Early embryonic development proceeds without zygotic transcription. Genetic control is executed by maternally inherited mRNAs that are expressed in a temporally regulated manner. To set up the body plan, it is pivotal to both exert translational regulation of maternal mRNAs and to integrate maternal signals that drive cell fate determination. Xenopus nanos1, dead end (dnd) and VegT are maternal messages critical for the germline and somatic development. nanos1 and dnd localize to the germ plasm at the vegetal cortex of oocytes, while VegT occupies a cortical region overlapping with, but broader than, that of the germ plasm. In this dissertation, we observed that unlike other mRNAs, synthetic nanos1 RNA translates very poorly if at all after injection into Xenopus oocytes. We find that a RNA secondary structural element immediately downstream of the AUG start site is both necessary and sufficient to prevent ribosome scanning in the absence of a repressor. nanos1 is translated shortly after fertilization, pointing to the existence of a developmentally regulated activator. These observations unravel a new mode of nanos1 regulation at the post-transcriptional level for eukaryotes that is essential for normal development. Further studies showed that co-injection of dnd and nanos1 into oocytes resulted in nanos1 activation. Consistent with Dnd being the activator, Nanos1 expression was attenuated in the absence of dnd activity. Recombinant Dnd interacted directly with nanos1 RNA in vitro and possessed ATPase activity. Our findings suggested that Dnd is the potential activator for nanos1 translation by directly disrupting the repressive structural element. We previously showed that VegT, the maternal transcription factor, is normally inherited by the primordial germ cells (PGCs). VegT is the endoderm determinant and must be silenced in PGCs to preserve the germline. We showed that a classic Pumilio Binding Element (PBE) within the VegT 3’UTR mediated translational repression of a fluorescent reporter in the germline. Accordingly, a direct interaction between Xenopus Pumilio1 RNA binding domain and the VegT PBE was demonstrated in a band shift assay. The Pumilio protein belongs to the Pum-FBF family that functions in translational repression. We show that Pumilio represses VegT in vivo. Our results suggest that the germline stays unresponsive to the somatic determinant VegT in part by Pumilio- and Nanos-mediated translational repression.

La croissance continue des besoins en puissance de calcul a conduit au triomphe du modèle de Cloud Computing. Des clients demandeurs en puissance de calcul vont s’approvisionner auprès de fournisseurs d’infrastructures de Cloud Computing, mises à disposition via Internet. Pour réaliser des économies d’échelles, ces infrastructures sont toujours plus grandes et concentrées en quelques endroits, conduisant à des problèmes tels que l’approvisionnement en énergie, la tolérance aux pannes et l’éloignement des utilisateurs. Cette thèse s’est intéressée à la mise en place d’un système d’IaaS massivement distribué et décentralisé exploitant un réseau de micros centres de données déployés sur la dorsale Internet, utilisant une version d’OpenStack revisitée pendant cette thèse autour du support non intrusif de bases de données non relationnelles. Des expériences sur Grid’5000 ont montré des résultats intéressants sur le plan des performances, toutefois limités par le fait qu’OpenStack ne tirait pas avantage nativement d’un fonctionnement géographiquement réparti. Nous avons étudié la prise en compte de la localité réseau pour améliorer les performances des services distribués en favorisant les collaborations proches. Un prototype de l’algorithme de placement de machines virtuelles DVMS, fonctionnant sur une topologie non structurée basée sur l’algorithme Vivaldi, a été validé sur Grid’5000. Ce prototype a fait l’objet d’un prix scientifique lors de l’école de printemps Grid’50002014. Enfin, ces travaux nous ont amenés à participer au développement du simulateur VMPlaceS. / The continuous increase of computing power needs has favored the triumph of the Cloud Computing model. Customers asking for computing power will receive supplies via Internet resources hosted by providers of Cloud Computing infrastructures. To make economies of scale, Cloud Computing that are increasingly large and concentrated in few attractive places, leading to problems such energy supply, fault tolerance and the fact that these infrastructures are far from most of their end users. During this thesis we studied the implementation of an fully distributed and decentralized IaaS system operating a network of micros data-centers deployed in the Internet backbone, using a modified version of OpenStack that leverages non relational databases. A prototype has been experimentally validated onGrid’5000, showing interesting results, however limited by the fact that OpenStack doesn’t take advantage of a geographically distributed functioning. Thus, we focused on adding the support of network locality to improve performance of Cloud Computing services by favoring collaborations between close nodes. A prototype of the DVMS algorithm, working with an unstructured topology based on the Vivaldi algorithm, has been validated on Grid’5000. This prototype got the first prize at the large scale challenge of the Grid’5000 spring school in 2014. Finally, the work made with DVMS enabled us to participate at the development of the VMPlaceS simulator.

La transition épithélio-mésenchymateuse (TEM) est un processus physiologique décrit dans le développement embryonnaire et chez l'adulte au cours de la cicatrisation. La TEM est également détournée dans le contexte pathologique au cours de l'invasion tumorale et les mécanismes moléculaires qui la contrôlent font à ce jour l'objet d'intenses investigations. Cette étude décrit le rôle du gène de la lignée germinale NANOS-3 dans la régulation de l'invasion tumorale broncho-pulmonaire associée à la TEM. Nous démontrons que l'expression de Nanos-3 est corrélée à l'agressivité des cancers bronchiques non à petites cellules (CBNPC) humains in vivo et qu'il est surexprimé pendant la TEM induite in vitro. De plus, la surexpression de Nanos-3 dans les lignées tumorales bronchiques augmente leurs capacités invasives in vitro en induisant la TEM alors que son inhibition induit l'effet opposé et promeut la transition mésenchymo-épithéliale (TME). Au cours de cette étude, nous rapportons également des mécanismes à la fois transcriptionnels et post-transcriptionnels de régulation des cibles de Nanos-3. Ainsi, nous montrons que Nanos-3 réprime la transcription du gène CADHERINE-E indépendamment des facteurs de transcription des familles Snail et ZEB. Nous décrivons également que la protéine Nanos-3 co-immunoprécipite avec certains ARNm de ses cibles et, plus particulièrement, qu'elle est capable de réguler la longueur de la queue poly-(A) du transcrit codant pour une de ses cibles majeures : la Vimentine. En parallèle, par des méthodes d'études in silico et in vitro, nous démontrons une localisation à la fois cytoplasmique et nucléaire de Nanos-3 ainsi que son accumulation nucléolaire. Enfin, nous mettons en évidence que la réexpression ectopique de Nanos-3 dans le contexte tumoral pourrait être attribuée à une dérégulation des mécanismes épigénétiques physiologiquement mis en place dans les cellules somatiques adultes. Ainsi, cette étude démontre le rôle de Nanos-3 dans l'acquisition d'un phénotype invasif par les cellules tumorales bronchiques et décrit un nouveau mécanisme de régulation de la TEM dépendant de la longueur de la queue poly-(A) de certains ARNm. / The Epithelial-Mesenchymal Transition (EMT) is a basic cellular process used by embryo to generate different tissues or in adult during wound healing. EMT is also misappropriated by cancer cells during the first step towards metastasis. Molecular mechanisms driving EMT during tumor progression are extensively studied and post-transcriptional regulations of EMT-associated genes emerge as major and promising field in oncology. Here we report a dual post-transcriptional and transcriptional regulation of EMT-associated genes by the NANOS-3 germline gene during lung tumor invasion. We show that the Nanos-3 expression in vivo correlates with aggressiveness of human non-small cell lung carcinomas (NSCLC) and that Nanos-3 is upregulated in cells which undergo an EMT in our in vitro EMT-inducible models. Moreover, Nanos-3 overexpression in human NSCLC cell lines enhances their invasive abilities by EMT regulation while its silencing induces the opposite effect leading to a Mesenchymal-Epithelial Transition (MET). Molecular investigations indicate that Nanos-3 controls its targets by either transcriptional or post-transcriptional mechanisms. We show that Nanos-3 represses E-CADHERIN transcription independently of Snail and ZEB transcription factor families. Moreover, we also find that mRNAs of post-transcriptionally regulated targets are co-immunoprecipitated with the Nanos-3 protein and that Nanos-3 regulates the length of the 3' poly-A tail of VIMENTIN mRNA. This dual mechanism of EMT regulation by Nanos-3 is to be related to the specific subcellular localization of Nanos-3 in both cytoplasm and nucleus associated with a nucleolus accumulation as shown by in vitro and in silico experiments. Finally, we demonstrate an epigenetic regulation of NANOS-3 gene expression in lung cell lines, thus supporting that its ectopic expression could be attributed to an epigenetic machinery deregulation in cancer cells.Thus, here we demonstrate a new innovative role for Nanos-3 in the acquisition of an invasive phenotype by lung tumor cells and we describe a novel mechanism of post-transcriptional regulation of EMT via the control of the mRNA poly-A tail length.

Η εργασία αυτή ασχολείται με την υλοποίηση ενός μεταφραστή για το μοντέλο παράλληλου προγραμματισμού OpenMP. Το μοντέλο αυτό χρησιμοποιείται για την υλοποίηση παράλληλων εφαρμογών για την αρχιτεκτονική κοινής μνήμης, και δίνει έμφαση στην ευκολία του προγραμματισμού και την μεταφερσιμότητα των παράλληλων εφαρμογών που αναπτύσσονται μ’ αυτό. Στην εργασία αυτή παρουσιάζεται η σχεδίαση και η υλοποίηση ενός μεταγλωττιστή παράλληλων εφαρμογών OpenMP για τη γλώσσα προγραμματισμού C σύμφωνα με την έκδοση 2.0 του προτύπου OpenMP. Ο μεταγλωττιστής που υλοποιήθηκε ανήκει στην κατηγορία των μεταφραστών, δηλαδή μεταφράζει τον πηγαίο κώδικα σε γλώσσα προγραμματισμού C με τις επεκτάσεις OpenMP, σε ισοδύναμο πηγαίο κώδικα σε γλώσσα προγραμματισμού C, στον οποίο οι επεκτάσεις OpenMP έχουν αντικατασταθεί από ισοδύναμα τμήματα κώδικα τα οποία χρησιμοποιούν κλήσεις βιβλιοθήκης νημάτων για την υλοποίηση του παραλληλισμού. Ο μεταφραστής έχει σχεδιαστεί με τέτοιο τρόπο ώστε να είναι μεταφέρσιμος, υποστηρίζοντας πολλαπλές πλατφόρμες εκτέλεσης, και επεκτάσιμος, υποστηρίζοντας πολλαπλές βιβλιοθήκες νημάτων κατά τη μετάφραση των οδηγιών OpenMP. Η υλοποίηση του μεταφραστή έγινε στη γλώσσα προγραμματισμού Java, χρησιμοποιώντας το γλωσσικό εργαλείο ANTLR για την υλοποίηση του λεκτικού και συντακτικού αναλυτή. Ο μεταφραστής συνοδεύεται, επίσης, από μια βιβλιοθήκη χρόνου εκτέλεσης, η οποία περιέχει τις συναρτήσεις που ορίζονται από το πρότυπο OpenMP v2.0, καθώς και άλλες συναρτήσεις που είναι απαραίτητες για την εκτέλεση των μεταφρασμένων παράλληλων εφαρμογών. Επίσης, στη βιβλιοθήκη υλοποιούνται οι πολιτικές χρονοδρομολόγησης, επιτρέπωντας εύκολα την υλοποίηση κάποιας νέας πολιτικής. Η βιβλιοθήκη έχει υλοποιηθεί σε γλώσσα προγραμματισμού C. Στα πλαίσια της εργασίας αυτής, έχει υλοποιηθεί η υποστήριξη των βιβλιοθηκών νημάτων POSIX και NANOS σε πολυεπεξεργαστικά συστήματα κοινής μνήμης, καθώς και οι πολιτικές χρονοδρομολόγησης που ορίζονται στο πρότυπο OpenMP v2.0. / The subject of this thesis is the implementation of a translator for the OpenMP parallel programming model. This model is used for the development of parallel applications for the shared memory model and emphasizes on the ease of programming and the portability of the applications developed with it. This thesis describes the design and the implementatino of a compiler for OpenMP parallel applications for the C programming language according to version 2.0 of the OpenMP model. The compiler that has been implemented belongs to the translator class, that is translates the source code in C programming language with the OpenMP extensions to equivalent source code in C programming language where the OpenMP extensions have been replaced with equivalent code segments which use thread library calls to implement the parallelism. The translator has been designed in order to be portable, supporting multiple execution platforms, and extensible, supporting multiple thread libraries during the translation of the OpenMP directives. The translator has been implemented using the Java language and using the language tool ANTLR for the implementation of the lexer and the parser. The translator comes with a run-time library, which contains all of the functions which are defined by the OpenMP v2.0, as well as other functions which are needed for the execution of the translated parallel applications. Also, the library contains the scheduling policies allowing easy implementation of a new one. The library has been implemented using the C language. The current implementation supports the POSIX and NANOS thread libraries in shared memory SMPs, as well as all the scheduling policies defined in OpenMP v2.0

No description available.

No description available.

<p>U disertaciji je prikazan postupak razvoja modela praćenja procesnih parametara štampe tekstilnih materijala koji za rezultat ima kvalitetnu i postojanu štampu sa upravljivim i predvidivim procesom. U radu su date osnove praćenja procesnih parametara štampe tekstilnih materijala. Pratio se uticaj povećanja broja nanosa boje na različitim tekstilnim materijalima, i njihov uticaj na otpornost odštampanih uzoraka na svetlost, pranje, toplotno dejstvo i trljanje što je osnova razvoja modela disertacije.</p> / <p>The dissertation presents development of the process parameters monitoring model for textile printing which provides high-quality and consistent printing with controllable and predictable process parameters. The thesis provides the basis for monitoring of textile printing process parameters such as influence of number of ink layers printed on light fastness, washing fastness, scrubbing and thermal treatment various textile materials.</p>

<p>U disertaciji su predstavljena istraživanja uticajnih parametara<br />digitalne štampe na toplotna svojstva odjevnih predmeta, pri čemu su<br />kao parametri procesa štampe ispitani uticaji različitog broja<br />nanosa boje u štampi i različite tonske pokrivenosti. Odštampani<br />uzorci podvrgnuti su ispitivanjima toplotnih karakteristika<br />štampanih tekstilnih materijala. Na bazi analize izabranih<br />parametara razvijen je model toplotnih svojstava štampanih odjevnih<br />predmeta koji ima poseban značaj za predviđanje toplotno fiziološke<br />udobnosti odjeće tokom upotrebe.</p> / <p>У дисертацији су представљена истраживања утицајних параметара<br />дигиталне штампе на топлотна својства одјевних предмета, при чему су<br />као параметри процеса штампе испитани утицаји различитог броја<br />наноса боје у штампи и различите тонске покривености. Одштампани<br />узорци подвргнути су испитивањима топлотних карактеристика<br />штампаних текстилних материјала. На бази анализе изабраних<br />параметара развијен је модел топлотних својстава штампаних одјевних<br />предмета који има посебан значај за предвиђање топлотно физиолошке<br />удобности одјеће током употребе.</p>

No description available.

I denna uppsats har jag studerat Konflikten i Antiochia, utifrån två aktuella perspektiv på Paulus - ”Nya Perspektivet på Paulus” och ”Paulus inom judendomen”. Syftet har varit att definiera och klarlägga den huvudsakliga innebörden i de två respektive perspektiven samt att utifrån den förståelsen göra en jämförande analys med hjälp av den valda perikopen. Jag har också sökt analysera vilka konsekvenser perspektiven kan få för vår förståelse av Paulus. För att avgränsa uppgiften har jag utgått från ett urval av forskare inom respektive perspektiv. Dessa är för NPP: E. P. Sanders, James D. G. Dunn och N.T. Wright. För PIJ har jag främst utgått från material av Mark Nanos och Magnus Zetterholm. För att kunna göra perspektiven rättvisa presenterar jag också en kort beskrivning av det ”Traditionella Perspektivet på Paulus” eftersom det är det perspektiv som i lite varierande form har varit det dominerande genom historien. Jag har också gjort några förhoppningsvis förtydligande utvikningar kring hur det gick till när judendom och kristendom skiljdes åt samt ett kort avsnitt kring begreppet bordsgemenskap. Slutsatsen i uppsatsen är att perspektiven förvisso skiljer sig åt på flera punkter men att de till övervägande del ligger nära varandra. Detta är särskilt tydligt vad gäller de vetenskapliga drivkrafterna och metoderna som respektive perspektiv använder sig av.