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Estudos computacionais e sintéticos visando o planejamento racional de novos agentes anticolinesterásicos /Danuello, Amanda Coelho. January 2010 (has links)
Resumo: O presente trabalho teve como objetivo o planejamento e síntese de novas substâncias inibidoras da acetilcolinesterase, enzima cuja modulação está associada ao tratamento de diversas patologias, entre elas a doença de Alzheimer. Para isto foi utilizada a técnica de docking molecular visando o reconhecimento dos sítios de interação da enzima que possibilitaram a modelagem de novos compostos híbridos. O modelo de docking foi criado utilizando a enzima de Torpedo californica, muito semelhante à acetilcolinesterase humana, complexada com a tacrina, donepezil e (-)-huperzina A que foi validado por cross-docking. Em seguida, a (-)-3-O-acetil-espectalina (32), (-)-3-O-acetil-cassina (36) e derivados virtualmente planejados foram ancorados na enzima e a partir de sobreposições destes alcalóides com os inibidores de acetilcolinesterase comerciais foram planejados diversos híbridos que apresentaram interações mais efetivas com a proteína que os modelos originais. Além disto, foram realizados estudos sobre o modo de inibição de 32, que corroboraram os resultados obtidos in vivo, apresentando inibição não-competitiva. A análise por docking e dinâmica molecular sugeriu que 32 e 36 apresentam diferentes interações com a enzima, sendo 36 potencialmente mais ativo que 32. O híbrido planejado por docking que apresentou melhor interação com a AChE, além de maior viabilidade sintética foi selecionado e por análise retrossintética foram escolhidas a 3-hidroxi-2-hidrometil-piridina (38) e a 4-bromoquinolina (42) como materiais de partida para uma rota convergente. Os estudos sintéticos levaram a obtenção de intermediários piridínicos sendo que numa das etapas da rota proposta, onde o objetivo era a proteção seletiva da hidroxila piridínica de 38, foi observada a proteção da hidroxila metil-piridínica o que sugere a migração dos grupos acetil... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The goal of this research deals with the design and synthesis of new acetylcholinesterase inhibitor molecules. This enzyme is associated to the treatment of several pathologies including Alzheimer's disease and thus the importance of studying molecules that may interact with it. To fulfill this task we used molecular docking aiming to recognize the enzyme's interaction sites allowing us to design new hybrid compounds. The docking model was created using Torpedo californica's enzyme, very similar to human acetylcholinesterase, complexed with tacrine, donepezil and (-)-huperzine A, all validated by cross-docking. Furthermore, (-)-3-O-acetyl-espectaline (32), (-)-3-O-acetyl-cassine (36) and virtually designed derivatives, were docked into the enzyme through geometric comparisons of known commercially available acetylcholinesterase inhibitors, allowing us to produce a series of enzyme effective molecular hybrids when compared to the original ones. Additionally, we studied the inhibition mode of action of 32 that confirmed the in vivo results showing a non-competitive inhibition. Docking and molecular dynamics of 32 and 36 revealed that they showed different enzyme interactions and that the latter compound was potentially more active than 32. The hybrid molecule planned by docking that showed a better interaction with AChE and, with the best synthetic viability was selected showing 3-hydroxy-2-hydromethyl-pyridine (38) and 4-bromoquinoline (42) as the starting materials of a convergent route. The synthesis studies lead us to the production of pyridine intermediaries and, in one of the stages where the main goal was the selective protection of a pyridine hydroxyl group; we observed instead, the protection of the methyl pyridine hydroxyl moiety suggesting the migration of the acetyl and benzoyl groups. We used several coupling methods for the pyridine and quinoline nuclei... (Complete abstract click electronic access below) / Orientador: Vanderlan da Silva Bolzani / Coorientador: Carlos Alberto Mansour Fraga / Banca: Ângela Regina Araújo / Banca: Luiz Carlos Dias / Banca: Maria Helena Sarragiotto / Banca: Nelilma Correia Romeiro / Doutor
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Estudos computacionais e sintéticos visando o planejamento racional de novos agentes anticolinesterásicosDanuello, Amanda Coelho [UNESP] 13 August 2010 (has links) (PDF)
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Previous issue date: 2010-08-13Bitstream added on 2014-06-13T19:45:05Z : No. of bitstreams: 1
danuello_ac_dr_araiq.pdf: 2901494 bytes, checksum: 00bdc27de65694c0e80f9d4ed89c46a3 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / O presente trabalho teve como objetivo o planejamento e síntese de novas substâncias inibidoras da acetilcolinesterase, enzima cuja modulação está associada ao tratamento de diversas patologias, entre elas a doença de Alzheimer. Para isto foi utilizada a técnica de docking molecular visando o reconhecimento dos sítios de interação da enzima que possibilitaram a modelagem de novos compostos híbridos. O modelo de docking foi criado utilizando a enzima de Torpedo californica, muito semelhante à acetilcolinesterase humana, complexada com a tacrina, donepezil e (–)-huperzina A que foi validado por cross-docking. Em seguida, a (–)-3-O-acetil-espectalina (32), (–)-3-O-acetil-cassina (36) e derivados virtualmente planejados foram ancorados na enzima e a partir de sobreposições destes alcalóides com os inibidores de acetilcolinesterase comerciais foram planejados diversos híbridos que apresentaram interações mais efetivas com a proteína que os modelos originais. Além disto, foram realizados estudos sobre o modo de inibição de 32, que corroboraram os resultados obtidos in vivo, apresentando inibição não-competitiva. A análise por docking e dinâmica molecular sugeriu que 32 e 36 apresentam diferentes interações com a enzima, sendo 36 potencialmente mais ativo que 32. O híbrido planejado por docking que apresentou melhor interação com a AChE, além de maior viabilidade sintética foi selecionado e por análise retrossintética foram escolhidas a 3-hidroxi-2-hidrometil-piridina (38) e a 4-bromoquinolina (42) como materiais de partida para uma rota convergente. Os estudos sintéticos levaram a obtenção de intermediários piridínicos sendo que numa das etapas da rota proposta, onde o objetivo era a proteção seletiva da hidroxila piridínica de 38, foi observada a proteção da hidroxila metil-piridínica o que sugere a migração dos grupos acetil... / The goal of this research deals with the design and synthesis of new acetylcholinesterase inhibitor molecules. This enzyme is associated to the treatment of several pathologies including Alzheimer’s disease and thus the importance of studying molecules that may interact with it. To fulfill this task we used molecular docking aiming to recognize the enzyme’s interaction sites allowing us to design new hybrid compounds. The docking model was created using Torpedo californica’s enzyme, very similar to human acetylcholinesterase, complexed with tacrine, donepezil and (–)-huperzine A, all validated by cross-docking. Furthermore, (–)-3-O-acetyl-espectaline (32), (–)-3-O-acetyl-cassine (36) and virtually designed derivatives, were docked into the enzyme through geometric comparisons of known commercially available acetylcholinesterase inhibitors, allowing us to produce a series of enzyme effective molecular hybrids when compared to the original ones. Additionally, we studied the inhibition mode of action of 32 that confirmed the in vivo results showing a non-competitive inhibition. Docking and molecular dynamics of 32 and 36 revealed that they showed different enzyme interactions and that the latter compound was potentially more active than 32. The hybrid molecule planned by docking that showed a better interaction with AChE and, with the best synthetic viability was selected showing 3-hydroxy-2-hydromethyl-pyridine (38) and 4-bromoquinoline (42) as the starting materials of a convergent route. The synthesis studies lead us to the production of pyridine intermediaries and, in one of the stages where the main goal was the selective protection of a pyridine hydroxyl group; we observed instead, the protection of the methyl pyridine hydroxyl moiety suggesting the migration of the acetyl and benzoyl groups. We used several coupling methods for the pyridine and quinoline nuclei... (Complete abstract click electronic access below)
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Avaliação do potencial antimicrobiano de novos compostos híbridos contendo os farmacóforos sulfonamida e 2-aminotiofenoOliveira, Jaismary Gonzaga Batista de 27 December 2013 (has links)
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Previous issue date: 2013-12-27 / The increased morbidity and mortality caused by bacterial infection is a public health issue
and has lead a debate about the worldwide emergence of multiresistant microorganisms. Part
of this phenomenon is due to the indiscriminate use of antibiotics, which allowed the
microorganisms to develop resistance mechanisms. Therefore, it is necessary to constantly
seeking to develop new drug candidates to antimicrobial agents. One of medicinal chemistry
strategies for the antibiotics development is the molecular hybridization, which allows the
combination of different pharmacophores in a single molecule, increasing them therapeutic
potential. In this context this study aimed to evaluate the in vitro antibacterial activity of novel
synthetic hybrid compounds containing the sulfonamide and 2-amino-thiophene
pharmacophores. Thus, seven new derivatives have been synthesized in two reaction steps,
starting with the Gewald reaction (obtaining 2-amino- thiophenes), followed by condensation
of these with 4- acetamido -benzene sulfonyl chloride using 40 kHz ultrasound irradiation.
The compounds were purified, characterized and have their structures confirmed by
H NMR.
Finally we determine the minimum inhibitory concentrations (MIC) and its activities as
modifiers of antibiotic activity (putative efflux pump inhibitors) by microdilution, in
Staphylococcus aureus strains overexpressing the NorA , MrsA and TetK genes. The hybrid
compounds were obtained until 80 minutes in satisfactory yields (40-99%), demonstrating
that ultrasound irradiation is a viable and appropriate option. Although none of the
compounds showed significant in vitro antibacterial activity (≥ 256µg/mL), some compounds
such as Sulfa 01, 02 and 04 acted as modifiers activity antibiotic, presumably by inhibiting
the efflux pump, in particular the strain SA - 1199B (which overexpresses the norA gene)
reducing the Norfloxacin CIM up to 16 times (128 to 8 mg / mL). How sulfonamides have no
inhibitory action of efflux pumps, our results lead us to believe that thiophene moiety is
responsible for this activity, suggesting that the new hybridized compounds when in vivo
(they refer to prodrugs) may act by two distinct mechanisms of action, potentiating their
actions. The results indicate that the new hybrid derivatives are potential candidates for
antibiotics prototypes, with great potential to act by a synergistic action mechanism. / O aumento dos índices de morbidade e mortalidade ocasionados por infecções bacterianas é
um problema de saúde pública, e tem provocado uma reflexão a nível mundial acerca do
surgimento de micro-organismos multirresistentes. Parte desse fenômeno deve-se ao uso
indiscriminado de antibióticos, que permitiu aos micro-organismos o desenvolvimento de
mecanismos de resistência. Por isso, faz-se necessário a constante busca do desenvolvimento
de novos fármacos candidatos a agentes antimicrobianos. Uma das estratégias da química
medicinal empregadas no desenvolvimento de antimicrobianos é a hibridização molecular,
que permite a conjugação de diferentes farmacóforos numa mesma molécula, ampliando o
potencial terapêutico das mesmas. Nesse contexto esse trabalho objetivou a avaliação da
atividade antibacteriana in vitro de novos compostos híbridos sintéticos contendo os
farmacóforos sulfonamida e 2-amino-tiofeno. Para tanto, sete novos derivados foram
sintetizados em duas etapas reacionais, iniciando pela reação de Gewald (obtenção de 2amino-tiofenos),
seguido pela condensação desses com cloreto de 4-acetamido-benzenosulfonila
utilizando irradiação de ultrassom 40 kHz. Os compostos foram purificados,
caracterizados e tiveram suas estruturas confirmadas através de análise de RMN
H. Por
último foram determinadas as concentrações inibitórias mínimas (CIM) e suas atividades
como modificadores da atividade antibiótica (inibidores putativos da bomba de efluxo),
através da técnica de microdiluição, em linhagens de Staphylococcus aureus que
superexpressam os genes NorA, MrsA e TetK. Os compostos híbridos foram obtidos em até
80 minutos, em rendimentos satisfatórios (40-99%), demonstrando que a irradiação de
ultrassom é uma opção viável e adequada. Apesar de nenhum dos compostos apresentarem
atividade antibacteriana relevante in vitro (≥256µg/mL), alguns compostos, como Sulfa 01,
Sulfa 02 e Sulfa 04, atuaram como modificadores da atividade antibiótica, provavelmente por
inibição de bomba de efluxo, em especial na linhagem SA-1199B (que superexpressa o gene
norA) ao reduzir a CIM da Norfloxacina em até 16 vezes (128 para 8 µg/mL). Como as
sulfonamidas não têm ação inibitória de bombas de efluxo, nossos resultados nos levam a crer
que a porção tiofênica é a responsável por essa atividade, sugerindo assim, que os novos
compostos hibridizados, quando in vivo (visto se tratarem de pró-drogas) poderão agir por
dois mecanismos de ação distintos, potencializando suas ações. Os resultados indicam que os
novos derivados híbridos são possíveis candidatos a protótipos de antibióticos, com grande
potencial de agir por um mecanismo de ação sinérgico.
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Synthesis, biological profiling and mechanistic studies of 4-aminoquinoline-based heterodimeric compounds with dual trypanocidal–antiplasmodial activity.Sola, I., Castellà, S., Viayna, E., Galdeano, C., Taylor, M.C., Gbedema, Stephen Y., Pérez, B., Clos, M.V., Jones, D.C., Fairlamb, A.H., Wright, Colin W., Kelly, J.M., Muñoz-Torrero, D. 2015 January 1924 (has links)
Yes / Dual submicromolar trypanocidal–antiplasmodial compounds have been identified by screening and chemical synthesis of 4-aminoquinoline-based heterodimeric compounds of three different structural classes. In Trypanosoma brucei, inhibition of the enzyme trypanothione reductase seems to be involved in the potent trypanocidal activity of these heterodimers, although it is probably not the main biological target. Regarding antiplasmodial activity, the heterodimers seem to share the mode of action of the antimalarial drug chloroquine, which involves inhibition of the haem detoxification process. Interestingly, all of these heterodimers display good brain permeabilities, thereby being potentially useful for late stage human African trypanosomiasis. Future optimization of these compounds should focus mainly on decreasing cytotoxicity and acetylcholinesterase inhibitory activity.
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Síntese diastereosseletivas e atividades antinociceptivas de novos derivados tetraidropirânicos substituídos / Diastereoselective synthesis and antinociceptive activities of new substituted tetrahydropyran derivativesCapim, Saulo Luis 02 August 2013 (has links)
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Previous issue date: 2013-08-02 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / This work is described the synthesis of ten new tetrahydropyran derivatives
(compounds 42-51) designed from (±)-Naproxen structure utilizing the Prins
reaction of cyclization as the key step to building shaped diastereoselective 2,4-
cis and 2,4,6-cis rings tetrahydropyran, with overall yields between 62 - 65%.
These new tetrahydropyran derivatives were in vivo bioevaluated on
antinociceptive effect in the acetic acid-induced abdominal writhing test, the tail
flick test, the rota-rod performance and open field tests, and all these new
compounds showed greater antinociceptive activity compared to compound (±)-
1a, highlighting high activity tetraidropirânico derivative (±)-49, which showed
87.5% of inhibition, whereas compound (±)-1a gave only 14% inhibition in in the
acetic acid-induced abdominal writhing test. Moreover, the (tail-flick test)
indicated compounds (±)-46 and (±)-49 as the most actives, and all compounds
showed antinociceptive activity (except compound (±) -51) without harming the
motor impairment and without showing toxicity in mice. In continuation to this
work, there was the synthesis of new hybrid molecules based on the structure
of six non-steroidal anti-inflammatory drugs with a portion tetrahydropyran using
molecular hybridization strategy. These new hybrid tetrahydropyran (74 - 79)
were obtained in yields between (70 - 93%). Preliminary studies antinociceptive
effect in the acetic acid-induced abdominal writhing test in the compounds (74 -
79) showed that all tetrahydropyran derivatives were more efficacious (lower
ED50) and their precursors drugs and no sign of intoxication were observed in
the animals. / Neste trabalho, é descrito a síntese de 10 novos derivados tetraidropirânicos
compostos (42 51) planejados a partir da estrutura do (±)-Naproxeno,
utilizando a reação de ciclização de Prins como etapa chave para a construção
em forma diastereosseletiva 2,4-cis e 2,4,6-cis de anéis tetraidropirânicos, com
rendimentos globais entre 62 65%. Estes novos derivados tetraidropirânicos
foram bioavaliados in vivo em testes de contorções abdominais, retirada de
cauda, desempenho no rota-rod e campo aberto, sendo que todos estes
compostos apresentaram uma maior atividade antinociceptiva em relação ao
composto (±)-1a, com destaque para a alta atividade do derivado
tetraidropirânico (±)-49, que apresentou 87,5% de inibição, enquanto que o
composto (±)-1a apresentou apenas 14% de inibição no teste de contorções
abdominais induzida por ácido acético. Além disso, os testes de retirada de
cauda indicaram os compostos (±)-46 e (±)-49 como os mais ativos, sendo que
todos os compostos apresentaram atividade antinociceptiva (exceto composto
(±)-51) sem prejudicar o comprometimento motor e sem demonstrar toxicidades
em camundongos. Em continuação ao nosso trabalho, realizou-se a síntese de
moléculas híbridas inéditas baseadas na estrutura de seis fármacos antiinflamatórios
não esteroidais com uma porção tetraidropirânica utilizando a
estratégia de hibridização molecular. Estes novos derivados tetraidropirânicos
híbridos (74 79) foram obtidos em rendimentos entre 70 93%. Estudos
preliminares realizados em teste contorções abdominais induzidas por ácido
acético realizados nos compostos (74 79) revelaram que todos os derivados
tetraidropirânicos foram mais eficazes (DE50 menor) que os seus fármacos
percusores e nenhum sintoma de intoxicação foi observado nos animais.
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Síntese de novos híbridos moleculares a partir de um derivado da piperina e anéis tetraidropiranos com potencial atividade antinociceptiva / Synthesis of new hybrids molecular from one piperine derivative and tetraydropyranyl rings with potential antinociceptive activityAlmeida, Thiago Brito de 25 August 2014 (has links)
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Previous issue date: 2014-08-25 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / This work was presented using the technique of molecular hybridization
which is a classic strategy in medicinal chemistry and useful in the design of
new drugs, consisting of the covalent joining of two or more fragments known
pharmacophoric or already present recognized therapeutic activities. Described
the technique of extraction, isolation and purification of piperine 6 with 2% yield,
with the same natural molecule mostly present in black pepper, where studies
have shown a variety of biological activities as analgesic, anti-inflammatory,
anti-thermal, antitumor, antifungal, antichagasic, insecticide, leishmanicidal,
among others. Next, was performed the synthesis of the respective piperic acid
12 obtained via basic hydrolysis with 87% yield. A series of alcohols
tetrahydropyran derivatives replaced (33, 34, 37, 38, 79 and 80) were
synthesized in good yields (76% -100%), with synthetic route and potent
antinociceptive already described by our group research. The Prins cyclization
reaction was used as key step to build diastereoselective 2,4-cis and 2,4,6-cis
tetrahydropyranyl rings. Subsequently, we performed the synthesis of 6 novel
hybrid molecules (64, 65, 66, 67, 68 and 69), based on the structure of an
analog of piperine (piperic acid) with 6 alcohols substituted tetrahydropyran
derivatives, using the classical approach molecular hybridization by Steglich
esterification reaction to join the two portions with relatively good yields (42% -
78%), which was the intention enhance the analgesic activity by these two
chemical entities. All molecular hybrids were characterized by spectroscopic (1H
and 13C) and IR / Neste trabalho foi apresentado o uso da técnica de hibridização
molecular que é uma estratégia clássica em química medicinal e bastante útil
na concepção de novos fármacos, consistindo na junção covalente de dois ou
mais fragmentos reconhecidamente farmacofóricos ou que já apresentem
atividades terapêuticas reconhecidas. Descreveu-se a técnica de extração,
isolamento e purificação da piperina 6 com 2% de rendimento, sendo a mesma
uma molécula natural presente principalmente na pimenta preta, onde estudos
mostraram uma série de atividades biológicas como, analgésico,
antiinflamatório, antitérmico, antitumoral, antifúngico, antichagásico, inseticida,
leishmanicida, dentre outras. Em seguida, foi realizado a síntese do seu
respectivo ácido pipérico 12 obtido via hidrólise básica com 87% de
rendimento. Uma série de derivados álcoois tetraidropiranos substituídos (33,
34, 37, 38, 79 e 80) foram sintetizados em bons rendimentos (76%-100%), com
rota sintética e potente atividade antinociceptiva já descritas pelo nosso grupo
de pesquisa. A reação de ciclização de Prins foi usada como etapa chave para
a construção, em forma diastereosseletiva 2,4-cis e 2,4,6-cis, dos anéis
tetraidropiranos. Posteriormente, realizou-se a síntese de 6 moléculas híbridas
inéditas (64, 65, 66, 67, 68 e 69), baseadas na estrutura de uma análogo da
piperina (ácido pipérico) com os 6 derivados álcoois tetraidropiranos
substituídos, utilizando a estratégia clássica de hibridização molecular através
da reação de esterificação de Steglich para unir as duas porções, com
rendimentos relativamente bons (42%-78%), onde o intuito foi potencializar a
atividade analgésica apresentada por estas duas entidades químicas. Todos os
híbridos moleculares foram caracterizados pelas técnicas de espectroscopia
(1H e 13C) e infravermelho
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