Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2017-10-26T15:58:59Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 447707 bytes, checksum: 66b1d7d8c5485f56036f54daad6f8de5 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-26T15:58:59Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 447707 bytes, checksum: 66b1d7d8c5485f56036f54daad6f8de5 (MD5) Previous issue date: 2017-07-27 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / A caracterização de atributos relacionados à qualidade nutricional de acessos de tomateiro presente em bancos de germoplasma é fundamental para a identificação de possíveis genitores que poderão ser usados em programas de melhoramento genético da cultura. Objetivou-se caracterizar acessos de S. lycopersicum provenientes do banco de germoplasma de hortaliças da Universidade Federal de Viçosa e determinar a diversidade genética entre os mesmos considerando atributos relacionados à qualidade nutricional dos frutos. O estudo foi realizado na Universidade Federal de Viçosa-Campus Rio Paranaíba, em dois cultivos (outono-inverno e primavera-verão). Os tratamentos foram 21 acessos de tomateiro do BGH-UFV, o híbrido Débora Plus e a cultivar Santa Clara. Os atributos avaliados foram: pH, sólidos solúveis (SS), acidez titulável (AT), relação entre SS e AT, ácido ascórbico, licopeno, carotenoides totais, peso médio de frutos, teor de água nos frutos, Ca, Mg, Na e K. Os dados foram submetidos à análise de variância, à distância euclidiana e de Mahalanobis (diversidade genética) e de agrupamento pelos métodos de UPGMA e Tocher. Todos os tratamentos apresentaram diferença estatística para todos os atributos avaliados. O agrupamento dos acessos de tomateiro pelo método de Tocher formou sete grupos para o cultivo de outono-inverno e cinco grupos para o cultivo de primavera-verão. Conclui-se que os acessos de tomateiro do BGH-UFV apresentam diversidade genética em estudo dos atributos relacionados à qualidade nutricional dos frutos. Os acessos 2064 (4), 985 (5) e 83 (17) podem ser usados como genitores em programas de melhoramento da cultura por apresentarem características semelhantes ao híbrido Débora Plus quando cultivados no período de outono inverno. / The characterization of attributes related to nutritional quality of tomato accessions present in germplasm banks is essential to the identification of possible genitors which could be used in genetical enhancement programs of the crop. The aim of this study was to characterize the S. lycopersicum accessions from the vegetables germplasm bank at Federal University of Viçosa and determine the genetic diversity among them considering attributes related to nutritional fruit quality. The study was conducted at Federal University of Viçosa - Rio Paranaíba Campus, in two cultivations (autumn-winter and spring-summer). The treatments used were 21 tomato accessions from BGH-UFV, Débora Plus hybrid and the Santa Clara cultivar. Were evaluated the following attributes: pH, soluble solids (SS), titratable acidity (TA), relation between SS and TA, ascorbic acid, lycopene, total carotenoids, fruit average weight, fruit water content, Ca, Mg, Na and K. The data were submitted to variance analysis, Euclidean and Mahalanobis (genetic diversity) distance, UPGMA and Tocher grouping methods. All treatments presented significantly statistical difference to all evaluated attributes. The tomato accessions grouping by Tocher method formed seven groups to the autumn-winter cultivation and five groups to the spring- summer cultivation. It was concluded that the tomato accessions from BGH-UFV presented genetic diversity in the attributes study related to the nutritional fruits quality. The 2064 (4), 985 (5) and 83 (17) accessions might be used as genitors in genetical enhancement programs of the crop for presenting similar characteristics to the Débora Plus hybrid when cultivated in the autumn-winter period. / Não foi localizado o currículo lattes do autor.

Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2018-01-15T15:39:28Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1009278 bytes, checksum: 0ca0f39af7e469a6dded1b9a46b70329 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-01-15T15:39:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1009278 bytes, checksum: 0ca0f39af7e469a6dded1b9a46b70329 (MD5) Previous issue date: 2017-07-20 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / O feijão comum (Phaseolus vulgaris L.) é uma das leguminosas mais cultivadas e consumidas em todo o mundo. É uma fonte relativamente barata de proteínas e nutrientes, firmando-se como um importante alimento na manutenção da segurança alimentar no planeta. Nesse sentido, o melhoramento genético é fundamental para a obtenção de cultivares mais produtivas, com arquitetura de plantas mais adequada aos sistemas de colheita, com ciclo compatível com às regiões de produção e de aspecto de grãos que atenda às exigências do mercado consumidor. Uma ferramenta auxiliar no melhoramento genético de plantas é a seleção assistida por marcadores moleculares do DNA. O mapeamento de ligação (Linkage Mapping, LM) é a abordagem mais comum no melhoramento para detectar marcadores moleculares associados a QTLs (Quantitative Trait Loci, ou locos controladores de características quantitativas). A abundância de marcadores no genoma das espécies fez do mapeamento de associação (Association Mapping, AM) uma nova estratégia pra detecção de QTLs. Uma importante metodologia do mapeamento de associação é o estudo de associação genômica ampla (Genome Wide Association Study, GWAS). Neste contexto, o Programa de Melhoramento do Feijoeiro da Universidade Federal de Viçosa (UFV) desenvolveu uma população formada por 376 RILs (Recombinant Inbred Lines, ou linhagens endogâmicas recombinantes) de feijão comum, obtidas do cruzamento entre Rudá e AND 277, para a obtenção de um mapa genético e detecção de QTLs relacionados a sete características morfo-agronômicas usando essas duas metodologias. Essa população foi denominada de RILs RA. Outro objetivo foi conhecer a função biológica destes QTLs pela sua localização em relação a genes candidatos com função biológicas que se relacionassem às características destes QTLs. A população foi genotipada com 3.098 marcadores do tipo SNP (Single Nucleotide Polymorphism, polimorfismo a partir de um único nucleotídeo) e fenotipada em campo para as características número de dias até o florescimento (DF) e até a maturação (DM), arquitetura de plantas (ARC), produtividade de grãos (YLD), grau de achatamento (SF) da semente, forma da semente (SS) e massa de cem grãos (SW). Pelo mapeamento de ligação (LM), foi obtido uma mapa genético com 1.962 SNPs e tamanho total de 1.065,48 cM. Também foram detectados 29 QTLs, para as sete características, distribuídos nos 11 cromossomos, que explicaram de 3,83 a 32,92% da variação fenotípica. Na anotação gênica, quatro sequências de SNPs identificados como ligados aos QTLs foram relacionados a 18 genes com função biológica conhecida. Pelo estudo de associação genômica ampla (GWAS), foram detectados 112 SNPs/QTLs em todos os cromossomos, com exceção dos cromossomos 06 e 07, relacionados a todas as características avaliadas. Alguns destes QTLs estavam posicionados próximos ou dentro de genes candidatos com função biológica que se relacionava com as características morfo-agronômicas avaliadas. Conclui-se que o tamanho da população de RILs RA (376 linhagens) permitiu a obtenção de um mapa genético com estimativas de frequência de recombinação acurada. O número de marcadores utilizados propiciou boa saturação em todos os cromossomos, o que permitiu a detecção de QTLs com mais eficiência e confiabilidade pelo mapeamento de ligação e pela GWAS. Os genes candidatos localizados nas regiões destes QTLs corroboram o potencial destes na seleção assistida por marcadores moleculares para as características morfo-agronômicas avaliadas. / Common bean (Phaseolus vulgaris L.) is one of the most cultivated and consumed legumes worldwide. It is a relatively inexpensive source of protein and nutrients, establishing itself as an important food in maintaining food security on the world. In this sense, genetic breeding is essential to obtain more productive cultivars, with plant architecture more adequate to the harvesting systems, with a cycle suitable to the regions of production, and grain type compatible with the requirements of the local market. An auxiliary tool in plant breeding is the DNA marker-assisted selection. Linkage mapping (LM) is the most common approach to detect molecular markers associated to quantitative trait loci (QTL). The abundance of molecular markers in the genome of the species made of association mapping (AM) a new methodology to QTLs detection. An important association mapping (AM) methodology is the genome wide association study (GWAS). In this context, the Common Bean Breeding Program of the Universidade Federal de Viçosa (UFV) developed a population consisting of 376 RILs, obtained from the crossing between Rudá and AND 277, to construct a genetic map and detect QTLs related to seven morpho-agronomic traits using these two methodologies. Another objective was to know the biological function of these QTLs by their location in relation to candidate genes with biological functions that related to the traits of these QTLs. The population was genotyped with 3,098 SNP (single nucleotide polymorphism) markers and phenotyped in the field conditions for the trais number of days to flowering (DF) and to maturity (DM), plant architecture (ARC), seed yield (YLD), degree of seed flatness (SF), seed shape (SS), and 100- seed weight (SW). A genetic map with 1,962 SNPs, spanning a total size of 1,065.48 cM, was obtained by linkage analysis. In addition, 29 QTLs were detected for the seven characteristics distributed on the 11 chromosomes, which explained from 3.83 to 32.92% of the phenotypic variation. In gene annotation, four sequences of SNPs identified as linked to QTLs were related to 18 genes with known biological function. 112 SNPs/QTLs related to the traits evaluated were detected in all chromosomes by genome wide association study (GWAS), except to chromosomes 06 and 07. Some of these QTLs were positioned near or within candidate genes with biological function that were related to the morpho-agronomic traits evaluated. It is concluded that the population size of RA RILs (376 lines) allowed to obtain a genetic map with accurate estimates of recombination frequency. The number of markers used in this study provided good saturation in all chromosomes, which allowed the efficiently and reliably QTL detection by linkage mapping and GWAS. The candidate genes located in the regions of these QTLs corroborate their potential in the marker-assisted selection for these seven morpho-agronomic traits.

Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2018-01-15T16:24:47Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 962345 bytes, checksum: 5a6d6072db690a2bf84a5142262e8313 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-01-15T16:24:47Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 962345 bytes, checksum: 5a6d6072db690a2bf84a5142262e8313 (MD5) Previous issue date: 2017-07-31 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / A presença de variabilidade genética associada a estratégias mais eficientes de seleção são imprescindíveis para se obter sucesso nos programas de melhoramento. Nesse sentido, o uso de marcadores moleculares em estudos de diversidade, bem como a seleção baseada em dados fenotípicos por meio do uso de procedimentos genético-estatísticos mais refinados têm se mostrado ferramentas úteis nos programas de melhoramento. Além disso, com o avanço das plataformas de NGS (Next Generation Sequencing), um novo método de seleção, que visa utilizar dados fenótipos e moleculares, denominado Seleção Genômica Ampla foi proposto. O objetivo do trabalho foi identificar marcadores SNP (Single Nucleotide Polymorphism) e validá-los em estudos de diversidade genética; estimar os parâmetros genéticos e os ganhos com a seleção utilizando a metodologia de modelos mistos (REML/BLUP); aplicar o princípio da GWS (Genome Wide Selection) e avaliar sua eficiência em população de C. canephora. A população em estudo, inicialmente, foi composta por 72 genótipos nos quais os marcadores SNP foram identificados e validados. A seleção fenotípica, por meio do procedimento REML/BLUP, foi realizada em 192 genótipos de cafeeiros. Por fim, a população avaliada por meio da GWS foi composta por 165 genótipos. Utilizando a plataforma de sequenciamento da empresa RAPiD Genomics foram identificados 117.450 SNP em 72 indivíduos de C. canephora. Após análises de qualidade, 33.485 SNP foram selecionados e validados em análises de diversidade e estrutura genética de populações. Os marcadores foram eficientes na avaliação da diversidade e estrutura genética de C. canephora e com base em nessas análises foi possível selecionar possíveis cruzamentos promissores dentro e entre os grupos varietais e Híbridos geneticamente mais distantes. Com base nas análises utilizando o método REML/BLUP foi possível selecionar genótipos Conilon e Robusta promissores por serem geneticamente divergentes pela análise de agrupamento e por proporcionarem ganhos elevados com a seleção. Estes podem ser intercruzados para obter cultivares dentro de cada grupo varietal e/ou como genitores em cruzamentos interpopulacionais. Além disso, foi possível selecionar famílias híbridas que se destacaram nas análises. Estas podem ser testadas em diferentes regiões e as promissoras utilizadas como variedade propagada por semente. As famílias híbridas selecionadas podem também ser intercruzadas (cruzamento intrapopulacional) para avanço da seleção recorrente. Por fim, a GWS mostrou-se ferramenta útil para o melhoramento de C. canephora, por predizer com alta acurácia os valores genéticos genômicos dos indivíduos e possibilitar a redução no tempo necessário para completar o ciclo de seleção, proporcionando ganhos significativos em eficiência seletiva por unidade de tempo. / The presence of genetic variability associated with more efficient selection strategies is essential for success in breeding programs. In this sense, the use of molecular markers in diversity studies, as well as selection based on phenotypic data through the use of more refined genetic-statistical procedures have been shown to be useful tools in breeding programs. In addition, with the advancement of NGS (Next Generation Sequencing) platforms, a new selection method, which aims to use phenotype and molecular data, called the Genome Wide Selection was proposed. The objective of this work was to identify SNP markers (Single Nucleotide Polymorphism) and to validate them in studies of genetic diversity; to estimate genetic parameters and selection gains using the mixed model methodology (REML/BLUP); to apply the principle of GWS (Genome Wide Selection) and to evaluate its efficiency in C. canephora population. The study population was initially composed of 72 genotypes in which the SNP markers were identified and validated. Phenotypic selection, using the REML/BLUP procedure, was performed on 192 coffee genotypes. Finally, the population evaluated through GWS consisted of 165 genotypes. Using the RAPiD Genomics company sequencing platform, 117,450 SNPs were identified in 72 C. canephora individuals. After quality analyzes, 33,485 SNPs were selected and validated in analyzes of diversity and genetic structure of populations. The markers were efficient in evaluating the genetic diversity and structure of C. canephora and based on these analyzes, it was possible to select possible promising crosses within and among the genetically distant varietal and hybrid groups. Based on the analyzes using the REML/BLUP method, it was possible to select promising Conilon and Robusta genotypes because they are genetically divergent by cluster analysis and because they provide high gains with selection. These can be cross-linked to obtain cultivars within each varietal group and/or as parents at interpopulation crossings. In addition, it was possible to select hybrid families that stood out in the analyzes. These can be tested in different regions and the promising ones used as seed propagated variety. Selected hybrid families can also be cross-linked (intrapopulation cross) to advance recurrent selection. Finally, the GWS proved to be a useful tool for the improvement of C. canephora, by accurately predicting the genomic genetic values of the individuals and allowing the reduction in the time needed to complete the selection cycle, providing significant gains in selective efficiency by unit of time.

Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2018-01-15T16:50:51Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 743820 bytes, checksum: 071d26b1453ad880be2d02695b0b98e5 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-01-15T16:50:51Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 743820 bytes, checksum: 071d26b1453ad880be2d02695b0b98e5 (MD5) Previous issue date: 2017-07-26 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Os trabalhos envolvendo a caracterização de acessos de Cucurbita moschata D., mantidos pelo Banco de Germoplasma de Hortaliças da Universidade Federal de Viçosa- BGH-UFV, tem revelado a expressiva variabilidade genética desse germoplasma para uma série de características de importância agronômica. Os acesso de C. moschata mantidos pelo BGH-UFV, são particularmente promissores em termos nutricionais, em face de suas elevadas quantidades de componentes bioativos como carotenoides, na polpa do fruto e da elevada qualidade nutricional do azeite de suas sementes. Assim, este trabalho teve como objetivo caracterizar parte dos acessos de C. moschata mantidos pelo BGH- UFV por meio de descritores morfoagronômicos e nutricionais. O experimento foi conduzido em unidade experimental do Departamento de Fitotecnia, “Horta Velha”, da UFV, no período de janeiro a Julho de 2016. Foram avaliados 148 acessos e 4 testemunhas comerciais. O delineamento adotado foi o de blocos aumentados de Federer, com cinco repetições para as testemunhas. Os acessos foram caracterizados por meio de 72 descritores, 11 para a fase de plântula, 19 para a vegetativa, 26 para as fases reprodutiva e características de fruto e 16 para as características da semente. As características qualitativas foram analisadas por meio da distribuição de frequências. Para as características quantitativas, foi realizado a análise de variância. A análise multivariada da variabilidade morfoagronômica foi realizada levando-se em consideração simultaneamente as informações quantitativas e qualitativas, com base na soma de matrizes de distâncias obtidas a partir dos dados quantitativos e qualitativos e no método de agrupamento de Tocher. Para as características quantitativas, foi realizada também a análise de Singh para aferição da contribuição de cada característica na diferenciação dos acessos. Os acessos de C. moschata mantidos pelo BGH-UFV possuem ampla variabilidade morfoagronômica para os descritores qualitativos e quantitativos. Foi constatada diferenças significativas entre os acessos para características de importância agronômica e nutricional como a produtividade de frutos, teor de carotenoides totais da polpa do fruto, massa de semente por fruto e produtividade de sementes e do azeite da semente. As características comprimento da rama principal aos 35 dias após o transplantio, o número de graus dias acumulados para o florescimento feminino e a produtividade de azeite tiveram as maiores contribuições na diferenciação dos acesso. Houve a formação de 36 grupos pelo método de agrupamento de Tocher multivariado, sendo que a maior parte dos acessos foram agrupados no primeiro grupo. A comparação de médias entre grupos permitiu identificar os grupos mais promissores para cada característica. O grupo 36, formado pelo BGH-291 constitui fonte promissoras para hábito de crescimento determinado. O grupo 20 é uma fonte promissora para a obtenção de elevada produtividade de frutos. Os grupos 28 e 34 foram os mais promissores para a estimativa do teor de carotenoides totais na polpa do fruto, os quais permitem a seleção de acessos com maior atividade pró vitamínica. Os grupos 19 e 22 tiveram as maiores médias para a massa de sementes por fruto e os grupos 17 e 27 as maiores médias para a massa de 100 sementes. Os grupos 25 e 5 foram os mais promissores para as produtividades de sementes e de azeite das sementes, os quais representam excelentes alternativas para a obtenção de ácidos graxos alimentares mais saudáveis. Os acessos de C. moschata mantidos pelo BGH-UFV possuem ampla variabilidade morfoagronômica e constituem fonte promissora para o melhoramento de características agronômicas e nutricionais dessa olerícola. / The works involving the characterization of Cucurbita moschata D. accessions maintained by the Vegetable Gen Bank of the Federal University of Viçosa- BGH-UFV, has revealed the expressive genetic variability for this germplasm for a series of characteristics of agronomic importance. The accessions of C. moschata maintained by the BGH-UFV, are particularly promising in terms of nutritional aspects, due their high content of bioactive compounds such as carotenoids, in the pulp of fruits, and the high nutritional quality of oil of their seeds. Thus, the objective of this work was to characterize part of the C. moschata accessions maintained by the BGH-UFV through morphological and nutritional descriptors, to analyze the morphoagronomic and nutritional variability among the accesses and selecting the promising accessions for morphoagronomic and nutritional characteristics. The experimental design adopted was the augmented blocks of Federer, with five repetitions for the checks. The accessions were characterized by 72 descriptors, 11 for the seedling phase, 19 for the vegetative, 26 for the reproductive and fruit characteristics, and 16 for the characteristics of seeds. The qualitative characteristics were analyzed through the frequency distribution. For the quantitative characteristics, was carried out an analysis of variance. The multivariate analysis of morphoagronomic variability was carried out taking into account simultaneously the quantitative and qualitative information, based on the sum of matrices of distances obtained from the quantitative and qualitative data and on the grouping method of Tocher. An analysis of Singh was performed for the quantitative characteristics in order to assess the contribution of each characteristic in the differentiation of the accessions. The accessions of C. moschata maintained by BGH-UFV have a wide morphoagronomic variability for the qualitative and quantitative descriptors. It was observed significant differences between the accessions for characteristics of agronomic and nutritional importance such as fruit yield, total carotenoid content in the pulp of fruit, seed mass per fruit and the yields of seeds and seed oil. The group 36, formed by the BGH-291 constitutes a promising source for determined growth habit. The group 20 is a promising source for the obtaining high yield of fruits. The groups 28 and 34 were the most promising for the estimation of total carotenoid content in the pulp of fruit, which allow selection of accessions with higher pro-vitamin activity. The groups 19 and 22 had the highest means for the mass of seeds per fruit and groups 17 and 27 had the highest mean for the mass of 100 seeds. Groups 25 and 5 were the most promising for the yields of seeds and seed oil, which are excellent alternatives for obtaining healthier food fatty acids. The accessions of C. moschata maintained by the BGH-UFV have a wide morphoagronomic variability and are a promising source for the improvement of agronomic and nutritional aspects of this vegetable.

Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2015-12-02T14:33:09Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 869288 bytes, checksum: 1ec9e1ebef3bae322c6fce4583cbe976 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-12-02T14:33:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 869288 bytes, checksum: 1ec9e1ebef3bae322c6fce4583cbe976 (MD5) Previous issue date: 2014-03-27 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Redes neurais artificiais (RNA) são modelos computacionais inspirados no sistema nervoso de seres vivos, capazes de aprender a partir de exemplos e empregá-lo na solução de problemas tais como predição não linear, reconhecimento de padrões e diversas outras aplicações. Neste trabalho utilizamos uma RNA para predizer o valor da área abaixo da curva de progresso da doença (AACPD) para o patossistema tomate x requeima. A AACPD é uma medida de ampla utilização na epidemiologia de doenças policíclicas, especialmente em estudos que inferem a respeito da resistência quantitativa dos genótipos. Contudo, para a obtenção do valor final desta área são necessárias, neste patossistema, uma série de seis avaliações ao longo do tempo. O objetivo deste trabalho é propor a utilização das RNAs para a obtenção da AACPD no patossistema tomate x requeima, utilizando um número reduzido de avaliações de severidade. Para tanto, foram considerados quatro experimentos independentes, totalizando 1836 plantas infectadas com o patógeno Phytophthora infestans e avaliadas a cada três dias em um total de seis oportunidades, sendo procedido o cálculo da AACPD por método convencional. A RNA criada permitiu predizer AACPD com correlação de 0,97 e 0,84 quando comparado com os métodos convencionais, utilizando-se de um número 50% e 67% menor de avaliações por genótipo respectivamente. Ao se utilizar a RNA gerada por um experimento para predizer a AACPD para os demais experimentos ocorreu correlação média de 0,94, com duas avaliações, e 0,96, com três avaliações, entre os valores preditos pela RNA e os observados com seis avaliações. Apresentamos neste trabalho um novo paradigma para a utilização da informação da AACPD em experimentos de tomateiro confrontado com P. infestans. Este novo paradigma proposto pode ser adaptado para diferentes patossistemas. / Artificial neural networks (ANN) are computational models, inspired in the nervous system of living organisms, that is able to learn from examples and uses it to solve problems such as non-linear prediction, pattern recognition, and many other applications. In this work we use an ANN to predict the value of the area under the disease progress curve (AUDPC) for pathosystem tomato x late blight. The AUDPC is a widely used measure in the epidemiology of polycyclic diseases, especially in studies about quantitative resistance of genotypes. However, to obtain the final value of this area is required, in this pathossystem, a series of six evaluations along time. The objective of this paper is to propose a new use of ANN, based on the principles of learning, for to obtain the AUDPC in pathosystem tomato x late blight, using a reduced number of disease severity evaluations. We considered four independent experiments, a total of 1836 infected plants with the pathogen Phytophthora infestans and assessed every three days for six times, and proceeded to calculate the AUDPC by conventional methods. The ANN created possible to predict the AUDPC with a correlation coefficient of 0.97 and 0.84 compared with conventional methods, using a number 50% and 67% less ratings for genotypes respectively. Using ANN generated by an experiment to predict the AUDPC for the other experiments there was an average correlation of 0.94, with two ratings, and 0.96, with three evaluations, between the value predicted from ANN and value observed with six evaluations. We present in this work a new paradigm for obtaining AUDPC in tomato experiments inoculated with P. infestans. This proposed new paradigm can be adapted to different pathosystems.

Submitted by Amauri Alves (amauri.alves@ufv.br) on 2015-12-03T12:15:30Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 594381 bytes, checksum: 78003bc43c8f85c2a92e37c856c8f191 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-12-03T12:15:30Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 594381 bytes, checksum: 78003bc43c8f85c2a92e37c856c8f191 (MD5) Previous issue date: 2015-07-16 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Os objetivos deste estudo foram obter estimativas do progresso genético para produtividade de grãos e outras características agronômicas, bem como, os parâmetros de adaptabilidade e estabilidade fenotípica em cultivares de feijão do tipo carioca recomendados no Brasil entre os anos de 1970 e 2013. Os experimentos foram conduzidos nos municípios de Viçosa/MG e Coimbra/MG nas safras da seca e de inverno de 2013. Foram avaliados 40 cultivares de feijão carioca recomendados pelos principais programas de melhoramento do Brasil entre 1970 a 2013. O delineamento experimental utilizado foi o de blocos casualizados, com três repetições. As características avaliadas para o estudo do progresso genético foram: produtividade de grãos (Prod); aspecto de grãos (AG); arquitetura de planta (Arq); número de vagens por planta (NVP); número de grãos por vagem (NGV) e massa de 1000 grãos (MMG). Para o estudo de adaptabilidade e estabilidade fenotípica, foi utilizada apenas a característica produtividade de grãos. O progresso genético foi estimado com base nas médias das características por meio da análise de regressão bissegmentada. As estimativas dos parâmetros de adaptabilidade e estabilidade foram obtidas por meio da metodologia de Eberhart e Russell (1966). As médias das caraterísticas foram agrupadas pelo método de agrupamento de Scott e Knott (1974). Observou-se expressivo progresso genético dos programas de melhoramento de feijão carioca para a produtividade de grãos, e esse progresso passou a ser significativo a partir de 1990, com um ganho de 68,15 kg ha -1 ou 6,74% ao ano. Melhorias também foram observadas no aspecto de grãos (1,36% ao ano), no número de vagens por planta vii(5,62% ao ano), no número de grãos por vagem (4,59 % ao ano) e na massa de mil grãos (2,08% ao ano). Embora tenham sido recomendadas algumas cultivares de feijão carioca de arquitetura ereta, não foi observado progresso genético significativo proporcionado pelo melhoramento genético de feijão no Brasil para esta característica. Além disso, com a análise de adaptabilidade e estabilidade foi possível verificar, que os cultivares recomendados após 2005 foram as que apresentaram o fenótipo proposto por Eberhart e Russell, ou seja, alta produtividade de grãos, ampla adaptabilidade e alta previsibilidade de comportamento. Palavras-Chave - Phaseolus vulgaris L.; interação genótipos x ambientes; ganho genético; regressão bissegmentada, componentes do rendimento. / We aimed to estimate genetic progress for grain yield and other agronomic traits, as well as the adaptability and stability parameters using carioca beans cultivars recommended in the Brazil between 1970 and 2013. The experiments were carried out in the cities of Viçosa/MG and Coimbra/MG at crops seasons of drought and winter of 2013. Forty cultivars recommended by the main breeding programs in Brazil were evaluated by using randomized block design with three replications. The evaluated traits for the study of genetic progress were: grain yield (Prod.); grain aspect (AG); plant architecture (Arq), number of pods per plant (NVP); number of seeds per pod (NGV) and 1000-seeds weight (MMG). To study the stability and adaptability was considered only the characteristic grain yield using the Eberhart and Russell method. The genetic progress was estimated for all traits based on the average over the year using the bi-segmented regression analysis. Being the means grouped by Scott and Knott method. Significant genetic progress in carioca cultivars beans was observed to the trait grain yield, and this progress became significant from the year 1990, with an increase of 68.15 kg ha -1 or 6.74 % per year. Improvements were also seen in the other traits (0.29 or 5.62% per year for number of pods per plant, 0.09 or 4.59% per year for number of grains per pod, 2.95 or 2, 08% per year for thousand grain weight and -0.07 or 1.36% per year for grain aspect). Although erect cultivars have been recommended, significant genetic progress was not observed for this trait. The cultivars indicated after 2005 showed the genotypic suggested by Eberhart and Russell, i.e. jointly submitted high grain yield, wide adaptability and high predictability of behavior. ixKeywords - Phaseolus vulgaris L.; interaction GxE; genetic gain; bi-segmented regression; yield components.

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2016-04-20T11:09:12Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 251735 bytes, checksum: 16d64bae7a029b52e0a18d65b3abc040 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-04-20T11:09:12Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 251735 bytes, checksum: 16d64bae7a029b52e0a18d65b3abc040 (MD5) Previous issue date: 2016-02-16 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / O Brasil é um país de clima tipicamente tropical e, por isso, apresenta uma considerável diversidade de espécies capaz de produzir óleo, como a macaúba (Acrocomia aculeata). Por ser uma cultura incipiente, têm-se poucos estudos genéticos relacionados à produção de óleo. Assim, o objetivo deste trabalho foi estimar os parâmetros relacionados ao controle genético dos caracteres físicos dos frutos, teor e produção de óleo, inferir sobre a diversidade genética, realizar o agrupamento e proceder à seleção dos acessos de macaúba. Frutos de 44 acessos de macaúba do banco ativo de germoplasma foram colhidos e levados ao laboratório de pós-colheita da Universidade Federal de Viçosa, para avaliação da: massa seca (g) da casca, polpa, endocarpo e amêndoa, teor de óleo e produção de óleo por planta. As estimativas das herdabilidades individuais no sentido restrito foram consideradas de média magnitude para todas as características avaliadas. O coeficiente de repetibilidade e a acurácia na seleção de famílias, para todas as características, foi de alta magnitude e a produção de óleo por planta apresentou o maior coeficiente de variação genética individual (77,16%). Dos 10 primeiros indivíduos selecionados pelo BLUP individual, houve uma contribuição de 5 acessos diferentes (8, 37, 49, 43, 26), sendo que os cinco melhores indivíduos para o caráter produção de óleo por planta, pertence à família do acesso 8, com destaque para o acesso 8 planta 7. O agrupamento genético dos 44 acessos, estabelecidos pelo método Tocher, baseado na distância euclidiana média, permitiu a formação de 11 grupos. O índice de média de ranks de Mulamba e Mock permitiu classificar os acessos em ordem favorável a seleção, considerando todas as características avaliadas, sendo que os acessos selecionados 43, 8, 37, 35 e 6 destacaram nas primeiras posições. / Brazil is a typical tropical climate country and, therefore, presents a considerable diversity for species capable of producing oil, such as macaw palm (Acrocomia aculeata). Few genetic studies related to oil production for this species are available, since it is an incipient crop. Thus, the main of this study was estimating genetic parameters related to genetic control of physical traits in fruits, quantifying content and oil production, inferring genetic diversity by cluster analysis and selecting macaw palm accessions. Fruits from 44 macaw palm accessions of the active germplasm bank were collected and transferred to postharvest laboratory in Universidade Federal de Viçosa, evaluating the following traits: dry mass (g) of the exocarp, mesocarp, endocarp and kernel, and oil content and production per plant. Estimated individual narrow sense heritability were classified as moderate magnitude for all traits. Coefficient of repeatability and accuracy for progenies selection were considered high magnitude for all traits and plant oil production presented the highest individual genetic variation coefficient (77.16%). Five distinct accessions (8, 37, 49, 43, 26)contributed among the first ten selected by the individual BLUP, however, the top five individuals for oil production belongs to accession 8 family, standing out the individual 7 from accession 8. The genetic cluster for the 44 accessions, performed by Tocher method based on average Euclidian distance, resulted in 11 groups formation. Mulamba and Mock average rank index allowed classifying accessions to favorable selection sequence, considering all traits evaluated, and the following accessions 43, 8, 37, 35 and 6 standed out in the top positions.

Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2016-04-22T14:00:04Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 442843 bytes, checksum: 214b021a6cbd81302f374a561f9712ca (MD5) / Made available in DSpace on 2016-04-22T14:00:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 442843 bytes, checksum: 214b021a6cbd81302f374a561f9712ca (MD5) Previous issue date: 2015-07-15 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Jatropha curcas L. é a oleaginosa perene mais promissora para produção de biodiesel e bioquerosene. Contudo, pesquisas recentes revelam estreita variabilidade genética na espécie e novos estudos nesse tema são necessários para fundamentar o seu melhoramento. O objetivo deste trabalho foi avaliar a variabilidade genética entre 93 famílias, cada qual representada por uma planta, por meio de cinco pares de marcadores SSR. Estas 93 famílias compõem o Banco Ativo de Germoplasma (BAG) da Universidade Federal de Viçosa (UFV). No total foram avaliados 60 pares de primers SSR, mas apenas os cinco mais polimórficos foram selecionados. Observou-se a constituição de nove grupos de diversidade pelo método UPGMA, com destaque para as famílias UFVJC 19, UFVJC 36 e UFVJC 98 que apresentaram a maior divergência genética. Pelo método de Tocher ocorreu a formação de 13 grupos, evidenciando a divergência das famílias UFVJC 18, UFVJC 36 e UFVJC 71 por suas singularidades. A variabilidade presente entre as famílias coletadas no norte de Minas Gerais suporta a hipótese da região como possível centro secundário de diversidade da espécie. Ainda que exploratória, a presente pesquisa evidenciou expressiva variabilidade genética no BAG. Este fato corrobora o acerto da estratégia de coleta das famílias do BAG-UFV, praticada com muitas plantas por família (mínimo de 16). Na implantação de outros BAGs a ênfase foi coletar maior número de acessos, porém com poucas plantas por acesso. Essa é talvez a principal razão de os estudos anteriores apontarem baixa variabilidade genética na espécie. A obtenção de novos marcadores SSR polimórficos e o processamento de análises de variabilidade dentro das famílias será a etapa seguinte da pesquisa. / Jatropha curcas L. is the most promising perennial oilseed for biodiesel and biokerosene. However, recent research reveals narrow genetic variability in the species and further studies on this topic are needed to support its genetic improvement. We evaluated the genetic variability among 93 families, each one represented by a single plant, through five primers of SSR markers. These 93 families make up the genebank of the Universidade Federal de Viçosa (UFV). In total 60 SSR primer pairs were evaluated, but only the five most polymorphic were selected. There was the establishment of nine clusters of diversity by using UPGMA method. Families UFVJC 19, UFVJC 36 and 98 had the highest genetic diversity. A total of 13 clusters were formed by using Tocher method, with the families UFVJC 18, UFVJC 36 and UFVJC 71 as the most divergent. This variability among families collected in northern Minas Gerais state supported the hypothesis of the region as putative secondary center of diversity of the species. Although exploratory, the present research showed significant genetic variability in UFV genebank. This fact confirms the correctness of the collection strategy of UFV genebank families, practiced with many plants per family (minimum of 16). In the implementation of other genebanks the emphasis was to collect more accessions, but with few plants for accession. Perhaps this is the main reason previous studies suggest low genetic variability in species. Obtaining new polymorphic SSR markers and processing variability analysis within families are the next step of the research.

MANO, Ana Raquel de Oliveira. Adaptabilidade e estabilidade fenotípica de cultivares de feijão de corda. 2009. 152f. Tese(Doutorado em Agronomia/Fitotecnia)- Centro de Ciências Agrárias, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2009. / Submitted by Maria Naires Souza (marianaires@ufc.br) on 2011-12-14T18:47:06Z No. of bitstreams: 1 2009-tese-aromano.pdf: 875027 bytes, checksum: 022f3ead1ca1bf8426ac46de4b7dafdc (MD5) / Approved for entry into archive by Aline Nascimento(vieiraaline@yahoo.com.br) on 2011-12-19T14:50:13Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2009-tese-aromano.pdf: 875027 bytes, checksum: 022f3ead1ca1bf8426ac46de4b7dafdc (MD5) / Made available in DSpace on 2011-12-19T14:50:13Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2009-tese-aromano.pdf: 875027 bytes, checksum: 022f3ead1ca1bf8426ac46de4b7dafdc (MD5) Previous issue date: 2009-08-18 / Cowpea (Vigna unguiculata (L.) Walp.), is very important crop for feeding the rural and urban populations of the tropical and subtropical areas of the world. The yield of that crop varies, mainly, because climate variations and of the use of low yield genetic materials with undesirable characteristics. Grains yield is influenced by the effects of environments (E), genotypes (G) and G × E interaction that into account the variabily of the genotypes in the several environments. The interaction G x E can be characterized by studying the adaptability and stability phenotipic using several techniques. This research aimed to verify the magnitude of the interaction G x E, their effects or the adaptability and the phenotipic stability of the productivity of grains of fifteen cultivate of cowpea. Four methodologies were used for this study (Eberhart and Russel, Cruz, Torres and Vencovsky, Lin and Binns and AMMI or “Additive Main effect and Multiplicative Interaction "). The experiments were carried out in five countries (“Alto Santo, Barreira, Crateús, Itapipoca and Limoeiro do Norte”) of the state of “Ceará”, Brasil, under rainfall conditions during the years of 2006 and 2007. A complete randomized design with 15 treatments and four replication were used. Each experimental unit were 3,0 m x 5,0 m, with four rows spaced by 0,75 m containing 20 plants 0,25 m apart. The two central rows were harvested for futher analysis. The extra plants in each experimental unit were thinning 15 days after sowing, leaving two plants per rows. The Eberhart and Russell linear regression did not classified the cultivars tested for general adaptation and stability; it means that all cultivars were considered unstable by this methodology. The bissegmented regression methodology proposed by Cruz, Torres and Vencovsky allowed to classify the cultivars as adaptable for favorable, unfavorable environment and for general adaptation, but all of than were considered unstable. The method of Lin and Binns classified the cultivars simultaneously for adaptability and stability with just a parameter in decreased order of sequence. The AMMI method made possible the explain most of the G x E interaction in the first two IPCA. This method classified the cultivars and environment in relation to the stability in two biplots in a pricise way. The f Spearman’s correlation indicated that some parameters used by the methodologies mentioned were associated and so they can not be used simultaneously. On the other hand, the one that were not associated be used as a complementarity. The list genotypes that showed highest adaptability and stability for grain yield were “Inhuma, BR 17 – Gurguéia, BRS-Marataoã, Sempre Verde-CE, BRS-Paraguaçu e BRS-Rouxinol” because they combined both parameters. / O feijão-de-corda (Vigna unguiculata (L.) Walp.), é uma espécie cultivada de grande importância para a alimentação das populações rurais e urbanas das regiões tropicais e subtropicais do mundo. A produtividade dessa espécie varia muito, em virtude, principalmente, das variações climáticas e da utilização de materiais genéticos pouco produtivos ou com características indesejáveis. A produtividade de grãos é influenciada por efeitos genotípicos (G), efeitos ambientais (E) e das interações genótipo x ambiente (G x E), que levam ao comportamento diferencial dos genótipos nos diversos ambientes. A interação G x E pode ser caracterizada por estudos sobre adaptabilidade e estabilidade fenotípica por meio de diversas técnicas. Com base nisso, esta pesquisa objetivou verificar a magnitude da interação G x E, e a sua conseqüência na adaptabilidade e a estabilidade fenotípica da produtividade de grãos de quinze cultivares de feijão-de-corda, por meio de quatro metodologias (Eberhart e Russell, Cruz, Torres e Vencovsky, Lin e Binns e AMMI ou “Additive Main effects and Multiplicative Interaction”). Os experimentos foram conduzidos em cinco municípios (Alto Santo, Barreira, Crateús, Itapipoca e Limoeiro do Norte) do estado do Ceará, em cultivo de sequeiro nos anos 2006 e 2007. O delineamento utilizado foi o de blocos casualizados com 15 tratamentos e quatro repetições. A parcela experimental teve dimensões de 3,0 m x 5,0 m, com quatro fileiras, espaçadas de 0,75 m entre, e 0,25 m dentro das fileiras. As duas fileiras centrais corresponderam à área útil. O desbaste foi feito aos 15 dias após plantio deixando-se em média duas plantas por cova. Os ambientes corresponderam à combinação de ano e local totalizando dez ambientes, dos quais foram utilizados oito para as análises estatísticas. O efeito de ambientes foi mais importante do que o efeito da interação genótipos x ambientes (G x E), e este mais importante do que o efeito de genótipos. A magnitude da interação G x E para a produtividade de grãos foi alta, indicando que este é um caractere instável. A regressão linear de Eberhart e Russell não classificou nenhum dos genótipos testados como de adaptação geral, nem estável nos ambientes avaliados. A regressão bissegmentada de Cruz, Torres e Vencovsky caracterizou os genótipos quanto à adaptabilidade em condições específicas de ambientes favoráveis, desfavoráveis ou de adaptação geral, mas todos instáveis. O método de Lin e Binns classificou simultaneamente os genótipos quanto à adaptabilidade e estabilidade com apenas um parâmetro, ordenando os genótipos em sequência decrescente. O método AMMI possibilitou a explicação da maior parte interação G x E nos dois primeiros CPIs. Esse método classificou os genótipos e ambientes quanto a estabilidade de forma precisa em dois biplots. A correlação de Spearman indicou que alguns parâmetros das diferentes metodologias utilizadas estão diretamente associados não devendo ser utilizados simultaneamente, enquanto outros não associados podem ser usados em complementaridade. Os genótipos que reuniram mais adaptabilidade com estabilidade para produtividade de grãos foram: Inhuma, BR 17 – Gurguéia, BRS-Marataoã, Sempre Verde-CE, BRS-Paraguaçu e BRS-Rouxinol, pela combinação de vários parâmetros.

Submitted by Patricia Barros (patricia.barros@ufes.br) on 2016-05-12T13:21:28Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) ADRIEL LIMA NASCIMENTO - MELHORAMENTO GENÉTICO DO MAMOEIRO - NOVOS HÍBRIDOS PARA O NORTE DO ESPÍRITO SANTO.pdf: 1058937 bytes, checksum: 9264d96e00245a7c63e65dbe5b22e77e (MD5) / Approved for entry into archive by Patricia Barros (patricia.barros@ufes.br) on 2016-05-12T13:21:44Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) ADRIEL LIMA NASCIMENTO - MELHORAMENTO GENÉTICO DO MAMOEIRO - NOVOS HÍBRIDOS PARA O NORTE DO ESPÍRITO SANTO.pdf: 1058937 bytes, checksum: 9264d96e00245a7c63e65dbe5b22e77e (MD5) / Made available in DSpace on 2016-05-12T13:21:44Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) ADRIEL LIMA NASCIMENTO - MELHORAMENTO GENÉTICO DO MAMOEIRO - NOVOS HÍBRIDOS PARA O NORTE DO ESPÍRITO SANTO.pdf: 1058937 bytes, checksum: 9264d96e00245a7c63e65dbe5b22e77e (MD5) / Capes / O mamoeiro (Carica papaya L.) é uma das culturas mais importantes e amplamente distribuídas nos países tropicais e subtropicais. Dos problemas que afetam o cultivo do mamoeiro está relacionado o baixo número de variedades e híbridos explorados comercialmente, que atendam às exigências dos mercados interno e externo. Uma alternativa e solução viável para estes problemas é a de recorrer à ampliação da base genética do mamoeiro, por meio de programas de melhoramento utilizando hibridações. Nesse contexto desenvolveram-se três trabalhos: o primeiro e o segundo objetivou-se avaliar o comportamento de 11 e 10 novos híbridos obtidos na Caliman Agrícola S.A. quanto aos caracteres morfológicos de planta e biométrico de frutos; no terceiro trabalho procedeu-se à avaliação sensorial e físico-química de frutos bem como a correlação linear em 23 cultivares. Os resultados obtidos com a análise de variância e posterior teste de média de todos os caracteres avaliados mostraram diferenças significativas entre as cultivares avaliadas. Com base nos resultados, detectou a presença de híbridos com caracteres morfológicos de planta, produtivos e qualidade de frutos interessantes, sugerindo que os mesmos sejam avaliados para outros caracteres de interesse agronômico para futuros lançamentos comerciais. A aceitação das cultivares pelo consumidor pode ser basicamente ix executada a partir das classificações quanto ao teor de sólidos solúveis totais por ser um método mais prático, barato e eficiente que a avaliação pela escala hedônica e apresentar alta correlação positiva com esta. / Papaya (Carica papaya L.) is one of the most important and widely distributed crops in tropical and subtropical countries. The problems affecting the cultivation of papaya involve the low number of commercially explored varieties and hybrids, that meet the requirements of national and international markets. An alternative and viable solution to these problems is to use the expansion of the genetic basis of papaya through improvement programs using hybridizations. In this context, three Works were developed: the first and the second aimed to evaluate the behavior of 11 and 10 new hybrids obtained in Caliman Agrícola S.A. as for the plant morphological characteristics and fruit biometric; the third work proceeded to sensory and physicochemical evaluation of fruit as well as the linear correlation in 23 cultivars. The results obtained with the variance analysis and subsequent average test of all characteristics evaluated showed significant differences among the cultivars. Based on the results, it was detected the presence of hybrid with plant morphological characteristics, productive aspects and interesting fruit quality, suggesting that they are assessed to other agronomically important characteristics for future commercial launches. The acceptance of the cultivars by the consumer can basically be performed from the ratings on the content of total soluble solids, since it is a method xi that is more practical, cheap and efficient than the evaluation by hedonic scale and it presents high positive correlation with the hedonic scale method.