604fdf5d5caf9 (MD5) Previous issue date: 2013-02-22 / O mamoeiro (Carica papaya L.) é atualmente uma das fruteiras de maior importância econômica, sendo cultivada e consumida nas regiões tropicais e subtropicais do mundo, provavelmente em função de sua centro de origem na America tropical. O Brasil se configura com o segundo produtor mundial dessa fruta, embora sua produção seja influenciada negativamente pelos altos preços das sementes hibridas geralmente importadas de Taiwan, dificultado o uso dessas em cultivos sucessivos. Trabalhos de melhoramento se tornam importantes, pois visam manutenção e aumento dos índices produtivo da cultura. Nesse contexto desenvolveu-se o presente trabalho dividido em dois capítulos com os seguintes propósitos: no primeiro capitulo visando avaliar por meio de características morfoagronômicas o grau de variabilidade genética entre cinquenta e nove acessos de mamoeiro no Norte capixaba. Para tanto a divergência genética foi avaliada por procedimentos multivariados: distância generalizada de Mahalanobis, técnicas de agrupamento de otimização de Tocher e hierárquico com base no método Unweighted Pair Group Method with Arithmetic Mean. Houve diferença significativa para todas as características avaliadas, demonstrando a existência de variabilidade entre os acessos. As características: altura de planta, altura de inserção do primeiro fruto, espessura maior de polpa de fruto, diâmetro de fruto e comprimento de fruto apresentaram valores de herdabilidade superiores a 80%, resultados que indicam ganhos expressivos no processo simples de seleção. Existe variabilidade genética entre os acessos, sendo o Americano, STZ-03 pecíolo curto e Califlora 209 os mais divergentes. Os métodos de otimização de Tocher e hierárquico Unweighted Pair Group Method with Arithmetic Mean foram parcialmente concordantes quanto à formação dos grupos heteróticos de acessos de mamoeiro no Norte do Espírito Santo. As características massa de fruto, diâmetro de fruto e altura de planta foram as de maior contribuição para a diversidade genética. O segundo capítulo teve como finalidade obter as estimativas de correlações fenotípicas entre características morfológicas e de frutos de mamoeiro, bem como analisar a relação entre essas características e seus desdobramentos em efeitos diretos e indiretos dos componentes primários e secundários sobre a produção por plantas. As correlações fenotípicas foram superiores as genotípicas. Não houve correlação significativa entre os caracteres avaliados e a variável principal produção por planta. Os componentes primários: número e massa de fruto explicam quase que totalmente as variações ocorridas na sobre produção por planta. Espessura menor de polpa de fruto foi o componente secundário que apresentou maiores efeitos diretos e indiretos sobre a variável primária massa de fruto. Palavras-chave: Carica papaya L., parâmetros genéticos, melhoramento vegetal, biometria, variabilidade genética.

O bioma pampa apresenta uma grande variabilidade de forrageiras nativas com bom valor nutritivo, indicando o potencial do desenvolvimento de pesquisas com o intuito de preservar este meio e apresentar alternativas de pastagens para os produtores rurais. Entretanto, esta imensa diversidade vem sendo substituída por espécies exóticas, provocando uma diminuição da comunidade campestre natural. Uma das espécies nativas que merece mais estudos é o Paspalum nicorae Parodi, espécie perene, apomítica, que apresenta uma ampla adaptação a diferentes tipos de solos, especialmente a solos arenosos, sendo tolerante a geadas e a secas moderadas, com alta tolerância ao pastejo. O presente estudo teve como objetivos avaliar uma coleção de 53 genótipos de P. nicorae, conduzidos em duas regiões fisiograficamente distintas durante dois anos, buscando caracterizar o comportamento produtivo da espécie e selecionar genótipos superiores através da analise de estabilidade e adaptabilidade, para etapas subseqüentes do Programa de Caracterização de Germoplasma e Melhoramento de Plantas Forrageiras. Um dos experimentos foi implantado na Área Experimental da Embrapa Pecuária Sul em Bagé e o outro na Estação Experimental Agronômica da Universidade Federal do Rio Grande do Sul, em Eldorado do Sul. As avaliações ocorreram de outubro de 2007 a fevereiro de 2009 através de linhas e de parcelas, adotando o delineamento de blocos causalizados com três repetições. Houve variação das produções forrageiras entre os tratamentos ao longo do tempo e entre diferentes locais. A maioria dos acessos de P. nicorae apresentaram elevados rendimentos ao serem comparados com os da testemunha (cv. Pensacola) tanto na avaliação em linhas, como na avaliação por hectare. Os acessos 28 B e 26 A de P. nicorae apresentando elevada produção, respectivamente para MST e MSF em g.linha-1 e previsibilidade, demonstrando serem estáveis e adaptados nas regiões estudas. Em relação à qualidade nutricional, os percentuais de PB e FDN obtidos pela coleção em estudo, apresentaram semelhanças aos encontrados na testemunha. Os resultados apontam perspectivas de trabalhos futuros visando explorar a variabilidade encontrada entre os acessos da coleção. A coleção de P. nicorae apresentou produção de forragem superior a cv. Pensacola, e alguns acessos apresentaram desempenhos bem expressivos. Para o rendimento de MST e MSF, destacaram-se, respectivamente, os acessos 28 B e 26 A de P. nicorae, demonstrando previsibilidade nos comportamentos. Sugere-se estes dois acessos para etapas subseqüentes em um programa de melhoramento de plantas forrageiras. / The Pampas Bioma presents a wide variability of native forages with good nutrition value, indicating a potential development of researches aiming at preserving this environment and presenting alternative forages to farmers. However, this large diversity has been replaced by exotic species, leading to a decreased natural field community. One of the native species requiring more studies is Paspalum nicorae Parodi, a perennial, apomitic species showing high adaptation to different kinds of soil, especially to sandy soils; it also tolerates hoarfrortr and mild drought, with high tolerance to grazing. This study aimed at assessing a collection of 53 genotypes of P. nicorae, introduced in two physiographically distinct regions along two years, in an attempt to both characterize the productive behavior of this species and select superior genotypes for subsequent phases of a program for forage improvement. This research is part of a more comprehensive project of characterization of a collection of P. nicorae belonging to the Department of Forages and Agrometeorology of UFRGS. One of the experiments was carried out in Bagé, at the Experimental área of Embrapa Pecuária Sul, and the other at the Experimental Agronomic Station of Universidade Federal do Rio Grande do Sul, in Eldorado do Sul. The assessments were performed from October 2007 to February 2008 through lines and plants, using the delineation of causal blocks with three repetitions. There was variation of forage production among treatments over time and in both sites. Most genotypes of P. nicorae presented high yields when compared to the clock (cv. Pensacola) both in the line and hectare assessments. Genotypes 28 B and 26 A of P. nicorae showed high yield to MST and MSF in g.line-1, respectively, as well as predictability, showing stability and adaptation in the regions studied. Regarding the bromatological quality, percentages of PB and FDN in the collection studied were similar to those found in the witness. Results have pointed out perspectives of future studies aiming at exploring the variability found among genotypes of the collection of P. nicorae. The performance of the collection of P. nicorae was higher than that of cv. Pensacola, and some genotypes presented quite significant yields. For the yield of MST and MSF, genotypes 28 B and 26 A of P. nicorae, respectively, were outstanding, showing predictability in behavior. These two genotypes have been suggested for subsequent phases of a program of forage improvement.

Nas últimas décadas, com aumento da industrialização e o uso mais intenso de práticas agrícolas, está havendo a liberação de altas quantidades de elementos potencialmente tóxicos na biosfera, como o metal pesado cádmio (Cd), que é muito tóxico à maioria dos organismos. Uma alternativa para solucionar este problema é o uso da fitoextração, que se baseia no cultivo de plantas para recuperar áreas degradadas. Porém, atualmente, poucas espécies de plantas foram descritas como hiperacumuladoras de Cd e há pouca informação sobre os mecanismos envolvidos na tolerância das plantas dessas espécies a altos teores deste metal em seus tecidos. Assim, o objetivo deste trabalho foi identificar e caracterizar novas espécies da família Solanaceae hiperacumuladoras de cádmio e os respectivos genes relacionados à sua absorção, translocação e acúmulo em plantas. Utilizaram-se três estratégias de análise. Inicialmente foram identificadas novas espécies hiperacumuladoras de Cd. Após, realizou-se um estudo na espécie modelo Arabidopsis thaliana para identificar genes relacionados a absorção, translocação e acúmulo de Cd nas plantas e, finalmente, buscou-se a aplicação dos conhecimentos obtidos em A.thaliana em duas espécies identificadas neste trabalho como hiperacumuladoras de Cd. Foram identificadas e caracterizadas duas espécies hiperacumuladoras de plantas, Solanum americanum e Solanum lycopersicum (tomate), cultivares Micro-Tom e Gaúcho. Os resultados obtidos evidenciaram que os genes HMA2 e HMA3 de A. thaliana estão relacionados ao processo de acúmulo de Cd na parte aérea da planta. Nesse estudo, foram identificados genes ortólogos aos genes HMA2 e HMA3 de A. thaliana em tomate, cv. Micro-Tom. A análise dos genes HMA2 e HMA3 indica alteração de suas expressões quando as plantas são expostas a Cd, sugerindo a participação desses genes em algum mecanismo de tolerância do tomate a esse metal pesado. Estudos de análise funcional dos genes identificados (HMA2 e HMA3) em tomate, cv. Micro- Tom, será importante para comprovar a importância desses dois genes nos processos de detoxificação e acúmulo de Cd nos tecidos das plantas. / In recent decades, with increasing industrialization and more intensive management of agricultural practices, the release of large quantities of potentially toxic elements in the biosphere has also increased, such as the heavy metal cadmium (Cd), which is extremely toxic element to most organisms. An alternative to solve this problem is phytoextraction, which is based on the use of plants to recover degraded areas. But so far, few plant species have been described as a Cd hyperaccumulator and there is little information about the mechanisms that allow these plants to tolerate high levels of this methal in their tissues. The aim of this study was to identify and characterize new species of Solanaceae Cd hyperaccumulators species and the genes related with Cd absorption, translocation and accumulation in these plants. Three strategies were used. First, Cd hyperaccumulators species were identified. Then, a study in the model specie Arabidopsis thaliana was performed to indentify genes related to Cd absorption, translocation and accumulation and, finally, we tried to apply the knowledge obtained in A. thaliana to two species described here as Cd hyperaccumulators. Two new Cd hyperaccumulator plant species were identified and characterized, Solanum americanum and Solanum lycopersicum (tomato), cultivar Micro-Tom and Gaucho. In this study, the A. thaliana genes HMA2 and HMA3 were related to the process of shoot Cd accumulation. From this result, we identified orthologous genes in tomato cv. Micro-Tom to the A. thaliana genes HMA2 and HMA3. The analysis of these genes indicates change in their expressions patterns when plants are exposed to cadmium, suggesting their participation in some mechanism of tolerance of this species to heavy metal. Functional analysis studies of identified genes (HMA2 and HMA3) in tomato cv. Micro-Tom will be important to demonstrate the importance of these two genes in the process of detoxification and accumulation of Cd in tissues.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:29:42Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-02-09Bitstream added on 2014-06-13T20:19:52Z : No. of bitstreams: 1 batista_cm_me_ilha.pdf: 351886 bytes, checksum: 7a32bba46398f3b30fabc1d91c4aac59 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / A intensa fragmentação dos habitats de ocorrência de Handroanthus vellosoi (Toledo) Mattos já extinguiu grande parte das populações naturais da espécie. Essa exploração inadequada vem comprometendo sua capacidade de sobrevivência nesses ambientes naturais. Neste contexto, as finalidades deste trabalho são a conservação ex situ, avaliação da variabilidade e estimativa de parâmetros genéticos em teste de procedências e progênies de polinização aberta da espécie arbórea tropical Handroanthus vellosoi por caracteres quantitativos. Mais especificamente, pretende-se estudar a herança de caracteres quantitativos, a correção entre estes caracteres e selecionar árvores superiores de H. vellosoi em um teste de procedências e progênies para a produção de sementes com ampla variabilidade genética para fins de recuperação ambiental. O teste foi instalado na Estação Experimental de Luiz Antônio, do Instituto Florestal de São Paulo em 1986. O delineamento experimental adotado foi o de blocos de famílias compactas, com seis repetições, com subparcelas lineares de cinco plantas provenientes de duas procedências, 17 progênies de polinização aberta de Bebedouro e 18 de Mogi Guaçu, obedecendo ao espaçamento de 3 x 3 m. O ensaio foi mensurado aos 24 anos de idade para diâmetro à altura do peito, altura de planta, volume, forma do fuste e sobrevivência. Para as análises estatísticas foi utilizado o programa estatístico SAS. As estimativas da diferenciação genética entre e dentro de procedências e progênies indicou que a maior parte da variação genética se encontra entre progênies / he intense fragmentation to of the habitat that Handroanthus vellosoi (Toledo) Mattos occur has extinguished much of the natural populations of the species. This exploitation is inadequate, compromising their ability to survive in these natural environments. In this context, the purposes of this study was the ex situ conservation, evaluation and estimation of the genetic variability and parameters in a open-pollinated provenance and progeny test of the tropical tree species Handroanthus vellosoi, based on quantitative traits. More specifically, we intend to study the inheritance of quantitative thaits, the correction between traits and to select superior trees of H. vellosoi for to seed production with wide genetic variability for environmental remediation. The provenance and progeny test was established in 1986 at the Experimental Station of Luiz Antônio, São Paulo Forestry Institute. The trial was established in a compact family block desing with six replicates, linear plots of five plants, using two provenances, 17 families from Bebedouro and 18 from Mogi Guaçu. The spacing used was the 3 x 3 m. The test was measured at 24 years of age to diameter at breast height (DBH), plant height, volume, stem forma and survival. The statistical analysis was performed using the SAS program. The estimates of genetic differentiation between and within provenances and progenies indicated that most of the genetic variation is found among progenies

CoordenaÃÃo de AperfeÃoamento de Pessoal de NÃvel Superior / O feijÃo-caupi à uma cultura amplamente produzida nas regiÃes norte e nordeste do Brasil, e bastante adaptada à condiÃÃes edafoclimÃticas adversas. Entretanto, o feijÃo-caupi ainda à uma cultura com baixa produtividade, principalmente pelo baixo nÃvel tecnolÃgico empregado. Nesse aspecto a FixaÃÃo BiolÃgica de NitrogÃnio (FBN) à uma alternativa viÃvel para o fornecimento de nitrogÃnio de forma barata, porÃm à importante selecionar variedades de feijÃo-caupi mais eficientes e adaptadas ao processo de FBN. Objetivou-se com esse trabalho, testar a capacidade de estirpes de rizÃbios nativos de regiÃes semiÃridas, em gerar ganhos na produÃÃo do feijÃo-caupi, capazes de se equiparar a cultura adubada e verificar a existÃncia de interaÃÃo entre o feijÃo-caupi e os rizÃbios. Foram testados 21 genÃtipos obtidos do banco de germoplasma da UFC e quatro estirpes de rizÃbios nativas do semiÃrido obtidas da coleÃÃo de culturas do laboratÃrio de microbiologia ambiental da UFC. Foram realizados quatro experimentos em delineamento de blocos ao acaso no esquema fatorial 6X8 sendo seis genÃtipos de feijÃo-caupi, oito fontes de nitrogÃnio e trÃs repetiÃÃes. As fontes de nitrogÃnio foram compostas por quatro estirpes nativas mais duas estirpes padrÃes e a testemunha adubada mais o controle sem inoculaÃÃo (sem adubo e sem rizÃbio). O genÃtipo CE-930 foi repetido em todos ensaios. Os experimentos foram realizados em casa de vegetaÃÃo da UFC e os genÃtipos semeados em vasos do tipo âLeonardâ, com substrato estÃril e inerte composto por areia e vermiculita. ApÃs 35 a 40 dias do plantio realizou-se a coleta de dados para anÃlise. NÃo foi encontrada interaÃÃo significativa entre os genÃtipos e as estirpes de rizÃbios. NÃo houve variaÃÃo de resposta quanto ao nitrogÃnio total entre nenhum dos genÃtipos avaliados nos quatro experimentos, todos foram estatisticamente iguais, porÃm quanto as demais variÃveis houveram valores bem diferentes em alguns casos. Quando se analisou as fontes de nitrogÃnio, nos quatro ensaios todas as estirpes com exceÃÃo da LAMAB-8 geraram aumento de produÃÃo quase sempre similar a testemunha nitrogenada. Os genÃtipos de feijÃo-caupi nÃo influenciaram as respostas das estirpes de rizÃbios, nÃo sendo revelada interaÃÃo entre ambos. As estirpes LAMAB-40, LAMAB-48 e LAMAB-65 expressaram capacidade de fixar nitrogÃnio de forma equiparada as estirpes jà recomendadas para a cultura e quando adubada quimicamente. / Cowpea is a crop widely produced in the North and Northeast of Brazil, and quite adapted to adverse environmental conditions. However, the cowpea is still a culture with low productivity, mainly by low technological level employee. In this respect Biological Nitrogen Fixation (BNF) is a viable option for the supply of nitrogen on the cheap alternative, but it is important to select cowpea varieties most efficient and adapted to the FBN process. The objective of this work was to test the ability of strains of rhizobia and semiarid regions, generating gains in the production of cowpea, able to match the fertilized crop and verify the existence of interaction between cowpea and rhizobia. 21 genotypes obtained from the germplasm bank of the UFC and four strains of native rhizobia obtained semiarid from the culture collection of the laboratory of environmental microbiology at UFC were tested. Four experiments were conducted in a randomized block design in a factorial 6X8 being six genotypes of cowpea, eight sources of nitrogen and three replications. The nitrogen sources were composed of four native strains plus two standard strains and fertilized witness over the uninoculated control (without fertilizer and without rhizobia). The CE-930 genotype was repeated for all trials. The experiments were conducted in a greenhouse of the UFC and genotypes was sown in pots such as "Leonard", with sterile and inert substrate composed of sand and vermiculite. After 35-40 days of planting was carried out collect data for analysis. No significant interaction was found between genotypes and strains of rhizobia. There was no response variation for total nitrogen between any of the genotypes in the four experiments, all were statistically equal, but as the other variables there were very different values in some cases. When we analyzed the sources of nitrogen in the four tests all strains except LAMAB-8 generated increased production almost always similar nitrogen witness. The genotypes of cowpea did not influence the responses of strains of rhizobia, not being revealed interaction between them. The LAMAB-40, LAMAB-48 and LAMAB-65 strains expressed ability to fix nitrogen assimilated form already strains recommended for culture and when chemically fertilized.

Nas últimas décadas, com aumento da industrialização e o uso mais intenso de práticas agrícolas, está havendo a liberação de altas quantidades de elementos potencialmente tóxicos na biosfera, como o metal pesado cádmio (Cd), que é muito tóxico à maioria dos organismos. Uma alternativa para solucionar este problema é o uso da fitoextração, que se baseia no cultivo de plantas para recuperar áreas degradadas. Porém, atualmente, poucas espécies de plantas foram descritas como hiperacumuladoras de Cd e há pouca informação sobre os mecanismos envolvidos na tolerância das plantas dessas espécies a altos teores deste metal em seus tecidos. Assim, o objetivo deste trabalho foi identificar e caracterizar novas espécies da família Solanaceae hiperacumuladoras de cádmio e os respectivos genes relacionados à sua absorção, translocação e acúmulo em plantas. Utilizaram-se três estratégias de análise. Inicialmente foram identificadas novas espécies hiperacumuladoras de Cd. Após, realizou-se um estudo na espécie modelo Arabidopsis thaliana para identificar genes relacionados a absorção, translocação e acúmulo de Cd nas plantas e, finalmente, buscou-se a aplicação dos conhecimentos obtidos em A.thaliana em duas espécies identificadas neste trabalho como hiperacumuladoras de Cd. Foram identificadas e caracterizadas duas espécies hiperacumuladoras de plantas, Solanum americanum e Solanum lycopersicum (tomate), cultivares Micro-Tom e Gaúcho. Os resultados obtidos evidenciaram que os genes HMA2 e HMA3 de A. thaliana estão relacionados ao processo de acúmulo de Cd na parte aérea da planta. Nesse estudo, foram identificados genes ortólogos aos genes HMA2 e HMA3 de A. thaliana em tomate, cv. Micro-Tom. A análise dos genes HMA2 e HMA3 indica alteração de suas expressões quando as plantas são expostas a Cd, sugerindo a participação desses genes em algum mecanismo de tolerância do tomate a esse metal pesado. Estudos de análise funcional dos genes identificados (HMA2 e HMA3) em tomate, cv. Micro- Tom, será importante para comprovar a importância desses dois genes nos processos de detoxificação e acúmulo de Cd nos tecidos das plantas. / In recent decades, with increasing industrialization and more intensive management of agricultural practices, the release of large quantities of potentially toxic elements in the biosphere has also increased, such as the heavy metal cadmium (Cd), which is extremely toxic element to most organisms. An alternative to solve this problem is phytoextraction, which is based on the use of plants to recover degraded areas. But so far, few plant species have been described as a Cd hyperaccumulator and there is little information about the mechanisms that allow these plants to tolerate high levels of this methal in their tissues. The aim of this study was to identify and characterize new species of Solanaceae Cd hyperaccumulators species and the genes related with Cd absorption, translocation and accumulation in these plants. Three strategies were used. First, Cd hyperaccumulators species were identified. Then, a study in the model specie Arabidopsis thaliana was performed to indentify genes related to Cd absorption, translocation and accumulation and, finally, we tried to apply the knowledge obtained in A. thaliana to two species described here as Cd hyperaccumulators. Two new Cd hyperaccumulator plant species were identified and characterized, Solanum americanum and Solanum lycopersicum (tomato), cultivar Micro-Tom and Gaucho. In this study, the A. thaliana genes HMA2 and HMA3 were related to the process of shoot Cd accumulation. From this result, we identified orthologous genes in tomato cv. Micro-Tom to the A. thaliana genes HMA2 and HMA3. The analysis of these genes indicates change in their expressions patterns when plants are exposed to cadmium, suggesting their participation in some mechanism of tolerance of this species to heavy metal. Functional analysis studies of identified genes (HMA2 and HMA3) in tomato cv. Micro-Tom will be important to demonstrate the importance of these two genes in the process of detoxification and accumulation of Cd in tissues.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2017-10-04T13:23:39Z No. of bitstreams: 1 Sueynne Marcella Santana Leite Bastos.pdf: 1577544 bytes, checksum: a6809db4f66151a4a19c205206910f9e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-04T13:23:39Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Sueynne Marcella Santana Leite Bastos.pdf: 1577544 bytes, checksum: a6809db4f66151a4a19c205206910f9e (MD5) Previous issue date: 2017-02-16 / The use of green roofs offers numerous benefits such as: reduction of rainwater, reduction of internal heat, reduction of the effects of heat islands, cleaning of atmospheric pollutants, besides contributing to the appreciation of urban landscape. Research related to green roofing techniques is growing around the world, seeking improvements in contemporary techniques, and selection of species for use on extensive green roofs. The objective of this research was to evaluate and select plant species for use on extensive green roofs, under conditions in the Forest zone of Pernambuco in restricted substrate depth, maintenance, irrigation, pruning and soil nutrition. The experiment was conducted in a randomized complete block design with four replications and nineteen treatments (species). The species were evaluated fortnightly how many to the characters: glue rate; Persistence rate; Soil cover capacity; height; Biomass of the aerial part; Root biomass; Internal surface temperature and general appearance of the plants after 150 DAP. The species Impatiens walleriana, Arachis repens, Indigofera campestris, Richardia grandiflora and Turnera subulata did not present growth and this was excluded from the process of evaluation of agronomic characters. The species Ipomoea assarifolia, Paspalum notatum 02, Paspalum notatum 04, Paspalum notatum 05, Paspalum notatum 06, Sphagneticola trilobata, Trandescantia pallida and Trandescantia zebrina showed good development, but were classified as poorly adapted. Callisia repens, Chlorophytum comosum, Ophiopogon jaburan, Paspalum lepton 01, Portulaca grandiflora and Sansevieria trifasciata Are indicated for use on extensive green roofs in the Zona da Mata of Pernambuco, as they presented higher rate of glue and persistence, as well as higher rates of vegetation cover, resulting in lower internal surface temperature, as well as a very adequate general appearance. / O uso de telhados verdes oferece inúmeros benefícios ao ambiente como: redução da água pluvial, redução do calor interno, reduz dos efeitos das ilhas de calor, limpeza de poluentes atmosféricos, além de contribuir na valorização do paisagismo do meio urbano. As pesquisas relacionadas às técnicas de telhados verdes crescem em todo o mundo, buscando melhorias nas técnicas contemporâneas, e seleção de espécies para uso em telhados verdes extensivos. Esta pesquisa teve como objetivo avaliar e selecionar espécies de plantas para uso em telhados verdes extensivos, nas condições da Zona da Mata de Pernambuco sob situações restritas de profundidade de substrato manutenção, irrigação, poda e nutrição do solo. O experimento foi conduzido em ambiente protegido em blocos ao acaso, com quatro repetições e dezenove tratamentos (espécies). As espécies foram avaliadas quinzenalmente quantos aos caracteres: taxa de pegamento; taxa de persistência; capacidade de cobertura do solo; altura; biomassa da parte aérea; biomassa da raiz; temperatura da superfície interna e aparência geral das plantas após 150 DAP. As espécies Impatiens walleriana, Arachis repens, Indigofera campestris, Richardia grandiflora e Turnera subulata não apresentaram crescimento e foram excluídas do processo de avaliação de caracteres agronômicos. As espécies Ipomoea assarifolia, Paspalum notatum 02, Paspalum notatum 04, Paspalum notatum 05, Paspalum notatum 06, Sphagneticola trilobata, Trandescantia pallida e Trandescantia zebrina apresentaram bom desenvolvimento, porém foram classificadas como pouco adequadas. Callisia repens, Chlorophytum comosum, Ophiopogon jaburan, Paspalum lepton 01, Portulaca grandiflora e Sansevieria trifasciata são indicadas para uso em telhados verdes extensivos na Zona da Mata de Pernambuco, pois apresentaram maior pegamento, persistência, capacidade de cobertura vegetal, acarretando menor temperatura da superfície interna, bem como uma excelente aparência geral.