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Evaluación de marcadores nucleares por EPIC-PCR y amplificación cruzada para estudios poblacionales en Merluccius gayi peruanus en el mar peruano

Silva Valle, Mayra Zelena January 2010 (has links)
La merluza peruana Merluccius gayi peruanus es una especie demersal con una gran importancia económica, necesariamente se deben hacer investigaciones de este tipo con la finalidad de conocer mejor al recurso para poder así tener mejores parámetros y facilitar su mejor aprovechamiento. De la merluza peruana, se posee escasa información acerca del componente genético poblacional. Debido a la carencia de esta información, el objetivo del presente trabajo fue caracterizar genéticamente las poblacionales de Merluccius gayi peruanus (periodo mayo, 2002) usando marcadores nucleares intrónicos: AldoC1 (AldolasaC intron 1), CK7 (Creatin Kinasa intron 7), GH5 (Hormona de Crecimiento intron 5) y Microsatélites (Mmer-hk9b). Las estrategias que se emplearon fueron EPIC-PCR y amplificación cruzada. El análisis estadístico realizado en la presente investigación demostró que las poblaciones estudiadas, de merluza constituyen una sola unidad poblacional. Palabras Claves: Optimización, PCR, marcador microsatélite, marcador EPICs, Merluccius gayi peruanus. / ---Peruvian hake Merluccius gayi peruanus is a demersal species of great economic importance, necessarily must make such research in order to better understand the resource and to have better parameters and facilitate the best use. For the Peruvian hake, it has little information about the population genetic component. Due to the lack of this information, the purpose of this study was to characterize genetically the population of Merluccius gayi peruanus (period May, 2002) using intronic nuclear markers: AldoC1 (AldolasaC intron 1), CK7 (Creatine kinase intron 7), GH5 ( Growth hormone intron 5) and microsatellites (MMER-hk9b). The strategies used were EPIC-PCR and cross-amplification. The statistical analysis in this investigation showed that the populations studied, as a single hake population structure.
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Evaluación de marcadores nucleares por EPIC-PCR y amplificación cruzada para estudios poblacionales en Merluccius gayi peruanus en el mar peruano

Silva Valle, Mayra Zelena January 2010 (has links)
La merluza peruana Merluccius gayi peruanus es una especie demersal con una gran importancia económica, necesariamente se deben hacer investigaciones de este tipo con la finalidad de conocer mejor al recurso para poder así tener mejores parámetros y facilitar su mejor aprovechamiento. De la merluza peruana, se posee escasa información acerca del componente genético poblacional. Debido a la carencia de esta información, el objetivo del presente trabajo fue caracterizar genéticamente las poblacionales de Merluccius gayi peruanus (periodo mayo, 2002) usando marcadores nucleares intrónicos: AldoC1 (AldolasaC intron 1), CK7 (Creatin Kinasa intron 7), GH5 (Hormona de Crecimiento intron 5) y Microsatélites (Mmer-hk9b). Las estrategias que se emplearon fueron EPIC-PCR y amplificación cruzada. El análisis estadístico realizado en la presente investigación demostró que las poblaciones estudiadas, de merluza constituyen una sola unidad poblacional. Palabras Claves: Optimización, PCR, marcador microsatélite, marcador EPICs, Merluccius gayi peruanus. / Peruvian hake Merluccius gayi peruanus is a demersal species of great economic importance, necessarily must make such research in order to better understand the resource and to have better parameters and facilitate the best use. For the Peruvian hake, it has little information about the population genetic component. Due to the lack of this information, the purpose of this study was to characterize genetically the population of Merluccius gayi peruanus (period May, 2002) using intronic nuclear markers: AldoC1 (AldolasaC intron 1), CK7 (Creatine kinase intron 7), GH5 ( Growth hormone intron 5) and microsatellites (MMER-hk9b). The strategies used were EPIC-PCR and cross-amplification. The statistical analysis in this investigation showed that the populations studied, as a single hake population structure.
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Estructura Genética de la población de merluza meruana (Merluccius Gayi Peruanus) (Primavera, 2001) usando variantes de secuencia de la región de control Mitocondrial

Oré Chávez, Daniel Saúl January 2011 (has links)
La merluza peruana (Merluccius gayi peruanus) sostiene una pesquería importante en el país. Actualmente la evaluación y manejo de este recurso asume la presencia de un solo stock en el mar norperuano, sin embargo, observaciones realizadas en 1997 sugieren la existencia de dos stocks, al norte y sur del paralelo 6°S. El objetivo del presente estudio es evaluar mediante el uso de marcadores mitocondriales la presencia de una o dos unidades poblacionales de merluza, para lo cual se amplificó la región de control mitocondrial parcial y completa, detectándose las variantes con dos técnicas Single Strand Conformational Polymorphism (SSCP) y secuenciamiento directo, respectivamente. Se observa una alta diversidad haplotípica y baja diversidad nucleotídica, con una escasa diferenciación y estructura genética, con la presencia de dos posibles líneas matrilineales yuxtapuestas geográficamente. Así mismo existe evidencia de que la población atravesó un reciente evento de expansión poblacional a finales del Pleistoceno. En conclusión, la merluza peruana comprende una sola unidad panmíctica en el mar norperuano sin presencia de una estructuración genética en sus poblaciones, lo cual apoya la hipótesis de un solo stock, siendo necesario el empleo de otros marcadores como los microsatélites para efectuar análisis multilocus a fin de tener mayores criterios que apoyen la hipótesis. -- Palabras clave: Merluccius, Merluza peruana, ADN mitocondrial, dinámica poblacional. / Peruvian hake (Merluccius gayi peruanus) supports a major fishery in the country. Currently the evaluation and management of this resource assumes the presence of a single stock in the north peruvian sea, however, observations in 1997 suggests the existence of two stocks in the north and south of 6 ° S. The aim of this study is to evaluate using mitochondrial markers the presence of one or two units of hake population, which was amplified for the mitochondrial control region of partial and complete, detected with two techniques: Single Strand Conformational Polymorphism (SSCP) and sequencing, respectively. A high haplotype diversity and low nucleotide diversity, with differentiation and structure genetic low, with the possible presence of two matrilineal lines juxtaposed geographically. Likewise there is evidence that the population underwent a recent population expansion event in the late Pleistocene. In conclusion, the Peruvian hake comprises a single panmictic unit north peruvian sea without the presence of genetic structure in populations, which supports the hypothesis of a single stock, requiring the use of other markers such as microsatellites for analysis to multilocus to have better criteria to support the hypothesis. Key words: Peruvian hake, Merluccius, AND mitochondrial, dynamics of populations. / Tesis
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Efecto de la radiación gamma sobre algunos parámetros de calidad de la porción H&G de merluza negra (Dissostichus eleginoides)

Principe, Francisco 04 September 2009 (has links)
La merluza negra (Dissostichus eleginoides) es una de las especies pesqueras del Mar Argentino de mayor valor comercial en el mercado mundial. Se trata de un pescado graso que se congela a bordo y se exporta principalmente en la forma descabezada y eviscerada denominada porción H&G. Para retardar su deterioro el método comúnmente empleado es el congelado. El uso de este método en el pescado no es suficiente para minimizar la ocurrencia de enfermedades transmitidas por los alimentos. El procesamiento del pescado con bajas dosis de radiaciones ionizantes puede anular el riesgo de dichas enfermedades, además de extender el período de aptitud del producto. Los objetivos de este trabajo fueron generar información sobre la calidad de la porción H&G de la merluza negra capturada en la Zona FAO N 41, durante el almacenaje por tiempo prolongado a 18C y conocer el efecto de la radiación gamma de Cobalto-60 desde el punto de vista de su preservación. Al respecto se determinaron, la rancidez oxidativa, el contenido de las bases nitrogenadas volátiles totales, el pH, la composición de lípidos y ácidos grasos en dicha porción, como así también su olor y sabor. En una primera etapa, se determinó que la rancidez oxidativa no fue significativa en las distintas partes de la porción H&G durante el almacenaje prolongado a 18C. Se corroboró que la presencia de signos de fallas operativas en la porción, indujeron incrementos en los productos secundarios de oxidación lipídica. Posteriormente, se encontró que la aplicación de 1, 3 y 5 kGy de rayos gamma de Cobalto-60 al producto congelado, globalmente, no afectó a la rancidez oxidativa, ni el nitrógeno básico volátil total ni al pH del músculo de la especie a lo largo del almacenaje. En la porción descongelada y mantenida a 5C, tanto en muestras control como irradiadas, se determinó que el producto resultó aceptable hasta las 72 horas de almacenaje. El perfil de ácidos grasos de los ejemplares tuvo como componentes principales a los ácidos grasos monoinsaturados teniendo al ácido oleico (18:1) como componente principal. Los saturados siguieron en importancia destacándose dentro el grupo el ácido palmítico (16:0). Un 17 % del total correspondió a los ácidos grasos poliinsaturados, destacándose el eicosapentaenoico (20:5 n-3) y el docosapentaenoico (22:6 n-3) como los principales exponentes del grupo. Las dosis de 1 y 5 kGy no afectaron al perfil de ácidos grasos ni al contenido de triglicéridos y fosfolípidos a lo largo del almacenaje prolongado a 18C. La irradiación no indujo formación de acidos grasos trans. En relación al análisis sensorial se determinó que la evaluación en cocido resulta más efectiva que la evaluación en crudo para investigar el olor y el sabor de esta especie. Se encontró que la dosis de 1 kGy mantiene una destacada calidad en alrededor de cuatro meses más con su control; mientras que 3 y 5 kGy tuvieron un efecto detrimental sobre estos atributos. Los efectos de las distintas dosis de irradiación sobre los parámetros analizados se explicaron a la luz de los conocimientos actuales de la química de las radiaciones en alimentos. Sobre la base de los datos informados, se concluye que la porción H&G de merluza negra capturada en el Mar Argentino presenta estabilidad durante el almacenaje prolongado en estado congelado. El tratamiento del producto con una baja dosis de radiación gamma extiende el tiempo en el cual los ejemplares mantienen destacada calidad para el consumo. Sumado a esto, la tecnología de irradiación permitiría contar con un producto microbiologicamente seguro, manteniendo las características nutricionales beneficiosas de sus ácidos grasos. Además estos resultados, pueden ser considerados como un antecedente de valor, tanto para la industria pesquera como para las autoridades sanitarias a fin de autorizar la incorporación de los alimentos marinos irradiados en el Código Alimentario Argentino. / The Patagonian toothfish is one of the fishing species in the Argentinian Sea with the highest commercial value in the world market. It is a fatty fish that is frozen on board and exported mainly headed and gutted -H&G-. However, this is not enough to prevent illnesses that may be caused by this food. The processing of the fish with low dosis of ionizing radiation can eliminate the risk of these illnesses and, what is more, extend its shelf life. The aims of this work were to provide information about the quality of the headed and gutted portion of Patagonian toothfish captured in the FAO N 41 area, during its long- term storage at -18C and to know the effect of Co60 gammma irradiation on its preservation. For this purpose it was necessary to determine its oxidative rancidity, the content of nitrogen of total volatile bases, its pH, the composition of lipids and fatty acid in this portion as well as its smell and taste. In a first stage it was found that the oxidative rancidity was not significant in the different parts of this portion. However, when some signs of operative failures appeared, there was an increase in the secondary lipid oxidation products. Later, it was found that, in general, the application of 1, 3 and 5 kGy Co60 gamma rays to the frozen products did not affect its oxidative rancidity, its nitrogen of total volatile bases and its muscle pH during storage. In the defrosted portion kept al 5C, both the control and irradiated samples were acceptable after storage of up to 72 hours. The fatty acid profiles of the samples had monounsaturated fatty acid as their main components, being the oleic acid (18:1) the principal element in this group. The saturated fatty acid appeared next, especially the palmitic acid (16:0). Seventeen per cent of all the fatty acids were the polinsaturated ones, among which the eicosapentaenoic acid (20:5 n-3) and docosahexaenoic (22:6 n-3) appear as the main ones in the group. The application of 1 and 5 kGy doses did not affect either the fatty acid profiles or the triglicerides and phospholipids contents and it did not cause the formation of trans fatty acids either. As regards sensorial analysis, the evaluation of odor and taste was more effective in cooked fish than in raw ones. It was also found that the 1 kGy doses kept good quality for four months more than its control group, whereas the 3 and 5 kGy doses had a detrimental effect. The effects of the different irradiation doses on the analized parameters were explained taking into account the present knowledge the radiation chemistry of food. In conclusion, the H&G portion of Patagonian toothfish captured in the Argentinian Sea presents stability during long-term storage in frozen state. When the product is irradated with a low dosis of gamma rays it keeps an excellent state for more time. Moreover, the irradiation technology renders the product microbiologically safe, keeping the nutritional characteristics of its fatty acids. Furthermore, these results may be considered as valuable background for the fishing industry as well as the sanitary authorities so as to permit the incorporation of these irradiated marine foods in the Argentine Food Code.
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Exportación de Merluza Austral a Suecia

Sánchez Grellet, Beatriz Marcela January 2009 (has links)
No description available.
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Trophic ecology of hake, anchovy, sardine, round sardinella and bullet tuna larvae of NW Mediterranean: influence of trophic environment and ontogeny

Morote Córdoba, Elvira 02 December 2011 (has links)
En esta Tesis Doctoral se ha analizado las relación de la comunidad ictioplanctonica con su ambiente físico y trófico en dos condiciones hidrográficas contrastadas (estratificación estival y mezcla otoñal) y se ha caracterizado la dieta larvaria de cinco especies de teleósteos presentes en el Noroeste del Mediterráneo: los tres clupeiformes de la región [anchoa (Engraulis encrasicolus), sardina (Sardina pilchardus) y alacha (Sardinella aurita)], un pequeño túnido [la melva (Auxis rochei)] y la especie de pez demersal más importante de la región [la merluza (Merluccius merluccius)]. Estas especies han sido elegidas porque representan dos morfotipos distintos, 1) morfotipo estilizado representado por los clupeiformes, con boca pequeña, cuerpo alargado y tracto digestivo ligado a la cola, y 2) morfotipo robusto representado por la melva y la merluza, con boca grande, cuerpo robusto y digestivo compacto e independiente de la cola. Además se han estudiado las variaciones de la dieta i) a lo largo del desarrollo, en relación ii) con la disponibilidad de presas y iii) con la morfología de las estructuras implicadas en la alimentación como son el sistema visual, el aparato bucal y el sistema digestivo. La alimentación es un aspecto de la ecología larvaria de los peces que en último termino afecta a la dinámica de sus poblaciones (a través de la supervivencia larvaria y las consiguientes fluctuaciones en el reclutamiento). Los factores que influyen en la preferencia de las larvas de peces por sus presas y las estrategias de alimentación han sido poco o nada estudiados para estas especies escogidas en el mar Catalán. Estos factores pueden diferir entre especies y cambiar a lo largo de la ontogenia. Esta tesis doctoral ha tenido como principal finalidad comprender las estrategias tróficas específicas de las larvas de estas cinco especies importantes en las pesquerías mediterráneas. A grandes rasgos se puede observar tres tipos de estrategias: 1) La que sigue la merluza, que desde el comienzo de la alimentación exógena se especializa en un tipo de presa (Clausocalanus spp.) y solo aumenta el número de copépodos que ingiere para responder al aumento de los requerimientos nutricionales de crecimiento. 2) La que siguen la anchoa y sardina, que muestran una baja intensidad alimenticia, y que varían el tamaño y número de presas poco a poco a lo largo del desarrollo sin grandes cambios en la dieta. 3) La descrita para la melva y la alacha, que contrariamente la las tres especies anteriores, son oportunistas y en su etapa larvaria ajustan los tipos de presa (y tamaños) conforme mejoran sus habilidades de una forma mucho más marcada que el resto de especies. El trabajo presentado en esta tesis ha estado dirigido a obtener información básica y necesaria para interpretar los patrones de distribución y dilucidar el efecto del tipo de ecología trófica de diversas especies de peces en la supervivencia larvaria. Ha sido la primera vez que se estudian las larvas de estas especies en el mar Catalán en relación a la distribución de sus presas potenciales del plancton para evaluar el papel que juega el acoplamiento espacio-temporal de larvas y presas en la estrategia alimentaria. También es la primera vez que se estudia la dieta de estas especies en relación a la morfología de estructuras relacionadas con la alimentación como son el sistema visual, la boca y el tracto digestivo. Los resultados de este trabajo muestran como la morfología opuesta del tipo de digestivo, junto con el tamaño de boca y ojos de las larvas explica las diferencias entre clupeiformes y melva y merluza en lo que se refiere a incidencia alimentaria de la población, tamaños extremos de presas grandes y agudeza visual, pero esto no es suficiente para explicar las estrategias de la alacha que se asemeja mas en sus hábitos alimentarios a la melva que a las especies morfológicamente similares (la anchoa y sardina), así como tampoco sirve para explicar las diferencias de dieta entre merluza y melva pese a que morfológicamente comparten características. Pese a que tanto la melva como la merluza parten de unas características morfológicas mas ventajosas como son el cuerpo robusto, tamaño de boca grande, mayor agudeza visual y digestivos con mayor capacidad de almacenaje, la melva sí refleja estas ventajas en unos hábitos predadores intensos y con incorporación de presas mas grandes y móviles conforme se desarrolla mientras que la merluza no cambia su dieta pese a que estaría capacitada para detectar y capturar presas más nutritivas. La merluza parte de un tamaño de boca relativamente grande al eclosionar que le permite ingerir presas grandes desde el comienzo de la alimentación exógena, patrón similar a las especies que nacen con desarrollo directo o con tamaños de larvas grandes, y no varía su dieta a lo largo del desarrollo larvario / We have analysed the relationship of the ictioplankton community with its fisical and trophic environment in two hydrographical contrasting conditions (summer stratification versus autumn mixed column), and we have characterized the larval diet of five teleost species in the NW Mediterranean: the three clupeiform of the region [anchovy (Engraulis encrasicolus), sardine (Sardina pilchardus) and round sardinella (Sardinella aurita)], a small tuna [bullet tuna (Auxis rochei)] and the most important demersal species of the region [hake (Merluccius merluccius)]. These species have been chosen because they represent two different morphotypes, 1) that of the clupeiforms, which correspond to a stylized larvae with small mouth, long body and digestive tract linked to the tail, and 2) that of bullet tuna and hake, which correspond to a robust larvae with big mouth, robust body and compact digestive tract independent of the tail. Moreover, we have studied the diet variations i) along development, in relation to ii) prey availability and iii) morphology of the feeding-related structures like visual system, mouth and digestive tract. Feeding is an important aspect of the larval fish ecology that affects the population dynamics (through larval survival and subsequence recruitment fluctuations). The factors that affect the larvae in their prey selection and the feeding strategies have been scarcely studied for these species in the Catalan Sea. These factors can be different depending on the species and can change with ontogeny. The main objective of this Ph.D has been to understand the specific trophic strategies of the larvae of these five important species in Mediterranean fisheries. We can point out three types of strategies: 1) The hake’s one, which from the onset specializes feeding in a prey type (Clausocalanus spp.) and only increases the number of copepods to respond to the nutritional requirements of growth. 2) Anchovy and sardine’s type, which show low feeding incidence at the beginning, and they change the size and number of preys step by step along development without showing abrupt changes in the diet. 3) Bullet tuna and hake’s type, opportunist species which deeply adjust their prey type (and size) in their larval period as they enhance their abilities. This research has aimed to obtain the basic and necessary information to explain the fish larval distribution and to elucidate the effect of the trophic ecology of several species of fishes in the larval survival. It has been the first time to study these species in the Catalan Sea in relation to the potential prey distribution to evaluate the rol of spatial-time match of larvae and preys in the feeding strategies. Moreover, it is the first time that the diet composition of the five species has been studied in relation to the morphology of the feeding-related structures such as the visual system, the mouth and the digestive tract. The results of this research highlights that the contrasting morphology of the digestive tract together with the mouth and eyes size can explain the differences in the feeding habits (feeding incidence, size range and visual acuity) among clupeiforms, bullet tuna and hake, but this is not enough to explain the strategies of round sardinella. The feeding habits of this clupeiform is closer to the bullet tuna’s than to the morphogically similar species (anchovy and sardine), nor serves to explain the differences between hake and bullet tuna diet despite sharing morphological characteristics. Although both bullet tuna and hake have a more favourable morphological features such as robust body, large mouth size, higher visual acuity and greater storage capacity, bullet tuna does reflect these advantages in an intense predatory habits with the incorporation of larger and more mobile prey as it develops, but hake diet does not change even though it would be able to detect and capture more nutritious prey. Hake has a relatively large mouth size at hatching therefore can eat larger prey since the beginning of exogenous feeding, similar to species that are born with direct development of larvae or large sizes, and does not change its diet during the course of larval development.
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Variación en los patrones de distribución y abundancia de merluza (Merluccius gayi peruanus Ginsburg, 1954) frente a la costa norte de Perú (2004 - 2014)

Barriga Rivera, Edward January 2017 (has links)
Publicación a texto completo no autorizada por el autor / Analiza los cambios en los patrones de distribución y abundancia de merluza, a partir de la estandarización de la tasas de captura de una serie temporal de 2004 a 2014, utilizando un modelo lineal generalizado cuyas variables explicativas son año, mes, flota, sector, estrato y la variable ambiental ONI (Oscillation El Niño Index). Las variaciones espaciales y temporales de la tasa de captura estandarizada, como indicador de abundancia relativa, indican que el stock disponible de merluza experimentó cambios en su distribución y abundancia entre 2004 y 2014, mostrando tres escenarios: el primero entre 2004 y 2006 con tendencia descendente de los niveles de abundancia y distribución, integrado por merluzas con talla media que decayó de 31 a 26 cm, un segundo escenario entre 2007 y 2011 con niveles de abundancia casi constantes y notorias fluctuaciones estacionales en su abundancia, distribución y talla media, influenciados por la variabilidad estacional de la ESCC, y un tercer escenario entre marzo de 2012 y mitad de 2014 con niveles de abundancia superiores a los escenarios anteriores, los más altos del periodo analizado, integrado por ejemplares con talla media de 35 cm. En general, a partir de 2007 la población de merluza frente a la costa norte del Perú, mostró tendencias positivas en su distribución, abundancia y estructura poblacional, atribuibles a la presencia de condiciones favorables del medio marino y a las medidas de ordenamiento pesquero implementadas en este periodo. / Tesis

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