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Investigation of protein-induced formation of lipid domains and their dynamics using fluorescence energy transfer /Wright, Jenny R. January 2005 (has links) (PDF)
Thesis (M.S.)--University of North Carolina at Wilmington, 2005. / Includes bibliographical references (leaves: 53-55)
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Análise proteômica de membrans de Paracoccidioides sp. durante privação de zincoSilva, Marielle Garcia 04 August 2014 (has links)
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Previous issue date: 2014-08-04 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Paracoccidioides spp. are pathogenic fungi that causes paracoccidioidomycosis, an important
systemic mycosis in Latin American countries. The success of infection depends on the pathogen
ability to obtain essential micronutrients (metals) from the host. This process of nutrient uptake
occurs through membrane associated transporters. The membranes are constituted of a lipid bilayer
with associated proteins and are involved in different processes during the establishment of
infection, such as transport of nutrients and homeostatic regulation. As zinc is a metal that plays an
important role in the regulation of host-pathogen interaction and changes in this micronutrient
homeostasis are implicated in the pathogenesis of infectious diseases, the aim of this study was to
identify the membrane proteins expressed under conditions of zinc deprivation. NanoUPLC-MSE
technique was employed in order to identify membrane proteins of yeast cells (Pb01) grown in
chemically defined media in the presence and absence of zinc. Transmission electron microscopy was performed to confirm the sample enrichment with membranes. Subsequently, the samples were
digested and analyzed by NanoUPLC-MSE. In silico analysis was performed to determine the
location of 460 proteins identified in extracts of Pb01 grown in + Zn (control) and TPEN (treated)
medium. Among the identified proteins, 141 were classified as belonging to membranes and of
those, 120 proteins were repressed and 21 were induced during zinc deprivation. Among the 141
membrane proteins, 81 showed transmembrane domains and 9 were classified as membranes
proteins with post-transcriptional modification. A total of 15 membrane proteins showed signal
peptide. Analysis of the function of membrane proteins, allowed the description that phospholipid
metabolism and cell integrity maintenance pathways were affected by zinc deprivation. / Paracoccidioides spp. são fungos patogênicos, causadores da paracoccidioidomicose, uma
importante micose sistêmica nos países latino-americanos. O sucesso da infecção depende da
capacidade do patógeno obter micronutrientes essenciais (metais) a partir do hospedeiro. Este
processo de captação de nutrientes ocorre através de transportadores associados às membranas. As
membranas são constituídas por uma bicamada lipídica com proteínas associadas e estão
envolvidas em diferentes processos durante o estabelecimento da infecção, como transporte de
nutrientes e regulação homeostática da célula. Como o zinco é um metal que desempenha um papel
importante na regulação da interação patógeno-hospedeiro e distúrbios na homeostase deste
micronutriente estão implicados na patogênese de doenças infecciosas, o objetivo deste estudo foi
identificar as proteínas de membranas expressas em condições de privação de zinco. A técnica
NanoUPLC-MSE foi empregada para identificar proteínas de membranas de células de levedura
(Pb01) cultivadas em meio quimicamente definido na presença e ausência de zinco. Microscopia
eletrônica de transmissão foi realizada para confirmar o enriquecimento da amostra com
membranas. Posteriormente, as amostras foram digeridas e analisadas por NanoUPLC-MSE.
Análises in silico foram realizadas para determinação da localização de 460 proteínas obtidas do
extrato proteico de Pb01 cultivado em meio com zinco (controle) e TPEN (tratado). Do total de
proteínas identificadas, 141 proteínas foram classificadas como pertencentes a membranas e destas,
120 proteínas foram reprimidas e 21 foram induzidas durante privação de zinco. Dentre as 141
proteínas de membranas, 81 apresentaram domínio transmembrana e 9 foram classificadas como
sendo de membrana, em decorrência de modificação pós-traducional. Um total de 15 proteínas de
membrana apresentou peptídeo sinal. Análises da função das proteínas de membranas permitiu a
descrição de que o metabolismo de fosfolipídeos e a integridade celular foram afetados pela
privação de zinco.
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Analyse du rôle de l’interaction de VirB6 avec VirB10 dans le système de sécrétion de type IVMary, Charline 04 1900 (has links)
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